seq1 = pF1KSDB0064.tfa, 2496 bp seq2 = pF1KSDB0064/gi568815597f_66525845.tfa (gi568815597f:66525845_66841442), 315598 bp >pF1KSDB0064 2496 >gi568815597f:66525845_66841442 (Chr1) 9-74 (100001-100066) 100% -> 75-99 (107226-107250) 100% -> 100-183 (108236-108319) 100% -> 184-240 (113933-113989) 100% -> 241-299 (116966-117025) 96% <- 300-471 (117704-117875) 99% == 495-520 (145150-145175) 100% -> 521-572 (146100-146151) 100% -> 573-658 (147437-147522) 100% -> 659-751 (151160-151252) 100% -> 752-826 (153834-153908) 100% -> 827-1327 (156025-156525) 100% -> 1328-1455 (163304-163431) 100% -> 1456-1582 (164346-164472) 100% -> 1583-1642 (169590-169649) 98% -> 1643-1754 (193450-193561) 100% -> 1755-1910 (203420-203575) 100% -> 1911-2043 (207904-208036) 100% -> 2044-2246 (213491-213693) 100% -> 2247-2311 (214814-214878) 100% -> 2312-2476 (215428-215592) 100% -> 2477-2496 (217229-217248) 100% 0 . : . : . : . : . : 9 AGGATTGAAAAAACGTACAAGGAAGGCCTTTGGAATACGGAAGAAAGAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 AGGATTGAAAAAACGTACAAGGAAGGCCTTTGGAATACGGAAGAAAGAAA 50 . : . : . : . : . : 59 AGGACACTGATTCTAC AGGTTCACCAGATAGAGATGGAATT ||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||| 100051 AGGACACTGATTCTACGTA...CAGAGGTTCACCAGATAGAGATGGAATT 100 . : . : . : . : . : 100 CAGGGGAAAAAAAAGACCCAGAAGACTCAGCTTCTCCTCAC >>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107251 GTA...CAGCAGGGGAAAAAAAAGACCCAGAAGACTCAGCTTCTCCTCAC 150 . : . : . : . : . : 141 CTCTTGCTTCTGGCTCAGAGCCCTCTCGTTAACTCTGTCTCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...> 108277 CTCTTGCTTCTGGCTCAGAGCCCTCTCGTTAACTCTGTCTCAGGTA...C 200 . : . : . : . : . : 184 AAGAAAAGCAATGGGGCACCAAATGGATTTTATGCGGAAATTGATTGG >>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 113931 AGAAGAAAAGCAATGGGGCACCAAATGGATTTTATGCGGAAATTGATTGG 250 . : . : . : . : . : 232 GAAAGATAT AACTCACCTGAGCTGGATGAAGAAGGCTACAG |||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||| 113981 GAAAGATATGTG...TAGAACTCACCTGAGCTGGATGAAGAAGGCTACAG 300 . : . : . : . : . : 273 CATCAGACCCGAGGAACCCGGCTCTA C CAAAGGAAAGCAC ||||||||||||||||||||||| ||-|<<<...<<<||||||||||||| 116998 CATCAGACCCGAGGAACCCGGCTATATCCTT...TACCAAAGGAAAGCAC 350 . : . : . : . : . : 313 TTTTATTCTTCAAGTGAATCGGAAGAAGAAGAAGAATCACATAAGAAATT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 117717 TTTTATTCTTCAAGTGAATCGGAAGAAGAAGAAGAATCACATAAGAAATT 400 . : . : . : . : . : 363 TAATATCAAGATTAAACCATTGCAATCTAAAGACATTCTTAGGAATGCTG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| 117767 TAATATCAAGATTAAACCATTGCAATCTAAAGACATTCTTAAGAATGCTG 450 . : . : . : . : . : 413 CAACTGTAGATGAATTGAAGGCATCAATAGGCAACATCGCACTTTCCCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 117817 CAACTGTAGATGAATTGAAGGCATCAATAGGCAACATCGCACTTTCCCCA 500 . 463 TCACCAGTG ||||||||| 117867 TCACCAGTG 0 . : . : . : . : . : 495 GGGTGCAATTAAAAGGAACTTATCCA GTGAAGAAGTGGCAA ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||| 145150 GGGTGCAATTAAAAGGAACTTATCCAGTA...CAGGTGAAGAAGTGGCAA 50 . : . : . : . : . : 536 GACCCAGGCGTTCCACACCAACTCCAGAACTTATAAG CAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||| 146115 GACCCAGGCGTTCCACACCAACTCCAGAACTTATAAGGTG...TAGCAAA 100 . : . : . : . : . : 577 AAGCCTCCAGATGACACTACGGCCCTTGCTCCTCTCTTTGGCCCACCACT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 147441 AAGCCTCCAGATGACACTACGGCCCTTGCTCCTCTCTTTGGCCCACCACT 150 . : . : . : . : . : 627 AGAATCAGCTTTTGATGAACAGAAGACAGAAG TTCTTTTAG ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||| 147491 AGAATCAGCTTTTGATGAACAGAAGACAGAAGGTA...CAGTTCTTTTAG 200 . : . : . : . : . : 668 ATCAGCCTGAGATATGGGGTTCAGGCCAACCAATTAATCCAAGCATGGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 151169 ATCAGCCTGAGATATGGGGTTCAGGCCAACCAATTAATCCAAGCATGGAG 250 . : . : . : . : . : 718 TCGCCAAAGTTAACAAGGCCTTTTCCCACTGGAA CACCTCC ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||| 151219 TCGCCAAAGTTAACAAGGCCTTTTCCCACTGGAAGTA...CAGCACCTCC 300 . : . : . : . : . : 759 ACCACTGCCTCCAAAAAATGTACCAGCTACCCCACCCCGAACAGGATCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 153841 ACCACTGCCTCCAAAAAATGTACCAGCTACCCCACCCCGAACAGGATCCC 350 . : . : . : . : . : 809 CCTTAACAATTGGACCAG GAAATGACCAGTCAGCCACAGAG ||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||| 153891 CCTTAACAATTGGACCAGGTA...CAGGAAATGACCAGTCAGCCACAGAG 400 . : . : . : . : . : 850 GTCAAAATTGAAAAACTACCATCCATCAATGACTTGGACAGCATTTTTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 156048 GTCAAAATTGAAAAACTACCATCCATCAATGACTTGGACAGCATTTTTGG 450 . : . : . : . : . : 900 GCCAGTATTGTCCCCCAAGTCTGTTGCTGTTAATGCTGAAGAAAAGTGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 156098 GCCAGTATTGTCCCCCAAGTCTGTTGCTGTTAATGCTGAAGAAAAGTGGG 500 . : . : . : . : . : 950 TCCATTTTTCTGATACATCCCCGGAACATGTTACTCCGGAGTTGACTCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 156148 TCCATTTTTCTGATACATCCCCGGAACATGTTACTCCGGAGTTGACTCCA 550 . : . : . : . : . : 1000 AGGGAAAAAGTGGTGTCCCCACCAGCTACACCAGACAACCCAGCTGACTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 156198 AGGGAAAAAGTGGTGTCCCCACCAGCTACACCAGACAACCCAGCTGACTC 600 . : . : . : . : . : 1050 CCCAGCTCCAGGCCCTCTCGGCCCCCCAGGTCCCACAGGCCCCCCAGGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 156248 CCCAGCTCCAGGCCCTCTCGGCCCCCCAGGTCCCACAGGCCCCCCAGGGC 650 . : . : . : . : . : 1100 CTCCTGGGCCTCCTCGCAATGTACTATCGCCGCTCAATTTAGAAGAAGTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 156298 CTCCTGGGCCTCCTCGCAATGTACTATCGCCGCTCAATTTAGAAGAAGTC 700 . : . : . : . : . : 1150 CAGAAGAAAGTCGCTGAGCAGACCTTCATTAAAGATGATTACTTAGAAAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 156348 CAGAAGAAAGTCGCTGAGCAGACCTTCATTAAAGATGATTACTTAGAAAC 750 . : . : . : . : . : 1200 AATCTCATCTCCTAAAGATTTTGGGTTGGGACAAAGAGCAACTCCACCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 156398 AATCTCATCTCCTAAAGATTTTGGGTTGGGACAAAGAGCAACTCCACCTC 800 . : . : . : . : . : 1250 CCCCACCACCACCCACCTACAGGACTGTGGTTTCGTCCCCCGGACCTGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 156448 CCCCACCACCACCCACCTACAGGACTGTGGTTTCGTCCCCCGGACCTGGC 850 . : . : . : . : . : 1300 TCGGGCCCTGGTCCGGGGACCACCAGTG GTGCATCATCCCC ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||| 156498 TCGGGCCCTGGTCCGGGGACCACCAGTGGTA...CAGGTGCATCATCCCC 900 . : . : . : . : . : 1341 TGCTCGACCAGCCACTCCTTTGGTTCCTTGCAGAAGTACCACTCCACCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 163317 TGCTCGACCAGCCACTCCTTTGGTTCCTTGCAGAAGTACCACTCCACCTC 950 . : . : . : . : . : 1391 CACCTCCTCCCCGGCCTCCATCCCGGCCAAAGCTACCTCCAGGAAAACCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 163367 CACCTCCTCCCCGGCCTCCATCCCGGCCAAAGCTACCTCCAGGAAAACCT 1000 . : . : . : . : . : 1441 GGAGTTGGAGATGTG TCCAGACCTTTTAGCCCTCCCATTCA |||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||| 163417 GGAGTTGGAGATGTGGTA...CAGTCCAGACCTTTTAGCCCTCCCATTCA 1050 . : . : . : . : . : 1482 TTCTTCCAGCCCTCCTCCAATAGCACCCTTAGCGCGGGCTGAAAGCACTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 164372 TTCTTCCAGCCCTCCTCCAATAGCACCCTTAGCGCGGGCTGAAAGCACTT 1100 . : . : . : . : . : 1532 CTTCAATATCGTCAACCAATTCCTTGAGCGCAGCCACCACTCCCACAGTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 164422 CTTCAATATCGTCAACCAATTCCTTGAGCGCAGCCACCACTCCCACAGTT 1150 . : . : . : . : . : 1582 G AGAATGAACAGCCTTCCCTCGTTTGGTTTGATAGAGGAAA |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| 164472 GGTA...CAGAGAATGAACAGCCTTCCCTCGTTTGGTTTGACAGAGGAAA 1200 . : . : . : . : . : 1623 GTTTTATTTGACTTTTGAAG GTTCTTCCAGGGGACCCAGCC ||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||| 169630 GTTTTATTTGACTTTTGAAGGTA...CAGGTTCTTCCAGGGGACCCAGCC 1250 . : . : . : . : . : 1664 CCCTAACCATGGGAGCTCAGGACACTCTCCCTGTTGCAGCAGCATTTACA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 193471 CCCTAACCATGGGAGCTCAGGACACTCTCCCTGTTGCAGCAGCATTTACA 1300 . : . : . : . : . : 1714 GAAACAGTCAATGCCTATTTCAAAGGAGCAGACCCAAGCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>> 193521 GAAACAGTCAATGCCTATTTCAAAGGAGCAGACCCAAGCAAGTA...CAG 1350 . : . : . : . : . : 1755 ATGTATCGTTAAGATTACCGGAGAAATGGTGTTGTCATTTCCTGCTGGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 203420 ATGTATCGTTAAGATTACCGGAGAAATGGTGTTGTCATTTCCTGCTGGCA 1400 . : . : . : . : . : 1805 TCACCAGACACTTTGCCAACAACCCGTCCCCAGCTGCTCTGACTTTTCGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 203470 TCACCAGACACTTTGCCAACAACCCGTCCCCAGCTGCTCTGACTTTTCGG 1450 . : . : . : . : . : 1855 GTGATAAATTTCAGCAGGTTAGAACACGTCCTGCCAAACCCCCAACTTCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 203520 GTGATAAATTTCAGCAGGTTAGAACACGTCCTGCCAAACCCCCAACTTCT 1500 . : . : . : . : . : 1905 CTGCTG TGATAATACACAAAATGATGCCAATACCAAGGAAT ||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||| 203570 CTGCTGGTA...CAGTGATAATACACAAAATGATGCCAATACCAAGGAAT 1550 . : . : . : . : . : 1946 TCTGGGTAAACATGCCAAATTTGATGACTCACCTAAAGAAAGTGTCTGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 207939 TCTGGGTAAACATGCCAAATTTGATGACTCACCTAAAGAAAGTGTCTGAA 1600 . : . : . : . : . : 1996 CAAAAACCCCAGGCTACATATTATAACGTTGACATGCTCAAATATCAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>> 207989 CAAAAACCCCAGGCTACATATTATAACGTTGACATGCTCAAATATCAGGT 1650 . : . : . : . : . : 2044 GTGTCTGCCCAGGGCATTCAGTCCACACCTCTGAACCTGGCAG >...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 208039 A...AAGGTGTCTGCCCAGGGCATTCAGTCCACACCTCTGAACCTGGCAG 1700 . : . : . : . : . : 2087 TGAATTGGCGATGTGAGCCTTCAAGCACTGACCTGCGCATAGATTACAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 213534 TGAATTGGCGATGTGAGCCTTCAAGCACTGACCTGCGCATAGATTACAAA 1750 . : . : . : . : . : 2137 TATAATACAGATGCAATGACGACTGCTGTGGCCCTCAACAATGTGCAGTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 213584 TATAATACAGATGCAATGACGACTGCTGTGGCCCTCAACAATGTGCAGTT 1800 . : . : . : . : . : 2187 CCTGGTCCCCATCGACGGAGGAGTCACCAAGCTCCAGGCAGTGCTCCCAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 213634 CCTGGTCCCCATCGACGGAGGAGTCACCAAGCTCCAGGCAGTGCTCCCAC 1850 . : . : . : . : . : 2237 CAGCAGTCTG GAATGCTGAACAACAGAGAATATTGTGGAAG ||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||| 213684 CAGCAGTCTGGTA...TAGGAATGCTGAACAACAGAGAATATTGTGGAAG 1900 . : . : . : . : . : 2278 ATTCCTGATATCTCTCAGAAGTCAGAAAATGGAG GGGTGGG ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||| 214845 ATTCCTGATATCTCTCAGAAGTCAGAAAATGGAGGTA...TAGGGGTGGG 1950 . : . : . : . : . : 2319 TTCTTTGTTGGCAAGATTTCAGTTATCTGAAGGCCCAAGCAAACCTTCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 215435 TTCTTTGTTGGCAAGATTTCAGTTATCTGAAGGCCCAAGCAAACCTTCTC 2000 . : . : . : . : . : 2369 CATTGGTTGTGCAGTTCACAAGTGAAGGAAGCACCCTTTCTGGCTGTGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 215485 CATTGGTTGTGCAGTTCACAAGTGAAGGAAGCACCCTTTCTGGCTGTGAC 2050 . : . : . : . : . : 2419 ATTGAACTTGTTGGAGCAGGGTATCGATTTTCACTCATCAAGAAAAGGTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 215535 ATTGAACTTGTTGGAGCAGGGTATCGATTTTCACTCATCAAGAAAAGGTT 2100 . : . : . : . 2469 TGCTGCAG GAAAATACTTGGCAGATAAC ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||| 215585 TGCTGCAGGTA...CAGGAAAATACTTGGCAGATAAC