Result of FASTA (omim) for pF1KA1008
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1008, 928 aa
  1>>>pF1KA1008 928 - 928 aa - 928 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7816+/-0.000396; mu= 19.4977+/- 0.025
 mean_var=84.4247+/-16.796, 0's: 0 Z-trim(113.8): 30  B-trim: 210 in 1/52
 Lambda= 0.139585
 statistics sampled from 23347 (23370) to 23347 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.627), E-opt: 0.2 (0.274), width:  16
 Scan time: 13.990

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001121698 (OMIM: 607533) exosome complex exonuc ( 928) 6159 1250.8       0
NP_001309277 (OMIM: 607533) exosome complex exonuc ( 835) 5459 1109.8       0
NP_055768 (OMIM: 607533) exosome complex exonuclea ( 958) 5459 1109.9       0
NP_001309278 (OMIM: 607533) exosome complex exonuc ( 796) 5238 1065.3       0
XP_005254203 (OMIM: 614183) PREDICTED: DIS3-like e ( 848)  964 204.6 1.7e-51
NP_588616 (OMIM: 614183) DIS3-like exonuclease 1 i ( 971)  964 204.7 1.9e-51
NP_001310865 (OMIM: 614183) DIS3-like exonuclease  ( 971)  964 204.7 1.9e-51
NP_001310874 (OMIM: 614183) DIS3-like exonuclease  ( 971)  964 204.7 1.9e-51
NP_001310873 (OMIM: 614183) DIS3-like exonuclease  (1037)  964 204.7   2e-51
NP_001137160 (OMIM: 614183) DIS3-like exonuclease  (1054)  964 204.7   2e-51
NP_001310877 (OMIM: 614183) DIS3-like exonuclease  ( 994)  948 201.5 1.8e-50
NP_001310866 (OMIM: 614183) DIS3-like exonuclease  ( 928)  945 200.8 2.6e-50
NP_001310870 (OMIM: 614183) DIS3-like exonuclease  ( 920)  939 199.6 5.9e-50
NP_001310875 (OMIM: 614183) DIS3-like exonuclease  ( 920)  939 199.6 5.9e-50
NP_001310868 (OMIM: 614183) DIS3-like exonuclease  ( 920)  939 199.6 5.9e-50
NP_001310867 (OMIM: 614183) DIS3-like exonuclease  ( 920)  939 199.6 5.9e-50
NP_001310872 (OMIM: 614183) DIS3-like exonuclease  ( 684)  646 140.5 2.7e-32
NP_001310869 (OMIM: 614183) DIS3-like exonuclease  ( 684)  646 140.5 2.7e-32
NP_001244210 (OMIM: 267000,614184) DIS3-like exonu ( 603)  566 124.4 1.7e-27
NP_689596 (OMIM: 267000,614184) DIS3-like exonucle ( 885)  566 124.5 2.3e-27
NP_208384 (OMIM: 611265) helicase with zinc finger (2080)  323 75.8 2.5e-12
NP_001032412 (OMIM: 611265) helicase with zinc fin (2649)  323 75.9   3e-12
NP_001244211 (OMIM: 267000,614184) DIS3-like exonu ( 249)  168 44.0  0.0011


>>NP_001121698 (OMIM: 607533) exosome complex exonucleas  (928 aa)
 initn: 6159 init1: 6159 opt: 6159  Z-score: 6699.0  bits: 1250.8 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 6159; 99.9% identity (99.9% similar) in 928 aa overlap (1-928:1-928)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MLKSKTFLKKTRAGGVMKIVREHYLRDDIGCGAPGCAACGGAHEGPALEPQPQDPASSVC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MLKSKTFLKKTRAGGVMKIVREHYLRDDIGCGAPGCAACGGAHEGPALEPQPQDPASSVC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 PQPHYLLPDTNVLLHQIVSAWRPGTWASVASSLRLPGSLETYVEQEQGENANDRNDRAIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PQPHYLLPDTNVLLHQIVSAWRPGTWASVASSLRLPGSLETYVEQEQGENANDRNDRAIR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 VAAKWYNEHLKKMSADNQLQVIFITNDRRNKEKAIEEGIPAFTCEEYVKSLTANPELIDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VAAKWYNEHLKKMSADNQLQVIFITNDRRNKEKAIEEGIPAFTCEEYVKSLTANPELIDR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 LACLSEEGNEIESGKIIFSEHLPLSKLQQGIKSGTYLQGTFRASRENYLEATVWIHGDNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LACLSEEGNEIESGKIIFSEHLPLSKLQQGIKSGTYLQGTFRASRENYLEATVWIHGDNE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 ENKEIILQGLKHLNRAVHEDIVAVELLPKSQWVAPSSVVLHDEGQNEEDVEKEEERERML
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::
NP_001 ENKEIILQGLKHLNRAVHEDIVAVELLPKSQWVAPSSVVLHDEGQNEEDVEKEEETERML
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 KTAVSEKMLKPTGRVVGIIKRNWRPYCGMLSKSDIKESRRHLFTPADKRIPRIRIETRQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KTAVSEKMLKPTGRVVGIIKRNWRPYCGMLSKSDIKESRRHLFTPADKRIPRIRIETRQA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 STLEGRRIIVAIDGWPRNSRYPNGHFVRNLGDVGEKETETEVLLLEHDVPHQPFSQAVLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 STLEGRRIIVAIDGWPRNSRYPNGHFVRNLGDVGEKETETEVLLLEHDVPHQPFSQAVLS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 FLPKMPWSITEKDMKNREDLRHLCICSVDPPGCTDIDDALHCRELENGNLEVGVHIADVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FLPKMPWSITEKDMKNREDLRHLCICSVDPPGCTDIDDALHCRELENGNLEVGVHIADVS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 HFIRPGNALDQESARRGTTVYLCEKRIDMVPELLSSNLCSLKCDVDRLAFSCIWEMNHNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HFIRPGNALDQESARRGTTVYLCEKRIDMVPELLSSNLCSLKCDVDRLAFSCIWEMNHNA
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 EILKTKFTKSVINSKASLTYAEAQLRIDSANMNDDITTSLRGLNKLAKILKKRRIEKGAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EILKTKFTKSVINSKASLTYAEAQLRIDSANMNDDITTSLRGLNKLAKILKKRRIEKGAL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA1 TLSSPEVRFHMDSETHDPIDLQTKELRETNSMVEEFMLLANISVAKKIHEEFSEHALLRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TLSSPEVRFHMDSETHDPIDLQTKELRETNSMVEEFMLLANISVAKKIHEEFSEHALLRK
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA1 HPAPPPSNYEILVKAARSRNLEIKTDTAKSLAESLDQAESPTFPYLNTLLRILATRCMMQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HPAPPPSNYEILVKAARSRNLEIKTDTAKSLAESLDQAESPTFPYLNTLLRILATRCMMQ
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA1 AVYFCSGMDNDFHHYGLASPIYTHFTSPIRRYADVIVHRLLAVAIGADCTYPELTDKHKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AVYFCSGMDNDFHHYGLASPIYTHFTSPIRRYADVIVHRLLAVAIGADCTYPELTDKHKL
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA1 ADICKNLNFRHKMAQYAQRASVAFHTQLFFKSKGIVSEEAYILFVRKNAIVVLIPKYGLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ADICKNLNFRHKMAQYAQRASVAFHTQLFFKSKGIVSEEAYILFVRKNAIVVLIPKYGLE
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA1 GTVFFEEKDKPNPQLIYDDEIPSLKIEDTVFHVFDKVKVKIMLDSSNLQHQKIRMSLVEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GTVFFEEKDKPNPQLIYDDEIPSLKIEDTVFHVFDKVKVKIMLDSSNLQHQKIRMSLVEP
              850       860       870       880       890       900

              910       920        
pF1KA1 QIPGISIPTDTSNMDLNGPKKKKMKLGK
       ::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QIPGISIPTDTSNMDLNGPKKKKMKLGK
              910       920        

>>NP_001309277 (OMIM: 607533) exosome complex exonucleas  (835 aa)
 initn: 5459 init1: 5459 opt: 5459  Z-score: 5937.8  bits: 1109.8 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 5459; 99.9% identity (99.9% similar) in 829 aa overlap (100-928:7-835)

      70        80        90       100       110       120         
pF1KA1 TNVLLHQIVSAWRPGTWASVASSLRLPGSLETYVEQEQGENANDRNDRAIRVAAKWYNEH
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001                         MCYCTRETYVEQEQGENANDRNDRAIRVAAKWYNEH
                                       10        20        30      

     130       140       150       160       170       180         
pF1KA1 LKKMSADNQLQVIFITNDRRNKEKAIEEGIPAFTCEEYVKSLTANPELIDRLACLSEEGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LKKMSADNQLQVIFITNDRRNKEKAIEEGIPAFTCEEYVKSLTANPELIDRLACLSEEGN
         40        50        60        70        80        90      

     190       200       210       220       230       240         
pF1KA1 EIESGKIIFSEHLPLSKLQQGIKSGTYLQGTFRASRENYLEATVWIHGDNEENKEIILQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EIESGKIIFSEHLPLSKLQQGIKSGTYLQGTFRASRENYLEATVWIHGDNEENKEIILQG
        100       110       120       130       140       150      

     250       260       270       280       290       300         
pF1KA1 LKHLNRAVHEDIVAVELLPKSQWVAPSSVVLHDEGQNEEDVEKEEERERMLKTAVSEKML
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::
NP_001 LKHLNRAVHEDIVAVELLPKSQWVAPSSVVLHDEGQNEEDVEKEEETERMLKTAVSEKML
        160       170       180       190       200       210      

     310       320       330       340       350       360         
pF1KA1 KPTGRVVGIIKRNWRPYCGMLSKSDIKESRRHLFTPADKRIPRIRIETRQASTLEGRRII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KPTGRVVGIIKRNWRPYCGMLSKSDIKESRRHLFTPADKRIPRIRIETRQASTLEGRRII
        220       230       240       250       260       270      

     370       380       390       400       410       420         
pF1KA1 VAIDGWPRNSRYPNGHFVRNLGDVGEKETETEVLLLEHDVPHQPFSQAVLSFLPKMPWSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VAIDGWPRNSRYPNGHFVRNLGDVGEKETETEVLLLEHDVPHQPFSQAVLSFLPKMPWSI
        280       290       300       310       320       330      

     430       440       450       460       470       480         
pF1KA1 TEKDMKNREDLRHLCICSVDPPGCTDIDDALHCRELENGNLEVGVHIADVSHFIRPGNAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TEKDMKNREDLRHLCICSVDPPGCTDIDDALHCRELENGNLEVGVHIADVSHFIRPGNAL
        340       350       360       370       380       390      

     490       500       510       520       530       540         
pF1KA1 DQESARRGTTVYLCEKRIDMVPELLSSNLCSLKCDVDRLAFSCIWEMNHNAEILKTKFTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DQESARRGTTVYLCEKRIDMVPELLSSNLCSLKCDVDRLAFSCIWEMNHNAEILKTKFTK
        400       410       420       430       440       450      

     550       560       570       580       590       600         
pF1KA1 SVINSKASLTYAEAQLRIDSANMNDDITTSLRGLNKLAKILKKRRIEKGALTLSSPEVRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SVINSKASLTYAEAQLRIDSANMNDDITTSLRGLNKLAKILKKRRIEKGALTLSSPEVRF
        460       470       480       490       500       510      

     610       620       630       640       650       660         
pF1KA1 HMDSETHDPIDLQTKELRETNSMVEEFMLLANISVAKKIHEEFSEHALLRKHPAPPPSNY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HMDSETHDPIDLQTKELRETNSMVEEFMLLANISVAKKIHEEFSEHALLRKHPAPPPSNY
        520       530       540       550       560       570      

     670       680       690       700       710       720         
pF1KA1 EILVKAARSRNLEIKTDTAKSLAESLDQAESPTFPYLNTLLRILATRCMMQAVYFCSGMD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EILVKAARSRNLEIKTDTAKSLAESLDQAESPTFPYLNTLLRILATRCMMQAVYFCSGMD
        580       590       600       610       620       630      

     730       740       750       760       770       780         
pF1KA1 NDFHHYGLASPIYTHFTSPIRRYADVIVHRLLAVAIGADCTYPELTDKHKLADICKNLNF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NDFHHYGLASPIYTHFTSPIRRYADVIVHRLLAVAIGADCTYPELTDKHKLADICKNLNF
        640       650       660       670       680       690      

     790       800       810       820       830       840         
pF1KA1 RHKMAQYAQRASVAFHTQLFFKSKGIVSEEAYILFVRKNAIVVLIPKYGLEGTVFFEEKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RHKMAQYAQRASVAFHTQLFFKSKGIVSEEAYILFVRKNAIVVLIPKYGLEGTVFFEEKD
        700       710       720       730       740       750      

     850       860       870       880       890       900         
pF1KA1 KPNPQLIYDDEIPSLKIEDTVFHVFDKVKVKIMLDSSNLQHQKIRMSLVEPQIPGISIPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KPNPQLIYDDEIPSLKIEDTVFHVFDKVKVKIMLDSSNLQHQKIRMSLVEPQIPGISIPT
        760       770       780       790       800       810      

     910       920        
pF1KA1 DTSNMDLNGPKKKKMKLGK
       :::::::::::::::::::
NP_001 DTSNMDLNGPKKKKMKLGK
        820       830     

>>NP_055768 (OMIM: 607533) exosome complex exonuclease R  (958 aa)
 initn: 5995 init1: 5459 opt: 5459  Z-score: 5936.9  bits: 1109.9 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 5927; 94.9% identity (95.4% similar) in 958 aa overlap (1-928:1-958)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MLKSKTFLKKTRAGGVMKIVREHYLRDDIGCGAPGCAACGGAHEGPALEPQPQDPASSVC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MLKSKTFLKKTRAGGVMKIVREHYLRDDIGCGAPGCAACGGAHEGPALEPQPQDPASSVC
               10        20        30        40        50        60

               70        80             90                         
pF1KA1 PQPHYLLPDTNVLLHQIVSAWRPG-----TWASVASSLR---LP----------------
       :::::::::::::::::     :.     .  .: . .:    :                
NP_055 PQPHYLLPDTNVLLHQIDVLEDPAIRNVIVLQTVLQEVRNRSAPVYKRIRDVTNNQEKHF
               70        80        90       100       110       120

              100       110       120       130       140       150
pF1KA1 ------GSLETYVEQEQGENANDRNDRAIRVAAKWYNEHLKKMSADNQLQVIFITNDRRN
                :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 YTFTNEHHRETYVEQEQGENANDRNDRAIRVAAKWYNEHLKKMSADNQLQVIFITNDRRN
              130       140       150       160       170       180

              160       170       180       190       200       210
pF1KA1 KEKAIEEGIPAFTCEEYVKSLTANPELIDRLACLSEEGNEIESGKIIFSEHLPLSKLQQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KEKAIEEGIPAFTCEEYVKSLTANPELIDRLACLSEEGNEIESGKIIFSEHLPLSKLQQG
              190       200       210       220       230       240

              220       230       240       250       260       270
pF1KA1 IKSGTYLQGTFRASRENYLEATVWIHGDNEENKEIILQGLKHLNRAVHEDIVAVELLPKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 IKSGTYLQGTFRASRENYLEATVWIHGDNEENKEIILQGLKHLNRAVHEDIVAVELLPKS
              250       260       270       280       290       300

              280       290       300       310       320       330
pF1KA1 QWVAPSSVVLHDEGQNEEDVEKEEERERMLKTAVSEKMLKPTGRVVGIIKRNWRPYCGML
       ::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QWVAPSSVVLHDEGQNEEDVEKEEETERMLKTAVSEKMLKPTGRVVGIIKRNWRPYCGML
              310       320       330       340       350       360

              340       350       360       370       380       390
pF1KA1 SKSDIKESRRHLFTPADKRIPRIRIETRQASTLEGRRIIVAIDGWPRNSRYPNGHFVRNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SKSDIKESRRHLFTPADKRIPRIRIETRQASTLEGRRIIVAIDGWPRNSRYPNGHFVRNL
              370       380       390       400       410       420

              400       410       420       430       440       450
pF1KA1 GDVGEKETETEVLLLEHDVPHQPFSQAVLSFLPKMPWSITEKDMKNREDLRHLCICSVDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GDVGEKETETEVLLLEHDVPHQPFSQAVLSFLPKMPWSITEKDMKNREDLRHLCICSVDP
              430       440       450       460       470       480

              460       470       480       490       500       510
pF1KA1 PGCTDIDDALHCRELENGNLEVGVHIADVSHFIRPGNALDQESARRGTTVYLCEKRIDMV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PGCTDIDDALHCRELENGNLEVGVHIADVSHFIRPGNALDQESARRGTTVYLCEKRIDMV
              490       500       510       520       530       540

              520       530       540       550       560       570
pF1KA1 PELLSSNLCSLKCDVDRLAFSCIWEMNHNAEILKTKFTKSVINSKASLTYAEAQLRIDSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PELLSSNLCSLKCDVDRLAFSCIWEMNHNAEILKTKFTKSVINSKASLTYAEAQLRIDSA
              550       560       570       580       590       600

              580       590       600       610       620       630
pF1KA1 NMNDDITTSLRGLNKLAKILKKRRIEKGALTLSSPEVRFHMDSETHDPIDLQTKELRETN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 NMNDDITTSLRGLNKLAKILKKRRIEKGALTLSSPEVRFHMDSETHDPIDLQTKELRETN
              610       620       630       640       650       660

              640       650       660       670       680       690
pF1KA1 SMVEEFMLLANISVAKKIHEEFSEHALLRKHPAPPPSNYEILVKAARSRNLEIKTDTAKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SMVEEFMLLANISVAKKIHEEFSEHALLRKHPAPPPSNYEILVKAARSRNLEIKTDTAKS
              670       680       690       700       710       720

              700       710       720       730       740       750
pF1KA1 LAESLDQAESPTFPYLNTLLRILATRCMMQAVYFCSGMDNDFHHYGLASPIYTHFTSPIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LAESLDQAESPTFPYLNTLLRILATRCMMQAVYFCSGMDNDFHHYGLASPIYTHFTSPIR
              730       740       750       760       770       780

              760       770       780       790       800       810
pF1KA1 RYADVIVHRLLAVAIGADCTYPELTDKHKLADICKNLNFRHKMAQYAQRASVAFHTQLFF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RYADVIVHRLLAVAIGADCTYPELTDKHKLADICKNLNFRHKMAQYAQRASVAFHTQLFF
              790       800       810       820       830       840

              820       830       840       850       860       870
pF1KA1 KSKGIVSEEAYILFVRKNAIVVLIPKYGLEGTVFFEEKDKPNPQLIYDDEIPSLKIEDTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KSKGIVSEEAYILFVRKNAIVVLIPKYGLEGTVFFEEKDKPNPQLIYDDEIPSLKIEDTV
              850       860       870       880       890       900

              880       890       900       910       920        
pF1KA1 FHVFDKVKVKIMLDSSNLQHQKIRMSLVEPQIPGISIPTDTSNMDLNGPKKKKMKLGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 FHVFDKVKVKIMLDSSNLQHQKIRMSLVEPQIPGISIPTDTSNMDLNGPKKKKMKLGK
              910       920       930       940       950        

>>NP_001309278 (OMIM: 607533) exosome complex exonucleas  (796 aa)
 initn: 5238 init1: 5238 opt: 5238  Z-score: 5697.6  bits: 1065.3 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 5238; 99.9% identity (99.9% similar) in 796 aa overlap (133-928:1-796)

            110       120       130       140       150       160  
pF1KA1 VEQEQGENANDRNDRAIRVAAKWYNEHLKKMSADNQLQVIFITNDRRNKEKAIEEGIPAF
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001                               MSADNQLQVIFITNDRRNKEKAIEEGIPAF
                                             10        20        30

            170       180       190       200       210       220  
pF1KA1 TCEEYVKSLTANPELIDRLACLSEEGNEIESGKIIFSEHLPLSKLQQGIKSGTYLQGTFR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TCEEYVKSLTANPELIDRLACLSEEGNEIESGKIIFSEHLPLSKLQQGIKSGTYLQGTFR
               40        50        60        70        80        90

            230       240       250       260       270       280  
pF1KA1 ASRENYLEATVWIHGDNEENKEIILQGLKHLNRAVHEDIVAVELLPKSQWVAPSSVVLHD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASRENYLEATVWIHGDNEENKEIILQGLKHLNRAVHEDIVAVELLPKSQWVAPSSVVLHD
              100       110       120       130       140       150

            290       300       310       320       330       340  
pF1KA1 EGQNEEDVEKEEERERMLKTAVSEKMLKPTGRVVGIIKRNWRPYCGMLSKSDIKESRRHL
       ::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EGQNEEDVEKEEETERMLKTAVSEKMLKPTGRVVGIIKRNWRPYCGMLSKSDIKESRRHL
              160       170       180       190       200       210

            350       360       370       380       390       400  
pF1KA1 FTPADKRIPRIRIETRQASTLEGRRIIVAIDGWPRNSRYPNGHFVRNLGDVGEKETETEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FTPADKRIPRIRIETRQASTLEGRRIIVAIDGWPRNSRYPNGHFVRNLGDVGEKETETEV
              220       230       240       250       260       270

            410       420       430       440       450       460  
pF1KA1 LLLEHDVPHQPFSQAVLSFLPKMPWSITEKDMKNREDLRHLCICSVDPPGCTDIDDALHC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLLEHDVPHQPFSQAVLSFLPKMPWSITEKDMKNREDLRHLCICSVDPPGCTDIDDALHC
              280       290       300       310       320       330

            470       480       490       500       510       520  
pF1KA1 RELENGNLEVGVHIADVSHFIRPGNALDQESARRGTTVYLCEKRIDMVPELLSSNLCSLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RELENGNLEVGVHIADVSHFIRPGNALDQESARRGTTVYLCEKRIDMVPELLSSNLCSLK
              340       350       360       370       380       390

            530       540       550       560       570       580  
pF1KA1 CDVDRLAFSCIWEMNHNAEILKTKFTKSVINSKASLTYAEAQLRIDSANMNDDITTSLRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CDVDRLAFSCIWEMNHNAEILKTKFTKSVINSKASLTYAEAQLRIDSANMNDDITTSLRG
              400       410       420       430       440       450

            590       600       610       620       630       640  
pF1KA1 LNKLAKILKKRRIEKGALTLSSPEVRFHMDSETHDPIDLQTKELRETNSMVEEFMLLANI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LNKLAKILKKRRIEKGALTLSSPEVRFHMDSETHDPIDLQTKELRETNSMVEEFMLLANI
              460       470       480       490       500       510

            650       660       670       680       690       700  
pF1KA1 SVAKKIHEEFSEHALLRKHPAPPPSNYEILVKAARSRNLEIKTDTAKSLAESLDQAESPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SVAKKIHEEFSEHALLRKHPAPPPSNYEILVKAARSRNLEIKTDTAKSLAESLDQAESPT
              520       530       540       550       560       570

            710       720       730       740       750       760  
pF1KA1 FPYLNTLLRILATRCMMQAVYFCSGMDNDFHHYGLASPIYTHFTSPIRRYADVIVHRLLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FPYLNTLLRILATRCMMQAVYFCSGMDNDFHHYGLASPIYTHFTSPIRRYADVIVHRLLA
              580       590       600       610       620       630

            770       780       790       800       810       820  
pF1KA1 VAIGADCTYPELTDKHKLADICKNLNFRHKMAQYAQRASVAFHTQLFFKSKGIVSEEAYI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VAIGADCTYPELTDKHKLADICKNLNFRHKMAQYAQRASVAFHTQLFFKSKGIVSEEAYI
              640       650       660       670       680       690

            830       840       850       860       870       880  
pF1KA1 LFVRKNAIVVLIPKYGLEGTVFFEEKDKPNPQLIYDDEIPSLKIEDTVFHVFDKVKVKIM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LFVRKNAIVVLIPKYGLEGTVFFEEKDKPNPQLIYDDEIPSLKIEDTVFHVFDKVKVKIM
              700       710       720       730       740       750

            890       900       910       920        
pF1KA1 LDSSNLQHQKIRMSLVEPQIPGISIPTDTSNMDLNGPKKKKMKLGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LDSSNLQHQKIRMSLVEPQIPGISIPTDTSNMDLNGPKKKKMKLGK
              760       770       780       790      

>>XP_005254203 (OMIM: 614183) PREDICTED: DIS3-like exonu  (848 aa)
 initn: 1436 init1: 378 opt: 964  Z-score: 1045.6  bits: 204.6 E(85289): 1.7e-51
Smith-Waterman score: 1586; 37.2% identity (62.7% similar) in 869 aa overlap (3-793:5-846)

                 10        20        30           40        50     
pF1KA1   MLKSKTFLKKTRAGGVMKIVREHYLRDDIGCGAPGC---AACGGAHEGPALEPQPQDP
           . :..: .:  : ...::::::::  . : .: :   :::  .:.:  :    .: 
XP_005 MLQKREKVLLLRTFQGRTLRIVREHYLRPCVPCHSPLCPQPAAC--SHDGKLL---SSDV
               10        20        30        40          50        

          60                70          80        90               
pF1KA1 ASSVCPQ----PHYL----LPDTN--VLLHQIVSAWRPGTWASVASSLR-----------
       .  : :.      ::    .:. .  ....   .: .        ..::           
XP_005 THYVIPDWKVVQDYLEILEFPELKGIIFMQTACQAVQHQRGRRQYNKLRNLLKDARHDCI
          60        70        80        90       100       110     

           100         110       120       130       140       150 
pF1KA1 -LPGSLET--YVEQEQGENANDRNDRAIRVAAKWYNEHLKKMSADNQLQVIFITNDRRNK
        . . ..   :. .:.::. .  . :.:  :: :: .: .     ... ....:.:..  
XP_005 LFANEFQQCCYLPRERGESMEKWQTRSIYNAAVWYYHHCQ-----DRMPIVMVTEDEEAI
         120       130       140       150            160       170

               160       170           180        190        200   
pF1KA1 EK--AIEEGIPAFTCEEYVKS----LTANPELIDR-LACLSEEGNEI-ESGKIIFSEHLP
       ..  .  ::. ..: ..:. .    : :  :: :  :    :. ::  ::    . ::::
XP_005 QQYGSETEGVFVITFKNYLDNFWPDLKAAHELCDSILQSRRERENESQESHGKEYPEHLP
              180       190       200       210       220       230

           210       220        230           240       250        
pF1KA1 LSKLQQGIKSGTYLQGTFRASREN-YLEATVWIHG----DNEENKEIILQGLKHLNRAVH
       :  :. ::::: :.:: . ....   .:: : ..:    :..  ..:...:.:  ::..:
XP_005 LEVLEAGIKSGRYIQGILNVNKHRAQIEAFVRLQGASSKDSDLVSDILIHGMKARNRSIH
              240       250       260       270       280       290

      260       270       280       290       300       310        
pF1KA1 EDIVAVELLPKSQWVAPSSVVLHDEGQNEEDVEKEEERERMLKTAVSEKMLKPTGRVVGI
        :.:.::::::..: .  .:.:      :.: . .   :     . :: :  ::::::::
XP_005 GDVVVVELLPKNEWKG-RTVAL-----CENDCDDKASGE-----SPSEPM--PTGRVVGI
              300        310            320              330       

      320       330            340       350       360       370   
pF1KA1 IKRNWRPYCGML-SKSDI----KESRRHLFTPADKRIPRIRIETRQASTLEGRRIIVAID
       ...::: :   . :: ..    :.... : :: : :::.::: :.:: ::.  :..: ::
XP_005 LQKNWRDYVVTFPSKEEVQSQGKNAQKILVTPWDYRIPKIRISTQQAETLQDFRVVVRID
       340       350       360       370       380       390       

           380       390       400       410       420             
pF1KA1 GWPRNSRYPNGHFVRNLGDVGEKETETEVLLLEHDVPHQPFSQAVLSFLP----KMPWSI
       .:  .: :::::::: :: .:. : :  ..:.:...   :::.: .  .:    . ::..
XP_005 SWESTSVYPNGHFVRVLGRIGDLEGEIATILVENSISVIPFSEAQMCEMPVNTPESPWKV
       400       410       420       430       440       450       

     430       440         450       460       470       480       
pF1KA1 TEKDMKNREDLR--HLCICSVDPPGCTDIDDALHCRELENGNLEVGVHIADVSHFIRPGN
       . .. ..:.:::  :: . :.:: :: :.::.:  : :.:::::.:::::::.::. :..
XP_005 SPEEEQKRKDLRKSHL-VFSIDPKGCEDVDDTLSVRTLNNGNLELGVHIADVTHFVAPNS
       460       470        480       490       500       510      

       490       500       510       520       530       540       
pF1KA1 ALDQESARRGTTVYLCEKRIDMVPELLSSNLCSLKCDVDRLAFSCIWEMNHNA-EILKTK
        .: :.  :.:: :: ..: ::.: .::..::::   ::: : : .::... . :: :. 
XP_005 YIDIEARTRATTYYLADRRYDMLPSVLSADLCSLLGGVDRYAVSIMWELDKASYEIKKVW
        520       530       540       550       560       570      

        550       560       570                   580           590
pF1KA1 FTKSVINSKASLTYAEAQLRIDSA-NMNDDIT-----------TSLRGL----NKLAKIL
       . ...: :  .: :  ::  .:.  .. :::            ..:. :    .::. : 
XP_005 YGRTIIRSAYKLFYEAAQELLDGNLSVVDDIPEFKDLDEKSRQAKLEELVWAIGKLTDIA
        580       590       600       610       620       630      

                 600       610         620       630       640     
pF1KA1 KKRRIEK---GALTLSSPEVRFHMDSET--HDPIDLQTKELRETNSMVEEFMLLANISVA
       .. : ..   ::: : . ::  ..:..   :: :  :  :..::   : : :.:::  ::
XP_005 RHVRAKRDGCGALELEGVEVCVQLDDKKNIHDLIPKQPLEVHET---VAECMILANHWVA
        640       650       660       670       680          690   

         650       660       670       680       690       700     
pF1KA1 KKIHEEFSEHALLRKHPAPPPSNYEILVKAARSRNLEIKTDTAKSLAESLDQAESPTFPY
       ::: : : ..::::.:: :    .  : . :..... : : . :.::.:::.:..:  : 
XP_005 KKIWESFPHQALLRQHPPPHQEFFSELRECAKAKGFFIDTRSNKTLADSLDNANDPHDPI
           700       710       720       730       740       750   

         710       720         730       740       750       760   
pF1KA1 LNTLLRILATRCMMQAVYFCSG--MDNDFHHYGLASPIYTHFTSPIRRYADVIVHRLLAV
       .: ::: .::. : .:.:: .:   ...:::::::   :::::::::::.:..::::: .
XP_005 VNRLLRSMATQAMSNALYFSTGSCAEEEFHHYGLALDKYTHFTSPIRRYSDIVVHRLLMA
           760       770       780       790       800       810   

           770          780       790       800       810       820
pF1KA1 AIGADCTYP---ELTDKHKLADICKNLNFRHKMAQYAQRASVAFHTQLFFKSKGIVSEEA
       ::. :  .    .: ... : ..:...: :...                           
XP_005 AISKDKKMEIKGNLFSNKDLEELCRHINNRNQVEM                         
           820       830       840                                 

              830       840       850       860       870       880
pF1KA1 YILFVRKNAIVVLIPKYGLEGTVFFEEKDKPNPQLIYDDEIPSLKIEDTVFHVFDKVKVK

>>NP_588616 (OMIM: 614183) DIS3-like exonuclease 1 isofo  (971 aa)
 initn: 1195 init1: 378 opt: 964  Z-score: 1044.8  bits: 204.7 E(85289): 1.9e-51
Smith-Waterman score: 1709; 37.2% identity (64.7% similar) in 886 aa overlap (102-912:43-906)

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pF1KA1 VLLHQIVSAWRPGTWASVASSLRLPGSLETYVEQEQGENANDRNDRAIRVAAKWYNEHLK
                                     :. .:.::. .  . :.:  :: :: .: .
NP_588 GRRQYNKLRNLLKDARHDCILFANEFQQCCYLPRERGESMEKWQTRSIYNAAVWYYHHCQ
             20        30        40        50        60        70  

             140       150         160       170           180     
pF1KA1 KMSADNQLQVIFITNDRRNKEK--AIEEGIPAFTCEEYVKS----LTANPELIDR-LACL
            ... ....:.:..  ..  .  ::. ..: ..:. .    : :  :: :  :   
NP_588 -----DRMPIVMVTEDEEAIQQYGSETEGVFVITFKNYLDNFWPDLKAAHELCDSILQSR
                  80        90       100       110       120       

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pF1KA1 SEEGNEI-ESGKIIFSEHLPLSKLQQGIKSGTYLQGTFRASREN-YLEATVWIHG----D
        :. ::  ::    . :::::  :. ::::: :.:: . ....   .:: : ..:    :
NP_588 RERENESQESHGKEYPEHLPLEVLEAGIKSGRYIQGILNVNKHRAQIEAFVRLQGASSKD
       130       140       150       160       170       180       

      240       250       260       270       280       290        
pF1KA1 NEENKEIILQGLKHLNRAVHEDIVAVELLPKSQWVAPSSVVLHDEGQNEEDVEKEEERER
       ..  ..:...:.:  ::..: :.:.::::::..:    .:.:      :.: . .   : 
NP_588 SDLVSDILIHGMKARNRSIHGDVVVVELLPKNEW-KGRTVAL-----CENDCDDKASGE-
       190       200       210       220             230       240 

      300       310       320       330            340       350   
pF1KA1 MLKTAVSEKMLKPTGRVVGIIKRNWRPYCGML-SKSDI----KESRRHLFTPADKRIPRI
           . :: :  ::::::::...::: :   . :: ..    :.... : :: : :::.:
NP_588 ----SPSEPM--PTGRVVGILQKNWRDYVVTFPSKEEVQSQGKNAQKILVTPWDYRIPKI
                    250       260       270       280       290    

           360       370       380       390       400       410   
pF1KA1 RIETRQASTLEGRRIIVAIDGWPRNSRYPNGHFVRNLGDVGEKETETEVLLLEHDVPHQP
       :: :.:: ::.  :..: ::.:  .: :::::::: :: .:. : :  ..:.:...   :
NP_588 RISTQQAETLQDFRVVVRIDSWESTSVYPNGHFVRVLGRIGDLEGEIATILVENSISVIP
          300       310       320       330       340       350    

           420           430       440         450       460       
pF1KA1 FSQAVLSFLP----KMPWSITEKDMKNREDLR--HLCICSVDPPGCTDIDDALHCRELEN
       ::.: .  .:    . ::... .. ..:.:::  :: . :.:: :: :.::.:  : :.:
NP_588 FSEAQMCEMPVNTPESPWKVSPEEEQKRKDLRKSHL-VFSIDPKGCEDVDDTLSVRTLNN
          360       370       380       390        400       410   

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pF1KA1 GNLEVGVHIADVSHFIRPGNALDQESARRGTTVYLCEKRIDMVPELLSSNLCSLKCDVDR
       ::::.:::::::.::. :.. .: :.  :.:: :: ..: ::.: .::..::::   :::
NP_588 GNLELGVHIADVTHFVAPNSYIDIEARTRATTYYLADRRYDMLPSVLSADLCSLLGGVDR
           420       430       440       450       460       470   

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pF1KA1 LAFSCIWEMNHNA-EILKTKFTKSVINSKASLTYAEAQLRIDSA-NMNDDIT--------
        : : .::... . :: :. . ...: :  .: :  ::  .:.  .. :::         
NP_588 YAVSIMWELDKASYEIKKVWYGRTIIRSAYKLFYEAAQELLDGNLSVVDDIPEFKDLDEK
           480       490       500       510       520       530   

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pF1KA1 ---TSLRGL----NKLAKILKKRRIEK---GALTLSSPEVRFHMDSET--HDPIDLQTKE
          ..:. :    .::. : .. : ..   ::: : . ::  ..:..   :: :  :  :
NP_588 SRQAKLEELVWAIGKLTDIARHVRAKRDGCGALELEGVEVCVQLDDKKNIHDLIPKQPLE
           540       550       560       570       580       590   

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pF1KA1 LRETNSMVEEFMLLANISVAKKIHEEFSEHALLRKHPAPPPSNYEILVKAARSRNLEIKT
       ..::   : : :.:::  ::::: : : ..::::.:: :    .  : . :..... : :
NP_588 VHET---VAECMILANHWVAKKIWESFPHQALLRQHPPPHQEFFSELRECAKAKGFFIDT
              600       610       620       630       640       650

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pF1KA1 DTAKSLAESLDQAESPTFPYLNTLLRILATRCMMQAVYFCSG--MDNDFHHYGLASPIYT
        . :.::.:::.:..:  : .: ::: .::. : .:.:: .:   ...:::::::   ::
NP_588 RSNKTLADSLDNANDPHDPIVNRLLRSMATQAMSNALYFSTGSCAEEEFHHYGLALDKYT
              660       670       680       690       700       710

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pF1KA1 HFTSPIRRYADVIVHRLLAVAIGADCTYP---ELTDKHKLADICKNLNFRHKMAQYAQRA
       :::::::::.:..::::: .::. :  .    .: ... : ..:...: :.. ::..:. 
NP_588 HFTSPIRRYSDIVVHRLLMAAISKDKKMEIKGNLFSNKDLEELCRHINNRNQAAQHSQKQ
              720       730       740       750       760       770

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pF1KA1 SVAFHTQLFFKSKGIVSEE-----AYILFVRKNAIVVLIPKYGLEGTVFFEEKD------
       :. .   ..::.:  ..::     . :  .: :.....::..:..:......::      
NP_588 STELFQCMYFKDKDPATEERCISDGVIYSIRTNGVLLFIPRFGIKGAAYLKNKDGLVISC
              780       790       800       810       820       830

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pF1KA1 --------KPNPQLIYDDEIPSLKI--EDTVFHVFDKVKVKIMLDSSNLQHQKIRMSLV-
               ::.    ....: :     :...::.::.: :.: ...:  . . ::. .. 
NP_588 GPDSCSEWKPGSLQRFQNKITSTTTDGESVTFHLFDHVTVRISIQASRCHSDTIRLEIIS
              840       850       860       870       880       890

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pF1KA1 -EP-QIPGISIPTDTSNMDLNGPKKKKMKLGK                            
        .: .::.  .  ..:                                            
NP_588 NKPYKIPNTELIHQSSPLLKSELVKEVTKSVEEAQLAQEVKVNIIQEEYQEYRQTKGRSL
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>>NP_001310865 (OMIM: 614183) DIS3-like exonuclease 1 is  (971 aa)
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pF1KA1 VLLHQIVSAWRPGTWASVASSLRLPGSLETYVEQEQGENANDRNDRAIRVAAKWYNEHLK
                                     :. .:.::. .  . :.:  :: :: .: .
NP_001 GRRQYNKLRNLLKDARHDCILFANEFQQCCYLPRERGESMEKWQTRSIYNAAVWYYHHCQ
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pF1KA1 KMSADNQLQVIFITNDRRNKEK--AIEEGIPAFTCEEYVKS----LTANPELIDR-LACL
            ... ....:.:..  ..  .  ::. ..: ..:. .    : :  :: :  :   
NP_001 -----DRMPIVMVTEDEEAIQQYGSETEGVFVITFKNYLDNFWPDLKAAHELCDSILQSR
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pF1KA1 SEEGNEI-ESGKIIFSEHLPLSKLQQGIKSGTYLQGTFRASREN-YLEATVWIHG----D
        :. ::  ::    . :::::  :. ::::: :.:: . ....   .:: : ..:    :
NP_001 RERENESQESHGKEYPEHLPLEVLEAGIKSGRYIQGILNVNKHRAQIEAFVRLQGASSKD
       130       140       150       160       170       180       

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pF1KA1 NEENKEIILQGLKHLNRAVHEDIVAVELLPKSQWVAPSSVVLHDEGQNEEDVEKEEERER
       ..  ..:...:.:  ::..: :.:.::::::..:    .:.:      :.: . .   : 
NP_001 SDLVSDILIHGMKARNRSIHGDVVVVELLPKNEW-KGRTVAL-----CENDCDDKASGE-
       190       200       210       220             230       240 

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pF1KA1 MLKTAVSEKMLKPTGRVVGIIKRNWRPYCGML-SKSDI----KESRRHLFTPADKRIPRI
           . :: :  ::::::::...::: :   . :: ..    :.... : :: : :::.:
NP_001 ----SPSEPM--PTGRVVGILQKNWRDYVVTFPSKEEVQSQGKNAQKILVTPWDYRIPKI
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pF1KA1 RIETRQASTLEGRRIIVAIDGWPRNSRYPNGHFVRNLGDVGEKETETEVLLLEHDVPHQP
       :: :.:: ::.  :..: ::.:  .: :::::::: :: .:. : :  ..:.:...   :
NP_001 RISTQQAETLQDFRVVVRIDSWESTSVYPNGHFVRVLGRIGDLEGEIATILVENSISVIP
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pF1KA1 FSQAVLSFLP----KMPWSITEKDMKNREDLR--HLCICSVDPPGCTDIDDALHCRELEN
       ::.: .  .:    . ::... .. ..:.:::  :: . :.:: :: :.::.:  : :.:
NP_001 FSEAQMCEMPVNTPESPWKVSPEEEQKRKDLRKSHL-VFSIDPKGCEDVDDTLSVRTLNN
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pF1KA1 GNLEVGVHIADVSHFIRPGNALDQESARRGTTVYLCEKRIDMVPELLSSNLCSLKCDVDR
       ::::.:::::::.::. :.. .: :.  :.:: :: ..: ::.: .::..::::   :::
NP_001 GNLELGVHIADVTHFVAPNSYIDIEARTRATTYYLADRRYDMLPSVLSADLCSLLGGVDR
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pF1KA1 LAFSCIWEMNHNA-EILKTKFTKSVINSKASLTYAEAQLRIDSA-NMNDDIT--------
        : : .::... . :: :. . ...: :  .: :  ::  .:.  .. :::         
NP_001 YAVSIMWELDKASYEIKKVWYGRTIIRSAYKLFYEAAQELLDGNLSVVDDIPEFKDLDEK
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pF1KA1 ---TSLRGL----NKLAKILKKRRIEK---GALTLSSPEVRFHMDSET--HDPIDLQTKE
          ..:. :    .::. : .. : ..   ::: : . ::  ..:..   :: :  :  :
NP_001 SRQAKLEELVWAIGKLTDIARHVRAKRDGCGALELEGVEVCVQLDDKKNIHDLIPKQPLE
           540       550       560       570       580       590   

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pF1KA1 LRETNSMVEEFMLLANISVAKKIHEEFSEHALLRKHPAPPPSNYEILVKAARSRNLEIKT
       ..::   : : :.:::  ::::: : : ..::::.:: :    .  : . :..... : :
NP_001 VHET---VAECMILANHWVAKKIWESFPHQALLRQHPPPHQEFFSELRECAKAKGFFIDT
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pF1KA1 DTAKSLAESLDQAESPTFPYLNTLLRILATRCMMQAVYFCSG--MDNDFHHYGLASPIYT
        . :.::.:::.:..:  : .: ::: .::. : .:.:: .:   ...:::::::   ::
NP_001 RSNKTLADSLDNANDPHDPIVNRLLRSMATQAMSNALYFSTGSCAEEEFHHYGLALDKYT
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pF1KA1 HFTSPIRRYADVIVHRLLAVAIGADCTYP---ELTDKHKLADICKNLNFRHKMAQYAQRA
       :::::::::.:..::::: .::. :  .    .: ... : ..:...: :.. ::..:. 
NP_001 HFTSPIRRYSDIVVHRLLMAAISKDKKMEIKGNLFSNKDLEELCRHINNRNQAAQHSQKQ
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              810            820       830       840               
pF1KA1 SVAFHTQLFFKSKGIVSEE-----AYILFVRKNAIVVLIPKYGLEGTVFFEEKD------
       :. .   ..::.:  ..::     . :  .: :.....::..:..:......::      
NP_001 STELFQCMYFKDKDPATEERCISDGVIYSIRTNGVLLFIPRFGIKGAAYLKNKDGLVISC
              780       790       800       810       820       830

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pF1KA1 --------KPNPQLIYDDEIPSLKI--EDTVFHVFDKVKVKIMLDSSNLQHQKIRMSLV-
               ::.    ....: :     :...::.::.: :.: ...:  . . ::. .. 
NP_001 GPDSCSEWKPGSLQRFQNKITSTTTDGESVTFHLFDHVTVRISIQASRCHSDTIRLEIIS
              840       850       860       870       880       890

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pF1KA1 -EP-QIPGISIPTDTSNMDLNGPKKKKMKLGK                            
        .: .::.  .  ..:                                            
NP_001 NKPYKIPNTELIHQSSPLLKSELVKEVTKSVEEAQLAQEVKVNIIQEEYQEYRQTKGRSL
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>>NP_001310874 (OMIM: 614183) DIS3-like exonuclease 1 is  (971 aa)
 initn: 1195 init1: 378 opt: 964  Z-score: 1044.8  bits: 204.7 E(85289): 1.9e-51
Smith-Waterman score: 1709; 37.2% identity (64.7% similar) in 886 aa overlap (102-912:43-906)

              80        90       100       110       120       130 
pF1KA1 VLLHQIVSAWRPGTWASVASSLRLPGSLETYVEQEQGENANDRNDRAIRVAAKWYNEHLK
                                     :. .:.::. .  . :.:  :: :: .: .
NP_001 GRRQYNKLRNLLKDARHDCILFANEFQQCCYLPRERGESMEKWQTRSIYNAAVWYYHHCQ
             20        30        40        50        60        70  

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pF1KA1 KMSADNQLQVIFITNDRRNKEK--AIEEGIPAFTCEEYVKS----LTANPELIDR-LACL
            ... ....:.:..  ..  .  ::. ..: ..:. .    : :  :: :  :   
NP_001 -----DRMPIVMVTEDEEAIQQYGSETEGVFVITFKNYLDNFWPDLKAAHELCDSILQSR
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pF1KA1 SEEGNEI-ESGKIIFSEHLPLSKLQQGIKSGTYLQGTFRASREN-YLEATVWIHG----D
        :. ::  ::    . :::::  :. ::::: :.:: . ....   .:: : ..:    :
NP_001 RERENESQESHGKEYPEHLPLEVLEAGIKSGRYIQGILNVNKHRAQIEAFVRLQGASSKD
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pF1KA1 NEENKEIILQGLKHLNRAVHEDIVAVELLPKSQWVAPSSVVLHDEGQNEEDVEKEEERER
       ..  ..:...:.:  ::..: :.:.::::::..:    .:.:      :.: . .   : 
NP_001 SDLVSDILIHGMKARNRSIHGDVVVVELLPKNEW-KGRTVAL-----CENDCDDKASGE-
       190       200       210       220             230       240 

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pF1KA1 MLKTAVSEKMLKPTGRVVGIIKRNWRPYCGML-SKSDI----KESRRHLFTPADKRIPRI
           . :: :  ::::::::...::: :   . :: ..    :.... : :: : :::.:
NP_001 ----SPSEPM--PTGRVVGILQKNWRDYVVTFPSKEEVQSQGKNAQKILVTPWDYRIPKI
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pF1KA1 RIETRQASTLEGRRIIVAIDGWPRNSRYPNGHFVRNLGDVGEKETETEVLLLEHDVPHQP
       :: :.:: ::.  :..: ::.:  .: :::::::: :: .:. : :  ..:.:...   :
NP_001 RISTQQAETLQDFRVVVRIDSWESTSVYPNGHFVRVLGRIGDLEGEIATILVENSISVIP
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pF1KA1 FSQAVLSFLP----KMPWSITEKDMKNREDLR--HLCICSVDPPGCTDIDDALHCRELEN
       ::.: .  .:    . ::... .. ..:.:::  :: . :.:: :: :.::.:  : :.:
NP_001 FSEAQMCEMPVNTPESPWKVSPEEEQKRKDLRKSHL-VFSIDPKGCEDVDDTLSVRTLNN
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pF1KA1 GNLEVGVHIADVSHFIRPGNALDQESARRGTTVYLCEKRIDMVPELLSSNLCSLKCDVDR
       ::::.:::::::.::. :.. .: :.  :.:: :: ..: ::.: .::..::::   :::
NP_001 GNLELGVHIADVTHFVAPNSYIDIEARTRATTYYLADRRYDMLPSVLSADLCSLLGGVDR
           420       430       440       450       460       470   

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pF1KA1 LAFSCIWEMNHNA-EILKTKFTKSVINSKASLTYAEAQLRIDSA-NMNDDIT--------
        : : .::... . :: :. . ...: :  .: :  ::  .:.  .. :::         
NP_001 YAVSIMWELDKASYEIKKVWYGRTIIRSAYKLFYEAAQELLDGNLSVVDDIPEFKDLDEK
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pF1KA1 ---TSLRGL----NKLAKILKKRRIEK---GALTLSSPEVRFHMDSET--HDPIDLQTKE
          ..:. :    .::. : .. : ..   ::: : . ::  ..:..   :: :  :  :
NP_001 SRQAKLEELVWAIGKLTDIARHVRAKRDGCGALELEGVEVCVQLDDKKNIHDLIPKQPLE
           540       550       560       570       580       590   

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pF1KA1 LRETNSMVEEFMLLANISVAKKIHEEFSEHALLRKHPAPPPSNYEILVKAARSRNLEIKT
       ..::   : : :.:::  ::::: : : ..::::.:: :    .  : . :..... : :
NP_001 VHET---VAECMILANHWVAKKIWESFPHQALLRQHPPPHQEFFSELRECAKAKGFFIDT
              600       610       620       630       640       650

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pF1KA1 DTAKSLAESLDQAESPTFPYLNTLLRILATRCMMQAVYFCSG--MDNDFHHYGLASPIYT
        . :.::.:::.:..:  : .: ::: .::. : .:.:: .:   ...:::::::   ::
NP_001 RSNKTLADSLDNANDPHDPIVNRLLRSMATQAMSNALYFSTGSCAEEEFHHYGLALDKYT
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pF1KA1 HFTSPIRRYADVIVHRLLAVAIGADCTYP---ELTDKHKLADICKNLNFRHKMAQYAQRA
       :::::::::.:..::::: .::. :  .    .: ... : ..:...: :.. ::..:. 
NP_001 HFTSPIRRYSDIVVHRLLMAAISKDKKMEIKGNLFSNKDLEELCRHINNRNQAAQHSQKQ
              720       730       740       750       760       770

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pF1KA1 SVAFHTQLFFKSKGIVSEE-----AYILFVRKNAIVVLIPKYGLEGTVFFEEKD------
       :. .   ..::.:  ..::     . :  .: :.....::..:..:......::      
NP_001 STELFQCMYFKDKDPATEERCISDGVIYSIRTNGVLLFIPRFGIKGAAYLKNKDGLVISC
              780       790       800       810       820       830

             850       860         870       880       890         
pF1KA1 --------KPNPQLIYDDEIPSLKI--EDTVFHVFDKVKVKIMLDSSNLQHQKIRMSLV-
               ::.    ....: :     :...::.::.: :.: ...:  . . ::. .. 
NP_001 GPDSCSEWKPGSLQRFQNKITSTTTDGESVTFHLFDHVTVRISIQASRCHSDTIRLEIIS
              840       850       860       870       880       890

       900        910       920                                    
pF1KA1 -EP-QIPGISIPTDTSNMDLNGPKKKKMKLGK                            
        .: .::.  .  ..:                                            
NP_001 NKPYKIPNTELIHQSSPLLKSELVKEVTKSVEEAQLAQEVKVNIIQEEYQEYRQTKGRSL
              900       910       920       930       940       950

>>NP_001310873 (OMIM: 614183) DIS3-like exonuclease 1 is  (1037 aa)
 initn: 1195 init1: 378 opt: 964  Z-score: 1044.3  bits: 204.7 E(85289): 2e-51
Smith-Waterman score: 1709; 37.2% identity (64.7% similar) in 886 aa overlap (102-912:109-972)

              80        90       100       110       120       130 
pF1KA1 VLLHQIVSAWRPGTWASVASSLRLPGSLETYVEQEQGENANDRNDRAIRVAAKWYNEHLK
                                     :. .:.::. .  . :.:  :: :: .: .
NP_001 GRRQYNKLRNLLKDARHDCILFANEFQQCCYLPRERGESMEKWQTRSIYNAAVWYYHHCQ
       80        90       100       110       120       130        

             140       150         160       170           180     
pF1KA1 KMSADNQLQVIFITNDRRNKEK--AIEEGIPAFTCEEYVKS----LTANPELIDR-LACL
            ... ....:.:..  ..  .  ::. ..: ..:. .    : :  :: :  :   
NP_001 -----DRMPIVMVTEDEEAIQQYGSETEGVFVITFKNYLDNFWPDLKAAHELCDSILQSR
           140       150       160       170       180       190   

          190        200       210       220        230            
pF1KA1 SEEGNEI-ESGKIIFSEHLPLSKLQQGIKSGTYLQGTFRASREN-YLEATVWIHG----D
        :. ::  ::    . :::::  :. ::::: :.:: . ....   .:: : ..:    :
NP_001 RERENESQESHGKEYPEHLPLEVLEAGIKSGRYIQGILNVNKHRAQIEAFVRLQGASSKD
           200       210       220       230       240       250   

      240       250       260       270       280       290        
pF1KA1 NEENKEIILQGLKHLNRAVHEDIVAVELLPKSQWVAPSSVVLHDEGQNEEDVEKEEERER
       ..  ..:...:.:  ::..: :.:.::::::..:    .:.:      :.: . .   : 
NP_001 SDLVSDILIHGMKARNRSIHGDVVVVELLPKNEW-KGRTVAL-----CENDCDDKASGE-
           260       270       280        290            300       

      300       310       320       330            340       350   
pF1KA1 MLKTAVSEKMLKPTGRVVGIIKRNWRPYCGML-SKSDI----KESRRHLFTPADKRIPRI
           . :: :  ::::::::...::: :   . :: ..    :.... : :: : :::.:
NP_001 ----SPSEPM--PTGRVVGILQKNWRDYVVTFPSKEEVQSQGKNAQKILVTPWDYRIPKI
            310         320       330       340       350       360

           360       370       380       390       400       410   
pF1KA1 RIETRQASTLEGRRIIVAIDGWPRNSRYPNGHFVRNLGDVGEKETETEVLLLEHDVPHQP
       :: :.:: ::.  :..: ::.:  .: :::::::: :: .:. : :  ..:.:...   :
NP_001 RISTQQAETLQDFRVVVRIDSWESTSVYPNGHFVRVLGRIGDLEGEIATILVENSISVIP
              370       380       390       400       410       420

           420           430       440         450       460       
pF1KA1 FSQAVLSFLP----KMPWSITEKDMKNREDLR--HLCICSVDPPGCTDIDDALHCRELEN
       ::.: .  .:    . ::... .. ..:.:::  :: . :.:: :: :.::.:  : :.:
NP_001 FSEAQMCEMPVNTPESPWKVSPEEEQKRKDLRKSHL-VFSIDPKGCEDVDDTLSVRTLNN
              430       440       450        460       470         

       470       480       490       500       510       520       
pF1KA1 GNLEVGVHIADVSHFIRPGNALDQESARRGTTVYLCEKRIDMVPELLSSNLCSLKCDVDR
       ::::.:::::::.::. :.. .: :.  :.:: :: ..: ::.: .::..::::   :::
NP_001 GNLELGVHIADVTHFVAPNSYIDIEARTRATTYYLADRRYDMLPSVLSADLCSLLGGVDR
     480       490       500       510       520       530         

       530       540        550       560       570                
pF1KA1 LAFSCIWEMNHNA-EILKTKFTKSVINSKASLTYAEAQLRIDSA-NMNDDIT--------
        : : .::... . :: :. . ...: :  .: :  ::  .:.  .. :::         
NP_001 YAVSIMWELDKASYEIKKVWYGRTIIRSAYKLFYEAAQELLDGNLSVVDDIPEFKDLDEK
     540       550       560       570       580       590         

          580           590          600       610         620     
pF1KA1 ---TSLRGL----NKLAKILKKRRIEK---GALTLSSPEVRFHMDSET--HDPIDLQTKE
          ..:. :    .::. : .. : ..   ::: : . ::  ..:..   :: :  :  :
NP_001 SRQAKLEELVWAIGKLTDIARHVRAKRDGCGALELEGVEVCVQLDDKKNIHDLIPKQPLE
     600       610       620       630       640       650         

         630       640       650       660       670       680     
pF1KA1 LRETNSMVEEFMLLANISVAKKIHEEFSEHALLRKHPAPPPSNYEILVKAARSRNLEIKT
       ..::   : : :.:::  ::::: : : ..::::.:: :    .  : . :..... : :
NP_001 VHET---VAECMILANHWVAKKIWESFPHQALLRQHPPPHQEFFSELRECAKAKGFFIDT
     660          670       680       690       700       710      

         690       700       710       720         730       740   
pF1KA1 DTAKSLAESLDQAESPTFPYLNTLLRILATRCMMQAVYFCSG--MDNDFHHYGLASPIYT
        . :.::.:::.:..:  : .: ::: .::. : .:.:: .:   ...:::::::   ::
NP_001 RSNKTLADSLDNANDPHDPIVNRLLRSMATQAMSNALYFSTGSCAEEEFHHYGLALDKYT
        720       730       740       750       760       770      

           750       760       770          780       790       800
pF1KA1 HFTSPIRRYADVIVHRLLAVAIGADCTYP---ELTDKHKLADICKNLNFRHKMAQYAQRA
       :::::::::.:..::::: .::. :  .    .: ... : ..:...: :.. ::..:. 
NP_001 HFTSPIRRYSDIVVHRLLMAAISKDKKMEIKGNLFSNKDLEELCRHINNRNQAAQHSQKQ
        780       790       800       810       820       830      

              810            820       830       840               
pF1KA1 SVAFHTQLFFKSKGIVSEE-----AYILFVRKNAIVVLIPKYGLEGTVFFEEKD------
       :. .   ..::.:  ..::     . :  .: :.....::..:..:......::      
NP_001 STELFQCMYFKDKDPATEERCISDGVIYSIRTNGVLLFIPRFGIKGAAYLKNKDGLVISC
        840       850       860       870       880       890      

             850       860         870       880       890         
pF1KA1 --------KPNPQLIYDDEIPSLKI--EDTVFHVFDKVKVKIMLDSSNLQHQKIRMSLV-
               ::.    ....: :     :...::.::.: :.: ...:  . . ::. .. 
NP_001 GPDSCSEWKPGSLQRFQNKITSTTTDGESVTFHLFDHVTVRISIQASRCHSDTIRLEIIS
        900       910       920       930       940       950      

       900        910       920                                    
pF1KA1 -EP-QIPGISIPTDTSNMDLNGPKKKKMKLGK                            
        .: .::.  .  ..:                                            
NP_001 NKPYKIPNTELIHQSSPLLKSELVKEVTKSVEEAQLAQEVKVNIIQEEYQEYRQTKGRSL
        960       970       980       990      1000      1010      

>>NP_001137160 (OMIM: 614183) DIS3-like exonuclease 1 is  (1054 aa)
 initn: 1260 init1: 378 opt: 964  Z-score: 1044.2  bits: 204.7 E(85289): 2e-51
Smith-Waterman score: 1762; 35.6% identity (62.5% similar) in 1012 aa overlap (3-912:5-989)

                 10        20        30           40        50     
pF1KA1   MLKSKTFLKKTRAGGVMKIVREHYLRDDIGCGAPGC---AACGGAHEGPALEPQPQDP
           . :..: .:  : ...::::::::  . : .: :   :::  .:.:  :    .: 
NP_001 MLQKREKVLLLRTFQGRTLRIVREHYLRPCVPCHSPLCPQPAAC--SHDGKLL---SSDV
               10        20        30        40          50        

          60                70          80        90               
pF1KA1 ASSVCPQ----PHYL----LPDTN--VLLHQIVSAWRPGTWASVASSLR-----------
       .  : :.      ::    .:. .  ....   .: .        ..::           
NP_001 THYVIPDWKVVQDYLEILEFPELKGIIFMQTACQAVQHQRGRRQYNKLRNLLKDARHDCI
          60        70        80        90       100       110     

           100         110       120       130       140       150 
pF1KA1 -LPGSLET--YVEQEQGENANDRNDRAIRVAAKWYNEHLKKMSADNQLQVIFITNDRRNK
        . . ..   :. .:.::. .  . :.:  :: :: .: .     ... ....:.:..  
NP_001 LFANEFQQCCYLPRERGESMEKWQTRSIYNAAVWYYHHCQ-----DRMPIVMVTEDEEAI
         120       130       140       150            160       170

               160       170           180        190        200   
pF1KA1 EK--AIEEGIPAFTCEEYVKS----LTANPELIDR-LACLSEEGNEI-ESGKIIFSEHLP
       ..  .  ::. ..: ..:. .    : :  :: :  :    :. ::  ::    . ::::
NP_001 QQYGSETEGVFVITFKNYLDNFWPDLKAAHELCDSILQSRRERENESQESHGKEYPEHLP
              180       190       200       210       220       230

           210       220        230           240       250        
pF1KA1 LSKLQQGIKSGTYLQGTFRASREN-YLEATVWIHG----DNEENKEIILQGLKHLNRAVH
       :  :. ::::: :.:: . ....   .:: : ..:    :..  ..:...:.:  ::..:
NP_001 LEVLEAGIKSGRYIQGILNVNKHRAQIEAFVRLQGASSKDSDLVSDILIHGMKARNRSIH
              240       250       260       270       280       290

      260       270       280       290       300       310        
pF1KA1 EDIVAVELLPKSQWVAPSSVVLHDEGQNEEDVEKEEERERMLKTAVSEKMLKPTGRVVGI
        :.:.::::::..: .  .:.:      :.: . .   :     . :: :  ::::::::
NP_001 GDVVVVELLPKNEWKG-RTVAL-----CENDCDDKASGE-----SPSEPM--PTGRVVGI
              300        310            320              330       

      320       330            340       350       360       370   
pF1KA1 IKRNWRPYCGML-SKSDI----KESRRHLFTPADKRIPRIRIETRQASTLEGRRIIVAID
       ...::: :   . :: ..    :.... : :: : :::.::: :.:: ::.  :..: ::
NP_001 LQKNWRDYVVTFPSKEEVQSQGKNAQKILVTPWDYRIPKIRISTQQAETLQDFRVVVRID
       340       350       360       370       380       390       

           380       390       400       410       420             
pF1KA1 GWPRNSRYPNGHFVRNLGDVGEKETETEVLLLEHDVPHQPFSQAVLSFLP----KMPWSI
       .:  .: :::::::: :: .:. : :  ..:.:...   :::.: .  .:    . ::..
NP_001 SWESTSVYPNGHFVRVLGRIGDLEGEIATILVENSISVIPFSEAQMCEMPVNTPESPWKV
       400       410       420       430       440       450       

     430       440         450       460       470       480       
pF1KA1 TEKDMKNREDLR--HLCICSVDPPGCTDIDDALHCRELENGNLEVGVHIADVSHFIRPGN
       . .. ..:.:::  :: . :.:: :: :.::.:  : :.:::::.:::::::.::. :..
NP_001 SPEEEQKRKDLRKSHL-VFSIDPKGCEDVDDTLSVRTLNNGNLELGVHIADVTHFVAPNS
       460       470        480       490       500       510      

       490       500       510       520       530       540       
pF1KA1 ALDQESARRGTTVYLCEKRIDMVPELLSSNLCSLKCDVDRLAFSCIWEMNHNA-EILKTK
        .: :.  :.:: :: ..: ::.: .::..::::   ::: : : .::... . :: :. 
NP_001 YIDIEARTRATTYYLADRRYDMLPSVLSADLCSLLGGVDRYAVSIMWELDKASYEIKKVW
        520       530       540       550       560       570      

        550       560       570                   580           590
pF1KA1 FTKSVINSKASLTYAEAQLRIDSA-NMNDDIT-----------TSLRGL----NKLAKIL
       . ...: :  .: :  ::  .:.  .. :::            ..:. :    .::. : 
NP_001 YGRTIIRSAYKLFYEAAQELLDGNLSVVDDIPEFKDLDEKSRQAKLEELVWAIGKLTDIA
        580       590       600       610       620       630      

                 600       610         620       630       640     
pF1KA1 KKRRIEK---GALTLSSPEVRFHMDSET--HDPIDLQTKELRETNSMVEEFMLLANISVA
       .. : ..   ::: : . ::  ..:..   :: :  :  :..::   : : :.:::  ::
NP_001 RHVRAKRDGCGALELEGVEVCVQLDDKKNIHDLIPKQPLEVHET---VAECMILANHWVA
        640       650       660       670       680          690   

         650       660       670       680       690       700     
pF1KA1 KKIHEEFSEHALLRKHPAPPPSNYEILVKAARSRNLEIKTDTAKSLAESLDQAESPTFPY
       ::: : : ..::::.:: :    .  : . :..... : : . :.::.:::.:..:  : 
NP_001 KKIWESFPHQALLRQHPPPHQEFFSELRECAKAKGFFIDTRSNKTLADSLDNANDPHDPI
           700       710       720       730       740       750   

         710       720         730       740       750       760   
pF1KA1 LNTLLRILATRCMMQAVYFCSG--MDNDFHHYGLASPIYTHFTSPIRRYADVIVHRLLAV
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pF1KA1 AIGADCTYP---ELTDKHKLADICKNLNFRHKMAQYAQRASVAFHTQLFFKSKGIVSEE-
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pF1KA1 ----AYILFVRKNAIVVLIPKYGLEGTVFFEEKD--------------KPNPQLIYDDEI
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