Result of FASTA (ccds) for pF1KB1393
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB1393, 810 aa
  1>>>pF1KB1393 810 - 810 aa - 810 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.4060+/-0.00118; mu= -8.0325+/- 0.070
 mean_var=324.5331+/-68.427, 0's: 0 Z-trim(111.1): 43  B-trim: 105 in 2/51
 Lambda= 0.071194
 statistics sampled from 12125 (12153) to 12125 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.713), E-opt: 0.2 (0.373), width:  16
 Scan time:  4.290

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS31419.1 PPFIBP2 gene_id:8495|Hs108|chr11       ( 876) 2853 307.6 5.8e-83
CCDS58116.1 PPFIBP2 gene_id:8495|Hs108|chr11       ( 764) 2850 307.3 6.4e-83
CCDS58117.1 PPFIBP2 gene_id:8495|Hs108|chr11       ( 733) 2844 306.6 9.5e-83
CCDS55813.1 PPFIBP1 gene_id:8496|Hs108|chr12       ( 980) 1655 184.6   7e-46
CCDS55814.1 PPFIBP1 gene_id:8496|Hs108|chr12       ( 858) 1638 182.8 2.1e-45
CCDS55812.1 PPFIBP1 gene_id:8496|Hs108|chr12       (1011) 1638 182.9 2.4e-45
CCDS8713.1 PPFIBP1 gene_id:8496|Hs108|chr12        (1005) 1627 181.7 5.2e-45
CCDS152.2 KAZN gene_id:23254|Hs108|chr1            ( 775)  603 76.5 1.9e-13


>>CCDS31419.1 PPFIBP2 gene_id:8495|Hs108|chr11            (876 aa)
 initn: 2818 init1: 2818 opt: 2853  Z-score: 1602.9  bits: 307.6 E(32554): 5.8e-83
Smith-Waterman score: 5139; 97.8% identity (98.1% similar) in 800 aa overlap (13-810:88-876)

                                 10          20        30        40
pF1KB1                   MDGDIDVYKHFSWLKRS--QVNHHSAASNETYQERLARLEGD
                                     :...:  :::::::::::::::::::::::
CCDS31 RLALEMLELPQERAALLSQIPGPTAAYIKEWFEESLSQVNHHSAASNETYQERLARLEGD
        60        70        80        90       100       110       

               50        60        70        80        90       100
pF1KB1 KESLILQVSVLTDQVEAQGEKIRDLEVCLEGHQVKLNAAEEMLQQELLSRTSLETQKLDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KESLILQVSVLTDQVEAQGEKIRDLEVCLEGHQVKLNAAEEMLQQELLSRTSLETQKLDL
       120       130       140       150       160       170       

              110       120       130       140       150       160
pF1KB1 MTEVSELKLKLVGMEKEQREQEEKQRKAEELLQELRHLKIKVEELENERNQYEWKLKATK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MTEVSELKLKLVGMEKEQREQEEKQRKAEELLQELRHLKIKVEELENERNQYEWKLKATK
       180       190       200       210       220       230       

              170       180       190       200       210       220
pF1KB1 AEVAQLQEQVALKDAEIERLHSQLSRTAALHSESHTERDQEIQRLKMGMETLLLANEDKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AEVAQLQEQVALKDAEIERLHSQLSRTAALHSESHTERDQEIQRLKMGMETLLLANEDKD
       240       250       260       270       280       290       

              230       240       250       260       270       280
pF1KB1 RRIEELTGLLNQYRKVKEIVMVTQGPSERTLSINEEEPEGGFSKWNATNKDPEELFKQEM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RRIEELTGLLNQYRKVKEIVMVTQGPSERTLSINEEEPEGGFSKWNATNKDPEELFKQEM
       300       310       320       330       340       350       

              290       300       310       320       330       340
pF1KB1 PPRCSSPTVGPPPLPQKSLETRAQKKLSCSLEDLRSESVDKCMDGNQPFPVLEPKDSPFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PPRCSSPTVGPPPLPQKSLETRAQKKLSCSLEDLRSESVDKCMDGNQPFPVLEPKDSPFL
       360       370       380       390       400       410       

              350       360       370       380       390       400
pF1KB1 AEHKYPTLPGKLSGATPNGEAAKSPPTICQPDATGSSLLRLNRGRSVSAPVLGDTESGWD
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::            :::::::
CCDS31 AEHKYPTLPGKLSGATPNGEAAKSPPTICQPDATGSSLLRLR-----------DTESGWD
       420       430       440       450                  460      

              410       420       430       440       450       460
pF1KB1 DTAVVNDLSSTSSGTESGPQSPLTPDGKRNPKGIKKFWGKIRRTQSGNFYTDTLGMAEFR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DTAVVNDLSSTSSGTESGPQSPLTPDGKRNPKGIKKFWGKIRRTQSGNFYTDTLGMAEFR
        470       480       490       500       510       520      

              470       480       490       500       510       520
pF1KB1 RGGLRATAGPRLSRTRDSKGQKSDANAPFAQWSTERVCAWLEDFGLAQYVIFARQWVSSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RGGLRATAGPRLSRTRDSKGQKSDANAPFAQWSTERVCAWLEDFGLAQYVIFARQWVSSG
        530       540       550       560       570       580      

              530       540       550       560       570       580
pF1KB1 HTLLTATPQDMEKELGIKHPLHRKKLVLAVKAINTKQEEKSALLDHIWVTRWLDDIGLPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HTLLTATPQDMEKELGIKHPLHRKKLVLAVKAINTKQEEKSALLDHIWVTRWLDDIGLPQ
        590       600       610       620       630       640      

              590       600       610       620       630       640
pF1KB1 YKDQFHESRVDGRMLQYLTVNDLLFLKVTSQLHHLSIKCAIHVLHVNKFNPHCLHRRPAD
       ::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YKDQFHESRVDRRMLQYLTVNDLLFLKVTSQLHHLSIKCAIHVLHVNKFNPHCLHRRPAD
        650       660       670       680       690       700      

              650       660       670       680       690       700
pF1KB1 ESNLSPSEVVQWSNHRVMEWLRSVDLAEYAPNLRGSGVHGGLIILEPRFTGDTLAMLLNI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ESNLSPSEVVQWSNHRVMEWLRSVDLAEYAPNLRGSGVHGGLIILEPRFTGDTLAMLLNI
        710       720       730       740       750       760      

              710       720       730       740       750       760
pF1KB1 PPQKTLLRRHLTTKFNALIGPEAEQEKREKMASPAYTPLTTTAKVRPRKLGFSHFGNIRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PPQKTLLRRHLTTKFNALIGPEAEQEKREKMASPAYTPLTTTAKVRPRKLGFSHFGNIRK
        770       780       790       800       810       820      

              770       780       790       800       810
pF1KB1 KKFDESTDYICPMEPSDGVSDSHRVYSGYRGLSPLDAPELDGLDQVGQIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KKFDESTDYICPMEPSDGVSDSHRVYSGYRGLSPLDAPELDGLDQVGQIS
        830       840       850       860       870      

>>CCDS58116.1 PPFIBP2 gene_id:8495|Hs108|chr11            (764 aa)
 initn: 2818 init1: 2818 opt: 2850  Z-score: 1602.1  bits: 307.3 E(32554): 6.4e-83
Smith-Waterman score: 4945; 98.2% identity (98.3% similar) in 764 aa overlap (47-810:12-764)

         20        30        40        50        60        70      
pF1KB1 SQVNHHSAASNETYQERLARLEGDKESLILQVSVLTDQVEAQGEKIRDLEVCLEGHQVKL
                                     .:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58                    MSSEQWPRLPGKVSVLTDQVEAQGEKIRDLEVCLEGHQVKL
                                  10        20        30        40 

         80        90       100       110       120       130      
pF1KB1 NAAEEMLQQELLSRTSLETQKLDLMTEVSELKLKLVGMEKEQREQEEKQRKAEELLQELR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NAAEEMLQQELLSRTSLETQKLDLMTEVSELKLKLVGMEKEQREQEEKQRKAEELLQELR
              50        60        70        80        90       100 

        140       150       160       170       180       190      
pF1KB1 HLKIKVEELENERNQYEWKLKATKAEVAQLQEQVALKDAEIERLHSQLSRTAALHSESHT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HLKIKVEELENERNQYEWKLKATKAEVAQLQEQVALKDAEIERLHSQLSRTAALHSESHT
             110       120       130       140       150       160 

        200       210       220       230       240       250      
pF1KB1 ERDQEIQRLKMGMETLLLANEDKDRRIEELTGLLNQYRKVKEIVMVTQGPSERTLSINEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ERDQEIQRLKMGMETLLLANEDKDRRIEELTGLLNQYRKVKEIVMVTQGPSERTLSINEE
             170       180       190       200       210       220 

        260       270       280       290       300       310      
pF1KB1 EPEGGFSKWNATNKDPEELFKQEMPPRCSSPTVGPPPLPQKSLETRAQKKLSCSLEDLRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EPEGGFSKWNATNKDPEELFKQEMPPRCSSPTVGPPPLPQKSLETRAQKKLSCSLEDLRS
             230       240       250       260       270       280 

        320       330       340       350       360       370      
pF1KB1 ESVDKCMDGNQPFPVLEPKDSPFLAEHKYPTLPGKLSGATPNGEAAKSPPTICQPDATGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ESVDKCMDGNQPFPVLEPKDSPFLAEHKYPTLPGKLSGATPNGEAAKSPPTICQPDATGS
             290       300       310       320       330       340 

        380       390       400       410       420       430      
pF1KB1 SLLRLNRGRSVSAPVLGDTESGWDDTAVVNDLSSTSSGTESGPQSPLTPDGKRNPKGIKK
       :::::            :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SLLRLR-----------DTESGWDDTAVVNDLSSTSSGTESGPQSPLTPDGKRNPKGIKK
                        350       360       370       380       390

        440       450       460       470       480       490      
pF1KB1 FWGKIRRTQSGNFYTDTLGMAEFRRGGLRATAGPRLSRTRDSKGQKSDANAPFAQWSTER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FWGKIRRTQSGNFYTDTLGMAEFRRGGLRATAGPRLSRTRDSKGQKSDANAPFAQWSTER
              400       410       420       430       440       450

        500       510       520       530       540       550      
pF1KB1 VCAWLEDFGLAQYVIFARQWVSSGHTLLTATPQDMEKELGIKHPLHRKKLVLAVKAINTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VCAWLEDFGLAQYVIFARQWVSSGHTLLTATPQDMEKELGIKHPLHRKKLVLAVKAINTK
              460       470       480       490       500       510

        560       570       580       590       600       610      
pF1KB1 QEEKSALLDHIWVTRWLDDIGLPQYKDQFHESRVDGRMLQYLTVNDLLFLKVTSQLHHLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QEEKSALLDHIWVTRWLDDIGLPQYKDQFHESRVDRRMLQYLTVNDLLFLKVTSQLHHLS
              520       530       540       550       560       570

        620       630       640       650       660       670      
pF1KB1 IKCAIHVLHVNKFNPHCLHRRPADESNLSPSEVVQWSNHRVMEWLRSVDLAEYAPNLRGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IKCAIHVLHVNKFNPHCLHRRPADESNLSPSEVVQWSNHRVMEWLRSVDLAEYAPNLRGS
              580       590       600       610       620       630

        680       690       700       710       720       730      
pF1KB1 GVHGGLIILEPRFTGDTLAMLLNIPPQKTLLRRHLTTKFNALIGPEAEQEKREKMASPAY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GVHGGLIILEPRFTGDTLAMLLNIPPQKTLLRRHLTTKFNALIGPEAEQEKREKMASPAY
              640       650       660       670       680       690

        740       750       760       770       780       790      
pF1KB1 TPLTTTAKVRPRKLGFSHFGNIRKKKFDESTDYICPMEPSDGVSDSHRVYSGYRGLSPLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TPLTTTAKVRPRKLGFSHFGNIRKKKFDESTDYICPMEPSDGVSDSHRVYSGYRGLSPLD
              700       710       720       730       740       750

        800       810
pF1KB1 APELDGLDQVGQIS
       ::::::::::::::
CCDS58 APELDGLDQVGQIS
              760    

>>CCDS58117.1 PPFIBP2 gene_id:8495|Hs108|chr11            (733 aa)
 initn: 2818 init1: 2818 opt: 2844  Z-score: 1599.1  bits: 306.6 E(32554): 9.5e-83
Smith-Waterman score: 4706; 98.1% identity (98.2% similar) in 726 aa overlap (85-810:19-733)

           60        70        80        90       100       110    
pF1KB1 VEAQGEKIRDLEVCLEGHQVKLNAAEEMLQQELLSRTSLETQKLDLMTEVSELKLKLVGM
                                     .:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58             MGKLITRMWKLLRRRSAPKELLSRTSLETQKLDLMTEVSELKLKLVGM
                           10        20        30        40        

          120       130       140       150       160       170    
pF1KB1 EKEQREQEEKQRKAEELLQELRHLKIKVEELENERNQYEWKLKATKAEVAQLQEQVALKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EKEQREQEEKQRKAEELLQELRHLKIKVEELENERNQYEWKLKATKAEVAQLQEQVALKD
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pF1KB1 AEIERLHSQLSRTAALHSESHTERDQEIQRLKMGMETLLLANEDKDRRIEELTGLLNQYR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AEIERLHSQLSRTAALHSESHTERDQEIQRLKMGMETLLLANEDKDRRIEELTGLLNQYR
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pF1KB1 KVKEIVMVTQGPSERTLSINEEEPEGGFSKWNATNKDPEELFKQEMPPRCSSPTVGPPPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KVKEIVMVTQGPSERTLSINEEEPEGGFSKWNATNKDPEELFKQEMPPRCSSPTVGPPPL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PQKSLETRAQKKLSCSLEDLRSESVDKCMDGNQPFPVLEPKDSPFLAEHKYPTLPGKLSG
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       :::::::::::::::::::::::::::            :::::::::::::::::::::
CCDS58 ATPNGEAAKSPPTICQPDATGSSLLRLR-----------DTESGWDDTAVVNDLSSTSSG
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pF1KB1 TESGPQSPLTPDGKRNPKGIKKFWGKIRRTQSGNFYTDTLGMAEFRRGGLRATAGPRLSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TESGPQSPLTPDGKRNPKGIKKFWGKIRRTQSGNFYTDTLGMAEFRRGGLRATAGPRLSR
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TRDSKGQKSDANAPFAQWSTERVCAWLEDFGLAQYVIFARQWVSSGHTLLTATPQDMEKE
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pF1KB1 LGIKHPLHRKKLVLAVKAINTKQEEKSALLDHIWVTRWLDDIGLPQYKDQFHESRVDGRM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS58 LGIKHPLHRKKLVLAVKAINTKQEEKSALLDHIWVTRWLDDIGLPQYKDQFHESRVDRRM
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pF1KB1 LQYLTVNDLLFLKVTSQLHHLSIKCAIHVLHVNKFNPHCLHRRPADESNLSPSEVVQWSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LQYLTVNDLLFLKVTSQLHHLSIKCAIHVLHVNKFNPHCLHRRPADESNLSPSEVVQWSN
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pF1KB1 HRVMEWLRSVDLAEYAPNLRGSGVHGGLIILEPRFTGDTLAMLLNIPPQKTLLRRHLTTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HRVMEWLRSVDLAEYAPNLRGSGVHGGLIILEPRFTGDTLAMLLNIPPQKTLLRRHLTTK
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pF1KB1 FNALIGPEAEQEKREKMASPAYTPLTTTAKVRPRKLGFSHFGNIRKKKFDESTDYICPME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FNALIGPEAEQEKREKMASPAYTPLTTTAKVRPRKLGFSHFGNIRKKKFDESTDYICPME
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pF1KB1 PSDGVSDSHRVYSGYRGLSPLDAPELDGLDQVGQIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PSDGVSDSHRVYSGYRGLSPLDAPELDGLDQVGQIS
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>>CCDS55813.1 PPFIBP1 gene_id:8496|Hs108|chr12            (980 aa)
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pF1KB1          MDGDIDVYKHFSWLKRSQVNHHSAASNETYQERLARLEGDKESLILQVSVL
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CCDS55 TDEKEGLRCQIPDSTAETLVEWLQSQMTNGHLPGNGDVYQERLARLENDKESLVLQVSVL
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pF1KB1 TDQVEAQGEKIRDLEVCLEGHQVKLNAAEEMLQQELLSRTSLETQKLDLMTEVSELKLKL
       ::::::::::::::: ::: :. :.::.::::::::::::::::::::::.:.:.:::::
CCDS55 TDQVEAQGEKIRDLEFCLEEHREKVNATEEMLQQELLSRTSLETQKLDLMAEISNLKLKL
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pF1KB1 VGMEKEQREQEEKQRKAEELLQELRHLKIKVEELENERNQYEWKLKATKAEVAQLQEQVA
       ...::.. . :.: : .: :.::.  :..:: :...:: ::: :::.:: :.:.:.::. 
CCDS55 TAVEKDRLDYEDKFRDTEGLIQEINDLRLKVSEMDSERLQYEKKLKSTKDELASLKEQLE
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pF1KB1 LKDAEIERLHSQLSRTAALHSESHTERDQEIQRLKMGMETLLLANEDKDRRIEELTGLLN
        :..:..::. .:      ..   ..:: :.:..: ..:.:. :::.:::.::.:   ::
CCDS55 EKESEVKRLQEKLVCKMKGEGVEIVDRDIEVQKMKKAVESLMAANEEKDRKIEDLRQCLN
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pF1KB1 QYRKVKEIVMVTQGPS---ERTL---SINEEEPEGGFSKWNATNKDPEEL-------FKQ
       .:.:... :...:: .   :. :   ::.      :::  . . .    .       :. 
CCDS55 RYKKMQDTVVLAQGKDGEYEELLNSSSISSLLDAQGFSDLEKSPSPTPVMGSPSCDPFNT
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      280       290           300           310            320     
pF1KB1 EMPPRCSSPTVG---PPPLPQK-SLETRAQKKLS----CSLED-----LRSESVDK--C-
        .: .  .  .    :  ::   :.::  ..::.     :.:.     . . .::   : 
CCDS55 SVPEEFHTTILQVSIPSLLPATVSMETSEKSKLTPKPETSFEENDGNIILGATVDTQLCD
           370       380       390       400       410       420   

                  330       340       350        360          370  
pF1KB1 ------MDGNQPFPVLEPKDSPFLAEHKYPTLPGKLSGAT-PNGEAAKSPP---TICQPD
             .. .. .  :. . :    :    :   .  . . : :     ::   :  . .
CCDS55 KLLTSSLQKSSSLGNLKKETSDGEKETIQKTSEDRAPAESRPFGTLPPRPPGQDTSMDDN
           430       440       450       460       470       480   

            380                 390       400       410        420 
pF1KB1 ATGSSLLR--LNRG--------RSVSAPVLGDTESGWDDTAVVNDLSSTSS-GTESGPQS
         :.  .:  ..::        :..::: :..::.   .::   ::...::   .:  .:
CCDS55 PFGTRKVRSSFGRGFFKIKSNKRTASAPNLAETEK---ETAEHLDLAGASSRPKDSQRNS
           490       500       510          520       530       540

                  430       440       450       460       470      
pF1KB1 PL-----TPDGKRNPKGIKKFWGKIRRTQSGNFYTDTLGMAEFRRGGLRATAGPRLSRTR
       :.     .::.:.. .:: :..::.::.:: .:  : ..  ::.::: ::::::::. .:
CCDS55 PFQIPPPSPDSKKKSRGIMKLFGKLRRSQSTTFNPDDMSEPEFKRGGTRATAGPRLGWSR
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pF1KB1 DSKGQKSDANAPFAQWSTERVCAWLEDFGLAQYVIFARQWVSSGHTLLTATPQDMEKELG
       :   ..:: . :::.:. :.:: :: . ::..:.  ...:..::.::: :. ::.:::::
CCDS55 DLGQSNSDLDMPFAKWTKEQVCNWLMEQGLGSYLNSGKHWIASGQTLLQASQQDLEKELG
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pF1KB1 IKHPLHRKKLVLAVKAINTKQEEKSALLDHIWVTRWLDDIGLPQYKDQFHESRVDGRMLQ
       ::: :::::: ::..:.....: . . ::  ::::::::::::::: :: :.:::::::.
CCDS55 IKHSLHRKKLQLALQALGSEEETNHGKLDFNWVTRWLDDIGLPQYKTQFDEGRVDGRMLH
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pF1KB1 YLTVNDLLFLKVTSQLHHLSIKCAIHVLHVNKFNPHCLHRRPADESNLSPSEVVQWSNHR
       :.::.::: :::.: ::::::: ::.::..:.:.:.::.:::.::....:::: .:.:::
CCDS55 YMTVDDLLSLKVVSVLHHLSIKRAIQVLRINNFEPNCLRRRPSDENTIAPSEVQKWTNHR
              730       740       750       760       770       780

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pF1KB1 VMEWLRSVDLAEYAPNLRGSGVHGGLIILEPRFTGDTLAMLLNIPPQKTLLRRHLTTKFN
       ::::::::::::::::::::::::::..:::::. .:.:.::::::.::::::::.:.::
CCDS55 VMEWLRSVDLAEYAPNLRGSGVHGGLMVLEPRFNVETMAQLLNIPPNKTLLRRHLATHFN
              790       800       810       820       830       840

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pF1KB1 ALIGPEAEQEKREKMASPAYTPLTTTAKVRPRKLGFSHFGNIRKKKFDESTDYICPMEPS
        ::: ::...::. :  : :. ::.::::.:.::.::.:::.:::: ... .:.:::: .
CCDS55 LLIGAEAQHQKRDAMELPDYVLLTATAKVKPKKLAFSNFGNLRKKKQEDGEEYVCPMELG
              850       860       870       880       890       900

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pF1KB1 DGVSDSHRVYSGYRGLSPLDAPELDGLDQVGQIS                          
       .. ... .  .:..    .   : : ::.. :.                           
CCDS55 QASGSASK--KGFKPGLDMRLYEEDDLDRLEQMEDSEGTVRQIGAFSEGINNLTHMLKED
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CCDS55 DMFKDFAARSPSASITDEDSNV
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>>CCDS55814.1 PPFIBP1 gene_id:8496|Hs108|chr12            (858 aa)
 initn: 1877 init1: 1549 opt: 1638  Z-score: 928.6  bits: 182.8 E(32554): 2.1e-45
Smith-Waterman score: 1989; 44.1% identity (68.8% similar) in 814 aa overlap (82-809:1-809)

              60        70        80        90       100       110 
pF1KB1 TDQVEAQGEKIRDLEVCLEGHQVKLNAAEEMLQQELLSRTSLETQKLDLMTEVSELKLKL
                                     ::::::::::::::::::::.:.:.:::::
CCDS55                               MLQQELLSRTSLETQKLDLMAEISNLKLKL
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pF1KB1 VGMEKEQREQEEKQRKAEELLQELRHLKIKVEELENERNQYEWKLKATKA----------
       ...::.. . :.: : .: :.::.  :..:: :...:: ::: :::.::.          
CCDS55 TAVEKDRLDYEDKFRDTEGLIQEINDLRLKVSEMDSERLQYEKKLKSTKSLMAKLSSMKI
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                                  170       180       190       200
pF1KB1 ---------------------EVAQLQEQVALKDAEIERLHSQLSRTAALHSESHTERDQ
                            :.:.:.::.  :..:..::. .:      ..   ..:: 
CCDS55 KVGQMQYEKQRMEQKWESLKDELASLKEQLEEKESEVKRLQEKLVCKMKGEGVEIVDRDI
              100       110       120       130       140       150

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pF1KB1 EIQRLKMGMETLLLANEDKDRRIEELTGLLNQYRKVKEIVMVTQGPS---ERTL---SIN
       :.:..: ..:.:. :::.:::.::.:   ::.:.:... :...:: .   :. :   ::.
CCDS55 EVQKMKKAVESLMAANEEKDRKIEDLRQCLNRYKKMQDTVVLAQGKDGEYEELLNSSSIS
              160       170       180       190       200       210

          260       270              280       290           300   
pF1KB1 EEEPEGGFSKWNATNKDPEEL-------FKQEMPPRCSSPTVG---PPPLPQK-SLETRA
             :::  . . .    .       :.  .: .  .  .    :  ::   :.::  
CCDS55 SLLDAQGFSDLEKSPSPTPVMGSPSCDPFNTSVPEEFHTTILQVSIPSLLPATVSMETSE
              220       230       240       250       260       270

               310            320                330       340     
pF1KB1 QKKLS----CSLED-----LRSESVDK--C-------MDGNQPFPVLEPKDSPFLAEHKY
       ..::.     :.:.     . . .::   :       .. .. .  :. . :    :   
CCDS55 KSKLTPKPETSFEENDGNIILGATVDTQLCDKLLTSSLQKSSSLGNLKKETSDGEKETIQ
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         350        360          370       380                 390 
pF1KB1 PTLPGKLSGAT-PNGEAAKSPP---TICQPDATGSSLLR--LNRG--------RSVSAPV
        :   .  . . : :     ::   :  . .  :.  .:  ..::        :..::: 
CCDS55 KTSEDRAPAESRPFGTLPPRPPGQDTSMDDNPFGTRKVRSSFGRGFFKIKSNKRTASAPN
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pF1KB1 LGDTESGWDDTAVVNDLSSTSS-GTESGPQSPL-----TPDGKRNPKGIKKFWGKIRRTQ
       :..::.   .::   ::...::   .:  .::.     .::.:.. .:: :..::.::.:
CCDS55 LAETEK---ETAEHLDLAGASSRPKDSQRNSPFQIPPPSPDSKKKSRGIMKLFGKLRRSQ
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pF1KB1 SGNFYTDTLGMAEFRRGGLRATAGPRLSRTRDSKGQKSDANAPFAQWSTERVCAWLEDFG
       : .:  : ..  ::.::: ::::::::. .::   ..:: . :::.:. :.:: :: . :
CCDS55 STTFNPDDMSEPEFKRGGTRATAGPRLGWSRDLGQSNSDLDMPFAKWTKEQVCNWLMEQG
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pF1KB1 LAQYVIFARQWVSSGHTLLTATPQDMEKELGIKHPLHRKKLVLAVKAINTKQEEKSALLD
       :..:.  ...:..::.::: :. ::.:::::::: :::::: ::..:.....: . . ::
CCDS55 LGSYLNSGKHWIASGQTLLQASQQDLEKELGIKHSLHRKKLQLALQALGSEEETNHGKLD
       510       520       530       540       550       560       

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pF1KB1 HIWVTRWLDDIGLPQYKDQFHESRVDGRMLQYLTVNDLLFLKVTSQLHHLSIKCAIHVLH
         ::::::::::::::: :: :.:::::::.:.::.::: :::.: ::::::: ::.::.
CCDS55 FNWVTRWLDDIGLPQYKTQFDEGRVDGRMLHYMTVDDLLSLKVVSVLHHLSIKRAIQVLR
       570       580       590       600       610       620       

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pF1KB1 VNKFNPHCLHRRPADESNLSPSEVVQWSNHRVMEWLRSVDLAEYAPNLRGSGVHGGLIIL
       .:.:.:.::.:::.::....:::: .:.:::::::::::::::::::::::::::::..:
CCDS55 INNFEPNCLRRRPSDENTIAPSEVQKWTNHRVMEWLRSVDLAEYAPNLRGSGVHGGLMVL
       630       640       650       660       670       680       

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pF1KB1 EPRFTGDTLAMLLNIPPQKTLLRRHLTTKFNALIGPEAEQEKREKMASPAYTPLTTTAKV
       ::::. .:.:.::::::.::::::::.:.:: ::: ::...::. :  : :. ::.::::
CCDS55 EPRFNVETMAQLLNIPPNKTLLRRHLATHFNLLIGAEAQHQKRDAMELPDYVLLTATAKV
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pF1KB1 RPRKLGFSHFGNIRKKKFDESTDYICPMEPSDGVSDSHRVYSGYRGLSPLDAPELDGLDQ
       .:.::.::.:::.:::: ... .:.:::: ... ... .  .:..    .   : : ::.
CCDS55 KPKKLAFSNFGNLRKKKQEDGEEYVCPMELGQASGSASK--KGFKPGLDMRLYEEDDLDR
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pF1KB1 VGQIS                                                
       . :.                                                 
CCDS55 LEQMEDSEGTVRQIGAFSEGINNLTHMLKEDDMFKDFAARSPSASITDEDSNV
         810       820       830       840       850        

>>CCDS55812.1 PPFIBP1 gene_id:8496|Hs108|chr12            (1011 aa)
 initn: 2187 init1: 1549 opt: 1638  Z-score: 927.6  bits: 182.9 E(32554): 2.4e-45
Smith-Waterman score: 2142; 45.4% identity (69.5% similar) in 844 aa overlap (52-809:124-962)

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pF1KB1 HSAASNETYQERLARLEGDKESLILQVSVLTDQVEAQGEKIRDLEVCLEGHQVKLNAAEE
                                     ::::::::::::::: ::: :. :.::.::
CCDS55 HLPGNGDVYQERLARLENDKESLVLQVSVLTDQVEAQGEKIRDLEFCLEEHREKVNATEE
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pF1KB1 MLQQELLSRTSLETQKLDLMTEVSELKLKLVGMEKEQREQEEKQRKAEELLQELRHLKIK
       ::::::::::::::::::::.:.:.:::::...::.. . :.: : .: :.::.  :..:
CCDS55 MLQQELLSRTSLETQKLDLMAEISNLKLKLTAVEKDRLDYEDKFRDTEGLIQEINDLRLK
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pF1KB1 VEELENERNQYEWKLKATKA-------------------------------EVAQLQEQV
       : :...:: ::: :::.::.                               :.:.:.::.
CCDS55 VSEMDSERLQYEKKLKSTKSLMAKLSSMKIKVGQMQYEKQRMEQKWESLKDELASLKEQL
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pF1KB1 ALKDAEIERLHSQLSRTAALHSESHTERDQEIQRLKMGMETLLLANEDKDRRIEELTGLL
         :..:..::. .:      ..   ..:: :.:..: ..:.:. :::.:::.::.:   :
CCDS55 EEKESEVKRLQEKLVCKMKGEGVEIVDRDIEVQKMKKAVESLMAANEEKDRKIEDLRQCL
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pF1KB1 NQYRKVKEIVMVTQGPS---ERTL---SINEEEPEGGFSKWNATNKDPEEL-------FK
       :.:.:... :...:: .   :. :   ::.      :::  . . .    .       :.
CCDS55 NRYKKMQDTVVLAQGKDGEYEELLNSSSISSLLDAQGFSDLEKSPSPTPVMGSPSCDPFN
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pF1KB1 QEMPPRCSSPTVG---PPPLPQK-SLETRAQKKLS----CSLED-----LRSESVDK--C
         .: .  .  .    :  ::   :.::  ..::.     :.:.     . . .::   :
CCDS55 TSVPEEFHTTILQVSIPSLLPATVSMETSEKSKLTPKPETSFEENDGNIILGATVDTQLC
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pF1KB1 -------MDGNQPFPVLEPKDSPFLAEHKYPTLPGKLSGAT-PNGEAAKSPP---TICQP
              .. .. .  :. . :    :    :   .  . . : :     ::   :  . 
CCDS55 DKLLTSSLQKSSSLGNLKKETSDGEKETIQKTSEDRAPAESRPFGTLPPRPPGQDTSMDD
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pF1KB1 DATGSSLLR--LNRG--------RSVSAPVLGDTESGWDDTAVVNDLSSTSS-GTESGPQ
       .  :.  .:  ..::        :..::: :..::.   .::   ::...::   .:  .
CCDS55 NPFGTRKVRSSFGRGFFKIKSNKRTASAPNLAETEK---ETAEHLDLAGASSRPKDSQRN
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pF1KB1 SPL-----TPDGKRNPKGIKKFWGKIRRTQSGNFYTDTLGMAEFRRGGLRATAGPRLSRT
       ::.     .::.:.. .:: :..::.::.:: .:  : ..  ::.::: ::::::::. .
CCDS55 SPFQIPPPSPDSKKKSRGIMKLFGKLRRSQSTTFNPDDMSEPEFKRGGTRATAGPRLGWS
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pF1KB1 RDSKGQKSDANAPFAQWSTERVCAWLEDFGLAQYVIFARQWVSSGHTLLTATPQDMEKEL
       ::   ..:: . :::.:. :.:: :: . ::..:.  ...:..::.::: :. ::.::::
CCDS55 RDLGQSNSDLDMPFAKWTKEQVCNWLMEQGLGSYLNSGKHWIASGQTLLQASQQDLEKEL
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pF1KB1 GIKHPLHRKKLVLAVKAINTKQEEKSALLDHIWVTRWLDDIGLPQYKDQFHESRVDGRML
       :::: :::::: ::..:.....: . . ::  ::::::::::::::: :: :.:::::::
CCDS55 GIKHSLHRKKLQLALQALGSEEETNHGKLDFNWVTRWLDDIGLPQYKTQFDEGRVDGRML
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pF1KB1 QYLTVNDLLFLKVTSQLHHLSIKCAIHVLHVNKFNPHCLHRRPADESNLSPSEVVQWSNH
       .:.::.::: :::.: ::::::: ::.::..:.:.:.::.:::.::....:::: .:.::
CCDS55 HYMTVDDLLSLKVVSVLHHLSIKRAIQVLRINNFEPNCLRRRPSDENTIAPSEVQKWTNH
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pF1KB1 RVMEWLRSVDLAEYAPNLRGSGVHGGLIILEPRFTGDTLAMLLNIPPQKTLLRRHLTTKF
       :::::::::::::::::::::::::::..:::::. .:.:.::::::.::::::::.:.:
CCDS55 RVMEWLRSVDLAEYAPNLRGSGVHGGLMVLEPRFNVETMAQLLNIPPNKTLLRRHLATHF
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pF1KB1 NALIGPEAEQEKREKMASPAYTPLTTTAKVRPRKLGFSHFGNIRKKKFDESTDYICPMEP
       : ::: ::...::. :  : :. ::.::::.:.::.::.:::.:::: ... .:.:::: 
CCDS55 NLLIGAEAQHQKRDAMELPDYVLLTATAKVKPKKLAFSNFGNLRKKKQEDGEEYVCPMEL
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pF1KB1 SDGVSDSHRVYSGYRGLSPLDAPELDGLDQVGQIS                         
       ... ... .  .:..    .   : : ::.. :.                          
CCDS55 GQASGSASK--KGFKPGLDMRLYEEDDLDRLEQMEDSEGTVRQIGAFSEGINNLTHMLKE
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CCDS55 DDMFKDFAARSPSASITDEDSNV
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>>CCDS8713.1 PPFIBP1 gene_id:8496|Hs108|chr12             (1005 aa)
 initn: 2263 init1: 1549 opt: 1627  Z-score: 921.5  bits: 181.7 E(32554): 5.2e-45
Smith-Waterman score: 2204; 46.3% identity (70.2% similar) in 846 aa overlap (46-809:118-956)

          20        30        40        50        60        70     
pF1KB1 RSQVNHHSAASNETYQERLARLEGDKESLILQVSVLTDQVEAQGEKIRDLEVCLEGHQVK
                                     ::::::::::::::::::::: ::: :. :
CCDS87 SQMTNGHLPGNGDVYQERLARLENDKESLVLQVSVLTDQVEAQGEKIRDLEFCLEEHREK
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pF1KB1 LNAAEEMLQQELLSRTSLETQKLDLMTEVSELKLKLVGMEKEQREQEEKQRKAEELLQEL
       .::.::::::::::::::::::::::.:.:.:::::...::.. . :.: : .: :.::.
CCDS87 VNATEEMLQQELLSRTSLETQKLDLMAEISNLKLKLTAVEKDRLDYEDKFRDTEGLIQEI
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pF1KB1 RHLKIKVEELENERNQYEWKLKATKAEVAQLQEQVALKDAEIERLHSQLSRTAALHSESH
         :..:: :...:: ::: :::.:: :.:.:.::.  :..:..::. .:      ..   
CCDS87 NDLRLKVSEMDSERLQYEKKLKSTKDELASLKEQLEEKESEVKRLQEKLVCKMKGEGVEI
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pF1KB1 TERDQ-----------EIQRLKMGMETLLLANEDKDRRIEELTGLLNQYRKVKEIVMVTQ
       ..::.           :.:..: ..:.:. :::.:::.::.:   ::.:.:... :...:
CCDS87 VDRDENFKKKLKEKNIEVQKMKKAVESLMAANEEKDRKIEDLRQCLNRYKKMQDTVVLAQ
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pF1KB1 GPS------ERTL---SINEEEPEGGFSKWNATNKDPEEL-------FKQEMPP------
       : .      :. :   ::.      :::  . . .    .       :.  .:       
CCDS87 GKKGKDGEYEELLNSSSISSLLDAQGFSDLEKSPSPTPVMGSPSCDPFNTSVPEEFHTTI
       330       340       350       360       370       380       

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pF1KB1 -RCSSPTVGPP-------------PLPQKSLE-------------TRAQKKL-------S
        . : :.. :              : :. :.:             :.   ::       :
CCDS87 LQVSIPSLLPATVSMETSEKSKLTPKPETSFEENDGNIILGATVDTQLCDKLLTSSLQKS
       390       400       410       420       430       440       

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pF1KB1 CSLEDLRSESVDKCMDGNQPFPVLE-PKDS-PFLAEHKYPTLPGKLSGATPNGEAAKSPP
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CCDS87 SSFGRGFFKIKSNKRTASAPNLDRKRSASAPTLAETEK---ETAEHLDLAGASSRPKDSQ
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       :::::: :::::: ::..:.....: . . ::  ::::::::::::::: :: :.:::::
CCDS87 ELGIKHSLHRKKLQLALQALGSEEETNHGKLDFNWVTRWLDDIGLPQYKTQFDEGRVDGR
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CCDS87 MLHYMTVDDLLSLKVVSVLHHLSIKRAIQVLRINNFEPNCLRRRPSDENTIAPSEVQKWT
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       :::::::::::::::::::::::::::::..:::::. .:.:.::::::.::::::::.:
CCDS87 NHRVMEWLRSVDLAEYAPNLRGSGVHGGLMVLEPRFNVETMAQLLNIPPNKTLLRRHLAT
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CCDS87 HFNLLIGAEAQHQKRDAMELPDYVLLTATAKVKPKKLAFSNFGNLRKKKQEDGEEYVCPM
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CCDS87 ELGQASGSASK--KGFKPGLDMRLYEEDDLDRLEQMEDSEGTVRQIGAFSEGINNLTHML
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CCDS87 KEDDMFKDFAARSPSASITDEDSNV
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CCDS15 EMLAKDLEESQGGKSSEVLSATELRVQLAQKEQELARAKEALQAMKADRKRLKGEKTDLV
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       ..... . ::    :.........    .:.:: .: . :    .:. : ...:. :   
CCDS15 SQMQQLYATL----ESREEQLRDFIRNYEQHRKESEDA-VKALAKEKDL-LEREKWELRR
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CCDS15 QAKEATDHATALRSQLDLKDNRMKELEAELAMAKQSLATLTKDVPKRHSLAMP---GETV
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CCDS15 ---LNGNQEWVV--QADLPLTAAIRQSQQTLYHSHPPHPADRQAVRVSPCHSRQPSVIS-
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CCDS15 -DASAAEGDRSSTPSDINSPRHRTHSLCNGDSPGPVQKNLHNPIVQSLEDLEDQKRKKKK
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CCDS15 EKMGFGSISRVFARGKQRKSLDPGLFDDSDSQCSPTRQSLSLSEGEEQMDRLQQVELVRT
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CCDS15 RRKLRLAIEDYRDAEAGRSLSKAAELDHHWVAKAWLNDIGLSQYSQAFQNHLVDGRMLNS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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