Result of FASTA (ccds) for pF1KSDF0136
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDF0136, 805 aa
  1>>>pF1KSDF0136 805 - 805 aa - 805 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4334+/-0.000783; mu= 20.6918+/- 0.047
 mean_var=77.7910+/-15.786, 0's: 0 Z-trim(109.3): 26  B-trim: 0 in 0/48
 Lambda= 0.145415
 statistics sampled from 10757 (10777) to 10757 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.692), E-opt: 0.2 (0.331), width:  16
 Scan time:  4.340

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS32748.1 TMC6 gene_id:11322|Hs108|chr17         ( 805) 5395 1141.6       0
CCDS10577.1 TMC5 gene_id:79838|Hs108|chr16         ( 760) 1126 246.0 1.8e-64
CCDS45431.1 TMC5 gene_id:79838|Hs108|chr16         (1006) 1126 246.1 2.2e-64
CCDS76837.1 TMC5 gene_id:79838|Hs108|chr16         ( 954)  902 199.0   3e-50
CCDS42126.1 TMC5 gene_id:79838|Hs108|chr16         ( 948)  862 190.7   1e-47
CCDS53992.1 TMC7 gene_id:79905|Hs108|chr16         ( 613)  456 105.3 3.1e-22
CCDS10573.1 TMC7 gene_id:79905|Hs108|chr16         ( 723)  456 105.4 3.5e-22
CCDS73837.1 TMC7 gene_id:79905|Hs108|chr16         ( 758)  417 97.2 1.1e-19
CCDS32749.1 TMC8 gene_id:147138|Hs108|chr17        ( 726)  370 87.4 9.6e-17
CCDS12882.1 TMC4 gene_id:147798|Hs108|chr19        ( 706)  363 85.9 2.6e-16
CCDS46174.1 TMC4 gene_id:147798|Hs108|chr19        ( 712)  363 85.9 2.6e-16
CCDS6643.1 TMC1 gene_id:117531|Hs108|chr9          ( 760)  289 70.4 1.3e-11
CCDS45324.1 TMC3 gene_id:342125|Hs108|chr15        (1100)  280 68.6 6.4e-11


>>CCDS32748.1 TMC6 gene_id:11322|Hs108|chr17              (805 aa)
 initn: 5395 init1: 5395 opt: 5395  Z-score: 6110.8  bits: 1141.6 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5395; 100.0% identity (100.0% similar) in 805 aa overlap (1-805:1-805)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAQPLAFILDVPETPGDQGQGPSPYDESEVHDSFQQLIQEQSQCTAQEGLELQQREREVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MAQPLAFILDVPETPGDQGQGPSPYDESEVHDSFQQLIQEQSQCTAQEGLELQQREREVT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD GSSQQTLWRPEGTQSTATLRILASMPSRTIGRSRGAIISQYYNRTVQLRCRSSRPLLGNF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GSSQQTLWRPEGTQSTATLRILASMPSRTIGRSRGAIISQYYNRTVQLRCRSSRPLLGNF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD VRSAWPSLRLYDLELDPTALEEEEKQSLLVKELQSLAVAQRDHMLRGMPLSLAEKRSLRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VRSAWPSLRLYDLELDPTALEEEEKQSLLVKELQSLAVAQRDHMLRGMPLSLAEKRSLRE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD KSRTPRGKWRGQPGSGGVCSCCGRLRYACVLALHSLGLALLSALQALMPWRYALKRIGGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KSRTPRGKWRGQPGSGGVCSCCGRLRYACVLALHSLGLALLSALQALMPWRYALKRIGGQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD FGSSVLSYFLFLKTLLAFNALLLLLLVAFIMGPQVAFPPALPGPAPVCTGLELLTGAGCF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FGSSVLSYFLFLKTLLAFNALLLLLLVAFIMGPQVAFPPALPGPAPVCTGLELLTGAGCF
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD THTVMYYGHYSNATLNQPCGSPLDGSQCTPRVGGLPYNMPLAYLSTVGVSFFITCITLVY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 THTVMYYGHYSNATLNQPCGSPLDGSQCTPRVGGLPYNMPLAYLSTVGVSFFITCITLVY
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD SMAHSFGESYRVGSTSGIHAITVFCSWDYKVTQKRASRLQQDNIRTRLKELLAEWQLRHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SMAHSFGESYRVGSTSGIHAITVFCSWDYKVTQKRASRLQQDNIRTRLKELLAEWQLRHS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD PRSVCGRLRQAAVLGLVWLLCLGTALGCAVAVHVFSEFMIQSPEAAGQEAVLLVLPLVVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PRSVCGRLRQAAVLGLVWLLCLGTALGCAVAVHVFSEFMIQSPEAAGQEAVLLVLPLVVG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD LLNLGAPYLCRVLAALEPHDSPVLEVYVAICRNLILKLAILGTLCYHWLGRRVGVLQGQC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LLNLGAPYLCRVLAALEPHDSPVLEVYVAICRNLILKLAILGTLCYHWLGRRVGVLQGQC
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD WEDFVGQELYRFLVMDFVLMLLDTLFGELVWRIISEKKLKRRRKPEFDIARNVLELIYGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 WEDFVGQELYRFLVMDFVLMLLDTLFGELVWRIISEKKLKRRRKPEFDIARNVLELIYGQ
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD TLTWLGVLFSPLLPAVQIIKLLLVFYVKKTSLLANCQAPRRPWLASHMSTVFLTLLCFPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TLTWLGVLFSPLLPAVQIIKLLLVFYVKKTSLLANCQAPRRPWLASHMSTVFLTLLCFPA
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD FLGAAVFLCYAVWQVKPSSTCGPFRTLDTMYEAGRVWVRHLEAAGPRVSWLPWVHRYLME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FLGAAVFLCYAVWQVKPSSTCGPFRTLDTMYEAGRVWVRHLEAAGPRVSWLPWVHRYLME
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD NTFFVFLVSALLLAVIYLNIQVVRGQRKVICLLKEQISNEGEDKIFLINKLHSIYERKER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NTFFVFLVSALLLAVIYLNIQVVRGQRKVICLLKEQISNEGEDKIFLINKLHSIYERKER
              730       740       750       760       770       780

              790       800     
pF1KSD EERSRVGTTEEAAAPPALLTDEQDA
       :::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EERSRVGTTEEAAAPPALLTDEQDA
              790       800     

>>CCDS10577.1 TMC5 gene_id:79838|Hs108|chr16              (760 aa)
 initn: 1293 init1: 558 opt: 1126  Z-score: 1271.0  bits: 246.0 E(32554): 1.8e-64
Smith-Waterman score: 1391; 35.9% identity (66.0% similar) in 685 aa overlap (127-804:81-742)

        100       110       120       130           140       150  
pF1KSD IISQYYNRTVQLRCRSSRPLLGNFVRSAWPSLRLYDLE---LD-PTALEEEEKQSLLVKE
                                     :  :..::   .: : . .:  . . :.  
CCDS10 DVIDSQTVSKRNDQKGNQVLRFSTSLNESMSQTLHSLECMGIDTPGSSHETVQGQKLIAS
               60        70        80        90       100       110

            160       170       180       190        200       210 
pF1KSD LQSLAVAQRDHMLRGMPLSLAEKRSLREKSRTPRGKWRGQPGSGGVC-SCCGRLRYACVL
       :  ..  .: . .:..: .. :::.::.     ..:   .  . . : .: . .  :   
CCDS10 LIPMTSRDRIKAIRNQPRTMEEKRNLRKIVDKEKSKQTHRILQLNCCIQCLNSISRAYRR
              120       130       140       150       160       170

             220       230       240       250       260       270 
pF1KSD ALHSLGLALLSALQALMPWRYALKRIGGQFGSSVLSYFLFLKTLLAFNALLLLLLVAFIM
       . .::.      :...  :. .:: :::.::.:::::: ::. :: :: . ..:  .::.
CCDS10 SKNSLS----EILNSISLWQKTLKIIGGKFGTSVLSYFNFLRWLLKFNIFSFILNFSFII
                  180       190       200       210       220      

             280       290       300       310       320       330 
pF1KSD GPQVAFPPALPGPAPVCTGLELLTGAGCFTHTVMYYGHYSNATLNQPCGSPLDGSQCTPR
        ::  :  :  .     ::::..::.: :  :::::: :.:.:...       :..    
CCDS10 IPQ--FTVAKKNTLQF-TGLEFFTGVGYFRDTVMYYGFYTNSTIQH-------GNS----
          230       240        250       260              270      

             340       350       360       370        380       390
pF1KSD VGGLPYNMPLAYLSTVGVSFFITCITLVYSMAHSFGESYRVGST-SGIHAITVFCSWDYK
         :  ::: :::. :.:. .    ..:..:::. : ...      ::  .  .:: ::. 
CCDS10 --GASYNMQLAYIFTIGACLTTCFFSLLFSMAKYFRNNFINPHIYSGGITKLIFC-WDFT
              280       290       300       310       320          

              400       410       420       430       440       450
pF1KSD VTQKRASRLQQDNIRTRLKELLAEWQLRHSPRSVCGRLRQAAVLGLVWLLCLGTALGCAV
       ::...: .:.: :. :...: :.: . ..:  .    : . ..  ..:..  :.:..: .
CCDS10 VTHEKAVKLKQKNLSTEIRENLSELRQENSKLTFNQLLTRFSAYMVAWVVSTGVAIACCA
     330       340       350       360       370       380         

              460       470       480       490       500       510
pF1KSD AVHVFSEFMIQSPEAAGQEAVLLVLPLVVGLLNLGAPYLCRVLAALEPHDSPVLEVYVAI
       ::. ..:. ..  .. .. ...:.::.::. .::..: .  ..  .: .. :  :::: .
CCDS10 AVYYLAEYNLEFLKTHSNPGAVLLLPFVVSCINLAVPCIYSMFRLVERYEMPRHEVYVLL
     390       400       410       420       430       440         

              520       530       540       550       560       570
pF1KSD CRNLILKLAILGTLCYHWLGRRVGVLQGQCWEDFVGQELYRFLVMDFVLMLLDTLFGELV
        ::..::..:.: :::.::.  :..   .::: ..::..::.:.::::. :.....::..
CCDS10 IRNIFLKISIIGILCYYWLNT-VALSGEECWETLIGQDIYRLLLMDFVFSLVNSFLGEFL
     450       460       470        480       490       500        

              580       590       600       610       620       630
pF1KSD WRIISEKKLKRRRKPEFDIARNVLELIYGQTLTWLGVLFSPLLPAVQIIKLLLVFYVKKT
        :::. . .      :::::::::::::.:::.:.:..: :::: .:.: :...:: :. 
CCDS10 RRIIGMQLITSLGLQEFDIARNVLELIYAQTLVWIGIFFCPLLPFIQMIMLFIMFYSKNI
      510       520       530       540       550       560        

              640       650       660       670       680       690
pF1KSD SLLANCQAPRRPWLASHMSTVFLTLLCFPAFLGAAVFLCYAVWQVKPSSTCGPFRTLDTM
       ::. : : : . : ::.: : :. :: ::.: :.   :  ..:..:::. ::::: :  .
CCDS10 SLMMNFQPPSKAWRASQMMTFFIFLLFFPSFTGVLCTLAITIWRLKPSADCGPFRGLPLF
      570       580       590       600       610       620        

              700       710       720       730       740       750
pF1KSD YEAGRVWVRHLEAAGPRVSWLPWVHRYLMENTFFVFLVSALLLAVIYLNIQVVRGQRKVI
        ..   :.  : .. :   :. :..: :. .. : :... ..: . ::  :...:.. .:
CCDS10 IHSIYSWIDTL-STRPGYLWVVWIYRNLIGSVHFFFILTLIVLIITYLYWQITEGRKIMI
      630        640       650       660       670       680       

              760       770        780       790       800         
pF1KSD CLLKEQISNEGEDKIFLINKLHSIYE-RKEREERSRVGTTEEAAAPPALLTDEQDA    
        ::.::: :::.::.:::.:: .. . .:. .  : :   .:.     :   :.:     
CCDS10 RLLHEQIINEGKDKMFLIEKLIKLQDMEKKANPSSLVLERREVEQQGFLHLGEHDGSLDL
       690       700       710       720       730       740       

CCDS10 RSRRSVQEGNPRA
       750       760

>>CCDS45431.1 TMC5 gene_id:79838|Hs108|chr16              (1006 aa)
 initn: 1293 init1: 558 opt: 1126  Z-score: 1269.2  bits: 246.1 E(32554): 2.2e-64
Smith-Waterman score: 1388; 33.5% identity (62.1% similar) in 813 aa overlap (10-804:224-988)

                                    10             20        30    
pF1KSD                      MAQPLAFILDVPETPGDQG-----QGPSPYDESEVHDSF
                                     : : .  .:.     . :.  :  . ::  
CCDS45 RINPYADSLGKPDYPGADIQPNSPPFFGEPDYPSAEDNQNLPSTWREPDYSDAENGHDYG
           200       210       220       230       240       250   

           40        50        60            70        80          
pF1KSD QQLIQEQSQCTAQEGLELQQREREVTGSSQQTLW----RPEGTQSTATLRILASMP-SRT
       ..   .... . ..   .:   :. . .   .::     ::: .       .:::  . .
CCDS45 SSETPKMTRGVLSRTSSIQPSFRHRSDDPVGSLWGENDYPEGIE-------MASMEMANS
           260       270       280       290              300      

      90        100       110         120       130       140      
pF1KSD IGRSR-GAIISQYYNRTVQLRCRSSRPL--LGNFVRSAWPSLRLYDLELDPTALEEEEKQ
        :.:  ::  : : : .       : :.   ::      : :   : . .: . .     
CCDS45 YGHSLPGAPGSGYVNPA---YVGESGPVHAYGN------PPLSECDWHKSPQGQK-----
        310       320          330             340       350       

        150       160       170       180       190        200     
pF1KSD SLLVKELQSLAVAQRDHMLRGMPLSLAEKRSLREKSRTPRGKWRGQPGSGGVC-SCCGRL
         :.  :  ..  .: . .:..: .. :::.::.     ..:   .  . . : .: . .
CCDS45 --LIASLIPMTSRDRIKAIRNQPRTMEEKRNLRKIVDKEKSKQTHRILQLNCCIQCLNSI
              360       370       380       390       400       410

         210       220       230       240       250       260     
pF1KSD RYACVLALHSLGLALLSALQALMPWRYALKRIGGQFGSSVLSYFLFLKTLLAFNALLLLL
         :   . .::.      :...  :. .:: :::.::.:::::: ::. :: :: . ..:
CCDS45 SRAYRRSKNSLS----EILNSISLWQKTLKIIGGKFGTSVLSYFNFLRWLLKFNIFSFIL
              420           430       440       450       460      

         270       280       290       300       310       320     
pF1KSD LVAFIMGPQVAFPPALPGPAPVCTGLELLTGAGCFTHTVMYYGHYSNATLNQPCGSPLDG
         .::. ::  :  :  .     ::::..::.: :  :::::: :.:.:...       :
CCDS45 NFSFIIIPQ--FTVAKKNTLQF-TGLEFFTGVGYFRDTVMYYGFYTNSTIQH-------G
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pF1KSD SQCTPRVGGLPYNMPLAYLSTVGVSFFITCITLVYSMAHSFGESY---RVGSTSGIHAIT
       ..      :  ::: :::. :.:. .    ..:..:::. : ...   .. : .::  . 
CCDS45 NS------GASYNMQLAYIFTIGACLTTCFFSLLFSMAKYFRNNFINPHIYS-GGITKL-
              520       530       540       550       560          

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pF1KSD VFCSWDYKVTQKRASRLQQDNIRTRLKELLAEWQLRHSPRSVCGRLRQAAVLGLVWLLCL
       .:: ::. ::...: .:.: :. :...: :.: . ..:  .    : . ..  ..:..  
CCDS45 IFC-WDFTVTHEKAVKLKQKNLSTEIRENLSELRQENSKLTFNQLLTRFSAYMVAWVVST
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pF1KSD GTALGCAVAVHVFSEFMIQSPEAAGQEAVLLVLPLVVGLLNLGAPYLCRVLAALEPHDSP
       :.:..: .::. ..:. ..  .. .. ...:.::.::. .::..: .  ..  .: .. :
CCDS45 GVAIACCAAVYYLAEYNLEFLKTHSNPGAVLLLPFVVSCINLAVPCIYSMFRLVERYEMP
       630       640       650       660       670       680       

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pF1KSD VLEVYVAICRNLILKLAILGTLCYHWLGRRVGVLQGQCWEDFVGQELYRFLVMDFVLMLL
         :::: . ::..::..:.: :::.::.  :..   .::: ..::..::.:.::::. :.
CCDS45 RHEVYVLLIRNIFLKISIIGILCYYWLNT-VALSGEECWETLIGQDIYRLLLMDFVFSLV
       690       700       710        720       730       740      

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pF1KSD DTLFGELVWRIISEKKLKRRRKPEFDIARNVLELIYGQTLTWLGVLFSPLLPAVQIIKLL
       ....::.. :::. . .      :::::::::::::.:::.:.:..: :::: .:.: :.
CCDS45 NSFLGEFLRRIIGMQLITSLGLQEFDIARNVLELIYAQTLVWIGIFFCPLLPFIQMIMLF
        750       760       770       780       790       800      

            630       640       650       660       670       680  
pF1KSD LVFYVKKTSLLANCQAPRRPWLASHMSTVFLTLLCFPAFLGAAVFLCYAVWQVKPSSTCG
       ..:: :. ::. : : : . : ::.: : :. :: ::.: :.   :  ..:..:::. ::
CCDS45 IMFYSKNISLMMNFQPPSKAWRASQMMTFFIFLLFFPSFTGVLCTLAITIWRLKPSADCG
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            690       700       710       720       730       740  
pF1KSD PFRTLDTMYEAGRVWVRHLEAAGPRVSWLPWVHRYLMENTFFVFLVSALLLAVIYLNIQV
       ::: :  . ..   :.  : .. :   :. :..: :. .. : :... ..: . ::  :.
CCDS45 PFRGLPLFIHSIYSWIDTL-STRPGYLWVVWIYRNLIGSVHFFFILTLIVLIITYLYWQI
        870       880        890       900       910       920     

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pF1KSD VRGQRKVICLLKEQISNEGEDKIFLINKLHSIYE-RKEREERSRVGTTEEAAAPPALLTD
       ..:.. .: ::.::: :::.::.:::.:: .. . .:. .  : :   .:.     :   
CCDS45 TEGRKIMIRLLHEQIINEGKDKMFLIEKLIKLQDMEKKANPSSLVLERREVEQQGFLHLG
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pF1KSD EQDA                 
       :.:                  
CCDS45 EHDGSLDLRSRRSVQEGNPRA
         990      1000      

>>CCDS76837.1 TMC5 gene_id:79838|Hs108|chr16              (954 aa)
 initn: 1211 init1: 558 opt: 902  Z-score: 1015.6  bits: 199.0 E(32554): 3e-50
Smith-Waterman score: 1216; 32.6% identity (58.1% similar) in 813 aa overlap (10-804:224-936)

                                    10             20        30    
pF1KSD                      MAQPLAFILDVPETPGDQG-----QGPSPYDESEVHDSF
                                     : : .  .:.     . :.  :  . ::  
CCDS76 RINPYADSLGKPDYPGADIQPNSPPFFGEPDYPSAEDNQNLPSTWREPDYSDAENGHDYG
           200       210       220       230       240       250   

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pF1KSD QQLIQEQSQCTAQEGLELQQREREVTGSSQQTLW----RPEGTQSTATLRILASMP-SRT
       ..   .... . ..   .:   :. . .   .::     ::: .       .:::  . .
CCDS76 SSETPKMTRGVLSRTSSIQPSFRHRSDDPVGSLWGENDYPEGIE-------MASMEMANS
           260       270       280       290              300      

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pF1KSD IGRSR-GAIISQYYNRTVQLRCRSSRPL--LGNFVRSAWPSLRLYDLELDPTALEEEEKQ
        :.:  ::  : : : .       : :.   ::      : :   : . .: . .     
CCDS76 YGHSLPGAPGSGYVNPA---YVGESGPVHAYGN------PPLSECDWHKSPQGQK-----
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pF1KSD SLLVKELQSLAVAQRDHMLRGMPLSLAEKRSLREKSRTPRGKWRGQPGSGGVC-SCCGRL
         :.  :  ..  .: . .:..: .. :::.::.     ..:   .  . . : .: . .
CCDS76 --LIASLIPMTSRDRIKAIRNQPRTMEEKRNLRKIVDKEKSKQTHRILQLNCCIQCLNSI
              360       370       380       390       400       410

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pF1KSD RYACVLALHSLGLALLSALQALMPWRYALKRIGGQFGSSVLSYFLFLKTLLAFNALLLLL
         :   . .::.      :...  :. .:: :::.::.:::::: ::. :: :: . ..:
CCDS76 SRAYRRSKNSLS----EILNSISLWQKTLKIIGGKFGTSVLSYFNFLRWLLKFNIFSFIL
              420           430       440       450       460      

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pF1KSD LVAFIMGPQVAFPPALPGPAPVCTGLELLTGAGCFTHTVMYYGHYSNATLNQPCGSPLDG
         .::. ::  :  :  .     ::::..::.: :  :::::: :.:.:...       :
CCDS76 NFSFIIIPQ--FTVAKKNTLQF-TGLEFFTGVGYFRDTVMYYGFYTNSTIQH-------G
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pF1KSD SQCTPRVGGLPYNMPLAYLSTVGVSFFITCITLVYSMAHSFGESY---RVGSTSGIHAIT
       ..      :  ::: :::. :.:. .    ..:..:::. : ...   .. : .::  . 
CCDS76 NS------GASYNMQLAYIFTIGACLTTCFFSLLFSMAKYFRNNFINPHIYS-GGITKL-
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            390       400       410       420       430       440  
pF1KSD VFCSWDYKVTQKRASRLQQDNIRTRLKELLAEWQLRHSPRSVCGRLRQAAVLGLVWLLCL
       .:: ::. ::...: .:.: :. :... : .     ::                      
CCDS76 IFC-WDFTVTHEKAVKLKQKNLSTEIRFLKT-----HS----------------------
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pF1KSD GTALGCAVAVHVFSEFMIQSPEAAGQEAVLLVLPLVVGLLNLGAPYLCRVLAALEPHDSP
                          .: :      .:.::.::. .::..: .  ..  .: .. :
CCDS76 -------------------NPGA------VLLLPFVVSCINLAVPCIYSMFRLVERYEMP
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            510       520       530       540       550       560  
pF1KSD VLEVYVAICRNLILKLAILGTLCYHWLGRRVGVLQGQCWEDFVGQELYRFLVMDFVLMLL
         :::: . ::..::..:.: :::.::.  :..   .::: ..::..::.:.::::. :.
CCDS76 RHEVYVLLIRNIFLKISIIGILCYYWLNT-VALSGEECWETLIGQDIYRLLLMDFVFSLV
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       ....::.. :::. . .      :::::::::::::.:::.:.:..: :::: .:.: :.
CCDS76 NSFLGEFLRRIIGMQLITSLGLQEFDIARNVLELIYAQTLVWIGIFFCPLLPFIQMIMLF
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            630       640       650       660       670       680  
pF1KSD LVFYVKKTSLLANCQAPRRPWLASHMSTVFLTLLCFPAFLGAAVFLCYAVWQVKPSSTCG
       ..:: :. ::. : : : . : ::.: : :. :: ::.: :.   :  ..:..:::. ::
CCDS76 IMFYSKNISLMMNFQPPSKAWRASQMMTFFIFLLFFPSFTGVLCTLAITIWRLKPSADCG
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            690       700       710       720       730       740  
pF1KSD PFRTLDTMYEAGRVWVRHLEAAGPRVSWLPWVHRYLMENTFFVFLVSALLLAVIYLNIQV
       ::: :  . ..   :.  : .. :   :. :..: :. .. : :... ..: . ::  :.
CCDS76 PFRGLPLFIHSIYSWIDTL-STRPGYLWVVWIYRNLIGSVHFFFILTLIVLIITYLYWQI
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            750       760       770        780       790       800 
pF1KSD VRGQRKVICLLKEQISNEGEDKIFLINKLHSIYE-RKEREERSRVGTTEEAAAPPALLTD
       ..:.. .: ::.::: :::.::.:::.:: .. . .:. .  : :   .:.     :   
CCDS76 TEGRKIMIRLLHEQIINEGKDKMFLIEKLIKLQDMEKKANPSSLVLERREVEQQGFLHLG
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pF1KSD EQDA                 
       :.:                  
CCDS76 EHDGSLDLRSRRSVQEGNPRA
           940       950    

>>CCDS42126.1 TMC5 gene_id:79838|Hs108|chr16              (948 aa)
 initn: 1215 init1: 480 opt: 862  Z-score: 970.3  bits: 190.7 E(32554): 1e-47
Smith-Waterman score: 1129; 31.1% identity (57.8% similar) in 813 aa overlap (10-804:224-930)

                                    10             20        30    
pF1KSD                      MAQPLAFILDVPETPGDQG-----QGPSPYDESEVHDSF
                                     : : .  .:.     . :.  :  . ::  
CCDS42 RINPYADSLGKPDYPGADIQPNSPPFFGEPDYPSAEDNQNLPSTWREPDYSDAENGHDYG
           200       210       220       230       240       250   

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pF1KSD QQLIQEQSQCTAQEGLELQQREREVTGSSQQTLW----RPEGTQSTATLRILASMP-SRT
       ..   .... . ..   .:   :. . .   .::     ::: .       .:::  . .
CCDS42 SSETPKMTRGVLSRTSSIQPSFRHRSDDPVGSLWGENDYPEGIE-------MASMEMANS
           260       270       280       290              300      

      90        100       110         120       130       140      
pF1KSD IGRSR-GAIISQYYNRTVQLRCRSSRPL--LGNFVRSAWPSLRLYDLELDPTALEEEEKQ
        :.:  ::  : : : .       : :.   ::      : :   : . .: . .     
CCDS42 YGHSLPGAPGSGYVNPA---YVGESGPVHAYGN------PPLSECDWHKSPQGQK-----
        310       320          330             340       350       

        150       160       170       180       190        200     
pF1KSD SLLVKELQSLAVAQRDHMLRGMPLSLAEKRSLREKSRTPRGKWRGQPGSGGVC-SCCGRL
         :.  :  ..  .: . .:..: .. :::.::.     ..:   .  . . : .: . .
CCDS42 --LIASLIPMTSRDRIKAIRNQPRTMEEKRNLRKIVDKEKSKQTHRILQLNCCIQCLNSI
              360       370       380       390       400       410

         210       220       230       240       250       260     
pF1KSD RYACVLALHSLGLALLSALQALMPWRYALKRIGGQFGSSVLSYFLFLKTLLAFNALLLLL
         :   . .::.      :...  :. .:: :::.::.:::::: ::. :: :: . ..:
CCDS42 SRAYRRSKNSLS----EILNSISLWQKTLKIIGGKFGTSVLSYFNFLRWLLKFNIFSFIL
              420           430       440       450       460      

         270       280       290       300       310       320     
pF1KSD LVAFIMGPQVAFPPALPGPAPVCTGLELLTGAGCFTHTVMYYGHYSNATLNQPCGSPLDG
         .::. ::  :  :  .     ::::..::.: :  :::::: :.:.:...       :
CCDS42 NFSFIIIPQ--FTVAKKNTLQF-TGLEFFTGVGYFRDTVMYYGFYTNSTIQH-------G
        470         480        490       500       510             

         330       340       350       360       370          380  
pF1KSD SQCTPRVGGLPYNMPLAYLSTVGVSFFITCITLVYSMAHSFGESY---RVGSTSGIHAIT
       ..      :  ::: :::. :.:. .    ..:..:::. : ...   .. : .::  . 
CCDS42 NS------GASYNMQLAYIFTIGACLTTCFFSLLFSMAKYFRNNFINPHIYS-GGITKL-
              520       530       540       550       560          

            390       400       410       420       430       440  
pF1KSD VFCSWDYKVTQKRASRLQQDNIRTRLKELLAEWQLRHSPRSVCGRLRQAAVLGLVWLLCL
       .:: ::. ::...: .:.: :. :...: :.: . ..:  .    : . ..  ..:..  
CCDS42 IFC-WDFTVTHEKAVKLKQKNLSTEIRENLSELRQENSKLTFNQLLTRFSAYMVAWVVST
      570        580       590       600       610       620       

            450       460       470       480       490       500  
pF1KSD GTALGCAVAVHVFSEFMIQSPEAAGQEAVLLVLPLVVGLLNLGAPYLCRVLAALEPHDSP
       :.:..: .::. ..:. ..  .. .. ...:.::.::. .::..: .  ..  .: .. :
CCDS42 GVAIACCAAVYYLAEYNLEFLKTHSNPGAVLLLPFVVSCINLAVPCIYSMFRLVERYEMP
       630       640       650       660       670       680       

            510       520       530       540       550       560  
pF1KSD VLEVYVAICRNLILKLAILGTLCYHWLGRRVGVLQGQCWEDFVGQELYRFLVMDFVLMLL
         :::: . ::..::..:.: :::.::.  :..   .::: ..::..::.:.::::. :.
CCDS42 RHEVYVLLIRNIFLKISIIGILCYYWLNT-VALSGEECWETLIGQDIYRLLLMDFVFSLV
       690       700       710        720       730       740      

            570       580       590       600       610       620  
pF1KSD DTLFGELVWRIISEKKLKRRRKPEFDIARNVLELIYGQTLTWLGVLFSPLLPAVQIIKLL
       ....::.. :::. . .      :::::::::::::.:::.:.:..: :::: .:.: :.
CCDS42 NSFLGEFLRRIIGMQLITSLGLQEFDIARNVLELIYAQTLVWIGIFFCPLLPFIQMIMLF
        750       760       770       780       790       800      

            630       640       650       660       670       680  
pF1KSD LVFYVKKTSLLANCQAPRRPWLASHMSTVFLTLLCFPAFLGAAVFLCYAVWQVKPSSTCG
       ..:: :. ::. : : : . : ::.: : :. :: ::.: :.   :  ..:..       
CCDS42 IMFYSKNISLMMNFQPPSKAWRASQMMTFFIFLLFFPSFTGVLCTLAITIWRI-------
        810       820       830       840       850                

            690       700       710       720       730       740  
pF1KSD PFRTLDTMYEAGRVWVRHLEAAGPRVSWLPWVHRYLMENTFFVFLVSALLLAVIYLNIQV
                                ...: :                           :.
CCDS42 -------------------------ITYLYW---------------------------QI
                              860                                  

            750       760       770        780       790       800 
pF1KSD VRGQRKVICLLKEQISNEGEDKIFLINKLHSIYE-RKEREERSRVGTTEEAAAPPALLTD
       ..:.. .: ::.::: :::.::.:::.:: .. . .:. .  : :   .:.     :   
CCDS42 TEGRKIMIRLLHEQIINEGKDKMFLIEKLIKLQDMEKKANPSSLVLERREVEQQGFLHLG
       870       880       890       900       910       920       

                            
pF1KSD EQDA                 
       :.:                  
CCDS42 EHDGSLDLRSRRSVQEGNPRA
       930       940        

>>CCDS53992.1 TMC7 gene_id:79905|Hs108|chr16              (613 aa)
 initn: 651 init1: 244 opt: 456  Z-score: 512.6  bits: 105.3 E(32554): 3.1e-22
Smith-Waterman score: 701; 27.7% identity (57.7% similar) in 596 aa overlap (230-771:35-604)

     200       210       220       230       240       250         
pF1KSD SCCGRLRYACVLALHSLGLALLSALQALMPWRYALKRIGGQFGSSVLSYFLFLKTLLAFN
                                     ::  .. : :.::... ::: ::. :. .:
CCDS53 SEWDQWKRYSSKSWKRFLEKAREMTTHLELWREDIRSIEGKFGTGIQSYFSFLRFLVLLN
           10        20        30        40        50        60    

     260       270       280                        290            
pF1KSD ALLLLLLVAFIMGPQVAFPPALPGPAPV----------CT-------GL--------ELL
        ...:..  ... : .     . . . :          ::       ::        .::
CCDS53 LVIFLIIFMLVLLPVLLTKYKITNSSFVLIPFKDMDKQCTVYPVSSSGLIYFYSYIIDLL
           70        80        90       100       110       120    

          300       310       320       330       340       350    
pF1KSD TGAGCFTHTVMYYGHYSNATLNQPCGSPLDGSQCTPRVGGLPYNMPLAYLSTVGVSFFIT
       .:.: . .: ..::::.           .::     .  .. :..::::: .. .:. ..
CCDS53 SGTGFLEETSLFYGHYT-----------IDGV----KFQNFTYDLPLAYLLSTIASLALS
          130       140                      150       160         

          360       370       380         390       400       410  
pF1KSD CITLVYSMAHSFGESYRVGSTSGIHAIT--VFCSWDYKVTQKRASRLQQDNIRTRLKELL
        . .:   ...:  .  . :   ...    .: .::. .:..  . :.....: .:.  :
CCDS53 LLWIVKRSVEGFKINL-IRSEEHFQSYCNKIFAGWDFCITNRSMADLKHSSLRYELRADL
     170       180        190       200       210       220        

              420       430          440       450        460      
pF1KSD AEWQLRH--SPRSVCGRLRQAAV---LGLVWLLCLGTALGCAVAVHVFS-EFMIQSPEAA
        : ..:.  . :.    .:  ..   :. . :  ::. .    .. ::: : : .  .  
CCDS53 EEERMRQKIAERTSEETIRIYSLRLFLNCIVLAVLGACFYAIYVATVFSQEHMKKEIDKM
      230       240       250       260       270       280        

          470        480       490       500       510       520   
pF1KSD --GQEAVLLVLP-LVVGLLNLGAPYLCRVLAALEPHDSPVLEVYVAICRNLILKLAILGT
         :..  .: :: .:. : :. .:..   .   : . :: .:. ..: : ....:: . .
CCDS53 VFGENLFILYLPSIVITLANFITPMIFAKIIRYEDY-SPGFEIRLTILRCVFMRLATICV
      290       300       310       320        330       340       

           530                    540       550       560       570
pF1KSD LCYHWLGRRV-----------GVLQG--QCWEDFVGQELYRFLVMDFVLMLLDTLFGELV
       : .  :: ..           :  :    :::  ::::.:.....::...:  ::: .. 
CCDS53 LVFT-LGSKITSCDDDTCDLCGYNQKLYPCWETQVGQEMYKLMIFDFIIILAVTLFVDFP
       350        360       370       380       390       400      

                   580       590       600       610       620     
pF1KSD WRII-----SEKKLKRRRKPEFDIARNVLELIYGQTLTWLGVLFSPLLPAVQIIKLLLVF
        ...     : : ..   . :: :  ::: ..::::. :.:..:::::::.  .:....:
CCDS53 RKLLVTYCSSCKLIQCWGQQEFAIPDNVLGIVYGQTICWIGAFFSPLLPAIATLKFIIIF
        410       420       430       440       450       460      

         630       640       650       660       670       680     
pF1KSD YVKKTSLLANCQAPRRPWLASHMSTVFLTLLCFPAFLGAAVFLCYAVWQVKPSSTCGPFR
       :::. ::: .:.   ::. ::. .  :: .: .   : : . :  .. ..  :..:::: 
CCDS53 YVKEWSLLYTCRPSPRPFRASNSNFFFLLVLLIGLCL-AIIPLTISISRIPSSKACGPFT
        470       480       490       500        510       520     

         690       700       710       720       730       740     
pF1KSD TLDTMYEAGRVWVRHLEAAGPRVSWLPWVHRYLMENTFFVFLVSALLLAVIYLNIQVVRG
       ...: .:.    . .  .. :  :   ..:    : .: : .   . : ..:. : .. .
CCDS53 NFNTTWEV----IPKTVSTFPS-SLQSFIHGVTSE-AFAVPFFMIICLIMFYF-IALAGA
         530           540        550        560       570         

         750       760       770       780       790       800     
pF1KSD QRKVICLLKEQISNEGEDKIFLINKLHSIYERKEREERSRVGTTEEAAAPPALLTDEQDA
       ...:.  :.::.: :..:: .::.::                                  
CCDS53 HKRVVIQLREQLSLESRDKCYLIQKLTEAQRDMRN                         
      580       590       600       610                            

>>CCDS10573.1 TMC7 gene_id:79905|Hs108|chr16              (723 aa)
 initn: 691 init1: 244 opt: 456  Z-score: 511.6  bits: 105.4 E(32554): 3.5e-22
Smith-Waterman score: 733; 27.0% identity (56.0% similar) in 732 aa overlap (103-771:24-714)

             80        90       100       110       120       130  
pF1KSD TQSTATLRILASMPSRTIGRSRGAIISQYYNRTVQLRCRSSRPLLGNFVRSAWPSLRLYD
                                     : ...  : :: :.  ::..   :: :  .
CCDS10        MSESSGSALQPGRPSRQPAVHPENLSLDSSCFSSPPV--NFLQEL-PSYR--S
                      10        20        30          40           

            140        150       160               170       180   
pF1KSD LELDPTALEEEEKQS-LLVKELQSLAVAQRD--------HMLRGMPLSLAEKRSLREKSR
       .    :... ..:::  :.:  .: .   .:        : ::.. :...::: ::. ..
CCDS10 IARRRTTVHSRDKQSGTLLKPTDSYSSQLEDRIAENLSSHSLRNYALNISEKRRLRDIQE
       50        60        70        80        90       100        

           190       200       210       220       230       240   
pF1KSD TPRGKWRGQPGSGGVCSCCGRLRYACVLALHSLGLALLSALQALMPWRYALKRIGGQFGS
       : . :. ..  .    :  .  :.       .  : :         ::  .. : :.::.
CCDS10 T-QMKYLSEWDQWKRYSSKSWKRFLEKAREMTTHLEL---------WREDIRSIEGKFGT
       110       120       130       140                150        

           250       260       270       280                       
pF1KSD SVLSYFLFLKTLLAFNALLLLLLVAFIMGPQVAFPPALPGPAPV----------CT----
       .. ::: ::. :. .: ...:..  ... : .     . . . :          ::    
CCDS10 GIQSYFSFLRFLVLLNLVIFLIIFMLVLLPVLLTKYKITNSSFVLIPFKDMDKQCTVYPV
      160       170       180       190       200       210        

        290               300       310       320       330        
pF1KSD ---GL--------ELLTGAGCFTHTVMYYGHYSNATLNQPCGSPLDGSQCTPRVGGLPYN
          ::        .::.:.: . .: ..::::.           .::     .  .. :.
CCDS10 SSSGLIYFYSYIIDLLSGTGFLEETSLFYGHYT-----------IDGV----KFQNFTYD
      220       230       240       250                      260   

      340       350       360       370       380         390      
pF1KSD MPLAYLSTVGVSFFITCITLVYSMAHSFGESYRVGSTSGIHAIT--VFCSWDYKVTQKRA
       .::::: .. .:. .. . .:   ...:  .  . :   ...    .: .::. .:..  
CCDS10 LPLAYLLSTIASLALSLLWIVKRSVEGFKINL-IRSEEHFQSYCNKIFAGWDFCITNRSM
           270       280       290        300       310       320  

        400       410         420       430          440       450 
pF1KSD SRLQQDNIRTRLKELLAEWQLRH--SPRSVCGRLRQAAV---LGLVWLLCLGTALGCAVA
       . :.....: .:.  : : ..:.  . :.    .:  ..   :. . :  ::. .    .
CCDS10 ADLKHSSLRYELRADLEEERMRQKIAERTSEETIRIYSLRLFLNCIVLAVLGACFYAIYV
            330       340       350       360       370       380  

              460         470        480       490       500       
pF1KSD VHVFS-EFMIQSPEAA--GQEAVLLVLP-LVVGLLNLGAPYLCRVLAALEPHDSPVLEVY
       . ::: : : .  .    :..  .: :: .:. : :. .:..   .   : . :: .:. 
CCDS10 ATVFSQEHMKKEIDKMVFGENLFILYLPSIVITLANFITPMIFAKIIRYEDY-SPGFEIR
            390       400       410       420       430        440 

       510       520       530                    540       550    
pF1KSD VAICRNLILKLAILGTLCYHWLGRRV-----------GVLQG--QCWEDFVGQELYRFLV
       ..: : ....:: . .: .  :: ..           :  :    :::  ::::.:....
CCDS10 LTILRCVFMRLATICVLVFT-LGSKITSCDDDTCDLCGYNQKLYPCWETQVGQEMYKLMI
             450       460        470       480       490       500

          560       570            580       590       600         
pF1KSD MDFVLMLLDTLFGELVWRII-----SEKKLKRRRKPEFDIARNVLELIYGQTLTWLGVLF
       .::...:  ::: ..  ...     : : ..   . :: :  ::: ..::::. :.:..:
CCDS10 FDFIIILAVTLFVDFPRKLLVTYCSSCKLIQCWGQQEFAIPDNVLGIVYGQTICWIGAFF
              510       520       530       540       550       560

     610       620       630       640       650       660         
pF1KSD SPLLPAVQIIKLLLVFYVKKTSLLANCQAPRRPWLASHMSTVFLTLLCFPAFLGAAVFLC
       ::::::.  .:....::::. ::: .:.   ::. ::. .  :: .: .   : : . : 
CCDS10 SPLLPAIATLKFIIIFYVKEWSLLYTCRPSPRPFRASNSNFFFLLVLLIGLCL-AIIPLT
              570       580       590       600       610          

     670       680       690       700       710       720         
pF1KSD YAVWQVKPSSTCGPFRTLDTMYEAGRVWVRHLEAAGPRVSWLPWVHRYLMENTFFVFLVS
        .. ..  :..:::: ...: .:.    . .  .. :  :   ..:    : .: : .  
CCDS10 ISISRIPSSKACGPFTNFNTTWEV----IPKTVSTFPS-SLQSFIHGVTSE-AFAVPFFM
     620       630       640           650        660        670   

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pF1KSD ALLLAVIYLNIQVVRGQRKVICLLKEQISNEGEDKIFLINKLHSIYERKEREERSRVGTT
        . : ..:. : .. ....:.  :.::.: :..:: .::.::                  
CCDS10 IICLIMFYF-IALAGAHKRVVIQLREQLSLESRDKCYLIQKLTEAQRDMRN         
           680        690       700       710       720            

     790       800     
pF1KSD EEAAAPPALLTDEQDA

>>CCDS73837.1 TMC7 gene_id:79905|Hs108|chr16              (758 aa)
 initn: 624 init1: 244 opt: 417  Z-score: 467.1  bits: 97.2 E(32554): 1.1e-19
Smith-Waterman score: 694; 26.6% identity (55.5% similar) in 719 aa overlap (103-758:24-701)

             80        90       100       110       120       130  
pF1KSD TQSTATLRILASMPSRTIGRSRGAIISQYYNRTVQLRCRSSRPLLGNFVRSAWPSLRLYD
                                     : ...  : :: :.  ::..   :: :  .
CCDS73        MSESSGSALQPGRPSRQPAVHPENLSLDSSCFSSPPV--NFLQEL-PSYR--S
                      10        20        30          40           

            140        150       160               170       180   
pF1KSD LELDPTALEEEEKQS-LLVKELQSLAVAQRD--------HMLRGMPLSLAEKRSLREKSR
       .    :... ..:::  :.:  .: .   .:        : ::.. :...::: ::. ..
CCDS73 IARRRTTVHSRDKQSGTLLKPTDSYSSQLEDRIAENLSSHSLRNYALNISEKRRLRDIQE
       50        60        70        80        90       100        

           190       200       210       220       230       240   
pF1KSD TPRGKWRGQPGSGGVCSCCGRLRYACVLALHSLGLALLSALQALMPWRYALKRIGGQFGS
       : . :. ..  .    :  .  :.       .  : :         ::  .. : :.::.
CCDS73 T-QMKYLSEWDQWKRYSSKSWKRFLEKAREMTTHLEL---------WREDIRSIEGKFGT
       110       120       130       140                150        

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pF1KSD SVLSYFLFLKTLLAFNALLLLLLVAFIMGPQVAFPPALPGPAPV----------CT----
       .. ::: ::. :. .: ...:..  ... : .     . . . :          ::    
CCDS73 GIQSYFSFLRFLVLLNLVIFLIIFMLVLLPVLLTKYKITNSSFVLIPFKDMDKQCTVYPV
      160       170       180       190       200       210        

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pF1KSD ---GL--------ELLTGAGCFTHTVMYYGHYSNATLNQPCGSPLDGSQCTPRVGGLPYN
          ::        .::.:.: . .: ..::::.           .::     .  .. :.
CCDS73 SSSGLIYFYSYIIDLLSGTGFLEETSLFYGHYT-----------IDGV----KFQNFTYD
      220       230       240       250                      260   

      340       350       360       370       380         390      
pF1KSD MPLAYLSTVGVSFFITCITLVYSMAHSFGESYRVGSTSGIHAIT--VFCSWDYKVTQKRA
       .::::: .. .:. .. . .:   ...:  .  . :   ...    .: .::. .:..  
CCDS73 LPLAYLLSTIASLALSLLWIVKRSVEGFKINL-IRSEEHFQSYCNKIFAGWDFCITNRSM
           270       280       290        300       310       320  

        400       410         420       430          440       450 
pF1KSD SRLQQDNIRTRLKELLAEWQLRH--SPRSVCGRLRQAAV---LGLVWLLCLGTALGCAVA
       . :.....: .:.  : : ..:.  . :.    .:  ..   :. . :  ::. .    .
CCDS73 ADLKHSSLRYELRADLEEERMRQKIAERTSEETIRIYSLRLFLNCIVLAVLGACFYAIYV
            330       340       350       360       370       380  

              460         470        480       490       500       
pF1KSD VHVFS-EFMIQSPEAA--GQEAVLLVLP-LVVGLLNLGAPYLCRVLAALEPHDSPVLEVY
       . ::: : : .  .    :..  .: :: .:. : :. .:..   .   : . :: .:. 
CCDS73 ATVFSQEHMKKEIDKMVFGENLFILYLPSIVITLANFITPMIFAKIIRYEDY-SPGFEIR
            390       400       410       420       430        440 

       510       520       530                    540       550    
pF1KSD VAICRNLILKLAILGTLCYHWLGRRV-----------GVLQG--QCWEDFVGQELYRFLV
       ..: : ....:: . .: .  :: ..           :  :    :::  ::::.:....
CCDS73 LTILRCVFMRLATICVLVFT-LGSKITSCDDDTCDLCGYNQKLYPCWETQVGQEMYKLMI
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pF1KSD MDFVLMLLDTLFGELVWRII-----SEKKLKRRRKPEFDIARNVLELIYGQTLTWLGVLF
       .::...:  ::: ..  ...     : : ..   . :: :  ::: ..::::. :.:..:
CCDS73 FDFIIILAVTLFVDFPRKLLVTYCSSCKLIQCWGQQEFAIPDNVLGIVYGQTICWIGAFF
              510       520       530       540       550       560

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pF1KSD SPLLPAVQIIKLLLVFYVKKTSLLANCQAPRRPWLASHMSTVFLTLLCFPAFLGAAVFLC
       ::::::.  .:....::::. ::: .:.   ::. ::. .  :: .: .   : : . : 
CCDS73 SPLLPAIATLKFIIIFYVKEWSLLYTCRPSPRPFRASNSNFFFLLVLLIGLCL-AIIPLT
              570       580       590       600       610          

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pF1KSD YAVWQVKPSSTCGPFRTLDTMYEAGRVWVRHLEAAGPRVSWLPWVHRYLMENTFFVFLVS
        .. ..  :..:::: ...: .:.    . .  .. :  :   ..:    : .: : .  
CCDS73 ISISRIPSSKACGPFTNFNTTWEV----IPKTVSTFPS-SLQSFIHGVTSE-AFAVPFFM
     620       630       640           650        660        670   

     730       740       750       760       770       780         
pF1KSD ALLLAVIYLNIQVVRGQRKVICLLKEQISNEGEDKIFLINKLHSIYERKEREERSRVGTT
        . : ..:. : .. ....:.  :.::.:                               
CCDS73 IICLIMFYF-IALAGAHKRVVIQLREQLSLVRKHSSRGSWLGTFTQDTARKVLFSWEGVK
           680        690       700       710       720       730  

>>CCDS32749.1 TMC8 gene_id:147138|Hs108|chr17             (726 aa)
 initn: 582 init1: 224 opt: 370  Z-score: 414.1  bits: 87.4 E(32554): 9.6e-17
Smith-Waterman score: 638; 29.6% identity (55.0% similar) in 665 aa overlap (165-771:36-646)

          140       150       160       170          180        190
pF1KSD LDPTALEEEEKQSLLVKELQSLAVAQRDHMLRGMPLSLAEKR---SLREKSRTPRGKW-R
                                     .::.: .. .::   .::: . .   .: :
CCDS32 SVSSERAPGVPEPEELWEAEMERLRGSGTPVRGLPYAMMDKRLIWQLREPAGVQTLRWQR
          10        20        30        40        50        60     

              200       210       220       230       240       250
pF1KSD GQPGSGGVCSCCGRLRYACVLALHSLGLALLSALQALMPWRYALKRIGGQFGSSVLSYFL
        :     :     ::: :     ..:::           :. :: .::: ::... ::: 
CCDS32 WQRRRQTVER---RLREAAQRLARGLGL-----------WEGALYEIGGLFGTGIRSYFT
          70           80        90                  100       110 

              260       270       280           290                
pF1KSD FLKTLLAFNALLLLLLVAFIMGPQVAFPPALPGPAPV----CTG---------------L
       ::. :: .: : ::: ..:.. : : . :  :::.      : :                
CCDS32 FLRFLLLLNLLSLLLTASFVLLPLVWLRPPDPGPTLNLTLQCPGSRQSPPGVLRFHNQLW
             120       130       140       150       160       170 

             300       310       320       330       340        350
pF1KSD ELLTGAGCFTHTVMYYGHYSNATLNQPCGSPLDGSQCTPRVGGLPYNMPLAYL-STVGVS
       ..::: . ::.: ..:: :  .    : .: .             :.. :::: : ..  
CCDS32 HVLTGRA-FTNTYLFYGAYRVG----PESSSV-------------YSIRLAYLLSPLACL
              180       190                        200       210   

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pF1KSD FFITCITLVYSMAHSFGESYRVGSTSGIHA---ITVFCSWDYKVTQKRASRLQQDNIRTR
       ..  : ::   :.... ..  .:.  : .:     :: :::. .  ..:. ... .: ..
CCDS32 LLCFCGTL-RRMVKGLPQKTLLGQ--GYQAPLSAKVFSSWDFCIRVQEAATIKKHEISNE
           220        230         240       250       260       270

       410          420          430       440       450       460 
pF1KSD LKELLAE---WQLRHSP---RSVCGRLRQAAVLGLVWLLCLGTALGCAVAVHVFSEFMIQ
       .:  : :   .:: ..    ...:  :    :  :  :: .:     :... .:  .  .
CCDS32 FKVELEEGRRFQLMQQQTRAQTACRLLSYLRVNVLNGLLVVG-----AISA-IF--WATK
              280       290       300       310               320  

             470           480       490       500       510       
pF1KSD SPEAAGQEAVLLVL----PLVVGLLNLGAPYLCRVLAALEPHDSPVLEVYVAICRNLILK
         .   .:...:.:    : :..:.:. .: :   :. :: .  :  :: ...   ..::
CCDS32 YSQDNKEESLFLLLQYLPPGVIALVNFLGPLLFTFLVQLENYP-PNTEVNLTLIWCVVLK
            330       340       350       360        370       380 

       520       530                      540       550       560  
pF1KSD LAILGTLCYHWLGRRV---------------GVLQGQCWEDFVGQELYRFLVMDFVLMLL
       :: :: .    ::. .               .: . ::::. ::.:::.. ...:.: . 
CCDS32 LASLGMFSVS-LGQTILCIGRDKSSCESYGYNVCDYQCWENSVGEELYKLSIFNFLLTVA
             390        400       410       420       430       440

            570       580           590       600       610        
pF1KSD DTLFGELVWRIISEKKLKRR----RKPEFDIARNVLELIYGQTLTWLGVLFSPLLPAVQI
        ...  :  :.. ..   :     .. :: . .:::... :::.::.:... :::: .. 
CCDS32 FAFLVTLPRRLLVDRFSGRFWAWLEREEFLVPKNVLDIVAGQTVTWMGLFYCPLLPLLNS
              450       460       470       480       490       500

      620       630       640       650       660       670        
pF1KSD IKLLLVFYVKKTSLLANCQAPRRPWLASHMSTVFLTLLCFPAFLGAAVFLCYAVWQVKPS
       . :.:.::.:: .:: : .:  ::. ::  :: :. :. . ..: ::: : :.: ... :
CCDS32 VFLFLTFYIKKYTLLKNSRASSRPFRASS-STFFFQLVLLLGLLLAAVPLGYVVSSIHSS
              510       520        530       540       550         

      680       690       700        710       720        730      
pF1KSD STCGPFRTLDTMYEAGRVWVRHLEAAG-PRVSWLPWVHRYLMENTF-FVFLVSALLLAVI
         :: :    : : :    : .: : : : ..    .: ::  ..: : .:.  .:  :.
CCDS32 WDCGLF----TNYSAPWQVVPELVALGLPPIGQRA-LH-YLGSHAFSFPLLI--MLSLVL
     560           570       580       590         600         610 

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pF1KSD YLNIQVVRGQRKVICLLKEQISNEGEDKIFLINKLHSIYERKEREERSRVGTTEEAAAPP
        . .. .... ..:  :..:.  . ..:  :.. :                         
CCDS32 TVCVSQTQANARAIHRLRKQLVWQVQEKWHLVEDLSRLLPEPGPSDSPGPKYPASQASRP
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        ..    :  :  : .:  .  .:. :... .     : :   :::   .  .::     
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         :.        .:..:.:: ..:::::::::... ::: .:. :: .:.:  .:.. . 
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       . :    . ::. :::          :   ::        .::.: : .  . ..:: : 
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             :   :       ::.. . :   : .  .::    . :. :.   . :  ..  
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       .. . .. . .  :: .::. .      ::.:  :  .::  : :  .:..   :..  .
CCDS12 LAESEALTSYSHRVFSAWDFGLCGDVHVRLRQRIILYELKVELEETVVRRQAAVRTLGQQ
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CCDS12 ARVWLVRVLLNLLVVALLGAAFYGVYWATGCTVELQ-EMPLV--QELPLLKLGVNYLPSI
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        .. .:.  : . ...: :: .      :.. . :...:.:: : .: .  :     :  
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CCDS12 SEAEDCKTCGYNYKQLPCWETVLGQEMYKLLLFDLLTVLAVALLIQFPRKLLCGLCPGAL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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