Result of FASTA (omim) for pF1KSDB0057
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDB0057, 793 aa
  1>>>pF1KSDB0057 793 - 793 aa - 793 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.9519+/-0.000488; mu= -4.3863+/- 0.030
 mean_var=387.7761+/-79.405, 0's: 0 Z-trim(120.1): 263  B-trim: 510 in 2/56
 Lambda= 0.065130
 statistics sampled from 34608 (34880) to 34608 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.716), E-opt: 0.2 (0.409), width:  16
 Scan time: 14.420

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_002245 (OMIM: 602845) kinesin-like protein KIF3 ( 793) 5144 498.3 5.4e-140
XP_005264356 (OMIM: 602845) PREDICTED: kinesin-lik ( 792) 5127 496.7 1.6e-139
NP_004789 (OMIM: 603754) kinesin-like protein KIF3 ( 747) 1315 138.5 1.1e-31
XP_006714589 (OMIM: 604683) PREDICTED: kinesin-lik ( 724)  940 103.2 4.2e-21
NP_001287720 (OMIM: 604683) kinesin-like protein K ( 726)  940 103.2 4.2e-21
XP_005246008 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik ( 984)  867 96.5   6e-19
XP_005246007 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik ( 985)  867 96.5   6e-19
XP_011540147 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik ( 992)  867 96.5   6e-19
XP_011540146 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik ( 997)  867 96.5 6.1e-19
XP_011540145 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik (1017)  867 96.5 6.2e-19
NP_001116291 (OMIM: 605037) kinesin-like protein K (1028)  867 96.5 6.2e-19
NP_065867 (OMIM: 605037) kinesin-like protein KIF1 (1029)  867 96.5 6.2e-19
XP_011540144 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik (1031)  867 96.5 6.2e-19
XP_011540143 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik (1038)  867 96.5 6.2e-19
XP_011540142 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik (1042)  867 96.5 6.3e-19
XP_011540141 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik (1043)  867 96.5 6.3e-19
XP_011540140 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik (1062)  867 96.5 6.3e-19
XP_011540139 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik (1063)  867 96.5 6.4e-19
NP_001274141 (OMIM: 605037) kinesin-like protein K ( 929)  604 71.7 1.6e-11
XP_011540148 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik ( 963)  604 71.8 1.6e-11
XP_016864484 (OMIM: 604683) PREDICTED: kinesin-lik ( 700)  600 71.3 1.7e-11
NP_001287721 (OMIM: 604683) kinesin-like protein K ( 702)  600 71.3 1.7e-11
NP_001239032 (OMIM: 608322) kinesin-like protein K (1610)  604 72.0 2.3e-11
NP_001239031 (OMIM: 608322) kinesin-like protein K (1623)  604 72.0 2.4e-11
NP_060066 (OMIM: 608322) kinesin-like protein KIF2 (1624)  604 72.0 2.4e-11
NP_001239029 (OMIM: 608322) kinesin-like protein K (1637)  604 72.0 2.4e-11
XP_016864485 (OMIM: 604683) PREDICTED: kinesin-lik ( 697)  594 70.7 2.5e-11
NP_008985 (OMIM: 604683) kinesin-like protein KIF3 ( 699)  594 70.7 2.5e-11
XP_016875099 (OMIM: 135700,608283) PREDICTED: kine (1607)  563 68.1 3.4e-10
XP_005269071 (OMIM: 135700,608283) PREDICTED: kine (1614)  563 68.1 3.4e-10
XP_005269070 (OMIM: 135700,608283) PREDICTED: kine (1627)  563 68.1 3.4e-10
XP_006719557 (OMIM: 135700,608283) PREDICTED: kine (1631)  563 68.1 3.4e-10
XP_005269069 (OMIM: 135700,608283) PREDICTED: kine (1632)  563 68.1 3.4e-10
XP_011536858 (OMIM: 135700,608283) PREDICTED: kine (1652)  563 68.1 3.5e-10
XP_005269068 (OMIM: 135700,608283) PREDICTED: kine (1657)  563 68.1 3.5e-10
XP_005269066 (OMIM: 135700,608283) PREDICTED: kine (1668)  563 68.1 3.5e-10
XP_005269065 (OMIM: 135700,608283) PREDICTED: kine (1670)  563 68.1 3.5e-10
NP_001166935 (OMIM: 135700,608283) kinesin-like pr (1674)  563 68.1 3.5e-10
XP_005269064 (OMIM: 135700,608283) PREDICTED: kine (1675)  563 68.1 3.5e-10
XP_016863148 (OMIM: 117143,616051) PREDICTED: cent (2551)  566 68.6 3.9e-10
XP_011529851 (OMIM: 117143,616051) PREDICTED: cent (2553)  566 68.6 3.9e-10
XP_011529850 (OMIM: 117143,616051) PREDICTED: cent (2604)  566 68.6 3.9e-10
XP_011529849 (OMIM: 117143,616051) PREDICTED: cent (2605)  566 68.6 3.9e-10
XP_011529848 (OMIM: 117143,616051) PREDICTED: cent (2633)  566 68.6   4e-10
XP_011529847 (OMIM: 117143,616051) PREDICTED: cent (2648)  566 68.6   4e-10
NP_001804 (OMIM: 117143,616051) centromere-associa (2701)  566 68.6   4e-10
NP_001273663 (OMIM: 117143,616051) centromere-asso (2580)  562 68.2 5.1e-10
XP_011529846 (OMIM: 117143,616051) PREDICTED: cent (2676)  562 68.2 5.2e-10
XP_016875100 (OMIM: 135700,608283) PREDICTED: kine (1601)  554 67.3 6.1e-10
XP_016875098 (OMIM: 135700,608283) PREDICTED: kine (1607)  554 67.3 6.1e-10


>>NP_002245 (OMIM: 602845) kinesin-like protein KIF3C [H  (793 aa)
 initn: 5144 init1: 5144 opt: 5144  Z-score: 2634.3  bits: 498.3 E(85289): 5.4e-140
Smith-Waterman score: 5144; 100.0% identity (100.0% similar) in 793 aa overlap (1-793:1-793)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MASKTKASEALKVVARCRPLSRKEEAAGHEQILTMDVKLGQVTLRNPRAAPGELPKTFTF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MASKTKASEALKVVARCRPLSRKEEAAGHEQILTMDVKLGQVTLRNPRAAPGELPKTFTF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD DAVYDASSKQADLYDETVRPLIDSVLQGFNGTVFAYGQTGTGKTYTMQGTWVEPELRGVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 DAVYDASSKQADLYDETVRPLIDSVLQGFNGTVFAYGQTGTGKTYTMQGTWVEPELRGVI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD PNAFEHIFTHISRSQNQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKEPGKRLELKENPETGVYIKDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 PNAFEHIFTHISRSQNQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKEPGKRLELKENPETGVYIKDL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD SSFVTKNVKEIEHVMNLGNQTRAVGSTHMNEVSSRSHAIFIITVECSERGSDGQDHIRVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SSFVTKNVKEIEHVMNLGNQTRAVGSTHMNEVSSRSHAIFIITVECSERGSDGQDHIRVG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD KLNLVDLAGSERQNKAGPNTAGGAATPSSGGGGGGGGSGGGAGGERPKEASKINLSLSAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 KLNLVDLAGSERQNKAGPNTAGGAATPSSGGGGGGGGSGGGAGGERPKEASKINLSLSAL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD GNVIAALAGNRSTHIPYRDSKLTRLLQDSLGGNAKTIMVATLGPASHSYDESLSTLRFAN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GNVIAALAGNRSTHIPYRDSKLTRLLQDSLGGNAKTIMVATLGPASHSYDESLSTLRFAN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD RAKNIKNKPRVNEDPKDTLLREFQEEIARLKAQLEKRGMLGKRPRRKSSRRKKAVSAPPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 RAKNIKNKPRVNEDPKDTLLREFQEEIARLKAQLEKRGMLGKRPRRKSSRRKKAVSAPPG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD YPEGPVIEAWVAEEEDDNNNNHRPPQPILESALEKNMENYLQEQKERLEEEKAAIQDDRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 YPEGPVIEAWVAEEEDDNNNNHRPPQPILESALEKNMENYLQEQKERLEEEKAAIQDDRS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD LVSEEKQKLLEEKEKMLEDLRREQQATELLAAKYKAMESKLLIGGRNIMDHTNEQQKMLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LVSEEKQKLLEEKEKMLEDLRREQQATELLAAKYKAMESKLLIGGRNIMDHTNEQQKMLE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD LKRQEIAEQKRREREMQQEMMLRDEETMELRGTYTSLQQEVEVKTKKLKKLYAKLQAVKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LKRQEIAEQKRREREMQQEMMLRDEETMELRGTYTSLQQEVEVKTKKLKKLYAKLQAVKA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD EIQDQHDEYIRVRQDLEEAQNEQTRELKLKYLIIENFIPPEEKNKIMNRLFLDCEEEQWK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 EIQDQHDEYIRVRQDLEEAQNEQTRELKLKYLIIENFIPPEEKNKIMNRLFLDCEEEQWK
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD FQPLVPAGVSSSQMKKRPTSAVGYKRPISQYARVAMAMGSHPRYRAENIMFLELDVSPPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 FQPLVPAGVSSSQMKKRPTSAVGYKRPISQYARVAMAMGSHPRYRAENIMFLELDVSPPA
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD VFEMEFSHDQEQDPRALHMERLMRLDSFLERPSTSKVRKSRSWCQSPQRPPPSTTHASLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 VFEMEFSHDQEQDPRALHMERLMRLDSFLERPSTSKVRKSRSWCQSPQRPPPSTTHASLA
              730       740       750       760       770       780

              790   
pF1KSD SASLRPATVADHE
       :::::::::::::
NP_002 SASLRPATVADHE
              790   

>>XP_005264356 (OMIM: 602845) PREDICTED: kinesin-like pr  (792 aa)
 initn: 4329 init1: 4329 opt: 5127  Z-score: 2625.7  bits: 496.7 E(85289): 1.6e-139
Smith-Waterman score: 5127; 99.9% identity (99.9% similar) in 793 aa overlap (1-793:1-792)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MASKTKASEALKVVARCRPLSRKEEAAGHEQILTMDVKLGQVTLRNPRAAPGELPKTFTF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MASKTKASEALKVVARCRPLSRKEEAAGHEQILTMDVKLGQVTLRNPRAAPGELPKTFTF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD DAVYDASSKQADLYDETVRPLIDSVLQGFNGTVFAYGQTGTGKTYTMQGTWVEPELRGVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DAVYDASSKQADLYDETVRPLIDSVLQGFNGTVFAYGQTGTGKTYTMQGTWVEPELRGVI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD PNAFEHIFTHISRSQNQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKEPGKRLELKENPETGVYIKDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PNAFEHIFTHISRSQNQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKEPGKRLELKENPETGVYIKDL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD SSFVTKNVKEIEHVMNLGNQTRAVGSTHMNEVSSRSHAIFIITVECSERGSDGQDHIRVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SSFVTKNVKEIEHVMNLGNQTRAVGSTHMNEVSSRSHAIFIITVECSERGSDGQDHIRVG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD KLNLVDLAGSERQNKAGPNTAGGAATPSSGGGGGGGGSGGGAGGERPKEASKINLSLSAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KLNLVDLAGSERQNKAGPNTAGGAATPSSGGGGGGGGSGGGAGGERPKEASKINLSLSAL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD GNVIAALAGNRSTHIPYRDSKLTRLLQDSLGGNAKTIMVATLGPASHSYDESLSTLRFAN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GNVIAALAGNRSTHIPYRDSKLTRLLQDSLGGNAKTIMVATLGPASHSYDESLSTLRFAN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD RAKNIKNKPRVNEDPKDTLLREFQEEIARLKAQLEKRGMLGKRPRRKSSRRKKAVSAPPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RAKNIKNKPRVNEDPKDTLLREFQEEIARLKAQLEKRGMLGKRPRRKSSRRKKAVSAPPG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD YPEGPVIEAWVAEEEDDNNNNHRPPQPILESALEKNMENYLQEQKERLEEEKAAIQDDRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YPEGPVIEAWVAEEEDDNNNNHRPPQPILESALEKNMENYLQEQKERLEEEKAAIQDDRS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD LVSEEKQKLLEEKEKMLEDLRREQQATELLAAKYKAMESKLLIGGRNIMDHTNEQQKMLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LVSEEKQKLLEEKEKMLEDLRREQQATELLAAKYKAMESKLLIGGRNIMDHTNEQQKMLE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD LKRQEIAEQKRREREMQQEMMLRDEETMELRGTYTSLQQEVEVKTKKLKKLYAKLQAVKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LKRQEIAEQKRREREMQQEMMLRDEETMELRGTYTSLQQEVEVKTKKLKKLYAKLQAVKA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD EIQDQHDEYIRVRQDLEEAQNEQTRELKLKYLIIENFIPPEEKNKIMNRLFLDCEEEQWK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EIQDQHDEYIRVRQDLEEAQNEQTRELKLKYLIIENFIPPEEKNKIMNRLFLDCEEEQWK
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD FQPLVPAGVSSSQMKKRPTSAVGYKRPISQYARVAMAMGSHPRYRAENIMFLELDVSPPA
       ::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FQPLVPAGVSS-QMKKRPTSAVGYKRPISQYARVAMAMGSHPRYRAENIMFLELDVSPPA
              670        680       690       700       710         

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD VFEMEFSHDQEQDPRALHMERLMRLDSFLERPSTSKVRKSRSWCQSPQRPPPSTTHASLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VFEMEFSHDQEQDPRALHMERLMRLDSFLERPSTSKVRKSRSWCQSPQRPPPSTTHASLA
     720       730       740       750       760       770         

              790   
pF1KSD SASLRPATVADHE
       :::::::::::::
XP_005 SASLRPATVADHE
     780       790  

>>NP_004789 (OMIM: 603754) kinesin-like protein KIF3B [H  (747 aa)
 initn: 2445 init1: 1289 opt: 1315  Z-score: 690.2  bits: 138.5 E(85289): 1.1e-31
Smith-Waterman score: 2978; 61.9% identity (81.9% similar) in 790 aa overlap (3-788:2-741)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MASKTKASEALKVVARCRPLSRKEEAAGHEQILTMDVKLGQVTLRNPRAAPGELPKTFTF
         :: :.::...::.::::.. ::.::...... .:::::::...::...  :.::::::
NP_004  MSKLKSSESVRVVVRCRPMNGKEKAASYDKVVDVDVKLGQVSVKNPKGTAHEMPKTFTF
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD DAVYDASSKQADLYDETVRPLIDSVLQGFNGTVFAYGQTGTGKTYTMQGTWVEPELRGVI
       ::::: ..:: .::::: :::.::::::::::.::::::::::::::.:   .:: ::::
NP_004 DAVYDWNAKQFELYDETFRPLVDSVLQGFNGTIFAYGQTGTGKTYTMEGIRGDPEKRGVI
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD PNAFEHIFTHISRSQNQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKEPGKRLELKENPETGVYIKDL
       ::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::.  ::::::: :.::::.:::
NP_004 PNSFDHIFTHISRSQNQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKDQTKRLELKERPDTGVYVKDL
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD SSFVTKNVKEIEHVMNLGNQTRAVGSTHMNEVSSRSHAIFIITVECSERGSDGQDHIRVG
       ::::::.:::::::::.:::.:.::.:.::: ::::::::.::.:::: : ::..:::::
NP_004 SSFVTKSVKEIEHVMNVGNQNRSVGATNMNEHSSRSHAIFVITIECSEVGLDGENHIRVG
     180       190       200       210       220       230         

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD KLNLVDLAGSERQNKAGPNTAGGAATPSSGGGGGGGGSGGGAGGERPKEASKINLSLSAL
       ::::::::::::: :.:                        : ::: :::.:::::::::
NP_004 KLNLVDLAGSERQAKTG------------------------AQGERLKEATKINLSLSAL
     240       250                               260       270     

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD GNVIAALAGNRSTHIPYRDSKLTRLLQDSLGGNAKTIMVATLGPASHSYDESLSTLRFAN
       ::::.::. ..:::::::::::::::::::::::::.:::..::::.. .:.:.:::.::
NP_004 GNVISALVDGKSTHIPYRDSKLTRLLQDSLGGNAKTVMVANVGPASYNVEETLTTLRYAN
         280       290       300       310       320       330     

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD RAKNIKNKPRVNEDPKDTLLREFQEEIARLKAQLEKRGMLGKRPRRKSSRRKKAVSAPPG
       :::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.. :.: ::.. ::. . :.  :
NP_004 RAKNIKNKPRVNEDPKDALLREFQEEIARLKAQLEKRSI-GRRKRREK-RREGGGSGGGG
         340       350       360       370        380        390   

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD YPEGPVIEAWVAEEEDDNNNNHRPPQPILESALEKNMENYLQEQKERLEEEKAAIQDDRS
         :    :.  .::: :....                  : .::.:.:: :: :: .:.:
NP_004 EEEEE--EGEEGEEEGDDKDD------------------YWREQQEKLEIEKRAIVEDHS
             400       410                         420       430   

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD LVSEEKQKLLEEKEKMLEDLRREQQATELLAAKYKAMESKLLIGGRNIMDHTNEQQKMLE
       ::.:::..::.:::: .::::::..:.:.:.:: ::::::::.::.::.::::::::.::
NP_004 LVAEEKMRLLKEKEKKMEDLRREKDAAEMLGAKIKAMESKLLVGGKNIVDHTNEQQKILE
           440       450       460       470       480       490   

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD LKRQEIAEQKRREREMQQEMMLRDEETMELRGTYTSLQQEVEVKTKKLKKLYAKLQAVKA
        ::::::::::::::.::.:  :::::.::. ::.::::::..::::::::..:::::::
NP_004 QKRQEIAEQKRREREIQQQMESRDEETLELKETYSSLQQEVDIKTKKLKKLFSKLQAVKA
           500       510       520       530       540       550   

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD EIQDQHDEYIRVRQDLEEAQNEQTRELKLKYLIIENFIPPEEKNKIMNRLFLDCEEEQWK
       ::.: ..:.:. ::.::..::: :::::::.:::::::: :::.::::: :.: ::..::
NP_004 EIHDLQEEHIKERQELEQTQNELTRELKLKHLIIENFIPLEEKSKIMNRAFFDEEEDHWK
           560       570       580       590       600       610   

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD FQPLVPAGVSSSQMKKRPTSAVGYKRPISQYARVAMAMGSHPRYRAENIMFLELDVSPPA
       ..:..   . ..:: :::.::::::::.::.::..: .  . :::::::..::::.   .
NP_004 LHPIT--RLENQQMMKRPVSAVGYKRPLSQHARMSMMIRPEARYRAENIVLLELDMPSRT
             620       630       640       650       660       670 

                  730       740       750       760       770      
pF1KSD VFEME----FSHDQEQDPRALHMERLMRLDSFLERPSTSKVRKSRSWCQSPQRPPPSTTH
       . ..:      . :     ::. :  ...:.   . ...:  :.:   .: ..   :.. 
NP_004 TRDYEGPAIAPKVQAALDAALQDEDEIQVDASSFESTANKKSKARP--KSGRKSGSSSSS
             680       690       700       710         720         

        780       790    
pF1KSD ASLASASLRPATVADHE 
       ..  ...: : .      
NP_004 SGTPASQLYPQSRGLVPK
     730       740       

>>XP_006714589 (OMIM: 604683) PREDICTED: kinesin-like pr  (724 aa)
 initn: 1466 init1: 551 opt: 940  Z-score: 499.9  bits: 103.2 E(85289): 4.2e-21
Smith-Waterman score: 1860; 44.3% identity (73.9% similar) in 698 aa overlap (4-687:8-670)

                   10        20        30        40        50      
pF1KSD     MASKTKASEALKVVARCRPLSRKEEAAGHEQILTMDVKLGQVTLRNPRAAPGELPK
              : .. . .:::.:::::...:..  ..: ...:   : .:...  .. .: ::
XP_006 MPINKSEKPESCDNVKVVVRCRPLNEREKSMCYKQAVSVDEMRGTITVHKTDSS-NEPPK
               10        20        30        40        50          

         60        70        80        90       100       110      
pF1KSD TFTFDAVYDASSKQADLYDETVRPLIDSVLQGFNGTVFAYGQTGTGKTYTMQGTWVEPEL
       :::::.:.   ::: :.:. :.::.:::::.:.:::.:::::::::::.::.:. . :::
XP_006 TFTFDTVFGPESKQLDVYNLTARPIIDSVLEGYNGTIFAYGQTGTGKTFTMEGVRAIPEL
      60        70        80        90       100       110         

        120       130        140       150       160       170     
pF1KSD RGVIPNAFEHIFTHISRSQ-NQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKEPGKRLELKENPETGV
       ::.:::.: ::: ::.... . ..:::.::::::.::.::::.:.  .:::.:: :..::
XP_006 RGIIPNSFAHIFGHIAKAEGDTRFLVRVSYLEIYNEEVRDLLGKDQTQRLEVKERPDVGV
     120       130       140       150       160       170         

         180       190       200       210       220       230     
pF1KSD YIKDLSSFVTKNVKEIEHVMNLGNQTRAVGSTHMNEVSSRSHAIFIITVECSERGSDGQD
       ::::::..:..:. .....:.::...:.::.:.::: :::::::: ::.::::.: ::. 
XP_006 YIKDLSAYVVNNADDMDRIMTLGHKNRSVGATNMNEHSSRSHAIFTITIECSEKGIDGNM
     180       190       200       210       220       230         

         240       250       260       270       280       290     
pF1KSD HIRVGKLNLVDLAGSERQNKAGPNTAGGAATPSSGGGGGGGGSGGGAGGERPKEASKINL
       :.:.:::.:::::::::: :.:                        : :.: :::.::::
XP_006 HVRMGKLHLVDLAGSERQAKTG------------------------ATGQRLKEATKINL
     240       250       260                               270     

         300       310       320       330       340       350     
pF1KSD SLSALGNVIAALAGNRSTHIPYRDSKLTRLLQDSLGGNAKTIMVATLGPASHSYDESLST
       :::.:::::.::. ..:::.:::.::::::::::::::.::.: :..:::...:::..::
XP_006 SLSTLGNVISALVDGKSTHVPYRNSKLTRLLQDSLGGNSKTMMCANIGPADYNYDETIST
         280       290       300       310       320       330     

         360       370       380       390       400       410     
pF1KSD LRFANRAKNIKNKPRVNEDPKDTLLREFQEEIARLKAQLEKRGMLGKRPRRKSSRRKKAV
       ::.:::::::::: :.::::::.:::.::.:: .:: .::.    :.    . :    . 
XP_006 LRYANRAKNIKNKARINEDPKDALLRQFQKEIEELKKKLEE----GE----EISGSDISG
         340       350       360       370               380       

         420       430          440       450       460            
pF1KSD SAPPGYPEGPVIEAWVAEEE---DDNNNNHRPPQPILESALEKNMENY----------LQ
       :      :: : :    ...   ......      ..:. :.: . :           . 
XP_006 SEEDDDEEGEVGEDGEKRKKRRGSSSSSSSDSTCSVIEKPLDKFLPNQAGKKKVSPDKMI
       390       400       410       420       430       440       

            470       480       490       500       510       520  
pF1KSD EQKERLEEEKAAIQDDRSLVSEEKQKLLEEKEKMLEDLRREQQATELLAAKYKAMESKLL
       :.. ...::. :..   ..  ::..:   : ::  .:: . ::  . :  : .:.:.:..
XP_006 EMQAKIDEERKALETKLDMEEEERNKARAELEKREKDLLKAQQEHQSLLEKLSALEKKVI
       450       460       470       480       490       500       

            530       540       550       560       570       580  
pF1KSD IGGRNIMDHTNEQQKMLELKRQEIAEQKRREREMQQEMMLRDEETMELRGTYTSLQQEVE
       .:: ... ...::.:.:: . .:. :...: .....:.  ...: ....  :::::.:..
XP_006 VGGVDLLAKAEEQEKLLEESNMELEERRKRAEQLRRELEEKEQERLDIEEKYTSLQEEAQ
       510       520       530       540       550       560       

            590       600       610       620       630       640  
pF1KSD VKTKKLKKLYAKLQAVKAEIQDQHDEYIRVRQDLEEAQNEQTRELKLKYLIIENFIPPEE
        :::::::... :.:.:.:. : ..:. :  . : :   . .:::.:..:::.:::: . 
XP_006 GKTKKLKKVWTMLMAAKSEMADLQQEHQREIEGLLENIRQLSRELRLQMLIIDNFIPRDY
       570       580       590       600       610       620       

            650       660       670       680       690       700  
pF1KSD KNKIMNRLFLDCEEEQWKFQPLVPAGVSSSQMKKRPTSAVGYKRPISQYARVAMAMGSHP
       .. : : .  . .  .:... .. .:  ... :. :.     : :               
XP_006 QEMIENYVHWNEDIGEWQLKCVAYTG--NNMRKQTPVPDKKEKDPFEVDLSHVYLAYTEE
       630       640       650         660       670       680     

            710       720       730       740       750       760  
pF1KSD RYRAENIMFLELDVSPPAVFEMEFSHDQEQDPRALHMERLMRLDSFLERPSTSKVRKSRS
                                                                   
XP_006 SLRQSLMKLERPRTSKGKARPKTGRSSGAMVSSFIKRYH                     
         690       700       710       720                         

>>NP_001287720 (OMIM: 604683) kinesin-like protein KIF3A  (726 aa)
 initn: 1464 init1: 551 opt: 940  Z-score: 499.9  bits: 103.2 E(85289): 4.2e-21
Smith-Waterman score: 1860; 44.3% identity (73.9% similar) in 698 aa overlap (4-687:8-670)

                   10        20        30        40        50      
pF1KSD     MASKTKASEALKVVARCRPLSRKEEAAGHEQILTMDVKLGQVTLRNPRAAPGELPK
              : .. . .:::.:::::...:..  ..: ...:   : .:...  .. .: ::
NP_001 MPINKSEKPESCDNVKVVVRCRPLNEREKSMCYKQAVSVDEMRGTITVHKTDSS-NEPPK
               10        20        30        40        50          

         60        70        80        90       100       110      
pF1KSD TFTFDAVYDASSKQADLYDETVRPLIDSVLQGFNGTVFAYGQTGTGKTYTMQGTWVEPEL
       :::::.:.   ::: :.:. :.::.:::::.:.:::.:::::::::::.::.:. . :::
NP_001 TFTFDTVFGPESKQLDVYNLTARPIIDSVLEGYNGTIFAYGQTGTGKTFTMEGVRAIPEL
      60        70        80        90       100       110         

        120       130        140       150       160       170     
pF1KSD RGVIPNAFEHIFTHISRSQ-NQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKEPGKRLELKENPETGV
       ::.:::.: ::: ::.... . ..:::.::::::.::.::::.:.  .:::.:: :..::
NP_001 RGIIPNSFAHIFGHIAKAEGDTRFLVRVSYLEIYNEEVRDLLGKDQTQRLEVKERPDVGV
     120       130       140       150       160       170         

         180       190       200       210       220       230     
pF1KSD YIKDLSSFVTKNVKEIEHVMNLGNQTRAVGSTHMNEVSSRSHAIFIITVECSERGSDGQD
       ::::::..:..:. .....:.::...:.::.:.::: :::::::: ::.::::.: ::. 
NP_001 YIKDLSAYVVNNADDMDRIMTLGHKNRSVGATNMNEHSSRSHAIFTITIECSEKGIDGNM
     180       190       200       210       220       230         

         240       250       260       270       280       290     
pF1KSD HIRVGKLNLVDLAGSERQNKAGPNTAGGAATPSSGGGGGGGGSGGGAGGERPKEASKINL
       :.:.:::.:::::::::: :.:                        : :.: :::.::::
NP_001 HVRMGKLHLVDLAGSERQAKTG------------------------ATGQRLKEATKINL
     240       250       260                               270     

         300       310       320       330       340       350     
pF1KSD SLSALGNVIAALAGNRSTHIPYRDSKLTRLLQDSLGGNAKTIMVATLGPASHSYDESLST
       :::.:::::.::. ..:::.:::.::::::::::::::.::.: :..:::...:::..::
NP_001 SLSTLGNVISALVDGKSTHVPYRNSKLTRLLQDSLGGNSKTMMCANIGPADYNYDETIST
         280       290       300       310       320       330     

         360       370       380       390       400       410     
pF1KSD LRFANRAKNIKNKPRVNEDPKDTLLREFQEEIARLKAQLEKRGMLGKRPRRKSSRRKKAV
       ::.:::::::::: :.::::::.:::.::.:: .:: .::.    :.    . :    . 
NP_001 LRYANRAKNIKNKARINEDPKDALLRQFQKEIEELKKKLEE----GE----EISGSDISG
         340       350       360       370               380       

         420       430          440       450       460            
pF1KSD SAPPGYPEGPVIEAWVAEEE---DDNNNNHRPPQPILESALEKNMENY----------LQ
       :      :: : :    ...   ......      ..:. :.: . :           . 
NP_001 SEEDDDEEGEVGEDGEKRKKRRGSSSSSSSDSTCSVIEKPLDKFLPNQAGKKKVSPDKMI
       390       400       410       420       430       440       

            470       480       490       500       510       520  
pF1KSD EQKERLEEEKAAIQDDRSLVSEEKQKLLEEKEKMLEDLRREQQATELLAAKYKAMESKLL
       :.. ...::. :..   ..  ::..:   : ::  .:: . ::  . :  : .:.:.:..
NP_001 EMQAKIDEERKALETKLDMEEEERNKARAELEKREKDLLKAQQEHQSLLEKLSALEKKVI
       450       460       470       480       490       500       

            530       540       550       560       570       580  
pF1KSD IGGRNIMDHTNEQQKMLELKRQEIAEQKRREREMQQEMMLRDEETMELRGTYTSLQQEVE
       .:: ... ...::.:.:: . .:. :...: .....:.  ...: ....  :::::.:..
NP_001 VGGVDLLAKAEEQEKLLEESNMELEERRKRAEQLRRELEEKEQERLDIEEKYTSLQEEAQ
       510       520       530       540       550       560       

            590       600       610       620       630       640  
pF1KSD VKTKKLKKLYAKLQAVKAEIQDQHDEYIRVRQDLEEAQNEQTRELKLKYLIIENFIPPEE
        :::::::... :.:.:.:. : ..:. :  . : :   . .:::.:..:::.:::: . 
NP_001 GKTKKLKKVWTMLMAAKSEMADLQQEHQREIEGLLENIRQLSRELRLQMLIIDNFIPRDY
       570       580       590       600       610       620       

            650       660       670       680       690       700  
pF1KSD KNKIMNRLFLDCEEEQWKFQPLVPAGVSSSQMKKRPTSAVGYKRPISQYARVAMAMGSHP
       .. : : .  . .  .:... .. .:  ... :. :.     : :               
NP_001 QEMIENYVHWNEDIGEWQLKCVAYTG--NNMRKQTPVPDKKEKDPFEVDLSHVYLAYTEE
       630       640       650         660       670       680     

            710       720       730       740       750       760  
pF1KSD RYRAENIMFLELDVSPPAVFEMEFSHDQEQDPRALHMERLMRLDSFLERPSTSKVRKSRS
                                                                   
NP_001 SLRQSLMKLERPRTSKGKARPKTGRRKRSAKPETVIDSLLQ                   
         690       700       710       720                         

>>XP_005246008 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-like pr  (984 aa)
 initn: 841 init1: 756 opt: 867  Z-score: 461.2  bits: 96.5 E(85289): 6e-19
Smith-Waterman score: 1419; 48.0% identity (70.2% similar) in 517 aa overlap (7-516:2-472)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MASKTKASEALKVVARCRPLSRKEEAAGHEQILTMDVKLGQVTLRNPRAAPGELPKTFTF
             ::::.:::.::::....:.    . ..:.:   .:  ..:: ::  : :: :::
XP_005      MASEAVKVVVRCRPMNQRERELRCQPVVTVDCARAQCCIQNPGAAD-EPPKQFTF
                    10        20        30        40         50    

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD DAVYDASSKQADLYDETVRPLIDSVLQGFNGTVFAYGQTGTGKTYTMQGTWVEPELRGVI
       :..: ..    ..:.: . ::...: .:.:::.:::::::.::..::::    :  ::.:
XP_005 DGAYHVDHVTEQIYNEIAYPLVEGVTEGYNGTIFAYGQTGSGKSFTMQGLPDPPSQRGII
           60        70        80        90       100       110    

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD PNAFEHIFTHISRSQNQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKEPGKRLELKENPETGVYIKDL
       : ::::.:  .. ..: ..::::::::::.:..::::. .  ..:::::.:: :::.: :
XP_005 PRAFEHVFESVQCAENTKFLVRASYLEIYNEDVRDLLGADTKQKLELKEHPEKGVYVKGL
          120       130       140       150       160       170    

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD SSFVTKNVKEIEHVMNLGNQTRAVGSTHMNEVSSRSHAIFIITVECSERGSDGQDHIRVG
       :  ....: . ::.:. : ..:.:: : ::. :::::.:: :..: :     :.::.:.:
XP_005 SMHTVHSVAQCEHIMETGWKNRSVGYTLMNKDSSRSHSIFTISIEMSAVDERGKDHLRAG
          180       190       200       210       220       230    

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD KLNLVDLAGSERQNKAGPNTAGGAATPSSGGGGGGGGSGGGAGGERPKEASKINLSLSAL
       :::::::::::::.:.:                        : ::: :::.:::::::::
XP_005 KLNLVDLAGSERQSKTG------------------------ATGERLKEATKINLSLSAL
          240       250                               260       270

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD GNVIAALAGNRSTHIPYRDSKLTRLLQDSLGGNAKTIMVATLGPASHSYDESLSTLRFAN
       ::::.::. .:  :.::::::::::::::::::.::.::: :.::...:::.:::::.::
XP_005 GNVISALVDGRCKHVPYRDSKLTRLLQDSLGGNTKTLMVACLSPADNNYDETLSTLRYAN
              280       290       300       310       320       330

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD RAKNIKNKPRVNEDPKDTLLREFQEEIARLKAQLEKRGMLGKRPRRKSSRRKKAVSAPPG
       :::::.::::.::::::.::::.:::: .::: : ..      :   :.  .. :  :: 
XP_005 RAKNIRNKPRINEDPKDALLREYQEEIKKLKAILTQQ----MSPSSLSALLSRQV--PPD
              340       350       360           370       380      

              430       440       450       460       470          
pF1KSD YPEGPVIEAWVAEEEDDNNNNHRPPQPILESALEKNMENYLQEQKERLEEEKA---AIQD
           ::    : :.          :::...  .: . .   .: .::: . ::   : :.
XP_005 ----PV---QVEEKLL--------PQPVIQHDVEAEKQLIREEYEERLARLKADYKAEQE
                 390               400       410       420         

       480       490           500       510       520       530   
pF1KSD DRSLVSEEKQKLLEEKEKML----EDLRREQQATELLAAKYKAMESKLLIGGRNIMDHTN
       .:. . :.   . .  .  :    :.::.: .:.  ... :::                 
XP_005 SRARLEEDITAMRNSYDVRLSTLEENLRKETEAVLQVGVLYKAEVMSRAEFASSAEYPPA
     430       440       450       460       470       480         

           540       550       560       570       580       590   
pF1KSD EQQKMLELKRQEIAEQKRREREMQQEMMLRDEETMELRGTYTSLQQEVEVKTKKLKKLYA
                                                                   
XP_005 FQYETVVKPKVFSTTDTLPSDDVSKTQVSSRFAELPKVEPSKSEISLGSSESSSLEETSV
     490       500       510       520       530       540         

>>XP_005246007 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-like pr  (985 aa)
 initn: 841 init1: 756 opt: 867  Z-score: 461.1  bits: 96.5 E(85289): 6e-19
Smith-Waterman score: 1419; 48.0% identity (70.2% similar) in 517 aa overlap (7-516:2-472)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MASKTKASEALKVVARCRPLSRKEEAAGHEQILTMDVKLGQVTLRNPRAAPGELPKTFTF
             ::::.:::.::::....:.    . ..:.:   .:  ..:: ::  : :: :::
XP_005      MASEAVKVVVRCRPMNQRERELRCQPVVTVDCARAQCCIQNPGAAD-EPPKQFTF
                    10        20        30        40         50    

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD DAVYDASSKQADLYDETVRPLIDSVLQGFNGTVFAYGQTGTGKTYTMQGTWVEPELRGVI
       :..: ..    ..:.: . ::...: .:.:::.:::::::.::..::::    :  ::.:
XP_005 DGAYHVDHVTEQIYNEIAYPLVEGVTEGYNGTIFAYGQTGSGKSFTMQGLPDPPSQRGII
           60        70        80        90       100       110    

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD PNAFEHIFTHISRSQNQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKEPGKRLELKENPETGVYIKDL
       : ::::.:  .. ..: ..::::::::::.:..::::. .  ..:::::.:: :::.: :
XP_005 PRAFEHVFESVQCAENTKFLVRASYLEIYNEDVRDLLGADTKQKLELKEHPEKGVYVKGL
          120       130       140       150       160       170    

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD SSFVTKNVKEIEHVMNLGNQTRAVGSTHMNEVSSRSHAIFIITVECSERGSDGQDHIRVG
       :  ....: . ::.:. : ..:.:: : ::. :::::.:: :..: :     :.::.:.:
XP_005 SMHTVHSVAQCEHIMETGWKNRSVGYTLMNKDSSRSHSIFTISIEMSAVDERGKDHLRAG
          180       190       200       210       220       230    

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD KLNLVDLAGSERQNKAGPNTAGGAATPSSGGGGGGGGSGGGAGGERPKEASKINLSLSAL
       :::::::::::::.:.:                        : ::: :::.:::::::::
XP_005 KLNLVDLAGSERQSKTG------------------------ATGERLKEATKINLSLSAL
          240       250                               260       270

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD GNVIAALAGNRSTHIPYRDSKLTRLLQDSLGGNAKTIMVATLGPASHSYDESLSTLRFAN
       ::::.::. .:  :.::::::::::::::::::.::.::: :.::...:::.:::::.::
XP_005 GNVISALVDGRCKHVPYRDSKLTRLLQDSLGGNTKTLMVACLSPADNNYDETLSTLRYAN
              280       290       300       310       320       330

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD RAKNIKNKPRVNEDPKDTLLREFQEEIARLKAQLEKRGMLGKRPRRKSSRRKKAVSAPPG
       :::::.::::.::::::.::::.:::: .::: : ..      :   :.  .. :  :: 
XP_005 RAKNIRNKPRINEDPKDALLREYQEEIKKLKAILTQQ----MSPSSLSALLSRQV--PPD
              340       350       360           370       380      

              430       440       450       460       470          
pF1KSD YPEGPVIEAWVAEEEDDNNNNHRPPQPILESALEKNMENYLQEQKERLEEEKA---AIQD
           ::    : :.          :::...  .: . .   .: .::: . ::   : :.
XP_005 ----PV---QVEEKLL--------PQPVIQHDVEAEKQLIREEYEERLARLKADYKAEQE
                 390               400       410       420         

       480       490           500       510       520       530   
pF1KSD DRSLVSEEKQKLLEEKEKML----EDLRREQQATELLAAKYKAMESKLLIGGRNIMDHTN
       .:. . :.   . .  .  :    :.::.: .:.  ... :::                 
XP_005 SRARLEEDITAMRNSYDVRLSTLEENLRKETEAVLQVGVLYKAEVMSRAEFASSAEYPPA
     430       440       450       460       470       480         

           540       550       560       570       580       590   
pF1KSD EQQKMLELKRQEIAEQKRREREMQQEMMLRDEETMELRGTYTSLQQEVEVKTKKLKKLYA
                                                                   
XP_005 FQYETVVKPKVFSTTDTLPSDDVSKTQVSSRFAELPKVEPSKSEISLGSSESSSLEETSV
     490       500       510       520       530       540         

>>XP_011540147 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-like pr  (992 aa)
 initn: 841 init1: 756 opt: 867  Z-score: 461.1  bits: 96.5 E(85289): 6e-19
Smith-Waterman score: 1419; 48.0% identity (70.2% similar) in 517 aa overlap (7-516:2-472)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MASKTKASEALKVVARCRPLSRKEEAAGHEQILTMDVKLGQVTLRNPRAAPGELPKTFTF
             ::::.:::.::::....:.    . ..:.:   .:  ..:: ::  : :: :::
XP_011      MASEAVKVVVRCRPMNQRERELRCQPVVTVDCARAQCCIQNPGAAD-EPPKQFTF
                    10        20        30        40         50    

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD DAVYDASSKQADLYDETVRPLIDSVLQGFNGTVFAYGQTGTGKTYTMQGTWVEPELRGVI
       :..: ..    ..:.: . ::...: .:.:::.:::::::.::..::::    :  ::.:
XP_011 DGAYHVDHVTEQIYNEIAYPLVEGVTEGYNGTIFAYGQTGSGKSFTMQGLPDPPSQRGII
           60        70        80        90       100       110    

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD PNAFEHIFTHISRSQNQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKEPGKRLELKENPETGVYIKDL
       : ::::.:  .. ..: ..::::::::::.:..::::. .  ..:::::.:: :::.: :
XP_011 PRAFEHVFESVQCAENTKFLVRASYLEIYNEDVRDLLGADTKQKLELKEHPEKGVYVKGL
          120       130       140       150       160       170    

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD SSFVTKNVKEIEHVMNLGNQTRAVGSTHMNEVSSRSHAIFIITVECSERGSDGQDHIRVG
       :  ....: . ::.:. : ..:.:: : ::. :::::.:: :..: :     :.::.:.:
XP_011 SMHTVHSVAQCEHIMETGWKNRSVGYTLMNKDSSRSHSIFTISIEMSAVDERGKDHLRAG
          180       190       200       210       220       230    

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD KLNLVDLAGSERQNKAGPNTAGGAATPSSGGGGGGGGSGGGAGGERPKEASKINLSLSAL
       :::::::::::::.:.:                        : ::: :::.:::::::::
XP_011 KLNLVDLAGSERQSKTG------------------------ATGERLKEATKINLSLSAL
          240       250                               260       270

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD GNVIAALAGNRSTHIPYRDSKLTRLLQDSLGGNAKTIMVATLGPASHSYDESLSTLRFAN
       ::::.::. .:  :.::::::::::::::::::.::.::: :.::...:::.:::::.::
XP_011 GNVISALVDGRCKHVPYRDSKLTRLLQDSLGGNTKTLMVACLSPADNNYDETLSTLRYAN
              280       290       300       310       320       330

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD RAKNIKNKPRVNEDPKDTLLREFQEEIARLKAQLEKRGMLGKRPRRKSSRRKKAVSAPPG
       :::::.::::.::::::.::::.:::: .::: : ..      :   :.  .. :  :: 
XP_011 RAKNIRNKPRINEDPKDALLREYQEEIKKLKAILTQQ----MSPSSLSALLSRQV--PPD
              340       350       360           370       380      

              430       440       450       460       470          
pF1KSD YPEGPVIEAWVAEEEDDNNNNHRPPQPILESALEKNMENYLQEQKERLEEEKA---AIQD
           ::    : :.          :::...  .: . .   .: .::: . ::   : :.
XP_011 ----PV---QVEEKLL--------PQPVIQHDVEAEKQLIREEYEERLARLKADYKAEQE
                 390               400       410       420         

       480       490           500       510       520       530   
pF1KSD DRSLVSEEKQKLLEEKEKML----EDLRREQQATELLAAKYKAMESKLLIGGRNIMDHTN
       .:. . :.   . .  .  :    :.::.: .:.  ... :::                 
XP_011 SRARLEEDITAMRNSYDVRLSTLEENLRKETEAVLQVGVLYKAEVMSRAEFASSAEYPPA
     430       440       450       460       470       480         

           540       550       560       570       580       590   
pF1KSD EQQKMLELKRQEIAEQKRREREMQQEMMLRDEETMELRGTYTSLQQEVEVKTKKLKKLYA
                                                                   
XP_011 FQYETVVKPKVFSTTDTLPSDDVSKTQVSSRFAELPKVEPSKSEISLGSSESSSLEETSV
     490       500       510       520       530       540         

>>XP_011540146 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-like pr  (997 aa)
 initn: 841 init1: 756 opt: 867  Z-score: 461.1  bits: 96.5 E(85289): 6.1e-19
Smith-Waterman score: 1419; 48.0% identity (70.2% similar) in 517 aa overlap (7-516:2-472)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MASKTKASEALKVVARCRPLSRKEEAAGHEQILTMDVKLGQVTLRNPRAAPGELPKTFTF
             ::::.:::.::::....:.    . ..:.:   .:  ..:: ::  : :: :::
XP_011      MASEAVKVVVRCRPMNQRERELRCQPVVTVDCARAQCCIQNPGAAD-EPPKQFTF
                    10        20        30        40         50    

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD DAVYDASSKQADLYDETVRPLIDSVLQGFNGTVFAYGQTGTGKTYTMQGTWVEPELRGVI
       :..: ..    ..:.: . ::...: .:.:::.:::::::.::..::::    :  ::.:
XP_011 DGAYHVDHVTEQIYNEIAYPLVEGVTEGYNGTIFAYGQTGSGKSFTMQGLPDPPSQRGII
           60        70        80        90       100       110    

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD PNAFEHIFTHISRSQNQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKEPGKRLELKENPETGVYIKDL
       : ::::.:  .. ..: ..::::::::::.:..::::. .  ..:::::.:: :::.: :
XP_011 PRAFEHVFESVQCAENTKFLVRASYLEIYNEDVRDLLGADTKQKLELKEHPEKGVYVKGL
          120       130       140       150       160       170    

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD SSFVTKNVKEIEHVMNLGNQTRAVGSTHMNEVSSRSHAIFIITVECSERGSDGQDHIRVG
       :  ....: . ::.:. : ..:.:: : ::. :::::.:: :..: :     :.::.:.:
XP_011 SMHTVHSVAQCEHIMETGWKNRSVGYTLMNKDSSRSHSIFTISIEMSAVDERGKDHLRAG
          180       190       200       210       220       230    

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD KLNLVDLAGSERQNKAGPNTAGGAATPSSGGGGGGGGSGGGAGGERPKEASKINLSLSAL
       :::::::::::::.:.:                        : ::: :::.:::::::::
XP_011 KLNLVDLAGSERQSKTG------------------------ATGERLKEATKINLSLSAL
          240       250                               260       270

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD GNVIAALAGNRSTHIPYRDSKLTRLLQDSLGGNAKTIMVATLGPASHSYDESLSTLRFAN
       ::::.::. .:  :.::::::::::::::::::.::.::: :.::...:::.:::::.::
XP_011 GNVISALVDGRCKHVPYRDSKLTRLLQDSLGGNTKTLMVACLSPADNNYDETLSTLRYAN
              280       290       300       310       320       330

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD RAKNIKNKPRVNEDPKDTLLREFQEEIARLKAQLEKRGMLGKRPRRKSSRRKKAVSAPPG
       :::::.::::.::::::.::::.:::: .::: : ..      :   :.  .. :  :: 
XP_011 RAKNIRNKPRINEDPKDALLREYQEEIKKLKAILTQQ----MSPSSLSALLSRQV--PPD
              340       350       360           370       380      

              430       440       450       460       470          
pF1KSD YPEGPVIEAWVAEEEDDNNNNHRPPQPILESALEKNMENYLQEQKERLEEEKA---AIQD
           ::    : :.          :::...  .: . .   .: .::: . ::   : :.
XP_011 ----PV---QVEEKLL--------PQPVIQHDVEAEKQLIREEYEERLARLKADYKAEQE
                 390               400       410       420         

       480       490           500       510       520       530   
pF1KSD DRSLVSEEKQKLLEEKEKML----EDLRREQQATELLAAKYKAMESKLLIGGRNIMDHTN
       .:. . :.   . .  .  :    :.::.: .:.  ... :::                 
XP_011 SRARLEEDITAMRNSYDVRLSTLEENLRKETEAVLQVGVLYKAEVMSRAEFASSAEYPPA
     430       440       450       460       470       480         

           540       550       560       570       580       590   
pF1KSD EQQKMLELKRQEIAEQKRREREMQQEMMLRDEETMELRGTYTSLQQEVEVKTKKLKKLYA
                                                                   
XP_011 FQYETVVKPKVFSTTDTLPSDDVSKTQVSSRFAELPKVEPSKSEISLGSSESSSLEETSV
     490       500       510       520       530       540         

>>XP_011540145 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-like pr  (1017 aa)
 initn: 841 init1: 756 opt: 867  Z-score: 461.0  bits: 96.5 E(85289): 6.2e-19
Smith-Waterman score: 1419; 48.0% identity (70.2% similar) in 517 aa overlap (7-516:2-472)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MASKTKASEALKVVARCRPLSRKEEAAGHEQILTMDVKLGQVTLRNPRAAPGELPKTFTF
             ::::.:::.::::....:.    . ..:.:   .:  ..:: ::  : :: :::
XP_011      MASEAVKVVVRCRPMNQRERELRCQPVVTVDCARAQCCIQNPGAAD-EPPKQFTF
                    10        20        30        40         50    

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD DAVYDASSKQADLYDETVRPLIDSVLQGFNGTVFAYGQTGTGKTYTMQGTWVEPELRGVI
       :..: ..    ..:.: . ::...: .:.:::.:::::::.::..::::    :  ::.:
XP_011 DGAYHVDHVTEQIYNEIAYPLVEGVTEGYNGTIFAYGQTGSGKSFTMQGLPDPPSQRGII
           60        70        80        90       100       110    

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD PNAFEHIFTHISRSQNQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKEPGKRLELKENPETGVYIKDL
       : ::::.:  .. ..: ..::::::::::.:..::::. .  ..:::::.:: :::.: :
XP_011 PRAFEHVFESVQCAENTKFLVRASYLEIYNEDVRDLLGADTKQKLELKEHPEKGVYVKGL
          120       130       140       150       160       170    

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD SSFVTKNVKEIEHVMNLGNQTRAVGSTHMNEVSSRSHAIFIITVECSERGSDGQDHIRVG
       :  ....: . ::.:. : ..:.:: : ::. :::::.:: :..: :     :.::.:.:
XP_011 SMHTVHSVAQCEHIMETGWKNRSVGYTLMNKDSSRSHSIFTISIEMSAVDERGKDHLRAG
          180       190       200       210       220       230    

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD KLNLVDLAGSERQNKAGPNTAGGAATPSSGGGGGGGGSGGGAGGERPKEASKINLSLSAL
       :::::::::::::.:.:                        : ::: :::.:::::::::
XP_011 KLNLVDLAGSERQSKTG------------------------ATGERLKEATKINLSLSAL
          240       250                               260       270

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD GNVIAALAGNRSTHIPYRDSKLTRLLQDSLGGNAKTIMVATLGPASHSYDESLSTLRFAN
       ::::.::. .:  :.::::::::::::::::::.::.::: :.::...:::.:::::.::
XP_011 GNVISALVDGRCKHVPYRDSKLTRLLQDSLGGNTKTLMVACLSPADNNYDETLSTLRYAN
              280       290       300       310       320       330

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD RAKNIKNKPRVNEDPKDTLLREFQEEIARLKAQLEKRGMLGKRPRRKSSRRKKAVSAPPG
       :::::.::::.::::::.::::.:::: .::: : ..      :   :.  .. :  :: 
XP_011 RAKNIRNKPRINEDPKDALLREYQEEIKKLKAILTQQ----MSPSSLSALLSRQV--PPD
              340       350       360           370       380      

              430       440       450       460       470          
pF1KSD YPEGPVIEAWVAEEEDDNNNNHRPPQPILESALEKNMENYLQEQKERLEEEKA---AIQD
           ::    : :.          :::...  .: . .   .: .::: . ::   : :.
XP_011 ----PV---QVEEKLL--------PQPVIQHDVEAEKQLIREEYEERLARLKADYKAEQE
                 390               400       410       420         

       480       490           500       510       520       530   
pF1KSD DRSLVSEEKQKLLEEKEKML----EDLRREQQATELLAAKYKAMESKLLIGGRNIMDHTN
       .:. . :.   . .  .  :    :.::.: .:.  ... :::                 
XP_011 SRARLEEDITAMRNSYDVRLSTLEENLRKETEAVLQVGVLYKAEVMSRAEFASSAEYPPA
     430       440       450       460       470       480         

           540       550       560       570       580       590   
pF1KSD EQQKMLELKRQEIAEQKRREREMQQEMMLRDEETMELRGTYTSLQQEVEVKTKKLKKLYA
                                                                   
XP_011 FQYETVVKPKVFSTTDTLPSDDVSKTQVSSRFAELPKVEPSKSEISLGSSESSSLEETSV
     490       500       510       520       530       540         




793 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 08:23:19 2016 done: Thu Nov  3 08:23:21 2016
 Total Scan time: 14.420 Total Display time:  0.200

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com