Result of FASTA (omim) for pF1KB3682
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3682, 752 aa
  1>>>pF1KB3682 752 - 752 aa - 752 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4569+/-0.000499; mu= 15.0982+/- 0.031
 mean_var=118.8704+/-22.942, 0's: 0 Z-trim(111.6): 79  B-trim: 51 in 1/52
 Lambda= 0.117635
 statistics sampled from 20221 (20295) to 20221 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.603), E-opt: 0.2 (0.238), width:  16
 Scan time: 10.900

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
XP_016860272 (OMIM: 600555,613796,614162,614892) P ( 752) 5032 866.2       0
NP_009330 (OMIM: 600555,613796,614162,614892) sign ( 750) 5010 862.4       0
XP_006712781 (OMIM: 600555,613796,614162,614892) P ( 750) 5010 862.4       0
NP_644671 (OMIM: 600555,613796,614162,614892) sign ( 712) 4762 820.3       0
XP_005257673 (OMIM: 102582,147060,615952) PREDICTE ( 769) 2643 460.7 9.9e-129
XP_016880464 (OMIM: 102582,147060,615952) PREDICTE ( 769) 2643 460.7 9.9e-129
NP_003141 (OMIM: 102582,147060,615952) signal tran ( 769) 2643 460.7 9.9e-129
XP_005257674 (OMIM: 102582,147060,615952) PREDICTE ( 770) 2643 460.7 9.9e-129
NP_644805 (OMIM: 102582,147060,615952) signal tran ( 770) 2643 460.7 9.9e-129
XP_011523447 (OMIM: 102582,147060,615952) PREDICTE ( 770) 2643 460.7 9.9e-129
XP_016880465 (OMIM: 102582,147060,615952) PREDICTE ( 721) 2614 455.8 2.8e-127
XP_016880462 (OMIM: 102582,147060,615952) PREDICTE ( 721) 2614 455.8 2.8e-127
XP_016880463 (OMIM: 102582,147060,615952) PREDICTE ( 721) 2614 455.8 2.8e-127
XP_016880461 (OMIM: 102582,147060,615952) PREDICTE ( 722) 2614 455.8 2.8e-127
XP_011523448 (OMIM: 102582,147060,615952) PREDICTE ( 722) 2614 455.8 2.8e-127
NP_998827 (OMIM: 102582,147060,615952) signal tran ( 722) 2614 455.8 2.8e-127
XP_006712782 (OMIM: 600558,612253) PREDICTED: sign ( 748) 2569 448.2 5.8e-125
NP_001230764 (OMIM: 600558,612253) signal transduc ( 748) 2569 448.2 5.8e-125
NP_003142 (OMIM: 600558,612253) signal transducer  ( 748) 2569 448.2 5.8e-125
XP_011510007 (OMIM: 600558,612253) PREDICTED: sign ( 748) 2569 448.2 5.8e-125
NP_005410 (OMIM: 600556,616636) signal transducer  ( 851) 1849 326.0 3.9e-88
XP_011536999 (OMIM: 600556,616636) PREDICTED: sign ( 859) 1847 325.7   5e-88
NP_938146 (OMIM: 600556,616636) signal transducer  ( 847) 1791 316.2 3.6e-85
XP_011537000 (OMIM: 600556,616636) PREDICTED: sign ( 855) 1789 315.9 4.6e-85
XP_016860273 (OMIM: 600558,612253) PREDICTED: sign ( 500) 1634 289.4 2.5e-77
XP_011537001 (OMIM: 600556,616636) PREDICTED: sign ( 592) 1465 260.7 1.2e-68
XP_016875393 (OMIM: 600556,616636) PREDICTED: sign ( 607) 1300 232.7 3.4e-60
XP_011537002 (OMIM: 600556,616636) PREDICTED: sign ( 615) 1298 232.4 4.3e-60
XP_005269168 (OMIM: 600556,616636) PREDICTED: sign ( 464) 1032 187.2 1.3e-46
XP_016880466 (OMIM: 245590,604260) PREDICTED: sign ( 693)  830 153.0 3.8e-36
NP_036580 (OMIM: 245590,604260) signal transducer  ( 787)  830 153.1 4.2e-36
NP_001275648 (OMIM: 601511) signal transducer and  ( 764)  800 148.0 1.4e-34
NP_001275647 (OMIM: 601511) signal transducer and  ( 794)  800 148.0 1.4e-34
NP_003143 (OMIM: 601511) signal transducer and act ( 794)  800 148.0 1.4e-34
XP_005257681 (OMIM: 601511) PREDICTED: signal tran ( 761)  785 145.4 8.2e-34
NP_001171551 (OMIM: 601512) signal transducer and  ( 737)  550 105.5 8.1e-22
NP_001171552 (OMIM: 601512) signal transducer and  ( 737)  550 105.5 8.1e-22
NP_003144 (OMIM: 601512) signal transducer and act ( 847)  550 105.6   9e-22
XP_006719638 (OMIM: 601512) PREDICTED: signal tran ( 847)  550 105.6   9e-22
NP_001171549 (OMIM: 601512) signal transducer and  ( 847)  550 105.6   9e-22
NP_001171550 (OMIM: 601512) signal transducer and  ( 847)  550 105.6   9e-22
XP_005257683 (OMIM: 245590,604260) PREDICTED: sign ( 497)  436 86.0   4e-16
NP_001275649 (OMIM: 601511) signal transducer and  ( 763)  394 79.1 7.7e-14
XP_011537011 (OMIM: 601512) PREDICTED: signal tran ( 755)  285 60.6 2.8e-08
XP_011537010 (OMIM: 601512) PREDICTED: signal tran ( 755)  285 60.6 2.8e-08
XP_011537006 (OMIM: 601512) PREDICTED: signal tran ( 865)  285 60.6 3.2e-08
XP_011537008 (OMIM: 601512) PREDICTED: signal tran ( 865)  285 60.6 3.2e-08
XP_011537009 (OMIM: 601512) PREDICTED: signal tran ( 865)  285 60.6 3.2e-08
XP_011537005 (OMIM: 601512) PREDICTED: signal tran ( 865)  285 60.6 3.2e-08
XP_011537007 (OMIM: 601512) PREDICTED: signal tran ( 865)  285 60.6 3.2e-08


>>XP_016860272 (OMIM: 600555,613796,614162,614892) PREDI  (752 aa)
 initn: 5032 init1: 5032 opt: 5032  Z-score: 4623.5  bits: 866.2 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 5032; 100.0% identity (100.0% similar) in 752 aa overlap (1-752:1-752)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MWMSQWYELQQLDSKFLEQVHQLYDDSFPMEIRQYLAQWLEKQDWEHAANDVSFATIRFH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MWMSQWYELQQLDSKFLEQVHQLYDDSFPMEIRQYLAQWLEKQDWEHAANDVSFATIRFH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 DLLSQLDDQYSRFSLENNFLLQHNIRKSKRNLQDNFQEDPIQMSMIIYSCLKEERKILEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DLLSQLDDQYSRFSLENNFLLQHNIRKSKRNLQDNFQEDPIQMSMIIYSCLKEERKILEN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 AQRFNQAQSGNIQSTVMLDKQKELDSKVRNVKDKVMCIEHEIKSLEDLQDEYDFKCKTLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AQRFNQAQSGNIQSTVMLDKQKELDSKVRNVKDKVMCIEHEIKSLEDLQDEYDFKCKTLQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 NREHETNGVAKSDQKQEQLLLKKMYLMLDNKRKEVVHKIIELLNVTELTQNALINDELVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NREHETNGVAKSDQKQEQLLLKKMYLMLDNKRKEVVHKIIELLNVTELTQNALINDELVE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 WKRRQQSACIGGPPNACLDQLQNWFTIVAESLQQVRQQLKKLEELEQKYTYEHDPITKNK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WKRRQQSACIGGPPNACLDQLQNWFTIVAESLQQVRQQLKKLEELEQKYTYEHDPITKNK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 QVLWDRTFSLFQQLIQSSFVVERQPCMPTHPQRPLVLKTGVQFTVKLRLLVKLQELNYNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QVLWDRTFSLFQQLIQSSFVVERQPCMPTHPQRPLVLKTGVQFTVKLRLLVKLQELNYNL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 KVKVLFDKDVNERNTVKGFRKFNILGTHTKVMNMEESTNGSLAAEFRHLQLKEQKNAGTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KVKVLFDKDVNERNTVKGFRKFNILGTHTKVMNMEESTNGSLAAEFRHLQLKEQKNAGTR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 TNEGPLIVTEELHSLSFETQLCQPGLVIDLETTSLPVVVISNVSQLPSGWASILWYNMLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TNEGPLIVTEELHSLSFETQLCQPGLVIDLETTSLPVVVISNVSQLPSGWASILWYNMLV
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 AEPRNLSFFLTPPCARWAQLSEVLSWQFSSVTKRGLNVDQLNMLGEKLLGPNASPDGLIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AEPRNLSFFLTPPCARWAQLSEVLSWQFSSVTKRGLNVDQLNMLGEKLLGPNASPDGLIP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 WTRFCKENINDKNFPFWLWIESILELIKKHLLPLWNDGCIMGFISKERERALLKDQQPGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WTRFCKENINDKNFPFWLWIESILELIKKHLLPLWNDGCIMGFISKERERALLKDQQPGT
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 FLLRFSESSREGAITFTWVERSQNGGEPDFHAVEPYTKKELSAVTFPDIIRNYKVMAAEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FLLRFSESSREGAITFTWVERSQNGGEPDFHAVEPYTKKELSAVTFPDIIRNYKVMAAEN
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB3 IPENPLKYLYPNIDKDHAFGKYYSRPKEAPEPMELDGPKGTGYIKTELISVSEVHPSRLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IPENPLKYLYPNIDKDHAFGKYYSRPKEAPEPMELDGPKGTGYIKTELISVSEVHPSRLQ
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750  
pF1KB3 TTDNLLPMSPEEFDEVSRIVGSVEFDSMMNTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TTDNLLPMSPEEFDEVSRIVGSVEFDSMMNTV
              730       740       750  

>>NP_009330 (OMIM: 600555,613796,614162,614892) signal t  (750 aa)
 initn: 5010 init1: 5010 opt: 5010  Z-score: 4603.3  bits: 862.4 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 5010; 100.0% identity (100.0% similar) in 750 aa overlap (3-752:1-750)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MWMSQWYELQQLDSKFLEQVHQLYDDSFPMEIRQYLAQWLEKQDWEHAANDVSFATIRFH
         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009   MSQWYELQQLDSKFLEQVHQLYDDSFPMEIRQYLAQWLEKQDWEHAANDVSFATIRFH
                 10        20        30        40        50        

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 DLLSQLDDQYSRFSLENNFLLQHNIRKSKRNLQDNFQEDPIQMSMIIYSCLKEERKILEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 DLLSQLDDQYSRFSLENNFLLQHNIRKSKRNLQDNFQEDPIQMSMIIYSCLKEERKILEN
       60        70        80        90       100       110        

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 AQRFNQAQSGNIQSTVMLDKQKELDSKVRNVKDKVMCIEHEIKSLEDLQDEYDFKCKTLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 AQRFNQAQSGNIQSTVMLDKQKELDSKVRNVKDKVMCIEHEIKSLEDLQDEYDFKCKTLQ
      120       130       140       150       160       170        

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 NREHETNGVAKSDQKQEQLLLKKMYLMLDNKRKEVVHKIIELLNVTELTQNALINDELVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 NREHETNGVAKSDQKQEQLLLKKMYLMLDNKRKEVVHKIIELLNVTELTQNALINDELVE
      180       190       200       210       220       230        

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 WKRRQQSACIGGPPNACLDQLQNWFTIVAESLQQVRQQLKKLEELEQKYTYEHDPITKNK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 WKRRQQSACIGGPPNACLDQLQNWFTIVAESLQQVRQQLKKLEELEQKYTYEHDPITKNK
      240       250       260       270       280       290        

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 QVLWDRTFSLFQQLIQSSFVVERQPCMPTHPQRPLVLKTGVQFTVKLRLLVKLQELNYNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 QVLWDRTFSLFQQLIQSSFVVERQPCMPTHPQRPLVLKTGVQFTVKLRLLVKLQELNYNL
      300       310       320       330       340       350        

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 KVKVLFDKDVNERNTVKGFRKFNILGTHTKVMNMEESTNGSLAAEFRHLQLKEQKNAGTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 KVKVLFDKDVNERNTVKGFRKFNILGTHTKVMNMEESTNGSLAAEFRHLQLKEQKNAGTR
      360       370       380       390       400       410        

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 TNEGPLIVTEELHSLSFETQLCQPGLVIDLETTSLPVVVISNVSQLPSGWASILWYNMLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 TNEGPLIVTEELHSLSFETQLCQPGLVIDLETTSLPVVVISNVSQLPSGWASILWYNMLV
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 AEPRNLSFFLTPPCARWAQLSEVLSWQFSSVTKRGLNVDQLNMLGEKLLGPNASPDGLIP
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pF1KB3 WTRFCKENINDKNFPFWLWIESILELIKKHLLPLWNDGCIMGFISKERERALLKDQQPGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 WTRFCKENINDKNFPFWLWIESILELIKKHLLPLWNDGCIMGFISKERERALLKDQQPGT
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pF1KB3 FLLRFSESSREGAITFTWVERSQNGGEPDFHAVEPYTKKELSAVTFPDIIRNYKVMAAEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 FLLRFSESSREGAITFTWVERSQNGGEPDFHAVEPYTKKELSAVTFPDIIRNYKVMAAEN
      600       610       620       630       640       650        

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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 IPENPLKYLYPNIDKDHAFGKYYSRPKEAPEPMELDGPKGTGYIKTELISVSEVHPSRLQ
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              730       740       750  
pF1KB3 TTDNLLPMSPEEFDEVSRIVGSVEFDSMMNTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 TTDNLLPMSPEEFDEVSRIVGSVEFDSMMNTV
      720       730       740       750

>>XP_006712781 (OMIM: 600555,613796,614162,614892) PREDI  (750 aa)
 initn: 5010 init1: 5010 opt: 5010  Z-score: 4603.3  bits: 862.4 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 5010; 100.0% identity (100.0% similar) in 750 aa overlap (3-752:1-750)

               10        20        30        40        50        60
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         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006   MSQWYELQQLDSKFLEQVHQLYDDSFPMEIRQYLAQWLEKQDWEHAANDVSFATIRFH
                 10        20        30        40        50        

               70        80        90       100       110       120
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB3 KVKVLFDKDVNERNTVKGFRKFNILGTHTKVMNMEESTNGSLAAEFRHLQLKEQKNAGTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KVKVLFDKDVNERNTVKGFRKFNILGTHTKVMNMEESTNGSLAAEFRHLQLKEQKNAGTR
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pF1KB3 TNEGPLIVTEELHSLSFETQLCQPGLVIDLETTSLPVVVISNVSQLPSGWASILWYNMLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TNEGPLIVTEELHSLSFETQLCQPGLVIDLETTSLPVVVISNVSQLPSGWASILWYNMLV
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pF1KB3 AEPRNLSFFLTPPCARWAQLSEVLSWQFSSVTKRGLNVDQLNMLGEKLLGPNASPDGLIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 AEPRNLSFFLTPPCARWAQLSEVLSWQFSSVTKRGLNVDQLNMLGEKLLGPNASPDGLIP
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pF1KB3 WTRFCKENINDKNFPFWLWIESILELIKKHLLPLWNDGCIMGFISKERERALLKDQQPGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB3 FLLRFSESSREGAITFTWVERSQNGGEPDFHAVEPYTKKELSAVTFPDIIRNYKVMAAEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 FLLRFSESSREGAITFTWVERSQNGGEPDFHAVEPYTKKELSAVTFPDIIRNYKVMAAEN
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pF1KB3 IPENPLKYLYPNIDKDHAFGKYYSRPKEAPEPMELDGPKGTGYIKTELISVSEVHPSRLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 IPENPLKYLYPNIDKDHAFGKYYSRPKEAPEPMELDGPKGTGYIKTELISVSEVHPSRLQ
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              730       740       750  
pF1KB3 TTDNLLPMSPEEFDEVSRIVGSVEFDSMMNTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TTDNLLPMSPEEFDEVSRIVGSVEFDSMMNTV
      720       730       740       750

>>NP_644671 (OMIM: 600555,613796,614162,614892) signal t  (712 aa)
 initn: 4762 init1: 4762 opt: 4762  Z-score: 4376.1  bits: 820.3 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4762; 100.0% identity (100.0% similar) in 712 aa overlap (3-714:1-712)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MWMSQWYELQQLDSKFLEQVHQLYDDSFPMEIRQYLAQWLEKQDWEHAANDVSFATIRFH
         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_644   MSQWYELQQLDSKFLEQVHQLYDDSFPMEIRQYLAQWLEKQDWEHAANDVSFATIRFH
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               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 DLLSQLDDQYSRFSLENNFLLQHNIRKSKRNLQDNFQEDPIQMSMIIYSCLKEERKILEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_644 DLLSQLDDQYSRFSLENNFLLQHNIRKSKRNLQDNFQEDPIQMSMIIYSCLKEERKILEN
       60        70        80        90       100       110        

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pF1KB3 AQRFNQAQSGNIQSTVMLDKQKELDSKVRNVKDKVMCIEHEIKSLEDLQDEYDFKCKTLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_644 AQRFNQAQSGNIQSTVMLDKQKELDSKVRNVKDKVMCIEHEIKSLEDLQDEYDFKCKTLQ
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pF1KB3 NREHETNGVAKSDQKQEQLLLKKMYLMLDNKRKEVVHKIIELLNVTELTQNALINDELVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_644 NREHETNGVAKSDQKQEQLLLKKMYLMLDNKRKEVVHKIIELLNVTELTQNALINDELVE
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pF1KB3 WKRRQQSACIGGPPNACLDQLQNWFTIVAESLQQVRQQLKKLEELEQKYTYEHDPITKNK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_644 WKRRQQSACIGGPPNACLDQLQNWFTIVAESLQQVRQQLKKLEELEQKYTYEHDPITKNK
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pF1KB3 QVLWDRTFSLFQQLIQSSFVVERQPCMPTHPQRPLVLKTGVQFTVKLRLLVKLQELNYNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_644 QVLWDRTFSLFQQLIQSSFVVERQPCMPTHPQRPLVLKTGVQFTVKLRLLVKLQELNYNL
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pF1KB3 KVKVLFDKDVNERNTVKGFRKFNILGTHTKVMNMEESTNGSLAAEFRHLQLKEQKNAGTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_644 KVKVLFDKDVNERNTVKGFRKFNILGTHTKVMNMEESTNGSLAAEFRHLQLKEQKNAGTR
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pF1KB3 TNEGPLIVTEELHSLSFETQLCQPGLVIDLETTSLPVVVISNVSQLPSGWASILWYNMLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_644 TNEGPLIVTEELHSLSFETQLCQPGLVIDLETTSLPVVVISNVSQLPSGWASILWYNMLV
      420       430       440       450       460       470        

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pF1KB3 AEPRNLSFFLTPPCARWAQLSEVLSWQFSSVTKRGLNVDQLNMLGEKLLGPNASPDGLIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_644 AEPRNLSFFLTPPCARWAQLSEVLSWQFSSVTKRGLNVDQLNMLGEKLLGPNASPDGLIP
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pF1KB3 WTRFCKENINDKNFPFWLWIESILELIKKHLLPLWNDGCIMGFISKERERALLKDQQPGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_644 WTRFCKENINDKNFPFWLWIESILELIKKHLLPLWNDGCIMGFISKERERALLKDQQPGT
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pF1KB3 FLLRFSESSREGAITFTWVERSQNGGEPDFHAVEPYTKKELSAVTFPDIIRNYKVMAAEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_644 FLLRFSESSREGAITFTWVERSQNGGEPDFHAVEPYTKKELSAVTFPDIIRNYKVMAAEN
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pF1KB3 IPENPLKYLYPNIDKDHAFGKYYSRPKEAPEPMELDGPKGTGYIKTELISVSEVHPSRLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::      
NP_644 IPENPLKYLYPNIDKDHAFGKYYSRPKEAPEPMELDGPKGTGYIKTELISVSEV      
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pF1KB3 TTDNLLPMSPEEFDEVSRIVGSVEFDSMMNTV

>>XP_005257673 (OMIM: 102582,147060,615952) PREDICTED: s  (769 aa)
 initn: 2088 init1: 911 opt: 2643  Z-score: 2432.1  bits: 460.7 E(85289): 9.9e-129
Smith-Waterman score: 2643; 53.2% identity (81.3% similar) in 739 aa overlap (3-734:1-731)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MWMSQWYELQQLDSKFLEQVHQLYDDSFPMEIRQYLAQWLEKQDWEHAANDVSFATIRFH
         :.:: .:::::...:::.::::.::::::.::.:: :.:.::: .::.  : ::. ::
XP_005   MAQWNQLQQLDTRYLEQLHQLYSDSFPMELRQFLAPWIESQDWAYAASKESHATLVFH
                 10        20        30        40        50        

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 DLLSQLDDQYSRFSLENNFLLQHNIRKSKRNLQDNFQEDPIQMSMIIYSCLKEERKILEN
       .::...:.:::::  :.: : :::.:. :. ::. . : :.... :.  :: :: ..:..
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>>NP_003141 (OMIM: 102582,147060,615952) signal transduc  (769 aa)
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>>NP_644805 (OMIM: 102582,147060,615952) signal transduc  (770 aa)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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