Result of FASTA (ccds) for pF1KB3404
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3404, 1691 aa
  1>>>pF1KB3404 1691 - 1691 aa - 1691 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 17.0763+/-0.00157; mu= -32.4707+/- 0.092
 mean_var=762.7851+/-164.931, 0's: 0 Z-trim(109.3): 467  B-trim: 0 in 0/55
 Lambda= 0.046438
 statistics sampled from 10358 (10796) to 10358 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.653), E-opt: 0.2 (0.332), width:  16
 Scan time:  5.260

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS1558.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1        (1719) 6289 438.9 7.2e-122
CCDS1559.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1        (1638) 5004 352.8 5.7e-96
CCDS9978.1 CDC42BPB gene_id:9578|Hs108|chr14       (1711) 4383 311.2   2e-83
CCDS31601.1 CDC42BPG gene_id:55561|Hs108|chr11     (1551) 2148 161.4 2.2e-38
CCDS12674.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19          ( 629) 1726 132.9 3.4e-30
CCDS74400.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19          ( 530) 1712 131.9 5.8e-30
CCDS46118.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19          ( 624) 1712 131.9 6.6e-30
CCDS46117.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19          ( 625) 1712 131.9 6.6e-30
CCDS46119.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19          ( 639) 1594 124.0 1.6e-27
CCDS11870.2 ROCK1 gene_id:6093|Hs108|chr18         (1354) 1528 119.8 6.2e-26
CCDS42654.1 ROCK2 gene_id:9475|Hs108|chr2          (1388) 1519 119.3 9.7e-26
CCDS55891.1 CIT gene_id:11113|Hs108|chr12          (2069) 1392 110.9 4.8e-23
CCDS9192.1 CIT gene_id:11113|Hs108|chr12           (2027) 1358 108.6 2.3e-22


>>CCDS1558.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1             (1719 aa)
 initn: 6289 init1: 6289 opt: 6289  Z-score: 2301.4  bits: 438.9 E(32554): 7.2e-122
Smith-Waterman score: 11092; 98.3% identity (98.4% similar) in 1719 aa overlap (1-1691:1-1719)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MSGEVRLRQLEQFILDGPAQTNGQCFSVETLLDILICLYDECNNSPLRREKNILEYLEWA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 MSGEVRLRQLEQFILDGPAQTNGQCFSVETLLDILICLYDECNNSPLRREKNILEYLEWA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 KPFTSKVKQMRLHREDFEILKVIGRGAFGEVAVVKLKNADKVFAMKILNKWEMLKRAETA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 KPFTSKVKQMRLHREDFEILKVIGRGAFGEVAVVKLKNADKVFAMKILNKWEMLKRAETA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 CFREERDVLVNGDNKWITTLHYAFQDDNNLYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDRLPEDMARF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 CFREERDVLVNGDNKWITTLHYAFQDDNNLYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDRLPEDMARF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 YLAEMVIAIDSVHQLHYVHRDIKPDNILMDMNGHIRLADFGSCLKLMEDGTVQSSVAVGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 YLAEMVIAIDSVHQLHYVHRDIKPDNILMDMNGHIRLADFGSCLKLMEDGTVQSSVAVGT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 PDYISPEILQAMEDGKGRYGPECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNHKER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 PDYISPEILQAMEDGKGRYGPECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNHKER
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 FQFPAQVTDVSENAKDLIRRLICSREHRLGQNGIEDFKKHPFFSGIDWDNIRNCEAPYIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 FQFPAQVTDVSENAKDLIRRLICSREHRLGQNGIEDFKKHPFFSGIDWDNIRNCEAPYIP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 EVSSPTDTSNFDVDDDCLKNSETMPPPTHTAFSGHHLPFVGFTYTSSCVLSDRSCLRVTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 EVSSPTDTSNFDVDDDCLKNSETMPPPTHTAFSGHHLPFVGFTYTSSCVLSDRSCLRVTA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 GPTSLDLDVNVQRTLDNNLATEAYERRIKRLEQEKLELSRKLQESTQTVQALQYSTVDGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 GPTSLDLDVNVQRTLDNNLATEAYERRIKRLEQEKLELSRKLQESTQTVQALQYSTVDGP
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 LTASKDLEIKNLKEEIEKLRKQVTESSHLEQQLEEANAVRQELDDAFRQIKAYEKQIKTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 LTASKDLEIKNLKEEIEKLRKQVTESSHLEQQLEEANAVRQELDDAFRQIKAYEKQIKTL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 QQEREDLNKELVQASERLKNQSKELKDAHCQRKLAMQEFMEINERLTELHTQKQKLARHV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 QQEREDLNKELVQASERLKNQSKELKDAHCQRKLAMQEFMEINERLTELHTQKQKLARHV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 RDKEEEVDLVMQKVESLRQELRRTERAKKELEVHTEALAAEASKDRKLREQSEHYSKQLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 RDKEEEVDLVMQKVESLRQELRRTERAKKELEVHTEALAAEASKDRKLREQSEHYSKQLE
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB3 NELEGLKQKQISYSPGVCSIEHQQEITKLKTDLEKKSIFYEEELSKREGIHANEIKNLKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 NELEGLKQKQISYSPGVCSIEHQQEITKLKTDLEKKSIFYEEELSKREGIHANEIKNLKK
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB3 ELHDSEGQQLALNKEIMILKDKLEKTRRESQSEREEFESEFKQQYEREKVLLTEENKKLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 ELHDSEGQQLALNKEIMILKDKLEKTRRESQSEREEFESEFKQQYEREKVLLTEENKKLT
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB3 SELDKLTTLYENLSIHNQQLEEEVKDLADKKESVAHWEAQITEIIQWVSDEKDARGYLQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 SELDKLTTLYENLSIHNQQLEEEVKDLADKKESVAHWEAQITEIIQWVSDEKDARGYLQA
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB3 LASKMTEELEALRNSSLGTRATDMPWKMRRFAKLDMSARLELQSALDAEIRAKQAIQEEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 LASKMTEELEALRNSSLGTRATDMPWKMRRFAKLDMSARLELQSALDAEIRAKQAIQEEL
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB3 NKVKASNIITECKLKDSEKKNLELLSEIEQLIKDTEELRSEKGIEHQDSQHSFLAFLNTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 NKVKASNIITECKLKDSEKKNLELLSEIEQLIKDTEELRSEKGIEHQDSQHSFLAFLNTP
              910       920       930       940       950       960

                                          970       980       990  
pF1KB3 TDALDQFE----------------------------RKTHQFFVKSFTTPTKCHQCTSLM
       ::::::::                            ::::::::::::::::::::::::
CCDS15 TDALDQFETVDSTPLSVHTPTLRKKGCPGSTGFPPKRKTHQFFVKSFTTPTKCHQCTSLM
              970       980       990      1000      1010      1020

           1000      1010      1020      1030      1040      1050  
pF1KB3 VGLIRQGCSCEVCGFSCHITCVNKAPTTCPVPPEQTKGPLGIDPQKGIGTAYEGHVRIPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 VGLIRQGCSCEVCGFSCHITCVNKAPTTCPVPPEQTKGPLGIDPQKGIGTAYEGHVRIPK
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

           1060      1070      1080      1090      1100      1110  
pF1KB3 PAGVKKGWQRALAIVCDFKLFLYDIAEGKASQPSVVISQVIDMRDEEFSVSSVLASDVIH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 PAGVKKGWQRALAIVCDFKLFLYDIAEGKASQPSVVISQVIDMRDEEFSVSSVLASDVIH
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

           1120      1130      1140      1150      1160      1170  
pF1KB3 ASRKDIPCIFRVTASQLSASNNKCSILMLADTENEKNKWVGVLSELHKILKKNKFRDRSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 ASRKDIPCIFRVTASQLSASNNKCSILMLADTENEKNKWVGVLSELHKILKKNKFRDRSV
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

           1180      1190      1200      1210      1220      1230  
pF1KB3 YVPKEAYDSTLPLIKTTQAAAIIDHERIALGNEEGLFVVHVTKDEIIRVGDNKKIHQIEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 YVPKEAYDSTLPLIKTTQAAAIIDHERIALGNEEGLFVVHVTKDEIIRVGDNKKIHQIEL
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

           1240      1250      1260      1270      1280      1290  
pF1KB3 IPNDQLVAVISGRNRHVRLFPMSALDGRETDFYKLSETKGCQTVTSGKVRHGALTCLCVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 IPNDQLVAVISGRNRHVRLFPMSALDGRETDFYKLSETKGCQTVTSGKVRHGALTCLCVA
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

           1300      1310      1320      1330      1340      1350  
pF1KB3 MKRQVLCYELFQSKTRHRKFKEIQVPYNVQWMAIFSEQLCVGFQSGFLRYPLNGEGNPYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 MKRQVLCYELFQSKTRHRKFKEIQVPYNVQWMAIFSEQLCVGFQSGFLRYPLNGEGNPYS
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

           1360      1370      1380      1390      1400      1410  
pF1KB3 MLHSNDHTLSFIAHQPMDAICAVEISSKEYLLCFNSIGIYTDCQGRRSRQQELMWPANPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 MLHSNDHTLSFIAHQPMDAICAVEISSKEYLLCFNSIGIYTDCQGRRSRQQELMWPANPS
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

           1420      1430      1440      1450      1460      1470  
pF1KB3 SCCYNAPYLSVYSENAVDIFDVNSMEWIQTLPLKKVRPLNNEGSLNLLGLETIRLIYFKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 SCCYNAPYLSVYSENAVDIFDVNSMEWIQTLPLKKVRPLNNEGSLNLLGLETIRLIYFKN
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

           1480      1490      1500      1510      1520      1530  
pF1KB3 KMAEGDELVVPETSDNSRKQMVRNINNKRRYSFRVPEEERMQQRREMLRDPEMRNKLISN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 KMAEGDELVVPETSDNSRKQMVRNINNKRRYSFRVPEEERMQQRREMLRDPEMRNKLISN
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

           1540      1550      1560      1570      1580      1590  
pF1KB3 PTNFNHIAHMGPGDGIQILKDLPMNPRPQESRTVFSGSVSIPSITKSRPEPGRSMSASSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 PTNFNHIAHMGPGDGIQILKDLPMNPRPQESRTVFSGSVSIPSITKSRPEPGRSMSASSG
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

           1600      1610      1620      1630      1640      1650  
pF1KB3 LSARSSAQNGSALKREFSGGSYSAKRQPMPSPSEGSLSSGGMDQGSDAPARDFDGEDSDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 LSARSSAQNGSALKREFSGGSYSAKRQPMPSPSEGSLSSGGMDQGSDAPARDFDGEDSDS
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

           1660      1670      1680      1690 
pF1KB3 PRHSTASNSSNLSSPPSPVSPRKTKSLSLESTDRGSWDP
       ::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS15 PRHSTASNSSNLSSPPSPASPRKTKSLSLESTDRGSWDP
             1690      1700      1710         

>>CCDS1559.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1             (1638 aa)
 initn: 8533 init1: 4870 opt: 5004  Z-score: 1836.4  bits: 352.8 E(32554): 5.7e-96
Smith-Waterman score: 10412; 93.6% identity (93.7% similar) in 1719 aa overlap (1-1691:1-1638)

               10        20        30        40        50        60
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CCDS15 VGLIRQGCSCEVCGFSCHITCVNKAPTTCPVPPEQTKGPLGIDPQKGIGTAYEGHVRIPK
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CCDS15 PAGVKKGWQRALAIVCDFKLFLYDIAEGKASQPSVVISQVIDMRDEEFSVSSVLASDVIH
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CCDS15 IPNDQLVAVISGRNRHVRLFPMSALDGRETDFYKLSETKGCQTVTSGKVRHGALTCLCVA
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS15 PRHSTASNSSNLSSPPSPASPRKTKSLSLESTDRGSWDP
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>>CCDS9978.1 CDC42BPB gene_id:9578|Hs108|chr14            (1711 aa)
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pF1KB3 MSGEVRLRQLEQFILDGPAQTNGQCFSVETLLDILICLYDECNNSPLRREKNILEYLEWA
       ::..:::..:::..::::   : . .:::::::.:.::: ::..: :::.: . :.::::
CCDS99 MSAKVRLKKLEQLLLDGP-WRNESALSVETLLDVLVCLYTECSHSALRRDKYVAEFLEWA
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pF1KB3 KPFTSKVKQMRLHREDFEILKVIGRGAFGEVAVVKLKNADKVFAMKILNKWEMLKRAETA
       ::::. ::.:.::::::::.:::::::::::::::.::.....:::::::::::::::::
CCDS99 KPFTQLVKEMQLHREDFEIIKVIGRGAFGEVAVVKMKNTERIYAMKILNKWEMLKRAETA
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pF1KB3 CFREERDVLVNGDNKWITTLHYAFQDDNNLYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDRLPEDMARF
       ::::::::::::: .:::.:::::::.:.::::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS99 CFREERDVLVNGDCQWITALHYAFQDENHLYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDKLPEDMARF
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pF1KB3 YLAEMVIAIDSVHQLHYVHRDIKPDNILMDMNGHIRLADFGSCLKLMEDGTVQSSVAVGT
       :..:::.::::.::::::::::::::.:.:.::::::::::::::. .::::::::::::
CCDS99 YIGEMVLAIDSIHQLHYVHRDIKPDNVLLDVNGHIRLADFGSCLKMNDDGTVQSSVAVGT
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pF1KB3 PDYISPEILQAMEDGKGRYGPECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNHKER
       ::::::::::::::: :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS99 PDYISPEILQAMEDGMGKYGPECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNHEER
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pF1KB3 FQFPAQVTDVSENAKDLIRRLICSREHRLGQNGIEDFKKHPFFSGIDWDNIRNCEAPYIP
       ::::..::::::.:::::.:::::::.::::::::::::: :: :..:.:::: ::::::
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CCDS99 LRKVKDANLTLESKLKDSEAKNRELLEEMEILKKKMEEKFRADTGLKLPDFQDSIFEYFN
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       : :  :      ..:.:.:::.: :  ..: ..:..  .. :   :.     .   : . 
CCDS31 LHAPTD------HRELEQLRKEVQTLRDRLPEMLRDKASLSQT--DG--PPAGSPGQDSD
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pF1KB3 LQQEREDLNKELVQASERLKNQSKELKDAHCQRKLAMQEFMEINERLTELHTQKQKLARH
       :.:: . :..::...   :. : .::  :. :..  .:...: .::              
CCDS31 LRQELDRLHRELAEGRAGLQAQEQELCRAQGQQEELLQRLQEAQERE-------------
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pF1KB3 VRDKEEEVDLVMQKVESLRQELRRTERAKKELEVHTEALAAEASKDRKLREQSEHYSKQL
                                              :: ::. : :  : :. ..  
CCDS31 ---------------------------------------AATASQTRALSSQLEE-ARAA
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pF1KB3 ENELEGLKQKQISYSPGVCSIEHQQEITKLKTDLEKKSIFYEEELSKREGIH-ANEIKNL
       . :::.    :.:      :. .:  .:.:. . :..     :: :. . :: :.: ...
CCDS31 QRELEA----QVS------SLSRQ--VTQLQGQWEQRL----EESSQAKTIHTASETNGM
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pF1KB3 KKELHDSEGQQLALNKEIMILKDKLEKTRRESQSEREEFESEFKQQYEREKVLLTEENKK
            ..  :.  : ::.  :...::... .  : .::   .           : :::..
CCDS31 GPP--EGGPQEAQLRKEVAALREQLEQAHSHRPSGKEEALCQ-----------LQEENRR
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pF1KB3 LTSELDKLTTLYENLSIHNQQLEEEVKDLADKKESVAHWEAQITEIIQWVSDEKDARGYL
       :. : ..: .   . .  .:.:: :      ..:. ..::::...:..::.::: .::::
CCDS31 LSREQERLEAELAQEQESKQRLEGE------RRETESNWEAQLADILSWVNDEKVSRGYL
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pF1KB3 QALASKMTEELEALRN---SSLGTRATDMPWKMRRFAKLDMSARLELQSALDAEIRAKQA
       ::::.::.::::.:::   ..: .:  :  :: ::. :.. ::::::::::.:::::::.
CCDS31 QALATKMAEELESLRNVGTQTLPARPLDHQWKARRLQKMEASARLELQSALEAEIRAKQG
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pF1KB3 IQEELNKVKASNIITECKLKDSEKKNLELLSEIEQLIKDTEELRSEKGIEHQDSQH--SF
       .::.:..:. ... .: .:...::..  : .:. .:    ::::..  .. . :.    :
CCDS31 LQERLTQVQEAQLQAERRLQEAEKQSQALQQELAML---REELRARGPVDTKPSNSLIPF
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pF1KB3 LAFLNTPTD-ALDQ----------------------------FERK--------------
       :.: ..  : : :                             : :               
CCDS31 LSFRSSEKDSAKDPGISGEATRHGGEPDLRPEGRRSLRMGAVFPRAPTANTASTEGLPAK
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pF1KB3 --THQFFVKSFTTPTKCHQCTSLMVGLIRQGCSCEVCGFSCHITCVNKAPTTCPVPPEQT
         .: .  .:: .:::: .:::::.:: ::: .:..::. :: ::. .::  :::::.  
CCDS31 PGSHTLRPRSFPSPTKCLRCTSLMLGLGRQGLGCDACGYFCHTTCAPQAPP-CPVPPDLL
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pF1KB3 KGPLGIDPQKGIGTAYEGHVRIPKPAGVKKGWQRALAIVCDFKLFLYDIAEGKASQPSVV
       .  ::. :. : :::::: . .:.:.::..::::..: . : .:.:.:  . . : :: .
CCDS31 RTALGVHPETGTGTAYEGFLSVPRPSGVRRGWQRVFAALSDSRLLLFDAPDLRLSPPSGA
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pF1KB3 ISQVIDMRDEEFSVSSVLASDVIHASRKDIPCIFRVTASQLSASNNKCSILMLADTENEK
       . ::.:.:: .::.. :::::::::. .:.: :::::.:::..  . :..:.::..:.:.
CCDS31 LLQVLDLRDPQFSATPVLASDVIHAQSRDLPRIFRVTTSQLAVPPTTCTVLLLAESEGER
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pF1KB3 NKWVGVLSELHKILKKNKFRDRSVYVPKEAYDSTLPLIKTTQAAAIIDHERIALGNEEGL
       ..:. ::.::...:   . : : ::. :::::. :::.  :  :::.:..:.:::.::::
CCDS31 ERWLQVLGELQRLLLDARPRPRPVYTLKEAYDNGLPLLPHTLCAAILDQDRLALGTEEGL
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pF1KB3 FVVHVTKDEIIRVGDNKKIHQIELIPNDQLVAVISGRNRHVRLFPMSALDGRETDFYKLS
       ::.:. ...:..::. ....:. : :.  :..:. ::.  :::: .. :.. :.   :. 
CCDS31 FVIHLRSNDIFQVGECRRVQQLTLSPSAGLLVVLCGRGPSVRLFALAELENIEVAGAKIP
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pF1KB3 ETKGCQTVTSGKVRHGALTCLCVAMKRQVLCYELFQSK-TRHRKFKEIQVPYNVQWMAIF
       :..:::....:.. ..    ::::.:::::::.:  .    .:...:.:.: .:: ....
CCDS31 ESRGCQVLAAGSILQARTPVLCVAVKRQVLCYQLGPGPGPWQRRIRELQAPATVQSLGLL
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pF1KB3 SEQLCVGFQSGFLRYPLNGEGNPYSMLHS-NDHTLSFIAHQPMDAICAVEISSKEYLLCF
       ...::::  .::  ::: .:. : ..  .   . :        .:. :::.: .:.:: :
CCDS31 GDRLCVGAAGGFALYPLLNEAAPLALGAGLVPEELPPSRGGLGEALGAVELSLSEFLLLF
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pF1KB3 NSIGIYTDCQGRRSRQQELMWPANPSSCCYNAPYLSVYSENAVDIFDVNSMEWIQTLPLK
       .. :::.:  ::.:: .::.::: : .  : ::::.:.:::..:.:::   ::.::.:::
CCDS31 TTAGIYVDGAGRKSRGHELLWPAAPMGWGYAAPYLTVFSENSIDVFDVRRAEWVQTVPLK
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pF1KB3 KVRPLNNEGSLNLLGLETIRLIYFKNKMAEGDELVVPETSDNSRKQMVRNINNKRRYSFR
       :::::: :::: : : : .:: :..:..:: ::. .:. .::::.:. :. ..:::. ::
CCDS31 KVRPLNPEGSLFLYGTEKVRLTYLRNQLAEKDEFDIPDLTDNSRRQLFRT-KSKRRFFFR
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pF1KB3 VPEEERMQQRREMLRDPEMRNKLISNPTNFNHIAHMGPGDGIQILKDLPMNPRPQESRTV
       : ::.. :::::::.:: .:.:::: ::::::..:.::..:    .:   .: :.:.  :
CCDS31 VSEEQQKQQRREMLKDPFVRSKLISPPTNFNHLVHVGPANGRPGARD--KSPAPEEKGRV
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pF1KB3 FSGSVSIPSITKSRPEPGRSMSASSGLSARSSAQNGSALKREFSGGSYSAKRQPMPSPSE
         ::            : :  : : .:  :  :. ::   . ..: .   ::.:  : : 
CCDS31 ARGS-----------GPQRPHSFSEAL--RRPASMGS---EGLGGDADPMKRKPWTSLSS
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pF1KB3 GSLSSGGMDQGSDAPARDFDGEDSDSPRHSTASNSSNLSSPPSPVSPRKTKSLSLESTDR
        :.:     ::: .:: ..  . :. ::  .   : .: : :                  
CCDS31 ESVSC---PQGSLSPATSL-MQVSERPR--SLPLSPELESSP                  
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       1690 
pF1KB3 GSWDP

>>CCDS12674.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19               (629 aa)
 initn: 1211 init1: 1094 opt: 1726  Z-score: 655.5  bits: 132.9 E(32554): 3.4e-30
Smith-Waterman score: 1726; 50.4% identity (76.0% similar) in 554 aa overlap (1-543:1-530)

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pF1KB3 MSGEVRLRQLEQFILDGPAQTNGQCFSVETLLDILICLYDECNNSPLRREKNILEYLEWA
       ::.:::::.:.:..:: :.      ...: :::.:. ...: . : : ..: . ..:.::
CCDS12 MSAEVRLRRLQQLVLD-PG-----FLGLEPLLDLLLGVHQELGASELAQDKYVADFLQWA
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pF1KB3 KPFTSKVKQMRLHREDFEILKVIGRGAFGEVAVVKLKNADKVFAMKILNKWEMLKRAETA
       .:.. ..:..::.:.:::::::::::::.::::::.:.. .:.::::.:::.::::.:..
CCDS12 EPIVVRLKEVRLQRDDFEILKVIGRGAFSEVAVVKMKQTGQVYAMKIMNKWDMLKRGEVS
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pF1KB3 CFREERDVLVNGDNKWITTLHYAFQDDNNLYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDRLPEDMARF
       ::::::::::::: .::: ::.::::.: :::::.:::::::::::::: .:.: .::::
CCDS12 CFREERDVLVNGDRRWITQLHFAFQDENYLYLVMEYYVGGDLLTLLSKFGERIPAEMARF
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pF1KB3 YLAEMVIAIDSVHQLHYVHRDIKPDNILMDMNGHIRLADFGSCLKLMEDGTVQSSVAVGT
       ::::.:.::::::.: ::::::::::::.:  ::::::::::::::  ::::.: :::::
CCDS12 YLAEIVMAIDSVHRLGYVHRDIKPDNILLDRCGHIRLADFGSCLKLRADGTVRSLVAVGT
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pF1KB3 PDYISPEILQAMEDGKGR--YGPECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNHK
       :::.:::::::.  : :   ::::::::.:::  :::.::.:::::.: .::::::...:
CCDS12 PDYLSPEILQAVGGGPGTGSYGPECDWWALGVFAYEMFYGQTPFYADSTAETYGKIVHYK
          240       250       260       270       280       290    

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pF1KB3 ERFQFPAQVTDVSENAKDLIRRLICSREHRLGQNGIEDFKKHPFFSGIDWDNIRNCEAPY
       :....:     : :.:.:.:.::.:  : :::..:  ::. :::: :.:::..:.   :.
CCDS12 EHLSLPLVDEGVPEEARDFIQRLLCPPETRLGRGGAGDFRTHPFFFGLDWDGLRDSVPPF
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pF1KB3 IPEVSSPTDTSNFDVDDDCLK-----NSETMPPPTHTAFSGHHLPFVGFTYTSSCV-LSD
        :.  . ::: :::. .: :      ..::.    . :  : ::::::..:  ::. : :
CCDS12 TPDFEGATDTCNFDLVEDGLTAMVSGGGETLSDIREGAPLGVHLPFVGYSY--SCMALRD
          360       370       380       390       400         410  

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pF1KB3 RSCLRVTAGPTSLDLDVNVQRTLDNNLATEAYERRIKRLEQEKLELSRKLQESTQTVQAL
             . ::: ..:.  ... :. .. . . :  ..  ..:  :..  .  .. ...: 
CCDS12 SE----VPGPTPMELE--AEQLLEPHVQAPSLEPSVSP-QDETAEVA--VPAAVPAAEAE
                420         430       440        450         460   

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pF1KB3 QYSTVDGPLTASKDLEI---KNLKEEIEKLRKQVTESSHLEQQLEEANAVRQELDDAFRQ
          :.   :  . . :.   ..:..:.: .:   :..... .::.::.:  ..:.   ::
CCDS12 AEVTLR-ELQEALEEEVLTRQSLSREMEAIR---TDNQNFASQLREAEARNRDLEAHVRQ
            470       480       490          500       510         

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pF1KB3 IKAYEKQIKTLQQEREDLNKELVQASERLKNQSKELKDAHCQRKLAMQEFMEINERLTEL
       ..   .... :: :                                              
CCDS12 LQ---ERMELLQAEGATAVTGVPSPRATDPPSHLDGPPAVAVGQCPLVGPGPMHRRHLLL
     520          530       540       550       560       570      

>>CCDS74400.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19               (530 aa)
 initn: 1730 init1: 1094 opt: 1712  Z-score: 651.5  bits: 131.9 E(32554): 5.8e-30
Smith-Waterman score: 1743; 50.8% identity (76.3% similar) in 549 aa overlap (1-543:1-525)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MSGEVRLRQLEQFILDGPAQTNGQCFSVETLLDILICLYDECNNSPLRREKNILEYLEWA
       ::.:::::.:.:..:: :.      ...: :::.:. ...: . : : ..: . ..:.::
CCDS74 MSAEVRLRRLQQLVLD-PG-----FLGLEPLLDLLLGVHQELGASELAQDKYVADFLQWA
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>>CCDS46117.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19               (625 aa)
 initn: 1729 init1: 1094 opt: 1712  Z-score: 650.4  bits: 131.9 E(32554): 6.6e-30
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CCDS46 EPIVVRLKEVRLQRDDFEILKVIGRGAFSEVAVVKMKQTGQVYAMKIMNKWDMLKRGEVS
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CCDS46 CFREERDVLVNGDRRWITQLHFAFQDENYLYLVMEYYVGGDLLTLLSKFGERIPAEMARF
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CCDS46 -VPGPTPMELE--AEQLLEPHVQAPSLEPSVSP-QDETAEVA--VPAAVPAAEAEAEVTL
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pF1KB3 DGPLTASKDLEI---KNLKEEIEKLRKQVTESSHLEQQLEEANAVRQELDDAFRQIKAYE
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CCDS46 R-ELQEALEEEVLTRQSLSREMEAIR---TDNQNFASQLREAEARNRDLEAHVRQLQ---
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pF1KB3 KQIKTLQQEREDLNKELVQASERLKNQSKELKDAHCQRKLAMQEFMEINERLTELHTQKQ
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>>CCDS46119.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19               (639 aa)
 initn: 1069 init1: 1013 opt: 1594  Z-score: 607.6  bits: 124.0 E(32554): 1.6e-27
Smith-Waterman score: 1594; 51.7% identity (76.2% similar) in 495 aa overlap (60-543:64-540)

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CCDS46 LYLVMEYYVGGDLLTLLSKFGERIPAEMARFYLAEIVMAIDSVHRLGYVHRDIKPDNILL
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CCDS46 LGVFAYEMFYGQTPFYADSTAETYGKIVHYKEHLSLPLVDEGVPEEARDFIQRLLCPPET
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       :::..:  ::. :::: :.:::..:.   :. :.  . ::: :::. .: :      ..:
CCDS46 RLGRGGAGDFRTHPFFFGLDWDGLRDSVPPFTPDFEGATDTCNFDLVEDGLTAMVSGGGE
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       :.    . :  : ::::::..:  ::. : :      . ::: ..:..  .. :. .. .
CCDS46 TLSDIREGAPLGVHLPFVGYSY--SCMALRDSE----VPGPTPMELEA--EQLLEPHVQA
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        . :  ..  ..:  :..  .  .. ...:    :.   :  . . :.   ..:..:.: 
CCDS46 PSLEPSVSP-QDETAEVA--VPAAVPAAEAEAEVTLR-ELQEALEEEVLTRQSLSREMEA
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CCDS46 IR---TDNQNFASQLREAEARNRDLEAHVRQLQ---ERMELLQAEGATAVTGVPSPRATD
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CCDS11 WARFYTAEVVLALDAIHSMGFIHRDVKPDNMLLDKSGHLKLADFGTCMKMNKEGMVRCDT
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CCDS11 AVGTPDYISPEVLKS-QGGDGYYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLVGTYSKIMN
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CCDS11 HKNSLTFPDD-NDISKEAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIKRHLFFKNDQWAWETLRDT
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CCDS11 VAPVVPDLSSDIDTSNFDDLEEDKGEEETFPIP--KAFVGNQLPFVGFTY-----YSNRR
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CCDS11 YLS-SANPNDNRTSSNADKSLQESLQKTIYKLEEQLHNEMQLKDEMEQKCRTSNIKLDKI
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CCDS11 MKELDEEGNQRRNLESTVSQIEKEKMLLQHRINEYQRKAEQENEKRRNVENEVSTLKDQL
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CCDS11 EDLKKVSQNSQLANEKLSQLQKQLEEANDLLRTESDTAVRLRKSHTEMSKSISQL-ESLN
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CCDS11 REL-QERNRILENSKSQTD---KDYYQLQAILEA-ERRDRGHDSEMIGDLQARITSLQEE
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pF1KB3 VDLV---MQKVESLRQE----LRRTERAKKELEVHT--------EALAAEASKDR--KLR
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CCDS11 VKHLKHNLEKVEGERKEAQDMLNHSEKEKNNLEIDLNYKLKSLQQRLEQEVNEHKVTKAR
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pF1KB3 EQSEHYSKQ---------LENELEGLKQKQISYSPGVCSIEHQQEITKLKTDLEKKSIFY
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CCDS11 LTDKHQSIEEAKSVAMCEMEKKLKEEREAREKAENRVVQIEKQ--CSMLDVDLKQSQQKL
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pF1KB3 EEELSKREGIHANEIKNLKKELHDSEGQQLALNKEI---MILKDKLEKTRRESQSERE--
       :.  ...: .. .:.:::  .:..  ...: :..:.    .  :.:.  ... ..: .  
CCDS11 EHLTGNKERME-DEVKNLTLQLEQESNKRLLLQNELKTQAFEADNLKGLEKQMKQEINTL
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pF1KB3 -------EFE-SEFKQQYEREKVLLTEENKKLTSELDKLTTLY--------ENLSIHNQQ
              ::: ... .::. ..  . : . .: .: . ..:::        :..  .:..
CCDS11 LEAKRLLEFELAQLTKQYRGNEGQMRELQDQLEAE-QYFSTLYKTQVKELKEEIEEKNRE
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         .....: ..::..:   .:.      . .:. ::: :.    ..:.: .  : :: . 
CCDS11 NLKKIQELQNEKETLA---TQLDLAETKAESEQLARGLLEEQYFELTQESKKAASRNRQ-
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pF1KB3 GTRATDMPWKMRRFAKLD--MSARLELQSALDAEI--RAKQA-------IQEELNKVKAS
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CCDS11 --EITDKDHTVSRLEEANSMLTKDIEILRRENEELTEKMKKAEEEYKLEKEEEISNLKAA
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CCDS11 FEKNINTERTLKTQAVNKLAEIMNRKDFKIDRKKANTQDLR-KKEKENRKLQLE----LN
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pF1KB3 TPTDALDQFERKTHQFFVKSFTTPT--KCHQCTSLMVGLIRQGCSCEVCGFSCHITCVNK
          . ..:.  : ::  .... .    .: . . :.. :  .    ..  .  ..  .. 
CCDS11 QEREKFNQMVVK-HQKELNDMQAQLVEECAHRNELQMQLASK--ESDIEQLRAKLLDLSD
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pF1KB3 APTTCPVPP-EQTKGPLGIDPQKGIGTAYEGHVRIPKPAGVKK-GWQRALAIVCDFKLFL
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CCDS11 STSVASFPSADETDGNL---PESRI----EGWLSVPNRGNIKRYGWKKQYVVVSSKKILF
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CCDS11 YNDEQDKEQSNPSM----VLDI-DKLFHVRPVTQGDVYRAETEEIPKIFQI----LYANE
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CCDS11 GECRKDVEMEPVQQAEKTNFQNHKGHEFIPTLYHFPANCDACAKPLWHVFKPPPALECRR
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18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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