seq1 = pF1KSDB1316.tfa, 2586 bp seq2 = pF1KSDB1316/gi568815589r_89278707.tfa (gi568815589r:89278707_89505456), 226750 bp >pF1KSDB1316 2586 >gi568815589r:89278707_89505456 (Chr9) (complement) 1-106 (100001-100106) 100% -> 107-252 (102441-102586) 100% -> 253-315 (106119-106181) 100% -> 316-414 (108622-108720) 100% -> 415-508 (111802-111895) 100% -> 509-622 (112921-113034) 100% -> 623-774 (114042-114193) 100% -> 775-950 (116410-116585) 100% -> 951-1107 (116665-116821) 99% -> 1108-1330 (117849-118071) 100% -> 1331-1446 (118975-119090) 100% -> 1447-1619 (124111-124283) 100% -> 1620-1663 (124359-124402) 100% -> 1664-2586 (125828-126750) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGAGGATGTGCACCCCCATTAGGGGGCTGCTCATGGCCCTTGCAGTGAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGAGGATGTGCACCCCCATTAGGGGGCTGCTCATGGCCCTTGCAGTGAT 50 . : . : . : . : . : 51 GTTTGGGACAGCGATGGCATTTGCACCCATACCCCGGATCACCTGGGAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 GTTTGGGACAGCGATGGCATTTGCACCCATACCCCGGATCACCTGGGAGC 100 . : . : . : . : . : 101 ACAGAG AGGTGCACCTGGTGCAGTTTCATGAGCCAGACATC ||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100101 ACAGAGGTG...CAGAGGTGCACCTGGTGCAGTTTCATGAGCCAGACATC 150 . : . : . : . : . : 142 TACAACTACTCAGCCTTGCTGCTGAGCGAGGACAAGGACACCTTGTACAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102476 TACAACTACTCAGCCTTGCTGCTGAGCGAGGACAAGGACACCTTGTACAT 200 . : . : . : . : . : 192 AGGTGCCCGGGAGGCGGTCTTCGCTGTGAACGCACTCAACATCTCCGAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102526 AGGTGCCCGGGAGGCGGTCTTCGCTGTGAACGCACTCAACATCTCCGAGA 250 . : . : . : . : . : 242 AGCAGCATGAG GTGTATTGGAAGGTCTCAGAAGACAAAAAA |||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||| 102576 AGCAGCATGAGGTA...CAGGTGTATTGGAAGGTCTCAGAAGACAAAAAA 300 . : . : . : . : . : 283 GCAAAATGTGCAGAAAAGGGGAAATCAAAACAG ACAGAGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||| 106149 GCAAAATGTGCAGAAAAGGGGAAATCAAAACAGGTA...CAGACAGAGTG 350 . : . : . : . : . : 324 CCTCAACTACATCCGGGTGCTGCAGCCACTCAGCGCCACTTCCCTTTACG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108630 CCTCAACTACATCCGGGTGCTGCAGCCACTCAGCGCCACTTCCCTTTACG 400 . : . : . : . : . : 374 TGTGTGGGACCAACGCATTCCAGCCGGCCTGTGACCACCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>> 108680 TGTGTGGGACCAACGCATTCCAGCCGGCCTGTGACCACCTGGTA...TAG 450 . : . : . : . : . : 415 AACTTAACATCCTTTAAGTTTCTGGGGAAAAATGAAGATGGCAAAGGAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 111802 AACTTAACATCCTTTAAGTTTCTGGGGAAAAATGAAGATGGCAAAGGAAG 500 . : . : . : . : . : 465 ATGTCCCTTTGACCCAGCACACAGCTACACATCCGTCATGGTTG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>... 111852 ATGTCCCTTTGACCCAGCACACAGCTACACATCCGTCATGGTTGGTG... 550 . : . : . : . : . : 509 ATGGAGAACTTTATTCGGGGACGTCGTATAATTTTTTGGGAAGTGAA >>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112918 CAGATGGAGAACTTTATTCGGGGACGTCGTATAATTTTTTGGGAAGTGAA 600 . : . : . : . : . : 556 CCCATCATCTCCCGAAATTCTTCCCACAGTCCTCTGAGGACAGAATATGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112968 CCCATCATCTCCCGAAATTCTTCCCACAGTCCTCTGAGGACAGAATATGC 650 . : . : . : . : . : 606 AATCCCTTGGCTGAACG AGCCTAGTTTCGTGTTTGCTGACG |||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||| 113018 AATCCCTTGGCTGAACGGTA...CAGAGCCTAGTTTCGTGTTTGCTGACG 700 . : . : . : . : . : 647 TGATCCGAAAAAGCCCAGACAGCCCCGACGGCGAGGATGACAGGGTCTAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114066 TGATCCGAAAAAGCCCAGACAGCCCCGACGGCGAGGATGACAGGGTCTAC 750 . : . : . : . : . : 697 TTCTTCTTCACGGAGGTGTCTGTGGAGTATGAGTTTGTGTTCAGGGTGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114116 TTCTTCTTCACGGAGGTGTCTGTGGAGTATGAGTTTGTGTTCAGGGTGCT 800 . : . : . : . : . : 747 GATCCCACGGATAGCAAGAGTGTGCAAG GGGGACCAGGGCG ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||| 114166 GATCCCACGGATAGCAAGAGTGTGCAAGGTG...TAGGGGGACCAGGGCG 850 . : . : . : . : . : 788 GCCTGAGGACCTTGCAGAAGAAATGGACCTCCTTCCTGAAAGCCCGACTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116423 GCCTGAGGACCTTGCAGAAGAAATGGACCTCCTTCCTGAAAGCCCGACTC 900 . : . : . : . : . : 838 ATCTGCTCCCGGCCAGACAGCGGCTTGGTCTTCAATGTGCTGCGGGATGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116473 ATCTGCTCCCGGCCAGACAGCGGCTTGGTCTTCAATGTGCTGCGGGATGT 950 . : . : . : . : . : 888 CTTCGTGCTCAGGTCCCCGGGCCTGAAGGTGCCTGTGTTCTATGCACTCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116523 CTTCGTGCTCAGGTCCCCGGGCCTGAAGGTGCCTGTGTTCTATGCACTCT 1000 . : . : . : . : . : 938 TCACCCCACAGCT GAACAACGTGGGGCTGTCGGCAGTGTGC |||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||| 116573 TCACCCCACAGCTGTA...CAGGAACAACGTGGGGCTGTCGGCAGTGTGC 1050 . : . : . : . : . : 979 ACCTACAACCTGTCCACAGCCGAGGAGGTCTTCTCCCACGGGAAGTACAT ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116693 GCCTACAACCTGTCCACAGCCGAGGAGGTCTTCTCCCACGGGAAGTACAT 1100 . : . : . : . : . : 1029 GCAGAGCACCACAGTGGAGCAGTCCCACACCAAGTGGGTGCGCTATAATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116743 GCAGAGCACCACAGTGGAGCAGTCCCACACCAAGTGGGTGCGCTATAATG 1150 . : . : . : . : . : 1079 GCCCGGTACCCAAGCCGCGGCCTGGAGCG TGCATCGACAGC |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||| 116793 GCCCGGTACCCAAGCCGCGGCCTGGAGCGGTG...CAGTGCATCGACAGC 1200 . : . : . : . : . : 1120 GAGGCACGGGCCGCCAACTACACCAGCTCCTTGAATTTGCCAGACAAGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 117861 GAGGCACGGGCCGCCAACTACACCAGCTCCTTGAATTTGCCAGACAAGAC 1250 . : . : . : . : . : 1170 GCTGCAGTTCGTTAAAGACCACCCTTTGATGGATGACTCGGTAACCCCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 117911 GCTGCAGTTCGTTAAAGACCACCCTTTGATGGATGACTCGGTAACCCCAA 1300 . : . : . : . : . : 1220 TAGACAACAGGCCCAGGTTAATCAAGAAAGATGTGAACTACACCCAGATC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 117961 TAGACAACAGGCCCAGGTTAATCAAGAAAGATGTGAACTACACCCAGATC 1350 . : . : . : . : . : 1270 GTGGTGGACCGGACCCAGGCCCTGGATGGGACTGTCTATGATGTCATGTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 118011 GTGGTGGACCGGACCCAGGCCCTGGATGGGACTGTCTATGATGTCATGTT 1400 . : . : . : . : . : 1320 TGTCAGCACAG ACCGGGGAGCTCTGCACAAAGCCATCAGCC |||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||| 118061 TGTCAGCACAGGTG...CAGACCGGGGAGCTCTGCACAAAGCCATCAGCC 1450 . : . : . : . : . : 1361 TCGAGCACGCTGTTCACATCATCGAGGAGACCCAGCTCTTCCAGGACTTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 119005 TCGAGCACGCTGTTCACATCATCGAGGAGACCCAGCTCTTCCAGGACTTT 1500 . : . : . : . : . : 1411 GAGCCAGTCCAGACCCTGCTGCTGTCTTCAAAGAAG GGCAA ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||| 119055 GAGCCAGTCCAGACCCTGCTGCTGTCTTCAAAGAAGGTA...CAGGGCAA 1550 . : . : . : . : . : 1452 CAGGTTTGTCTATGCTGGCTCTAACTCGGGCGTGGTCCAGGCCCCGCTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 124116 CAGGTTTGTCTATGCTGGCTCTAACTCGGGCGTGGTCCAGGCCCCGCTGG 1600 . : . : . : . : . : 1502 CCTTCTGTGGGAAGCACGGCACCTGCGAGGACTGTGTGCTGGCGCGGGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 124166 CCTTCTGTGGGAAGCACGGCACCTGCGAGGACTGTGTGCTGGCGCGGGAC 1650 . : . : . : . : . : 1552 CCCTACTGCGCCTGGAGCCCGCCCACAGCGACCTGCGTGGCTCTGCACCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 124216 CCCTACTGCGCCTGGAGCCCGCCCACAGCGACCTGCGTGGCTCTGCACCA 1700 . : . : . : . : . : 1602 GACCGAGAGCCCCAGCAG GGGTTTGATTCAGGAGATGAGCG ||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||| 124266 GACCGAGAGCCCCAGCAGGTA...CAGGGGTTTGATTCAGGAGATGAGCG 1750 . : . : . : . : . : 1643 GCGATGCTTCTGTGTGCCCGG ATAAAAGTAAAGGAAGTTAC |||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||| 124382 GCGATGCTTCTGTGTGCCCGGGTG...CAGATAAAAGTAAAGGAAGTTAC 1800 . : . : . : . : . : 1684 CGGCAGCATTTTTTCAAGCACGGTGGCACAGCGGAACTGAAATGCTCCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 125848 CGGCAGCATTTTTTCAAGCACGGTGGCACAGCGGAACTGAAATGCTCCCA 1850 . : . : . : . : . : 1734 AAAATCCAACCTGGCCCGGGTCTTTTGGAAGTTCCAGAATGGCGTGTTGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 125898 AAAATCCAACCTGGCCCGGGTCTTTTGGAAGTTCCAGAATGGCGTGTTGA 1900 . : . : . : . : . : 1784 AGGCCGAGAGCCCCAAGTACGGTCTTATGGGCAGAAAAAACTTGCTCATC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 125948 AGGCCGAGAGCCCCAAGTACGGTCTTATGGGCAGAAAAAACTTGCTCATC 1950 . : . : . : . : . : 1834 TTCAACTTGTCAGAAGGAGACAGTGGGGTGTACCAGTGCCTGTCAGAGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 125998 TTCAACTTGTCAGAAGGAGACAGTGGGGTGTACCAGTGCCTGTCAGAGGA 2000 . : . : . : . : . : 1884 GAGGGTTAAGAACAAAACGGTCTTCCAAGTGGTCGCCAAGCACGTCCTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 126048 GAGGGTTAAGAACAAAACGGTCTTCCAAGTGGTCGCCAAGCACGTCCTGG 2050 . : . : . : . : . : 1934 AAGTGAAGGTGGTTCCAAAGCCCGTAGTGGCCCCCACCTTGTCAGTTGTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 126098 AAGTGAAGGTGGTTCCAAAGCCCGTAGTGGCCCCCACCTTGTCAGTTGTT 2100 . : . : . : . : . : 1984 CAGACAGAAGGTAGTAGGATTGCCACCAAAGTGTTGGTGGCATCCACCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 126148 CAGACAGAAGGTAGTAGGATTGCCACCAAAGTGTTGGTGGCATCCACCCA 2150 . : . : . : . : . : 2034 AGGGTCTTCTCCCCCAACCCCAGCCGTGCAGGCCACCTCCTCCGGGGCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 126198 AGGGTCTTCTCCCCCAACCCCAGCCGTGCAGGCCACCTCCTCCGGGGCCA 2200 . : . : . : . : . : 2084 TCACCCTTCCTCCCAAGCCTGCGCCCACCGGCACATCCTGCGAACCAAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 126248 TCACCCTTCCTCCCAAGCCTGCGCCCACCGGCACATCCTGCGAACCAAAG 2250 . : . : . : . : . : 2134 ATCGTCATCAACACGGTCCCCCAGCTCCACTCGGAGAAAACCATGTATCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 126298 ATCGTCATCAACACGGTCCCCCAGCTCCACTCGGAGAAAACCATGTATCT 2300 . : . : . : . : . : 2184 TAAGTCCAGCGACAACCGCCTCCTCATGTCCCTCTTCCTCTTCTTCTTTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 126348 TAAGTCCAGCGACAACCGCCTCCTCATGTCCCTCTTCCTCTTCTTCTTTG 2350 . : . : . : . : . : 2234 TTCTCTTCCTCTGCCTCTTTTTCTACAACTGCTATAAGGGATACCTGCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 126398 TTCTCTTCCTCTGCCTCTTTTTCTACAACTGCTATAAGGGATACCTGCCC 2400 . : . : . : . : . : 2284 AGACAGTGCTTGAAATTCCGCTCGGCCCTACTAATTGGGAAGAAGAAGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 126448 AGACAGTGCTTGAAATTCCGCTCGGCCCTACTAATTGGGAAGAAGAAGCC 2450 . : . : . : . : . : 2334 CAAGTCAGATTTCTGTGACCGTGAGCAGAGCCTGAAGGAGACGTTAGTAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 126498 CAAGTCAGATTTCTGTGACCGTGAGCAGAGCCTGAAGGAGACGTTAGTAG 2500 . : . : . : . : . : 2384 AGCCAGGGAGCTTCTCCCAGCAGAATGGGGAGCACCCCAAGCCAGCCCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 126548 AGCCAGGGAGCTTCTCCCAGCAGAATGGGGAGCACCCCAAGCCAGCCCTG 2550 . : . : . : . : . : 2434 GACACCGGCTATGAGACCGAGCAAGACACCATCACCAGCAAAGTCCCCAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 126598 GACACCGGCTATGAGACCGAGCAAGACACCATCACCAGCAAAGTCCCCAC 2600 . : . : . : . : . : 2484 GGATAGGGAGGACTCACAGAGGATCGACGACCTTTCTGCCAGGGACAAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 126648 GGATAGGGAGGACTCACAGAGGATCGACGACCTTTCTGCCAGGGACAAGC 2650 . : . : . : . : . : 2534 CCTTTGACGTCAAGTGTGAGCTGAAGTTCGCTGACTCAGACGCAGATGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 126698 CCTTTGACGTCAAGTGTGAGCTGAAGTTCGCTGACTCAGACGCAGATGGA 2700 2584 GAC ||| 126748 GAC