Result of SIM4 for pF1KSDA1547

seq1 = pF1KSDA1547.tfa, 2280 bp
seq2 = pF1KSDA1547/gi568815583r_69950100.tfa (gi568815583r:69950100_70196262), 246163 bp

>pF1KSDA1547 2280
>gi568815583r:69950100_70196262 (Chr15)

(complement)

1-24  (99465-99488)   100% ->
25-125  (100002-100102)   100% ->
126-189  (100622-100685)   100% ->
190-234  (101687-101731)   100% ->
235-297  (120105-120167)   100% ->
298-372  (121656-121730)   100% ->
373-579  (130045-130249)   99% ->
580-714  (135614-135733)   88% ->
715-765  (136803-136853)   98% ->
766-918  (137448-137600)   100% ->
919-1024  (137972-138077)   100% ->
1025-1224  (138605-138804)   100% ->
1225-1301  (139889-139965)   100% ->
1302-1551  (140965-141214)   100% ->
1552-1799  (141578-141825)   100% ->
1800-1947  (142889-143036)   100% ->
1948-2098  (143739-143889)   100% ->
2099-2175  (144796-144872)   100% ->
2176-2280  (146059-146163)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTATCCGCAGGGCAGACATCCG         GCTCCCCATCAACCCGG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
  99465 ATGTATCCGCAGGGCAGACATCCGGTG...CAGGCTCCCCATCAACCCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GCAGCCGGGATTTAAATTCACGGTGGCTGAGTCTTGTGACAGGATCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100019 GCAGCCGGGATTTAAATTCACGGTGGCTGAGTCTTGTGACAGGATCAAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACGAATTCCAGTTCCTGCAAGCTCAGTATCACAG         CCTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100069 ACGAATTCCAGTTCCTGCAAGCTCAGTATCACAGGTA...CAGCCTCAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GTGGAGTACGACAAGCTGGCAAACGAGAAGACGGAGATGCAGCGCCATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100629 GTGGAGTACGACAAGCTGGCAAACGAGAAGACGGAGATGCAGCGCCATTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGTGATG         TACTATGAGATGTCCTATGGCTTGAACATTGAAA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100679 TGTGATGGTG...TAGTACTATGAGATGTCCTATGGCTTGAACATTGAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TGCACAAGCAG         ACAGAGATTGCGAAGAGACTGAACACAATT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 101721 TGCACAAGCAGGTA...CAGACAGAGATTGCGAAGAGACTGAACACAATT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    265 TTAGCACAGATCATGCCTTTCCTGTCACAAGAG         CACCAGCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 120135 TTAGCACAGATCATGCCTTTCCTGTCACAAGAGGTA...CAGCACCAGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    306 GCAGGTGGCGCAGGCAGTGGAGCGCGCCAAGCAGGTCACCATGACGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121664 GCAGGTGGCGCAGGCAGTGGAGCGCGCCAAGCAGGTCACCATGACGGAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    356 TGAACGCCATCATCGGG         CAGCAGCAGCTCCAGGCGCAGCAC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 121714 TGAACGCCATCATCGGGGTA...CAGCAGCAGCAGCTCCAGGCGCAGCAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    397 CTCTCCCATGCCACACACGGCCCCCCGGTCCAGTTGCCACCCCACCCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130069 CTCTCCCATGCCACACACGGCCCCCCGGTCCAGTTGCCACCCCACCCGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    447 AGGTCTCCAGCCTCCAGGAATCCCCCCAGTGACAGGGAGCAGCTCCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130119 AGGTCTCCAGCCTCCAGGAATCCCCCCAGTGACAGGGAGCAGCTCCGGGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 TGCTGGCACTGGGCGCCCTGGGCAGCCAGGCCCATCTGACGGTGAAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130169 TGCTGGCACTGGGCGCCCTGGGCAGCCAGGCCCATCTGACGGTGAAGGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 GAGAAGAACCACCATGAACTCGATCACAGAGAG         AGAGAATC
        |||||||||||||||||||||||||||||||-->>>...>>>--------
 130219 GAGAAGAACCACCATGAACTCGATCACAGAG  GTG...CAG        

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 CAGTGCGAATAACTCTGTGTCACCCTCCGAAAGCCTCCGGGCCAGTGAGA
        -------|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 135614        AATAACTCTGTGTCACCCTCGGAAAGCCTCCGGGCCAGTGAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 AGCACCGGGGCTCTGCGGACTACAGCATGGAAGCCAAGAAGCGGAAGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135657 AGCACCGGGGCTCTGCGGACTACAGCATGGAAGCCAAGAAGCGGAAGGCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 GAGGAGAAGGACAGCTTGAGCCGATAC         GACAGTGATGGGGA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||| ||
 135707 GAGGAGAAGGACAGCTTGAGCCGATACGTA...CAGGACAGTGATGGAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 CAAGAGTGATGATCTGGTGGTGGATGTTTCCAATGAG         GACC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 136817 CAAGAGTGATGATCTGGTGGTGGATGTTTCCAATGAGGTA...CAGGACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    770 CCGCAACGCCCCGGGTCAGCCCGGCACACTCCCCTCCTGAAAATGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137452 CCGCAACGCCCCGGGTCAGCCCGGCACACTCCCCTCCTGAAAATGGGCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 GACAAGGCCCGTAGCCTGAAAAAAGATGCCCCCACCAGCCCTGCCTCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137502 GACAAGGCCCGTAGCCTGAAAAAAGATGCCCCCACCAGCCCTGCCTCGGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 GGCCTCTTCCAGTAGCACACCTTCCTCCAAGACCAAAGACCTTGGTCAT 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 137552 GGCCTCTTCCAGTAGCACACCTTCCTCCAAGACCAAAGACCTTGGTCATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    919         AACGACAAATCCTCCACCCCTGGGCTCAAGTCCAACACACCA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137602 TA...CAGAACGACAAATCCTCCACCCCTGGGCTCAAGTCCAACACACCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 ACCCCAAGGAACGACGCCCCAACTCCAGGCACCAGCACGACCCCAGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138014 ACCCCAAGGAACGACGCCCCAACTCCAGGCACCAGCACGACCCCAGGGCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 CAGGTCGATGCCGG         CCTCGGCTCTGCGCACGCCCATCTCCA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 138064 CAGGTCGATGCCGGGTA...CAGCCTCGGCTCTGCGCACGCCCATCTCCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1052 TCACCAGCTCCTATGCGGCGCCCTTCGCCATGATGAGCCACCATGAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138632 TCACCAGCTCCTATGCGGCGCCCTTCGCCATGATGAGCCACCATGAGATG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 AACGGCTCCCTCACCAGTCCTGGCGCCTACGCCGGCCTCCACAACATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138682 AACGGCTCCCTCACCAGTCCTGGCGCCTACGCCGGCCTCCACAACATCCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 ACCCCAGATGAGCGCCGCCGCCGCTGCTGCAGCCGCTGCCTATGGCCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138732 ACCCCAGATGAGCGCCGCCGCCGCTGCTGCAGCCGCTGCCTATGGCCGAT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 CGCCAATGGTGAGCTTTGGAGCT         GTTGGTTTTGACCCTCAC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 138782 CGCCAATGGTGAGCTTTGGAGCTGTA...CAGGTTGGTTTTGACCCTCAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 CCCCCGATGCGGGCCACAGGCCTCCCCTCAAGCCTGGCCTCCATTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139907 CCCCCGATGCGGGCCACAGGCCTCCCCTCAAGCCTGGCCTCCATTCCTGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 AGGAAAACC         AGCGTACTCATTCCATGTGAGTGCTGATGGGC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 139957 AGGAAAACCGTA...CAGAGCGTACTCATTCCATGTGAGTGCTGATGGGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1334 AGATGCAGCCCGTGCCCTTCCCCCACGACGCCCTGGCAGGCCCCGGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140997 AGATGCAGCCCGTGCCCTTCCCCCACGACGCCCTGGCAGGCCCCGGCATC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 CCGAGGCACGCCCGGCAGATCAACACACTCAGCCACGGGGAGGTGGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141047 CCGAGGCACGCCCGGCAGATCAACACACTCAGCCACGGGGAGGTGGTGTG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 TGCCGTGACCATCAGCAACCCCACGAGGCACGTCTACACAGGTGGCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141097 TGCCGTGACCATCAGCAACCCCACGAGGCACGTCTACACAGGTGGCAAGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 GCTGCGTGAAGATCTGGGACATCAGCCAGCCAGGCAGCAAGAGCCCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141147 GCTGCGTGAAGATCTGGGACATCAGCCAGCCAGGCAGCAAGAGCCCCATC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 TCCCAGCTGGACTGCCTG         AACAGGGACAATTACATCCGCTC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 141197 TCCCAGCTGGACTGCCTGGTG...CAGAACAGGGACAATTACATCCGCTC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 CTGCAAGCTGCTCCCTGATGGGCGCACGCTCATCGTGGGCGGCGAGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141601 CTGCAAGCTGCTCCCTGATGGGCGCACGCTCATCGTGGGCGGCGAGGCCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 GCACGCTCACCATCTGGGACCTGGCCTCGCCCACGCCCCGCATCAAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141651 GCACGCTCACCATCTGGGACCTGGCCTCGCCCACGCCCCGCATCAAGGCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 GAGCTGACGTCCTCGGCTCCCGCCTGTTATGCCCTGGCCATTAGCCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141701 GAGCTGACGTCCTCGGCTCCCGCCTGTTATGCCCTGGCCATTAGCCCTGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 CGCCAAAGTCTGCTTCTCCTGCTGCAGCGATGGGAACATTGCTGTCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141751 CGCCAAAGTCTGCTTCTCCTGCTGCAGCGATGGGAACATTGCTGTCTGGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 ACCTGCACAACCAGACCCTGGTCAG         GCAGTTCCAGGGCCAC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 141801 ACCTGCACAACCAGACCCTGGTCAGGTG...TAGGCAGTTCCAGGGCCAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 ACAGATGGGGCCAGCTGCATAGACATCTCCCATGATGGCACCAAACTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142905 ACAGATGGGGCCAGCTGCATAGACATCTCCCATGATGGCACCAAACTGTG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 GACAGGGGGCCTGGACAACACGGTGCGCTCCTGGGACCTGCGGGAGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142955 GACAGGGGGCCTGGACAACACGGTGCGCTCCTGGGACCTGCGGGAGGGCC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 GACAGCTACAGCAGCATGACTTCACTTCCCAG         ATCTTCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 143005 GACAGCTACAGCAGCATGACTTCACTTCCCAGGTG...CAGATCTTCTCG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1957 CTGGGCTACTGCCCCACTGGGGAGTGGCTGGCTGTGGGCATGGAGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143748 CTGGGCTACTGCCCCACTGGGGAGTGGCTGGCTGTGGGCATGGAGAGCAG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007 CAACGTGGAGGTGCTGCACCACACCAAGCCTGACAAGTACCAGCTGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143798 CAACGTGGAGGTGCTGCACCACACCAAGCCTGACAAGTACCAGCTGCACC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 TGCACGAGAGCTGCGTGCTCTCCCTCAAGTTCGCCTACTGCG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 143848 TGCACGAGAGCTGCGTGCTCTCCCTCAAGTTCGCCTACTGCGGTG...CA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2099  GCAAGTGGTTCGTGAGCACTGGGAAAGATAACCTTCTCAACGCCTGGAG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144795 GGCAAGTGGTTCGTGAGCACTGGGAAAGATAACCTTCTCAACGCCTGGAG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2148 GACGCCTTATGGAGCCAGCATATTCCAG         TCTAAAGAATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 144845 GACGCCTTATGGAGCCAGCATATTCCAGGTA...CAGTCTAAAGAATCCT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2189 CGTCTGTCTTGAGTTGTGACATTTCAGCGGATGACAAATACATTGTAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146072 CGTCTGTCTTGAGTTGTGACATTTCAGCGGATGACAAATACATTGTAACA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :
   2239 GGCTCTGGTGACAAGAAGGCCACAGTTTATGAGGTCATCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146122 GGCTCTGGTGACAAGAAGGCCACAGTTTATGAGGTCATCTAC

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