Result of FASTA (ccds) for pF1KSDB0064
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDB0064, 832 aa
  1>>>pF1KSDB0064 832 - 832 aa - 832 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.4170+/-0.00121; mu= -18.2929+/- 0.073
 mean_var=629.7171+/-129.764, 0's: 0 Z-trim(116.6): 50  B-trim: 188 in 1/54
 Lambda= 0.051109
 statistics sampled from 17165 (17209) to 17165 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.783), E-opt: 0.2 (0.529), width:  16
 Scan time:  5.160

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS30744.1 SGIP1 gene_id:84251|Hs108|chr1         ( 828) 5432 415.9 1.4e-115
CCDS76171.1 SGIP1 gene_id:84251|Hs108|chr1         ( 631) 2537 202.3 2.1e-51
CCDS54868.1 FCHO2 gene_id:115548|Hs108|chr5        ( 777) 1347 114.7 6.5e-25
CCDS47230.1 FCHO2 gene_id:115548|Hs108|chr5        ( 810) 1347 114.7 6.7e-25
CCDS59366.1 FCHO1 gene_id:23149|Hs108|chr19        ( 839) 1059 93.4 1.7e-18
CCDS32955.1 FCHO1 gene_id:23149|Hs108|chr19        ( 889) 1059 93.5 1.8e-18
CCDS59365.1 FCHO1 gene_id:23149|Hs108|chr19        ( 891) 1040 92.1 4.7e-18


>>CCDS30744.1 SGIP1 gene_id:84251|Hs108|chr1              (828 aa)
 initn: 5456 init1: 5246 opt: 5432  Z-score: 2188.3  bits: 415.9 E(32554): 1.4e-115
Smith-Waterman score: 5432; 97.0% identity (97.8% similar) in 832 aa overlap (1-832:1-828)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MMEGLKKRTRKAFGIRKKEKDTDSTGSPDRDGIQGKKKTQKTQLLLTSCFWLRALSLTLS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::: . . .      . :   :  .  .:
CCDS30 MMEGLKKRTRKAFGIRKKEKDTDSTGSPDRDGIQPSPH-EPPYNSKAEC--AREGGKKVS
               10        20        30         40          50       

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD QKKSNGAPNGFYAEIDWERYNSPELDEEGYSIRPEEPGSTKGKHFYSSSESEEEEESHKK
        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 -KKSNGAPNGFYAEIDWERYNSPELDEEGYSIRPEEPGSTKGKHFYSSSESEEEEESHKK
         60        70        80        90       100       110      

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD FNIKIKPLQSKDILRNAATVDELKASIGNIALSPSPVRKSPRRSPGAIKRNLSSEEVARP
       ::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 FNIKIKPLQSKDILKNAATVDELKASIGNIALSPSPVRKSPRRSPGAIKRNLSSEEVARP
        120       130       140       150       160       170      

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD RRSTPTPELISKKPPDDTTALAPLFGPPLESAFDEQKTEVLLDQPEIWGSGQPINPSMES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RRSTPTPELISKKPPDDTTALAPLFGPPLESAFDEQKTEVLLDQPEIWGSGQPINPSMES
        180       190       200       210       220       230      

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD PKLTRPFPTGTPPPLPPKNVPATPPRTGSPLTIGPGNDQSATEVKIEKLPSINDLDSIFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PKLTRPFPTGTPPPLPPKNVPATPPRTGSPLTIGPGNDQSATEVKIEKLPSINDLDSIFG
        240       250       260       270       280       290      

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD PVLSPKSVAVNAEEKWVHFSDTSPEHVTPELTPREKVVSPPATPDNPADSPAPGPLGPPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PVLSPKSVAVNAEEKWVHFSDTSPEHVTPELTPREKVVSPPATPDNPADSPAPGPLGPPG
        300       310       320       330       340       350      

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD PTGPPGPPGPPRNVLSPLNLEEVQKKVAEQTFIKDDYLETISSPKDFGLGQRATPPPPPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PTGPPGPPGPPRNVLSPLNLEEVQKKVAEQTFIKDDYLETISSPKDFGLGQRATPPPPPP
        360       370       380       390       400       410      

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD PTYRTVVSSPGPGSGPGPGTTSGASSPARPATPLVPCRSTTPPPPPPRPPSRPKLPPGKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PTYRTVVSSPGPGSGPGPGTTSGASSPARPATPLVPCRSTTPPPPPPRPPSRPKLPPGKP
        420       430       440       450       460       470      

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD GVGDVSRPFSPPIHSSSPPPIAPLARAESTSSISSTNSLSAATTPTVENEQPSLVWFDRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 GVGDVSRPFSPPIHSSSPPPIAPLARAESTSSISSTNSLSAATTPTVENEQPSLVWFDRG
        480       490       500       510       520       530      

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD KFYLTFEGSSRGPSPLTMGAQDTLPVAAAFTETVNAYFKGADPSKCIVKITGEMVLSFPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 KFYLTFEGSSRGPSPLTMGAQDTLPVAAAFTETVNAYFKGADPSKCIVKITGEMVLSFPA
        540       550       560       570       580       590      

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD GITRHFANNPSPAALTFRVINFSRLEHVLPNPQLLCCDNTQNDANTKEFWVNMPNLMTHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 GITRHFANNPSPAALTFRVINFSRLEHVLPNPQLLCCDNTQNDANTKEFWVNMPNLMTHL
        600       610       620       630       640       650      

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD KKVSEQKPQATYYNVDMLKYQVSAQGIQSTPLNLAVNWRCEPSSTDLRIDYKYNTDAMTT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 KKVSEQKPQATYYNVDMLKYQVSAQGIQSTPLNLAVNWRCEPSSTDLRIDYKYNTDAMTT
        660       670       680       690       700       710      

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD AVALNNVQFLVPIDGGVTKLQAVLPPAVWNAEQQRILWKIPDISQKSENGGVGSLLARFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 AVALNNVQFLVPIDGGVTKLQAVLPPAVWNAEQQRILWKIPDISQKSENGGVGSLLARFQ
        720       730       740       750       760       770      

              790       800       810       820       830  
pF1KSD LSEGPSKPSPLVVQFTSEGSTLSGCDIELVGAGYRFSLIKKRFAAGKYLADN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LSEGPSKPSPLVVQFTSEGSTLSGCDIELVGAGYRFSLIKKRFAAGKYLADN
        780       790       800       810       820        

>>CCDS76171.1 SGIP1 gene_id:84251|Hs108|chr1              (631 aa)
 initn: 2526 init1: 1914 opt: 2537  Z-score: 1036.2  bits: 202.3 E(32554): 2.1e-51
Smith-Waterman score: 3645; 73.3% identity (74.2% similar) in 836 aa overlap (1-832:1-631)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MMEGLKKRTRKAFGIRKKEKDTDSTGSPDRDGIQGKKKTQKTQLLLTSCFWLRALSLTLS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::                           
CCDS76 MMEGLKKRTRKAFGIRKKEKDTDSTGSPDRDGI---------------------------
               10        20        30                              

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD QKKSNGAPNGFYAEIDWERYNSPELDEEGYSIRPEEPGSTKGKHFYSSSESEEEEESHKK
        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 -KKSNGAPNGFYAEIDWERYNSPELDEEGYSIRPEEPGSTKGKHFYSSSESEEEEESHKK
             40        50        60        70        80        90  

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD FNIKIKPLQSKDILRNAATVDELKASIGNIALSPSPVRKSPRRSPGAIKRNLSSEEVARP
       ::::::::::::::.::::::::::::::::::::::        :::::::::::::::
CCDS76 FNIKIKPLQSKDILKNAATVDELKASIGNIALSPSPV--------GAIKRNLSSEEVARP
            100       110       120               130       140    

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD RRSTPTPELISKKPPDDTTALAPLFGPPLESAFDEQKTEVLLDQPEIWGSGQPINPSMES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 RRSTPTPELISKKPPDDTTALAPLFGPPLESAFDEQKTEVLLDQPEIWGSGQPINPSMES
          150       160       170       180       190       200    

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD PKLTRPFPTGTPPPLPPKNVPATPPRTGSPLTIGPGNDQSATEVKIEKLPSINDLDSIFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::                        
CCDS76 PKLTRPFPTGTPPPLPPKNVPATPPRTGSPLTIGPG------------------------
          210       220       230       240                        

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD PVLSPKSVAVNAEEKWVHFSDTSPEHVTPELTPREKVVSPPATPDNPADSPAPGPLGPPG
                                                                   
CCDS76 ------------------------------------------------------------
                                                                   

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD PTGPPGPPGPPRNVLSPLNLEEVQKKVAEQTFIKDDYLETISSPKDFGLGQRATPPPPPP
                                                                   
CCDS76 ------------------------------------------------------------
                                                                   

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD PTYRTVVSSPGPGSGPGPGTTSGASSPARPATPLVPCRSTTPPPPPPRPPSRPKLPPGKP
                              :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 -----------------------ASSPARPATPLVPCRSTTPPPPPPRPPSRPKLPPGKP
                                     250       260       270       

              490       500       510       520       530          
pF1KSD GVGDVSRPFSPPIHSSSPPPIAPLARAESTSSISSTNSLSAATTPTVENEQPSLVWFDR-
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .:.   :..:. 
CCDS76 GVGDVSRPFSPPIHSSSPPPIAPLARAESTSSISSTNSLSAATTPTVVSEDD--VFYDKL
       280       290       300       310       320         330     

     540          550       560       570       580       590      
pF1KSD GKFYLTFE---GSSRGPSPLTMGAQDTLPVAAAFTETVNAYFKGADPSKCIVKITGEMVL
        .:    :   :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PSFERRCETPAGSSRGPSPLTMGAQDTLPVAAAFTETVNAYFKGADPSKCIVKITGEMVL
         340       350       360       370       380       390     

        600       610       620       630       640       650      
pF1KSD SFPAGITRHFANNPSPAALTFRVINFSRLEHVLPNPQLLCCDNTQNDANTKEFWVNMPNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SFPAGITRHFANNPSPAALTFRVINFSRLEHVLPNPQLLCCDNTQNDANTKEFWVNMPNL
         400       410       420       430       440       450     

        660       670       680       690       700       710      
pF1KSD MTHLKKVSEQKPQATYYNVDMLKYQVSAQGIQSTPLNLAVNWRCEPSSTDLRIDYKYNTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MTHLKKVSEQKPQATYYNVDMLKYQVSAQGIQSTPLNLAVNWRCEPSSTDLRIDYKYNTD
         460       470       480       490       500       510     

        720       730       740       750       760       770      
pF1KSD AMTTAVALNNVQFLVPIDGGVTKLQAVLPPAVWNAEQQRILWKIPDISQKSENGGVGSLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 AMTTAVALNNVQFLVPIDGGVTKLQAVLPPAVWNAEQQRILWKIPDISQKSENGGVGSLL
         520       530       540       550       560       570     

        780       790       800       810       820       830  
pF1KSD ARFQLSEGPSKPSPLVVQFTSEGSTLSGCDIELVGAGYRFSLIKKRFAAGKYLADN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ARFQLSEGPSKPSPLVVQFTSEGSTLSGCDIELVGAGYRFSLIKKRFAAGKYLADN
         580       590       600       610       620       630 

>>CCDS54868.1 FCHO2 gene_id:115548|Hs108|chr5             (777 aa)
 initn: 1380 init1: 897 opt: 1347  Z-score: 560.8  bits: 114.7 E(32554): 6.5e-25
Smith-Waterman score: 1651; 42.2% identity (65.7% similar) in 740 aa overlap (112-831:106-776)

              90       100       110       120       130       140 
pF1KSD SPELDEEGYSIRPEEPGSTKGKHFYSSSESEEEEESHKKFNIKIKPLQSKDILRNAATVD
                                     ::. .:::: . ..    . . ...  .. 
CCDS54 FKTSTEKLANCHLDLVRKLQELIKEVQKYGEEQVKSHKKTKEEVAG--TLEAVQTIQSIT
          80        90       100       110       120         130   

              150       160       170       180       190       200
pF1KSD E-LKASIGNIALSPSPVRKSPRRSPGAIKRNLSSEEVARPRRSTPTPELISKKPPDDTTA
       . :. :  :   . . :..   .. :: .:.. .  : . ...: : .:  .:      :
CCDS54 QALQKSKENY--NAKCVEQERLKKEGATQREIEKAAV-KSKKATDTYKLYVEK-----YA
           140         150       160        170       180          

              210       220       230       240         250        
pF1KSD LAPLFGPPLESAFDEQKTEVLLDQPEIWGSGQPINPSMES--PKLTRPFPTGTPPPL---
       ::       .. :... ::.   . :. ..    : ..::   :...   ::   :    
CCDS54 LA-------KADFEQKMTETAQVHEEFINNMA--NTTVESLIQKFAESKGTGKERPGLIE
                190       200       210         220       230      

              260       270          280       290         300     
pF1KSD -----PPKNVPATPPRTGSPLTIGPG---NDQSATEVKIEKLPSIN--DLDSIFGPVLSP
              . : .  ::  . ... ::   ....:  :.     :.:  :.:   :  ..:
CCDS54 FEECDTASAVEGIKPRKRKTFAL-PGIIKKEKDAESVECPDADSLNIPDVDE-EGYSIKP
        240       250        260       270       280        290    

         310       320       330       340       350       360     
pF1KSD KSVAVNAEEKWVHFSDTSPEHVTPELTPREKVVSPPATPDNPADSPAPGPLGPPGPTGPP
       ..   ...:.  :: ..:      :   . ..   :  :.:   . :       .  .  
CCDS54 ETNQNDTKEN--HFYSSSDSDSEDEEPKKYRIEIKPMHPNNSHHTMASLDELKVSIGNIT
          300         310       320       330       340       350  

         370       380       390       400       410       420     
pF1KSD GPPGPPRNVLSPLNLEEVQKKVAEQTFIKDDYLETISSPKDFGLGQRATPPPPPPPTYRT
         :.  :.  ::....   ...... . :       :.:         . ::    :   
CCDS54 LSPAISRH--SPVQMN---RNLSNEELTK-------SKP---------SAPPNEKGTSDL
            360            370                       380       390 

         430         440       450       460       470        480  
pF1KSD VVSSP--GPGSGPGPGTTSGASSPARPATPLVPCRSTTPPPPPPRPPSRPKLPPGK-PGV
       .. .:  ::.   . ...  .:: :::.:::    :.    ::::: :::::  ::  :.
CCDS54 LAWDPLFGPSLDSSSSSSLTSSSSARPTTPL----SVGTIVPPPRPASRPKLTSGKLSGI
             400       410       420           430       440       

            490        500       510       520       530       540 
pF1KSD GDVSRPFSPPIHS-SSPPPIAPLARAESTSSISSTNSLSAATTPTVENEQPSLVWFDRGK
       ... ::::::. : .:::: ::::::::.:::::. :::::.::::              
CCDS54 NEIPRPFSPPVTSNTSPPPAAPLARAESSSSISSSASLSAANTPTV--------------
       450       460       470       480       490                 

             550       560       570       580       590       600 
pF1KSD FYLTFEGSSRGPSPLTMGAQDTLPVAAAFTETVNAYFKGADPSKCIVKITGEMVLSFPAG
             : ::::::...: :::::::.:.::.::::::::::.::::::::.:..:::.:
CCDS54 ------GVSRGPSPVSLGNQDTLPVAVALTESVNAYFKGADPTKCIVKITGDMTMSFPSG
                 500       510       520       530       540       

             610       620       630       640       650       660 
pF1KSD ITRHFANNPSPAALTFRVINFSRLEHVLPNPQLLCCDNTQNDANTKEFWVNMPNLMTHLK
       : . :..::.::.: ::: :.::::..::: ::.  : .: :.:::.::.::  . ..::
CCDS54 IIKVFTSNPTPAVLCFRVKNISRLEQILPNAQLVFSDPSQCDSNTKDFWMNMQAVTVYLK
       550       560       570       580       590       600       

             670       680       690       700       710       720 
pF1KSD KVSEQKPQATYYNVDMLKYQVSAQGIQSTPLNLAVNWRCEPSSTDLRIDYKYNTDAMTTA
       :.:::.: :.:::::.::::::..::::::::::. :.:  :.::::.::::: .::.. 
CCDS54 KLSEQNPAASYYNVDVLKYQVSSNGIQSTPLNLATYWKCSASTTDLRVDYKYNPEAMVAP
       610       620       630       640       650       660       

             730       740       750       760       770       780 
pF1KSD VALNNVQFLVPIDGGVTKLQAVLPPAVWNAEQQRILWKIPDISQKSENGGVGSLLARFQL
        .:.:.: .::.:::::..:. ::::.:::::.. .::. .::.:::::: ::: :.:.:
CCDS54 SVLSNIQVVVPVDGGVTNMQS-LPPAIWNAEQMKAFWKLSSISEKSENGGSGSLRAKFDL
       670       680        690       700       710       720      

             790       800       810       820       830  
pF1KSD SEGPSKPSPLVVQFTSEGSTLSGCDIELVGAGYRFSLIKKRFAAGKYLADN
       :::::::. :.::: :::::::: :.::::.:::.::::::::.:.:::: 
CCDS54 SEGPSKPTTLAVQFLSEGSTLSGVDFELVGTGYRLSLIKKRFATGRYLADC
        730       740       750       760       770       

>>CCDS47230.1 FCHO2 gene_id:115548|Hs108|chr5             (810 aa)
 initn: 1380 init1: 897 opt: 1347  Z-score: 560.6  bits: 114.7 E(32554): 6.7e-25
Smith-Waterman score: 1642; 48.2% identity (70.2% similar) in 581 aa overlap (260-831:279-809)

     230       240       250       260       270          280      
pF1KSD SGQPINPSMESPKLTRPFPTGTPPPLPPKNVPATPPRTGSPLTIGPG---NDQSATEVKI
                                     : .  ::  . ... ::   ....:  :. 
CCDS47 SLIQKFAESKGTGKERPGLIEFEECDTASAVEGIKPRKRKTFAL-PGIIKKEKDAESVEC
      250       260       270       280       290        300       

        290         300       310       320       330       340    
pF1KSD EKLPSIN--DLDSIFGPVLSPKSVAVNAEEKWVHFSDTSPEHVTPELTPREKVVSPPATP
           :.:  :.:   :  ..:..   ...:.  :: ..:      :   . ..   :  :
CCDS47 PDADSLNIPDVDE-EGYSIKPETNQNDTKEN--HFYSSSDSDSEDEEPKKYRIEIKPMHP
       310       320        330         340       350       360    

          350       360       370       380       390       400    
pF1KSD DNPADSPAPGPLGPPGPTGPPGPPGPPRNVLSPLNLEEVQKKVAEQTFIKDDYLETISSP
       .:   . :       .  .    :.  :.  ::...   ....... . :       :.:
CCDS47 NNSHHTMASLDELKVSIGNITLSPAISRH--SPVQM---NRNLSNEELTK-------SKP
          370       380       390            400              410  

          410       420       430         440       450       460  
pF1KSD KDFGLGQRATPPPPPPPTYRTVVSSP--GPGSGPGPGTTSGASSPARPATPLVPCRSTTP
                . ::    :   .. .:  ::.   . ...  .:: :::.:::    :.  
CCDS47 ---------SAPPNEKGTSDLLAWDPLFGPSLDSSSSSSLTSSSSARPTTPL----SVGT
                     420       430       440       450             

            470        480       490        500       510       520
pF1KSD PPPPPRPPSRPKLPPGK-PGVGDVSRPFSPPIHS-SSPPPIAPLARAESTSSISSTNSLS
         ::::: :::::  ::  :.... ::::::. : .:::: ::::::::.:::::. :::
CCDS47 IVPPPRPASRPKLTSGKLSGINEIPRPFSPPVTSNTSPPPAAPLARAESSSSISSSASLS
     460       470       480       490       500       510         

              530       540       550       560       570       580
pF1KSD AATTPTVENEQPSLVWFDRGKFYLTFEGSSRGPSPLTMGAQDTLPVAAAFTETVNAYFKG
       ::.::::                    : ::::::...: :::::::.:.::.:::::::
CCDS47 AANTPTV--------------------GVSRGPSPVSLGNQDTLPVAVALTESVNAYFKG
     520                           530       540       550         

              590       600       610       620       630       640
pF1KSD ADPSKCIVKITGEMVLSFPAGITRHFANNPSPAALTFRVINFSRLEHVLPNPQLLCCDNT
       :::.::::::::.:..:::.:: . :..::.::.: ::: :.::::..::: ::.  : .
CCDS47 ADPTKCIVKITGDMTMSFPSGIIKVFTSNPTPAVLCFRVKNISRLEQILPNAQLVFSDPS
     560       570       580       590       600       610         

              650       660       670       680       690       700
pF1KSD QNDANTKEFWVNMPNLMTHLKKVSEQKPQATYYNVDMLKYQVSAQGIQSTPLNLAVNWRC
       : :.:::.::.::  . ..:::.:::.: :.:::::.::::::..::::::::::. :.:
CCDS47 QCDSNTKDFWMNMQAVTVYLKKLSEQNPAASYYNVDVLKYQVSSNGIQSTPLNLATYWKC
     620       630       640       650       660       670         

              710       720       730       740       750       760
pF1KSD EPSSTDLRIDYKYNTDAMTTAVALNNVQFLVPIDGGVTKLQAVLPPAVWNAEQQRILWKI
         :.::::.::::: .::..  .:.:.: .::.:::::..:. ::::.:::::.. .::.
CCDS47 SASTTDLRVDYKYNPEAMVAPSVLSNIQVVVPVDGGVTNMQS-LPPAIWNAEQMKAFWKL
     680       690       700       710       720        730        

              770       780       790       800       810       820
pF1KSD PDISQKSENGGVGSLLARFQLSEGPSKPSPLVVQFTSEGSTLSGCDIELVGAGYRFSLIK
        .::.:::::: ::: :.:.::::::::. :.::: :::::::: :.::::.:::.::::
CCDS47 SSISEKSENGGSGSLRAKFDLSEGPSKPTTLAVQFLSEGSTLSGVDFELVGTGYRLSLIK
      740       750       760       770       780       790        

              830  
pF1KSD KRFAAGKYLADN
       ::::.:.:::: 
CCDS47 KRFATGRYLADC
      800       810

>>CCDS59366.1 FCHO1 gene_id:23149|Hs108|chr19             (839 aa)
 initn: 1164 init1: 455 opt: 1059  Z-score: 445.6  bits: 93.4 E(32554): 1.7e-18
Smith-Waterman score: 1142; 35.1% identity (61.6% similar) in 606 aa overlap (254-829:251-836)

           230       240       250       260       270       280   
pF1KSD QPEIWGSGQPINPSMESPKLTRPFPTGTPPPLPPKNVPATPPRTGSPLTIGPGNDQSATE
                                     : ::  :    : .:.     :  :. .  
CCDS59 YSAAALQEAMKRLRGAKAFRLPGLSRREREPEPPAAVDFLEPDSGT----CPEVDEEGFT
              230       240       250       260           270      

           290       300       310       320        330       340  
pF1KSD VKIEKLPSINDLDSIFGPVLSPKSVAVNAEEKWVHFSDTSPEHV-TPELTPREKVVSPPA
       :.    :.... ..     .: ..   . ::    .   .:  . .:  .:.  ...  :
CCDS59 VR----PDVTQNSTAEPSRFSSSDSDFDDEEPRKFYVHIKPAPARAPACSPEAAAAQLRA
            280       290       300       310       320       330  

            350        360       370       380       390           
pF1KSD TPDNPADSPAPG-PLGPPGPTGPPGPPGPPRNVLSPLNLEEVQKKVAEQTFIKDDY---L
       :  .    :.::  .   .     : :  ::.  .: .   ...  .:.   :. .   :
CCDS59 TAGSLILPPGPGGTMKRHSSRDAAGKPQRPRS--APRTSSCAERLQSEEQVSKNLFGPPL
            340       350       360         370       380       390

      400           410           420       430       440       450
pF1KSD ETISSPKDF----GLGQRATPPP----PPPPTYRTVVSSPGPGSGPGPGTTSGASSPARP
       :.  . .::    .::  ..: :     :  .  . ..::.  ..:::.  : .  :. :
CCDS59 ESAFDHEDFTGSSSLGFTSSPSPFSSSSPENVEDSGLDSPSH-AAPGPSPDSWVPRPGTP
              400       410       420       430        440         

               460             470         480             490     
pF1KSD ATPLVP-CRSTTPPPP------PPRPPSRPKLP--PGKPGV-----GDV-SRPFSPPIHS
        .:  : ::.  :::       :: : :   :   ::  :.     ::.   : .:  . 
CCDS59 QSP--PSCRA--PPPEARGIRAPPLPDSPQPLASSPGPWGLEALAGGDLMPAPADPTARE
     450           460       470       480       490       500     

          500       510       520       530       540        550   
pF1KSD S-SPPPIAPLARAESTSSISSTNSLSAATTPTVENEQPSLVWFDRGKFY-LTFEGSSRGP
       . . ::    .:  :     :...:: . .:.  . . . . ..: .:   : .: ::::
CCDS59 GLAAPPRRLRSRKVSCPLTRSNGDLSRSLSPSPLGSSAASTALERPSFLSQTGHGVSRGP
         510       520       530       540       550       560     

           560       570       580       590       600       610   
pF1KSD SPLTMGAQDTLPVAAAFTETVNAYFKGADPSKCIVKITGEMVLSFPAGITRHFANNPSPA
       ::...:.::.::.:.:::: :.:::.: .:: :....:::....:::::.: :...: : 
CCDS59 SPVVLGSQDALPIATAFTEYVHAYFRGHSPS-CLARVTGELTMTFPAGIVRVFSGTPPPP
         570       580       590        600       610       620    

           620       630       640       650       660       670   
pF1KSD ALTFRVINFSRLEHVLPNPQLLCCDNTQNDANTKEFWVNMPNLMTHLKKVSEQKPQATYY
       .:.::... . .::  :: .::  : .:.: .::.::.::  :   :.. .::.: :.::
CCDS59 VLSFRLVHTTAIEHFQPNADLLFSDPSQSDPETKDFWLNMAALTEALQRQAEQNPTASYY
          630       640       650       660       670       680    

           680       690       700       710       720       730   
pF1KSD NVDMLKYQVSAQGIQSTPLNLAVNWRCEPSSTDLRIDYKYNTDAMTTAVALNNVQFLVPI
       :: .:.:: :  : ::.::.:...:.:  . :.. ..: :   : .. . :.:::.:.:.
CCDS59 NVVLLRYQFSRPGPQSVPLQLSAHWQCGATLTQVSVEYGYRPGATAVPTPLTNVQILLPV
          690       700       710       720       730       740    

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          ::... . : :.:: :..:. :..::.   :: :: : : : ..   ::: :::...
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       ::::::.:::: :.::::.:::.::.:.:::.: ::   
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       ::...:.::.::.:.:::: :.:::.: .:: :....:::....:::::.: :...: : 
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       .:.::... . .::  :: .::  : .:.: .::.::.::  :   :.. .::.: :.::
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       :: .:.:: :  : ::.::.:...:.:  . :.. ..: :   : .. . :.:::.:.:.
CCDS32 NVVLLRYQFSRPGPQSVPLQLSAHWQCGATLTQVSVEYGYRPGATAVPTPLTNVQILLPV
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CCDS32 GEPVTNVR-LQPAATWNLEEKRLTWRLPDV---SEAGGSGRLSASWEPLSGPSTPSPVAA
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pF1KSD QFTSEGSTLSGCDIELVGAGYRFSLIKKRFAAGKYLADN
       ::::::.:::: :.::::.:::.::.:.:::.: ::   
CCDS32 QFTSEGTTLSGVDLELVGSGYRMSLVKRRFATGMYLVSC
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832 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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 start: Thu Nov  3 08:28:22 2016 done: Thu Nov  3 08:28:23 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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