Result of FASTA (ccds) for pF1KSDB1453
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDB1453, 465 aa
  1>>>pF1KSDB1453 465 - 465 aa - 465 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.5736+/-0.00145; mu= -24.9602+/- 0.082
 mean_var=444.0395+/-102.223, 0's: 0 Z-trim(106.1): 357  B-trim: 107 in 1/51
 Lambda= 0.060864
 statistics sampled from 8402 (8772) to 8402 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.622), E-opt: 0.2 (0.269), width:  16
 Scan time:  2.260

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS4822.1 STK38 gene_id:11329|Hs108|chr6          ( 465) 3106 288.1 1.4e-77
CCDS31761.1 STK38L gene_id:23012|Hs108|chr12       ( 464) 2707 253.0 4.8e-67
CCDS34551.1 LATS1 gene_id:9113|Hs108|chr6          (1130)  792 85.1 4.2e-16
CCDS9294.1 LATS2 gene_id:26524|Hs108|chr13         (1088)  787 84.6 5.5e-16
CCDS74400.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19          ( 530)  614 69.3 1.1e-11
CCDS46118.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19          ( 624)  614 69.3 1.3e-11
CCDS46117.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19          ( 625)  614 69.3 1.3e-11
CCDS12674.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19          ( 629)  614 69.3 1.3e-11
CCDS46119.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19          ( 639)  614 69.3 1.3e-11
CCDS31601.1 CDC42BPG gene_id:55561|Hs108|chr11     (1551)  622 70.2 1.7e-11
CCDS1559.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1        (1638)  605 68.8   5e-11
CCDS1558.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1        (1719)  605 68.8 5.2e-11
CCDS11870.2 ROCK1 gene_id:6093|Hs108|chr18         (1354)  599 68.2 6.1e-11
CCDS9978.1 CDC42BPB gene_id:9578|Hs108|chr14       (1711)  598 68.2 7.9e-11


>>CCDS4822.1 STK38 gene_id:11329|Hs108|chr6               (465 aa)
 initn: 3106 init1: 3106 opt: 3106  Z-score: 1506.5  bits: 288.1 E(32554): 1.4e-77
Smith-Waterman score: 3106; 100.0% identity (100.0% similar) in 465 aa overlap (1-465:1-465)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAMTGSTPCSSMSNHTKERVTMTKVTLENFYSNLIAQHEEREMRQKKLEKVMEEEGLKDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MAMTGSTPCSSMSNHTKERVTMTKVTLENFYSNLIAQHEEREMRQKKLEKVMEEEGLKDE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD EKRLRRSAHARKETEFLRLKRTRLGLEDFESLKVIGRGAFGEVRLVQKKDTGHVYAMKIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 EKRLRRSAHARKETEFLRLKRTRLGLEDFESLKVIGRGAFGEVRLVQKKDTGHVYAMKIL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD RKADMLEKEQVGHIRAERDILVEADSLWVVKMFYSFQDKLNLYLIMEFLPGGDMMTLLMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 RKADMLEKEQVGHIRAERDILVEADSLWVVKMFYSFQDKLNLYLIMEFLPGGDMMTLLMK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD KDTLTEEETQFYIAETVLAIDSIHQLGFIHRDIKPDNLLLDSKGHVKLSDFGLCTGLKKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 KDTLTEEETQFYIAETVLAIDSIHQLGFIHRDIKPDNLLLDSKGHVKLSDFGLCTGLKKA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD HRTEFYRNLNHSLPSDFTFQNMNSKRKAETWKRNRRQLAFSTVGTPDYIAPEVFMQTGYN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 HRTEFYRNLNHSLPSDFTFQNMNSKRKAETWKRNRRQLAFSTVGTPDYIAPEVFMQTGYN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD KLCDWWSLGVIMYEMLIGYPPFCSETPQETYKKVMNWKETLTFPPEVPISEKAKDLILRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 KLCDWWSLGVIMYEMLIGYPPFCSETPQETYKKVMNWKETLTFPPEVPISEKAKDLILRF
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD CCEWEHRIGAPGVEEIKSNSFFEGVDWEHIRERPAAISIEIKSIDDTSNFDEFPESDILK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 CCEWEHRIGAPGVEEIKSNSFFEGVDWEHIRERPAAISIEIKSIDDTSNFDEFPESDILK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460     
pF1KSD PTVATSNHPETDYKNKDWVFINYTYKRFEGLTARGAIPSYMKAAK
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PTVATSNHPETDYKNKDWVFINYTYKRFEGLTARGAIPSYMKAAK
              430       440       450       460     

>>CCDS31761.1 STK38L gene_id:23012|Hs108|chr12            (464 aa)
 initn: 2683 init1: 2493 opt: 2707  Z-score: 1317.1  bits: 253.0 E(32554): 4.8e-67
Smith-Waterman score: 2707; 86.9% identity (94.2% similar) in 466 aa overlap (1-465:1-463)

                10        20        30        40        50         
pF1KSD MAMT-GSTPCSSMSNHTKERVTMTKVTLENFYSNLIAQHEEREMRQKKLEKVMEEEGLKD
       :::: :.:    :::::.::::..:.:::::::::: :::::: :::::: .:::::: :
CCDS31 MAMTAGTTTTFPMSNHTRERVTVAKLTLENFYSNLILQHEERETRQKKLEVAMEEEGLAD
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KSD EEKRLRRSAHARKETEFLRLKRTRLGLEDFESLKVIGRGAFGEVRLVQKKDTGHVYAMKI
       :::.:::: ::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS31 EEKKLRRSQHARKETEFLRLKRTRLGLDDFESLKVIGRGAFGEVRLVQKKDTGHIYAMKI
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KSD LRKADMLEKEQVGHIRAERDILVEADSLWVVKMFYSFQDKLNLYLIMEFLPGGDMMTLLM
       :::.::::::::.:::::::::::::. :::::::::::: :::::::::::::::::::
CCDS31 LRKSDMLEKEQVAHIRAERDILVEADGAWVVKMFYSFQDKRNLYLIMEFLPGGDMMTLLM
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KSD KKDTLTEEETQFYIAETVLAIDSIHQLGFIHRDIKPDNLLLDSKGHVKLSDFGLCTGLKK
       ::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS31 KKDTLTEEETQFYISETVLAIDAIHQLGFIHRDIKPDNLLLDAKGHVKLSDFGLCTGLKK
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KSD AHRTEFYRNLNHSLPSDFTFQNMNSKRKAETWKRNRRQLAFSTVGTPDYIAPEVFMQTGY
       ::::::::::.:. ::::.::::::::::::::.::::::.:::::::::::::::::::
CCDS31 AHRTEFYRNLTHNPPSDFSFQNMNSKRKAETWKKNRRQLAYSTVGTPDYIAPEVFMQTGY
              250       260       270       280       290       300

     300       310       320       330       340       350         
pF1KSD NKLCDWWSLGVIMYEMLIGYPPFCSETPQETYKKVMNWKETLTFPPEVPISEKAKDLILR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::::::::::
CCDS31 NKLCDWWSLGVIMYEMLIGYPPFCSETPQETYRKVMNWKETLVFPPEVPISEKAKDLILR
              310       320       330       340       350       360

     360       370       380       390       400       410         
pF1KSD FCCEWEHRIGAPGVEEIKSNSFFEGVDWEHIRERPAAISIEIKSIDDTSNFDEFPESDIL
       :: . :.:::  ::::::.. ::::::::::::::::: :::::::::::::.:::::::
CCDS31 FCIDSENRIGNSGVEEIKGHPFFEGVDWEHIRERPAAIPIEIKSIDDTSNFDDFPESDIL
              370       380       390       400       410       420

     420       430       440       450       460      
pF1KSD KPTVATSNHPETDYKNKDWVFINYTYKRFEGLTARGAIPSYMKAAK 
       .:.    :  : :::.:::::.::::::::::: ::.::.::::.: 
CCDS31 QPV---PNTTEPDYKSKDWVFLNYTYKRFEGLTQRGSIPTYMKAGKL
                 430       440       450       460    

>>CCDS34551.1 LATS1 gene_id:9113|Hs108|chr6               (1130 aa)
 initn: 1205 init1: 731 opt: 792  Z-score: 402.6  bits: 85.1 E(32554): 4.2e-16
Smith-Waterman score: 1270; 43.7% identity (72.1% similar) in 444 aa overlap (24-448:640-1083)

                      10        20        30        40        50   
pF1KSD        MAMTGSTPCSSMSNHTKERVTMTKVTLENFYSNLIAQHEEREMRQKKLEKVME
                                     :  .:.   :.. .:..:  :.:.::. : 
CCDS34 ITTSPITVRKNKKDEERRESRIQSYSPQAFKFFMEQHVENVLKSHQQRLHRKKQLENEMM
     610       620       630       640       650       660         

            60        70        80        90       100       110   
pF1KSD EEGLKDEEKRLRRSAHARKETEFLRLKRTRLGLEDFESLKVIGRGAFGEVRLVQKKDTGH
       . ::... .   :.   .::....::::...    : ..:..: :::::: :..: ::  
CCDS34 RVGLSQDAQDQMRKMLCQKESNYIRLKRAKMDKSMFVKIKTLGIGAFGEVCLARKVDTKA
     670       680       690       700       710       720         

           120       130       140       150       160       170   
pF1KSD VYAMKILRKADMLEKEQVGHIRAERDILVEADSLWVVKMFYSFQDKLNLYLIMEFLPGGD
       .:: : ::: :.: ..::.:..::::::.:::. :::...:::::: :::..:...::::
CCDS34 LYATKTLRKKDVLLRNQVAHVKAERDILAEADNEWVVRLYYSFQDKDNLYFVMDYIPGGD
     730       740       750       760       770       780         

           180       190       200       210       220       230   
pF1KSD MMTLLMKKDTLTEEETQFYIAETVLAIDSIHQLGFIHRDIKPDNLLLDSKGHVKLSDFGL
       ::.::..   . :  ..::::: . :..:.:..:::::::::::.:.:  ::.::.::::
CCDS34 MMSLLIRMGIFPESLARFYIAELTCAVESVHKMGFIHRDIKPDNILIDRDGHIKLTDFGL
     790       800       810       820       830       840         

           240       250       260           270               280 
pF1KSD CTGLKKAHRTEFYRNLNHSLPSDFTFQNM----NSKRKAETWK----RNRRQ----LAFS
       :::.. .: ...:.. .:   ... :.:     .: : ..  :    :  ::    :: :
CCDS34 CTGFRWTHDSKYYQSGDHPRQDSMDFSNEWGDPSSCRCGDRLKPLERRAARQHQRCLAHS
     850       860       870       880       890       900         

             290       300       310       320       330       340 
pF1KSD TVGTPDYIAPEVFMQTGYNKLCDWWSLGVIMYEMLIGYPPFCSETPQETYKKVMNWKETL
        ::::.::::::...:::..::::::.:::..:::.: ::: ..:: ::  ::.::. .:
CCDS34 LVGTPNYIAPEVLLRTGYTQLCDWWSVGVILFEMLVGQPPFLAQTPLETQMKVINWQTSL
     910       920       930       940       950       960         

             350       360       370       380        390       400
pF1KSD TFPPEVPISEKAKDLILRFCCEWEHRIGAPGVEEIKSNSFFEGVDWEH-IRERPAAISIE
        .::.. .: .:.:::...:   : :.:  :..:::.. ::. .:.   .:.. :.   .
CCDS34 HIPPQAKLSPEASDLIIKLCRGPEDRLGKNGADEIKAHPFFKTIDFSSDLRQQSASYIPK
     970       980       990      1000      1010      1020         

              410       420       430             440       450    
pF1KSD IKSIDDTSNFDEFPESDILKPTVATSNHPETD---YKN---KDWVFINYTYKRFEGLTAR
       :    ::::::    . . .      :  .:    :::    . .: ..:..::      
CCDS34 ITHPTDTSNFDPVDPDKLWSDDNEEENVNDTLNGWYKNGKHPEHAFYEFTFRRFFDDNGY
    1030      1040      1050      1060      1070      1080         

          460                                   
pF1KSD GAIPSYMKAAK                              
                                                
CCDS34 PYNYPKPIEYEYINSQGSEQQSDEDDQNTGSEIKNRDLVYV
    1090      1100      1110      1120      1130

>>CCDS9294.1 LATS2 gene_id:26524|Hs108|chr13              (1088 aa)
 initn: 1248 init1: 756 opt: 787  Z-score: 400.5  bits: 84.6 E(32554): 5.5e-16
Smith-Waterman score: 1305; 44.0% identity (72.8% similar) in 464 aa overlap (24-465:603-1065)

                      10        20        30        40        50   
pF1KSD        MAMTGSTPCSSMSNHTKERVTMTKVTLENFYSNLIAQHEEREMRQKKLEKVME
                                     :  .:.   :.:  ....  :. .::. : 
CCDS92 IQTSPVPVRKNSRDEEKRESRIKSYSPYAFKFFMEQHVENVIKTYQQKVNRRLQLEQEMA
            580       590       600       610       620       630  

            60        70        80        90       100       110   
pF1KSD EEGLKDEEKRLRRSAHARKETEFLRLKRTRLGLEDFESLKVIGRGAFGEVRLVQKKDTGH
       . :: . :..  :.   .::... ::::...    : ..:..: :::::: :. : ::  
CCDS92 KAGLCEAEQEQMRKILYQKESNYNRLKRAKMDKSMFVKIKTLGIGAFGEVCLACKVDTHA
            640       650       660       670       680       690  

           120       130       140       150       160       170   
pF1KSD VYAMKILRKADMLEKEQVGHIRAERDILVEADSLWVVKMFYSFQDKLNLYLIMEFLPGGD
       .:::: ::: :.:...::.:..::::::.:::. ::::..:::::: .::..:...::::
CCDS92 LYAMKTLRKKDVLNRNQVAHVKAERDILAEADNEWVVKLYYSFQDKDSLYFVMDYIPGGD
            700       710       720       730       740       750  

           180       190       200       210       220       230   
pF1KSD MMTLLMKKDTLTEEETQFYIAETVLAIDSIHQLGFIHRDIKPDNLLLDSKGHVKLSDFGL
       ::.::.. ... :. ..::::: .:::.:.:..:::::::::::.:.:  ::.::.::::
CCDS92 MMSLLIRMEVFPEHLARFYIAELTLAIESVHKMGFIHRDIKPDNILIDLDGHIKLTDFGL
            760       770       780       790       800       810  

           240       250            260       270               280
pF1KSD CTGLKKAHRTEFYRNLNH----SL-PSDFTFQNMNSKRKAETWK----RNRRQ----LAF
       :::.. .: ...:.. .:    :. :::. ...... : ..  :    : :.:    :: 
CCDS92 CTGFRWTHNSKYYQKGSHVRQDSMEPSDL-WDDVSNCRCGDRLKTLEQRARKQHQRCLAH
            820       830       840        850       860       870 

              290       300       310       320       330       340
pF1KSD STVGTPDYIAPEVFMQTGYNKLCDWWSLGVIMYEMLIGYPPFCSETPQETYKKVMNWKET
       : ::::.::::::... ::..::::::.:::..:::.: ::: . :: ::  ::.::..:
CCDS92 SLVGTPNYIAPEVLLRKGYTQLCDWWSVGVILFEMLVGQPPFLAPTPTETQLKVINWENT
             880       890       900       910       920       930 

              350       360       370       380        390         
pF1KSD LTFPPEVPISEKAKDLILRFCCEWEHRIGAPGVEEIKSNSFFEGVDWEH-IRERPAAISI
       : .: .: .: .:.::: ..::  .::.:  :....:.. :: ..:.   ::..::    
CCDS92 LHIPAQVKLSPEARDLITKLCCSADHRLGRNGADDLKAHPFFSAIDFSSDIRKQPAPYVP
             940       950       960       970       980       990 

     400       410           420        430       440          450 
pF1KSD EIKSIDDTSNFD----EFPESDILK-PTVATSNHPETDYKNKDWVFINYTYKRF---EGL
        :.   ::::::    : : .:  .  : : ..    . :. . .: ..:..::   .: 
CCDS92 TISHPMDTSNFDPVDEESPWNDASEGSTKAWDTLTSPNNKHPEHAFYEFTFRRFFDDNGY
            1000      1010      1020      1030      1040      1050 

             460                            
pF1KSD TARGAIPSYMKAAK                       
         :   ::  .:..                       
CCDS92 PFRCPKPSGAEASQAESSDLESSDLVDQTEGCQPVYV
            1060      1070      1080        

>>CCDS74400.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19               (530 aa)
 initn: 933 init1: 379 opt: 614  Z-score: 323.0  bits: 69.3 E(32554): 1.1e-11
Smith-Waterman score: 906; 41.6% identity (68.0% similar) in 344 aa overlap (77-411:59-368)

         50        60        70        80        90       100      
pF1KSD KLEKVMEEEGLKDEEKRLRRSAHARKETEFLRLKRTRLGLEDFESLKVIGRGAFGEVRLV
                                     .:::..::  .::: :::::::::.:: .:
CCDS74 LLGVHQELGASELAQDKYVADFLQWAEPIVVRLKEVRLQRDDFEILKVIGRGAFSEVAVV
       30        40        50        60        70        80        

        110       120       130       140       150       160      
pF1KSD QKKDTGHVYAMKILRKADMLEKEQVGHIRAERDILVEADSLWVVKMFYSFQDKLNLYLIM
       . :.::.::::::. : :::.. .:. .: :::.::..:  :.... ..:::.  :::.:
CCDS74 KMKQTGQVYAMKIMNKWDMLKRGEVSCFREERDVLVNGDRRWITQLHFAFQDENYLYLVM
       90       100       110       120       130       140        

        170       180        190       200       210       220     
pF1KSD EFLPGGDMMTLLMK-KDTLTEEETQFYIAETVLAIDSIHQLGFIHRDIKPDNLLLDSKGH
       :.  :::..::: :  . .  : ..::.:: :.::::.:.::..::::::::.:::  ::
CCDS74 EYYVGGDLLTLLSKFGERIPAEMARFYLAEIVMAIDSVHRLGYVHRDIKPDNILLDRCGH
      150       160       170       180       190       200        

         230       240       250       260       270       280     
pF1KSD VKLSDFGLCTGLKKAHRTEFYRNLNHSLPSDFTFQNMNSKRKAETWKRNRRQLAFSTVGT
       ..:.::: :  :.                .: : ... .                  :::
CCDS74 IRLADFGSCLKLR----------------ADGTVRSLVA------------------VGT
      210       220                       230                      

         290              300       310       320       330        
pF1KSD PDYIAPEVFMQTG-------YNKLCDWWSLGVIMYEMLIGYPPFCSETPQETYKKVMNWK
       :::..::... .:       :.  ::::.:::. :::. :  :: ...  ::: :....:
CCDS74 PDYLSPEILQAVGGGPGTGSYGPECDWWALGVFAYEMFYGQTPFYADSTAETYGKIVHYK
          240       250       260       270       280       290    

      340        350       360       370       380       390       
pF1KSD ETLTFP-PEVPISEKAKDLILRFCCEWEHRIGAPGVEEIKSNSFFEGVDWEHIRERPAAI
       : :..:  .  . :.:.:.: :. :  : :.:  :. ..... :: :.::. .:.    .
CCDS74 EHLSLPLVDEGVPEEARDFIQRLLCPPETRLGRGGAGDFRTHPFFFGLDWDGLRDSVPPF
          300       310       320       330       340       350    

       400       410       420       430       440       450       
pF1KSD SIEIKSIDDTSNFDEFPESDILKPTVATSNHPETDYKNKDWVFINYTYKRFEGLTARGAI
       . ....  :: :::                                              
CCDS74 TPDFEGATDTCNFDLVEDGLTAMETLSDIREGAPLGVHLPFVGYSYSCMALRDSEVPGPT
          360       370       380       390       400       410    

>>CCDS46118.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19               (624 aa)
 initn: 933 init1: 379 opt: 614  Z-score: 322.0  bits: 69.3 E(32554): 1.3e-11
Smith-Waterman score: 906; 41.6% identity (68.0% similar) in 344 aa overlap (77-411:59-368)

         50        60        70        80        90       100      
pF1KSD KLEKVMEEEGLKDEEKRLRRSAHARKETEFLRLKRTRLGLEDFESLKVIGRGAFGEVRLV
                                     .:::..::  .::: :::::::::.:: .:
CCDS46 LLGVHQELGASELAQDKYVADFLQWAEPIVVRLKEVRLQRDDFEILKVIGRGAFSEVAVV
       30        40        50        60        70        80        

        110       120       130       140       150       160      
pF1KSD QKKDTGHVYAMKILRKADMLEKEQVGHIRAERDILVEADSLWVVKMFYSFQDKLNLYLIM
       . :.::.::::::. : :::.. .:. .: :::.::..:  :.... ..:::.  :::.:
CCDS46 KMKQTGQVYAMKIMNKWDMLKRGEVSCFREERDVLVNGDRRWITQLHFAFQDENYLYLVM
       90       100       110       120       130       140        

        170       180        190       200       210       220     
pF1KSD EFLPGGDMMTLLMK-KDTLTEEETQFYIAETVLAIDSIHQLGFIHRDIKPDNLLLDSKGH
       :.  :::..::: :  . .  : ..::.:: :.::::.:.::..::::::::.:::  ::
CCDS46 EYYVGGDLLTLLSKFGERIPAEMARFYLAEIVMAIDSVHRLGYVHRDIKPDNILLDRCGH
      150       160       170       180       190       200        

         230       240       250       260       270       280     
pF1KSD VKLSDFGLCTGLKKAHRTEFYRNLNHSLPSDFTFQNMNSKRKAETWKRNRRQLAFSTVGT
       ..:.::: :  :.                .: : ... .                  :::
CCDS46 IRLADFGSCLKLR----------------ADGTVRSLVA------------------VGT
      210       220                       230                      

         290              300       310       320       330        
pF1KSD PDYIAPEVFMQTG-------YNKLCDWWSLGVIMYEMLIGYPPFCSETPQETYKKVMNWK
       :::..::... .:       :.  ::::.:::. :::. :  :: ...  ::: :....:
CCDS46 PDYLSPEILQAVGGGPGTGSYGPECDWWALGVFAYEMFYGQTPFYADSTAETYGKIVHYK
          240       250       260       270       280       290    

      340        350       360       370       380       390       
pF1KSD ETLTFP-PEVPISEKAKDLILRFCCEWEHRIGAPGVEEIKSNSFFEGVDWEHIRERPAAI
       : :..:  .  . :.:.:.: :. :  : :.:  :. ..... :: :.::. .:.    .
CCDS46 EHLSLPLVDEGVPEEARDFIQRLLCPPETRLGRGGAGDFRTHPFFFGLDWDGLRDSVPPF
          300       310       320       330       340       350    

       400       410       420       430       440       450       
pF1KSD SIEIKSIDDTSNFDEFPESDILKPTVATSNHPETDYKNKDWVFINYTYKRFEGLTARGAI
       . ....  :: :::                                              
CCDS46 TPDFEGATDTCNFDLVEDGLTAMETLSDIREGAPLGVHLPFVGYSYSCMALRDSEVPGPT
          360       370       380       390       400       410    

>>CCDS46117.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19               (625 aa)
 initn: 933 init1: 379 opt: 614  Z-score: 322.0  bits: 69.3 E(32554): 1.3e-11
Smith-Waterman score: 906; 41.6% identity (68.0% similar) in 344 aa overlap (77-411:59-368)

         50        60        70        80        90       100      
pF1KSD KLEKVMEEEGLKDEEKRLRRSAHARKETEFLRLKRTRLGLEDFESLKVIGRGAFGEVRLV
                                     .:::..::  .::: :::::::::.:: .:
CCDS46 LLGVHQELGASELAQDKYVADFLQWAEPIVVRLKEVRLQRDDFEILKVIGRGAFSEVAVV
       30        40        50        60        70        80        

        110       120       130       140       150       160      
pF1KSD QKKDTGHVYAMKILRKADMLEKEQVGHIRAERDILVEADSLWVVKMFYSFQDKLNLYLIM
       . :.::.::::::. : :::.. .:. .: :::.::..:  :.... ..:::.  :::.:
CCDS46 KMKQTGQVYAMKIMNKWDMLKRGEVSCFREERDVLVNGDRRWITQLHFAFQDENYLYLVM
       90       100       110       120       130       140        

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pF1KSD EFLPGGDMMTLLMK-KDTLTEEETQFYIAETVLAIDSIHQLGFIHRDIKPDNLLLDSKGH
       :.  :::..::: :  . .  : ..::.:: :.::::.:.::..::::::::.:::  ::
CCDS46 EYYVGGDLLTLLSKFGERIPAEMARFYLAEIVMAIDSVHRLGYVHRDIKPDNILLDRCGH
      150       160       170       180       190       200        

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pF1KSD VKLSDFGLCTGLKKAHRTEFYRNLNHSLPSDFTFQNMNSKRKAETWKRNRRQLAFSTVGT
       ..:.::: :  :.                .: : ... .                  :::
CCDS46 IRLADFGSCLKLR----------------ADGTVRSLVA------------------VGT
      210       220                       230                      

         290              300       310       320       330        
pF1KSD PDYIAPEVFMQTG-------YNKLCDWWSLGVIMYEMLIGYPPFCSETPQETYKKVMNWK
       :::..::... .:       :.  ::::.:::. :::. :  :: ...  ::: :....:
CCDS46 PDYLSPEILQAVGGGPGTGSYGPECDWWALGVFAYEMFYGQTPFYADSTAETYGKIVHYK
          240       250       260       270       280       290    

      340        350       360       370       380       390       
pF1KSD ETLTFP-PEVPISEKAKDLILRFCCEWEHRIGAPGVEEIKSNSFFEGVDWEHIRERPAAI
       : :..:  .  . :.:.:.: :. :  : :.:  :. ..... :: :.::. .:.    .
CCDS46 EHLSLPLVDEGVPEEARDFIQRLLCPPETRLGRGGAGDFRTHPFFFGLDWDGLRDSVPPF
          300       310       320       330       340       350    

       400       410       420       430       440       450       
pF1KSD SIEIKSIDDTSNFDEFPESDILKPTVATSNHPETDYKNKDWVFINYTYKRFEGLTARGAI
       . ....  :: :::                                              
CCDS46 TPDFEGATDTCNFDLVEDGLTAMETLSDIREGAPLGVHLPFVGYSYSCMALRDSEVPGPT
          360       370       380       390       400       410    

>>CCDS12674.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19               (629 aa)
 initn: 934 init1: 380 opt: 614  Z-score: 321.9  bits: 69.3 E(32554): 1.3e-11
Smith-Waterman score: 908; 39.2% identity (65.8% similar) in 383 aa overlap (77-445:59-405)

         50        60        70        80        90       100      
pF1KSD KLEKVMEEEGLKDEEKRLRRSAHARKETEFLRLKRTRLGLEDFESLKVIGRGAFGEVRLV
                                     .:::..::  .::: :::::::::.:: .:
CCDS12 LLGVHQELGASELAQDKYVADFLQWAEPIVVRLKEVRLQRDDFEILKVIGRGAFSEVAVV
       30        40        50        60        70        80        

        110       120       130       140       150       160      
pF1KSD QKKDTGHVYAMKILRKADMLEKEQVGHIRAERDILVEADSLWVVKMFYSFQDKLNLYLIM
       . :.::.::::::. : :::.. .:. .: :::.::..:  :.... ..:::.  :::.:
CCDS12 KMKQTGQVYAMKIMNKWDMLKRGEVSCFREERDVLVNGDRRWITQLHFAFQDENYLYLVM
       90       100       110       120       130       140        

        170       180        190       200       210       220     
pF1KSD EFLPGGDMMTLLMK-KDTLTEEETQFYIAETVLAIDSIHQLGFIHRDIKPDNLLLDSKGH
       :.  :::..::: :  . .  : ..::.:: :.::::.:.::..::::::::.:::  ::
CCDS12 EYYVGGDLLTLLSKFGERIPAEMARFYLAEIVMAIDSVHRLGYVHRDIKPDNILLDRCGH
      150       160       170       180       190       200        

         230       240       250       260       270       280     
pF1KSD VKLSDFGLCTGLKKAHRTEFYRNLNHSLPSDFTFQNMNSKRKAETWKRNRRQLAFSTVGT
       ..:.::: :  :.                .: : ... .                  :::
CCDS12 IRLADFGSCLKLR----------------ADGTVRSLVA------------------VGT
      210       220                       230                      

         290              300       310       320       330        
pF1KSD PDYIAPEVFMQTG-------YNKLCDWWSLGVIMYEMLIGYPPFCSETPQETYKKVMNWK
       :::..::... .:       :.  ::::.:::. :::. :  :: ...  ::: :....:
CCDS12 PDYLSPEILQAVGGGPGTGSYGPECDWWALGVFAYEMFYGQTPFYADSTAETYGKIVHYK
          240       250       260       270       280       290    

      340        350       360       370       380       390       
pF1KSD ETLTFP-PEVPISEKAKDLILRFCCEWEHRIGAPGVEEIKSNSFFEGVDWEHIRERPAAI
       : :..:  .  . :.:.:.: :. :  : :.:  :. ..... :: :.::. .:.    .
CCDS12 EHLSLPLVDEGVPEEARDFIQRLLCPPETRLGRGGAGDFRTHPFFFGLDWDGLRDSVPPF
          300       310       320       330       340       350    

       400       410       420       430            440       450  
pF1KSD SIEIKSIDDTSNFDEFPESDILKPTVATSNHPETDYKNKDWV-----FINYTYKRFEGLT
       . ....  :: :::     : :   :. ...  .: ..   .     :..:.:       
CCDS12 TPDFEGATDTCNFDLV--EDGLTAMVSGGGETLSDIREGAPLGVHLPFVGYSYSCMALRD
          360       370         380       390       400       410  

            460                                                    
pF1KSD ARGAIPSYMKAAK                                               
                                                                   
CCDS12 SEVPGPTPMELEAEQLLEPHVQAPSLEPSVSPQDETAEVAVPAAVPAAEAEAEVTLRELQ
            420       430       440       450       460       470  

>>CCDS46119.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19               (639 aa)
 initn: 934 init1: 380 opt: 614  Z-score: 321.8  bits: 69.3 E(32554): 1.3e-11
Smith-Waterman score: 908; 39.2% identity (65.8% similar) in 383 aa overlap (77-445:69-415)

         50        60        70        80        90       100      
pF1KSD KLEKVMEEEGLKDEEKRLRRSAHARKETEFLRLKRTRLGLEDFESLKVIGRGAFGEVRLV
                                     .:::..::  .::: :::::::::.:: .:
CCDS46 EGGAFPLVSSALSGDPRFFSPTTPPAEPIVVRLKEVRLQRDDFEILKVIGRGAFSEVAVV
       40        50        60        70        80        90        

        110       120       130       140       150       160      
pF1KSD QKKDTGHVYAMKILRKADMLEKEQVGHIRAERDILVEADSLWVVKMFYSFQDKLNLYLIM
       . :.::.::::::. : :::.. .:. .: :::.::..:  :.... ..:::.  :::.:
CCDS46 KMKQTGQVYAMKIMNKWDMLKRGEVSCFREERDVLVNGDRRWITQLHFAFQDENYLYLVM
      100       110       120       130       140       150        

        170       180        190       200       210       220     
pF1KSD EFLPGGDMMTLLMK-KDTLTEEETQFYIAETVLAIDSIHQLGFIHRDIKPDNLLLDSKGH
       :.  :::..::: :  . .  : ..::.:: :.::::.:.::..::::::::.:::  ::
CCDS46 EYYVGGDLLTLLSKFGERIPAEMARFYLAEIVMAIDSVHRLGYVHRDIKPDNILLDRCGH
      160       170       180       190       200       210        

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pF1KSD VKLSDFGLCTGLKKAHRTEFYRNLNHSLPSDFTFQNMNSKRKAETWKRNRRQLAFSTVGT
       ..:.::: :  :.                .: : ... .                  :::
CCDS46 IRLADFGSCLKLR----------------ADGTVRSLVA------------------VGT
      220       230                       240                      

         290              300       310       320       330        
pF1KSD PDYIAPEVFMQTG-------YNKLCDWWSLGVIMYEMLIGYPPFCSETPQETYKKVMNWK
       :::..::... .:       :.  ::::.:::. :::. :  :: ...  ::: :....:
CCDS46 PDYLSPEILQAVGGGPGTGSYGPECDWWALGVFAYEMFYGQTPFYADSTAETYGKIVHYK
          250       260       270       280       290       300    

      340        350       360       370       380       390       
pF1KSD ETLTFP-PEVPISEKAKDLILRFCCEWEHRIGAPGVEEIKSNSFFEGVDWEHIRERPAAI
       : :..:  .  . :.:.:.: :. :  : :.:  :. ..... :: :.::. .:.    .
CCDS46 EHLSLPLVDEGVPEEARDFIQRLLCPPETRLGRGGAGDFRTHPFFFGLDWDGLRDSVPPF
          310       320       330       340       350       360    

       400       410       420       430            440       450  
pF1KSD SIEIKSIDDTSNFDEFPESDILKPTVATSNHPETDYKNKDWV-----FINYTYKRFEGLT
       . ....  :: :::     : :   :. ...  .: ..   .     :..:.:       
CCDS46 TPDFEGATDTCNFDLV--EDGLTAMVSGGGETLSDIREGAPLGVHLPFVGYSYSCMALRD
          370       380         390       400       410       420  

            460                                                    
pF1KSD ARGAIPSYMKAAK                                               
                                                                   
CCDS46 SEVPGPTPMELEAEQLLEPHVQAPSLEPSVSPQDETAEVAVPAAVPAAEAEAEVTLRELQ
            430       440       450       460       470       480  

>>CCDS31601.1 CDC42BPG gene_id:55561|Hs108|chr11          (1551 aa)
 initn: 1018 init1: 378 opt: 622  Z-score: 319.9  bits: 70.2 E(32554): 1.7e-11
Smith-Waterman score: 982; 43.2% identity (67.9% similar) in 377 aa overlap (78-445:60-398)

        50        60        70        80        90       100       
pF1KSD LEKVMEEEGLKDEEKRLRRSAHARKETEFLRLKRTRLGLEDFESLKVIGRGAFGEVRLVQ
                                     ..:. ::  .::: :::::::::::: .:.
CCDS31 LALHHELSSGPLRRERSVAQFLSWASPFVSKVKELRLQRDDFEILKVIGRGAFGEVTVVR
      30        40        50        60        70        80         

       110       120       130       140       150       160       
pF1KSD KKDTGHVYAMKILRKADMLEKEQVGHIRAERDILVEADSLWVVKMFYSFQDKLNLYLIME
       ..:::...:::.:.: .::.. ... .: :::.::..:: ::. . :.:::.  :::.:.
CCDS31 QRDTGQIFAMKMLHKWEMLKRAETACFREERDVLVKGDSRWVTTLHYAFQDEEYLYLVMD
      90       100       110       120       130       140         

       170       180        190       200       210       220      
pF1KSD FLPGGDMMTLLMK-KDTLTEEETQFYIAETVLAIDSIHQLGFIHRDIKPDNLLLDSKGHV
       .  :::..::: . .: :  : .:::.:: :::: :.::::..:::.::::.::: .::.
CCDS31 YYAGGDLLTLLSRFEDRLPPELAQFYLAEMVLAIHSLHQLGYVHRDVKPDNVLLDVNGHI
     150       160       170       180       190       200         

        230       240       250       260       270       280      
pF1KSD KLSDFGLCTGLKKAHRTEFYRNLNHSLPSDFTFQNMNSKRKAETWKRNRRQLAFSTVGTP
       .:.::: :  :          : :  . :. .                        ::::
CCDS31 RLADFGSCLRL----------NTNGMVDSSVA------------------------VGTP
     210       220                 230                             

        290            300       310       320       330       340 
pF1KSD DYIAPEVF--MQTG---YNKLCDWWSLGVIMYEMLIGYPPFCSETPQETYKKVMNWKETL
       :::.::..  :. :   :.  ::::::::  ::.:.:  :: .:.  ::: :.:: .. :
CCDS31 DYISPEILQAMEEGKGHYGPQCDWWSLGVCAYELLFGETPFYAESLVETYGKIMNHEDHL
         240       250       260       270       280       290     

              350       360       370       380       390       400
pF1KSD TFPPEVP-ISEKAKDLILRFCCEWEHRIGAPGVEEIKSNSFFEGVDWEHIRERPAAISIE
        :::.:: .  .:.::: .. :. :.:.:  :....... ::::::::..    :    :
CCDS31 QFPPDVPDVPASAQDLIRQLLCRQEERLGRGGLDDFRNHPFFEGVDWERLASSTAPYIPE
         300       310       320       330       340       350     

              410       420         430       440       450        
pF1KSD IKSIDDTSNFDEFPESDILK-P-TVATSNHPETDYKNKDWVFINYTYKRFEGLTARGAIP
       ...  ::::::   ..: :. : :.   .:    ....   :...::             
CCDS31 LRGPMDTSNFD--VDDDTLNHPGTLPPPSHGA--FSGHHLPFVGFTYTSGSHSPESSSEA
         360         370       380         390       400       410 

      460                                                          
pF1KSD SYMKAAK                                                     
                                                                   
CCDS31 WAALERKLQCLEQEKVELSRKHQEALHAPTDHRELEQLRKEVQTLRDRLPEMLRDKASLS
             420       430       440       450       460       470 




465 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 08:36:38 2016 done: Thu Nov  3 08:36:38 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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