Result of FASTA (ccds) for pF1KA1114
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1114, 1431 aa
  1>>>pF1KA1114 1431 - 1431 aa - 1431 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.0671+/-0.00146; mu= 7.2976+/- 0.088
 mean_var=271.4253+/-54.614, 0's: 0 Z-trim(108.2): 144  B-trim: 0 in 0/49
 Lambda= 0.077848
 statistics sampled from 9923 (10061) to 9923 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.612), E-opt: 0.2 (0.309), width:  16
 Scan time:  5.840

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS43959.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX            (1431) 9241 1053.1       0
CCDS59528.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX            (1034) 6714 769.2       0
CCDS59529.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX            ( 962) 6326 725.6 1.7e-208
CCDS43958.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX            ( 706) 4157 481.9 2.9e-135
CCDS59527.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX            ( 309) 1630 197.7 4.4e-50
CCDS14362.1 MAGED2 gene_id:10916|Hs108|chrX        ( 606) 1431 175.6 3.8e-43
CCDS14337.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX         ( 778) 1331 164.5 1.1e-39
CCDS35281.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX       ( 739) 1330 164.4 1.1e-39
CCDS48116.1 MAGED4 gene_id:728239|Hs108|chrX       ( 739) 1330 164.4 1.1e-39
CCDS14338.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX       ( 741) 1330 164.4 1.1e-39
CCDS35279.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX         ( 834) 1331 164.5 1.2e-39
CCDS56602.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX       ( 757)  824 107.5 1.5e-22
CCDS65261.1 MAGED4 gene_id:728239|Hs108|chrX       ( 757)  824 107.5 1.5e-22
CCDS10023.1 NSMCE3 gene_id:56160|Hs108|chr15       ( 304)  680 91.0 5.8e-18
CCDS3269.1 MAGEF1 gene_id:64110|Hs108|chr3         ( 307)  678 90.8 6.8e-18
CCDS14433.1 MAGEE1 gene_id:57692|Hs108|chrX        ( 957)  648 87.9 1.6e-16
CCDS73700.1 MAGEL2 gene_id:54551|Hs108|chr15       (1249)  639 87.0 3.8e-16
CCDS10014.1 NDN gene_id:4692|Hs108|chr15           ( 321)  615 83.7 9.4e-16
CCDS35221.1 MAGEB10 gene_id:139422|Hs108|chrX      ( 347)  609 83.1 1.6e-15
CCDS14221.1 MAGEB4 gene_id:4115|Hs108|chrX         ( 346)  608 83.0 1.7e-15
CCDS14220.1 MAGEB3 gene_id:4114|Hs108|chrX         ( 346)  598 81.8 3.7e-15
CCDS59524.1 MAGEB17 gene_id:645864|Hs108|chrX      ( 336)  592 81.1 5.8e-15
CCDS14216.1 MAGEB18 gene_id:286514|Hs108|chrX      ( 343)  587 80.6 8.8e-15
CCDS43927.1 MAGEB16 gene_id:139604|Hs108|chrX      ( 324)  584 80.2 1.1e-14
CCDS48180.1 MAGEA11 gene_id:4110|Hs108|chrX        ( 429)  564 78.1 6.1e-14
CCDS14219.1 MAGEB2 gene_id:4113|Hs108|chrX         ( 319)  557 77.2 8.6e-14
CCDS14692.1 MAGEA8 gene_id:4107|Hs108|chrX         ( 318)  555 77.0   1e-13
CCDS14705.1 MAGEA10 gene_id:4109|Hs108|chrX        ( 369)  556 77.1   1e-13
CCDS14222.1 MAGEB1 gene_id:4112|Hs108|chrX         ( 347)  544 75.8 2.5e-13
CCDS35417.1 MAGEC1 gene_id:9947|Hs108|chrX         (1142)  543 76.2 6.3e-13
CCDS14217.1 MAGEB6 gene_id:158809|Hs108|chrX       ( 407)  531 74.4 7.7e-13
CCDS59003.1 MUC22 gene_id:100507679|Hs108|chr6     (1773)  514 73.1 8.2e-12
CCDS65233.1 MAGEB5 gene_id:347541|Hs108|chrX       ( 275)  495 70.2 9.7e-12
CCDS76051.1 MAGEA1 gene_id:4100|Hs108|chrX         ( 309)  495 70.2   1e-11
CCDS14702.1 MAGEA4 gene_id:4103|Hs108|chrX         ( 317)  495 70.2 1.1e-11
CCDS14677.1 MAGEC3 gene_id:139081|Hs108|chrX       ( 346)  491 69.8 1.6e-11
CCDS35423.1 MAGEA9B gene_id:728269|Hs108|chrX      ( 315)  484 69.0 2.5e-11
CCDS14691.1 MAGEA9 gene_id:4108|Hs108|chrX         ( 315)  484 69.0 2.5e-11
CCDS14678.1 MAGEC2 gene_id:51438|Hs108|chrX        ( 373)  480 68.6 3.9e-11


>>CCDS43959.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX                 (1431 aa)
 initn: 9241 init1: 9241 opt: 9241  Z-score: 5623.8  bits: 1053.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 9241; 100.0% identity (100.0% similar) in 1431 aa overlap (1-1431:1-1431)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MDRRNDYGYRVPLFQGPLPPPGSLGLPFPPDIQTETTEEDSVLLMHTLLAATKDSLAMDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MDRRNDYGYRVPLFQGPLPPPGSLGLPFPPDIQTETTEEDSVLLMHTLLAATKDSLAMDP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 PVVNRPKKSKTKKAPIKTITKAAPAAPPVPAANEIATNKPKITWQALNLPVITQISQALP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PVVNRPKKSKTKKAPIKTITKAAPAAPPVPAANEIATNKPKITWQALNLPVITQISQALP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 TTEVTNTQASSVTAQPKKANKMKRVTAKAAQGSQSPTGHEGGTIQLKSPLQVLKLPVISQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TTEVTNTQASSVTAQPKKANKMKRVTAKAAQGSQSPTGHEGGTIQLKSPLQVLKLPVISQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 NIHAPIANESASSQALITSIKPKKASKAKKAANKAIASATEVSLAATATHTATTQGQITN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NIHAPIANESASSQALITSIKPKKASKAKKAANKAIASATEVSLAATATHTATTQGQITN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 ETASIHTTAASIRTKKASKARKTIAKVINTDTEHIEALNVTDAATRQIEASVVAIRPKKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ETASIHTTAASIRTKKASKARKTIAKVINTDTEHIEALNVTDAATRQIEASVVAIRPKKS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 KGKKAASRGPNSVSEISEAPLATQIVTNQALAATLRVKRGSRARKAATKARATESQTPNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KGKKAASRGPNSVSEISEAPLATQIVTNQALAATLRVKRGSRARKAATKARATESQTPNA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 DQGAQAKIASAQTNVSALETQVAAAVQALADDYLAQLSLEPTTRTRGKRNRKSKHLNGDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DQGAQAKIASAQTNVSALETQVAAAVQALADDYLAQLSLEPTTRTRGKRNRKSKHLNGDE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 RSGSNYRRIPWGRRPAPPRDVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RSGSNYRRIPWGRRPAPPRDVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 YFPEIIERASYTLEKMFRVNLKEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YFPEIIERASYTLEKMFRVNLKEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVIL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 SVIFMNGNKASEAVIWEVLRKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SVIFMNGNKASEAVIWEVLRKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRP
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA1 PEYEFFWGLRSYHETSKMKVLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PEYEFFWGLRSYHETSKMKVLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEAR
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA1 AEARAQMGIGEEAVAGPWNWDDMDIDCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AEARAQMGIGEEAVAGPWNWDDMDIDCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTN
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA1 VNFSRGASTRAGFSDGASISFNGAPSSSGGFSGGPGITFGVAPSTSASFSNTASISFGGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VNFSRGASTRAGFSDGASISFNGAPSSSGGFSGGPGITFGVAPSTSASFSNTASISFGGT
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA1 LSTSSSFSSAASISFGCAHSTSTSFSSEASISFGGMPCTSASFSGGVSSSFSGPLSTSAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LSTSSSFSSAASISFGCAHSTSTSFSSEASISFGGMPCTSASFSGGVSSSFSGPLSTSAT
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA1 FSGGASSGFGGTLSTTAGFSGVLSTSTSFGSAPTTSTVFSSALSTSTGFGGILSTSVCFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FSGGASSGFGGTLSTTAGFSGVLSTSTSFGSAPTTSTVFSSALSTSTGFGGILSTSVCFG
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA1 GSPSSSGSFGGTLSTSICFGGSPCTSTGFGGTLSTSVSFGGSSSTSANFGGTLSTSICFD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GSPSSSGSFGGTLSTSICFGGSPCTSTGFGGTLSTSVSFGGSSSTSANFGGTLSTSICFD
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA1 GSPSTGAGFGGALNTSASFGSVLNTSTGFGGAMSTSADFGGTLSTSVCFGGSPGTSVSFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GSPSTGAGFGGALNTSASFGSVLNTSTGFGGAMSTSADFGGTLSTSVCFGGSPGTSVSFG
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA1 SALNTNAGYGGAVSTNTDFGGTLSTSVCFGGSPSTSAGFGGALNTNASFGCAVSTSASFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SALNTNAGYGGAVSTNTDFGGTLSTSVCFGGSPSTSAGFGGALNTNASFGCAVSTSASFS
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA1 GAVSTSACFSGAPITNPGFGGAFSTSAGFGGALSTAADFGGTPSNSIGFGAAPSTSVSFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GAVSTSACFSGAPITNPGFGGAFSTSAGFGGALSTAADFGGTPSNSIGFGAAPSTSVSFG
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KA1 GAHGTSLCFGGAPSTSLCFGSASNTNLCFGGPPSTSACFSGATSPSFCDGPSTSTGFSFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GAHGTSLCFGGAPSTSLCFGSASNTNLCFGGPPSTSACFSGATSPSFCDGPSTSTGFSFG
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KA1 NGLSTNAGFGGGLNTSAGFGGGLGTSAGFSGGLSTSSGFDGGLGTSAGFGGGPGTSTGFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NGLSTNAGFGGGLNTSAGFGGGLGTSAGFSGGLSTSSGFDGGLGTSAGFGGGPGTSTGFG
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KA1 GGLGTSAGFSGGLGTSAGFGGGLVTSDGFGGGLGTNASFGSTLGTSAGFSGGLSTSDGFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GGLGTSAGFSGGLGTSAGFGGGLVTSDGFGGGLGTNASFGSTLGTSAGFSGGLSTSDGFG
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KA1 SRPNASFDRGLSTIIGFGSGSNTSTGFTGEPSTSTGFSSGPSSIVGFSGGPSTGVGFCSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SRPNASFDRGLSTIIGFGSGSNTSTGFTGEPSTSTGFSSGPSSIVGFSGGPSTGVGFCSG
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430 
pF1KA1 PSTSGFSGGPSTGAGFGGGPNTGAGFGGGPSTSAGFGSGAASLGACGFSYG
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PSTSGFSGGPSTGAGFGGGPNTGAGFGGGPSTSAGFGSGAASLGACGFSYG
             1390      1400      1410      1420      1430 

>>CCDS59528.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX                 (1034 aa)
 initn: 6714 init1: 6714 opt: 6714  Z-score: 4091.8  bits: 769.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6714; 99.9% identity (100.0% similar) in 1020 aa overlap (412-1431:15-1034)

             390       400       410       420       430       440 
pF1KA1 VAAAVQALADDYLAQLSLEPTTRTRGKRNRKSKHLNGDERSGSNYRRIPWGRRPAPPRDV
                                     .:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59                 MDRRNDYGYRVPLFQSKHLNGDERSGSNYRRIPWGRRPAPPRDV
                               10        20        30        40    

             450       460       470       480       490       500 
pF1KA1 AILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDEYFPEIIERASYTLEKMFRVNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 AILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDEYFPEIIERASYTLEKMFRVNL
           50        60        70        80        90       100    

             510       520       530       540       550       560 
pF1KA1 KEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVILSVIFMNGNKASEAVIWEVLRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVILSVIFMNGNKASEAVIWEVLRK
          110       120       130       140       150       160    

             570       580       590       600       610       620 
pF1KA1 LGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRPPEYEFFWGLRSYHETSKMKVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRPPEYEFFWGLRSYHETSKMKVL
          170       180       190       200       210       220    

             630       640       650       660       670       680 
pF1KA1 KFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEARAEARAQMGIGEEAVAGPWNWD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEARAEARAQMGIGEEAVAGPWNWD
          230       240       250       260       270       280    

             690       700       710       720       730       740 
pF1KA1 DMDIDCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTNVNFSRGASTRAGFSDGASISF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DMDIDCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTNVNFSRGASTRAGFSDGASISF
          290       300       310       320       330       340    

             750       760       770       780       790       800 
pF1KA1 NGAPSSSGGFSGGPGITFGVAPSTSASFSNTASISFGGTLSTSSSFSSAASISFGCAHST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 NGAPSSSGGFSGGPGITFGVAPSTSASFSNTASISFGGTLSTSSSFSSAASISFGCAHST
          350       360       370       380       390       400    

             810       820       830       840       850       860 
pF1KA1 STSFSSEASISFGGMPCTSASFSGGVSSSFSGPLSTSATFSGGASSGFGGTLSTTAGFSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 STSFSSEASISFGGMPCTSASFSGGVSSSFSGPLSTSATFSGGASSGFGGTLSTTAGFSG
          410       420       430       440       450       460    

             870       880       890       900       910       920 
pF1KA1 VLSTSTSFGSAPTTSTVFSSALSTSTGFGGILSTSVCFGGSPSSSGSFGGTLSTSICFGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 VLSTSTSFGSAPTTSTVFSSALSTSTGFGGILSTSVCFGGSPSSSGSFGGTLSTSICFGG
          470       480       490       500       510       520    

             930       940       950       960       970       980 
pF1KA1 SPCTSTGFGGTLSTSVSFGGSSSTSANFGGTLSTSICFDGSPSTGAGFGGALNTSASFGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SPCTSTGFGGTLSTSVSFGGSSSTSANFGGTLSTSICFDGSPSTGAGFGGALNTSASFGS
          530       540       550       560       570       580    

             990      1000      1010      1020      1030      1040 
pF1KA1 VLNTSTGFGGAMSTSADFGGTLSTSVCFGGSPGTSVSFGSALNTNAGYGGAVSTNTDFGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 VLNTSTGFGGAMSTSADFGGTLSTSVCFGGSPGTSVSFGSALNTNAGYGGAVSTNTDFGG
          590       600       610       620       630       640    

            1050      1060      1070      1080      1090      1100 
pF1KA1 TLSTSVCFGGSPSTSAGFGGALNTNASFGCAVSTSASFSGAVSTSACFSGAPITNPGFGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 TLSTSVCFGGSPSTSAGFGGALNTNASFGCAVSTSASFSGAVSTSACFSGAPITNPGFGG
          650       660       670       680       690       700    

            1110      1120      1130      1140      1150      1160 
pF1KA1 AFSTSAGFGGALSTAADFGGTPSNSIGFGAAPSTSVSFGGAHGTSLCFGGAPSTSLCFGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 AFSTSAGFGGALSTAADFGGTPSNSIGFGAAPSTSVSFGGAHGTSLCFGGAPSTSLCFGS
          710       720       730       740       750       760    

            1170      1180      1190      1200      1210      1220 
pF1KA1 ASNTNLCFGGPPSTSACFSGATSPSFCDGPSTSTGFSFGNGLSTNAGFGGGLNTSAGFGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ASNTNLCFGGPPSTSACFSGATSPSFCDGPSTSTGFSFGNGLSTNAGFGGGLNTSAGFGG
          770       780       790       800       810       820    

            1230      1240      1250      1260      1270      1280 
pF1KA1 GLGTSAGFSGGLSTSSGFDGGLGTSAGFGGGPGTSTGFGGGLGTSAGFSGGLGTSAGFGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GLGTSAGFSGGLSTSSGFDGGLGTSAGFGGGPGTSTGFGGGLGTSAGFSGGLGTSAGFGG
          830       840       850       860       870       880    

            1290      1300      1310      1320      1330      1340 
pF1KA1 GLVTSDGFGGGLGTNASFGSTLGTSAGFSGGLSTSDGFGSRPNASFDRGLSTIIGFGSGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GLVTSDGFGGGLGTNASFGSTLGTSAGFSGGLSTSDGFGSRPNASFDRGLSTIIGFGSGS
          890       900       910       920       930       940    

            1350      1360      1370      1380      1390      1400 
pF1KA1 NTSTGFTGEPSTSTGFSSGPSSIVGFSGGPSTGVGFCSGPSTSGFSGGPSTGAGFGGGPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 NTSTGFTGEPSTSTGFSSGPSSIVGFSGGPSTGVGFCSGPSTSGFSGGPSTGAGFGGGPN
          950       960       970       980       990      1000    

            1410      1420      1430 
pF1KA1 TGAGFGGGPSTSAGFGSGAASLGACGFSYG
       ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 TGAGFGGGPSTSAGFGSGAASLGACGFSYG
         1010      1020      1030    

>>CCDS59529.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX                 (962 aa)
 initn: 6326 init1: 6326 opt: 6326  Z-score: 3856.7  bits: 725.6 E(32554): 1.7e-208
Smith-Waterman score: 6326; 100.0% identity (100.0% similar) in 962 aa overlap (470-1431:1-962)

     440       450       460       470       480       490         
pF1KA1 DVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDEYFPEIIERASYTLEKMFRV
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59                               MLRDVIQEYDEYFPEIIERASYTLEKMFRV
                                             10        20        30

     500       510       520       530       540       550         
pF1KA1 NLKEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVILSVIFMNGNKASEAVIWEVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 NLKEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVILSVIFMNGNKASEAVIWEVL
               40        50        60        70        80        90

     560       570       580       590       600       610         
pF1KA1 RKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRPPEYEFFWGLRSYHETSKMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 RKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRPPEYEFFWGLRSYHETSKMK
              100       110       120       130       140       150

     620       630       640       650       660       670         
pF1KA1 VLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEARAEARAQMGIGEEAVAGPWN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 VLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEARAEARAQMGIGEEAVAGPWN
              160       170       180       190       200       210

     680       690       700       710       720       730         
pF1KA1 WDDMDIDCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTNVNFSRGASTRAGFSDGASI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 WDDMDIDCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTNVNFSRGASTRAGFSDGASI
              220       230       240       250       260       270

     740       750       760       770       780       790         
pF1KA1 SFNGAPSSSGGFSGGPGITFGVAPSTSASFSNTASISFGGTLSTSSSFSSAASISFGCAH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SFNGAPSSSGGFSGGPGITFGVAPSTSASFSNTASISFGGTLSTSSSFSSAASISFGCAH
              280       290       300       310       320       330

     800       810       820       830       840       850         
pF1KA1 STSTSFSSEASISFGGMPCTSASFSGGVSSSFSGPLSTSATFSGGASSGFGGTLSTTAGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 STSTSFSSEASISFGGMPCTSASFSGGVSSSFSGPLSTSATFSGGASSGFGGTLSTTAGF
              340       350       360       370       380       390

     860       870       880       890       900       910         
pF1KA1 SGVLSTSTSFGSAPTTSTVFSSALSTSTGFGGILSTSVCFGGSPSSSGSFGGTLSTSICF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SGVLSTSTSFGSAPTTSTVFSSALSTSTGFGGILSTSVCFGGSPSSSGSFGGTLSTSICF
              400       410       420       430       440       450

     920       930       940       950       960       970         
pF1KA1 GGSPCTSTGFGGTLSTSVSFGGSSSTSANFGGTLSTSICFDGSPSTGAGFGGALNTSASF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GGSPCTSTGFGGTLSTSVSFGGSSSTSANFGGTLSTSICFDGSPSTGAGFGGALNTSASF
              460       470       480       490       500       510

     980       990      1000      1010      1020      1030         
pF1KA1 GSVLNTSTGFGGAMSTSADFGGTLSTSVCFGGSPGTSVSFGSALNTNAGYGGAVSTNTDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GSVLNTSTGFGGAMSTSADFGGTLSTSVCFGGSPGTSVSFGSALNTNAGYGGAVSTNTDF
              520       530       540       550       560       570

    1040      1050      1060      1070      1080      1090         
pF1KA1 GGTLSTSVCFGGSPSTSAGFGGALNTNASFGCAVSTSASFSGAVSTSACFSGAPITNPGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GGTLSTSVCFGGSPSTSAGFGGALNTNASFGCAVSTSASFSGAVSTSACFSGAPITNPGF
              580       590       600       610       620       630

    1100      1110      1120      1130      1140      1150         
pF1KA1 GGAFSTSAGFGGALSTAADFGGTPSNSIGFGAAPSTSVSFGGAHGTSLCFGGAPSTSLCF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GGAFSTSAGFGGALSTAADFGGTPSNSIGFGAAPSTSVSFGGAHGTSLCFGGAPSTSLCF
              640       650       660       670       680       690

    1160      1170      1180      1190      1200      1210         
pF1KA1 GSASNTNLCFGGPPSTSACFSGATSPSFCDGPSTSTGFSFGNGLSTNAGFGGGLNTSAGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GSASNTNLCFGGPPSTSACFSGATSPSFCDGPSTSTGFSFGNGLSTNAGFGGGLNTSAGF
              700       710       720       730       740       750

    1220      1230      1240      1250      1260      1270         
pF1KA1 GGGLGTSAGFSGGLSTSSGFDGGLGTSAGFGGGPGTSTGFGGGLGTSAGFSGGLGTSAGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GGGLGTSAGFSGGLSTSSGFDGGLGTSAGFGGGPGTSTGFGGGLGTSAGFSGGLGTSAGF
              760       770       780       790       800       810

    1280      1290      1300      1310      1320      1330         
pF1KA1 GGGLVTSDGFGGGLGTNASFGSTLGTSAGFSGGLSTSDGFGSRPNASFDRGLSTIIGFGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GGGLVTSDGFGGGLGTNASFGSTLGTSAGFSGGLSTSDGFGSRPNASFDRGLSTIIGFGS
              820       830       840       850       860       870

    1340      1350      1360      1370      1380      1390         
pF1KA1 GSNTSTGFTGEPSTSTGFSSGPSSIVGFSGGPSTGVGFCSGPSTSGFSGGPSTGAGFGGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GSNTSTGFTGEPSTSTGFSSGPSSIVGFSGGPSTGVGFCSGPSTSGFSGGPSTGAGFGGG
              880       890       900       910       920       930

    1400      1410      1420      1430 
pF1KA1 PNTGAGFGGGPSTSAGFGSGAASLGACGFSYG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PNTGAGFGGGPSTSAGFGSGAASLGACGFSYG
              940       950       960  

>>CCDS43958.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX                 (706 aa)
 initn: 4157 init1: 4157 opt: 4157  Z-score: 2541.8  bits: 481.9 E(32554): 2.9e-135
Smith-Waterman score: 4157; 100.0% identity (100.0% similar) in 662 aa overlap (1-662:1-662)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MDRRNDYGYRVPLFQGPLPPPGSLGLPFPPDIQTETTEEDSVLLMHTLLAATKDSLAMDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MDRRNDYGYRVPLFQGPLPPPGSLGLPFPPDIQTETTEEDSVLLMHTLLAATKDSLAMDP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 PVVNRPKKSKTKKAPIKTITKAAPAAPPVPAANEIATNKPKITWQALNLPVITQISQALP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PVVNRPKKSKTKKAPIKTITKAAPAAPPVPAANEIATNKPKITWQALNLPVITQISQALP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 TTEVTNTQASSVTAQPKKANKMKRVTAKAAQGSQSPTGHEGGTIQLKSPLQVLKLPVISQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TTEVTNTQASSVTAQPKKANKMKRVTAKAAQGSQSPTGHEGGTIQLKSPLQVLKLPVISQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 NIHAPIANESASSQALITSIKPKKASKAKKAANKAIASATEVSLAATATHTATTQGQITN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NIHAPIANESASSQALITSIKPKKASKAKKAANKAIASATEVSLAATATHTATTQGQITN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 ETASIHTTAASIRTKKASKARKTIAKVINTDTEHIEALNVTDAATRQIEASVVAIRPKKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ETASIHTTAASIRTKKASKARKTIAKVINTDTEHIEALNVTDAATRQIEASVVAIRPKKS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 KGKKAASRGPNSVSEISEAPLATQIVTNQALAATLRVKRGSRARKAATKARATESQTPNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KGKKAASRGPNSVSEISEAPLATQIVTNQALAATLRVKRGSRARKAATKARATESQTPNA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 DQGAQAKIASAQTNVSALETQVAAAVQALADDYLAQLSLEPTTRTRGKRNRKSKHLNGDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DQGAQAKIASAQTNVSALETQVAAAVQALADDYLAQLSLEPTTRTRGKRNRKSKHLNGDE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 RSGSNYRRIPWGRRPAPPRDVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RSGSNYRRIPWGRRPAPPRDVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 YFPEIIERASYTLEKMFRVNLKEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YFPEIIERASYTLEKMFRVNLKEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVIL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 SVIFMNGNKASEAVIWEVLRKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SVIFMNGNKASEAVIWEVLRKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRP
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA1 PEYEFFWGLRSYHETSKMKVLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PEYEFFWGLRSYHETSKMKVLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEAR
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA1 AEARAQMGIGEEAVAGPWNWDDMDIDCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTN
       ::                                                          
CCDS43 AEIYSPCLQIPLINCSSPSHGAKVHPWNLCPHSSQGSYGQSAEGVM              
              670       680       690       700                    

>>CCDS59527.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX                 (309 aa)
 initn: 1630 init1: 1630 opt: 1630  Z-score: 1012.6  bits: 197.7 E(32554): 4.4e-50
Smith-Waterman score: 1630; 99.6% identity (100.0% similar) in 251 aa overlap (412-662:15-265)

             390       400       410       420       430       440 
pF1KA1 VAAAVQALADDYLAQLSLEPTTRTRGKRNRKSKHLNGDERSGSNYRRIPWGRRPAPPRDV
                                     .:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59                 MDRRNDYGYRVPLFQSKHLNGDERSGSNYRRIPWGRRPAPPRDV
                               10        20        30        40    

             450       460       470       480       490       500 
pF1KA1 AILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDEYFPEIIERASYTLEKMFRVNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 AILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDEYFPEIIERASYTLEKMFRVNL
           50        60        70        80        90       100    

             510       520       530       540       550       560 
pF1KA1 KEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVILSVIFMNGNKASEAVIWEVLRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVILSVIFMNGNKASEAVIWEVLRK
          110       120       130       140       150       160    

             570       580       590       600       610       620 
pF1KA1 LGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRPPEYEFFWGLRSYHETSKMKVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRPPEYEFFWGLRSYHETSKMKVL
          170       180       190       200       210       220    

             630       640       650       660       670       680 
pF1KA1 KFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEARAEARAQMGIGEEAVAGPWNWD
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                   
CCDS59 KFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEARAEIYSPCLQIPLINCSSPSHG
          230       240       250       260       270       280    

             690       700       710       720       730       740 
pF1KA1 DMDIDCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTNVNFSRGASTRAGFSDGASISF
                                                                   
CCDS59 AKVHPWNLCPHSSQGSYGQSAEGVM                                   
          290       300                                            

>>CCDS14362.1 MAGED2 gene_id:10916|Hs108|chrX             (606 aa)
 initn: 1557 init1: 893 opt: 1431  Z-score: 888.1  bits: 175.6 E(32554): 3.8e-43
Smith-Waterman score: 1468; 46.4% identity (70.6% similar) in 612 aa overlap (175-759:30-605)

          150       160       170       180       190       200    
pF1KA1 VTAKAAQGSQSPTGHEGGTIQLKSPLQVLKLPVISQNIHAPIANESASSQALITSIKPKK
                                     : ...::...:  .   .:.:: .: .  :
CCDS14  MSDTSESGAGLTRFQAEASEKDSSSMMQTLLTVTQNVEVP--ETPKASKALEVS-EDVK
                10        20        30        40          50       

          210       220       230       240       250       260    
pF1KA1 ASKAKKAANKAIASATEVSLAATATHTATTQGQITNETASIHTTAASIRTKKASKARKTI
       .:::.     ....::::: .  : .. .::.. :.. .. .. ::  ..  :.  ..  
CCDS14 VSKAS-----GVSKATEVSKTPEAREAPATQASSTTQLTDTQVLAAENKSLAADTKKQ--
         60             70        80        90       100           

          270       280       290          300       310       320 
pF1KA1 AKVINTDTEHIEALNVTDAATRQIEASVVA---IRPKKSKGKKAASRGPNSVSEISEAPL
           :.: .      ::  ::.  ..: ::   .  : .. . : :..: .  :   :  
CCDS14 ----NADPQ-----AVTMPATETKKVSHVADTKVNTKAQETEAAPSQAPADEPEPESA--
         110            120       130       140       150          

             330       340         350       360          370      
pF1KA1 ATQIVTNQALAATLRVKRGSRARK--AATKARATESQTPNADQG---AQAKIASAQTNVS
       :.:   ::     ...:.. ....  .   . . .::. ..  :   ..: .::    .:
CCDS14 AAQSQENQDTRPKVKAKKARKVKHLDGEEDGSSDQSQASGTTGGRRVSKALMASMARRAS
      160       170       180       190       200       210        

            380       390       400       410       420       430  
pF1KA1 ----ALETQVAAAVQALADDYLAQLSLEPTTRTRGKRNRKSKHLNGDERSGSNYRRIPWG
           :. .. :. ..  :    : :::.     :::  :.. .:.....        :  
CCDS14 RGPIAFWARRASRTRLAAWARRALLSLRSPKARRGKARRRAAKLQSSQE--------P--
      220       230       240       250       260                  

            440       450       460       470       480       490  
pF1KA1 RRPAPPRDVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDEYFPEIIERASYT
        .  ::::::.:: ::: ::::::.::::::::::::::.:.:.:: . .:::::::.:.
CCDS14 -EAPPPRDVALLQGRANDLVKYLLAKDQTKIPIKRSDMLKDIIKEYTDVYPEIIERAGYS
       270       280       290       300       310       320       

            500       510        520       530       540       550 
pF1KA1 LEKMFRVNLKEIDKQSSLYILISTQE-SSAGILGTTKDTPKLGLLMVILSVIFMNGNKAS
       :::.: ..::::::.. ::::.:: : ..:::::::::.::::::::.::.::::::..:
CCDS14 LEKVFGIQLKEIDKNDHLYILLSTLEPTDAGILGTTKDSPKLGLLMVLLSIIFMNGNRSS
       330       340       350       360       370       380       

             560       570       580       590       600       610 
pF1KA1 EAVIWEVLRKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRPPEYEFFWGLRS
       ::::::::::::::::..:::::.:.:::::::::::::.: ::::: ::::::::::::
CCDS14 EAVIWEVLRKLGLRPGIHHSLFGDVKKLITDEFVKQKYLDYARVPNSNPPEYEFFWGLRS
       390       400       410       420       430       440       

             620       630       640       650       660       670 
pF1KA1 YHETSKMKVLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEARAEARAQMGIG-
       :.::::::::::::.:::::::.::.:::::.: ...::: :.:::.:::: ::.:::: 
CCDS14 YYETSKMKVLKFACKVQKKDPKEWAAQYREAMEADLKAAAEAAAEAKARAEIRARMGIGL
       450       460       470       480       490       500       

               680         690       700       710       720       
pF1KA1 -EEAVAGPWNWDDMDID--CLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTNVNFSRGA
         : .::: :::. ::     .: . : .:.: .. :    . :. .:..::: . : .:
CCDS14 GSENAAGPCNWDEADIGPWAKARIQAGAEAKAKAQES----GSASTGASTSTNNSASASA
       510       520       530       540           550       560   

       730       740                 750       760       770       
pF1KA1 STRAGFSDGASIS----------FNGAPSSSGGFSGGPGITFGVAPSTSASFSNTASISF
       :: .::: :::..          ..:: .:..: ::. :...                  
CCDS14 STSGGFSAGASLTATLTFGLFAGLGGAGASTSGSSGACGFSYK                 
           570       580       590       600                       

       780       790       800       810       820       830       
pF1KA1 GGTLSTSSSFSSAASISFGCAHSTSTSFSSEASISFGGMPCTSASFSGGVSSSFSGPLST

>>CCDS14337.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX              (778 aa)
 initn: 1444 init1: 1322 opt: 1331  Z-score: 826.0  bits: 164.5 E(32554): 1.1e-39
Smith-Waterman score: 1365; 38.8% identity (61.2% similar) in 794 aa overlap (33-751:15-775)

             10        20        30        40        50        60  
pF1KA1 RRNDYGYRVPLFQGPLPPPGSLGLPFPPDIQTETTEEDSVLLMHTLLAATKDSLAMDPPV
                                     :.:.. :::.:::.::. : . : :  :: 
CCDS14                 MAQKMDCGAGLLGFQAEASVEDSALLMQTLMEAIQISEA--PP-
                               10        20        30          40  

             70        80        90              100       110     
pF1KA1 VNRPKKSKTKKAPIKTITKAAPAAPPVPAANEIA-------TNKPKITWQALNLPV----
               :..:     . :.: .   :.:::.:       . .:: .... :  .    
CCDS14 --------TNQAT----AAASPQSSQPPTANEMADIQVSAAAARPKSAFKVQNATTKGPN
                          50        60        70        80         

              120       130           140       150       160      
pF1KA1 -ITQISQALPTTEVTNTQAS----SVTAQPKKANKMKRVTAKAAQGSQSPTGHEGGTIQL
        . ..:::  . .: ::: .    : .: ::  :     .  :. :  . .  :   . .
CCDS14 GVYDFSQAHNAKDVPNTQPKAAFKSQNATPKGPNAAYDFSQAATTGELAANKSE---MAF
      90       100       110       120       130       140         

        170        180        190       200       210       220    
pF1KA1 KSPLQVLKL-PVISQNIHAPI-ANESASSQALITSIKPKKASKAKKAANKAIASATEVSL
       :.   . :. :  . :.   . ::. :.:       .::   :: . ..:: .. :... 
CCDS14 KAQNATTKVGPNATYNFSQSLNANDLANS-------RPKTPFKAWNDTTKAPTADTQTQN
        150       160       170              180       190         

          230       240       250        260         270       280 
pF1KA1 AATATHTATTQGQITNETASIHTTAASIRTKK-ASKARKTIAKVI--NTDTEHIEALNVT
       .  : . ::.:..: .. .  .  .:. .:.  .:.:..  ...:  .  :..:. ::: 
CCDS14 VNQA-KMATSQADIETDPGISEPDGATAQTSADGSQAQNLESRTIIRGKRTRKINNLNVE
     200        210       220       230       240       250        

             290       300       310         320       330         
pF1KA1 DAATRQIEASVVAIRPKKSKGKKAASRGPNSVSE--ISEAPLATQIVTNQALAATLRVKR
       . .. . . . .:    .:    .....: ..    . ..::: :   : .   .  ...
CCDS14 ENSSGDQRRAPLAAGTWRSAPVPVTTQNPPGAPPNVLWQTPLAWQ---NPSGWQNQTARQ
      260       270       280       290       300          310     

     340       350         360                                370  
pF1KA1 GSRARKAATKARATES--QTPNADQGA---------QAKIA----------------SAQ
          ::..   :: :    :.: : :.          :  .                  : 
CCDS14 TPPARQSPP-ARQTPPAWQNPVAWQNPVIWPNPVIWQNPVIWPNPIVWPGPVVWPNPLAW
         320        330       340       350       360       370    

            380           390              400       410       420 
pF1KA1 TNVSALET----QVAAAVQALAD-----DYL--AQLSLEPTTRTRGKRNRKSKHLNGDE-
        :  . .:    :.  . :.  :     :.    .  : :              . .:  
CCDS14 QNPPGWQTPPGWQTPPGWQGPPDWQGPPDWPLPPDWPLPPDWPLPTDWPLPPDWIPADWP
          380       390       400       410       420       430    

                      430            440       450       460       
pF1KA1 --------RSGSNYRRIPWGR---RP--APPRDVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKR
               : . : :  : .:    :  : :::::.::::::::::::..:: ::.::::
CCDS14 IPPDWQNLRPSPNLRPSPNSRASQNPGAAQPRDVALLQERANKLVKYLMLKDYTKVPIKR
          440       450       460       470       480       490    

       470       480       490       500       510       520       
pF1KA1 SDMLRDVIQEYDEYFPEIIERASYTLEKMFRVNLKEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTT
       :.::::.:.:: . .::::::: ..::: : ..::::::.  ::::::: :: :::::::
CCDS14 SEMLRDIIREYTDVYPEIIERACFVLEKKFGIQLKEIDKEEHLYILISTPESLAGILGTT
          500       510       520       530       540       550    

       530       540       550       560       570       580       
pF1KA1 KDTPKLGLLMVILSVIFMNGNKASEAVIWEVLRKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQ
       :::::::::.:::.:::::::.:::::.::.:::.:::::::: :.:..:::.: :::::
CCDS14 KDTPKLGLLLVILGVIFMNGNRASEAVLWEALRKMGLRPGVRHPLLGDLRKLLTYEFVKQ
          560       570       580       590       600       610    

       590       600       610       620       630       640       
pF1KA1 KYLEYKRVPNSRPPEYEFFWGLRSYHETSKMKVLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEV
       :::.:.::::: ::::::.:::::::::::::::.:  .:::.::.::..:. ::..  .
CCDS14 KYLDYRRVPNSNPPEYEFLWGLRSYHETSKMKVLRFIAEVQKRDPRDWTAQFMEAADEAL
          620       630       640       650       660       670    

       650       660       670       680       690       700       
pF1KA1 QAAAVAVAEAEARAEARAQMGIGEEAVAGPWNWDDMDIDCLTREELGDDAQAWSRFSFEI
       .:  .:.::::::::::..::::.:::.:::.:::.... :: .: :: .. :::. : .
CCDS14 DALDAAAAEAEARAEARTRMGIGDEAVSGPWSWDDIEFELLTWDEEGDFGDPWSRIPFTF
          680       690       700       710       720       730    

       710       720       730       740       750       760       
pF1KA1 EARAQENADASTNVNFSRGASTRAGFSDGASISFNGAPSSSGGFSGGPGITFGVAPSTSA
        :: ..:: .    .:   :.   : .  :: .: .  .. : :                
CCDS14 WARYHQNARSRFPQTF---AGPIIGPGGTASANFAANFGAIGFFWVE             
          740       750          760       770                     

       770       780       790       800       810       820       
pF1KA1 SFSNTASISFGGTLSTSSSFSSAASISFGCAHSTSTSFSSEASISFGGMPCTSASFSGGV

>>CCDS35281.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX            (739 aa)
 initn: 1352 init1: 1231 opt: 1330  Z-score: 825.7  bits: 164.4 E(32554): 1.1e-39
Smith-Waterman score: 1425; 41.8% identity (65.5% similar) in 722 aa overlap (95-769:68-734)

           70        80        90       100       110           120
pF1KA1 RPKKSKTKKAPIKTITKAAPAAPPVPAANEIATNKPKITWQALNLPVITQ-ISQAL---P
                                     : .:.:   :.  : ::..: . .::   :
CCDS35 EFGAFGGYGTLTSFDIHILRAFGSLGPGLRILSNEP---WELEN-PVLAQTLVEALQLDP
        40        50        60        70            80        90   

              130        140       150         160        170      
pF1KA1 TTEVTNTQASSVT-AQPKKANKMKRVTAKAAQG--SQSPTGHEGGTIQLKSP-LQVLKLP
        : ...: : ... :.   .:.  :..: ::.   ::  ..:. .: :...   :     
CCDS35 ETLANETAARAANVARAAASNRAARAAAAAARTAFSQVVASHRVATPQVSGEDTQPTTYA
           100       110       120       130       140       150   

        180         190       200       210       220       230    
pF1KA1 VISQNI--HAPIANESASSQALITSIKPKKASKAKKAANKAIASATEVSLAATATHTATT
       . .:.   . :.:. . .:: :.::         : :: .: :.... : ... .. :.:
CCDS35 AEAQGPTPEPPLASPQ-TSQMLVTS---------KMAAPEAPATSAQ-SQTGSPAQEAAT
           160        170                180       190        200  

          240       250       260       270       280       290    
pF1KA1 QGQITNETASIHTTAASIRTKKASKARKTIAKVINTDTEHIEALNVTDAATRQIEASVVA
       .:     .:   . :   :   :.  : . : . ..:        : :  :.   .: .:
CCDS35 EGP---SSACAFSQAPCAREVDAN--RPSTAFLGQND--------VFDF-TQPAGVSGMA
               210       220         230                240        

            300       310       320       330       340       350  
pF1KA1 I-RPKK-SKGKKAASRGPNSVSEISEAPLATQIVTNQALAATLRVKRGSRARKAATKARA
       . :::. . ...::..::...: .   :   :   .. .::: : :  ... :: .:.: 
CCDS35 FPRPKRPAPAQEAATEGPSAASGV---P---QTGPGREVAAT-RPKT-TKSGKALAKTRW
      250       260       270             280         290       300

            360       370       380       390       400       410  
pF1KA1 TESQTPNADQGAQAKIASAQTNVSALETQVAAAVQALADDYLAQLSLEPTTRTRGKRNRK
       .: :.  :  .:.::.:.     :  : . :::. :       : : :: .:  :::..:
CCDS35 VEPQNVVAAAAAKAKMAT-----SIPEPEGAAAATA-------QHSAEPWARMGGKRTKK
              310            320       330              340        

            420       430                                          
pF1KA1 SKHLNGDERSGSNYRRIP-----W-------------GRRPA---------------PPR
       ::::. . .:. . :. :     :             . ::                :::
CCDS35 SKHLDDEYESSEEERETPAVPPTWRASQPSLTVRAQLAPRPPMAPRSQIPSRHVLCLPPR
      350       360       370       380       390       400        

     440       450       460       470       480       490         
pF1KA1 DVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDEYFPEIIERASYTLEKMFRV
       .:..::::::::::::..::  ::::::.:::.:::.::::.::::::::.::::: : .
CCDS35 NVTLLQERANKLVKYLMIKDYKKIPIKRADMLKDVIREYDEHFPEIIERATYTLEKKFGI
      410       420       430       440       450       460        

     500       510       520       530       540       550         
pF1KA1 NLKEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVILSVIFMNGNKASEAVIWEVL
       .::::::.  ::::. :..::: .:: :::::.:.::.:::.:::::::.:::::.::.:
CCDS35 HLKEIDKEEHLYILVCTRDSSARLLGKTKDTPRLSLLLVILGVIFMNGNRASEAVLWEAL
      470       480       490       500       510       520        

     560       570       580       590       600       610         
pF1KA1 RKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRPPEYEFFWGLRSYHETSKMK
       ::.:::::::: ..:..::::::.::::::::::..::: ::::::.::::. ::::::.
CCDS35 RKMGLRPGVRHPFLGDLRKLITDDFVKQKYLEYKKIPNSNPPEYEFLWGLRARHETSKMR
      530       540       550       560       570       580        

     620       630       640       650       660       670         
pF1KA1 VLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEARAEARAQMGIGEEAVAGPWN
       ::.:  . :..::..: ... :::.   ..  : .:: .:::. ::::.::.::. : :.
CCDS35 VLRFIAQNQNRDPREWKAHFLEAVDDAFKTMDVDMAEEHARAQMRAQMNIGDEALIGRWS
      590       600       610       620       630       640        

     680       690       700       710       720       730         
pF1KA1 WDDMDIDCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTNVNFSRGASTRAGFSDGASI
       :::.... :: .: :: ..::.:. : . :: ..    :. .:  : :. ::: :.:.  
CCDS35 WDDIQVELLTWDEDGDFGDAWARIPFAFWARYHQYILNSNRAN--RRATWRAGVSSGT--
      650       660       670       680       690         700      

     740         750       760       770       780       790       
pF1KA1 SFNGAPSSS--GGFSGGPGITFGVAPSTSASFSNTASISFGGTLSTSSSFSSAASISFGC
         ::. :.:   : : .  :    :  ..:::                            
CCDS35 --NGGASTSVLDGPSTSSTIRTRNAARAGASFFSWIQ                       
            710       720       730                                

       800       810       820       830       840       850       
pF1KA1 AHSTSTSFSSEASISFGGMPCTSASFSGGVSSSFSGPLSTSATFSGGASSGFGGTLSTTA

>>CCDS48116.1 MAGED4 gene_id:728239|Hs108|chrX            (739 aa)
 initn: 1352 init1: 1231 opt: 1330  Z-score: 825.7  bits: 164.4 E(32554): 1.1e-39
Smith-Waterman score: 1425; 41.8% identity (65.5% similar) in 722 aa overlap (95-769:68-734)

           70        80        90       100       110           120
pF1KA1 RPKKSKTKKAPIKTITKAAPAAPPVPAANEIATNKPKITWQALNLPVITQ-ISQAL---P
                                     : .:.:   :.  : ::..: . .::   :
CCDS48 EFGAFGGYGTLTSFDIHILRAFGSLGPGLRILSNEP---WELEN-PVLAQTLVEALQLDP
        40        50        60        70            80        90   

              130        140       150         160        170      
pF1KA1 TTEVTNTQASSVT-AQPKKANKMKRVTAKAAQG--SQSPTGHEGGTIQLKSP-LQVLKLP
        : ...: : ... :.   .:.  :..: ::.   ::  ..:. .: :...   :     
CCDS48 ETLANETAARAANVARAAASNRAARAAAAAARTAFSQVVASHRVATPQVSGEDTQPTTYA
           100       110       120       130       140       150   

        180         190       200       210       220       230    
pF1KA1 VISQNI--HAPIANESASSQALITSIKPKKASKAKKAANKAIASATEVSLAATATHTATT
       . .:.   . :.:. . .:: :.::         : :: .: :.... : ... .. :.:
CCDS48 AEAQGPTPEPPLASPQ-TSQMLVTS---------KMAAPEAPATSAQ-SQTGSPAQEAAT
           160        170                180       190        200  

          240       250       260       270       280       290    
pF1KA1 QGQITNETASIHTTAASIRTKKASKARKTIAKVINTDTEHIEALNVTDAATRQIEASVVA
       .:     .:   . :   :   :.  : . : . ..:        : :  :.   .: .:
CCDS48 EGP---SSACAFSQAPCAREVDAN--RPSTAFLGQND--------VFDF-TQPAGVSGMA
               210       220         230                240        

            300       310       320       330       340       350  
pF1KA1 I-RPKK-SKGKKAASRGPNSVSEISEAPLATQIVTNQALAATLRVKRGSRARKAATKARA
       . :::. . ...::..::...: .   :   :   .. .::: : :  ... :: .:.: 
CCDS48 FPRPKRPAPAQEAATEGPSAASGV---P---QTGPGREVAAT-RPKT-TKSGKALAKTRW
      250       260       270             280         290       300

            360       370       380       390       400       410  
pF1KA1 TESQTPNADQGAQAKIASAQTNVSALETQVAAAVQALADDYLAQLSLEPTTRTRGKRNRK
       .: :.  :  .:.::.:.     :  : . :::. :       : : :: .:  :::..:
CCDS48 VEPQNVVAAAAAKAKMAT-----SIPEPEGAAAATA-------QHSAEPWARMGGKRTKK
              310            320       330              340        

            420       430                                          
pF1KA1 SKHLNGDERSGSNYRRIP-----W-------------GRRPA---------------PPR
       ::::. . .:. . :. :     :             . ::                :::
CCDS48 SKHLDDEYESSEEERETPAVPPTWRASQPSLTVRAQLAPRPPMAPRSQIPSRHVLCLPPR
      350       360       370       380       390       400        

     440       450       460       470       480       490         
pF1KA1 DVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDEYFPEIIERASYTLEKMFRV
       .:..::::::::::::..::  ::::::.:::.:::.::::.::::::::.::::: : .
CCDS48 NVTLLQERANKLVKYLMIKDYKKIPIKRADMLKDVIREYDEHFPEIIERATYTLEKKFGI
      410       420       430       440       450       460        

     500       510       520       530       540       550         
pF1KA1 NLKEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVILSVIFMNGNKASEAVIWEVL
       .::::::.  ::::. :..::: .:: :::::.:.::.:::.:::::::.:::::.::.:
CCDS48 HLKEIDKEEHLYILVCTRDSSARLLGKTKDTPRLSLLLVILGVIFMNGNRASEAVLWEAL
      470       480       490       500       510       520        

     560       570       580       590       600       610         
pF1KA1 RKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRPPEYEFFWGLRSYHETSKMK
       ::.:::::::: ..:..::::::.::::::::::..::: ::::::.::::. ::::::.
CCDS48 RKMGLRPGVRHPFLGDLRKLITDDFVKQKYLEYKKIPNSNPPEYEFLWGLRARHETSKMR
      530       540       550       560       570       580        

     620       630       640       650       660       670         
pF1KA1 VLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEARAEARAQMGIGEEAVAGPWN
       ::.:  . :..::..: ... :::.   ..  : .:: .:::. ::::.::.::. : :.
CCDS48 VLRFIAQNQNRDPREWKAHFLEAVDDAFKTMDVDMAEEHARAQMRAQMNIGDEALIGRWS
      590       600       610       620       630       640        

     680       690       700       710       720       730         
pF1KA1 WDDMDIDCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTNVNFSRGASTRAGFSDGASI
       :::.... :: .: :: ..::.:. : . :: ..    :. .:  : :. ::: :.:.  
CCDS48 WDDIQVELLTWDEDGDFGDAWARIPFAFWARYHQYILNSNRAN--RRATWRAGVSSGT--
      650       660       670       680       690         700      

     740         750       760       770       780       790       
pF1KA1 SFNGAPSSS--GGFSGGPGITFGVAPSTSASFSNTASISFGGTLSTSSSFSSAASISFGC
         ::. :.:   : : .  :    :  ..:::                            
CCDS48 --NGGASTSVLDGPSTSSTIRTRNAARAGASFFSWIQ                       
            710       720       730                                

       800       810       820       830       840       850       
pF1KA1 AHSTSTSFSSEASISFGGMPCTSASFSGGVSSSFSGPLSTSATFSGGASSGFGGTLSTTA

>>CCDS14338.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX            (741 aa)
 initn: 1352 init1: 1231 opt: 1330  Z-score: 825.6  bits: 164.4 E(32554): 1.1e-39
Smith-Waterman score: 1425; 41.8% identity (65.5% similar) in 722 aa overlap (95-769:68-734)

           70        80        90       100       110           120
pF1KA1 RPKKSKTKKAPIKTITKAAPAAPPVPAANEIATNKPKITWQALNLPVITQ-ISQAL---P
                                     : .:.:   :.  : ::..: . .::   :
CCDS14 EFGAFGGYGTLTSFDIHILRAFGSLGPGLRILSNEP---WELEN-PVLAQTLVEALQLDP
        40        50        60        70            80        90   

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pF1KA1 TTEVTNTQASSVT-AQPKKANKMKRVTAKAAQG--SQSPTGHEGGTIQLKSP-LQVLKLP
        : ...: : ... :.   .:.  :..: ::.   ::  ..:. .: :...   :     
CCDS14 ETLANETAARAANVARAAASNRAARAAAAAARTAFSQVVASHRVATPQVSGEDTQPTTYA
           100       110       120       130       140       150   

        180         190       200       210       220       230    
pF1KA1 VISQNI--HAPIANESASSQALITSIKPKKASKAKKAANKAIASATEVSLAATATHTATT
       . .:.   . :.:. . .:: :.::         : :: .: :.... : ... .. :.:
CCDS14 AEAQGPTPEPPLASPQ-TSQMLVTS---------KMAAPEAPATSAQ-SQTGSPAQEAAT
           160        170                180       190        200  

          240       250       260       270       280       290    
pF1KA1 QGQITNETASIHTTAASIRTKKASKARKTIAKVINTDTEHIEALNVTDAATRQIEASVVA
       .:     .:   . :   :   :.  : . : . ..:        : :  :.   .: .:
CCDS14 EGP---SSACAFSQAPCAREVDAN--RPSTAFLGQND--------VFDF-TQPAGVSGMA
               210       220         230                240        

            300       310       320       330       340       350  
pF1KA1 I-RPKK-SKGKKAASRGPNSVSEISEAPLATQIVTNQALAATLRVKRGSRARKAATKARA
       . :::. . ...::..::...: .   :   :   .. .::: : :  ... :: .:.: 
CCDS14 FPRPKRPAPAQEAATEGPSAASGV---P---QTGPGREVAAT-RPKT-TKSGKALAKTRW
      250       260       270             280         290       300

            360       370       380       390       400       410  
pF1KA1 TESQTPNADQGAQAKIASAQTNVSALETQVAAAVQALADDYLAQLSLEPTTRTRGKRNRK
       .: :.  :  .:.::.:.     :  : . :::. :       : : :: .:  :::..:
CCDS14 VEPQNVVAAAAAKAKMAT-----SIPEPEGAAAATA-------QHSAEPWARMGGKRTKK
              310            320       330              340        

            420       430                                          
pF1KA1 SKHLNGDERSGSNYRRIP-----W-------------GRRPA---------------PPR
       ::::. . .:. . :. :     :             . ::                :::
CCDS14 SKHLDDEYESSEEERETPAVPPTWRASQPSLTVRAQLAPRPPMAPRSQIPSRHVLCLPPR
      350       360       370       380       390       400        

     440       450       460       470       480       490         
pF1KA1 DVAILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDEYFPEIIERASYTLEKMFRV
       .:..::::::::::::..::  ::::::.:::.:::.::::.::::::::.::::: : .
CCDS14 NVTLLQERANKLVKYLMIKDYKKIPIKRADMLKDVIREYDEHFPEIIERATYTLEKKFGI
      410       420       430       440       450       460        

     500       510       520       530       540       550         
pF1KA1 NLKEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVILSVIFMNGNKASEAVIWEVL
       .::::::.  ::::. :..::: .:: :::::.:.::.:::.:::::::.:::::.::.:
CCDS14 HLKEIDKEEHLYILVCTRDSSARLLGKTKDTPRLSLLLVILGVIFMNGNRASEAVLWEAL
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pF1KA1 RKLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRPPEYEFFWGLRSYHETSKMK
       ::.:::::::: ..:..::::::.::::::::::..::: ::::::.::::. ::::::.
CCDS14 RKMGLRPGVRHPFLGDLRKLITDDFVKQKYLEYKKIPNSNPPEYEFLWGLRARHETSKMR
      530       540       550       560       570       580        

     620       630       640       650       660       670         
pF1KA1 VLKFACRVQKKDPKDWAVQYREAVEMEVQAAAVAVAEAEARAEARAQMGIGEEAVAGPWN
       ::.:  . :..::..: ... :::.   ..  : .:: .:::. ::::.::.::. : :.
CCDS14 VLRFIAQNQNRDPREWKAHFLEAVDDAFKTMDVDMAEEHARAQMRAQMNIGDEALIGRWS
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pF1KA1 WDDMDIDCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTNVNFSRGASTRAGFSDGASI
       :::.... :: .: :: ..::.:. : . :: ..    :. .:  : :. ::: :.:.  
CCDS14 WDDIQVELLTWDEDGDFGDAWARIPFAFWARYHQYILNSNRAN--RRATWRAGVSSGT--
      650       660       670       680       690         700      

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pF1KA1 SFNGAPSSS--GGFSGGPGITFGVAPSTSASFSNTASISFGGTLSTSSSFSSAASISFGC
         ::. :.:   : : .  :    :  ..:::                            
CCDS14 --NGGASTSVLDGPSTSSTIRTRNAARAGASFFSWIQHR                     
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pF1KA1 AHSTSTSFSSEASISFGGMPCTSASFSGGVSSSFSGPLSTSATFSGGASSGFGGTLSTTA




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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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