Result of FASTA (ccds) for pF1KB3411
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3411, 899 aa
  1>>>pF1KB3411 899 - 899 aa - 899 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7016+/- 0.001; mu= 7.3750+/- 0.061
 mean_var=265.8676+/-54.481, 0's: 0 Z-trim(113.9): 108  B-trim: 669 in 1/49
 Lambda= 0.078658
 statistics sampled from 14392 (14501) to 14392 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.748), E-opt: 0.2 (0.445), width:  16
 Scan time:  4.040

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS41565.1 NFKB2 gene_id:4791|Hs108|chr10         ( 899) 6027 698.0  2e-200
CCDS41564.1 NFKB2 gene_id:4791|Hs108|chr10         ( 900) 6015 696.6 5.1e-200
CCDS54783.1 NFKB1 gene_id:4790|Hs108|chr4          ( 968)  923 118.8 4.7e-26
CCDS3657.1 NFKB1 gene_id:4790|Hs108|chr4           ( 969)  923 118.8 4.7e-26
CCDS74515.1 REL gene_id:5966|Hs108|chr2            ( 587)  523 73.2 1.6e-12
CCDS1864.1 REL gene_id:5966|Hs108|chr2             ( 619)  520 72.9   2e-12
CCDS12642.2 BCL3 gene_id:602|Hs108|chr19           ( 454)  508 71.4 4.2e-12
CCDS46110.1 RELB gene_id:5971|Hs108|chr19          ( 579)  477 68.0 5.7e-11


>>CCDS41565.1 NFKB2 gene_id:4791|Hs108|chr10              (899 aa)
 initn: 6027 init1: 6027 opt: 6027  Z-score: 3711.8  bits: 698.0 E(32554): 2e-200
Smith-Waterman score: 6027; 100.0% identity (100.0% similar) in 899 aa overlap (1-899:1-899)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MESCYNPGLDGIIEYDDFKLNSSIVEPKEPAPETADGPYLVIVEQPKQRGFRFRYGCEGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MESCYNPGLDGIIEYDDFKLNSSIVEPKEPAPETADGPYLVIVEQPKQRGFRFRYGCEGP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 SHGGLPGASSEKGRKTYPTVKICNYEGPAKIEVDLVTHSDPPRAHAHSLVGKQCSELGIC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SHGGLPGASSEKGRKTYPTVKICNYEGPAKIEVDLVTHSDPPRAHAHSLVGKQCSELGIC
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 AVSVGPKDMTAQFNNLGVLHVTKKNMMGTMIQKLQRQRLRSRPQGLTEAEQRELEQEAKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AVSVGPKDMTAQFNNLGVLHVTKKNMMGTMIQKLQRQRLRSRPQGLTEAEQRELEQEAKE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 LKKVMDLSIVRLRFSAFLRASDGSFSLPLKPVISQPIHDSKSPGASNLKISRMDKTAGSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LKKVMDLSIVRLRFSAFLRASDGSFSLPLKPVISQPIHDSKSPGASNLKISRMDKTAGSV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 RGGDEVYLLCDKVQKDDIEVRFYEDDENGWQAFGDFSPTDVHKQYAIVFRTPPYHKMKIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RGGDEVYLLCDKVQKDDIEVRFYEDDENGWQAFGDFSPTDVHKQYAIVFRTPPYHKMKIE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 RPVTVFLQLKRKRGGDVSDSKQFTYYPLVEDKEEVQRKRRKALPTFSQPFGGGSHMGGGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RPVTVFLQLKRKRGGDVSDSKQFTYYPLVEDKEEVQRKRRKALPTFSQPFGGGSHMGGGS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 GGAAGGYGGAGGGGSLGFFPSSLAYSPYQSGAGPMGCYPGGGGGAQMAATVPSRDSGEEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GGAAGGYGGAGGGGSLGFFPSSLAYSPYQSGAGPMGCYPGGGGGAQMAATVPSRDSGEEA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 AEPSAPSRTPQCEPQAPEMLQRAREYNARLFGLAQRSARALLDYGVTADARALLAGQRHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AEPSAPSRTPQCEPQAPEMLQRAREYNARLFGLAQRSARALLDYGVTADARALLAGQRHL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 LTAQDENGDTPLHLAIIHGQTSVIEQIVYVIHHAQDLGVVNLTNHLHQTPLHLAVITGQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LTAQDENGDTPLHLAIIHGQTSVIEQIVYVIHHAQDLGVVNLTNHLHQTPLHLAVITGQT
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 SVVSFLLRVGADPALLDRHGDSAMHLALRAGAGAPELLRALLQSGAPAVPQLLHMPDFEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SVVSFLLRVGADPALLDRHGDSAMHLALRAGAGAPELLRALLQSGAPAVPQLLHMPDFEG
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 LYPVHLAVRARSPECLDLLVDSGAEVEATERQGGRTALHLATEMEELGLVTHLVTKLRAN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LYPVHLAVRARSPECLDLLVDSGAEVEATERQGGRTALHLATEMEELGLVTHLVTKLRAN
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB3 VNARTFAGNTPLHLAAGLGYPTLTRLLLKAGADIHAENEEPLCPLPSPPTSDSDSDSEGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VNARTFAGNTPLHLAAGLGYPTLTRLLLKAGADIHAENEEPLCPLPSPPTSDSDSDSEGP
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB3 EKDTRSSFRGHTPLDLTCSTKVKTLLLNAAQNTMEPPLTPPSPAGPGLSLGDTALQNLEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EKDTRSSFRGHTPLDLTCSTKVKTLLLNAAQNTMEPPLTPPSPAGPGLSLGDTALQNLEQ
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB3 LLDGPEAQGSWAELAERLGLRSLVDTYRQTTSPSGSLLRSYELAGGDLAGLLEALSDMGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LLDGPEAQGSWAELAERLGLRSLVDTYRQTTSPSGSLLRSYELAGGDLAGLLEALSDMGL
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890         
pF1KB3 EEGVRLLRGPETRDKLPSTEVKEDSAYGSQSVEQEAEKLGPPPEPPGGLCHGHPQPQVH
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EEGVRLLRGPETRDKLPSTEVKEDSAYGSQSVEQEAEKLGPPPEPPGGLCHGHPQPQVH
              850       860       870       880       890         

>>CCDS41564.1 NFKB2 gene_id:4791|Hs108|chr10              (900 aa)
 initn: 5942 init1: 5747 opt: 6015  Z-score: 3704.4  bits: 696.6 E(32554): 5.1e-200
Smith-Waterman score: 6015; 99.9% identity (99.9% similar) in 900 aa overlap (1-899:1-900)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MESCYNPGLDGIIEYDDFKLNSSIVEPKEPAPETADGPYLVIVEQPKQRGFRFRYGCEGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MESCYNPGLDGIIEYDDFKLNSSIVEPKEPAPETADGPYLVIVEQPKQRGFRFRYGCEGP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 SHGGLPGASSEKGRKTYPTVKICNYEGPAKIEVDLVTHSDPPRAHAHSLVGKQCSELGIC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SHGGLPGASSEKGRKTYPTVKICNYEGPAKIEVDLVTHSDPPRAHAHSLVGKQCSELGIC
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 AVSVGPKDMTAQFNNLGVLHVTKKNMMGTMIQKLQRQRLRSRPQGLTEAEQRELEQEAKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AVSVGPKDMTAQFNNLGVLHVTKKNMMGTMIQKLQRQRLRSRPQGLTEAEQRELEQEAKE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 LKKVMDLSIVRLRFSAFLRASDGSFSLPLKPVISQPIHDSKSPGASNLKISRMDKTAGSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LKKVMDLSIVRLRFSAFLRASDGSFSLPLKPVISQPIHDSKSPGASNLKISRMDKTAGSV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 RGGDEVYLLCDKVQKDDIEVRFYEDDENGWQAFGDFSPTDVHKQYAIVFRTPPYHKMKIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RGGDEVYLLCDKVQKDDIEVRFYEDDENGWQAFGDFSPTDVHKQYAIVFRTPPYHKMKIE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 RPVTVFLQLKRKRGGDVSDSKQFTYYPLVEDKEEVQRKRRKALPTFSQPFGGGSHMGGGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RPVTVFLQLKRKRGGDVSDSKQFTYYPLVEDKEEVQRKRRKALPTFSQPFGGGSHMGGGS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 GGAAGGYGGAGGGGSLGFFPSSLAYSPYQSGAGPMGCYPGGGGGAQMAATVPSRDSGEEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GGAAGGYGGAGGGGSLGFFPSSLAYSPYQSGAGPMGCYPGGGGGAQMAATVPSRDSGEEA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 AEPSAPSRTPQCEPQAPEMLQRAREYNARLFGLAQRSARALLDYGVTADARALLAGQRHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AEPSAPSRTPQCEPQAPEMLQRAREYNARLFGLAQRSARALLDYGVTADARALLAGQRHL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 LTAQDENGDTPLHLAIIHGQTSVIEQIVYVIHHAQDLGVVNLTNHLHQTPLHLAVITGQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LTAQDENGDTPLHLAIIHGQTSVIEQIVYVIHHAQDLGVVNLTNHLHQTPLHLAVITGQT
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 SVVSFLLRVGADPALLDRHGDSAMHLALRAGAGAPELLRALLQSGAPAVPQLLHMPDFEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SVVSFLLRVGADPALLDRHGDSAMHLALRAGAGAPELLRALLQSGAPAVPQLLHMPDFEG
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 LYPVHLAVRARSPECLDLLVDSGAEVEATERQGGRTALHLATEMEELGLVTHLVTKLRAN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LYPVHLAVRARSPECLDLLVDSGAEVEATERQGGRTALHLATEMEELGLVTHLVTKLRAN
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB3 VNARTFAGNTPLHLAAGLGYPTLTRLLLKAGADIHAENEEPLCPLPSPPTSDSDSDSEGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VNARTFAGNTPLHLAAGLGYPTLTRLLLKAGADIHAENEEPLCPLPSPPTSDSDSDSEGP
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB3 EKDTRSSFRGHTPLDLTCSTKVKTLLLNAAQNTMEPPLTPPSPAGPGLSLGDTALQNLEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EKDTRSSFRGHTPLDLTCSTKVKTLLLNAAQNTMEPPLTPPSPAGPGLSLGDTALQNLEQ
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB3 LLDGPEAQGSWAELAERLGLRSLVDTYRQTTSPSGSLLRSYELAGGDLAGLLEALSDMGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LLDGPEAQGSWAELAERLGLRSLVDTYRQTTSPSGSLLRSYELAGGDLAGLLEALSDMGL
              790       800       810       820       830       840

              850        860       870       880       890         
pF1KB3 EEGVRLLRGPETRDKLPST-EVKEDSAYGSQSVEQEAEKLGPPPEPPGGLCHGHPQPQVH
       ::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EEGVRLLRGPETRDKLPSTAEVKEDSAYGSQSVEQEAEKLGPPPEPPGGLCHGHPQPQVH
              850       860       870       880       890       900

>>CCDS54783.1 NFKB1 gene_id:4790|Hs108|chr4               (968 aa)
 initn: 1759 init1: 463 opt: 923  Z-score: 581.2  bits: 118.8 E(32554): 4.7e-26
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CCDS54 MAEDDPYLGRPEQMFHLDPSLTHTIFNPEVFQPQMALPTDGPYLQILEQPKQRGFRFRYV
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       ::::::::::::::::..:.:: :::::: ::::. :.:::..   . ::::::::.: :
CCDS54 CEGPSHGGLPGASSEKNKKSYPQVKICNYVGPAKVIVQLVTNGKNIHLHAHSLVGKHC-E
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        :::.:..:::::.. : :::.::::::... :.  .. .  .:.   ::         .
CCDS54 DGICTVTAGPKDMVVGFANLGILHVTKKKVFETLEARMTEACIRGYNPGLLVHPDLAYLQ
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       ::   .:.: .. :::         : ::::.::: :.:::  : :::.  :.::.:. :
CCDS54 AEGGGDRQLGDREKELIRQAALQQTKEMDLSVVRLMFTAFLPDSTGSFTRRLEPVVSDAI
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       .:::.:.:::::: :::.::: : ::.:.::::::::::::..::::..:::  :..:::
CCDS54 YDSKAPNASNLKIVRMDRTAGCVTGGEEIYLLCDKVQKDDIQIRFYEEEENGGVWEGFGD
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       :::::::.:.::::.:: :. ..: .:..::.::.::   ..:. : : ::: ..:::::
CCDS54 FSPTDVHRQFAIVFKTPKYKDINITKPASVFVQLRRKSDLETSEPKPFLYYPEIKDKEEV
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pF1KB3 QRKRRKALPTFSQPFGGGSHMGGGSGGAAGGYGGAGGGGSLG----F----FPS--SLAY
       ::::.: .:.::. :::::  :.:.::  :. ::.:: :: :    :    ::.  ....
CCDS54 QRKRQKLMPNFSDSFGGGSGAGAGGGGMFGSGGGGGGTGSTGPGYSFPHYGFPTYGGITF
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pF1KB3 SP--YQSGAG-------------PMGCYPGGGGGA--QMAATVPSRDSGEEAAEPSAP--
        :   .:.::             : ::  .   ..   .. .. . .. .: .: ..   
CCDS54 HPGTTKSNAGMKHGTMDTESKKDPEGCDKSDDKNTVNLFGKVIETTEQDQEPSEATVGNG
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pF1KB3 --SRTPQCEPQAPEMLQRAREYNARLFGLAQRSARALLDYGVTADARALLAGQRHLLTAQ
         . :     .      .   .  . . ::.: : ::.::.::.:.. ::: :::: ..:
CCDS54 EVTLTYATGTKEESAGVQDNLFLEKAMQLAKRHANALFDYAVTGDVKMLLAVQRHLTAVQ
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pF1KB3 DENGDTPLHLAIIHGQTSVIEQIVYVIHHAQDLGVVNLTNHLHQTPLHLAVITGQTSVVS
       :::::. ::::::: ......... :     .  ..:. : :.:::::::::: : .:: 
CCDS54 DENGDSVLHLAIIHLHSQLVRDLLEVTSGLISDDIINMRNDLYQTPLHLAVITKQEDVVE
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pF1KB3 FLLRVGADPALLDRHGDSAMHLALRAGAGAPELLRALLQSGAPAVPQLLHMPDFEGLYPV
        :::.::: .:::: :.:..:::  :  :  ..:  ::.    :.  ::  :. .::  .
CCDS54 DLLRAGADLSLLDRLGNSVLHLA--AKEGHDKVLSILLKHKKAAL--LLDHPNGDGLNAI
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pF1KB3 HLAVRARSPECLDLLVDSGAEVEATERQGGRTALHLATEMEELGLVTHLVTKLRANVNAR
       :::. . :  :: ::: .::.:.: :...::::::::.: ....:.  :. .  :.:.. 
CCDS54 HLAMMSNSLPCLLLLVAAGADVNAQEQKSGRTALHLAVEHDNISLAGCLLLEGDAHVDST
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pF1KB3 TFAGNTPLHLAAGLGYPTLTRLLLKAGADIHAENEEPLCPLPSPPTSDSDSDSEGPEKDT
       :. :.::::.::: :   :. ::  ::::  .:: :::         : :.. :.  .: 
CCDS54 TYDGTTPLHIAAGRGSTRLAALLKAAGADPLVENFEPL--------YDLDDSWENAGED-
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pF1KB3 RSSFRGHTPLDLTCSTKVKTLLLNAAQNTMEPPLTPPS--PAGPGLSLGDTALQNLEQLL
       ..   : ::::.. : .:  .: :.  . .:: .:  .    :   .:.. .  .: .::
CCDS54 EGVVPGTTPLDMATSWQVFDIL-NG--KPYEPEFTSDDLLAQGDMKQLAEDVKLQLYKLL
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pF1KB3 DGPEAQGSWAELAERLGLRSLVDTYRQTTSPSGSLLRSYELAGGDLAGLLEALSDMGLEE
       . :. . .:: ::..:::  : ...: . .:: .:. .::..:: .  :.::: .::  :
CCDS54 EIPDPDKNWATLAQKLGLGILNNAFRLSPAPSKTLMDNYEVSGGTVRELVEALRQMGYTE
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pF1KB3 GVRLLRGPETRDKLPSTEVKEDSAYGSQSVEQEAEKLGPPPEPPGGLCHGHPQPQVH   
       .......  .  :  :                                            
CCDS54 AIEVIQAASSPVKTTSQAHSLPLSPASTRQQIDELRDSDSVCDSGVETSFRKLSFTESLT
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>>CCDS3657.1 NFKB1 gene_id:4790|Hs108|chr4                (969 aa)
 initn: 1769 init1: 463 opt: 923  Z-score: 581.2  bits: 118.8 E(32554): 4.7e-26
Smith-Waterman score: 2249; 44.9% identity (68.6% similar) in 893 aa overlap (20-858:26-900)

                     10        20        30        40        50    
pF1KB3       MESCYNPGLDGIIEYDDFKLNSSIVEPKEPAPETADGPYLVIVEQPKQRGFRFR
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CCDS36 MAEDDPYLGRPEQMFHLDPSLTHTIFNPEVFQPQMALP-TADGPYLQILEQPKQRGFRFR
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pF1KB3 YGCEGPSHGGLPGASSEKGRKTYPTVKICNYEGPAKIEVDLVTHSDPPRAHAHSLVGKQC
       : ::::::::::::::::..:.:: :::::: ::::. :.:::..   . ::::::::.:
CCDS36 YVCEGPSHGGLPGASSEKNKKSYPQVKICNYVGPAKVIVQLVTNGKNIHLHAHSLVGKHC
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pF1KB3 SELGICAVSVGPKDMTAQFNNLGVLHVTKKNMMGTMIQKLQRQRLRSRPQGLT-------
        : :::.:..:::::.. : :::.::::::... :.  .. .  .:.   ::        
CCDS36 -EDGICTVTAGPKDMVVGFANLGILHVTKKKVFETLEARMTEACIRGYNPGLLVHPDLAY
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pF1KB3 -EAE---QRELEQEAKEL--------KKVMDLSIVRLRFSAFLRASDGSFSLPLKPVISQ
        .::   .:.: .. :::         : ::::.::: :.:::  : :::.  :.::.:.
CCDS36 LQAEGGGDRQLGDREKELIRQAALQQTKEMDLSVVRLMFTAFLPDSTGSFTRRLEPVVSD
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pF1KB3 PIHDSKSPGASNLKISRMDKTAGSVRGGDEVYLLCDKVQKDDIEVRFYEDDENG--WQAF
        :.:::.:.:::::: :::.::: : ::.:.::::::::::::..::::..:::  :..:
CCDS36 AIYDSKAPNASNLKIVRMDRTAGCVTGGEEIYLLCDKVQKDDIQIRFYEEEENGGVWEGF
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pF1KB3 GDFSPTDVHKQYAIVFRTPPYHKMKIERPVTVFLQLKRKRGGDVSDSKQFTYYPLVEDKE
       :::::::::.:.::::.:: :. ..: .:..::.::.::   ..:. : : ::: ..:::
CCDS36 GDFSPTDVHRQFAIVFKTPKYKDINITKPASVFVQLRRKSDLETSEPKPFLYYPEIKDKE
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pF1KB3 EVQRKRRKALPTFSQPFGGGSHMGGGSGGAAGGYGGAGGGGSLG----F----FPS--SL
       ::::::.: .:.::. :::::  :.:.::  :. ::.:: :: :    :    ::.  ..
CCDS36 EVQRKRQKLMPNFSDSFGGGSGAGAGGGGMFGSGGGGGGTGSTGPGYSFPHYGFPTYGGI
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pF1KB3 AYSP--YQSGAG-------------PMGCYPGGGGGA--QMAATVPSRDSGEEAAEPSAP
       .. :   .:.::             : ::  .   ..   .. .. . .. .: .: .. 
CCDS36 TFHPGTTKSNAGMKHGTMDTESKKDPEGCDKSDDKNTVNLFGKVIETTEQDQEPSEATVG
      420       430       440       450       460       470        

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pF1KB3 ----SRTPQCEPQAPEMLQRAREYNARLFGLAQRSARALLDYGVTADARALLAGQRHLLT
           . :     .      .   .  . . ::.: : ::.::.::.:.. ::: :::: .
CCDS36 NGEVTLTYATGTKEESAGVQDNLFLEKAMQLAKRHANALFDYAVTGDVKMLLAVQRHLTA
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pF1KB3 AQDENGDTPLHLAIIHGQTSVIEQIVYVIHHAQDLGVVNLTNHLHQTPLHLAVITGQTSV
       .::::::. ::::::: ......... :     .  ..:. : :.:::::::::: : .:
CCDS36 VQDENGDSVLHLAIIHLHSQLVRDLLEVTSGLISDDIINMRNDLYQTPLHLAVITKQEDV
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pF1KB3 VSFLLRVGADPALLDRHGDSAMHLALRAGAGAPELLRALLQSGAPAVPQLLHMPDFEGLY
       :  :::.::: .:::: :.:..:::  :  :  ..:  ::.    :.  ::  :. .:: 
CCDS36 VEDLLRAGADLSLLDRLGNSVLHLA--AKEGHDKVLSILLKHKKAAL--LLDHPNGDGLN
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pF1KB3 PVHLAVRARSPECLDLLVDSGAEVEATERQGGRTALHLATEMEELGLVTHLVTKLRANVN
        .:::. . :  :: ::: .::.:.: :...::::::::.: ....:.  :. .  :.:.
CCDS36 AIHLAMMSNSLPCLLLLVAAGADVNAQEQKSGRTALHLAVEHDNISLAGCLLLEGDAHVD
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pF1KB3 ARTFAGNTPLHLAAGLGYPTLTRLLLKAGADIHAENEEPLCPLPSPPTSDSDSDSEGPEK
       . :. :.::::.::: :   :. ::  ::::  .:: :::  :      :.. .. : ..
CCDS36 STTYDGTTPLHIAAGRGSTRLAALLKAAGADPLVENFEPLYDL------DDSWENAGEDE
          720       730       740       750             760        

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pF1KB3 DTRSSFRGHTPLDLTCSTKVKTLLLNAAQNTMEPPLTPPS--PAGPGLSLGDTALQNLEQ
        .     : ::::.. : .:  .: :.  . .:: .:  .    :   .:.. .  .: .
CCDS36 GVVP---GTTPLDMATSWQVFDIL-NG--KPYEPEFTSDDLLAQGDMKQLAEDVKLQLYK
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pF1KB3 LLDGPEAQGSWAELAERLGLRSLVDTYRQTTSPSGSLLRSYELAGGDLAGLLEALSDMGL
       ::. :. . .:: ::..:::  : ...: . .:: .:. .::..:: .  :.::: .:: 
CCDS36 LLEIPDPDKNWATLAQKLGLGILNNAFRLSPAPSKTLMDNYEVSGGTVRELVEALRQMGY
            830       840       850       860       870       880  

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pF1KB3 EEGVRLLRGPETRDKLPSTEVKEDSAYGSQSVEQEAEKLGPPPEPPGGLCHGHPQPQVH 
        :.......  .  :  :                                          
CCDS36 TEAIEVIQAASSPVKTTSQAHSLPLSPASTRQQIDELRDSDSVCDSGVETSFRKLSFTES
            890       900       910       920       930       940  

>>CCDS74515.1 REL gene_id:5966|Hs108|chr2                 (587 aa)
 initn: 785 init1: 322 opt: 523  Z-score: 338.5  bits: 73.2 E(32554): 1.6e-12
Smith-Waterman score: 847; 37.3% identity (63.2% similar) in 410 aa overlap (35-434:5-395)

           10        20        30        40        50        60    
pF1KB3 YNPGLDGIIEYDDFKLNSSIVEPKEPAPETADGPYLVIVEQPKQRGFRFRYGCEGPSHGG
                                     : .::. :.:::.:::.:::: ::: : :.
CCDS74                           MASGAYNPYIEIIEQPRQRGMRFRYKCEGRSAGS
                                         10        20        30    

           70        80        90       100       110       120    
pF1KB3 LPGASSEKGRKTYPTVKICNYEGPAKIEVDLVTHSDPPRAHAHSLVGKQCSELGICAVSV
       .::  :  . .:::...: :: : .:... :::..:: . : :.::::.: . :   .  
CCDS74 IPGEHSTDNNRTYPSIQIMNYYGKGKVRITLVTKNDPYKPHPHDLVGKDCRD-GYYEAEF
           40        50        60        70        80         90   

          130       140       150       160       170       180    
pF1KB3 GPKDMTAQFNNLGVLHVTKKNMMGTMIQKLQRQRLRSRPQGLTEAEQRELEQEAKELKKV
       : .     :.:::.  : ::..  ..: ..   .    : .. : .  ..:.        
CCDS74 GQERRPLFFQNLGIRCVKKKEVKEAIITRI---KAGINPFNVPEKQLNDIED--------
           100       110       120          130       140          

          190       200       210       220       230       240    
pF1KB3 MDLSIVRLRFSAFLRASDGSFSLPLKPVISQPIHDSKSPGASNLKISRMDKTAGSVRGGD
        ::..::: :..::    :...  : ::.:.::.:...:....:.: :..:. :::::::
CCDS74 CDLNVVRLCFQVFLPDEHGNLTTALPPVVSNPIYDNRAPNTAELRICRVNKNCGSVRGGD
            150       160       170       180       190       200  

          250       260       270       280       290       300    
pF1KB3 EVYLLCDKVQKDDIEVRFYEDDENGWQAFGDFSPTDVHKQYAIVFRTPPYHKMKIERPVT
       :..:::::::::::::::  .:   :.: : :: .:::.: ::::.:::: :  : .:::
CCDS74 EIFLLCDKVQKDDIEVRFVLND---WEAKGIFSQADVHRQVAIVFKTPPYCKA-ITEPVT
            210       220          230       240       250         

          310       320       330       340       350       360    
pF1KB3 VFLQLKRKRGGDVSDSKQFTYYPLVEDKEEVQRKRRKALPTFSQPFGGGSHMGGGSGGAA
       : .::.:    .::.: .: : :  .:    . :..:.   :..     .:..       
CCDS74 VKMQLRRPSDQEVSESMDFRYLPDEKDTYGNKAKKQKTTLLFQKLC--QDHVNFPERPRP
      260       270       280       290       300         310      

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pF1KB3 GGYGGAGGGGSLGFFPSSLAYS------PYQSGAGPMGCYPGGG----GGAQMAATVPSR
       :  :. : :  .   :. ....      :   ..   . ::. :    : .. :. .:  
CCDS74 GLLGSIGEGRYFKKEPNLFSHDAVVREMPTGVSSQAESYYPSPGPISSGLSHHASMAPLP
        320       330       340       350       360       370      

          420       430       440       450       460       470    
pF1KB3 DSGEEAAEPSAPSRTPQCEPQAPEMLQRAREYNARLFGLAQRSARALLDYGVTADARALL
       .:.  ..   .: :. . .:                                        
CCDS74 SSSWSSVAHPTP-RSGNTNPLSSFSTRTLPSNSQGIPPFLRIPVGNDLNASNACIYNNAD
        380        390       400       410       420       430     

>>CCDS1864.1 REL gene_id:5966|Hs108|chr2                  (619 aa)
 initn: 785 init1: 322 opt: 520  Z-score: 336.4  bits: 72.9 E(32554): 2e-12
Smith-Waterman score: 844; 43.3% identity (68.8% similar) in 314 aa overlap (35-348:5-302)

           10        20        30        40        50        60    
pF1KB3 YNPGLDGIIEYDDFKLNSSIVEPKEPAPETADGPYLVIVEQPKQRGFRFRYGCEGPSHGG
                                     : .::. :.:::.:::.:::: ::: : :.
CCDS18                           MASGAYNPYIEIIEQPRQRGMRFRYKCEGRSAGS
                                         10        20        30    

           70        80        90       100       110       120    
pF1KB3 LPGASSEKGRKTYPTVKICNYEGPAKIEVDLVTHSDPPRAHAHSLVGKQCSELGICAVSV
       .::  :  . .:::...: :: : .:... :::..:: . : :.::::.: . :   .  
CCDS18 IPGEHSTDNNRTYPSIQIMNYYGKGKVRITLVTKNDPYKPHPHDLVGKDCRD-GYYEAEF
           40        50        60        70        80         90   

          130       140       150       160       170       180    
pF1KB3 GPKDMTAQFNNLGVLHVTKKNMMGTMIQKLQRQRLRSRPQGLTEAEQRELEQEAKELKKV
       : .     :.:::.  : ::..  ..: ...       : .. : .  ..:.        
CCDS18 GQERRPLFFQNLGIRCVKKKEVKEAIITRIKAG---INPFNVPEKQLNDIED--------
           100       110       120          130       140          

          190       200       210       220       230       240    
pF1KB3 MDLSIVRLRFSAFLRASDGSFSLPLKPVISQPIHDSKSPGASNLKISRMDKTAGSVRGGD
        ::..::: :..::    :...  : ::.:.::.:...:....:.: :..:. :::::::
CCDS18 CDLNVVRLCFQVFLPDEHGNLTTALPPVVSNPIYDNRAPNTAELRICRVNKNCGSVRGGD
            150       160       170       180       190       200  

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pF1KB3 EVYLLCDKVQKDDIEVRFYEDDENGWQAFGDFSPTDVHKQYAIVFRTPPYHKMKIERPVT
       :..:::::::::::::::  .:   :.: : :: .:::.: ::::.:::: :  : .:::
CCDS18 EIFLLCDKVQKDDIEVRFVLND---WEAKGIFSQADVHRQVAIVFKTPPYCKA-ITEPVT
            210       220          230       240       250         

          310       320       330       340       350       360    
pF1KB3 VFLQLKRKRGGDVSDSKQFTYYPLVEDKEEVQRKRRKALPTFSQPFGGGSHMGGGSGGAA
       : .::.:    .::.: .: : :  .:    . :..:.   :..                
CCDS18 VKMQLRRPSDQEVSESMDFRYLPDEKDTYGNKAKKQKTTLLFQKLCQDHVETGFRHVDQD
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pF1KB3 GGYGGAGGGGSLGFFPSSLAYSPYQSGAGPMGCYPGGGGGAQMAATVPSRDSGEEAAEPS
                                                                   
CCDS18 GLELLTSGDPPTLASQSAGITVNFPERPRPGLLGSIGEGRYFKKEPNLFSHDAVVREMPT
      320       330       340       350       360       370        

>>CCDS12642.2 BCL3 gene_id:602|Hs108|chr19                (454 aa)
 initn: 506 init1: 177 opt: 508  Z-score: 330.7  bits: 71.4 E(32554): 4.2e-12
Smith-Waterman score: 509; 34.3% identity (64.4% similar) in 306 aa overlap (480-770:127-416)

     450       460       470       480       490       500         
pF1KB3 LFGLAQRSARALLDYGVTADARALLAGQRHLLTAQDENGDTPLHLAIIHGQTSVIEQIVY
                                     . :  ::.::::::.:...:.  .....: 
CCDS12 MGSPFPLVNLPTPLYPMMCPMEHPLSADIAMATRADEDGDTPLHIAVVQGNLPAVHRLVN
        100       110       120       130       140       150      

     510       520       530       540       550       560         
pF1KB3 VIHHAQDLGVVNLTNHLHQTPLHLAVITGQTSVVSFLLRVGADPALLDRHGDSAMHLALR
       ...  :    ... :.:.::::::::::   ::: .:. .::.:  :::::..: ::: .
CCDS12 LFQ--QGGRELDIYNNLRQTPLHLAVITTLPSVVRLLVTAGASPMALDRHGQTAAHLACE
          160       170       180       190       200       210    

     570       580       590       600       610       620         
pF1KB3 AGAGAPELLRALLQSGAPAVPQLLHMPDFEGLYPVHLAVRARSPECLDLLVDSGAEVEAT
           .:  :::::.:.::.. .: .  ...::  .:.:: ..  : ..::.. ::...:.
CCDS12 HR--SPTCLRALLDSAAPGTLDL-EARNYDGLTALHVAVNTECQETVQLLLERGADIDAV
            220       230        240       250       260       270 

     630       640       650       660       670       680         
pF1KB3 ERQGGRTALHLATEMEELGLVTHLVTKLRANVNARTFAGNTPLHLAAGLGYPTLTRLLLK
       . ..::. :  :.: . :..: .:. .  :::::. ..:.. :: :.: :   :.: :..
CCDS12 DIKSGRSPLIHAVENNSLSMV-QLLLQHGANVNAQMYSGSSALHSASGRGLLPLVRTLVR
             280       290        300       310       320       330

     690       700                      710       720       730    
pF1KB3 AGADIHAENEEPLCPL---------------PSPPTSDSDSDSEGPEKDTRSSFRGHTPL
       .:::   .: .   ::                . :.: :. :  .:.... .:     : 
CCDS12 SGADSSLKNCHNDTPLMVARSRRVIDILRGKATRPASTSQPDP-SPDRSANTS-----P-
              340       350       360       370        380         

          740       750       760       770       780       790    
pF1KB3 DLTCSTKVKTLLLNAAQNTMEPPLTPPSPAGPGLSLGDTALQNLEQLLDGPEAQGSWAEL
           :.....  : .:. .  :  .::    ::. .                        
CCDS12 --ESSSRLSSNGLLSASPSSSPSQSPPRDP-PGFPMAPPNFFLPSPSPPAFLPFAGVLRG
             390       400       410        420       430       440

          800       810       820       830       840       850    
pF1KB3 AERLGLRSLVDTYRQTTSPSGSLLRSYELAGGDLAGLLEALSDMGLEEGVRLLRGPETRD
                                                                   
CCDS12 PGRPVPPSPAPGGS                                              
              450                                                  

>>CCDS46110.1 RELB gene_id:5971|Hs108|chr19               (579 aa)
 initn: 551 init1: 228 opt: 477  Z-score: 310.4  bits: 68.0 E(32554): 5.7e-11
Smith-Waterman score: 782; 37.2% identity (63.0% similar) in 422 aa overlap (30-437:117-509)

                10        20        30        40        50         
pF1KB3  MESCYNPGLDGIIEYDDFKLNSSIVEPKEPAPETADGPYLVIVEQPKQRGFRFRYGCEG
                                     :::  .  :.:::.:::::::.:::: :::
CCDS46 AASLSTVTLGPVAPPATPPPWGCPLGRLVSPAPGPGPQPHLVITEQPKQRGMRFRYECEG
         90       100       110       120       130       140      

      60        70        80        90         100       110       
pF1KB3 PSHGGLPGASSEKGRKTYPTVKICNYEGPAKIEVD--LVTHSDPPRAHAHSLVGKQCSEL
        : :.. : :: .. :: :.... .  :  ..::   :: .. : :.: ::::::.:.. 
CCDS46 RSAGSILGESSTEASKTLPAIELRDCGGLREVEVTACLVWKDWPHRVHPHSLVGKDCTD-
        150       160       170       180       190       200      

       120        130       140       150       160       170      
pF1KB3 GICAVSVGPK-DMTAQFNNLGVLHVTKKNMMGTMIQKLQRQRLRSRPQGLTEAEQRELEQ
       ::: : . :. .   .:::::.  : ::.. ... .:.:         :.   .   :..
CCDS46 GICRVRLRPHVSPRHSFNNLGIQCVRKKEIEAAIERKIQ--------LGIDPYNAGSLKN
         210       220       230       240               250       

        180       190       200       210       220       230      
pF1KB3 EAKELKKVMDLSIVRLRFSAFLRASDGSFSLPLKPVISQPIHDSKSPGASNLKISRMDKT
       . .     .:...::. :.:  : ..:..   . ::.:.:..:.:: ..:.:.: :..: 
CCDS46 HQE-----VDMNVVRICFQASYRDQQGQMRR-MDPVLSEPVYDKKSTNTSELRICRINKE
       260            270       280        290       300       310 

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB3 AGSVRGGDEVYLLCDKVQKDDIEVRFYEDDENGWQAFGDFSPTDVHKQYAIVFRTPPYHK
       .:   ::.:.:::::::::.:: : :   .. .:.. .::: .:::.: ::::.::::. 
CCDS46 SGPCTGGEELYLLCDKVQKEDISVVF---SRASWEGRADFSQADVHRQIAIVFKTPPYED
             320       330          340       350       360        

        300       310       320       330       340             350
pF1KB3 MKIERPVTVFLQLKRKRGGDVSDSKQFTYYPLVEDKEEVQRKRRKALPTF------SQPF
       ..: .:::: . :.:   :  :.   ::: :  .:.  :..::....:        :.: 
CCDS46 LEIVEPVTVNVFLQRLTDGVCSEPLPFTYLPRDHDSYGVDKKRKRGMPDVLGELNSSDPH
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