Result of FASTA (ccds) for pF1KSDB0042
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDB0042, 671 aa
  1>>>pF1KSDB0042 671 - 671 aa - 671 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4046+/-0.00104; mu= 9.6641+/- 0.062
 mean_var=118.7789+/-24.247, 0's: 0 Z-trim(107.2): 97  B-trim: 123 in 2/49
 Lambda= 0.117681
 statistics sampled from 9334 (9435) to 9334 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.647), E-opt: 0.2 (0.29), width:  16
 Scan time:  3.530

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS14472.1 SYTL4 gene_id:94121|Hs108|chrX         ( 671) 4461 769.0       0
CCDS53688.1 SYTL2 gene_id:54843|Hs108|chr11        ( 934) 1040 188.2 4.5e-47
CCDS53689.1 SYTL2 gene_id:54843|Hs108|chr11        ( 935) 1040 188.2 4.5e-47
CCDS76461.1 SYTL2 gene_id:54843|Hs108|chr11        ( 902) 1026 185.8 2.3e-46
CCDS31652.1 SYTL2 gene_id:54843|Hs108|chr11        ( 376) 1002 181.6 1.8e-45
CCDS41698.1 SYTL2 gene_id:54843|Hs108|chr11        ( 365)  981 178.0 2.1e-44
CCDS31649.1 SYTL2 gene_id:54843|Hs108|chr11        ( 910)  972 176.7 1.3e-43
CCDS53687.1 SYTL2 gene_id:54843|Hs108|chr11        ( 336)  959 174.3 2.6e-43
CCDS34563.1 SYTL3 gene_id:94120|Hs108|chr6         ( 542)  750 138.9 1.9e-32
CCDS56458.1 SYTL3 gene_id:94120|Hs108|chr6         ( 610)  746 138.2 3.3e-32
CCDS14244.1 SYTL5 gene_id:94122|Hs108|chrX         ( 730)  645 121.1 5.6e-27
CCDS55399.1 SYTL5 gene_id:94122|Hs108|chrX         ( 752)  645 121.1 5.7e-27
CCDS298.1 SYTL1 gene_id:84958|Hs108|chr1           ( 550)  501 96.6   1e-19
CCDS53286.1 SYTL1 gene_id:84958|Hs108|chr1         ( 562)  501 96.6   1e-19


>>CCDS14472.1 SYTL4 gene_id:94121|Hs108|chrX              (671 aa)
 initn: 4461 init1: 4461 opt: 4461  Z-score: 4099.8  bits: 769.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4461; 99.9% identity (100.0% similar) in 671 aa overlap (1-671:1-671)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSELLDLSFLSEEEKDLILSVLQRDEEVRKADEKRIRRLKNELLEIKRKGAKRGSQHYSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MSELLDLSFLSEEEKDLILSVLQRDEEVRKADEKRIRRLKNELLEIKRKGAKRGSQHYSD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD RTCARCQESLGRLSPKTNTCRGCNHLVCRDCRIQESNGTWRCKVCAKEIELKKATGDWFY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RTCARCQESLGRLSPKTNTCRGCNHLVCRDCRIQESNGTWRCKVCAKEIELKKATGDWFY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD DQKVNRFAYRTGSEIIRMSLRHKPAVSKRETVGQSLLHQTQMGDIWPGRKIIQERQKEPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DQKVNRFAYRTGSEIIRMSLRHKPAVSKRETVGQSLLHQTQMGDIWPGRKIIQERQKEPS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD VLFEVPKLKSGKSALEAESESLDSFTADSDSTSRRDSLDKSGLFPEWKKMSAPKSQVEKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VLFEVPKLKSGKSALEAESESLDSFTADSDSTSRRDSLDKSGLFPEWKKMSAPKSQVEKE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD TQPGGQNVVFVDEGEMIFKKNTRKILRPSEYTKSVIDLRPEDVVHESGSLGDRSKSVPGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TQPGGQNVVFVDEGEMIFKKNTRKILRPSEYTKSVIDLRPEDVVHESGSLGDRSKSVPGL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD NVDMEEEEEEEDIDHLVKLHRQKLARSSMQSGSSMSTIGSMMSIYSEAGDFGNIFVTGRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NVDMEEEEEEEDIDHLVKLHRQKLARSSMQSGSSMSTIGSMMSIYSEAGDFGNIFVTGRI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD AFSLKYEQQTQSLVVHVKECHQLAYADEAKKRSNPYVKTYLLPDKSRQGKRKTSIKRDTV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS14 AFSLKYEQQTQSLVVHVKECHQLAYADEAKKRSNPYVKTYLLPDKSRQGKRKTSIKRDTI
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD NPLYDETLRYEIPESLLAQRTLQFSVWHHGRFGRNTFLGEAEIQMDSWKLDKKLDHCLPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NPLYDETLRYEIPESLLAQRTLQFSVWHHGRFGRNTFLGEAEIQMDSWKLDKKLDHCLPL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD HGKISAESPTGLPSHKGELVVSLKYIPASKTPVGGDRKKSKGGEGGELQVWIKEAKNLTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 HGKISAESPTGLPSHKGELVVSLKYIPASKTPVGGDRKKSKGGEGGELQVWIKEAKNLTA
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD AKAGGTSDSFVKGYLLPMRNKASKRKTPVMKKTLNPHYNHTFVYNGVRLEDLQHMCLELT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AKAGGTSDSFVKGYLLPMRNKASKRKTPVMKKTLNPHYNHTFVYNGVRLEDLQHMCLELT
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD VWDREPLASNDFLGGVRLGVGTGISNGEVVDWMDSTGEEVSLWQKMRQYPGSWAEGTLQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VWDREPLASNDFLGGVRLGVGTGISNGEVVDWMDSTGEEVSLWQKMRQYPGSWAEGTLQL
              610       620       630       640       650       660

              670 
pF1KSD RSSMAKQKLGL
       :::::::::::
CCDS14 RSSMAKQKLGL
              670 

>>CCDS53688.1 SYTL2 gene_id:54843|Hs108|chr11             (934 aa)
 initn: 865 init1: 438 opt: 1040  Z-score: 958.6  bits: 188.2 E(32554): 4.5e-47
Smith-Waterman score: 1040; 35.3% identity (64.2% similar) in 553 aa overlap (122-661:387-925)

             100       110       120       130       140       150 
pF1KSD RIQESNGTWRCKVCAKEIELKKATGDWFYDQKVNRFAYRTGSEIIRMSLRHKPAVSKRET
                                     .: . :   :.:  .  :  :.: .:    
CCDS53 SVLESDRLKNGMEDAGDTEEFQSDPKPSQYRKPSLFHQSTSSPYVSKSETHQPMTSGSFP
        360       370       380       390       400       410      

             160       170       180        190         200        
pF1KSD VGQSLLHQTQMGDIWPGRKIIQERQKEPS-VLFEVPKLKS--GKSALEAESESLDSFTAD
       .. .:  ....    :     .   .::.    :. .:.:   .:  .  :. ..   ..
CCDS53 IN-GLHSHSEVLTARPQSMENSPTINEPKDKSSELTRLESVLPRSPADELSHCVEPEPSQ
         420       430       440       450       460       470     

      210       220       230       240       250       260        
pF1KSD SDSTSRRDSLDKSGLFPEWKKMSAPKSQVEKETQPGGQNVVFVDEGEMIFKKNTRKILRP
         . : ::  . :   :     .  .: ..:  . . ...   . ..    .. ....: 
CCDS53 VPGGSSRDRQQGSEEEPSPVLKTLERSAARKMPSKSLEDISSDSSNQAKVDNQPEELVRS
         480       490       500       510       520       530     

      270       280       290       300       310         320      
pF1KSD SEYTKSVIDLRPEDVVHESGSLGDRSKSVPGLNVDMEEEEEEEDI--DHLVKLHRQKLAR
       .: . :..  .:..   .  .:   :::::..  : : ...: :   .   .: :.: . 
CCDS53 AEDV-STVPTQPDNPFSHPDKLKRMSKSVPAFLQD-ESDDRETDTASESSYQLSRHKKSP
          540       550       560        570       580       590   

             330         340       350       360       370         
pF1KSD SSM-----QSG-SSMSTI-GSMMSIYSEAGDFGNIFVTGRIAFSLKYEQQTQSLVVHVKE
       ::.     .:: .:.:.. ::.::.::  :::::. : : : :...: .. . : : : .
CCDS53 SSLTNLSSSSGMTSLSSVSGSVMSVYS--GDFGNLEVKGNIQFAIEYVESLKELHVFVAQ
           600       610       620         630       640       650 

     380       390       400       410       420       430         
pF1KSD CHQLAYADEAKKRSNPYVKTYLLPDKSRQGKRKTSIKRDTVNPLYDETLRYEIPESLLAQ
       :..:: ::  :.::.::::.::::::...::.:: . . :.::.:.: :::.: ...:  
CCDS53 CKDLAAADVKKQRSDPYVKAYLLPDKGKMGKKKTLVVKKTLNPVYNEILRYKIEKQILKT
             660       670       680       690       700       710 

     440       450       460       470       480       490         
pF1KSD RTLQFSVWHHGRFGRNTFLGEAEIQMDSWKLDKKLDHCLPLHGKISAESPTGLPS-HKGE
       . :..:.::.  : ::.::::.:.....:  :.: .. :  .      .:..: . ..::
CCDS53 QKLNLSIWHRDTFKRNSFLGEVELDLETWDWDNKQNKQLRWYPLKRKTAPVALEAENRGE
             720       730       740       750       760       770 

      500       510       520       530       540       550        
pF1KSD LVVSLKYIPASKTPVGGDRKKSKGGEGGELQVWIKEAKNLTAAKAGGTSDSFVKGYLLPM
       . ..:.:.:    :: : .  . :    :...:.::  .:   . :.  .::::  .:: 
CCDS53 MKLALQYVPE---PVPGKKLPTTG----EVHIWVKECLDLPLLR-GSHLNSFVKCTILPD
             780          790           800        810       820   

      560       570       580       590       600       610        
pF1KSD RNKASKRKTPVMKKTLNPHYNHTFVYNGVRLEDLQHMCLELTVWDREPLASNDFLGGVRL
        .. :..:: .. :: :: .:::.::.: : :::.. :.::::::.  : .:.::::.:.
CCDS53 TSRKSRQKTRAVGKTTNPIFNHTMVYDGFRPEDLMEACVELTVWDHYKL-TNQFLGGLRI
           830       840       850       860       870        880  

      620       630       640       650       660       670 
pF1KSD GVGTGISNGEVVDWMDSTGEEVSLWQKMRQYPGSWAEGTLQLRSSMAKQKLGL
       : ::: : :  :::::::.:::.::.:: . :..: :.:: ::          
CCDS53 GFGTGKSYGTEVDWMDSTSEEVALWEKMVNSPNTWIEATLPLRMLLIAKISK 
            890       900       910       920       930     

>>CCDS53689.1 SYTL2 gene_id:54843|Hs108|chr11             (935 aa)
 initn: 865 init1: 438 opt: 1040  Z-score: 958.6  bits: 188.2 E(32554): 4.5e-47
Smith-Waterman score: 1040; 35.3% identity (64.2% similar) in 553 aa overlap (122-661:388-926)

             100       110       120       130       140       150 
pF1KSD RIQESNGTWRCKVCAKEIELKKATGDWFYDQKVNRFAYRTGSEIIRMSLRHKPAVSKRET
                                     .: . :   :.:  .  :  :.: .:    
CCDS53 SVLESDRLKNGMEDAGDTEEFQSDPKPSQYRKPSLFHQSTSSPYVSKSETHQPMTSGSFP
       360       370       380       390       400       410       

             160       170       180        190         200        
pF1KSD VGQSLLHQTQMGDIWPGRKIIQERQKEPS-VLFEVPKLKS--GKSALEAESESLDSFTAD
       .. .:  ....    :     .   .::.    :. .:.:   .:  .  :. ..   ..
CCDS53 IN-GLHSHSEVLTARPQSMENSPTINEPKDKSSELTRLESVLPRSPADELSHCVEPEPSQ
        420       430       440       450       460       470      

      210       220       230       240       250       260        
pF1KSD SDSTSRRDSLDKSGLFPEWKKMSAPKSQVEKETQPGGQNVVFVDEGEMIFKKNTRKILRP
         . : ::  . :   :     .  .: ..:  . . ...   . ..    .. ....: 
CCDS53 VPGGSSRDRQQGSEEEPSPVLKTLERSAARKMPSKSLEDISSDSSNQAKVDNQPEELVRS
        480       490       500       510       520       530      

      270       280       290       300       310         320      
pF1KSD SEYTKSVIDLRPEDVVHESGSLGDRSKSVPGLNVDMEEEEEEEDI--DHLVKLHRQKLAR
       .: . :..  .:..   .  .:   :::::..  : : ...: :   .   .: :.: . 
CCDS53 AEDV-STVPTQPDNPFSHPDKLKRMSKSVPAFLQD-ESDDRETDTASESSYQLSRHKKSP
        540        550       560       570        580       590    

             330         340       350       360       370         
pF1KSD SSM-----QSG-SSMSTI-GSMMSIYSEAGDFGNIFVTGRIAFSLKYEQQTQSLVVHVKE
       ::.     .:: .:.:.. ::.::.::  :::::. : : : :...: .. . : : : .
CCDS53 SSLTNLSSSSGMTSLSSVSGSVMSVYS--GDFGNLEVKGNIQFAIEYVESLKELHVFVAQ
          600       610       620         630       640       650  

     380       390       400       410       420       430         
pF1KSD CHQLAYADEAKKRSNPYVKTYLLPDKSRQGKRKTSIKRDTVNPLYDETLRYEIPESLLAQ
       :..:: ::  :.::.::::.::::::...::.:: . . :.::.:.: :::.: ...:  
CCDS53 CKDLAAADVKKQRSDPYVKAYLLPDKGKMGKKKTLVVKKTLNPVYNEILRYKIEKQILKT
            660       670       680       690       700       710  

     440       450       460       470       480       490         
pF1KSD RTLQFSVWHHGRFGRNTFLGEAEIQMDSWKLDKKLDHCLPLHGKISAESPTGLPS-HKGE
       . :..:.::.  : ::.::::.:.....:  :.: .. :  .      .:..: . ..::
CCDS53 QKLNLSIWHRDTFKRNSFLGEVELDLETWDWDNKQNKQLRWYPLKRKTAPVALEAENRGE
            720       730       740       750       760       770  

      500       510       520       530       540       550        
pF1KSD LVVSLKYIPASKTPVGGDRKKSKGGEGGELQVWIKEAKNLTAAKAGGTSDSFVKGYLLPM
       . ..:.:.:    :: : .  . :    :...:.::  .:   . :.  .::::  .:: 
CCDS53 MKLALQYVPE---PVPGKKLPTTG----EVHIWVKECLDLPLLR-GSHLNSFVKCTILPD
            780          790           800        810       820    

      560       570       580       590       600       610        
pF1KSD RNKASKRKTPVMKKTLNPHYNHTFVYNGVRLEDLQHMCLELTVWDREPLASNDFLGGVRL
        .. :..:: .. :: :: .:::.::.: : :::.. :.::::::.  : .:.::::.:.
CCDS53 TSRKSRQKTRAVGKTTNPIFNHTMVYDGFRPEDLMEACVELTVWDHYKL-TNQFLGGLRI
          830       840       850       860       870        880   

      620       630       640       650       660       670 
pF1KSD GVGTGISNGEVVDWMDSTGEEVSLWQKMRQYPGSWAEGTLQLRSSMAKQKLGL
       : ::: : :  :::::::.:::.::.:: . :..: :.:: ::          
CCDS53 GFGTGKSYGTEVDWMDSTSEEVALWEKMVNSPNTWIEATLPLRMLLIAKISK 
           890       900       910       920       930      

>>CCDS76461.1 SYTL2 gene_id:54843|Hs108|chr11             (902 aa)
 initn: 691 init1: 438 opt: 1026  Z-score: 946.0  bits: 185.8 E(32554): 2.3e-46
Smith-Waterman score: 1026; 36.0% identity (65.5% similar) in 534 aa overlap (139-661:385-893)

      110       120       130       140       150       160        
pF1KSD IELKKATGDWFYDQKVNRFAYRTGSEIIRMSLRHKPAVSKRETVGQSLLHQTQMGDIWPG
                                     :....:.... .  .. : .  ..    :.
CCDS76 KSETHQPMTSGSFPINGLHSHSEVLTARPQSMENSPTINEPKDKSSELTRLESVLPRSPA
          360       370       380       390       400       410    

      170       180       190       200       210       220        
pF1KSD RKIIQERQKEPSVLFEVPKLKSGKSALEAESESLDSFTADSDSTSRRDSLDKSGLFPEWK
        .. .  . :::   .::  .:      .: :    . .   :..:.  . ...:    .
CCDS76 DELSHCVEPEPS---QVPGGSSRDRQQGSEEEPSPVLKTLERSAARK--MPSKSL----E
          420          430       440       450         460         

      230        240       250       260       270       280       
pF1KSD KMSAPKS-QVEKETQPGGQNVVFVDEGEMIFKKNTRKILRPSEYTKSVIDLRPEDVVHES
        .:. .: :.. ..::  ...:   : .   : . . .        :..  .:..   . 
CCDS76 DISSDSSNQAKVDNQP--EELVRSAEDDE--KPDQKPVTNECVPRISTVPTQPDNPFSHP
         470       480         490         500       510       520 

       290       300       310         320            330          
pF1KSD GSLGDRSKSVPGLNVDMEEEEEEEDI--DHLVKLHRQKLARSSM-----QSG-SSMSTI-
        .:   :::::..  : : ...: :   .   .: :.: . ::.     .:: .:.:.. 
CCDS76 DKLKRMSKSVPAFLQD-ESDDRETDTASESSYQLSRHKKSPSSLTNLSSSSGMTSLSSVS
             530        540       550       560       570       580

      340       350       360       370       380       390        
pF1KSD GSMMSIYSEAGDFGNIFVTGRIAFSLKYEQQTQSLVVHVKECHQLAYADEAKKRSNPYVK
       ::.::.::  :::::. : : : :...: .. . : : : .:..:: ::  :.::.::::
CCDS76 GSVMSVYS--GDFGNLEVKGNIQFAIEYVESLKELHVFVAQCKDLAAADVKKQRSDPYVK
                590       600       610       620       630        

      400       410       420       430       440       450        
pF1KSD TYLLPDKSRQGKRKTSIKRDTVNPLYDETLRYEIPESLLAQRTLQFSVWHHGRFGRNTFL
       .::::::...::.:: . . :.::.:.: :::.: ...:  . :..:.::.  : ::.::
CCDS76 AYLLPDKGKMGKKKTLVVKKTLNPVYNEILRYKIEKQILKTQKLNLSIWHRDTFKRNSFL
      640       650       660       670       680       690        

      460       470       480       490        500       510       
pF1KSD GEAEIQMDSWKLDKKLDHCLPLHGKISAESPTGLPS-HKGELVVSLKYIPASKTPVGGDR
       ::.:.....:  :.: .. :  .      .:..: . ..::. ..:.:.:    :: : .
CCDS76 GEVELDLETWDWDNKQNKQLRWYPLKRKTAPVALEAENRGEMKLALQYVPE---PVPGKK
      700       710       720       730       740          750     

       520       530       540       550       560       570       
pF1KSD KKSKGGEGGELQVWIKEAKNLTAAKAGGTSDSFVKGYLLPMRNKASKRKTPVMKKTLNPH
         .     ::...:.::  .:   . :.  .::::  .::  .. :..:: .. :: :: 
CCDS76 LPTT----GEVHIWVKECLDLPLLR-GSHLNSFVKCTILPDTSRKSRQKTRAVGKTTNPI
             760       770        780       790       800       810

       580       590       600       610       620       630       
pF1KSD YNHTFVYNGVRLEDLQHMCLELTVWDREPLASNDFLGGVRLGVGTGISNGEVVDWMDSTG
       .:::.::.: : :::.. :.::::::.  : .:.::::.:.: ::: : :  :::::::.
CCDS76 FNHTMVYDGFRPEDLMEACVELTVWDHYKL-TNQFLGGLRIGFGTGKSYGTEVDWMDSTS
              820       830       840        850       860         

       640       650       660       670 
pF1KSD EEVSLWQKMRQYPGSWAEGTLQLRSSMAKQKLGL
       :::.::.:: . :..: :.:: ::          
CCDS76 EEVALWEKMVNSPNTWIEATLPLRMLLIAKISK 
     870       880       890       900   

>>CCDS31652.1 SYTL2 gene_id:54843|Hs108|chr11             (376 aa)
 initn: 691 init1: 438 opt: 1002  Z-score: 929.9  bits: 181.6 E(32554): 1.8e-45
Smith-Waterman score: 1002; 43.9% identity (71.7% similar) in 378 aa overlap (294-661:2-367)

           270       280       290       300       310         320 
pF1KSD KILRPSEYTKSVIDLRPEDVVHESGSLGDRSKSVPGLNVDMEEEEEEEDI--DHLVKLHR
                                     :::::..  : : ...: :   .   .: :
CCDS31                              MSKSVPAFLQD-ESDDRETDTASESSYQLSR
                                            10         20        30

                  330         340       350       360       370    
pF1KSD QKLARSSM-----QSG-SSMSTI-GSMMSIYSEAGDFGNIFVTGRIAFSLKYEQQTQSLV
       .: . ::.     .:: .:.:.. ::.::.::  :::::. : : : :...: .. . : 
CCDS31 HKKSPSSLTNLSSSSGMTSLSSVSGSVMSVYS--GDFGNLEVKGNIQFAIEYVESLKELH
               40        50        60          70        80        

          380       390       400       410       420       430    
pF1KSD VHVKECHQLAYADEAKKRSNPYVKTYLLPDKSRQGKRKTSIKRDTVNPLYDETLRYEIPE
       : : .:..:: ::  :.::.::::.::::::...::.:: . . :.::.:.: :::.: .
CCDS31 VFVAQCKDLAAADVKKQRSDPYVKAYLLPDKGKMGKKKTLVVKKTLNPVYNEILRYKIEK
       90       100       110       120       130       140        

          440       450       460       470       480       490    
pF1KSD SLLAQRTLQFSVWHHGRFGRNTFLGEAEIQMDSWKLDKKLDHCLPLHGKISAESPTGLPS
       ..:  . :..:.::.  : ::.::::.:.....:  :.: .. :  .      .:..: .
CCDS31 QILKTQKLNLSIWHRDTFKRNSFLGEVELDLETWDWDNKQNKQLRWYPLKRKTAPVALEA
      150       160       170       180       190       200        

           500       510       520       530       540       550   
pF1KSD -HKGELVVSLKYIPASKTPVGGDRKKSKGGEGGELQVWIKEAKNLTAAKAGGTSDSFVKG
        ..::. ..:.:.:    :: : .  . :    :...:.::  .:   . :.  .:::: 
CCDS31 ENRGEMKLALQYVP---EPVPGKKLPTTG----EVHIWVKECLDLPLLR-GSHLNSFVKC
      210       220          230           240       250        260

           560       570       580       590       600       610   
pF1KSD YLLPMRNKASKRKTPVMKKTLNPHYNHTFVYNGVRLEDLQHMCLELTVWDREPLASNDFL
        .::  .. :..:: .. :: :: .:::.::.: : :::.. :.::::::.  : .:.::
CCDS31 TILPDTSRKSRQKTRAVGKTTNPIFNHTMVYDGFRPEDLMEACVELTVWDHYKL-TNQFL
              270       280       290       300       310          

           620       630       640       650       660       670 
pF1KSD GGVRLGVGTGISNGEVVDWMDSTGEEVSLWQKMRQYPGSWAEGTLQLRSSMAKQKLGL
       ::.:.: ::: : :  :::::::.:::.::.:: . :..: :.:: ::          
CCDS31 GGLRIGFGTGKSYGTEVDWMDSTSEEVALWEKMVNSPNTWIEATLPLRMLLIAKISK 
     320       330       340       350       360       370       

>>CCDS41698.1 SYTL2 gene_id:54843|Hs108|chr11             (365 aa)
 initn: 691 init1: 438 opt: 981  Z-score: 910.8  bits: 178.0 E(32554): 2.1e-44
Smith-Waterman score: 981; 42.6% identity (72.0% similar) in 364 aa overlap (303-661:4-356)

            280       290       300       310       320       330  
pF1KSD KSVIDLRPEDVVHESGSLGDRSKSVPGLNVDMEEEEEEEDIDHLVKLHRQKLARSSMQSG
                                     : : .   :.  .: . ...  . ....:.
CCDS41                            MSDDRETDTASESSYQLSRHKKSPSSLTNLSSS
                                          10        20        30   

                340       350       360       370       380        
pF1KSD SSMSTI----GSMMSIYSEAGDFGNIFVTGRIAFSLKYEQQTQSLVVHVKECHQLAYADE
       :.:...    ::.::.::  :::::. : : : :...: .. . : : : .:..:: :: 
CCDS41 SGMTSLSSVSGSVMSVYS--GDFGNLEVKGNIQFAIEYVESLKELHVFVAQCKDLAAADV
            40        50          60        70        80        90 

      390       400       410       420       430       440        
pF1KSD AKKRSNPYVKTYLLPDKSRQGKRKTSIKRDTVNPLYDETLRYEIPESLLAQRTLQFSVWH
        :.::.::::.::::::...::.:: . . :.::.:.: :::.: ...:  . :..:.::
CCDS41 KKQRSDPYVKAYLLPDKGKMGKKKTLVVKKTLNPVYNEILRYKIEKQILKTQKLNLSIWH
             100       110       120       130       140       150 

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pF1KSD HGRFGRNTFLGEAEIQMDSWKLDKKLDHCLPLHGKISAESPTGLPS-HKGELVVSLKYIP
       .  : ::.::::.:.....:  :.: .. :  .      .:..: . ..::. ..:.:.:
CCDS41 RDTFKRNSFLGEVELDLETWDWDNKQNKQLRWYPLKRKTAPVALEAENRGEMKLALQYVP
             160       170       180       190       200       210 

       510       520       530       540       550       560       
pF1KSD ASKTPVGGDRKKSKGGEGGELQVWIKEAKNLTAAKAGGTSDSFVKGYLLPMRNKASKRKT
           :: : .  . :    :...:.::  .:   . :.  .::::  .::  .. :..::
CCDS41 E---PVPGKKLPTTG----EVHIWVKECLDLPLLR-GSHLNSFVKCTILPDTSRKSRQKT
                220           230        240       250       260   

       570       580       590       600       610       620       
pF1KSD PVMKKTLNPHYNHTFVYNGVRLEDLQHMCLELTVWDREPLASNDFLGGVRLGVGTGISNG
        .. :: :: .:::.::.: : :::.. :.::::::.  : .:.::::.:.: ::: : :
CCDS41 RAVGKTTNPIFNHTMVYDGFRPEDLMEACVELTVWDHYKL-TNQFLGGLRIGFGTGKSYG
           270       280       290       300        310       320  

       630       640       650       660       670 
pF1KSD EVVDWMDSTGEEVSLWQKMRQYPGSWAEGTLQLRSSMAKQKLGL
         :::::::.:::.::.:: . :..: :.:: ::          
CCDS41 TEVDWMDSTSEEVALWEKMVNSPNTWIEATLPLRMLLIAKISK 
            330       340       350       360      

>>CCDS31649.1 SYTL2 gene_id:54843|Hs108|chr11             (910 aa)
 initn: 831 init1: 437 opt: 972  Z-score: 896.4  bits: 176.7 E(32554): 1.3e-43
Smith-Waterman score: 985; 35.4% identity (63.8% similar) in 536 aa overlap (155-661:390-901)

          130       140       150       160       170       180    
pF1KSD NRFAYRTGSEIIRMSLRHKPAVSKRETVGQSLLHQTQMGDIWPGRKIIQERQKEPSVLFE
                                     ::.::.  .   :  .  . .:   :  : 
CCDS31 ESDRLKNGMEDAGDTEEFQSDPKPSQYRKPSLFHQSTSS---PYVSKSETHQPMTSGSFP
     360       370       380       390          400       410      

          190       200       210       220             230        
pF1KSD VPKLKSGKSALEAESESLDSFTADSDSTSRRDSLDK-SGLFP-----EWKKMSAPK-SQV
       .  :.: . .: :. .:...  . ..  .. . : .  ...:     : ..   :. :::
CCDS31 INGLHSHSEVLTARPQSMENSPTINEPKDKSSELTRLESVLPRSPADELSHCVEPEPSQV
        420       430       440       450       460       470      

           240       250       260         270                280  
pF1KSD E----KETQPGGQNVVFVDEGEMIFKKNTRKILR--PSEYTKSV---------IDLRPED
            .. : :..     .:   ..:   :.  :  ::.  ...         .: .::.
CCDS31 PGGSSRDRQQGSE-----EEPSPVLKTLERSAARKMPSKSLEDISSDSSNQAKVDNQPEE
        480            490       500       510       520       530 

            290       300            310       320        330      
pF1KSD VVHESGSLGDRSKSVPGLN-----VDMEEEEEEEDIDHLVKLHRQ-KLARSSMQSGSSMS
       .:. :.   ..  . :  :     ..    . .. ..:  ::.:. : . . .:.  :  
CCDS31 LVR-SAEDDEKPDQKPVTNECVPRISTVPTQPDNPFSHPDKLKRMSKSVPAFLQDEVS--
              540       550       560       570       580          

        340       350       360       370       380       390      
pF1KSD TIGSMMSIYSEAGDFGNIFVTGRIAFSLKYEQQTQSLVVHVKECHQLAYADEAKKRSNPY
         ::.::.::  :::::. : : : :...: .. . : : : .:..:: ::  :.::.::
CCDS31 --GSVMSVYS--GDFGNLEVKGNIQFAIEYVESLKELHVFVAQCKDLAAADVKKQRSDPY
        590         600       610       620       630       640    

        400       410       420       430       440       450      
pF1KSD VKTYLLPDKSRQGKRKTSIKRDTVNPLYDETLRYEIPESLLAQRTLQFSVWHHGRFGRNT
       ::.::::::...::.:: . . :.::.:.: :::.: ...:  . :..:.::.  : ::.
CCDS31 VKAYLLPDKGKMGKKKTLVVKKTLNPVYNEILRYKIEKQILKTQKLNLSIWHRDTFKRNS
          650       660       670       680       690       700    

        460       470       480       490        500       510     
pF1KSD FLGEAEIQMDSWKLDKKLDHCLPLHGKISAESPTGLPS-HKGELVVSLKYIPASKTPVGG
       ::::.:.....:  :.: .. :  .      .:..: . ..::. ..:.:.:    :: :
CCDS31 FLGEVELDLETWDWDNKQNKQLRWYPLKRKTAPVALEAENRGEMKLALQYVP---EPVPG
          710       720       730       740       750          760 

         520       530       540       550       560       570     
pF1KSD DRKKSKGGEGGELQVWIKEAKNLTAAKAGGTSDSFVKGYLLPMRNKASKRKTPVMKKTLN
        .  . :    :...:.::  .:   . :.  .::::  .::  .. :..:: .. :: :
CCDS31 KKLPTTG----EVHIWVKECLDLPLLR-GSHLNSFVKCTILPDTSRKSRQKTRAVGKTTN
                 770       780        790       800       810      

         580       590       600       610       620       630     
pF1KSD PHYNHTFVYNGVRLEDLQHMCLELTVWDREPLASNDFLGGVRLGVGTGISNGEVVDWMDS
       : .:::.::.: : :::.. :.::::::.  : .:.::::.:.: ::: : :  ::::::
CCDS31 PIFNHTMVYDGFRPEDLMEACVELTVWDHYKL-TNQFLGGLRIGFGTGKSYGTEVDWMDS
        820       830       840        850       860       870     

         640       650       660       670 
pF1KSD TGEEVSLWQKMRQYPGSWAEGTLQLRSSMAKQKLGL
       :.:::.::.:: . :..: :.:: ::          
CCDS31 TSEEVALWEKMVNSPNTWIEATLPLRMLLIAKISK 
         880       890       900       910 

>>CCDS53687.1 SYTL2 gene_id:54843|Hs108|chr11             (336 aa)
 initn: 686 init1: 437 opt: 959  Z-score: 891.2  bits: 174.3 E(32554): 2.6e-43
Smith-Waterman score: 959; 45.7% identity (73.5% similar) in 324 aa overlap (339-661:15-327)

      310       320       330       340       350       360        
pF1KSD EEEDIDHLVKLHRQKLARSSMQSGSSMSTIGSMMSIYSEAGDFGNIFVTGRIAFSLKYEQ
                                     ::.::.::  :::::. : : : :...: .
CCDS53                 MSKSVPAFLQDEVSGSVMSVYS--GDFGNLEVKGNIQFAIEYVE
                               10        20          30        40  

      370       380       390       400       410       420        
pF1KSD QTQSLVVHVKECHQLAYADEAKKRSNPYVKTYLLPDKSRQGKRKTSIKRDTVNPLYDETL
       . . : : : .:..:: ::  :.::.::::.::::::...::.:: . . :.::.:.: :
CCDS53 SLKELHVFVAQCKDLAAADVKKQRSDPYVKAYLLPDKGKMGKKKTLVVKKTLNPVYNEIL
             50        60        70        80        90       100  

      430       440       450       460       470       480        
pF1KSD RYEIPESLLAQRTLQFSVWHHGRFGRNTFLGEAEIQMDSWKLDKKLDHCLPLHGKISAES
       ::.: ...:  . :..:.::.  : ::.::::.:.....:  :.: .. :  .      .
CCDS53 RYKIEKQILKTQKLNLSIWHRDTFKRNSFLGEVELDLETWDWDNKQNKQLRWYPLKRKTA
            110       120       130       140       150       160  

      490        500       510       520       530       540       
pF1KSD PTGLPS-HKGELVVSLKYIPASKTPVGGDRKKSKGGEGGELQVWIKEAKNLTAAKAGGTS
       :..: . ..::. ..:.:.:    :: : .  . :    :...:.::  .:   . :.  
CCDS53 PVALEAENRGEMKLALQYVPE---PVPGKKLPTTG----EVHIWVKECLDLPLLR-GSHL
            170       180          190           200       210     

       550       560       570       580       590       600       
pF1KSD DSFVKGYLLPMRNKASKRKTPVMKKTLNPHYNHTFVYNGVRLEDLQHMCLELTVWDREPL
       .::::  .::  .. :..:: .. :: :: .:::.::.: : :::.. :.::::::.  :
CCDS53 NSFVKCTILPDTSRKSRQKTRAVGKTTNPIFNHTMVYDGFRPEDLMEACVELTVWDHYKL
          220       230       240       250       260       270    

       610       620       630       640       650       660       
pF1KSD ASNDFLGGVRLGVGTGISNGEVVDWMDSTGEEVSLWQKMRQYPGSWAEGTLQLRSSMAKQ
        .:.::::.:.: ::: : :  :::::::.:::.::.:: . :..: :.:: ::      
CCDS53 -TNQFLGGLRIGFGTGKSYGTEVDWMDSTSEEVALWEKMVNSPNTWIEATLPLRMLLIAK
           280       290       300       310       320       330   

       670 
pF1KSD KLGL
           
CCDS53 ISK 
           

>>CCDS34563.1 SYTL3 gene_id:94120|Hs108|chr6              (542 aa)
 initn: 972 init1: 418 opt: 750  Z-score: 696.2  bits: 138.9 E(32554): 1.9e-32
Smith-Waterman score: 952; 33.0% identity (57.5% similar) in 675 aa overlap (1-660:1-541)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSELLDLSFLSEEEKDLILSVLQRDEEVRKADEKRIRRLKNELLEIKRKGAKRGSQHYSD
       :.. .::: :.: :.. ::.:: ::. :....:.: :.::..: ... ::::  . ....
CCDS34 MAQEIDLSALKELEREAILQVLYRDQAVQNTEEERTRKLKTHLQHLRWKGAKNTDWEHKE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90        100       110         
pF1KSD RTCARCQESLGRLSPKTNTCRGCNHLVCRDCRI-QESNGTWRCKVCAKEIELKKATGDWF
       . :::::. :: :  .  .::::.: :: .::.  ... .:.: :: .. ..:  ::.::
CCDS34 KCCARCQQVLGFLLHRGAVCRGCSHRVCAQCRVFLRGTHAWKCTVCFEDRNVKIKTGEWF
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KSD YDQKVNRFAYRTGSEIIRMSLRHKPAVSKRETVGQSLLHQTQMGDIWPGRKIIQERQKEP
       :......:                :. .:.:::: .::.. :             . .. 
CCDS34 YEERAKKF----------------PTGGKHETVGGQLLQSYQ-------------KLSKI
                              130       140                    150 

     180       190       200       210       220       230         
pF1KSD SVLFEVPKLKSGKSALEAESESLDSFTADSDSTSRRDSLDKSGLFPEWKKMSAPKSQVEK
       ::.  .:   :       ::.        : : .:              :.:::      
CCDS34 SVVPPTPPPVS-------ESQC-------SRSPGR--------------KVSAPD-----
             160                     170                           

     240       250       260       270       280       290         
pF1KSD ETQPGGQNVVFVDEGEMIFKKNTRKILRPSEYTKSVIDLRPEDVVHESGSLGDRSKSVPG
                                ::.:         :  ::          . .. : 
CCDS34 -------------------------ILKP---------LNQED---------PKCSTNPI
                               180                         190     

     300       310       320       330       340          350      
pF1KSD LNVDMEEEEEEEDIDHLVKLHRQKLARSSMQSGSSMSTIGSMMSIYS---EAGDFGNIFV
       :        .....        .. : :.. ::.     ::..:: :   : :.: :  :
CCDS34 L--------KQQNLP-------SSPAPSTIFSGGFRH--GSLISIDSTCTEMGNFDNANV
                 200              210         220       230        

        360       370       380       390       400       410      
pF1KSD TGRIAFSLKYEQQTQSLVVHVKECHQLAYADEAKKRSNPYVKTYLLPDKSRQGKRKTSIK
       ::.: :...:  .:.:: . .: :..:::..: ::. :::::::::::.: ::::::...
CCDS34 TGEIEFAIHYCFKTHSLEICIKACKNLAYGEEKKKKCNPYVKTYLLPDRSSQGKRKTGVQ
      240       250       260       270       280       290        

        420       430       440       450       460       470      
pF1KSD RDTVNPLYDETLRYEIPESLLAQRTLQFSVWHHGRFGRNTFLGEAEIQMDSWKLDKKLDH
       :.::.: ..:::.:..  . :. : :: :::: : ..: .::::. : . .: .. .  .
CCDS34 RNTVDPTFQETLKYQVAPAQLVTRQLQVSVWHLGTLARRVFLGEVIIPLATWDFEDSTTQ
      300       310       320       330       340       350        

        480         490       500       510       520              
pF1KSD CLPLHG-KISAES-PTGLPSHKGELVVSLKYIPASKTPVGGDRKKSKGGEG-------GE
        .  :  . .::.   ..:. .:::.:  : .  :. :    :: ... ::       :.
CCDS34 SFRWHPLRAKAEKYEDSVPQSNGELTVRAKLVLPSR-P----RKLQEAQEGTDQPSLHGQ
      360       370       380       390            400       410   

       530       540       550        560       570       580      
pF1KSD LQVWIKEAKNLTAAKAGGTSDSFVKGYL-LPMRNKASKRKTPVMKKTLNPHYNHTFVYNG
       : . .  :::: . .  :: .::::: : :: ..:  . :.::..:   :...:.::..:
CCDS34 LCLVVLGAKNLPV-RPDGTLNSFVKGCLTLPDQQKL-RLKSPVLRKQACPQWKHSFVFSG
           420        430       440        450       460       470 

        590       600       610        620       630       640     
pF1KSD VRLEDLQHMCLELTVWDREPLASND-FLGGVRLGVGTGISNGEVVDWMDSTGEEVSLWQK
       :   .:..  :::::::.  .. :: .:::.:::     :.:...   :. .     :::
CCDS34 VTPAQLRQSSLELTVWDQALFGMNDRLLGGTRLG-----SKGDTAVGGDACSLSKLQWQK
             480       490       500            510       520      

         650       660       670 
pF1KSD MRQYPGSWAEGTLQLRSSMAKQKLGL
       . . :. :.. :: :           
CCDS34 VLSSPNLWTDMTLVLH          
        530       540            

>>CCDS56458.1 SYTL3 gene_id:94120|Hs108|chr6              (610 aa)
 initn: 993 init1: 418 opt: 746  Z-score: 691.7  bits: 138.2 E(32554): 3.3e-32
Smith-Waterman score: 1070; 33.5% identity (61.9% similar) in 683 aa overlap (1-660:1-609)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSELLDLSFLSEEEKDLILSVLQRDEEVRKADEKRIRRLKNELLEIKRKGAKRGSQHYSD
       :.. .::: :.: :.. ::.:: ::. :....:.: :.::..: ... ::::  . ....
CCDS56 MAQEIDLSALKELEREAILQVLYRDQAVQNTEEERTRKLKTHLQHLRWKGAKNTDWEHKE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90        100       110         
pF1KSD RTCARCQESLGRLSPKTNTCRGCNHLVCRDCRI-QESNGTWRCKVCAKEIELKKATGDWF
       . :::::. :: :  .  .::::.: :: .::.  ... .:.: :: .. ..:  ::.::
CCDS56 KCCARCQQVLGFLLHRGAVCRGCSHRVCAQCRVFLRGTHAWKCTVCFEDRNVKIKTGEWF
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160           170     
pF1KSD YDQKVNRFAYRTGSEIIRMSLRHKPAVSKRETVGQSLLHQTQ----MGDIWPGRKIIQER
       :......:                :. .:.:::: .::.. :    .. . :    ..: 
CCDS56 YEERAKKF----------------PTGGKHETVGGQLLQSYQKLSKISVVPPTPPPVSES
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        .. .  . .  :  . .::.   ..:. .:::.:  : .  :. :    :: ... :: 
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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