Result of FASTA (ccds) for pF1KA0882
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0882, 1266 aa
  1>>>pF1KA0882 1266 - 1266 aa - 1266 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2627+/-0.0012; mu= 19.1454+/- 0.073
 mean_var=105.0659+/-20.322, 0's: 0 Z-trim(105.5): 101  B-trim: 87 in 1/50
 Lambda= 0.125125
 statistics sampled from 8347 (8449) to 8347 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.605), E-opt: 0.2 (0.26), width:  16
 Scan time:  5.260

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS47136.1 TBC1D9 gene_id:23158|Hs108|chr4        (1266) 8395 1527.3       0
CCDS43408.1 TBC1D9B gene_id:23061|Hs108|chr5       (1250) 5134 938.6       0
CCDS4450.1 TBC1D9B gene_id:23061|Hs108|chr5        (1233) 4560 835.0       0
CCDS82486.1 TBC1D8 gene_id:11138|Hs108|chr2        (1155) 2655 491.1 6.9e-138
CCDS46375.1 TBC1D8 gene_id:11138|Hs108|chr2        (1140) 2404 445.8  3e-124
CCDS14522.1 TBC1D8B gene_id:54885|Hs108|chrX       (1120) 2007 374.1 1.1e-102
CCDS14523.1 TBC1D8B gene_id:54885|Hs108|chrX       ( 632)  892 172.7 2.7e-42
CCDS14002.1 SGSM3 gene_id:27352|Hs108|chr22        ( 749)  589 118.0 9.2e-26
CCDS9534.2 GRTP1 gene_id:79774|Hs108|chr13         ( 336)  531 107.3 6.9e-23
CCDS66591.1 GRTP1 gene_id:79774|Hs108|chr13        ( 344)  531 107.3 7.1e-23
CCDS45314.1 TBC1D2B gene_id:23102|Hs108|chr15      ( 963)  534 108.2 1.1e-22
CCDS32301.2 TBC1D2B gene_id:23102|Hs108|chr15      ( 914)  516 104.9 9.9e-22
CCDS10676.2 TBC1D10B gene_id:26000|Hs108|chr16     ( 808)  495 101.1 1.2e-20
CCDS8162.1 TBC1D10C gene_id:374403|Hs108|chr11     ( 446)  479 98.0 5.8e-20
CCDS59137.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9        ( 468)  467 95.8 2.7e-19
CCDS75865.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9        ( 928)  467 96.1 4.6e-19
CCDS13874.1 TBC1D10A gene_id:83874|Hs108|chr22     ( 508)  463 95.2 4.8e-19
CCDS56227.1 TBC1D10A gene_id:83874|Hs108|chr22     ( 515)  463 95.2 4.8e-19
CCDS35080.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9        ( 917)  400 84.0   2e-15
CCDS12188.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19       ( 794)  392 82.5 4.9e-15
CCDS30774.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1           ( 810)  391 82.3 5.6e-15
CCDS76179.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1           ( 821)  391 82.3 5.7e-15
CCDS54209.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19       ( 805)  386 81.4   1e-14
CCDS6848.2 RABGAP1 gene_id:23637|Hs108|chr9        (1069)  381 80.6 2.4e-14
CCDS1314.1 RABGAP1L gene_id:9910|Hs108|chr1        ( 815)  379 80.1 2.5e-14
CCDS33972.1 TBC1D1 gene_id:23216|Hs108|chr4        (1168)  377 79.9 4.3e-14
CCDS53492.1 USP6NL gene_id:9712|Hs108|chr10        ( 828)  340 73.1 3.4e-12
CCDS44357.1 USP6NL gene_id:9712|Hs108|chr10        ( 845)  340 73.1 3.4e-12
CCDS66563.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13        (1235)  340 73.2 4.6e-12
CCDS66564.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13        (1290)  340 73.2 4.8e-12
CCDS41901.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13        (1298)  340 73.2 4.8e-12
CCDS73606.1 GRTP1 gene_id:79774|Hs108|chr13        ( 236)  312 67.7 4.2e-11


>>CCDS47136.1 TBC1D9 gene_id:23158|Hs108|chr4             (1266 aa)
 initn: 8395 init1: 8395 opt: 8395  Z-score: 8188.3  bits: 1527.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 8395; 100.0% identity (100.0% similar) in 1266 aa overlap (1-1266:1-1266)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MWVNPEEVLLANALWITERANPYFILQRRKGHAGDGGGGGGLAGLLVGTLDVVLDSSARV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MWVNPEEVLLANALWITERANPYFILQRRKGHAGDGGGGGGLAGLLVGTLDVVLDSSARV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 APYRILYQTPDSLVYWTIACGGSRKEITEHWEWLEQNLLQTLSIFENENDITTFVRGKIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 APYRILYQTPDSLVYWTIACGGSRKEITEHWEWLEQNLLQTLSIFENENDITTFVRGKIQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 GIIAEYNKINDVKEDDDTEKFKEAIVKFHRLFGMPEEEKLVNYYSCSYWKGKVPRQGWMY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GIIAEYNKINDVKEDDDTEKFKEAIVKFHRLFGMPEEEKLVNYYSCSYWKGKVPRQGWMY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 LSINHLCFYSFLMGREAKLVIRWVDITQLEKNATLLLPDVIKVSTRSSEHFFSVFLNINE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LSINHLCFYSFLMGREAKLVIRWVDITQLEKNATLLLPDVIKVSTRSSEHFFSVFLNINE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 TFKLMEQLANIAMRQLLDNEGFEQDRSLPKLKRKSPKKVSALKRDLDARAKSERYRALFR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TFKLMEQLANIAMRQLLDNEGFEQDRSLPKLKRKSPKKVSALKRDLDARAKSERYRALFR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 LPKDEKLDGHTDCTLWTPFNKMHILGQMFVSTNYICFTSKEENLCSLIIPLREVTIVEKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LPKDEKLDGHTDCTLWTPFNKMHILGQMFVSTNYICFTSKEENLCSLIIPLREVTIVEKA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 DSSSVLPSPLSISTRNRMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQQTTSKIYSDKEFAGSYNSSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DSSSVLPSPLSISTRNRMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQQTTSKIYSDKEFAGSYNSSD
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 DEVYSRPSSLVSSSPQRSTSSDADGERQFNLNGNSVPTATQTLMTMYRRRSPEEFNPKLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DEVYSRPSSLVSSSPQRSTSSDADGERQFNLNGNSVPTATQTLMTMYRRRSPEEFNPKLA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 KEFLKEQAWKIHFAEYGQGICMYRTEKTRELVLKGIPESMRGELWLLLSGAINEKATHPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KEFLKEQAWKIHFAEYGQGICMYRTEKTRELVLKGIPESMRGELWLLLSGAINEKATHPG
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 YYEDLVEKSMGKYNLATEEIERDLHRSLPEHPAFQNEMGIAALRRVLTAYAFRNPNIGYC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YYEDLVEKSMGKYNLATEEIERDLHRSLPEHPAFQNEMGIAALRRVLTAYAFRNPNIGYC
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 QAMNIVTSVLLLYAKEEEAFWLLVALCERMLPDYYNTRVVGALVDQGVFEELARDYVPQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QAMNIVTSVLLLYAKEEEAFWLLVALCERMLPDYYNTRVVGALVDQGVFEELARDYVPQL
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 YDCMQDLGVISTISLSWFLTLFLSVMPFESAVVVVDCFFYEGIKVIFQLALAVLDANVDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YDCMQDLGVISTISLSWFLTLFLSVMPFESAVVVVDCFFYEGIKVIFQLALAVLDANVDK
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 LLNCKDDGEAMTVLGRYLDSVTNKDSTLPPIPHLHSLLSDDVEPYPEVDIFRLIRTSYEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LLNCKDDGEAMTVLGRYLDSVTNKDSTLPPIPHLHSLLSDDVEPYPEVDIFRLIRTSYEK
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 FGTIRADLIEQMRFKQRLKVIQTLEDTTKRNVVRTIVTETSFTIDELEELYALFKAEHLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FGTIRADLIEQMRFKQRLKVIQTLEDTTKRNVVRTIVTETSFTIDELEELYALFKAEHLT
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 SCYWGGSSNALDRHDPSLPYLEQYRIDFEQFKGMFALLFPWACGTHSDVLASRLFQLLDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SCYWGGSSNALDRHDPSLPYLEQYRIDFEQFKGMFALLFPWACGTHSDVLASRLFQLLDE
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA0 NGDSLINFREFVSGLSAACHGDLTEKLKLLYKMHVLPEPSSDQDEPDSAFEATQYFFEDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NGDSLINFREFVSGLSAACHGDLTEKLKLLYKMHVLPEPSSDQDEPDSAFEATQYFFEDI
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA0 TPECTHVVGLDSRSKQGADDGFVTVSLKPDKGKRANSQENRNYLRLWTPENKSKSKNAKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TPECTHVVGLDSRSKQGADDGFVTVSLKPDKGKRANSQENRNYLRLWTPENKSKSKNAKD
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA0 LPKLNQGQFIELCKTMYNMFSEDPNEQELYHATAAVTSLLLEIGEVGKLFVAQPAKEGGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LPKLNQGQFIELCKTMYNMFSEDPNEQELYHATAAVTSLLLEIGEVGKLFVAQPAKEGGS
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA0 GGSGPSCHQGIPGVLFPKKGPGQPYVVESVEPLPASLAPDSEEHSLGGQMEDIKLEDSSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GGSGPSCHQGIPGVLFPKKGPGQPYVVESVEPLPASLAPDSEEHSLGGQMEDIKLEDSSP
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KA0 RDNGACSSMLISDDDTKDDSSMSSYSVLSAGSHEEDKLHCEDIGEDTVLVRSGQGTAALP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RDNGACSSMLISDDDTKDDSSMSSYSVLSAGSHEEDKLHCEDIGEDTVLVRSGQGTAALP
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KA0 RSTSLDRDWAITFEQFLASLLTEPALVKYFDKPVCMMARITSAKNIRMMGKPLTSASDYE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RSTSLDRDWAITFEQFLASLLTEPALVKYFDKPVCMMARITSAKNIRMMGKPLTSASDYE
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             
pF1KA0 ISAMSG
       ::::::
CCDS47 ISAMSG
             

>>CCDS43408.1 TBC1D9B gene_id:23061|Hs108|chr5            (1250 aa)
 initn: 4910 init1: 2367 opt: 5134  Z-score: 5007.0  bits: 938.6 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5164; 63.1% identity (83.5% similar) in 1288 aa overlap (1-1266:1-1250)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MWVNPEEVLLANALWITERANPYFILQRRKGHAGDGGGGGGLAGLLVGTLDVVLDSSARV
       ::..:::::.:::::.::::::.:.::::.::    : ::::.:::::::::::::::::
CCDS43 MWLSPEEVLVANALWVTERANPFFVLQRRRGH----GRGGGLTGLLVGTLDVVLDSSARV
               10        20        30            40        50      

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 APYRILYQTPDSLVYWTIACGGSRKEITEHWEWLEQNLLQTLSIFENENDITTFVRGKIQ
       ::::::.:: :: ::::.:::.::::::.::::::.:::::::::..:.::::::.:::.
CCDS43 APYRILHQTQDSQVYWTVACGSSRKEITKHWEWLENNLLQTLSIFDSEEDITTFVKGKIH
         60        70        80        90       100       110      

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 GIIAEYNKINDVKEDDDTEKFKEAIVKFHRLFGMPEEEKLVNYYSCSYWKGKVPRQGWMY
       ::::: ::  . . :.:  ::::: .:... ::::: ::::::::::::::.::::::.:
CCDS43 GIIAEENKNLQPQGDEDPGKFKEAELKMRKQFGMPEGEKLVNYYSCSYWKGRVPRQGWLY
        120       130       140       150       160       170      

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 LSINHLCFYSFLMGREAKLVIRWVDITQLEKNATLLLPDVIKVSTRSSEHFFSVFLNINE
       :..:::::::::.:.:..::..:::::.::::::::.:. :.:.::..: :::.::::.:
CCDS43 LTVNHLCFYSFLLGKEVSLVVQWVDITRLEKNATLLFPESIRVDTRDQELFFSMFLNIGE
        180       190       200       210       220       230      

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 TFKLMEQLANIAMRQLLDNEGFEQDRSLPKLKRKSPKKVSALKRDLDARAKSERYRALFR
       ::::::::::.:::::::.::: .:..::.  :   ...::::::::::::.: ::: ::
CCDS43 TFKLMEQLANLAMRQLLDSEGFLEDKALPRPIRPH-RNISALKRDLDARAKNECYRATFR
        240       250       260       270        280       290     

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 LPKDEKLDGHTDCTLWTPFNKMHILGQMFVSTNYICFTSKEENLCSLIIPLREVTIVEKA
       ::.::.:::::.:::::::::.:: ::::.:.:::::.::::. : ::::::::::::::
CCDS43 LPRDERLDGHTSCTLWTPFNKLHIPGQMFISNNYICFASKEEDACHLIIPLREVTIVEKA
         300       310       320       330       340       350     

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 DSSSVLPSPLSISTRNRMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQQTTSKIYSDKEFAGSYNSSD
       ::::::::::::::...:::::::::::::::::::::::.: ::        :: .:  
CCDS43 DSSSVLPSPLSISTKSKMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQKTPSKQ------PGSIGSRK
         360       370       380       390       400               

              430       440            450       460       470     
pF1KA0 DEVYSRPSSLVSSSPQRSTSSDAD-----GERQFNLNGNSVPTATQTLMTMYRRRSP-EE
         : . ::.  : .::... . :.     . :: .. .. .:::.: :. .... :: :.
CCDS43 ASVVD-PSTESSPAPQEGSEQPASPASPLSSRQ-SFCAQEAPTASQGLLKLFQKNSPMED
     410        420       430       440        450       460       

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pF1KA0 FNPKLAKEFLKEQAWKIHFAEYGQGICMYRTEKTRELVLKGIPESMRGELWLLLSGAINE
       .. : ::: .::..:.::: :::.:.::::: ::: :::::::::.:::::::.::: ::
CCDS43 LGAKGAKEKMKEESWHIHFFEYGRGVCMYRTAKTRALVLKGIPESLRGELWLLFSGAWNE
       470       480       490       500       510       520       

          540       550       560       570       580       590    
pF1KA0 KATHPGYYEDLVEKSMGKYNLATEEIERDLHRSLPEHPAFQNEMGIAALRRVLTAYAFRN
        .:::::: .::::: :::.:::::::::::::.:::::::::.::::::::::::::::
CCDS43 MVTHPGYYAELVEKSTGKYSLATEEIERDLHRSMPEHPAFQNELGIAALRRVLTAYAFRN
       530       540       550       560       570       580       

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pF1KA0 PNIGYCQAMNIVTSVLLLYAKEEEAFWLLVALCERMLPDYYNTRVVGALVDQGVFEELAR
       :.:::::::::::::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.:
CCDS43 PTIGYCQAMNIVTSVLLLYGSEEEAFWLLVALCERMLPDYYNTRVVGALVDQGIFEELTR
       590       600       610       620       630       640       

          660       670       680       690       700       710    
pF1KA0 DYVPQLYDCMQDLGVISTISLSWFLTLFLSVMPFESAVVVVDCFFYEGIKVIFQLALAVL
       :..::: . ::::::::.:::::::::::::::::::::.::::::::::::.:.:::::
CCDS43 DFLPQLSEKMQDLGVISSISLSWFLTLFLSVMPFESAVVIVDCFFYEGIKVILQVALAVL
       650       660       670       680       690       700       

          720       730       740       750       760       770    
pF1KA0 DANVDKLLNCKDDGEAMTVLGRYLDSVTNKDSTLPPIPHLHSLLSDDVEPYPEVDIFRLI
       :::...::.:.:.:::::.::::::.:.::.:. ::::::..:::.. .:  :::::.:.
CCDS43 DANMEQLLGCSDEGEAMTMLGRYLDNVVNKQSVSPPIPHLRALLSSSDDPPAEVDIFELL
       710       720       730       740       750       760       

          780       790       800       810       820       830    
pF1KA0 RTSYEKFGTIRADLIEQMRFKQRLKVIQTLEDTTKRNVVRTIVTETSFTIDELEELYALF
       ..:::::...::. ::::::::::::::.::::.::.:::.: .. .:.:.:::.:: .:
CCDS43 KVSYEKFSSLRAEDIEQMRFKQRLKVIQSLEDTAKRSVVRAIPVDIGFSIEELEDLYMVF
       770       780       790       800       810       820       

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pF1KA0 KAEHLTSCYWGGSSNALDRHDPSLPYLEQYRIDFEQFKGMFALLFPWACGTHSDVLASRL
       ::.::.: ::: : .   :.:::::::::::::  ::. .:: : :::::.:. .::.:.
CCDS43 KAKHLASQYWGCSRTMAGRRDPSLPYLEQYRIDASQFRELFASLTPWACGSHTPLLAGRM
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pF1KA0 FQLLDENGDSLINFREFVSGLSAACHGDLTEKLKLLYKMHVLPEPSSDQDEPDSAFEATQ
       :.::::: ::::::.:::.:.:.  :::::::::.:::.: :: :. . .: .::.::..
CCDS43 FRLLDENKDSLINFKEFVTGMSGMYHGDLTEKLKVLYKLH-LP-PALSPEEAESALEAAH
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pF1KA0 YFFEDITPECTHVVG-LDSRSKQGADDGFVTV----SLKPDKG--KRANSQENRNYLRLW
       :: :: . : . ... ::      :....       : . ..:  : ..: . :.:::.:
CCDS43 YFTEDSSSEASPLASDLDLFLPWEAQEALPQEEQEGSGSEERGEEKGTSSPDYRHYLRMW
         950       960       970       980       990      1000     

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pF1KA0 TPENKSKSKNAKDLPKLNQGQFIELCKTMYNMFSEDPNEQELYHATAAVTSLLLEIGEVG
       . :....... :::::.:: ::::::::.:::::::: ::.:::: :.:.::::.:::::
CCDS43 AKEKEAQKETIKDLPKMNQEQFIELCKTLYNMFSEDPMEQDLYHAIATVASLLLRIGEVG
        1010      1020      1030      1040      1050      1060     

      1070      1080            1090      1100      1110      1120 
pF1KA0 KLFVAQPAKEGGSGGS------GPSCHQGIPGVLFPKKGPGQPYVVESVEPLPASLAPDS
       : : :. ...  . ..      .:  ::     : :  . :.:          :. . :.
CCDS43 KKFSARTGRKPRDCATEEDEPPAPELHQDAARELQPP-AAGDPQ---------AKAGGDT
        1070      1080      1090      1100                1110     

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pF1KA0 EEHSLGG--QMEDIKLEDSSPRDNGACSSMLISDDDTKDDSSMSSYSVLSAGSHEEDKLH
       .   ::   :  .. .: .: . .:.  :.:.:::.:::: :::::::.:.::     :.
CCDS43 H---LGKAPQESQVVVEGGSGEGQGS-PSQLLSDDETKDDMSMSSYSVVSTGS-----LQ
           1120      1130       1140      1150      1160           

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pF1KA0 CEDIGEDTVLVRSGQGTAALPR-STSLDRDWAITFEQFLASLLTEPALVKYFDKPVCMMA
       :::...::::: .:.. .   : . ..: :: :.:::.:::.::: .::..:.: : .  
CCDS43 CEDLADDTVLV-GGEACSPTARIGGTVDTDWCISFEQILASILTESVLVNFFEKRVDIGL
       1170       1180      1190      1200      1210      1220     

     1240      1250      1260      
pF1KA0 RITSAKNIRMMGKPLTSASDYEISAMSG
       .: . :...   . ...:::.:  ..::
CCDS43 KIKDQKKVE---RQFSTASDHEQPGVSG
        1230         1240      1250

>>CCDS4450.1 TBC1D9B gene_id:23061|Hs108|chr5             (1233 aa)
 initn: 4892 init1: 2350 opt: 4560  Z-score: 4447.1  bits: 835.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5164; 63.3% identity (83.6% similar) in 1281 aa overlap (1-1266:1-1233)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MWVNPEEVLLANALWITERANPYFILQRRKGHAGDGGGGGGLAGLLVGTLDVVLDSSARV
       ::..:::::.:::::.::::::.:.::::.::    : ::::.:::::::::::::::::
CCDS44 MWLSPEEVLVANALWVTERANPFFVLQRRRGH----GRGGGLTGLLVGTLDVVLDSSARV
               10        20        30            40        50      

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 APYRILYQTPDSLVYWTIACGGSRKEITEHWEWLEQNLLQTLSIFENENDITTFVRGKIQ
       ::::::.:: :: ::::.:::.::::::.::::::.:::::::::..:.::::::.:::.
CCDS44 APYRILHQTQDSQVYWTVACGSSRKEITKHWEWLENNLLQTLSIFDSEEDITTFVKGKIH
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pF1KA0 GIIAEYNKINDVKEDDDTEKFKEAIVKFHRLFGMPEEEKLVNYYSCSYWKGKVPRQGWMY
       ::::: ::  . . :.:  ::::: .:... ::::: ::::::::::::::.::::::.:
CCDS44 GIIAEENKNLQPQGDEDPGKFKEAELKMRKQFGMPEGEKLVNYYSCSYWKGRVPRQGWLY
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pF1KA0 LSINHLCFYSFLMGREAKLVIRWVDITQLEKNATLLLPDVIKVSTRSSEHFFSVFLNINE
       :..:::::::::.:.:..::..:::::.::::::::.:. :.:.::..: :::.::::.:
CCDS44 LTVNHLCFYSFLLGKEVSLVVQWVDITRLEKNATLLFPESIRVDTRDQELFFSMFLNIGE
        180       190       200       210       220       230      

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pF1KA0 TFKLMEQLANIAMRQLLDNEGFEQDRSLPKLKRKSPKKVSALKRDLDARAKSERYRALFR
       ::::::::::.:::::::.::: .:..::.  :   ...::::::::::::.: ::: ::
CCDS44 TFKLMEQLANLAMRQLLDSEGFLEDKALPRPIRPH-RNISALKRDLDARAKNECYRATFR
        240       250       260       270        280       290     

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pF1KA0 LPKDEKLDGHTDCTLWTPFNKMHILGQMFVSTNYICFTSKEENLCSLIIPLREVTIVEKA
       ::.::.:::::.:::::::::.:: ::::.:.:::::.::::. : ::::::::::::::
CCDS44 LPRDERLDGHTSCTLWTPFNKLHIPGQMFISNNYICFASKEEDACHLIIPLREVTIVEKA
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pF1KA0 DSSSVLPSPLSISTRNRMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQQTTSKIYSDKEFAGSYNSSD
       ::::::::::::::...:::::::::::::::::::::::.: ::        :: .:  
CCDS44 DSSSVLPSPLSISTKSKMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQKTPSKQ------PGSIGSRK
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pF1KA0 DEVYSRPSSLVSSSPQRSTSSDAD-----GERQFNLNGNSVPTATQTLMTMYRRRSP-EE
         : . ::.  : .::... . :.     . :: .. .. .:::.: :. .... :: :.
CCDS44 ASVVD-PSTESSPAPQEGSEQPASPASPLSSRQ-SFCAQEAPTASQGLLKLFQKNSPMED
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pF1KA0 FNPKLAKEFLKEQAWKIHFAEYGQGICMYRTEKTRELVLKGIPESMRGELWLLLSGAINE
       .. : ::: .::..:.::: :::.:.::::: ::: :::::::::.:::::::.::: ::
CCDS44 LGAKGAKEKMKEESWHIHFFEYGRGVCMYRTAKTRALVLKGIPESLRGELWLLFSGAWNE
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        .:::::: .::::: :::.:::::::::::::.:::::::::.::::::::::::::::
CCDS44 MVTHPGYYAELVEKSTGKYSLATEEIERDLHRSMPEHPAFQNELGIAALRRVLTAYAFRN
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pF1KA0 PNIGYCQAMNIVTSVLLLYAKEEEAFWLLVALCERMLPDYYNTRVVGALVDQGVFEELAR
       :.:::::::::::::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.:
CCDS44 PTIGYCQAMNIVTSVLLLYGSEEEAFWLLVALCERMLPDYYNTRVVGALVDQGIFEELTR
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pF1KA0 DYVPQLYDCMQDLGVISTISLSWFLTLFLSVMPFESAVVVVDCFFYEGIKVIFQLALAVL
       :..::: . ::::::::.:::::::::::::::::::::.::::::::::::.:.:::::
CCDS44 DFLPQLSEKMQDLGVISSISLSWFLTLFLSVMPFESAVVIVDCFFYEGIKVILQVALAVL
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pF1KA0 DANVDKLLNCKDDGEAMTVLGRYLDSVTNKDSTLPPIPHLHSLLSDDVEPYPEVDIFRLI
       :::...::.:.:.:::::.::::::.:.::.:. ::::::..:::.. .:  :::::.:.
CCDS44 DANMEQLLGCSDEGEAMTMLGRYLDNVVNKQSVSPPIPHLRALLSSSDDPPAEVDIFELL
       710       720       730       740       750       760       

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pF1KA0 RTSYEKFGTIRADLIEQMRFKQRLKVIQTLEDTTKRNVVRTIVTETSFTIDELEELYALF
       ..:::::...::. ::::::::::::::.::::.::.:::.: .. .:.:.:::.:: .:
CCDS44 KVSYEKFSSLRAEDIEQMRFKQRLKVIQSLEDTAKRSVVRAIPVDIGFSIEELEDLYMVF
       770       780       790       800       810       820       

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pF1KA0 KAEHLTSCYWGGSSNALDRHDPSLPYLEQYRIDFEQFKGMFALLFPWACGTHSDVLASRL
       ::.::.: ::: : .   :.:::::::::::::  ::. .:: : :::::.:. .::.:.
CCDS44 KAKHLASQYWGCSRTMAGRRDPSLPYLEQYRIDASQFRELFASLTPWACGSHTPLLAGRM
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pF1KA0 FQLLDENGDSLINFREFVSGLSAACHGDLTEKLKLLYKMHVLPEPSSDQDEPDSAFEATQ
       :.::::: ::::::.:::.:.:.  :::::::::.:::.: :: :. . .: .::.::..
CCDS44 FRLLDENKDSLINFKEFVTGMSGMYHGDLTEKLKVLYKLH-LP-PALSPEEAESALEAAH
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pF1KA0 YFFEDITPECTHVVGLDSRSKQGADDGFVTVSLKPDKGKRANSQENRNYLRLWTPENKSK
       :: :: . :     .: .. ..:.       : .  . : ..: . :.:::.:. :....
CCDS44 YFTEDSSSEE----ALPQEEQEGSG------SEERGEEKGTSSPDYRHYLRMWAKEKEAQ
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pF1KA0 SKNAKDLPKLNQGQFIELCKTMYNMFSEDPNEQELYHATAAVTSLLLEIGEVGKLFVAQP
       ... :::::.:: ::::::::.:::::::: ::.:::: :.:.::::.:::::: : :. 
CCDS44 KETIKDLPKMNQEQFIELCKTLYNMFSEDPMEQDLYHAIATVASLLLRIGEVGKKFSART
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pF1KA0 AKEGGSGGS------GPSCHQGIPGVLFPKKGPGQPYVVESVEPLPASLAPDSEEHSLGG
       ...  . ..      .:  ::     : :  . :.:          :. . :..   :: 
CCDS44 GRKPRDCATEEDEPPAPELHQDAARELQPP-AAGDPQ---------AKAGGDTH---LGK
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pF1KA0 --QMEDIKLEDSSPRDNGACSSMLISDDDTKDDSSMSSYSVLSAGSHEEDKLHCEDIGED
         :  .. .: .: . .:.  :.:.:::.:::: :::::::.:.::     :.:::...:
CCDS44 APQESQVVVEGGSGEGQGS-PSQLLSDDETKDDMSMSSYSVVSTGS-----LQCEDLADD
           1110      1120       1130      1140           1150      

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pF1KA0 TVLVRSGQGTAALPR-STSLDRDWAITFEQFLASLLTEPALVKYFDKPVCMMARITSAKN
       :::: .:.. .   : . ..: :: :.:::.:::.::: .::..:.: : .  .: . :.
CCDS44 TVLV-GGEACSPTARIGGTVDTDWCISFEQILASILTESVLVNFFEKRVDIGLKIKDQKK
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        1250      1260      
pF1KA0 IRMMGKPLTSASDYEISAMSG
       ..   . ...:::.:  ..::
CCDS44 VE---RQFSTASDHEQPGVSG
           1220      1230   

>>CCDS82486.1 TBC1D8 gene_id:11138|Hs108|chr2             (1155 aa)
 initn: 3184 init1: 1956 opt: 2655  Z-score: 2589.0  bits: 491.1 E(32554): 6.9e-138
Smith-Waterman score: 3664; 46.8% identity (71.6% similar) in 1295 aa overlap (1-1264:1-1155)

               10          20        30        40        50        
pF1KA0 MWVNPEEVLLANAL--WITERANPYFILQRRKGHAGDGGGGGGLAGLLVGTLDVVLDSSA
       ::..:::::: :::  :.:.... :::::::.::   : ::: :.: :::.::.::::.:
CCDS82 MWLKPEEVLLKNALKLWVTQKSSCYFILQRRRGH---GEGGGRLTGRLVGALDAVLDSNA
               10        20        30           40        50       

       60        70                       80        90       100   
pF1KA0 RVAPYRILYQTPDSLVY---------------WTIACGGSRKEITEHWEWLEQNLLQTLS
       ::::.::: :.: : ::               :.:: :.. .::..::.:::::::.:::
CCDS82 RVAPFRILLQVPGSQVYSPIACGELLNGSDVYWAIATGATLEEINQHWDWLEQNLLHTLS
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pF1KA0 IFENENDITTFVRGKIQGIIAEYNKINDVKEDDDTEKFKEAIVKFHRLFGMPEEEKLVNY
       .:.:..::..::.::....::: ..   ...... :::.::.:::.  :..:: ::::.:
CCDS82 VFDNKDDIASFVKGKVKALIAEETSSRLAEQEEEPEKFREALVKFEARFNFPEAEKLVTY
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pF1KA0 YSCSYWKGKVPRQGWMYLSINHLCFYSFLMGREAKLVIRWVDITQLEKNATLLLPDVIKV
       :::  :::.::::::.::::::::::::..:.: :::. :::: .::......: :.:..
CCDS82 YSCCCWKGRVPRQGWLYLSINHLCFYSFFLGKELKLVVPWVDIQKLERTSNVFLTDTIRI
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pF1KA0 STRSSEHFFSVFLNINETFKLMEQLANIAMRQLLDNEGFEQDRSLPKLKRKSPKKVSALK
       .:...:. ::.:::..:.::.:::::....:.::::: :. :   : :..  :....  :
CCDS82 TTQNKERDFSMFLNLDEVFKVMEQLADVTLRRLLDNEVFDLD---PDLQE--PSQIT--K
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pF1KA0 RDLDARAKSERYRALFRLPKDEKLDGHTDCTLWTPFNKMHILGQMFVSTNYICFTSKEEN
       :::.:::..: .::.::::. ::: . .::.:::::.. :  :.::.: .::::.:.:..
CCDS82 RDLEARAQNEFFRAFFRLPRKEKLHAVVDCSLWTPFSRCHTTGRMFASDSYICFASREDG
              300       310       320       330       340       350

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pF1KA0 LCSLIIPLREVTIVEKADSSSVLPSPLSISTRNRMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQQTT
        :..:.:::::. .:: ...:.:: :. .: :....: : .:.::: ::. .   :.:  
CCDS82 CCKIILPLREVVSIEKMEDTSLLPHPIIVSIRSKVAFQFIELRDRDSLVEALLARLKQ--
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pF1KA0 SKIYSDKEFAGSYNSS-DDEVYSRPSSLVSSSPQRSTSSDAD-GERQFNLNGNSVPTATQ
         .....     :..: ::..    .:::  :   :  ::   :. ..  . ::  .  .
CCDS82 --VHANHPV--HYDTSADDDM----ASLVFHS--TSMCSDHRFGDLEMMSSQNSEESEKE
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pF1KA0 --------TLMTMYRRRSPEEFNPKLAKEFLKEQAWKIHFAEYGQGICMYRTEKTRELVL
               .:.: ... . .  . ....: .: . :. ::.:::. .::.:::: :.:: 
CCDS82 KSPLMHPDALVTAFQQSGSQSPDSRMSREQIKISLWNDHFVEYGRTVCMFRTEKIRKLVA
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pF1KA0 KGIPESMRGELWLLLSGAINEKATHPGYYEDLVEKSMGKYNLATEEIERDLHRSLPEHPA
        :::::.::.::::.: :... :.::::: .:::.:.::  :.:::::::::::::::::
CCDS82 MGIPESLRGRLWLLFSDAVTDLASHPGYYGNLVEESLGKCCLVTEEIERDLHRSLPEHPA
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pF1KA0 FQNEMGIAALRRVLTAYAFRNPNIGYCQAMNIVTSVLLLYAKEEEAFWLLVALCERMLPD
       :::: ::::::::::::: :::.:::::.:::.:::::::.:::::::::::.:::::::
CCDS82 FQNETGIAALRRVLTAYAHRNPKIGYCQSMNILTSVLLLYTKEEEAFWLLVAVCERMLPD
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pF1KA0 YYNTRVVGALVDQGVFEELARDYVPQLYDCMQDLGVISTISLSWFLTLFLSVMPFESAVV
       :.: ::.:: :::.::::: . ..:.: . :.::......:::::::::::.::.:::: 
CCDS82 YFNHRVIGAQVDQSVFEELIKGHLPELAEHMNDLSALASVSLSWFLTLFLSIMPLESAVN
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pF1KA0 VVDCFFYEGIKVIFQLALAVLDANVDKLLNCKDDGEAMTVLGRYLDSVTNKDSTLPPIPH
       :::::::.:::.::::.::::.::.. : . ::::.:. .:.:.:: . :.::  ::.  
CCDS82 VVDCFFYDGIKAIFQLGLAVLEANAEDLCSSKDDGQALMILSRFLDHIKNEDSPGPPVGS
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pF1KA0 LHSLLSDDVEPYPEVDIFRLIRTSYEKFGTIRADLIEQMRFKQRLKVIQTLEDTTKRNVV
        :...::: :::: .::  ::: ::::::   .. ::..:.:.:..:.:  :::::.::.
CCDS82 HHAFFSDDQEPYPVTDISDLIRDSYEKFGDQSVEQIEHLRYKHRIRVLQGHEDTTKQNVL
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pF1KA0 RTIVTETSFTIDELEELYALFKAEHLTSCYWGGSSNALDRHDPSLPYLEQYRIDFEQFKG
       :... :.:.  ..::::: ::: ::. ::::       .::::: :: :::::: .::  
CCDS82 RVVIPEVSILPEDLEELYDLFKREHMMSCYWEQPRPMASRHDPSRPYAEQYRIDARQFAH
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pF1KA0 MFALLFPWACGTHSDVLASRLFQLLDENGDSLINFREFVSGLSAACHGDLTEKLKLLYKM
       .: :. ::.::.:...:: : :.:::.: :.::.:. ::: :.   .:...::.::::..
CCDS82 LFQLVSPWTCGAHTEILAERTFRLLDDNMDQLIEFKAFVSCLDIMYNGEMNEKIKLLYRL
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pF1KA0 HVLPEPSSDQDEPDSAFEATQYFFEDITPECTHVVGLDSRSKQGADDGFVTVSLKPDKGK
       :. : :.  ... ::     . ..    :    : :                  ::. : 
CCDS82 HI-P-PALTENDRDSQSPLRNPLLSTSRPL---VFG------------------KPN-GD
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pF1KA0 RANSQENRNYLRLWTPENKSKSKNAKDLPKLNQGQFIELCKTMYNMFSEDPNEQELYHAT
        .. :  ..  ..     : :.:. :.:::..: .::..:::.:.:: :::.:..::.: 
CCDS82 AVDYQ--KQLKQMIKDLAKEKDKTEKELPKMSQREFIQFCKTLYSMFHEDPEENDLYQAI
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pF1KA0 AAVTSLLLEIGEVGKLFVAQPAKEGGSGGSGPSCHQGIPGVLFPKKGPGQPYVVESVEPL
       :.::.:::.:::::        ..:.:.:   :: :                  :  : :
CCDS82 ATVTTLLLQIGEVG--------QRGSSSG---SCSQ------------------ECGEEL
           1040              1050                           1060   

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pF1KA0 PASLAPDSEEHSLGGQMEDIKLEDSSPRDNGACSSMLISDDDTKDDSSMSSYSVLSAGSH
        :: ::                   ::.:                       ::..    
CCDS82 RAS-AP-------------------SPED-----------------------SVFA----
                              1070                                 

          1180      1190      1200      1210      1220      1230   
pF1KA0 EEDKLHCEDIGEDTVLVRSGQGTAALPRSTSLDRDWAITFEQFLASLLTEPALVKYFDKP
               : :      .. : . :.:...  .:::....:..::::::: .::..:.::
CCDS82 --------DTG------KTPQDSQAFPEAA--ERDWTVSLEHILASLLTEQSLVNFFEKP
                     1080      1090        1100      1110      1120

          1240          1250      1260      
pF1KA0 VCMMARITSAK----NIRMMGKPLTSASDYEISAMSG
       . : ... .::    :.. .     : :. ..: .  
CCDS82 LDMKSKLENAKINQYNLKTFEMSHQSQSELKLSNL  
             1130      1140      1150       

>>CCDS46375.1 TBC1D8 gene_id:11138|Hs108|chr2             (1140 aa)
 initn: 3310 init1: 1956 opt: 2404  Z-score: 2344.2  bits: 445.8 E(32554): 3e-124
Smith-Waterman score: 3698; 47.3% identity (72.3% similar) in 1280 aa overlap (1-1264:1-1140)

               10          20        30        40        50        
pF1KA0 MWVNPEEVLLANAL--WITERANPYFILQRRKGHAGDGGGGGGLAGLLVGTLDVVLDSSA
       ::..:::::: :::  :.:.... :::::::.::   : ::: :.: :::.::.::::.:
CCDS46 MWLKPEEVLLKNALKLWVTQKSSCYFILQRRRGH---GEGGGRLTGRLVGALDAVLDSNA
               10        20        30           40        50       

       60        70        80        90       100       110        
pF1KA0 RVAPYRILYQTPDSLVYWTIACGGSRKEITEHWEWLEQNLLQTLSIFENENDITTFVRGK
       ::::.::: :.: : ::  ::::.. .::..::.:::::::.:::.:.:..::..::.::
CCDS46 RVAPFRILLQVPGSQVYSPIACGATLEEINQHWDWLEQNLLHTLSVFDNKDDIASFVKGK
        60        70        80        90       100       110       

      120       130       140       150       160       170        
pF1KA0 IQGIIAEYNKINDVKEDDDTEKFKEAIVKFHRLFGMPEEEKLVNYYSCSYWKGKVPRQGW
       ....::: ..   ...... :::.::.:::.  :..:: ::::.::::  :::.::::::
CCDS46 VKALIAEETSSRLAEQEEEPEKFREALVKFEARFNFPEAEKLVTYYSCCCWKGRVPRQGW
       120       130       140       150       160       170       

      180       190       200       210       220       230        
pF1KA0 MYLSINHLCFYSFLMGREAKLVIRWVDITQLEKNATLLLPDVIKVSTRSSEHFFSVFLNI
       .::::::::::::..:.: :::. :::: .::......: :.:...:...:. ::.:::.
CCDS46 LYLSINHLCFYSFFLGKELKLVVPWVDIQKLERTSNVFLTDTIRITTQNKERDFSMFLNL
       180       190       200       210       220       230       

      240       250       260       270       280       290        
pF1KA0 NETFKLMEQLANIAMRQLLDNEGFEQDRSLPKLKRKSPKKVSALKRDLDARAKSERYRAL
       .:.::.:::::....:.::::: :. :   : :..  :....  ::::.:::..: .::.
CCDS46 DEVFKVMEQLADVTLRRLLDNEVFDLD---PDLQE--PSQIT--KRDLEARAQNEFFRAF
       240       250       260            270         280       290

      300       310       320       330       340       350        
pF1KA0 FRLPKDEKLDGHTDCTLWTPFNKMHILGQMFVSTNYICFTSKEENLCSLIIPLREVTIVE
       ::::. ::: . .::.:::::.. :  :.::.: .::::.:.:.. :..:.:::::. .:
CCDS46 FRLPRKEKLHAVVDCSLWTPFSRCHTTGRMFASDSYICFASREDGCCKIILPLREVVSIE
              300       310       320       330       340       350

      360       370       380       390       400       410        
pF1KA0 KADSSSVLPSPLSISTRNRMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQQTTSKIYSDKEFAGSYNS
       : ...:.:: :. .: :....: : .:.::: ::. .   :.:    .....     :..
CCDS46 KMEDTSLLPHPIIVSIRSKVAFQFIELRDRDSLVEALLARLKQ----VHANHPV--HYDT
              360       370       380       390           400      

       420       430       440        450       460                
pF1KA0 S-DDEVYSRPSSLVSSSPQRSTSSDAD-GERQFNLNGNSVPTATQ--------TLMTMYR
       : ::..    .:::  :   :  ::   :. ..  . ::  .  .        .:.: ..
CCDS46 SADDDM----ASLVFHS--TSMCSDHRFGDLEMMSSQNSEESEKEKSPLMHPDALVTAFQ
          410             420       430       440       450        

      470       480       490       500       510       520        
pF1KA0 RRSPEEFNPKLAKEFLKEQAWKIHFAEYGQGICMYRTEKTRELVLKGIPESMRGELWLLL
       . . .  . ....: .: . :. ::.:::. .::.:::: :.::  :::::.::.::::.
CCDS46 QSGSQSPDSRMSREQIKISLWNDHFVEYGRTVCMFRTEKIRKLVAMGIPESLRGRLWLLF
      460       470       480       490       500       510        

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pF1KA0 SGAINEKATHPGYYEDLVEKSMGKYNLATEEIERDLHRSLPEHPAFQNEMGIAALRRVLT
       : :... :.::::: .:::.:.::  :.::::::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS46 SDAVTDLASHPGYYGNLVEESLGKCCLVTEEIERDLHRSLPEHPAFQNETGIAALRRVLT
      520       530       540       550       560       570        

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pF1KA0 AYAFRNPNIGYCQAMNIVTSVLLLYAKEEEAFWLLVALCERMLPDYYNTRVVGALVDQGV
       ::: :::.:::::.:::.:::::::.:::::::::::.::::::::.: ::.:: :::.:
CCDS46 AYAHRNPKIGYCQSMNILTSVLLLYTKEEEAFWLLVAVCERMLPDYFNHRVIGAQVDQSV
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pF1KA0 FEELARDYVPQLYDCMQDLGVISTISLSWFLTLFLSVMPFESAVVVVDCFFYEGIKVIFQ
       :::: . ..:.: . :.::......:::::::::::.::.:::: :::::::.:::.:::
CCDS46 FEELIKGHLPELAEHMNDLSALASVSLSWFLTLFLSIMPLESAVNVVDCFFYDGIKAIFQ
      640       650       660       670       680       690        

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pF1KA0 LALAVLDANVDKLLNCKDDGEAMTVLGRYLDSVTNKDSTLPPIPHLHSLLSDDVEPYPEV
       :.::::.::.. : . ::::.:. .:.:.:: . :.::  ::.   :...::: :::: .
CCDS46 LGLAVLEANAEDLCSSKDDGQALMILSRFLDHIKNEDSPGPPVGSHHAFFSDDQEPYPVT
      700       710       720       730       740       750        

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pF1KA0 DIFRLIRTSYEKFGTIRADLIEQMRFKQRLKVIQTLEDTTKRNVVRTIVTETSFTIDELE
       ::  ::: ::::::   .. ::..:.:.:..:.:  :::::.::.:... :.:.  ..::
CCDS46 DISDLIRDSYEKFGDQSVEQIEHLRYKHRIRVLQGHEDTTKQNVLRVVIPEVSILPEDLE
      760       770       780       790       800       810        

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pF1KA0 ELYALFKAEHLTSCYWGGSSNALDRHDPSLPYLEQYRIDFEQFKGMFALLFPWACGTHSD
       ::: ::: ::. ::::       .::::: :: :::::: .::  .: :. ::.::.:..
CCDS46 ELYDLFKREHMMSCYWEQPRPMASRHDPSRPYAEQYRIDARQFAHLFQLVSPWTCGAHTE
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pF1KA0 VLASRLFQLLDENGDSLINFREFVSGLSAACHGDLTEKLKLLYKMHVLPEPSSDQDEPDS
       .:: : :.:::.: :.::.:. ::: :.   .:...::.::::..:. : :.  ... ::
CCDS46 ILAERTFRLLDDNMDQLIEFKAFVSCLDIMYNGEMNEKIKLLYRLHI-P-PALTENDRDS
      880       890       900       910       920         930      

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pF1KA0 AFEATQYFFEDITPECTHVVGLDSRSKQGADDGFVTVSLKPDKGKRANSQENRNYLRLWT
            . ..    :    : :                  ::. :  .. :  ..  ..  
CCDS46 QSPLRNPLLSTSRPL---VFG------------------KPN-GDAVDYQ--KQLKQMIK
        940       950                             960         970  

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pF1KA0 PENKSKSKNAKDLPKLNQGQFIELCKTMYNMFSEDPNEQELYHATAAVTSLLLEIGEVGK
          : :.:. :.:::..: .::..:::.:.:: :::.:..::.: :.::.:::.::::: 
CCDS46 DLAKEKDKTEKELPKMSQREFIQFCKTLYSMFHEDPEENDLYQAIATVTTLLLQIGEVG-
            980       990      1000      1010      1020      1030  

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pF1KA0 LFVAQPAKEGGSGGSGPSCHQGIPGVLFPKKGPGQPYVVESVEPLPASLAPDSEEHSLGG
              ..:.:.:   :: :                  :  : : :: ::         
CCDS46 -------QRGSSSG---SCSQ------------------ECGEELRAS-AP---------
                      1040                        1050             

     1130      1140      1150      1160      1170      1180        
pF1KA0 QMEDIKLEDSSPRDNGACSSMLISDDDTKDDSSMSSYSVLSAGSHEEDKLHCEDIGEDTV
                 ::.:                       ::..            : :    
CCDS46 ----------SPED-----------------------SVFA------------DTG----
                                           1060                    

     1190      1200      1210      1220      1230      1240        
pF1KA0 LVRSGQGTAALPRSTSLDRDWAITFEQFLASLLTEPALVKYFDKPVCMMARITSAK----
         .. : . :.:...  .:::....:..::::::: .::..:.::. : ... .::    
CCDS46 --KTPQDSQAFPEAA--ERDWTVSLEHILASLLTEQSLVNFFEKPLDMKSKLENAKINQY
           1070        1080      1090      1100      1110      1120

         1250      1260      
pF1KA0 NIRMMGKPLTSASDYEISAMSG
       :.. .     : :. ..: .  
CCDS46 NLKTFEMSHQSQSELKLSNL  
             1130      1140  

>>CCDS14522.1 TBC1D8B gene_id:54885|Hs108|chrX            (1120 aa)
 initn: 3627 init1: 1978 opt: 2007  Z-score: 1957.0  bits: 374.1 E(32554): 1.1e-102
Smith-Waterman score: 3648; 52.5% identity (78.2% similar) in 1100 aa overlap (1-1092:1-1053)

               10          20        30        40        50        
pF1KA0 MWVNPEEVLLANAL--WITERANPYFILQRRKGHAGDGGGGGGLAGLLVGTLDVVLDSSA
       ::..:::::: :::  :. ::.: ::.::::.:.. .:::  ::.:::::::: ::::.:
CCDS14 MWLKPEEVLLKNALKLWLMERSNDYFVLQRRRGYGEEGGG--GLTGLLVGTLDSVLDSTA
               10        20        30        40          50        

       60        70        80        90       100       110        
pF1KA0 RVAPYRILYQTPDSLVYWTIACGGSRKEITEHWEWLEQNLLQTLSIFENENDITTFVRGK
       .:::.:::.::::: :: .::::..:.:::.::.:::::...:::.:....:::.::.::
CCDS14 KVAPFRILHQTPDSQVYLSIACGANREEITKHWDWLEQNIMKTLSVFDSNEDITNFVQGK
       60        70        80        90       100       110        

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pF1KA0 IQGIIAEYNKINDVKEDDDTEKFKEAIVKFHRLFGMPEEEKLVNYYSCSYWKGKVPRQGW
       :.:.::: .:   .::::  :::.::..::.. ::.::.::::.:::::::::.:: :::
CCDS14 IRGLIAEEGKHCFAKEDDP-EKFREALLKFEKCFGLPEKEKLVTYYSCSYWKGRVPCQGW
      120       130        140       150       160       170       

      180       190       200       210       220       230        
pF1KA0 MYLSINHLCFYSFLMGREAKLVIRWVDITQLEKNATLLLPDVIKVSTRSSEHFFSVFLNI
       .::: : : :::::.: : ::.: : ....:::.....: . :.: ... .:.::.::.:
CCDS14 LYLSTNFLSFYSFLLGSEIKLIISWDEVSKLEKTSNVILTESIHVCSQGENHYFSMFLHI
       180       190       200       210       220       230       

      240       250       260       270       280       290        
pF1KA0 NETFKLMEQLANIAMRQLLDNEGFEQDRSLPKLKRKSPKKVSALKRDLDARAKSERYRAL
       :.:. ::::::: :.:.:.:.: :..:   : :   .: ...  :: :. ::.::.. :.
CCDS14 NQTYLLMEQLANYAIRRLFDKETFDND---PVL--YNPLQIT--KRGLENRAHSEQFNAF
       240       250       260            270         280       290

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pF1KA0 FRLPKDEKLDGHTDCTLWTPFNKMHILGQMFVSTNYICFTSKEENLCSLIIPLREVTIVE
       ::::: :.:    .: ::.::....  :.: .: :::::.:.. : ::.:::::::  ..
CCDS14 FRLPKGESLKEVHECFLWVPFSHFNTHGKMCISENYICFASQDGNQCSVIIPLREVLAID
              300       310       320       330       340       350

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pF1KA0 KADSSSVLPSPLSISTRNRMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQQTTSKIYSD--KEFAGSY
       :...::   . . :: ... .: : ..:: . :: ..  .   ..:  : :   :.: : 
CCDS14 KTNDSS---KSVIISIKGKTAFRFHEVKDFEQLVAKLR-LRCGAASTQYHDISTELAISS
                 360       370       380        390       400      

        420       430       440       450       460       470      
pF1KA0 NSSDDEVYSRPSSLVSSSPQRSTSSDADGERQFNLNGNSVPTATQTLMTMYRRRSPEEFN
       .:..     . .::.:   ::  :. ..               :..:::... .. : .:
CCDS14 ESTEPSDNFEVQSLTS---QRECSKTVN---------------TEALMTVFHPQNLETLN
        410       420          430                      440        

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pF1KA0 PKLAKEFLKEQAWKIHFAEYGQGICMYRTEKTRELVLKGIPESMRGELWLLLSGAINEKA
        :. :: .:::.::: ::: :.:. :.::.:::.::..::::..:::::.:.:::.:. :
CCDS14 SKMLKEKMKEQSWKILFAECGRGVSMFRTKKTRDLVVRGIPETLRGELWMLFSGAVNDMA
      450       460       470       480       490       500        

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pF1KA0 THPGYYEDLVEKSMGKYNLATEEIERDLHRSLPEHPAFQNEMGIAALRRVLTAYAFRNPN
       :.: :: ..::.:.:  :::::::::::.::::::::::.. ::.::::::::::.:::.
CCDS14 TNPDYYTEVVEQSLGTCNLATEEIERDLRRSLPEHPAFQSDTGISALRRVLTAYAYRNPK
      510       520       530       540       550       560        

        600       610       620       630       640       650      
pF1KA0 IGYCQAMNIVTSVLLLYAKEEEAFWLLVALCERMLPDYYNTRVVGALVDQGVFEELARDY
       :::::::::.:::::::::::::::::::.::::::::.: :..::::::.::::: ::.
CCDS14 IGYCQAMNILTSVLLLYAKEEEAFWLLVAVCERMLPDYFNRRIIGALVDQAVFEELIRDH
      570       580       590       600       610       620        

        660       670       680       690       700       710      
pF1KA0 VPQLYDCMQDLGVISTISLSWFLTLFLSVMPFESAVVVVDCFFYEGIKVIFQLALAVLDA
       .::: . : :.  .:..:::::::::.::.:.:::: :::::::.:::.:.::.::.:: 
CCDS14 LPQLTEHMTDMTFFSSVSLSWFLTLFISVLPIESAVNVVDCFFYDGIKAILQLGLAILDY
      630       640       650       660       670       680        

        720       730       740       750       760       770      
pF1KA0 NVDKLLNCKDDGEAMTVLGRYLDSVTNKDSTLPPIPHLHSLLSDDVEPYPEVDIFRLIRT
       :.::::.::::.::.:.:.:..:.:::::: ::   .  : .::.   . .:::  ::: 
CCDS14 NLDKLLTCKDDAEAVTALNRFFDNVTNKDSPLPSNVQQGSNVSDEKTSHTRVDITDLIRE
      690       700       710       720       730       740        

        780       790       800       810       820       830      
pF1KA0 SYEKFGTIRADLIEQMRFKQRLKVIQTLEDTTKRNVVRTIVTETSFTIDELEELYALFKA
       : ::.:.:: . :..:: ..:: ::::::.:::.::.:..  .......::.:::..:: 
CCDS14 SNEKYGNIRYEDIHSMRCRNRLYVIQTLEETTKQNVLRVVSQDVKLSLQELDELYVIFKK
      750       760       770       780       790       800        

        840       850       860       870       880       890      
pF1KA0 EHLTSCYWGGSSNALDRHDPSLPYLEQYRIDFEQFKGMFALLFPWACGTHSDVLASRLFQ
       : . ::::  .  .: .:::::::::::.:: .::.... :: ::: ....: ::   :.
CCDS14 ELFLSCYWCLGCPVLKHHDPSLPYLEQYQIDCQQFRALYHLLSPWAHSANKDSLALWTFR
      810       820       830       840       850       860        

        900       910       920       930           940       950  
pF1KA0 LLDENGDSLINFREFVSGLSAACHGDLTEKLKLLYKMHVLPE----PSSDQDEPDSAFEA
       :::::.: ::::.:: :...   .:..:::::::.:.:. :      :.: .. :   . 
CCDS14 LLDENSDCLINFKEFSSAIDIMYNGSFTEKLKLLFKLHIPPAYTEVKSKDASKGDELSKE
      870       880       890       900       910       920        

            960       970       980       990      1000      1010  
pF1KA0 TQYFFEDITPECTHVVGLDSRSKQGADDGFVTVSLKPDKGKRANSQENRNYLRLWTPENK
          .: ..     ::      :: . .    ... .:.:::  .. . . ::  :  :  
CCDS14 ELLYFSQL-----HV------SKPANEKEAESAKHSPEKGK--GKIDIQAYLSQWQDELF
      930                  940       950         960       970     

           1020      1030      1040      1050      1060      1070  
pF1KA0 SKSKNAKDLPKLNQGQFIELCKTMYNMFSEDPNEQELYHATAAVTSLLLEIGEVGKLFVA
       .: .: ::::..::.:::.. ::.::.: :::.:. ::.: :.::::::.. :::. .  
CCDS14 KKEENIKDLPRMNQSQFIQFSKTLYNLFHEDPEEESLYQAIAVVTSLLLRMEEVGRKL-H
         980       990      1000      1010      1020      1030     

           1080      1090      1100      1110      1120      1130  
pF1KA0 QPAKEGGSGGSGPSCHQGIPGVLFPKKGPGQPYVVESVEPLPASLAPDSEEHSLGGQMED
       .:.. ...: ::  : .: :                                        
CCDS14 SPTS-SAKGFSGTVCGSGGPSEEKTGSHLEKDPCSFREEPQWSFAFEQILASLLNEPALV
          1040      1050      1060      1070      1080      1090   

>>CCDS14523.1 TBC1D8B gene_id:54885|Hs108|chrX            (632 aa)
 initn: 2194 init1: 879 opt: 892  Z-score: 872.7  bits: 172.7 E(32554): 2.7e-42
Smith-Waterman score: 2291; 54.8% identity (80.2% similar) in 646 aa overlap (1-642:1-614)

               10          20        30        40        50        
pF1KA0 MWVNPEEVLLANAL--WITERANPYFILQRRKGHAGDGGGGGGLAGLLVGTLDVVLDSSA
       ::..:::::: :::  :. ::.: ::.::::.:.. .:::  ::.:::::::: ::::.:
CCDS14 MWLKPEEVLLKNALKLWLMERSNDYFVLQRRRGYGEEGGG--GLTGLLVGTLDSVLDSTA
               10        20        30        40          50        

       60        70        80        90       100       110        
pF1KA0 RVAPYRILYQTPDSLVYWTIACGGSRKEITEHWEWLEQNLLQTLSIFENENDITTFVRGK
       .:::.:::.::::: :: .::::..:.:::.::.:::::...:::.:....:::.::.::
CCDS14 KVAPFRILHQTPDSQVYLSIACGANREEITKHWDWLEQNIMKTLSVFDSNEDITNFVQGK
       60        70        80        90       100       110        

      120       130       140       150       160       170        
pF1KA0 IQGIIAEYNKINDVKEDDDTEKFKEAIVKFHRLFGMPEEEKLVNYYSCSYWKGKVPRQGW
       :.:.::: .:   .::::  :::.::..::.. ::.::.::::.:::::::::.:: :::
CCDS14 IRGLIAEEGKHCFAKEDDP-EKFREALLKFEKCFGLPEKEKLVTYYSCSYWKGRVPCQGW
      120       130        140       150       160       170       

      180       190       200       210       220       230        
pF1KA0 MYLSINHLCFYSFLMGREAKLVIRWVDITQLEKNATLLLPDVIKVSTRSSEHFFSVFLNI
       .::: : : :::::.: : ::.: : ....:::.....: . :.: ... .:.::.::.:
CCDS14 LYLSTNFLSFYSFLLGSEIKLIISWDEVSKLEKTSNVILTESIHVCSQGENHYFSMFLHI
       180       190       200       210       220       230       

      240       250       260       270       280       290        
pF1KA0 NETFKLMEQLANIAMRQLLDNEGFEQDRSLPKLKRKSPKKVSALKRDLDARAKSERYRAL
       :.:. ::::::: :.:.:.:.: :..:   : :   .: ...  :: :. ::.::.. :.
CCDS14 NQTYLLMEQLANYAIRRLFDKETFDND---PVLY--NPLQIT--KRGLENRAHSEQFNAF
       240       250       260            270         280       290

      300       310       320       330       340       350        
pF1KA0 FRLPKDEKLDGHTDCTLWTPFNKMHILGQMFVSTNYICFTSKEENLCSLIIPLREVTIVE
       ::::: :.:    .: ::.::....  :.: .: :::::.:.. : ::.:::::::  ..
CCDS14 FRLPKGESLKEVHECFLWVPFSHFNTHGKMCISENYICFASQDGNQCSVIIPLREVLAID
              300       310       320       330       340       350

      360       370       380       390       400         410      
pF1KA0 KADSSSVLPSPLSISTRNRMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQQTTSKIYSD--KEFAGSY
       :...::   . . :: ... .: : ..:: . :: ..  .   ..:  : :   :.: : 
CCDS14 KTNDSS---KSVIISIKGKTAFRFHEVKDFEQLVAKLR-LRCGAASTQYHDISTELAISS
                 360       370       380        390       400      

        420       430       440       450       460       470      
pF1KA0 NSSDDEVYSRPSSLVSSSPQRSTSSDADGERQFNLNGNSVPTATQTLMTMYRRRSPEEFN
       .:..     . .::.:   ::  :. ..               :..:::... .. : .:
CCDS14 ESTEPSDNFEVQSLTS---QRECSKTVN---------------TEALMTVFHPQNLETLN
        410       420          430                      440        

        480       490       500       510       520       530      
pF1KA0 PKLAKEFLKEQAWKIHFAEYGQGICMYRTEKTRELVLKGIPESMRGELWLLLSGAINEKA
        :. :: .:::.::: ::: :.:. :.::.:::.::..::::..:::::.:.:::.:. :
CCDS14 SKMLKEKMKEQSWKILFAECGRGVSMFRTKKTRDLVVRGIPETLRGELWMLFSGAVNDMA
      450       460       470       480       490       500        

        540       550       560       570       580       590      
pF1KA0 THPGYYEDLVEKSMGKYNLATEEIERDLHRSLPEHPAFQNEMGIAALRRVLTAYAFRNPN
       :.: :: ..::.:.:  :::::::::::.::::::::::.. ::.::::::::::.:::.
CCDS14 TNPDYYTEVVEQSLGTCNLATEEIERDLRRSLPEHPAFQSDTGISALRRVLTAYAYRNPK
      510       520       530       540       550       560        

        600       610       620       630       640       650      
pF1KA0 IGYCQAMNIVTSVLLLYAKEEEAFWLLVALCERMLPDYYNTRVVGALVDQGVFEELARDY
       :::::::::.:::::::::::::::::::.::::::::.: :..:.              
CCDS14 IGYCQAMNILTSVLLLYAKEEEAFWLLVAVCERMLPDYFNRRIIGSDDFMPLVRIQGQCV
      570       580       590       600       610       620        

        660       670       680       690       700       710      
pF1KA0 VPQLYDCMQDLGVISTISLSWFLTLFLSVMPFESAVVVVDCFFYEGIKVIFQLALAVLDA
                                                                   
CCDS14 IGEK                                                        
      630                                                          

>>CCDS14002.1 SGSM3 gene_id:27352|Hs108|chr22             (749 aa)
 initn: 315 init1: 205 opt: 589  Z-score: 576.0  bits: 118.0 E(32554): 9.2e-26
Smith-Waterman score: 589; 29.5% identity (61.6% similar) in 417 aa overlap (422-832:23-423)

             400       410       420       430       440       450 
pF1KA0 VQRISDFLQQTTSKIYSDKEFAGSYNSSDDEVYSRPSSLVSSSPQRSTSSDADGERQFNL
                                     :. .. ..   :. :     :  : : .. 
CCDS14         MSGSHTPACGPFSALTPSIWPQEILAKYTQKEESAEQPEFYYDEFGFRVYKE
                       10        20        30        40        50  

             460       470       480       490        500       510
pF1KA0 NGNSVPTATQTLMTMYRRRSPEEFNPKLAKEFLKEQAWKIHFAEYGQ-GICMYRTEKTRE
       .:.  : ..    .   . .:...  .   :: ...   .    . . .. . :.:: : 
CCDS14 EGDE-PGSSLLANSPLMEDAPQRLRWQAHLEFTHNH--DVGDLTWDKIAVSLPRSEKLRS
              60        70        80          90       100         

              520       530       540       550       560       570
pF1KA0 LVLKGIPESMRGELWLLLSGAINEKATHPGYYEDLVEKSMGKYNLATEEIERDLHRSLPE
       ::: :::..:: .::. ::::...: .    :...:..: .  ..:...::.:: :..: 
CCDS14 LVLAGIPHGMRPQLWMRLSGALQKKRNSELSYREIVKNSSNDETIAAKQIEKDLLRTMPS
     110       120       130       140       150       160         

                580       590       600       610       620        
pF1KA0 HPAFQN--EMGIAALRRVLTAYAFRNPNIGYCQAMNIVTSVLLLYAKEEEAFWLLVALCE
       .  : .   .:.  ::::: : :.  :.:::::. ..:.. :::. .::.:::.. :. :
CCDS14 NACFASMGSIGVPRLRRVLRALAWLYPEIGYCQGTGMVAACLLLFLEEEDAFWMMSAIIE
     170       180       190       200       210       220         

      630        640       650       660        670       680      
pF1KA0 RMLP-DYYNTRVVGALVDQGVFEELARDYVPQLYDCMQDLGV-ISTISLSWFLTLFLSVM
        .:: .:..: ..:. .:: :...:  .:.:.:   .:.  . .: :.: :::: : ::.
CCDS14 DLLPASYFSTTLLGVQTDQRVLRHLIVQYLPRLDKLLQEHDIELSLITLHWFLTAFASVV
     230       240       250       260       270       280         

        690       700       710       720       730       740      
pF1KA0 PFESAVVVVDCFFYEGIKVIFQLALAVLDANVDKLLNCKDDGEAMTVLGRYLDSVTNKDS
        ..  . . : ::::: .:.:::.:..:  . ..:.. ....  ...:.   ... . . 
CCDS14 DIKLLLRIWDLFFYEGSRVLFQLTLGMLHLKEEELIQSENSASIFNTLSDIPSQMEDAEL
     290       300       310       320       330       340         

        750       760        770       780       790       800     
pF1KA0 TLPPIPHLHSLLSD-DVEPYPEVDIFRLIRTSYEKFGTIRADLIEQMRFKQRLKVIQTLE
        :    .: . :.:  ::   .  .  ::  . . .:   :  . ..         :...
CCDS14 LLGVAMRLAGSLTDVAVETQRRKHLAYLIADQGQLLG---AGTLTNLS--------QVVR
     350       360       370       380          390                

         810       820       830       840       850       860     
pF1KA0 DTTKRNVVRTIVTETSFTIDELEELYALFKAEHLTSCYWGGSSNALDRHDPSLPYLEQYR
         :.:   .. .:   :  :.:: : :                                 
CCDS14 RRTQRR--KSTITALLFGEDDLEALKAKNIKQTELVADLREAILRVARHFQCTDPKNCSV
      400         410       420       430       440       450      

>>CCDS9534.2 GRTP1 gene_id:79774|Hs108|chr13              (336 aa)
 initn: 504 init1: 171 opt: 531  Z-score: 524.3  bits: 107.3 E(32554): 6.9e-23
Smith-Waterman score: 531; 34.8% identity (66.7% similar) in 267 aa overlap (467-722:15-278)

        440       450       460       470       480       490      
pF1KA0 RSTSSDADGERQFNLNGNSVPTATQTLMTMYRRRSPEEFNPKLAKEFLKEQAWK-----I
                                     :  . ::.:.    ..:..          :
CCDS95                 MQPAERSRVPRIDPYGFERPEDFDDAAYEKFFSSYLVTLTRRAI
                               10        20        30        40    

             500       510       520       530       540       550 
pF1KA0 HFAEYGQGICMYRTEKTRELVLKGIPESMRGELWLLLSGAINEKATHPGYYEDLVEKSMG
       ....  ::  . :.. ... : ::.:   :...:..::::  .   .::::..:..   :
CCDS95 KWSRLLQGGGVPRSRTVKRYVRKGVPLEHRARVWMVLSGAQAQMDQNPGYYHQLLQ---G
           50        60        70        80        90       100    

              560       570       580          590       600       
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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