Result of SIM4 for pF1KSDF0136

seq1 = pF1KSDF0136.tfa, 2415 bp
seq2 = pF1KSDF0136/gi568815581r_78013151.tfa (gi568815581r:78013151_78226832), 213682 bp

>pF1KSDF0136 2415
>gi568815581r:78013151_78226832 (Chr17)

(complement)

1-56  (100001-100056)   100% ->
57-181  (100185-100309)   100% ->
182-271  (100467-100556)   100% ->
272-430  (100949-101107)   100% ->
431-536  (101570-101675)   100% ->
537-633  (101848-101944)   100% ->
634-891  (102052-102309)   100% ->
892-1082  (102654-102844)   100% ->
1083-1227  (104084-104228)   100% ->
1228-1383  (105122-105277)   100% ->
1384-1535  (105669-105820)   100% ->
1536-1715  (106001-106180)   100% ->
1716-1811  (107441-107536)   100% ->
1812-1887  (107787-107862)   100% ->
1888-2021  (108898-109031)   100% ->
2022-2198  (109189-109365)   100% ->
2199-2277  (109486-109564)   100% ->
2278-2354  (113209-113285)   100% ->
2355-2415  (113622-113682)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCAGCCACTGGCCTTCATCCTCGATGTCCCTGAGACCCCAGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCCAGCCACTGGCCTTCATCCTCGATGTCCCTGAGACCCCAGGGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCAGGG         CCAGGGCCCCAGCCCCTATGATGAAAGCGAAGTGC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCAGGGGTA...CAGCCAGGGCCCCAGCCCCTATGATGAAAGCGAAGTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACGACTCCTTCCAGCAGCTCATCCAGGAGCAGAGCCAGTGCACGGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100220 ACGACTCCTTCCAGCAGCTCATCCAGGAGCAGAGCCAGTGCACGGCCCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGGGGCTGGAGCTGCAGCAGAGAGAGCGGGAGGTGACAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100270 GAGGGGCTGGAGCTGCAGCAGAGAGAGCGGGAGGTGACAGGTG...TAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AAGTAGCCAGCAGACACTCTGGCGGCCCGAGGGCACCCAGAGCACGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100468 AAGTAGCCAGCAGACACTCTGGCGGCCCGAGGGCACCCAGAGCACGGCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CACTCCGCATCCTGGCCAGCATGCCCAGCCGCACCATTG         GC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100518 CACTCCGCATCCTGGCCAGCATGCCCAGCCGCACCATTGGTG...TAGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CGCAGCCGAGGTGCCATCATCTCCCAGTACTACAACCGCACGGTGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CGCAGCCGAGGTGCCATCATCTCCCAGTACTACAACCGCACGGTGCAGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TCGGTGCAGGAGCAGCCGGCCCCTGCTCGGGAACTTTGTCCGCTCCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TCGGTGCAGGAGCAGCCGGCCCCTGCTCGGGAACTTTGTCCGCTCCGCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GGCCCAGCCTCCGCCTGTACGACCTGGAGCTGGACCCCACGGCCCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GGCCCAGCCTCCGCCTGTACGACCTGGAGCTGGACCCCACGGCCCTGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAGGAGG         AGAAGCAGAGCCTCCTGGTGAAGGAGCTCCAGAG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GAGGAGGGTG...CAGAGAAGCAGAGCCTCCTGGTGAAGGAGCTCCAGAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CCTGGCAGTGGCACAGCGGGACCACATGCTTCGCGGGATGCCCTTAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101604 CCTGGCAGTGGCACAGCGGGACCACATGCTTCGCGGGATGCCCTTAAGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGGCTGAGAAACGCAGCCTGCG         AGAGAAGAGCAGGACCCCG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 101654 TGGCTGAGAAACGCAGCCTGCGGTG...CAGAGAGAAGAGCAGGACCCCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AGGGGGAAGTGGAGGGGCCAGCCGGGCAGCGGCGGGGTCTGCTCCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101867 AGGGGGAAGTGGAGGGGCCAGCCGGGCAGCGGCGGGGTCTGCTCCTGCTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGGCCGGCTCAGATATGCCTGCGTGCTG         GCCTTGCACAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 101917 TGGCCGGCTCAGATATGCCTGCGTGCTGGTA...CAGGCCTTGCACAGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TGGGCCTGGCGCTGCTCTCCGCCCTGCAGGCCCTGATGCCGTGGCGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102065 TGGGCCTGGCGCTGCTCTCCGCCCTGCAGGCCCTGATGCCGTGGCGCTAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GCCCTGAAGCGCATCGGGGGCCAGTTCGGCTCCAGCGTGCTCTCCTACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102115 GCCCTGAAGCGCATCGGGGGCCAGTTCGGCTCCAGCGTGCTCTCCTACTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CCTCTTTCTCAAGACCCTGCTGGCTTTCAATGCCCTCCTGCTGCTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102165 CCTCTTTCTCAAGACCCTGCTGGCTTTCAATGCCCTCCTGCTGCTGCTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TGGTGGCCTTCATCATGGGCCCTCAGGTCGCCTTCCCACCCGCCCTGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102215 TGGTGGCCTTCATCATGGGCCCTCAGGTCGCCTTCCCACCCGCCCTGCCG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GGCCCTGCCCCCGTCTGCACAGGCCTGGAGCTCCTCACAGGCGCG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 102265 GGCCCTGCCCCCGTCTGCACAGGCCTGGAGCTCCTCACAGGCGCGGTG..

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892     GGTTGCTTCACCCACACCGTCATGTACTACGGCCACTACAGTAACG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102315 .CAGGGTTGCTTCACCCACACCGTCATGTACTACGGCCACTACAGTAACG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CCACGCTGAACCAGCCGTGTGGCAGCCCCCTGGATGGCAGCCAGTGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102700 CCACGCTGAACCAGCCGTGTGGCAGCCCCCTGGATGGCAGCCAGTGCACA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CCCAGGGTGGGTGGCCTGCCCTACAACATGCCCCTGGCCTACCTCTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102750 CCCAGGGTGGGTGGCCTGCCCTACAACATGCCCCTGGCCTACCTCTCCAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TGTGGGCGTGAGCTTCTTTATCACCTGCATCACCCTGGTGTACAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 102800 TGTGGGCGTGAGCTTCTTTATCACCTGCATCACCCTGGTGTACAGGTA..

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083     CATGGCTCACTCTTTCGGGGAGAGCTACCGGGTGGGCAGCACCTCT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102850 .CAGCATGGCTCACTCTTTCGGGGAGAGCTACCGGGTGGGCAGCACCTCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GGCATCCACGCCATCACCGTCTTCTGCTCCTGGGACTACAAGGTGACGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104130 GGCATCCACGCCATCACCGTCTTCTGCTCCTGGGACTACAAGGTGACGCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 GAAGCGGGCCTCCCGCCTCCAGCAGGACAATATTCGCACCCGGCTGAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 104180 GAAGCGGGCCTCCCGCCTCCAGCAGGACAATATTCGCACCCGGCTGAAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1228         GAGCTGCTGGCCGAGTGGCAGCTGCGGCACAGCCCCAGGAGC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104230 TG...CAGGAGCTGCTGGCCGAGTGGCAGCTGCGGCACAGCCCCAGGAGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 GTGTGCGGGAGGCTGCGGCAGGCGGCTGTGCTGGGGCTTGTGTGGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105164 GTGTGCGGGAGGCTGCGGCAGGCGGCTGTGCTGGGGCTTGTGTGGCTGCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GTGTCTGGGGACCGCGCTGGGCTGCGCCGTGGCCGTCCACGTCTTCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105214 GTGTCTGGGGACCGCGCTGGGCTGCGCCGTGGCCGTCCACGTCTTCTCGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 AGTTCATGATCCAG         AGTCCAGAGGCTGCTGGCCAGGAGGCT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 105264 AGTTCATGATCCAGGTG...CAGAGTCCAGAGGCTGCTGGCCAGGAGGCT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 GTGCTGCTGGTCCTGCCCCTGGTGGTTGGCCTCCTCAACCTGGGGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105696 GTGCTGCTGGTCCTGCCCCTGGTGGTTGGCCTCCTCAACCTGGGGGCCCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 CTACCTGTGCCGTGTCCTGGCCGCCCTGGAGCCGCATGACTCCCCGGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105746 CTACCTGTGCCGTGTCCTGGCCGCCCTGGAGCCGCATGACTCCCCGGTAC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 TGGAGGTGTACGTGGCCATCTGCAG         GAACCTCATCCTCAAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 105796 TGGAGGTGTACGTGGCCATCTGCAGGTG...CAGGAACCTCATCCTCAAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 CTGGCCATCCTGGGGACACTGTGCTACCACTGGCTGGGCCGCAGGGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106017 CTGGCCATCCTGGGGACACTGTGCTACCACTGGCTGGGCCGCAGGGTGGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 CGTCCTGCAGGGCCAGTGCTGGGAGGATTTTGTGGGCCAGGAGCTGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106067 CGTCCTGCAGGGCCAGTGCTGGGAGGATTTTGTGGGCCAGGAGCTGTACC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 GGTTCCTGGTGATGGACTTCGTCCTCATGTTGCTGGACACGCTTTTTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106117 GGTTCCTGGTGATGGACTTCGTCCTCATGTTGCTGGACACGCTTTTTGGG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 GAACTGGTGTGGAG         GATTATCTCCGAGAAGAAGCTGAAGAG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 106167 GAACTGGTGTGGAGGTG...CAGGATTATCTCCGAGAAGAAGCTGAAGAG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 GAGGCGGAAGCCGGAGTTTGACATTGCCCGGAATGTCCTGGAGCTGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107468 GAGGCGGAAGCCGGAGTTTGACATTGCCCGGAATGTCCTGGAGCTGATTT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 ATGGGCAGACTCTGACCTG         GCTGGGGGTGCTCTTCTCGCCC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 107518 ATGGGCAGACTCTGACCTGGTG...CAGGCTGGGGGTGCTCTTCTCGCCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 CTCCTCCCCGCCGTGCAGATCATCAAGCTGCTGCTCGTCTTCTATGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107809 CTCCTCCCCGCCGTGCAGATCATCAAGCTGCTGCTCGTCTTCTATGTCAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 GAAG         ACCAGCCTTCTGGCCAACTGCCAGGCGCCGCGCCGGC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107859 GAAGGTG...CAGACCAGCCTTCTGGCCAACTGCCAGGCGCCGCGCCGGC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 CCTGGCTGGCCTCACACATGAGCACCGTCTTCCTCACGCTGCTCTGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108935 CCTGGCTGGCCTCACACATGAGCACCGTCTTCCTCACGCTGCTCTGCTTC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 CCCGCCTTCCTGGGCGCCGCTGTCTTCCTCTGCTACGCCGTCTGGCA   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 108985 CCCGCCTTCCTGGGCGCCGCTGTCTTCCTCTGCTACGCCGTCTGGCAGTG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2022       GGTGAAGCCCTCGAGCACCTGCGGCCCCTTCCGGACCCTGGACA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109035 ...CAGGGTGAAGCCCTCGAGCACCTGCGGCCCCTTCCGGACCCTGGACA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 CCATGTACGAGGCCGGCAGGGTGTGGGTGCGCCACCTGGAGGCGGCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109233 CCATGTACGAGGCCGGCAGGGTGTGGGTGCGCCACCTGGAGGCGGCAGGC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 CCCAGGGTCTCCTGGCTGCCCTGGGTGCACCGGTACCTGATGGAAAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109283 CCCAGGGTCTCCTGGCTGCCCTGGGTGCACCGGTACCTGATGGAAAACAC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 CTTCTTTGTCTTCCTGGTGTCAGCCCTGCTGCT         GGCCGTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 109333 CTTCTTTGTCTTCCTGGTGTCAGCCCTGCTGCTGTG...CAGGGCCGTGA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 TCTACCTCAACATCCAGGTGGTGCGGGGCCAGCGCAAGGTCATCTGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109494 TCTACCTCAACATCCAGGTGGTGCGGGGCCAGCGCAAGGTCATCTGCCTG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2257 CTCAAGGAGCAGATCAGCAAT         GAGGGTGAGGACAAAATCTT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 109544 CTCAAGGAGCAGATCAGCAATGTG...TAGGAGGGTGAGGACAAAATCTT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2298 CTTAATCAACAAGCTTCACTCCATCTACGAGAGGAAGGAGAGGGAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113229 CTTAATCAACAAGCTTCACTCCATCTACGAGAGGAAGGAGAGGGAGGAGA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2348 GGAGCAG         GGTTGGGACAACCGAGGAGGCTGCGGCACCCCCT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113279 GGAGCAGGTG...CAGGGTTGGGACAACCGAGGAGGCTGCGGCACCCCCT

   2550     .    :    .    :    .
   2389 GCCCTGCTCACAGATGAACAGGATGCC
        |||||||||||||||||||||||||||
 113656 GCCCTGCTCACAGATGAACAGGATGCC

Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com