Result of FASTA (ccds) for pF1KA0599
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0599, 1340 aa
  1>>>pF1KA0599 1340 - 1340 aa - 1340 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5082+/-0.000952; mu= 4.5999+/- 0.058
 mean_var=227.9600+/-45.594, 0's: 0 Z-trim(113.8): 98  B-trim: 163 in 1/52
 Lambda= 0.084946
 statistics sampled from 14271 (14369) to 14271 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.747), E-opt: 0.2 (0.441), width:  16
 Scan time:  5.400

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS76690.1 PLEKHG3 gene_id:26030|Hs108|chr14      (1219) 5004 627.1 9.2e-179
CCDS34552.1 PLEKHG1 gene_id:57480|Hs108|chr6       (1385) 1537 202.2 8.1e-51
CCDS33022.2 PLEKHG2 gene_id:64857|Hs108|chr19      (1386) 1128 152.1   1e-35
CCDS42754.1 ARHGEF4 gene_id:50649|Hs108|chr2       ( 670)  487 73.3 2.5e-12
CCDS2165.1 ARHGEF4 gene_id:50649|Hs108|chr2        ( 690)  487 73.3 2.5e-12
CCDS55430.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX       ( 463)  445 68.1 6.5e-11
CCDS83477.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX       ( 495)  441 67.6 9.6e-11
CCDS35315.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX       ( 516)  441 67.6   1e-10


>>CCDS76690.1 PLEKHG3 gene_id:26030|Hs108|chr14           (1219 aa)
 initn: 5004 init1: 5004 opt: 5004  Z-score: 3322.9  bits: 627.1 E(32554): 9.2e-179
Smith-Waterman score: 7853; 90.9% identity (90.9% similar) in 1340 aa overlap (1-1340:1-1219)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MPVSTSLHQDGSQERPVSLTSTTSSSGSSCDSRSAMEEPSSSEAPAKNGAGSLRSRHLPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MPVSTSLHQDGSQERPVSLTSTTSSSGSSCDSRSAMEEPSSSEAPAKNGAGSLRSRHLPN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 SNNNSSSWLNVKGPLSPFNSRAAAGPAHHKLSYLGRVVREIVETERMYVQDLRSIVEDYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SNNNSSSWLNVKGPLSPFNSRAAAGPAHHKLSYLGRVVREIVETERMYVQDLRSIVEDYL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 LKIIDTPGLLKPEQVSALFGNIENIYALNSQLLRDLDSCNSDPVAVASCFVERSQEFDIY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LKIIDTPGLLKPEQVSALFGNIENIYALNSQLLRDLDSCNSDPVAVASCFVERSQEFDIY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 TQYCNNYPNSVAALTECMRDKQQAKFFRDRQELLQHSLPLGSYLLKPVQRILKYHLLLQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 TQYCNNYPNSVAALTECMRDKQQAKFFRDRQELLQHSLPLGSYLLKPVQRILKYHLLLQE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 IAKHFDEEEDGFEVVEDAIDTMTCVAWYINDMKRRHEHAVRLQEIQSLLINWKGPDLTTY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 IAKHFDEEEDGFEVVEDAIDTMTCVAWYINDMKRRHEHAVRLQEIQSLLINWKGPDLTTY
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 GELVLEGTFRVHRVRNERTFFLFDKTLLITKKRGDHFVYKGNIPCSSLMLIESTRDSLCF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 GELVLEGTFRVHRVRNERTFFLFDKTLLITKKRGDHFVYKGNIPCSSLMLIESTRDSLCF
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 TVTHYKHSKQQYSIQAKTVEEKRNWTHHIKRLILENHHATIPQKAKEAILEMDSYYPNRY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 TVTHYKHSKQQYSIQAKTVEEKRNWTHHIKRLILENHHATIPQKAKEAILEMDSYYPNRY
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 RCSPERLKKAWSSQDEVSTNVRQGRRQSEPTKHLLRQLNEKARAAGMKHAGSAGTLLDFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::            
CCDS76 RCSPERLKKAWSSQDEVSTNVRQGRRQSEPTKHLLRQLNEKARAAGMK------------
              430       440       450       460                    

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 QPSRTRGLQPEAEGATQEEEEEEEEVVEEEEEEEEEEQAFQVSLEDLTGHEGNEKGAGPE
                                                                   
CCDS76 ------------------------------------------------------------
                                                                   

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 PPGSEEEEEEQEESLAVAEQVADFASSLLAALHCWHYRANALLFSRGAMGKGRRESESSR
                                                        :::::::::::
CCDS76 -------------------------------------------------GKGRRESESSR
                                                       470         

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 SSRRPSGRSPTSTEKRMSFESISSLPEVEPDPEAGSEQEVFSAVEGPSAEETPSDTESPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SSRRPSGRSPTSTEKRMSFESISSLPEVEPDPEAGSEQEVFSAVEGPSAEETPSDTESPE
     480       490       500       510       520       530         

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 VLETQLDAHQGLLGMDPPGDMVDFVAAESTEDLKALSSEEEEEMGGAAQEPESLLPPSVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VLETQLDAHQGLLGMDPPGDMVDFVAAESTEDLKALSSEEEEEMGGAAQEPESLLPPSVL
     540       550       560       570       580       590         

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 DQASVIAERFVSSFSRRSSVAQEDSKSSGFGSPRLVSRSSSVLSLEGSEKGLARHGSATD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 DQASVIAERFVSSFSRRSSVAQEDSKSSGFGSPRLVSRSSSVLSLEGSEKGLARHGSATD
     600       610       620       630       640       650         

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 SLSCQLSPEVDISVGVATEDSPSVNGMEPPSPGCPVEPDRSSCKKKESALSTRDRLLLDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SLSCQLSPEVDISVGVATEDSPSVNGMEPPSPGCPVEPDRSSCKKKESALSTRDRLLLDK
     660       670       680       690       700       710         

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 IKSYYENAEHHDAGFSVRRRESLSYIPKGLVRNSISRFNSLPRPDPEPVPPVGSKRQVGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 IKSYYENAEHHDAGFSVRRRESLSYIPKGLVRNSISRFNSLPRPDPEPVPPVGSKRQVGS
     720       730       740       750       760       770         

              910       920       930       940       950       960
pF1KA0 RPTSWALFELPGPSQAVKGDPPPISDAEFRPSSEIVKIWEGMESSGGSPGKGPGQGQANG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 RPTSWALFELPGPSQAVKGDPPPISDAEFRPSSEIVKIWEGMESSGGSPGKGPGQGQANG
     780       790       800       810       820       830         

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA0 FDLHEPLFILEEHELGAITEESATASPESSSPTEGRSPAHLARELKELVKELSSSTQGEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 FDLHEPLFILEEHELGAITEESATASPESSSPTEGRSPAHLARELKELVKELSSSTQGEL
     840       850       860       870       880       890         

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA0 VAPLHPRIVQLSHVMDSHVSERVKNKVYQLARQYSLRIKSNKPVMARPPLQWEKVAPERD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VAPLHPRIVQLSHVMDSHVSERVKNKVYQLARQYSLRIKSNKPVMARPPLQWEKVAPERD
     900       910       920       930       940       950         

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA0 GKSPTVPCLQEEAGEPLGGKGKRKPVLSLFDYEQLMAQEHSPPKPSSAGEMSPQRFFFNP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 GKSPTVPCLQEEAGEPLGGKGKRKPVLSLFDYEQLMAQEHSPPKPSSAGEMSPQRFFFNP
     960       970       980       990      1000      1010         

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KA0 SAVSQRTTSPGGRPSAWSPLSPTETFSWPDVRELCSKYASRDEARRAGGGRPRGPPVNRS
       :::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SAVSQRTTSPGGRPSARSPLSPTETFSWPDVRELCSKYASRDEARRAGGGRPRGPPVNRS
    1020      1030      1040      1050      1060      1070         

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KA0 HSVPENMVEPPLSGRVGRCRSLSTKRGRGGGEAAQSPGPLPQSKPDGGETLYVTADLTLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 HSVPENMVEPPLSGRVGRCRSLSTKRGRGGGEAAQSPGPLPQSKPDGGETLYVTADLTLE
    1080      1090      1100      1110      1120      1130         

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KA0 DNRRVIVMEKGPLPSPTAGLEESSGQGPSSPVALLGQVQDFQQSAECQPKEEGSRDPADP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 DNRRVIVMEKGPLPSPTAGLEESSGQGPSSPVALLGQVQDFQQSAECQPKEEGSRDPADP
    1140      1150      1160      1170      1180      1190         

             1330      1340
pF1KA0 SQQGRVRNLREKFQALNSVG
       ::::::::::::::::::::
CCDS76 SQQGRVRNLREKFQALNSVG
    1200      1210         

>>CCDS34552.1 PLEKHG1 gene_id:57480|Hs108|chr6            (1385 aa)
 initn: 1816 init1: 1114 opt: 1537  Z-score: 1025.8  bits: 202.2 E(32554): 8.1e-51
Smith-Waterman score: 1633; 32.2% identity (57.9% similar) in 1342 aa overlap (14-1278:7-1262)

               10        20        30            40                
pF1KA0 MPVSTSLHQDGSQERPVSLTSTTSSSGSSCDSR----SAMEEPSSSEA------------
                    .::::. :: :::.:: ::.    : :   :.:.             
CCDS34        MELSDSDRPVSFGST-SSSASSRDSHGSFGSRMTLVSNSHMGLFNQDKEVGAI
                      10         20        30        40        50  

                50        60        70        80               90  
pF1KA0 -----PAKNGAGSLRSRHLPNSNNNSSSWLNVKGPLSPFNSRAAAGP-------AHHKLS
            ::.  ..:  .:  : .......  . . : . .   . ..:       .  :: 
CCDS34 KLELIPARPFSSSELQRDNPATGQQNADEGSERPPRAQWRVDSNGAPKTIADSATSPKLL
             60        70        80        90       100       110  

            100       110       120        130       140       150 
pF1KA0 YLGRVVREIVETERMYVQDLRSIVEDYLLKIIDTPGL-LKPEQVSALFGNIENIYALNSQ
       :. :::.::.:::: :::::.:::::::  : :   : :  :. :::::::..:: .::.
CCDS34 YVDRVVQEILETERTYVQDLKSIVEDYLDCIRDQTKLPLGTEERSALFGNIQDIYHFNSE
            120       130       140       150       160       170  

             160       170       180       190       200       210 
pF1KA0 LLRDLDSCNSDPVAVASCFVERSQEFDIYTQYCNNYPNSVAALTECMRDKQQAKFFRDRQ
       ::.::..:..::::.: ::: .:.:: ::::::.::: :::.::::::.:  :::::.::
CCDS34 LLQDLENCENDPVAIAECFVSKSEEFHIYTQYCTNYPRSVAVLTECMRNKILAKFFRERQ
            180       190       200       210       220       230  

             220       230       240       250       260       270 
pF1KA0 ELLQHSLPLGSYLLKPVQRILKYHLLLQEIAKHFDEEEDGFEVVEDAIDTMTCVAWYIND
       : :.:::::::::::::::::::::::.:: .:.:.. .:..:: ::::::  :::.:::
CCDS34 ETLKHSLPLGSYLLKPVQRILKYHLLLHEIENHLDKDTEGYDVVLDAIDTMQRVAWHIND
            240       250       260       270       280       290  

             280       290       300       310       320       330 
pF1KA0 MKRRHEHAVRLQEIQSLLINWKGPDLTTYGELVLEGTFRVHRVRNERTFFLFDKTLLITK
       :::.:::::::::::::: ::::::::.:::::::::::..:..::::.::::: :::::
CCDS34 MKRKHEHAVRLQEIQSLLTNWKGPDLTSYGELVLEGTFRIQRAKNERTLFLFDKLLLITK
            300       310       320       330       340       350  

             340       350        360       370       380       390
pF1KA0 KRGDHFVYKGNIPCSSLMLIEST-RDSLCFTVTHYKHSKQQYSIQAKTVEEKRNWTHHIK
       :: : :.::..: :..:::.:   .. : :.: :::. : :...:::. ..:: :. :.:
CCDS34 KRDDTFTYKAHILCGNLMLVEVIPKEPLSFSVFHYKNPKLQHTVQAKSQQDKRLWVLHLK
            360       370       380       390       400       410  

              400       410       420       430       440       450
pF1KA0 RLILENHHATIPQKAKEAILEMDSYYPNRYRCSPERLKKAWSSQDEVSTNVRQGRRQSEP
       ::::::: : :: :::.::::::. .   .  :::   ::  .. : :.  :  ::.:::
CCDS34 RLILENHAAKIPAKAKQAILEMDAIHHPGFCYSPEGGTKALFGSKEGSAPYRL-RRKSEP
            420       430       440       450       460        470 

              460       470         480        490                 
pF1KA0 TKHLLRQLNEKARAAGMKHAGSA-GT-LLDFGQPSRT-RGLQP---------EAEGATQE
       ...  . :. .  :  .....   :.  :. ..:: . :. ::         .: :: ..
CCDS34 SSRSHKVLKTSETAQDIQKVSREEGSPQLSSARPSPAQRNSQPSSSTMISVLRAGGALRN
             480       490       500       510       520       530 

        500              510       520         530       540       
pF1KA0 --EEEEEEEVV-------EEEEEEEEEEQAF--QVSLEDLTGHEGNEKGAGPEPPGSEEE
          ... ....       .:.:..:.. : :  . :  ::.. .  : ... .: . .  
CCDS34 IWTDHQIRQALFPSRRSPQENEDDEDDYQMFVPSFSSSDLNSTRLCEDSTSSRPCSWHMG
             540       550       560       570       580       590 

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pF1KA0 EEEQEESLAVAEQVADFASSLLAALHCWHYRANALLFSRGAMGKGRRESESSRSSRRPSG
       . :. :. . .....  :::   .  :              .: . :  : . : .  . 
CCDS34 QMESTETSSSGHRIVRRASSAGESNTC-----------PPEIGTSDRTRELQNSPKTEGQ
             600       610                  620       630       640

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pF1KA0 R--SPTSTEKRMSFESISSLPE---VEPDPEAGSEQEVFSAVEGPSAEETPSDTESPEVL
       .  .: ..  ......:. . .    :      ...:   .. . ::...     .::. 
CCDS34 EEMTPFGSSIELTIDDIDHVYDNISYEDLKLMVAKREEAESTPSKSARDSVRPKSTPELA
              650       660       670       680       690       700

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pF1KA0 ETQLDA-H-QGLLGMDPPGDMVDFVAA-ESTEDLKALSSEEEEEMGGAAQEPESLLPPSV
        :. .: : .: :  .  : .    :. .::..:.:.    ::..  .   :.   :::.
CCDS34 FTKRQAGHSKGSLYAQTDGTLSGGEASSQSTHELQAV----EENIYDTIGLPD---PPSL
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pF1KA0 LDQASVIAERFVSSFSRRSSVAQEDSKSSGFGSPR-LVSRSSSVLSLEGSEKGLARHGSA
         . : . .      ..::.    ..      : : .::..    ::. ::     : ..
CCDS34 GFKCSSLKR------AKRSTFLGLEADFVCCDSLRPFVSQD----SLQLSEDEAPYHQAT
           760             770       780           790       800   

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pF1KA0 TDSLSCQLSPEVDISVGVATEDSPSVNGMEPPSPGCPVEPDRSSCKKKESALSTRDRLLL
        :    .:             :::: :   : .:      :. : .  :         . 
CCDS34 PDHGYLSL-----------LYDSPSGNLSMPHKP----VSDKLSEEVDE---------IW
           810                  820           830                  

      840       850       860       870       880       890        
pF1KA0 DKIKSYYENAEHHDAGFSVRRRESLSYIPKGLVRNSISRFNSLPRPDPEPVPPVGSKRQV
       . ...: .. : .       : . :. .:       .:. .   :   : .: ..  :.:
CCDS34 NDLENYIKKNEDKA------RDRLLAAFP-------VSKDDVPDRLHAESTPELS--RDV
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pF1KA0 GSRPTSWALFELPGPSQAVKGDPPPISDAEFRPSSEIVKIWEGMESSGGSPGKGPGQGQA
       :   .. .: :    :::.     :...   : :     . : . :. ::  .    . :
CCDS34 GRSVSTLSLPE----SQALL---TPVKSRAGRASRANCPFEEDLISKEGSFMSLNRLSLA
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pF1KA0 NGFDLHEPLFILEEHELGAITEESATASPESSSPTEGRSPAHLARELKELVKELSSSTQG
       . . : .  . : .  :.    :.   . :... :..:    .::. .. .:. ..  . 
CCDS34 SEMPLMDNPYDLANSGLSQTDPENPDLGMEATDKTKSRV-FMMARQYSQKIKKANQLLKV
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pF1KA0 ELVAPLHPRIVQLSHVMDSHVSERVKNKVYQLARQYSLRIKSNKPVMARPPLQWEKVAPE
       . .   .:   : .. : . ..  ...:  : .   . ::   . .. .  ..   .  .
CCDS34 KSLELEQPPASQHQKSMHKDLAAILEEK-KQGGPAIGARIAEYSQLYDQIVFRESPLKIQ
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pF1KA0 RDG-KSPTVPCLQEEAGEPLGGKGKRKPVLSLFDYEQLMAQEHSPPKPSSAGEMSPQRFF
       .::  ::    : . ..     .:.   .:     .  .:.   ::. .  ... :  : 
CCDS34 KDGWASPQESSLLRSVSPSQVHHGSGDWLLHSTYSNGELADFCLPPEQDLRSRY-PT-FE
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pF1KA0 FNPSAVSQRTTSPGGRPSAWS--PLSPTE-----TFSWPDVRELCSKYASRDEARRAGGG
       .: ... .. ..  . ::  .  ::  .      . : :. .. :. .   . .:.  : 
CCDS34 INTKSTPRQLSAACSVPSLQTSDPLPGSVQRCSVVVSQPNKENWCQDHLYNSLGRK--GI
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pF1KA0 RPRGPPVNRSHSVPENMVEPPLSG-----RVGRCRSLSTKRGRGGGEAAQSPGP-LPQSK
         .. : .::.:    ...  ...      ::. . :: .:. .  :. :.  : . .:.
CCDS34 SAKSQPYHRSQSSSSVLINKSMDSINYPSDVGKQQLLSLHRS-SRCESHQDLLPDIADSH
            1180      1190      1200      1210       1220      1230

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pF1KA0 PDGGETLYVTADLTLEDNRRVIVMEKG-PLPSPTAGLEESSGQGPSSPVALLGQVQDFQQ
        .: : :   .::::.:...:.:.... :: .  :                         
CCDS34 QQGTEKL---SDLTLQDSQKVVVVNRNLPLNAQIATQNYFSNFKETDGDEDDYVEIKSEE
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pF1KA0 SAECQPKEEGSRDPADPSQQGRVRNLREKFQALNSVG                       
                                                                   
CCDS34 DESELELSHNRRRKSDSKFVDADFSDNVCSGNTLHSLNSPRTPKKPVNSKLGLSPYLTPY
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>>CCDS33022.2 PLEKHG2 gene_id:64857|Hs108|chr19           (1386 aa)
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pF1KA0   MPVSTSLHQDGSQERPVSLTSTTSSSGSSCDSRSAMEEPSSSEAPAKNGAGSLRSRHL
                                   :. :..:.:   :..    .  :.::  :   
CCDS33 MPEGAQGLSLSKPSPSLGCGRRGEVCDCGTVCETRTA---PAAPTMASPRGSGSSTSLST
               10        20        30           40        50       

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pF1KA0 ----------PNSNNNSSSWLNVKGPLSPFNSRAAAGPAHHKLSYLGRVVREIVETERMY
                 :.   ..:    . ::   ..   .. :.  . : : ::.:::::::: :
CCDS33 VGSEGDPAPGPTPACSASRPEPLPGPPIRLHLSPVGIPGSARPSRLERVAREIVETERAY
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pF1KA0 VQDLRSIVEDYLLKIIDTPGL-LKPEQVSALFGNIENIYALNSQLLRDLDSCNSDPVAVA
       :.::::::::::  ..:   : :. :::..::.:::.:: ..:.::.::.. .:.  ..:
CCDS33 VRDLRSIVEDYLGPLLDGGVLGLSVEQVGTLFANIEDIYEFSSELLEDLEN-SSSAGGIA
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pF1KA0 SCFVERSQEFDIYTQYCNNYPNSVAALTECMRDKQQAKFFRDRQELLQHSLPLGSYLLKP
        :::.::..::::: :: :::.:.: : :   .   : ....::  :.::::: :.::::
CCDS33 ECFVQRSEDFDIYTLYCMNYPSSLALLRELSLSPPAALWLQERQAQLRHSLPLQSFLLKP
        180       190       200       210       220       230      

       230       240       250         260       270       280     
pF1KA0 VQRILKYHLLLQEIAKHFDEEED--GFEVVEDAIDTMTCVAWYINDMKRRHEHAVRLQEI
       :::::::::::::..::. :     : :.::.:: .:: ::::::::::..:::.::::.
CCDS33 VQRILKYHLLLQELGKHWAEGPGTGGREMVEEAIVSMTAVAWYINDMKRKQEHAARLQEV
        240       250       260       270       280       290      

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pF1KA0 QSLLINWKGPDLTTYGELVLEGTFRVH-----RVRN-ERTFFLFDKTLLITKKRGDHFVY
       :  : .: ::.:...:::::::.::       :.:. :: .:::.. ::..:.:: ...:
CCDS33 QRRLGGWTGPELSAFGELVLEGAFRGGGGGGPRLRGGERLLFLFSRMLLVAKRRGLEYTY
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     340       350       360       370       380       390         
pF1KA0 KGNIPCSSLMLIESTRDSLCFTVTHYKHSKQQYSIQAKTVEEKRNWTHHIKRLILENHHA
       ::.: : .: . :: :: : : :.     :... .:::. :::: : : ..::..::: :
CCDS33 KGHIFCCNLSVSESPRDPLGFKVSDLTIPKHRHLLQAKNQEEKRLWIHCLQRLFFENHPA
        360       370       380       390       400       410      

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pF1KA0 TIPQKAKEAILE-------------------MDSYYPNRYRC-SPERLKKAWSSQDEVST
       .:: :::...::                   . :  :   :  .: : . : :    :  
CCDS33 SIPAKAKQVLLENSLHCAPKSKPVLEPLTPPLGSPRPRDARSFTPGRRNTAPSPGPSV--
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pF1KA0 NVRQGRRQSEPTKHLLRQLNEKARAAGMKHAGSAGTLLD-FGQPSRTRGLQPEA-EGATQ
        .:.:::::::.:    .. ..:.  :.::::: : :    .::  . .  ::  : :  
CCDS33 -IRRGRRQSEPVKDPYVMFPQNAKP-GFKHAGSEGELYPPESQPPVSGSAPPEDLEDAGP
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pF1KA0 EEEEEEEEVVEEEEEEEEEEQAFQ---VSLEDLTGHEGNEKGAGPEP-------PG--SE
          .     . ::  :  ......    : .:.    :. .  :          :.  : 
CCDS33 PTLDPSGTSITEEILELLNQRGLRDPGPSTHDIPKFPGDSQVPGDSETLTFQALPSRDSS
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pF1KA0 EEEEEQEESLAVAEQVADFASSLLAALHCWHYRANALLFSRGAMGKGRRESESSRSSRR-
       :::::.::.: . :.    . : : .:.  .    : . :   . :     .  .   : 
CCDS33 EEEEEEEEGLEMDER----GPSPLHVLEGLESSIAAEMPSIPCLTKIPDVPNLPEIPSRC
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             610       620         630       640         650       
pF1KA0 --PSG-RSPTSTEKRMSFE--SISSLPEVEPDPEAGSEQEVF--SAVEGPSAEETPSDTE
         : : : :. ..    ::   . ..: :   :  .:   .   : ..::  : . . . 
CCDS33 EIPEGSRLPSLSDISDVFEMPCLPAIPSVPNTPSLSSTPTLSCDSWLQGPLQEPAEAPAT
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pF1KA0 SPEVLETQLDAHQGLLGMDPPGDMVDFVAAESTEDLKALSSEEEEEMGGAAQEPESLLPP
         :..     .. : ::  : :              ::   :.:: .. .  .:...   
CCDS33 RRELFS---GSNPGKLGEPPSGG-------------KAGPEEDEEGVSFTDFQPQDVTQH
      710          720                    730       740       750  

       720       730        740       750       760       770      
pF1KA0 SVLDQASVIAERFVSSF-SRRSSVAQEDSKSSGFGSPRLVSRSSSVLSLEGSEKGLARHG
       . . .   .: :  : . :  ... : .    ::  : :. ..:.. .  :: :. :  .
CCDS33 QGFPDE--LAFRSCSEIRSAWQALEQGQLARPGFPEPLLILEDSDLGGDSGSGKAGAPSS
              760       770       780       790       800       810

        780       790       800       810        820           830 
pF1KA0 SATDSLSCQLSPEVDISVGVATEDSPSVNGMEPPS-PGCPVEPDRSSCKKKESA----LS
         : :   .:.   .  .    .    ...  :   :   ..:. : :  .:.:    : 
CCDS33 ERTASRVRELARLYSERIQQMQRAETRASANAPRRRPRVLAQPQPSPCLPQEQAEPGLLP
              820       830       840       850       860       870

             840       850        860       870        880         
pF1KA0 TRDRLLLDKIKSYYENAEHH-DAGFSVRRRESLSYIPKGLVRNSIS-RFNSLPRPDPEPV
       .  ..:. ..      :..    : .:  . ..    .:   .. . . ..::. :   .
CCDS33 AFGHVLVCELAFPLTCAQESVPLGPAVWVQAAIPLSKQGGSPDGQGLHVSNLPKQDLPGI
              880       890       900       910       920       930

             890       900       910       920          930        
pF1KA0 --------PPVGSKRQVGSRPTSWALFELPGPSQAVKGDPPPISDA---EFR-P-SSEIV
               :  :..:.: . :..  : .  :: .        .::    :.. : .. . 
CCDS33 HVSAATLLPEQGGSRHVQA-PAATPLPKQEGPLHLQVPALTTFSDQGHPEIQVPATTPLP
              940        950       960       970       980         

        940       950       960       970        980       990     
pF1KA0 KIWEGMESSGGSPGKGPGQGQANGFDLHEPLFILEEHELGA-ITEESATASPESSSPTEG
       .    :   . : .  : ::.    :.: :      .:. . .:   .:  :.. .  ..
CCDS33 EHRSHMVIPAPSTAFCPEQGHCA--DIHVPTTPALPKEICSDFTVSVTTPVPKQEGHLDS
     990      1000      1010        1020      1030      1040       

        1000                    1010             1020      1030    
pF1KA0 RSPAHL-------ARELK-------ELVKELS---SSTQ----GELVAPLHPRIVQLS--
       .::...       .:...       . .. ::   :: .    :. . ::  .. .:.  
CCDS33 ESPTNIPLTKQGGSRDVQGPDPVCSQPIQPLSWHGSSLDPQGPGDTLPPLPCHLPDLQIP
      1050      1060      1070      1080      1090      1100       

                1040       1050       1060      1070           1080
pF1KA0 -----HVMDSHVSERVK-NKVYQLARQY-SLRIKSNKPVMARPPLQ---WEKVAPE--RD
             .  ::...:.  :   .:...  . .. .. : .  : .    : .. :   ..
CCDS33 GTSPLPAHGSHLDHRIPANAPLSLSQELPDTQVPATTP-LPLPQVLTDIWVQALPTSPKQ
      1110      1120      1130      1140       1150      1160      

               1090      1100      1110      1120         1130     
pF1KA0 GKSPTV--PCLQEEAGEPLGGKGKRKPVLSLFDYEQLMAQEHSP---PKPSSAGEMSPQR
       :. : .  :       ::     . . .   .. ..:. . : :   : :  .: .. : 
CCDS33 GSLPDIQGPAAAPPLPEPSLTDTQVQKLTPSLEQKSLI-DAHVPAATPLPERGGSLDIQG
       1170      1180      1190      1200       1210      1220     

        1140      1150            1160             1170            
pF1KA0 FFFNPSAVSQRTTSPGGRPSAW------SPLSPTET-------FSWPDV----RELCSKY
       .  .:  ...  ..:::  ..       : :.: ..       .  :..    : : ..:
CCDS33 LSPTPVQTTMVLSKPGGSLASHVARLESSDLTPPHSPPPSSRQLLGPNAAALSRYLAASY
        1230      1240      1250      1260      1270      1280     

     1180        1190             1200       1210      1220        
pF1KA0 ASRDEARRAG--GGRP---RGP----PVNRSHSVP-ENMVEPPLSGRVGRCRSLSTKRGR
        :.. ::: :  :: :   ::     :..:. : : . .  :: . :..   ... . : 
CCDS33 ISQSLARRQGPGGGAPAASRGSWSSAPTSRASSPPPQPQPPPPPARRLSYATTVNIHVGG
        1290      1300      1310      1320      1330      1340     

     1230      1240      1250      1260      1270      1280        
pF1KA0 GGGEAAQSPGPLPQSKPDGGETLYVTADLTLEDNRRVIVMEKGPLPSPTAGLEESSGQGP
       ::                                                          
CCDS33 GGRLRPAKAQVRLNHPALLASTQESMGLHRAQGAPDAPFHM                   
        1350      1360      1370      1380                         

>>CCDS42754.1 ARHGEF4 gene_id:50649|Hs108|chr2            (670 aa)
 initn: 463 init1: 185 opt: 487  Z-score: 334.9  bits: 73.3 E(32554): 2.5e-12
Smith-Waterman score: 504; 29.8% identity (58.9% similar) in 406 aa overlap (74-454:263-651)

            50        60        70        80        90          100
pF1KA0 APAKNGAGSLRSRHLPNSNNNSSSWLNVKGPLSPFNSRAAAGPAHHKLS---YLGRVVRE
                                     ::.  :: :  : :. . :   .   :. :
CCDS42 WGRVADGEGWFPASFVRLRVNQDEPADDDAPLAG-NSGAEDGGAEAQSSKDQMRTNVINE
            240       250       260        270       280       290 

              110       120       130       140       150          
pF1KA0 IVETERMYVQDLRSIVEDYLLKIIDTPGLLKPEQVSALFGNIENIYALNSQLLRDLDS-C
       :. ::: :.. ::.: : :. .      ... ::. ..:::::.::  .. ... :..  
CCDS42 ILSTERDYIKHLRDICEGYVRQCRKRADMFSEEQLRTIFGNIEDIYRCQKAFVKALEQRF
             300       310       320       330       340       350 

     160          170       180       190       200       210      
pF1KA0 NSD-P--VAVASCFVERSQEFDIYTQYCNNYPNSVAALTECMRDKQQAKFFRDRQELLQH
       : . :    ...::.:.. .:.::..::::.::. . :..  . .. . :: .  .:::.
CCDS42 NRERPHLSELGACFLEHQADFQIYSEYCNNHPNACVELSRLTKLSKYVYFF-EACRLLQK
             360       370       380       390       400        410

          220       230       240       250       260       270    
pF1KA0 --SLPLGSYLLKPVQRILKYHLLLQEIAKHFDEEEDGFEVVEDAIDTMTCVAWYINDMKR
         .. : ..:: :::.: :: : : :. :.   ..  :. :: :. .:  ::  ::. ::
CCDS42 MIDISLDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTHPQHRDFKDVEAALHAMKNVAQLINERKR
              420       430       440       450       460       470

          280       290       300         310          320         
pF1KA0 RHEHAVRLQEIQSLLINWKGPDLTTYG-ELVLEGTF-RVHRVR---NERTFFLFDKTLLI
       : :.  .. . :: . .:.: :: . . ::.  : . :: . .   ..: :::::. :. 
CCDS42 RLENIDKIAQWQSSIEDWEGEDLLVRSSELIYSGELTRVTQPQAKSQQRMFFLFDHQLIY
              480       490       500       510       520       530

     330          340       350          360            370        
pF1KA0 TKK---RGDHFVYKGNIPCSSLMLI--ESTRD-SLCFTVT-----HYKHSKQQYSIQAKT
        ::   : : . ::: .  ..: ..  :. .: .:  ..      :   . ... . .. 
CCDS42 CKKDLLRRDVLYYKGRLDMDGLEVVDLEDGKDRDLHVSIKNAFRLHRGATGDSHLLCTRK
              540       550       560       570       580       590

      380       390       400       410       420       430        
pF1KA0 VEEKRNWTHHIKRLILENHHATIPQKAKEAILEMDSYYPNRYRCSPERLKKAWSSQDEVS
        :.:. :   .: .  : ... . :..  .: :.            .: .   ... .  
CCDS42 PEQKQRW---LKAFAREREQVQLDQETGFSITEL------------QRKQAMLNASKQQV
                 600       610       620                   630     

      440       450       460       470       480       490        
pF1KA0 TNVRQGRRQSEPTKHLLRQLNEKARAAGMKHAGSAGTLLDFGQPSRTRGLQPEAEGATQE
       :.  .::: . :  .:                                            
CCDS42 TGKPKGRRTAAPPPRLPGPYPADIIPFSEPQSQAS                         
         640       650       660       670                         

>>CCDS2165.1 ARHGEF4 gene_id:50649|Hs108|chr2             (690 aa)
 initn: 463 init1: 185 opt: 487  Z-score: 334.7  bits: 73.3 E(32554): 2.5e-12
Smith-Waterman score: 501; 31.3% identity (61.0% similar) in 364 aa overlap (74-412:263-621)

            50        60        70        80        90          100
pF1KA0 APAKNGAGSLRSRHLPNSNNNSSSWLNVKGPLSPFNSRAAAGPAHHKLS---YLGRVVRE
                                     ::.  :: :  : :. . :   .   :. :
CCDS21 WGRVADGEGWFPASFVRLRVNQDEPADDDAPLAG-NSGAEDGGAEAQSSKDQMRTNVINE
            240       250       260        270       280       290 

              110       120       130       140       150          
pF1KA0 IVETERMYVQDLRSIVEDYLLKIIDTPGLLKPEQVSALFGNIENIYALNSQLLRDLDS-C
       :. ::: :.. ::.: : :. .      ... ::. ..:::::.::  .. ... :..  
CCDS21 ILSTERDYIKHLRDICEGYVRQCRKRADMFSEEQLRTIFGNIEDIYRCQKAFVKALEQRF
             300       310       320       330       340       350 

     160          170       180       190       200       210      
pF1KA0 NSD-P--VAVASCFVERSQEFDIYTQYCNNYPNSVAALTECMRDKQQAKFFRDRQELLQH
       : . :    ...::.:.. .:.::..::::.::. . :..  . .. . :: .  .:::.
CCDS21 NRERPHLSELGACFLEHQADFQIYSEYCNNHPNACVELSRLTKLSKYVYFF-EACRLLQK
             360       370       380       390       400        410

          220       230       240       250       260       270    
pF1KA0 --SLPLGSYLLKPVQRILKYHLLLQEIAKHFDEEEDGFEVVEDAIDTMTCVAWYINDMKR
         .. : ..:: :::.: :: : : :. :.   ..  :. :: :. .:  ::  ::. ::
CCDS21 MIDISLDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTHPQHRDFKDVEAALHAMKNVAQLINERKR
              420       430       440       450       460       470

          280       290       300         310          320         
pF1KA0 RHEHAVRLQEIQSLLINWKGPDLTTYG-ELVLEGTF-RVHRVR---NERTFFLFDKTLLI
       : :.  .. . :: . .:.: :: . . ::.  : . :: . .   ..: :::::. :. 
CCDS21 RLENIDKIAQWQSSIEDWEGEDLLVRSSELIYSGELTRVTQPQAKSQQRMFFLFDHQLIY
              480       490       500       510       520       530

     330          340       350          360            370        
pF1KA0 TKK---RGDHFVYKGNIPCSSLMLI--ESTRD-SLCFTVT-----HYKHSKQQYSIQAKT
        ::   : : . ::: .  ..: ..  :. .: .:  ..      :   . ... . .. 
CCDS21 CKKDLLRRDVLYYKGRLDMDGLEVVDLEDGKDRDLHVSIKNAFRLHRGATGDSHLLCTRK
              540       550       560       570       580       590

      380       390       400       410       420       430        
pF1KA0 VEEKRNWTHHIKRLILENHHATIPQKAKEAILEMDSYYPNRYRCSPERLKKAWSSQDEVS
        :.:. :   .: .  : ... . :..  .: :.                          
CCDS21 PEQKQRW---LKAFAREREQVQLDQETGFSITELQRKQAMLNASKQQVTGKPKAVGRPCY
                 600       610       620       630       640       

      440       450       460       470       480       490        
pF1KA0 TNVRQGRRQSEPTKHLLRQLNEKARAAGMKHAGSAGTLLDFGQPSRTRGLQPEAEGATQE
                                                                   
CCDS21 LTRQKHPALPSNRPQQQVLVLAEPRRKPSTFWHSISRLAPFRK                 
       650       660       670       680       690                 

>>CCDS55430.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX            (463 aa)
 initn: 407 init1: 145 opt: 445  Z-score: 309.4  bits: 68.1 E(32554): 6.5e-11
Smith-Waterman score: 533; 31.1% identity (62.5% similar) in 363 aa overlap (47-385:5-363)

         20        30        40        50        60        70      
pF1KA0 VSLTSTTSSSGSSCDSRSAMEEPSSSEAPAKNGAGSLRSRHLPNSNNNSSSWLNVKGPLS
                                     ..:.: :   .  . ... :.  :  : :.
CCDS55                           MQWIRGGSGMLWVNQEDEVEEGPSDVQN--GHLD
                                         10        20          30  

         80         90       100       110       120       130     
pF1KA0 PFNSRAAAG-PAHHKLSYLGRVVREIVETERMYVQDLRSIVEDYLLKIIDTPGLLKPEQV
       : ..    : : ... .. . :. ::. ::: :.. :..: : :: .      ... ::.
CCDS55 PNSDCLCLGRPLQNRDQMRANVINEIMSTERHYIKHLKDICEGYLKQCRKRRDMFSDEQL
             40        50        60        70        80        90  

         140       150         160         170       180       190 
pF1KA0 SALFGNIENIYALNSQLLRDLDS--CNSDP--VAVASCFVERSQEFDIYTQYCNNYPNSV
       ...:::::.:: ..  ..:::..   :.::    .. ::.:... : ::..::::. .. 
CCDS55 KVIFGNIEDIYRFQMGFVRDLEKQYNNDDPHLSEIGPCFLEHQDGFWIYSEYCNNHLDAC
            100       110       120       130       140       150  

             200       210         220       230       240         
pF1KA0 AALTECMRDKQQAKFFRDRQELLQH--SLPLGSYLLKPVQRILKYHLLLQEIAKHFDEEE
         :.. :.:..  .:: .  .:::.  .. . ..:: :::.: :: : : :. :.  ...
CCDS55 MELSKLMKDSRYQHFF-EACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTAQDH
            160        170       180       190       200       210 

     250       260       270       280       290        300        
pF1KA0 DGFEVVEDAIDTMTCVAWYINDMKRRHEHAVRLQEIQSLLINWKGPD-LTTYGELVLEGT
       . .. :  :. .:  :.  ::. ::: :.  .. . :. ...:.: : :   .::.  : 
CCDS55 SDYRYVAAALAVMRNVTQQINERKRRLENIDKIAQWQASVLDWEGEDILDRSSELIYTGE
             220       230       240       250       260       270 

          310       320       330          340       350           
pF1KA0 ----FRVHRVRNERTFFLFDKTLLITKK---RGDHFVYKGNIPCSSLML--IESTRDSLC
           .. .   ..:.:::::. ... ::   : : . ::: :  ..  .  ::. ::.  
CCDS55 MAWIYQPYGRNQQRVFFLFDHQMVLCKKDLIRRDILYYKGRIDMDKYEVVDIEDGRDDD-
             280       290       300       310       320       330 

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pF1KA0 FTVT-------HYKHSKQQYSIQAKTVEEKRNWTHHIKRLILENHHATIPQKAKEAILEM
       :.:.       : :.... . . :: .:::  :                           
CCDS55 FNVSMKNAFKLHNKETEEIHLFFAKKLEEKIRWLRAFREERKMVQEDEKIGFEISENQKR
              340       350       360       370       380       390

            420       430       440       450       460       470  
pF1KA0 DSYYPNRYRCSPERLKKAWSSQDEVSTNVRQGRRQSEPTKHLLRQLNEKARAAGMKHAGS
                                                                   
CCDS55 QAAMTVRKVPKQKGVNSARSVPPSYPPPQDPLNHGQYLVPDGIAQSQVFEFTEPKRSQSP
              400       410       420       430       440       450

>>CCDS83477.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX            (495 aa)
 initn: 407 init1: 145 opt: 441  Z-score: 306.3  bits: 67.6 E(32554): 9.6e-11
Smith-Waterman score: 529; 32.0% identity (63.2% similar) in 337 aa overlap (73-385:61-395)

             50        60        70        80         90       100 
pF1KA0 EAPAKNGAGSLRSRHLPNSNNNSSSWLNVKGPLSPFNSRAAAG-PAHHKLSYLGRVVREI
                                     : :.: ..    : : ... .. . :. ::
CCDS83 DEEGWFPASFVRLWVNQEDEVEEGPSDVQNGHLDPNSDCLCLGRPLQNRDQMRANVINEI
               40        50        60        70        80        90

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pF1KA0 VETERMYVQDLRSIVEDYLLKIIDTPGLLKPEQVSALFGNIENIYALNSQLLRDLDS--C
       . ::: :.. :..: : :: .      ... ::....:::::.:: ..  ..:::..   
CCDS83 MSTERHYIKHLKDICEGYLKQCRKRRDMFSDEQLKVIFGNIEDIYRFQMGFVRDLEKQYN
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pF1KA0 NSDP--VAVASCFVERSQEFDIYTQYCNNYPNSVAALTECMRDKQQAKFFRDRQELLQH-
       :.::    .. ::.:... : ::..::::. ..   :.. :.:..  .:: .  .:::. 
CCDS83 NDDPHLSEIGPCFLEHQDGFWIYSEYCNNHLDACMELSKLMKDSRYQHFF-EACRLLQQM
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pF1KA0 -SLPLGSYLLKPVQRILKYHLLLQEIAKHFDEEEDGFEVVEDAIDTMTCVAWYINDMKRR
        .. . ..:: :::.: :: : : :. :.  .... .. :  :. .:  :.  ::. :::
CCDS83 IDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTAQDHSDYRYVAAALAVMRNVTQQINERKRR
     210       220       230       240       250       260         

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pF1KA0 HEHAVRLQEIQSLLINWKGPD-LTTYGELVLEGT----FRVHRVRNERTFFLFDKTLLIT
        :.  .. . :. ...:.: : :   .::.  :     .. .   ..:.:::::. ... 
CCDS83 LENIDKIAQWQASVLDWEGEDILDRSSELIYTGEMAWIYQPYGRNQQRVFFLFDHQMVLC
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pF1KA0 KK---RGDHFVYKGNIPCSSLML--IESTRDSLCFTVT-------HYKHSKQQYSIQAKT
       ::   : : . ::: :  ..  .  ::. ::.  :.:.       : :.... . . :: 
CCDS83 KKDLIRRDILYYKGRIDMDKYEVVDIEDGRDDD-FNVSMKNAFKLHNKETEEIHLFFAKK
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pF1KA0 VEEKRNWTHHIKRLILENHHATIPQKAKEAILEMDSYYPNRYRCSPERLKKAWSSQDEVS
       .:::  :                                                     
CCDS83 LEEKIRWLRAFREERKMVQEDEKIGFEISENQKRQAAMTVRKVPKQKGVNSARSVPPSYP
      390       400       410       420       430       440        

>>CCDS35315.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX            (516 aa)
 initn: 407 init1: 145 opt: 441  Z-score: 306.1  bits: 67.6 E(32554): 1e-10
Smith-Waterman score: 529; 32.0% identity (63.2% similar) in 337 aa overlap (73-385:82-416)

             50        60        70        80         90       100 
pF1KA0 EAPAKNGAGSLRSRHLPNSNNNSSSWLNVKGPLSPFNSRAAAG-PAHHKLSYLGRVVREI
                                     : :.: ..    : : ... .. . :. ::
CCDS35 DEEGWFPASFVRLWVNQEDEVEEGPSDVQNGHLDPNSDCLCLGRPLQNRDQMRANVINEI
              60        70        80        90       100       110 

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pF1KA0 VETERMYVQDLRSIVEDYLLKIIDTPGLLKPEQVSALFGNIENIYALNSQLLRDLDS--C
       . ::: :.. :..: : :: .      ... ::....:::::.:: ..  ..:::..   
CCDS35 MSTERHYIKHLKDICEGYLKQCRKRRDMFSDEQLKVIFGNIEDIYRFQMGFVRDLEKQYN
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     160         170       180       190       200       210       
pF1KA0 NSDP--VAVASCFVERSQEFDIYTQYCNNYPNSVAALTECMRDKQQAKFFRDRQELLQH-
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CCDS35 NDDPHLSEIGPCFLEHQDGFWIYSEYCNNHLDACMELSKLMKDSRYQHFF-EACRLLQQM
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pF1KA0 -SLPLGSYLLKPVQRILKYHLLLQEIAKHFDEEEDGFEVVEDAIDTMTCVAWYINDMKRR
        .. . ..:: :::.: :: : : :. :.  .... .. :  :. .:  :.  ::. :::
CCDS35 IDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTAQDHSDYRYVAAALAVMRNVTQQINERKRR
              240       250       260       270       280       290

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pF1KA0 HEHAVRLQEIQSLLINWKGPD-LTTYGELVLEGT----FRVHRVRNERTFFLFDKTLLIT
        :.  .. . :. ...:.: : :   .::.  :     .. .   ..:.:::::. ... 
CCDS35 LENIDKIAQWQASVLDWEGEDILDRSSELIYTGEMAWIYQPYGRNQQRVFFLFDHQMVLC
              300       310       320       330       340       350

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pF1KA0 KK---RGDHFVYKGNIPCSSLML--IESTRDSLCFTVT-------HYKHSKQQYSIQAKT
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CCDS35 KKDLIRRDILYYKGRIDMDKYEVVDIEDGRDDD-FNVSMKNAFKLHNKETEEIHLFFAKK
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pF1KA0 VEEKRNWTHHIKRLILENHHATIPQKAKEAILEMDSYYPNRYRCSPERLKKAWSSQDEVS
       .:::  :                                                     
CCDS35 LEEKIRWLRAFREERKMVQEDEKIGFEISENQKRQAAMTVRKVPKQKGVNSARSVPPSYP
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1340 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 09:52:28 2016 done: Thu Nov  3 09:52:29 2016
 Total Scan time:  5.400 Total Display time:  0.230

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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