seq1 = pF1KSDB0003.tfa, 1506 bp seq2 = pF1KSDB0003/gi568815592f_135938291.tfa (gi568815592f:135938291_136291837), 353547 bp >pF1KSDB0003 1506 >gi568815592f:135938291_136291837 (Chr6) 1-238 (100001-100238) 100% -> 239-322 (170441-170524) 100% -> 323-474 (209061-209212) 100% -> 475-538 (210797-210860) 100% -> 539-634 (212870-212965) 100% -> 635-735 (215785-215885) 100% -> 736-867 (217337-217468) 100% -> 868-959 (235507-235598) 100% -> 960-1104 (240707-240851) 100% -> 1105-1201 (242937-243033) 100% -> 1202-1282 (248746-248826) 100% -> 1283-1506 (253324-253547) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGCCTGTGCTAGAGCGATATTTCCACCCAGCAGAGCTAGGCAGGAGGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGCCTGTGCTAGAGCGATATTTCCACCCAGCAGAGCTAGGCAGGAGGTG 50 . : . : . : . : . : 51 GACAGGCCCAGAAGGTGTGCTGCCCTCCTCCCCGGGAAGCCGGCCGGGGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 GACAGGCCCAGAAGGTGTGCTGCCCTCCTCCCCGGGAAGCCGGCCGGGGT 100 . : . : . : . : . : 101 GCCAGCAGGGGCCGCTGCCCTGGGACTTGCCAGAGATGATCAGGATGGTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100101 GCCAGCAGGGGCCGCTGCCCTGGGACTTGCCAGAGATGATCAGGATGGTA 150 . : . : . : . : . : 151 AAGCTGGTTTGGAAATCCAAAAGTGAGCTGCAGGCGACCAAACAGAGAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100151 AAGCTGGTTTGGAAATCCAAAAGTGAGCTGCAGGCGACCAAACAGAGAGG 200 . : . : . : . : . : 201 CATTCTGGACAATGAAGATGCTCTCCGCAGCTTTCCAG GAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||| 100201 CATTCTGGACAATGAAGATGCTCTCCGCAGCTTTCCAGGTA...TAGGAG 250 . : . : . : . : . : 242 ATATACGACTAAGGGGTCAGACGGGGGTTCGTGCTGAACGCCGTGGCTCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 170444 ATATACGACTAAGGGGTCAGACGGGGGTTCGTGCTGAACGCCGTGGCTCC 300 . : . : . : . : . : 292 TACCCATTCATTGACTTCCGCCTACTTAACA GTACAACATA |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||| 170494 TACCCATTCATTGACTTCCGCCTACTTAACAGTG...CAGGTACAACATA 350 . : . : . : . : . : 333 CTCAGGGGAGATTGGCACCAAGAAAAAGGTGAAAAGACTATTAAGCTTTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 209071 CTCAGGGGAGATTGGCACCAAGAAAAAGGTGAAAAGACTATTAAGCTTTC 400 . : . : . : . : . : 383 AAAGATACTTCCATGCATCAAGGCTGCTTCGTGGAATTATACCACAAGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 209121 AAAGATACTTCCATGCATCAAGGCTGCTTCGTGGAATTATACCACAAGCC 450 . : . : . : . : . : 433 CCTCTGCACCTGCTGGATGAAGACTACCTTGGACAAGCAAGG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>> 209171 CCTCTGCACCTGCTGGATGAAGACTACCTTGGACAAGCAAGGGTA...CA 500 . : . : . : . : . : 475 CATATGCTCTCCAAAGTGGGAATGTGGGATTTTGACATTTTCTTGTTTG >||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 210796 GCATATGCTCTCCAAAGTGGGAATGTGGGATTTTGACATTTTCTTGTTTG 550 . : . : . : . : . : 524 ATCGCTTGACAAATG GAAACAGCCTGGTAACACTGTTGTGC |||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||| 210846 ATCGCTTGACAAATGGTA...CAGGAAACAGCCTGGTAACACTGTTGTGC 600 . : . : . : . : . : 565 CACCTCTTCAATACCCATGGACTCATTCACCATTTCAAGTTAGATATGGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 212896 CACCTCTTCAATACCCATGGACTCATTCACCATTTCAAGTTAGATATGGT 650 . : . : . : . : . : 615 GACCTTACACCGATTTTTAG TCATGGTTCAAGAAGATTACC ||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||| 212946 GACCTTACACCGATTTTTAGGTA...CAGTCATGGTTCAAGAAGATTACC 700 . : . : . : . : . : 656 ACAGCCAAAACCCGTATCACAATGCTGTTCACGCAGCCGACGTCACCCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 215806 ACAGCCAAAACCCGTATCACAATGCTGTTCACGCAGCCGACGTCACCCAG 750 . : . : . : . : . : 706 GCCATGCACTGCTACCTGAAAGAGCCAAAG CTTGCCAGCTT ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||| 215856 GCCATGCACTGCTACCTGAAAGAGCCAAAGGTA...CAGCTTGCCAGCTT 800 . : . : . : . : . : 747 CCTCACGCCTCTGGACATCATGCTTGGACTGCTGGCTGCAGCAGCACACG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 217348 CCTCACGCCTCTGGACATCATGCTTGGACTGCTGGCTGCAGCAGCACACG 850 . : . : . : . : . : 797 ATGTGGACCACCCAGGGGTGAACCAGCCATTTTTGATAAAAACTAACCAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 217398 ATGTGGACCACCCAGGGGTGAACCAGCCATTTTTGATAAAAACTAACCAC 900 . : . : . : . : . : 847 CATCTTGCAAACCTATATCAG AATATGTCTGTGCTGGAGAA |||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||| 217448 CATCTTGCAAACCTATATCAGGTA...TAGAATATGTCTGTGCTGGAGAA 950 . : . : . : . : . : 888 TCATCACTGGCGATCTACAATTGGCATGCTTCGAGAATCAAGGCTTCTTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 235527 TCATCACTGGCGATCTACAATTGGCATGCTTCGAGAATCAAGGCTTCTTG 1000 . : . : . : . : . : 938 CTCATTTGCCAAAGGAAATGAC ACAGGATATTGAACAGCAG ||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||| 235577 CTCATTTGCCAAAGGAAATGACGTA...CAGACAGGATATTGAACAGCAG 1050 . : . : . : . : . : 979 CTGGGCTCCTTGATCTTGGCAACAGACATCAACAGGCAGAATGAATTTTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 240726 CTGGGCTCCTTGATCTTGGCAACAGACATCAACAGGCAGAATGAATTTTT 1100 . : . : . : . : . : 1029 GACCAGATTGAAAGCTCACCTCCACAATAAAGACTTAAGACTGGAGGATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 240776 GACCAGATTGAAAGCTCACCTCCACAATAAAGACTTAAGACTGGAGGATG 1150 . : . : . : . : . : 1079 CACAGGACAGGCACTTTATGCTTCAG ATCGCCTTGAAGTGT ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||| 240826 CACAGGACAGGCACTTTATGCTTCAGGTA...CAGATCGCCTTGAAGTGT 1200 . : . : . : . : . : 1120 GCTGACATTTGCAATCCTTGTAGAATCTGGGAGATGAGCAAGCAGTGGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 242952 GCTGACATTTGCAATCCTTGTAGAATCTGGGAGATGAGCAAGCAGTGGAG 1250 . : . : . : . : . : 1170 TGAAAGGGTCTGTGAAGAATTCTACAGGCAAG GTGAACTTG ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||| 243002 TGAAAGGGTCTGTGAAGAATTCTACAGGCAAGGTT...TAGGTGAACTTG 1300 . : . : . : . : . : 1211 AACAGAAATTTGAACTGGAAATCAGTCCTCTTTGTAATCAACAGAAAGAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 248755 AACAGAAATTTGAACTGGAAATCAGTCCTCTTTGTAATCAACAGAAAGAT 1350 . : . : . : . : . : 1261 TCCATCCCTAGTATACAAATTG GTTTCATGAGCTACATCGT ||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||| 248805 TCCATCCCTAGTATACAAATTGGTG...TAGGTTTCATGAGCTACATCGT 1400 . : . : . : . : . : 1302 GGAGCCGCTCTTCCGGGAATGGGCCCATTTCACGGGTAACAGCACCCTGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 253343 GGAGCCGCTCTTCCGGGAATGGGCCCATTTCACGGGTAACAGCACCCTGT 1450 . : . : . : . : . : 1352 CGGAGAACATGCTGGGCCACCTCGCACACAACAAGGCCCAGTGGAAGAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 253393 CGGAGAACATGCTGGGCCACCTCGCACACAACAAGGCCCAGTGGAAGAGC 1500 . : . : . : . : . : 1402 CTGTTGCCCAGGCAGCACAGAAGCAGGGGCAGCAGTGGCAGCGGGCCTGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 253443 CTGTTGCCCAGGCAGCACAGAAGCAGGGGCAGCAGTGGCAGCGGGCCTGA 1550 . : . : . : . : . : 1452 CCACGACCACGCAGGCCAAGGGACTGAGAGCGAGGAGCAGGAAGGCGACA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 253493 CCACGACCACGCAGGCCAAGGGACTGAGAGCGAGGAGCAGGAAGGCGACA 1600 . 1502 GCCCC ||||| 253543 GCCCC