Result of SIM4 for pF1KA1231

seq1 = pF1KA1231.tfa, 3183 bp
seq2 = pF1KA1231/gi568815587r_129802316.tfa (gi568815587r:129802316_130047406), 245091 bp

>pF1KA1231 3183
>gi568815587r:129802316_130047406 (Chr11)

(complement)

1-262  (100001-100262)   100% ->
263-504  (102395-102636)   100% ->
505-708  (104778-104981)   100% ->
709-781  (109737-109809)   100% ->
782-899  (112189-112306)   100% ->
900-1029  (115176-115305)   100% ->
1030-1284  (116149-116400)   97% ->
1285-1632  (122178-122525)   100% ->
1633-1788  (124004-124159)   100% ->
1789-1968  (128689-128868)   100% ->
1969-2079  (130170-130280)   100% ->
2080-2280  (131547-131747)   100% ->
2281-2595  (132389-132703)   100% ->
2596-2697  (135182-135283)   100% ->
2698-2878  (136751-136931)   100% ->
2879-2982  (141666-141769)   100% ->
2983-3183  (144891-145091)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTGCTTACTCTGTGCCTTCAACTTTTGCCCAGGCCTCATTGCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTGCTTACTCTGTGCCTTCAACTTTTGCCCAGGCCTCATTGCCAGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCATAACCAGGTGCTGCCTTCCATCGAGAGTGTAGATGGGTCCGACCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCATAACCAGGTGCTGCCTTCCATCGAGAGTGTAGATGGGTCCGACCCTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGCAACTCTGCAGACCCCTCTAGGCAGACTGGAGGCCAAAGAGGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGCAACTCTGCAGACCCCTCTAGGCAGACTGGAGGCCAAAGAGGAAGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GATGAGGATGAGGACGAGGACACTGAGGAAGATGAGGAAGAAGACGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GATGAGGATGAGGACGAGGACACTGAGGAAGATGAGGAAGAAGACGGTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGACACGGATCTGGATGACTGGGAGCCAGACCCGCCCCGGCCCTTCGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGACACGGATCTGGATGACTGGGAGCCAGACCCGCCCCGGCCCTTCGACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CACACGACTTGT         GGTGTGAGGAGTGCAATAACGCGCATGCT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CACACGACTTGTGTA...CAGGGTGTGAGGAGTGCAATAACGCGCATGCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TCAGTGTGTCCGAAGCACGGCCCCTTGCACCCGATCCCCAACCGGCCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102424 TCAGTGTGTCCGAAGCACGGCCCCTTGCACCCGATCCCCAACCGGCCGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GCTCACCCGGGCCAGGGCGAGCCTCCCCCTGGTGCTCTACATAGACAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102474 GCTCACCCGGGCCAGGGCGAGCCTCCCCCTGGTGCTCTACATAGACAGGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TTCTGGGCGGGGTGTTCTCCAAGCGGCGCATCCCCAAGCGCACCCAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102524 TTCTGGGCGGGGTGTTCTCCAAGCGGCGCATCCCCAAGCGCACCCAGTTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GGCCCCGTGGAGGGGCCTCTCGTCAGGGGCTCGGAGCTGAAAGACTGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102574 GGCCCCGTGGAGGGGCCTCTCGTCAGGGGCTCGGAGCTGAAAGACTGTTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CATTCACCTCAAG         GTTTCTCTTGATAAAGGGGACAGGAAAG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 102624 CATTCACCTCAAGGTA...CAGGTTTCTCTTGATAAAGGGGACAGGAAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AAAGGGATTTACATGAAGACCTATGGTTTGAGTTGTCTGATGAGACGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104806 AAAGGGATTTACATGAAGACCTATGGTTTGAGTTGTCTGATGAGACGCTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 TGTAACTGGATGATGTTTGTACGGCCAGCCCAGAATCACCTGGAGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104856 TGTAACTGGATGATGTTTGTACGGCCAGCCCAGAATCACCTGGAGCAGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CCTGGTGGCTTACCAGTATGGCCACCATGTGTATTATACAACCATAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104906 CCTGGTGGCTTACCAGTATGGCCACCATGTGTATTATACAACCATAAAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 ATGTGGAGCCCAAGCAGGAACTGAAG         GTGTGGTATGCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 104956 ATGTGGAGCCCAAGCAGGAACTGAAGGTA...CAGGTGTGGTATGCCGCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TCCTATGCTGAGTTCGTGAACCAGAAAATTCATGACATTTCTGAGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109752 TCCTATGCTGAGTTCGTGAACCAGAAAATTCATGACATTTCTGAGGAAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 AAGGAAAG         TTCTTCGAGAGCAAGAGAAGAATTGGCCCTGCT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 109802 AAGGAAAGGTG...TAGTTCTTCGAGAGCAAGAGAAGAATTGGCCCTGCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 ATGAATGTAACCGCCGATTTATAAGCTCGGAGCAGTTGCAACAGCATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112222 ATGAATGTAACCGCCGATTTATAAGCTCGGAGCAGTTGCAACAGCATCTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 AATTCTCATGATGAGAAACTAGATGTGTTTAGCAG         AACAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 112272 AATTCTCATGATGAGAAACTAGATGTGTTTAGCAGGTA...CAGAACAAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 AGGCAGAGGAAGGGGACGAGGCAAGAGGCGATTCGGTCCAGGTCGACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115182 AGGCAGAGGAAGGGGACGAGGCAAGAGGCGATTCGGTCCAGGTCGACGGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CGGGGCGTCCTCCAAAATTTATCCGCCTGGAAATCACCAGCGAAAATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115232 CGGGGCGTCCTCCAAAATTTATCCGCCTGGAAATCACCAGCGAAAATGGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 GAAAAGAGTGACGATGGGACACAG         GACTTGCTACATTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 115282 GAAAAGAGTGACGATGGGACACAGGTA...CAGGACTTGCTACATTTTCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CACAAAGGAGCAATTTGATGAGGCTGAACCAGCCACTCTGAATGGGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116166 CACAAAGGAGCAATTTGATGAGGCTGAACCAGCCACTCTGAATGGGCTGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 ATCAACCAGAACAGACCACTATCCCAATCCCTCAGCTGCCACAGGAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116216 ATCAACCAGAACAGACCACTATCCCAATCCCTCAGCTGCCACAGGAAACC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 CAGTCTTCCCTGGAACATGAACCAGAAACTCACACCCTGCACCTGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116266 CAGTCTTCCCTGGAACATGAACCAGAAACTCACACCCTGCACCTGCAGCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 GCAGCATGAAGAGAGCGTGGTGCCCACCCAGAGCACGCTGACAGCCGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116316 GCAGCATGAAGAGAGCGTGGTGCCCACCCAGAGCACGCTGACAGCCGACG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 ACATGCGCAGAGCCAAGCGCATCCGATTGGAGCTGCAG         AAT
        |||||||||||||||||||||||||| | -||-|| -|>>>...>>>|||
 116366 ACATGCGCAGAGCCAAGCGCATCCGAGTA AG TGG GGAA...CAGAAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 GCAGCTCTTCAGCATCTGTTTATTCGGAAGTCCTTCCGGCCTTTTAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122181 GCAGCTCTTCAGCATCTGTTTATTCGGAAGTCCTTCCGGCCTTTTAAATG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 CTTGCAGTGTGGGAAGGCCTTCCGGGAAAAGGACAAACTGGACCAGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122231 CTTGCAGTGTGGGAAGGCCTTCCGGGAAAAGGACAAACTGGACCAGCACT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 TACGCTTCCATGGGCGGGAGGGGAACTGCCCACTGACCTGTGATCTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122281 TACGCTTCCATGGGCGGGAGGGGAACTGCCCACTGACCTGTGATCTCTGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 AACAAGGGCTTCATCAGCAGCACATCCTTGGAGAGCCACATGAAGCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122331 AACAAGGGCTTCATCAGCAGCACATCCTTGGAGAGCCACATGAAGCTCCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 CTCAGACCAGAAGACTTACTCTTGCATTTTTTGCCCAGAATCCTTTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122381 CTCAGACCAGAAGACTTACTCTTGCATTTTTTGCCCAGAATCCTTTGACC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538 GCCTTGATTTGTTGAAAGATCATGTGGCCATTCATATCAATGATGGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122431 GCCTTGATTTGTTGAAAGATCATGTGGCCATTCATATCAATGATGGCTAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1588 TTCACCTGCCCAACTTGTAAGAAACGGTTCCCAGATTTTATCCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 122481 TTCACCTGCCCAACTTGTAAGAAACGGTTCCCAGATTTTATCCAGGTG..

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1633     GTGAAAAAACACGTGCGCAGCTTCCACTCAGAAAAGATCTACCAGT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122531 .CAGGTGAAAAAACACGTGCGCAGCTTCCACTCAGAAAAGATCTACCAGT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1679 GCACAGAGTGTGACAAGGCCTTCTGTCGCCCCGATAAACTGCGACTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124050 GCACAGAGTGTGACAAGGCCTTCTGTCGCCCCGATAAACTGCGACTCCAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1729 ATGCTCCGGCATTCGGACCGCAAAGACTTCCTGTGTTCCACCTGTGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124100 ATGCTCCGGCATTCGGACCGCAAAGACTTCCTGTGTTCCACCTGTGGGAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1779 GCAATTTAAG         CGAAAAGACAAACTACGGGAACACATGCAGA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 124150 GCAATTTAAGGTA...TAGCGAAAAGACAAACTACGGGAACACATGCAGA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1820 GGATGCATAATCCTGAGAGGGAGGCCAAGAAAGCCGACCGCATCAGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128720 GGATGCATAATCCTGAGAGGGAGGCCAAGAAAGCCGACCGCATCAGCCGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1870 TCCAAGACGTTCAAGCCCCGCATCACGTCCACAGACTACGACAGCTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128770 TCCAAGACGTTCAAGCCCCGCATCACGTCCACAGACTACGACAGCTTCAC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1920 GTTCAAGTGCCGCCTGTGCATGATGGGCTTCCGGCGGCGCGGCATGCTG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 128820 GTTCAAGTGCCGCCTGTGCATGATGGGCTTCCGGCGGCGCGGCATGCTGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1969         GTAAATCACTTATCGAAGAGACACCCAGACATGAAGATAGAA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128870 TC...TAGGTAAATCACTTATCGAAGAGACACCCAGACATGAAGATAGAA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2011 GAGGTGCCAGAGTTAACTCTACCCATCATAAAACCCAATCGTGATTACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130212 GAGGTGCCAGAGTTAACTCTACCCATCATAAAACCCAATCGTGATTACTT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2061 TTGTCAGTATTGCGATAAG         GTTTATAAAAGTGCCAGCAAGC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 130262 TTGTCAGTATTGCGATAAGGTA...CAGGTTTATAAAAGTGCCAGCAAGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2102 GCAAAGCCCACATTCTGAAGAACCACCCAGGAGCAGAGCTCCCACCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131569 GCAAAGCCCACATTCTGAAGAACCACCCAGGAGCAGAGCTCCCACCGAGC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2152 ATTCGGAAGCTCCGACCCGCTGGTCCTGGAGAGCCAGACCCCATGCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131619 ATTCGGAAGCTCCGACCCGCTGGTCCTGGAGAGCCAGACCCCATGCTGAG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2202 CACACACACCCAGCTGACGGGCACCATCGCCACCCCTCCCGTCTGCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131669 CACACACACCCAGCTGACGGGCACCATCGCCACCCCTCCCGTCTGCTGTC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2252 CCCACTGCTCCAAGCAGTACAGCAGCAAG         ACCAAGATGGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 131719 CCCACTGCTCCAAGCAGTACAGCAGCAAGGTA...CAGACCAAGATGGTC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2293 CAGCACATTCGAAAGAAGCATCCAGAGTTCGCCCAGCTCTCCAACACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132401 CAGCACATTCGAAAGAAGCATCCAGAGTTCGCCCAGCTCTCCAACACCAT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2343 ACACACACCACTGACGACAGCTGTGATCAGTGCCACCCCAGCGGTTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132451 ACACACACCACTGACGACAGCTGTGATCAGTGCCACCCCAGCGGTTTTGA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2393 CTACAGACAGCGCCACTGGAGAGACTGTGGTGACGACGGACCTGCTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132501 CTACAGACAGCGCCACTGGAGAGACTGTGGTGACGACGGACCTGCTCACC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2443 CAAGCAATGACAGAACTGTCCCAGACCTTAACGACAGACTACCGAACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132551 CAAGCAATGACAGAACTGTCCCAGACCTTAACGACAGACTACCGAACGCC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2493 ACAAGGGGATTACCAGAGAATTCAGTACATCCCTGTGTCGCAGTCGGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132601 ACAAGGGGATTACCAGAGAATTCAGTACATCCCTGTGTCGCAGTCGGCGT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2543 CTGGCCTCCAGCAGCCTCAGCACATACAGCTGCAAGTGGTTCAAGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132651 CTGGCCTCCAGCAGCCTCAGCACATACAGCTGCAAGTGGTTCAAGTGGCC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2593 TCG         GCCACTTCCCCTCACCAGTCACAGCAGTCCACTGTGGA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132701 TCGGTA...CAGGCCACTTCCCCTCACCAGTCACAGCAGTCCACTGTGGA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2634 TGTTGGCCAGCTCCATGATCCTCAGCCCTACCCCCAGCACGCCATCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135220 TGTTGGCCAGCTCCATGATCCTCAGCCCTACCCCCAGCACGCCATCCAGG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2684 TGCAGCACATCCAG         GTATCTGGGCAGCCGTTGAGTCCCTCA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 135270 TGCAGCACATCCAGGTC...CAGGTATCTGGGCAGCCGTTGAGTCCCTCA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2725 GCCCAGCAGGCTCAGCAGGGGCTCAGCCCCTCCCACATCCAGGGCAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136778 GCCCAGCAGGCTCAGCAGGGGCTCAGCCCCTCCCACATCCAGGGCAGTTC

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2775 TTCCACACAGGGGCAGGCTCTGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136828 TTCCACACAGGGGCAGGCTCTGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGAATT

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2825 CCTCTGTGCAGCACACGTACCTGCCCAGTGCTTGGAATTCCTTCCGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136878 CCTCTGTGCAGCACACGTACCTGCCCAGTGCTTGGAATTCCTTCCGTGGC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2875 TATT         CATCTGAGATTCAAATGATGACGCTTCCTCCGGGTCA
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 136928 TATTGTA...TAGCATCTGAGATTCAAATGATGACGCTTCCTCCGGGTCA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2916 GTTTGTGATTACAGACAGTGGTGTGGCAACTCCAGTTACTACTGGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141703 GTTTGTGATTACAGACAGTGGTGTGGCAACTCCAGTTACTACTGGCCAGG

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2966 TGAAGGCGGTTACTTCG         GGTCATTATGTGTTATCAGAAAGT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 141753 TGAAGGCGGTTACTTCGGTA...TAGGGTCATTATGTGTTATCAGAAAGT

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3007 CAATCAGAATTGGAAGAAAAGCAAACTTCTGCCCTCTCTGGTGGAGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144915 CAATCAGAATTGGAAGAAAAGCAAACTTCTGCCCTCTCTGGTGGAGTCCA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3057 GGTCGAGCCACCTGCACACAGTGACTCCCTGGACCCCCAGACCAACAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144965 GGTCGAGCCACCTGCACACAGTGACTCCCTGGACCCCCAGACCAACAGCC

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3107 AACAGCAGACCACACAGTACATCATCACCACCACCACCAACGGGAACGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145015 AACAGCAGACCACACAGTACATCATCACCACCACCACCAACGGGAACGGA

   3300     .    :    .    :    .
   3157 AGCAGCGAAGTGCATATCACCAAACCA
        |||||||||||||||||||||||||||
 145065 AGCAGCGAAGTGCATATCACCAAACCA

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