Result of FASTA (omim) for pF1KSDA1445
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA1445, 1151 aa
  1>>>pF1KSDA1445 1151 - 1151 aa - 1151 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8010+/-0.00042; mu= 21.0796+/- 0.026
 mean_var=124.5166+/-24.337, 0's: 0 Z-trim(116.4): 424  B-trim: 200 in 1/51
 Lambda= 0.114937
 statistics sampled from 27117 (27611) to 27117 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.672), E-opt: 0.2 (0.324), width:  16
 Scan time: 12.040

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001243275 (OMIM: 609298) semaphorin-5B isoform  (1151) 8212 1374.2       0
NP_001026872 (OMIM: 609298) semaphorin-5B isoform  (1151) 8212 1374.2       0
NP_001243276 (OMIM: 609298) semaphorin-5B isoform  (1205) 8212 1374.3       0
XP_016862127 (OMIM: 609298) PREDICTED: semaphorin- (1117) 6993 1172.1       0
NP_001243277 (OMIM: 609298) semaphorin-5B isoform  (1057) 6033 1012.9       0
XP_016862128 (OMIM: 609298) PREDICTED: semaphorin- ( 794) 5475 920.2       0
XP_006714570 (OMIM: 609297) PREDICTED: semaphorin- (1074) 4734 797.5       0
XP_011512460 (OMIM: 609297) PREDICTED: semaphorin- (1074) 4734 797.5       0
NP_003957 (OMIM: 609297) semaphorin-5A precursor [ (1074) 4734 797.5       0
XP_006714569 (OMIM: 609297) PREDICTED: semaphorin- (1074) 4734 797.5       0
XP_011512458 (OMIM: 609297) PREDICTED: semaphorin- (1074) 4734 797.5       0
XP_011512459 (OMIM: 609297) PREDICTED: semaphorin- (1074) 4734 797.5       0
XP_011512457 (OMIM: 609297) PREDICTED: semaphorin- (1074) 4734 797.5       0
XP_011512461 (OMIM: 609297) PREDICTED: semaphorin- (1027) 4509 760.1 1.5e-218
XP_016865505 (OMIM: 609297) PREDICTED: semaphorin- ( 917) 4220 712.2 3.7e-204
XP_011508177 (OMIM: 607292,610282,610283) PREDICTE ( 662)  910 163.2   5e-39
XP_011508178 (OMIM: 607292,610282,610283) PREDICTE ( 662)  910 163.2   5e-39
XP_011508180 (OMIM: 607292,610282,610283) PREDICTE ( 662)  910 163.2   5e-39
XP_011508176 (OMIM: 607292,610282,610283) PREDICTE ( 662)  910 163.2   5e-39
XP_011508173 (OMIM: 607292,610282,610283) PREDICTE ( 723)  910 163.2 5.3e-39
XP_011508175 (OMIM: 607292,610282,610283) PREDICTE ( 761)  910 163.2 5.5e-39
XP_016857545 (OMIM: 607292,610282,610283) PREDICTE ( 761)  910 163.2 5.5e-39
XP_011508174 (OMIM: 607292,610282,610283) PREDICTE ( 761)  910 163.2 5.5e-39
NP_001180229 (OMIM: 607292,610282,610283) semaphor ( 761)  910 163.2 5.5e-39
NP_071762 (OMIM: 607292,610282,610283) semaphorin- ( 761)  910 163.2 5.5e-39
NP_001180230 (OMIM: 607292,610282,610283) semaphor ( 761)  910 163.2 5.5e-39
NP_079242 (OMIM: 609295) semaphorin-6D isoform 6 p ( 476)  881 158.2 1.1e-37
NP_705872 (OMIM: 609295) semaphorin-6D isoform 5 p ( 597)  881 158.3 1.3e-37
XP_011520383 (OMIM: 609295) PREDICTED: semaphorin- ( 998)  881 158.5 1.8e-37
NP_705869 (OMIM: 609295) semaphorin-6D isoform 2 p ( 998)  881 158.5 1.8e-37
XP_016878110 (OMIM: 609295) PREDICTED: semaphorin- ( 998)  881 158.5 1.8e-37
NP_001185928 (OMIM: 609295) semaphorin-6D isoform  (1011)  881 158.5 1.9e-37
NP_065909 (OMIM: 609295) semaphorin-6D isoform 1 p (1011)  881 158.5 1.9e-37
XP_011520382 (OMIM: 609295) PREDICTED: semaphorin- (1011)  881 158.5 1.9e-37
XP_011520381 (OMIM: 609295) PREDICTED: semaphorin- (1017)  881 158.5 1.9e-37
XP_016878109 (OMIM: 609295) PREDICTED: semaphorin- (1017)  881 158.5 1.9e-37
NP_705870 (OMIM: 609295) semaphorin-6D isoform 3 p (1017)  881 158.5 1.9e-37
XP_011520380 (OMIM: 609295) PREDICTED: semaphorin- (1030)  881 158.6 1.9e-37
XP_016878108 (OMIM: 609295) PREDICTED: semaphorin- (1030)  881 158.6 1.9e-37
XP_005254746 (OMIM: 609295) PREDICTED: semaphorin- (1054)  881 158.6 1.9e-37
XP_011520379 (OMIM: 609295) PREDICTED: semaphorin- (1054)  881 158.6 1.9e-37
XP_016878107 (OMIM: 609295) PREDICTED: semaphorin- (1067)  881 158.6 1.9e-37
XP_011520378 (OMIM: 609295) PREDICTED: semaphorin- (1067)  881 158.6 1.9e-37
NP_705871 (OMIM: 609295) semaphorin-6D isoform 4 p (1073)  881 158.6 1.9e-37
XP_005254744 (OMIM: 609295) PREDICTED: semaphorin- (1073)  881 158.6 1.9e-37
XP_016878106 (OMIM: 609295) PREDICTED: semaphorin- (1086)  881 158.6   2e-37
XP_005254742 (OMIM: 609295) PREDICTED: semaphorin- (1086)  881 158.6   2e-37
XP_005254743 (OMIM: 609295) PREDICTED: semaphorin- (1086)  881 158.6   2e-37
XP_011520377 (OMIM: 609295) PREDICTED: semaphorin- (1086)  881 158.6   2e-37
XP_011525943 (OMIM: 608873) PREDICTED: semaphorin- ( 578)  851 153.3   4e-36


>>NP_001243275 (OMIM: 609298) semaphorin-5B isoform 1 [H  (1151 aa)
 initn: 8212 init1: 8212 opt: 8212  Z-score: 7362.5  bits: 1374.2 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 8212; 99.7% identity (99.7% similar) in 1151 aa overlap (1-1151:1-1151)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MPCGFSPSPVAHHLVPGPPDTPAQQLRCGWTVGGWLLSLVRGLLPCLPPGARTAEGPIMV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MPCGFSPSPVAHHLVPGPPDTPAQQLRCGWTVGGWLLSLVRGLLPCLPPGARTAEGPIMV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD LAGPLAVSLLLPSLTLLVSHLSSSQDVSSEPSSEQQLCALSKHPTVAFEDLQPWVSNFTY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LAGPLAVSLLLPSLTLLVSHLSSSQDVSSEPSSEQQLCALSKHPTVAFEDLQPWVSNFTY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD PGARDFSQLALDPSGNQLIVGARNYLFRLSLANVSLLQATEWASSEDTRRSCQSKGKTEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PGARDFSQLALDPSGNQLIVGARNYLFRLSLANVSLLQATEWASSEDTRRSCQSKGKTEE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD ECQNYVRVLIVAGRKVFMCGTNAFSPMCTSRQVGNLSRTTEKINGVARCPYDPRHNSTAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
NP_001 ECQNYVRVLIVAGRKVFMCGTNAFSPMCTSRQVGNLSRTIEKINGVARCPYDPRHNSTAV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD ISSQGELYAATVIDFSGRDPAIYRSLGSGPPLRTAQYNSKWLNEPNFVAAYDIGLFAYFF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ISSQGELYAATVIDFSGRDPAIYRSLGSGPPLRTAQYNSKWLNEPNFVAAYDIGLFAYFF
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD LRENAVEHDCGRTVYSRVARVCKNDVGGRFLLEDTWTTFMKARLNCSRPGEVPFYYNELQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LRENAVEHDCGRTVYSRVARVCKNDVGGRFLLEDTWTTFMKARLNCSRPGEVPFYYNELQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD SAFHLPEQDLIYGVFTTNVNSIAASAVCAFNLSAISQAFNGPFRYQENPRAAWLPIANPI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SAFHLPEQDLIYGVFTTNVNSIAASAVCAFNLSAISQAFNGPFRYQENPRAAWLPIANPI
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD PNFQCGTLPETGPNENLTERSLQDAQRLFLMSEAVQPVTPEPCVTQDSVRFSHLVVDLVQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PNFQCGTLPETGPNENLTERSLQDAQRLFLMSEAVQPVTPEPCVTQDSVRFSHLVVDLVQ
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD AKDTLYHVLYIGTESGTILKALSTASRSLHGCYLEELHVLPPGRREPLRSLRILHSARAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AKDTLYHVLYIGTESGTILKALSTASRSLHGCYLEELHVLPPGRREPLRSLRILHSARAL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD FVGLRDGVLRVPLERCAAYRSQGACLGARDPYCGWDGKQQRCSTLEDSSNMSLWTQNITA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FVGLRDGVLRVPLERCAAYRSQGACLGARDPYCGWDGKQQRCSTLEDSSNMSLWTQNITA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD CPVRNVTRDGGFGPWSPWQPCEHLDGDNSGSCLCRARSCDSPRPRCGGLDCLGPAIHIAN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CPVRNVTRDGGFGPWSPWQPCEHLDGDNSGSCLCRARSCDSPRPRCGGLDCLGPAIHIAN
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD CSRNGAWTPWSSWALCSTSCGIGFQVRQRSCSNPAPRHGGRICVGKSREERFCNENTPCP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CSRNGAWTPWSSWALCSTSCGIGFQVRQRSCSNPAPRHGGRICVGKSREERFCNENTPCP
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD VPIFWASWGSWSKCSSNCGGGMQSRRRACENGNSCLGCGVEFKTCNPEGCPEVRRNTPWT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VPIFWASWGSWSKCSSNCGGGMQSRRRACENGNSCLGCGVEFKTCNPEGCPEVRRNTPWT
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD PWLPVNVTQGGARQEQRFRFTCRAPLADPHGLQFGRRRTETRTCPADGSGSCDTDALVED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: 
NP_001 PWLPVNVTQGGARQEQRFRFTCRAPLADPHGLQFGRRRTETRTCPADGSGSCDTDALVEV
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD LLRSGSTSPHTVSGGWAAWGPWSSCSRDCELGFRVRKRTCTNPEPRNGGLPCVGDAAEYQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLRSGSTSPHTVSGGWAAWGPWSSCSRDCELGFRVRKRTCTNPEPRNGGLPCVGDAAEYQ
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD DCNPQACPVRGAWSCWTSWSPCSASCGGGHYQRTRSCTSPAPSPGEDICLGLHTEEALCA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DCNPQACPVRGAWSCWTSWSPCSASCGGGHYQRTRSCTSPAPSPGEDICLGLHTEEALCA
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD TQACPEGWSPWSEWSKCTDDGAQSRSRHCEELLPGSSACAGNSSQSRPCPYSEIPVILPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TQACPEGWSPWSEWSKCTDDGAQSRSRHCEELLPGSSACAGNSSQSRPCPYSEIPVILPA
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD SSMEEATGCAGFNLIHLVATGISCFLGSGLLTLAVYLSCQHCQRQSQESTLVHPATPNHL
       ::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSMEEATDCAGFNLIHLVATGISCFLGSGLLTLAVYLSCQHCQRQSQESTLVHPATPNHL
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD HYKGGGTPKNEKYTPMEFKTLNKNNLIPDDRANFYPLQQTNVYTTTYYPSPLNKHSFRPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HYKGGGTPKNEKYTPMEFKTLNKNNLIPDDRANFYPLQQTNVYTTTYYPSPLNKHSFRPE
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150 
pF1KSD ASPGQRCFPNS
       :::::::::::
NP_001 ASPGQRCFPNS
             1150 

>>NP_001026872 (OMIM: 609298) semaphorin-5B isoform 1 [H  (1151 aa)
 initn: 8212 init1: 8212 opt: 8212  Z-score: 7362.5  bits: 1374.2 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 8212; 99.7% identity (99.7% similar) in 1151 aa overlap (1-1151:1-1151)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MPCGFSPSPVAHHLVPGPPDTPAQQLRCGWTVGGWLLSLVRGLLPCLPPGARTAEGPIMV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MPCGFSPSPVAHHLVPGPPDTPAQQLRCGWTVGGWLLSLVRGLLPCLPPGARTAEGPIMV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD LAGPLAVSLLLPSLTLLVSHLSSSQDVSSEPSSEQQLCALSKHPTVAFEDLQPWVSNFTY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LAGPLAVSLLLPSLTLLVSHLSSSQDVSSEPSSEQQLCALSKHPTVAFEDLQPWVSNFTY
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pF1KSD PGARDFSQLALDPSGNQLIVGARNYLFRLSLANVSLLQATEWASSEDTRRSCQSKGKTEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PGARDFSQLALDPSGNQLIVGARNYLFRLSLANVSLLQATEWASSEDTRRSCQSKGKTEE
              130       140       150       160       170       180

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pF1KSD ECQNYVRVLIVAGRKVFMCGTNAFSPMCTSRQVGNLSRTTEKINGVARCPYDPRHNSTAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
NP_001 ECQNYVRVLIVAGRKVFMCGTNAFSPMCTSRQVGNLSRTIEKINGVARCPYDPRHNSTAV
              190       200       210       220       230       240

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pF1KSD ISSQGELYAATVIDFSGRDPAIYRSLGSGPPLRTAQYNSKWLNEPNFVAAYDIGLFAYFF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ISSQGELYAATVIDFSGRDPAIYRSLGSGPPLRTAQYNSKWLNEPNFVAAYDIGLFAYFF
              250       260       270       280       290       300

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pF1KSD LRENAVEHDCGRTVYSRVARVCKNDVGGRFLLEDTWTTFMKARLNCSRPGEVPFYYNELQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LRENAVEHDCGRTVYSRVARVCKNDVGGRFLLEDTWTTFMKARLNCSRPGEVPFYYNELQ
              310       320       330       340       350       360

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pF1KSD SAFHLPEQDLIYGVFTTNVNSIAASAVCAFNLSAISQAFNGPFRYQENPRAAWLPIANPI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SAFHLPEQDLIYGVFTTNVNSIAASAVCAFNLSAISQAFNGPFRYQENPRAAWLPIANPI
              370       380       390       400       410       420

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pF1KSD PNFQCGTLPETGPNENLTERSLQDAQRLFLMSEAVQPVTPEPCVTQDSVRFSHLVVDLVQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PNFQCGTLPETGPNENLTERSLQDAQRLFLMSEAVQPVTPEPCVTQDSVRFSHLVVDLVQ
              430       440       450       460       470       480

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pF1KSD AKDTLYHVLYIGTESGTILKALSTASRSLHGCYLEELHVLPPGRREPLRSLRILHSARAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AKDTLYHVLYIGTESGTILKALSTASRSLHGCYLEELHVLPPGRREPLRSLRILHSARAL
              490       500       510       520       530       540

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pF1KSD FVGLRDGVLRVPLERCAAYRSQGACLGARDPYCGWDGKQQRCSTLEDSSNMSLWTQNITA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FVGLRDGVLRVPLERCAAYRSQGACLGARDPYCGWDGKQQRCSTLEDSSNMSLWTQNITA
              550       560       570       580       590       600

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pF1KSD CPVRNVTRDGGFGPWSPWQPCEHLDGDNSGSCLCRARSCDSPRPRCGGLDCLGPAIHIAN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CPVRNVTRDGGFGPWSPWQPCEHLDGDNSGSCLCRARSCDSPRPRCGGLDCLGPAIHIAN
              610       620       630       640       650       660

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pF1KSD CSRNGAWTPWSSWALCSTSCGIGFQVRQRSCSNPAPRHGGRICVGKSREERFCNENTPCP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CSRNGAWTPWSSWALCSTSCGIGFQVRQRSCSNPAPRHGGRICVGKSREERFCNENTPCP
              670       680       690       700       710       720

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pF1KSD VPIFWASWGSWSKCSSNCGGGMQSRRRACENGNSCLGCGVEFKTCNPEGCPEVRRNTPWT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VPIFWASWGSWSKCSSNCGGGMQSRRRACENGNSCLGCGVEFKTCNPEGCPEVRRNTPWT
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD PWLPVNVTQGGARQEQRFRFTCRAPLADPHGLQFGRRRTETRTCPADGSGSCDTDALVED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: 
NP_001 PWLPVNVTQGGARQEQRFRFTCRAPLADPHGLQFGRRRTETRTCPADGSGSCDTDALVEV
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD LLRSGSTSPHTVSGGWAAWGPWSSCSRDCELGFRVRKRTCTNPEPRNGGLPCVGDAAEYQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLRSGSTSPHTVSGGWAAWGPWSSCSRDCELGFRVRKRTCTNPEPRNGGLPCVGDAAEYQ
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD DCNPQACPVRGAWSCWTSWSPCSASCGGGHYQRTRSCTSPAPSPGEDICLGLHTEEALCA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DCNPQACPVRGAWSCWTSWSPCSASCGGGHYQRTRSCTSPAPSPGEDICLGLHTEEALCA
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD TQACPEGWSPWSEWSKCTDDGAQSRSRHCEELLPGSSACAGNSSQSRPCPYSEIPVILPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TQACPEGWSPWSEWSKCTDDGAQSRSRHCEELLPGSSACAGNSSQSRPCPYSEIPVILPA
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD SSMEEATGCAGFNLIHLVATGISCFLGSGLLTLAVYLSCQHCQRQSQESTLVHPATPNHL
       ::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSMEEATDCAGFNLIHLVATGISCFLGSGLLTLAVYLSCQHCQRQSQESTLVHPATPNHL
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD HYKGGGTPKNEKYTPMEFKTLNKNNLIPDDRANFYPLQQTNVYTTTYYPSPLNKHSFRPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HYKGGGTPKNEKYTPMEFKTLNKNNLIPDDRANFYPLQQTNVYTTTYYPSPLNKHSFRPE
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150 
pF1KSD ASPGQRCFPNS
       :::::::::::
NP_001 ASPGQRCFPNS
             1150 

>>NP_001243276 (OMIM: 609298) semaphorin-5B isoform 2 [H  (1205 aa)
 initn: 8212 init1: 8212 opt: 8212  Z-score: 7362.3  bits: 1374.3 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 8212; 99.7% identity (99.7% similar) in 1151 aa overlap (1-1151:55-1205)

                                             10        20        30
pF1KSD                               MPCGFSPSPVAHHLVPGPPDTPAQQLRCGW
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FGRGHSTGTGKQKRRDRVSGSSWCLACVSWMPCGFSPSPVAHHLVPGPPDTPAQQLRCGW
           30        40        50        60        70        80    

               40        50        60        70        80        90
pF1KSD TVGGWLLSLVRGLLPCLPPGARTAEGPIMVLAGPLAVSLLLPSLTLLVSHLSSSQDVSSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TVGGWLLSLVRGLLPCLPPGARTAEGPIMVLAGPLAVSLLLPSLTLLVSHLSSSQDVSSE
           90       100       110       120       130       140    

              100       110       120       130       140       150
pF1KSD PSSEQQLCALSKHPTVAFEDLQPWVSNFTYPGARDFSQLALDPSGNQLIVGARNYLFRLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PSSEQQLCALSKHPTVAFEDLQPWVSNFTYPGARDFSQLALDPSGNQLIVGARNYLFRLS
          150       160       170       180       190       200    

              160       170       180       190       200       210
pF1KSD LANVSLLQATEWASSEDTRRSCQSKGKTEEECQNYVRVLIVAGRKVFMCGTNAFSPMCTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LANVSLLQATEWASSEDTRRSCQSKGKTEEECQNYVRVLIVAGRKVFMCGTNAFSPMCTS
          210       220       230       240       250       260    

              220       230       240       250       260       270
pF1KSD RQVGNLSRTTEKINGVARCPYDPRHNSTAVISSQGELYAATVIDFSGRDPAIYRSLGSGP
       ::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RQVGNLSRTIEKINGVARCPYDPRHNSTAVISSQGELYAATVIDFSGRDPAIYRSLGSGP
          270       280       290       300       310       320    

              280       290       300       310       320       330
pF1KSD PLRTAQYNSKWLNEPNFVAAYDIGLFAYFFLRENAVEHDCGRTVYSRVARVCKNDVGGRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PLRTAQYNSKWLNEPNFVAAYDIGLFAYFFLRENAVEHDCGRTVYSRVARVCKNDVGGRF
          330       340       350       360       370       380    

              340       350       360       370       380       390
pF1KSD LLEDTWTTFMKARLNCSRPGEVPFYYNELQSAFHLPEQDLIYGVFTTNVNSIAASAVCAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLEDTWTTFMKARLNCSRPGEVPFYYNELQSAFHLPEQDLIYGVFTTNVNSIAASAVCAF
          390       400       410       420       430       440    

              400       410       420       430       440       450
pF1KSD NLSAISQAFNGPFRYQENPRAAWLPIANPIPNFQCGTLPETGPNENLTERSLQDAQRLFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NLSAISQAFNGPFRYQENPRAAWLPIANPIPNFQCGTLPETGPNENLTERSLQDAQRLFL
          450       460       470       480       490       500    

              460       470       480       490       500       510
pF1KSD MSEAVQPVTPEPCVTQDSVRFSHLVVDLVQAKDTLYHVLYIGTESGTILKALSTASRSLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSEAVQPVTPEPCVTQDSVRFSHLVVDLVQAKDTLYHVLYIGTESGTILKALSTASRSLH
          510       520       530       540       550       560    

              520       530       540       550       560       570
pF1KSD GCYLEELHVLPPGRREPLRSLRILHSARALFVGLRDGVLRVPLERCAAYRSQGACLGARD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GCYLEELHVLPPGRREPLRSLRILHSARALFVGLRDGVLRVPLERCAAYRSQGACLGARD
          570       580       590       600       610       620    

              580       590       600       610       620       630
pF1KSD PYCGWDGKQQRCSTLEDSSNMSLWTQNITACPVRNVTRDGGFGPWSPWQPCEHLDGDNSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PYCGWDGKQQRCSTLEDSSNMSLWTQNITACPVRNVTRDGGFGPWSPWQPCEHLDGDNSG
          630       640       650       660       670       680    

              640       650       660       670       680       690
pF1KSD SCLCRARSCDSPRPRCGGLDCLGPAIHIANCSRNGAWTPWSSWALCSTSCGIGFQVRQRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SCLCRARSCDSPRPRCGGLDCLGPAIHIANCSRNGAWTPWSSWALCSTSCGIGFQVRQRS
          690       700       710       720       730       740    

              700       710       720       730       740       750
pF1KSD CSNPAPRHGGRICVGKSREERFCNENTPCPVPIFWASWGSWSKCSSNCGGGMQSRRRACE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CSNPAPRHGGRICVGKSREERFCNENTPCPVPIFWASWGSWSKCSSNCGGGMQSRRRACE
          750       760       770       780       790       800    

              760       770       780       790       800       810
pF1KSD NGNSCLGCGVEFKTCNPEGCPEVRRNTPWTPWLPVNVTQGGARQEQRFRFTCRAPLADPH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NGNSCLGCGVEFKTCNPEGCPEVRRNTPWTPWLPVNVTQGGARQEQRFRFTCRAPLADPH
          810       820       830       840       850       860    

              820       830       840       850       860       870
pF1KSD GLQFGRRRTETRTCPADGSGSCDTDALVEDLLRSGSTSPHTVSGGWAAWGPWSSCSRDCE
       ::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GLQFGRRRTETRTCPADGSGSCDTDALVEVLLRSGSTSPHTVSGGWAAWGPWSSCSRDCE
          870       880       890       900       910       920    

              880       890       900       910       920       930
pF1KSD LGFRVRKRTCTNPEPRNGGLPCVGDAAEYQDCNPQACPVRGAWSCWTSWSPCSASCGGGH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LGFRVRKRTCTNPEPRNGGLPCVGDAAEYQDCNPQACPVRGAWSCWTSWSPCSASCGGGH
          930       940       950       960       970       980    

              940       950       960       970       980       990
pF1KSD YQRTRSCTSPAPSPGEDICLGLHTEEALCATQACPEGWSPWSEWSKCTDDGAQSRSRHCE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YQRTRSCTSPAPSPGEDICLGLHTEEALCATQACPEGWSPWSEWSKCTDDGAQSRSRHCE
          990      1000      1010      1020      1030      1040    

             1000      1010      1020      1030      1040      1050
pF1KSD ELLPGSSACAGNSSQSRPCPYSEIPVILPASSMEEATGCAGFNLIHLVATGISCFLGSGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
NP_001 ELLPGSSACAGNSSQSRPCPYSEIPVILPASSMEEATDCAGFNLIHLVATGISCFLGSGL
         1050      1060      1070      1080      1090      1100    

             1060      1070      1080      1090      1100      1110
pF1KSD LTLAVYLSCQHCQRQSQESTLVHPATPNHLHYKGGGTPKNEKYTPMEFKTLNKNNLIPDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LTLAVYLSCQHCQRQSQESTLVHPATPNHLHYKGGGTPKNEKYTPMEFKTLNKNNLIPDD
         1110      1120      1130      1140      1150      1160    

             1120      1130      1140      1150 
pF1KSD RANFYPLQQTNVYTTTYYPSPLNKHSFRPEASPGQRCFPNS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RANFYPLQQTNVYTTTYYPSPLNKHSFRPEASPGQRCFPNS
         1170      1180      1190      1200     

>>XP_016862127 (OMIM: 609298) PREDICTED: semaphorin-5B i  (1117 aa)
 initn: 6993 init1: 6993 opt: 6993  Z-score: 6270.3  bits: 1172.1 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 7712; 97.6% identity (97.6% similar) in 1117 aa overlap (59-1151:1-1117)

       30        40        50        60        70        80        
pF1KSD GWTVGGWLLSLVRGLLPCLPPGARTAEGPIMVLAGPLAVSLLLPSLTLLVSHLSSSQDVS
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016                               MVLAGPLAVSLLLPSLTLLVSHLSSSQDVS
                                             10        20        30

       90       100       110       120       130       140        
pF1KSD SEPSSEQQLCALSKHPTVAFEDLQPWVSNFTYPGARDFSQLALDPSGNQLIVGARNYLFR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SEPSSEQQLCALSKHPTVAFEDLQPWVSNFTYPGARDFSQLALDPSGNQLIVGARNYLFR
               40        50        60        70        80        90

      150       160       170                               180    
pF1KSD LSLANVSLLQATEWASSEDTRRSCQSKGKTE------------------------EECQN
       :::::::::::::::::::::::::::::::                        :::::
XP_016 LSLANVSLLQATEWASSEDTRRSCQSKGKTEWCEREISSIAPGELCCLLLSFLPQEECQN
              100       110       120       130       140       150

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pF1KSD YVRVLIVAGRKVFMCGTNAFSPMCTSRQVGNLSRTTEKINGVARCPYDPRHNSTAVISSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
XP_016 YVRVLIVAGRKVFMCGTNAFSPMCTSRQVGNLSRTIEKINGVARCPYDPRHNSTAVISSQ
              160       170       180       190       200       210

          250       260       270       280       290       300    
pF1KSD GELYAATVIDFSGRDPAIYRSLGSGPPLRTAQYNSKWLNEPNFVAAYDIGLFAYFFLREN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GELYAATVIDFSGRDPAIYRSLGSGPPLRTAQYNSKWLNEPNFVAAYDIGLFAYFFLREN
              220       230       240       250       260       270

          310       320       330       340       350       360    
pF1KSD AVEHDCGRTVYSRVARVCKNDVGGRFLLEDTWTTFMKARLNCSRPGEVPFYYNELQSAFH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AVEHDCGRTVYSRVARVCKNDVGGRFLLEDTWTTFMKARLNCSRPGEVPFYYNELQSAFH
              280       290       300       310       320       330

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pF1KSD LPEQDLIYGVFTTNVNSIAASAVCAFNLSAISQAFNGPFRYQENPRAAWLPIANPIPNFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LPEQDLIYGVFTTNVNSIAASAVCAFNLSAISQAFNGPFRYQENPRAAWLPIANPIPNFQ
              340       350       360       370       380       390

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pF1KSD CGTLPETGPNENLTERSLQDAQRLFLMSEAVQPVTPEPCVTQDSVRFSHLVVDLVQAKDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CGTLPETGPNENLTERSLQDAQRLFLMSEAVQPVTPEPCVTQDSVRFSHLVVDLVQAKDT
              400       410       420       430       440       450

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pF1KSD LYHVLYIGTESGTILKALSTASRSLHGCYLEELHVLPPGRREPLRSLRILHSARALFVGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LYHVLYIGTESGTILKALSTASRSLHGCYLEELHVLPPGRREPLRSLRILHSARALFVGL
              460       470       480       490       500       510

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pF1KSD RDGVLRVPLERCAAYRSQGACLGARDPYCGWDGKQQRCSTLEDSSNMSLWTQNITACPVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RDGVLRVPLERCAAYRSQGACLGARDPYCGWDGKQQRCSTLEDSSNMSLWTQNITACPVR
              520       530       540       550       560       570

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pF1KSD NVTRDGGFGPWSPWQPCEHLDGDNSGSCLCRARSCDSPRPRCGGLDCLGPAIHIANCSRN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NVTRDGGFGPWSPWQPCEHLDGDNSGSCLCRARSCDSPRPRCGGLDCLGPAIHIANCSRN
              580       590       600       610       620       630

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pF1KSD GAWTPWSSWALCSTSCGIGFQVRQRSCSNPAPRHGGRICVGKSREERFCNENTPCPVPIF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GAWTPWSSWALCSTSCGIGFQVRQRSCSNPAPRHGGRICVGKSREERFCNENTPCPVPIF
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pF1KSD WASWGSWSKCSSNCGGGMQSRRRACENGNSCLGCGVEFKTCNPEGCPEVRRNTPWTPWLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WASWGSWSKCSSNCGGGMQSRRRACENGNSCLGCGVEFKTCNPEGCPEVRRNTPWTPWLP
              700       710       720       730       740       750

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pF1KSD VNVTQGGARQEQRFRFTCRAPLADPHGLQFGRRRTETRTCPADGSGSCDTDALVEDLLRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::
XP_016 VNVTQGGARQEQRFRFTCRAPLADPHGLQFGRRRTETRTCPADGSGSCDTDALVEVLLRS
              760       770       780       790       800       810

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pF1KSD GSTSPHTVSGGWAAWGPWSSCSRDCELGFRVRKRTCTNPEPRNGGLPCVGDAAEYQDCNP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GSTSPHTVSGGWAAWGPWSSCSRDCELGFRVRKRTCTNPEPRNGGLPCVGDAAEYQDCNP
              820       830       840       850       860       870

          910       920       930       940       950       960    
pF1KSD QACPVRGAWSCWTSWSPCSASCGGGHYQRTRSCTSPAPSPGEDICLGLHTEEALCATQAC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QACPVRGAWSCWTSWSPCSASCGGGHYQRTRSCTSPAPSPGEDICLGLHTEEALCATQAC
              880       890       900       910       920       930

          970       980       990      1000      1010      1020    
pF1KSD PEGWSPWSEWSKCTDDGAQSRSRHCEELLPGSSACAGNSSQSRPCPYSEIPVILPASSME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PEGWSPWSEWSKCTDDGAQSRSRHCEELLPGSSACAGNSSQSRPCPYSEIPVILPASSME
              940       950       960       970       980       990

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pF1KSD EATGCAGFNLIHLVATGISCFLGSGLLTLAVYLSCQHCQRQSQESTLVHPATPNHLHYKG
       ::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EATDCAGFNLIHLVATGISCFLGSGLLTLAVYLSCQHCQRQSQESTLVHPATPNHLHYKG
             1000      1010      1020      1030      1040      1050

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pF1KSD GGTPKNEKYTPMEFKTLNKNNLIPDDRANFYPLQQTNVYTTTYYPSPLNKHSFRPEASPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GGTPKNEKYTPMEFKTLNKNNLIPDDRANFYPLQQTNVYTTTYYPSPLNKHSFRPEASPG
             1060      1070      1080      1090      1100      1110

         1150 
pF1KSD QRCFPNS
       :::::::
XP_016 QRCFPNS
              

>>NP_001243277 (OMIM: 609298) semaphorin-5B isoform 3 pr  (1057 aa)
 initn: 6015 init1: 6015 opt: 6033  Z-score: 5410.2  bits: 1012.9 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 7398; 96.4% identity (96.4% similar) in 1093 aa overlap (59-1151:1-1057)

       30        40        50        60        70        80        
pF1KSD GWTVGGWLLSLVRGLLPCLPPGARTAEGPIMVLAGPLAVSLLLPSLTLLVSHLSSSQDVS
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001                               MVLAGPLAVSLLLPSLTLLVSHLSSSQDVS
                                             10        20        30

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pF1KSD SEPSSEQQLCALSKHPTVAFEDLQPWVSNFTYPGARDFSQLALDPSGNQLIVGARNYLFR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SEPSSEQQLCALSKHPTVAFEDLQPWVSNFTYPGARDFSQLALDPSGNQLIVGARNYLFR
               40        50        60        70        80        90

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pF1KSD LSLANVSLLQATEWASSEDTRRSCQSKGKTEEECQNYVRVLIVAGRKVFMCGTNAFSPMC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LSLANVSLLQATEWASSEDTRRSCQSKGKTEEECQNYVRVLIVAGRKVFMCGTNAFSPMC
              100       110       120       130       140       150

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pF1KSD TSRQVGNLSRTTEKINGVARCPYDPRHNSTAVISSQGELYAATVIDFSGRDPAIYRSLGS
       ::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TSRQVGNLSRTIEKINGVARCPYDPRHNSTAVISSQGELYAATVIDFSGRDPAIYRSLGS
              160       170       180       190       200       210

      270       280       290       300       310       320        
pF1KSD GPPLRTAQYNSKWLNEPNFVAAYDIGLFAYFFLRENAVEHDCGRTVYSRVARVCKNDVGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GPPLRTAQYNSKWLNEPNFVAAYDIGLFAYFFLRENAVEHDCGRTVYSRVARVCKNDVGG
              220       230       240       250       260       270

      330       340       350       360       370       380        
pF1KSD RFLLEDTWTTFMKARLNCSRPGEVPFYYNELQSAFHLPEQDLIYGVFTTNVNSIAASAVC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RFLLEDTWTTFMKARLNCSRPGEVPFYYNELQSAFHLPEQDLIYGVFTTNVNSIAASAVC
              280       290       300       310       320       330

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pF1KSD AFNLSAISQAFNGPFRYQENPRAAWLPIANPIPNFQCGTLPETGPNENLTERSLQDAQRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AFNLSAISQAFNGPFRYQENPRAAWLPIANPIPNFQCGTLPETGPNENLTERSLQDAQRL
              340       350       360       370       380       390

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pF1KSD FLMSEAVQPVTPEPCVTQDSVRFSHLVVDLVQAKDTLYHVLYIGTESGTILKALSTASRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FLMSEAVQPVTPEPCVTQDSVRFSHLVVDLVQAKDTLYHVLYIGTESGTILKALSTASRS
              400       410       420       430       440       450

      510       520       530       540       550       560        
pF1KSD LHGCYLEELHVLPPGRREPLRSLRILHSARALFVGLRDGVLRVPLERCAAYRSQGACLGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LHGCYLEELHVLPPGRREPLRSLRILHSARALFVGLRDGVLRVPLERCAAYRSQGACLGA
              460       470       480       490       500       510

      570       580       590       600       610       620        
pF1KSD RDPYCGWDGKQQRCSTLEDSSNMSLWTQNITACPVRNVTRDGGFGPWSPWQPCEHLDGDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RDPYCGWDGKQQRCSTLEDSSNMSLWTQNITACPVRNVTRDGGFGPWSPWQPCEHLDGDN
              520       530       540       550       560       570

      630       640       650       660       670       680        
pF1KSD SGSCLCRARSCDSPRPRCGGLDCLGPAIHIANCSRNGAWTPWSSWALCSTSCGIGFQVRQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SGSCLCRARSCDSPRPRCGGLDCLGPAIHIANCSRNGAWTPWSSWALCSTSCGIGFQVRQ
              580       590       600       610       620       630

      690       700       710       720       730       740        
pF1KSD RSCSNPAPRHGGRICVGKSREERFCNENTPCPVPIFWASWGSWSKCSSNCGGGMQSRRRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RSCSNPAPRHGGRICVGKSREERFCNENTPCPVPIFWASWGSWSKCSSNCGGGMQSRRRA
              640       650       660       670       680       690

      750       760       770       780       790       800        
pF1KSD CENGNSCLGCGVEFKTCNPEGCPEVRRNTPWTPWLPVNVTQGGARQEQRFRFTCRAPLAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CENGNSCLGCGVEFKTCNPEGCPEVRRNTPWTPWLPVNVTQGGARQEQRFRFTCRAPLAD
              700       710       720       730       740       750

      810       820       830       840       850       860        
pF1KSD PHGLQFGRRRTETRTCPADGSGSCDTDALVEDLLRSGSTSPHTVSGGWAAWGPWSSCSRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PHGLQFGRRRTETRTCPADGSGSCDTDALVEVLLRSGSTSPHTVSGGWAAWGPWSSCSRD
              760       770       780       790       800       810

      870       880       890       900       910       920        
pF1KSD CELGFRVRKRTCTNPEPRNGGLPCVGDAAEYQDCNPQACPVRGAWSCWTSWSPCSASCGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                    
NP_001 CELGFRVRKRTCTNPEPRNGGLPCVGDAAEYQDCNPQACP--------------------
              820       830       840       850                    

      930       940       950       960       970       980        
pF1KSD GHYQRTRSCTSPAPSPGEDICLGLHTEEALCATQACPEGWSPWSEWSKCTDDGAQSRSRH
                       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ----------------GEDICLGLHTEEALCATQACPEGWSPWSEWSKCTDDGAQSRSRH
                              860       870       880       890    

      990      1000      1010      1020      1030      1040        
pF1KSD CEELLPGSSACAGNSSQSRPCPYSEIPVILPASSMEEATGCAGFNLIHLVATGISCFLGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
NP_001 CEELLPGSSACAGNSSQSRPCPYSEIPVILPASSMEEATDCAGFNLIHLVATGISCFLGS
          900       910       920       930       940       950    

     1050      1060      1070      1080      1090      1100        
pF1KSD GLLTLAVYLSCQHCQRQSQESTLVHPATPNHLHYKGGGTPKNEKYTPMEFKTLNKNNLIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GLLTLAVYLSCQHCQRQSQESTLVHPATPNHLHYKGGGTPKNEKYTPMEFKTLNKNNLIP
          960       970       980       990      1000      1010    

     1110      1120      1130      1140      1150 
pF1KSD DDRANFYPLQQTNVYTTTYYPSPLNKHSFRPEASPGQRCFPNS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DDRANFYPLQQTNVYTTTYYPSPLNKHSFRPEASPGQRCFPNS
         1020      1030      1040      1050       

>>XP_016862128 (OMIM: 609298) PREDICTED: semaphorin-5B i  (794 aa)
 initn: 5475 init1: 5475 opt: 5475  Z-score: 4911.7  bits: 920.2 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 5475; 99.9% identity (99.9% similar) in 777 aa overlap (59-835:1-777)

       30        40        50        60        70        80        
pF1KSD GWTVGGWLLSLVRGLLPCLPPGARTAEGPIMVLAGPLAVSLLLPSLTLLVSHLSSSQDVS
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016                               MVLAGPLAVSLLLPSLTLLVSHLSSSQDVS
                                             10        20        30

       90       100       110       120       130       140        
pF1KSD SEPSSEQQLCALSKHPTVAFEDLQPWVSNFTYPGARDFSQLALDPSGNQLIVGARNYLFR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SEPSSEQQLCALSKHPTVAFEDLQPWVSNFTYPGARDFSQLALDPSGNQLIVGARNYLFR
               40        50        60        70        80        90

      150       160       170       180       190       200        
pF1KSD LSLANVSLLQATEWASSEDTRRSCQSKGKTEEECQNYVRVLIVAGRKVFMCGTNAFSPMC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LSLANVSLLQATEWASSEDTRRSCQSKGKTEEECQNYVRVLIVAGRKVFMCGTNAFSPMC
              100       110       120       130       140       150

      210       220       230       240       250       260        
pF1KSD TSRQVGNLSRTTEKINGVARCPYDPRHNSTAVISSQGELYAATVIDFSGRDPAIYRSLGS
       ::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TSRQVGNLSRTIEKINGVARCPYDPRHNSTAVISSQGELYAATVIDFSGRDPAIYRSLGS
              160       170       180       190       200       210

      270       280       290       300       310       320        
pF1KSD GPPLRTAQYNSKWLNEPNFVAAYDIGLFAYFFLRENAVEHDCGRTVYSRVARVCKNDVGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GPPLRTAQYNSKWLNEPNFVAAYDIGLFAYFFLRENAVEHDCGRTVYSRVARVCKNDVGG
              220       230       240       250       260       270

      330       340       350       360       370       380        
pF1KSD RFLLEDTWTTFMKARLNCSRPGEVPFYYNELQSAFHLPEQDLIYGVFTTNVNSIAASAVC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RFLLEDTWTTFMKARLNCSRPGEVPFYYNELQSAFHLPEQDLIYGVFTTNVNSIAASAVC
              280       290       300       310       320       330

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pF1KSD AFNLSAISQAFNGPFRYQENPRAAWLPIANPIPNFQCGTLPETGPNENLTERSLQDAQRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AFNLSAISQAFNGPFRYQENPRAAWLPIANPIPNFQCGTLPETGPNENLTERSLQDAQRL
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pF1KSD FLMSEAVQPVTPEPCVTQDSVRFSHLVVDLVQAKDTLYHVLYIGTESGTILKALSTASRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FLMSEAVQPVTPEPCVTQDSVRFSHLVVDLVQAKDTLYHVLYIGTESGTILKALSTASRS
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pF1KSD LHGCYLEELHVLPPGRREPLRSLRILHSARALFVGLRDGVLRVPLERCAAYRSQGACLGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LHGCYLEELHVLPPGRREPLRSLRILHSARALFVGLRDGVLRVPLERCAAYRSQGACLGA
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pF1KSD RDPYCGWDGKQQRCSTLEDSSNMSLWTQNITACPVRNVTRDGGFGPWSPWQPCEHLDGDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RDPYCGWDGKQQRCSTLEDSSNMSLWTQNITACPVRNVTRDGGFGPWSPWQPCEHLDGDN
              520       530       540       550       560       570

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pF1KSD SGSCLCRARSCDSPRPRCGGLDCLGPAIHIANCSRNGAWTPWSSWALCSTSCGIGFQVRQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SGSCLCRARSCDSPRPRCGGLDCLGPAIHIANCSRNGAWTPWSSWALCSTSCGIGFQVRQ
              580       590       600       610       620       630

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pF1KSD RSCSNPAPRHGGRICVGKSREERFCNENTPCPVPIFWASWGSWSKCSSNCGGGMQSRRRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RSCSNPAPRHGGRICVGKSREERFCNENTPCPVPIFWASWGSWSKCSSNCGGGMQSRRRA
              640       650       660       670       680       690

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pF1KSD CENGNSCLGCGVEFKTCNPEGCPEVRRNTPWTPWLPVNVTQGGARQEQRFRFTCRAPLAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CENGNSCLGCGVEFKTCNPEGCPEVRRNTPWTPWLPVNVTQGGARQEQRFRFTCRAPLAD
              700       710       720       730       740       750

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pF1KSD PHGLQFGRRRTETRTCPADGSGSCDTDALVEDLLRSGSTSPHTVSGGWAAWGPWSSCSRD
       :::::::::::::::::::::::::::                                 
XP_016 PHGLQFGRRRTETRTCPADGSGSCDTDGTPRPAPPPSSLPAPER                
              760       770       780       790                    

>>XP_006714570 (OMIM: 609297) PREDICTED: semaphorin-5A i  (1074 aa)
 initn: 4667 init1: 2810 opt: 4734  Z-score: 4246.0  bits: 797.5 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4734; 59.2% identity (83.9% similar) in 1045 aa overlap (98-1135:30-1071)

        70        80        90       100       110       120       
pF1KSD SLLLPSLTLLVSHLSSSQDVSSEPSSEQQLCALSKHPTVAFEDLQPWVSNFTYPGARDFS
                                     :  ..::....... ::. .:   .: :::
XP_006  MKGTCVIAWLFSSLGLWRLAHPEAQGTTQCQRTEHPVISYKEIGPWLREFRAKNAVDFS
                10        20        30        40        50         

       130       140       150       160       170       180       
pF1KSD QLALDPSGNQLIVGARNYLFRLSLANVSLLQATEWASSEDTRRSCQSKGKTEEECQNYVR
       ::..::. ..:.::::::::::.: ..::.::.::  .: :...: ::::..::::::.:
XP_006 QLTFDPGQKELVVGARNYLFRLQLEDLSLIQAVEWECDEATKKACYSKGKSKEECQNYIR
      60        70        80        90       100       110         

       190       200       210       220       230       240       
pF1KSD VLIVAGRKVFMCGTNAFSPMCTSRQVGNLSRTTEKINGVARCPYDPRHNSTAVISSQGEL
       ::.:.: ..: ::::::.:.::.:...::..  ..:.:.:::::.:.:::::.... :::
XP_006 VLLVGGDRLFTCGTNAFTPVCTNRSLSNLTEIHDQISGMARCPYSPQHNSTALLTAGGEL
     120       130       140       150       160       170         

       250       260       270       280       290       300       
pF1KSD YAATVIDFSGRDPAIYRSLGSGPPLRTAQYNSKWLNEPNFVAAYDIGLFAYFFLRENAVE
       ::::..:: :::::::::::  :::::::::::::::::::..:::: :.:::.::::::
XP_006 YAATAMDFPGRDPAIYRSLGILPPLRTAQYNSKWLNEPNFVSSYDIGNFTYFFFRENAVE
     180       190       200       210       220       230         

       310       320       330       340       350       360       
pF1KSD HDCGRTVYSRVARVCKNDVGGRFLLEDTWTTFMKARLNCSRPGEVPFYYNELQSAFHLPE
       ::::.::.::.:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.: :::
XP_006 HDCGKTVFSRAARVCKNDIGGRFLLEDTWTTFMKARLNCSRPGEVPFYYNELQSTFFLPE
     240       250       260       270       280       290         

       370       380       390       400       410       420       
pF1KSD QDLIYGVFTTNVNSIAASAVCAFNLSAISQAFNGPFRYQENPRAAWLPIANPIPNFQCGT
        :::::.::::::::::::::.::::::.:::.:::.:::: :.::::  :: :.:::::
XP_006 LDLIYGIFTTNVNSIAASAVCVFNLSAIAQAFSGPFKYQENSRSAWLPYPNPNPHFQCGT
     300       310       320       330       340       350         

       430       440       450       460       470       480       
pF1KSD LPETGPNENLTERSLQDAQRLFLMSEAVQPVTPEPCVTQDSVRFSHLVVDLVQAKDTLYH
       . . :   :::::.:::::...:: :.:::::  :   .:. ::::..::.::....: :
XP_006 V-DQGLYVNLTERNLQDAQKFILMHEVVQPVTTVPSFMEDNSRFSHVAVDVVQGREALVH
     360        370       380       390       400       410        

       490       500       510       520       530       540       
pF1KSD VLYIGTESGTILKALSTASRSLHGCYLEELHVLPPGRREPLRSLRILHSARALFVGLRDG
       ..:..:. ::: :.    ...  .: :::....:  ::::.:::.::::  .::::::. 
XP_006 IIYLATDYGTIKKVRVPLNQTSSSCLLEEIELFPERRREPIRSLQILHSQSVLFVGLREH
      420       430       440       450       460       470        

       550       560       570       580       590       600       
pF1KSD VLRVPLERCAAYRSQGACLGARDPYCGWDGKQQRCSTLEDSSNMSLWTQNITACPVRNVT
       :...::.::  ::....:.::.:::::::  ...:..::.: .:. : :.:.:::.::.:
XP_006 VVKIPLKRCQFYRTRSTCIGAQDPYCGWDVVMKKCTSLEESLSMTQWEQSISACPTRNLT
      480       490       500       510       520       530        

       610       620       630       640       650       660       
pF1KSD RDGGFGPWSPWQPCEHLDGDNSGSCLCRARSCDSPRPRCGGLDCLGPAIHIANCSRNGAW
        :: :: :::: :: : ::.  ::::::.:::::: :.::: .: ::...::::::::.:
XP_006 VDGHFGVWSPWTPCTHTDGSAVGSCLCRTRSCDSPAPQCGGWQCEGPGMEIANCSRNGGW
      540       550       560       570       580       590        

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pF1KSD TPWSSWALCSTSCGIGFQVRQRSCSNPAPRHGGRICVGKSREERFCNENTPCPVPIFWAS
       :::.::. :::.:::::::::::::::.::::::.:::..::::.:::.  ::  .::..
XP_006 TPWTSWSPCSTTCGIGFQVRQRSCSNPTPRHGGRVCVGQNREERYCNEHLLCPPHMFWTG
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pF1KSD WGSWSKCSSNCGGGMQSRRRACENGNSCLGCGVEFKTCNPEGCPEVRRNTPWTPWLPVNV
       :: : .:...::::.:.::: :::: .: ::.::...:: . :::....:::::: :::.
XP_006 WGPWERCTAQCGGGIQARRRICENGPDCAGCNVEYQSCNTNPCPELKKTTPWTPWTPVNI
      660       670       680       690       700       710        

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pF1KSD TQGGARQEQRFRFTCRAPLADPHGLQFGRRRTETRTCPADGSGSCDTDALVEDLLRSGST
       ...:.. :::::.::.: ::::. :. ::.: : : : .::...:.::.:  :.::.:  
XP_006 SDNGGHYEQRFRYTCKARLADPNLLEVGRQRIEMRYCSSDGTSGCSTDGLSGDFLRAGRY
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pF1KSD SPHTVSGGWAAWGPWSSCSRDCELGFRVRKRTCTNPEPRNGGLPCVGDAAEYQDCNPQAC
       : :::.:.:.::  ::.:::::  :.: :::.:.::::. ::.::.: . :::.::   :
XP_006 SAHTVNGAWSAWTSWSQCSRDCSRGIRNRKRVCNNPEPKYGGMPCLGPSLEYQECNILPC
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pF1KSD PVRGAWSCWTSWSPCSASCGGGHYQRTRSCTSPAPSPGEDICLGLHTEEALCATQACPEG
       :: :.::::. :. :::.::::::.:::::..:::. : ::::::::::::: :: :::.
XP_006 PVDGVWSCWSPWTKCSATCGGGHYMRTRSCSNPAPAYGGDICLGLHTEEALCNTQPCPES
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pF1KSD WSPWSEWSKCTDDGAQSRSRHCEELLPGSSACAGNSSQSRPCPYSE--IPVILPA--SSM
       :: ::.::.:  .:.: :.:.:  :.: .: :.::...:::: ..   :: .  :  ::.
XP_006 WSEWSDWSECEASGVQVRARQCILLFPMGSQCSGNTTESRPCVFDSNFIPEVSVARSSSV
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pF1KSD EEATGCAGFNLIHLVATGISCFLGSGLLTLAVYLSCQHCQRQSQESTLVHPATPNHLHYK
       ::   :. ::..:..:.:.:  . . :::: ::  ::. :.::...:..::..:  :. .
XP_006 EEKR-CGEFNMFHMIAVGLSSSILGCLLTLLVYTYCQRYQQQSHDATVIHPVSPAPLNTS
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pF1KSD -GGGTPKNEKYTPME-FKTLNKNNLIPDDRANFY-PLQQTNVYTTTYYPSPLNKHSFRPE
         .   : .::  .: .:..:::::: ..: ... :    ..:...:. . ::..     
XP_006 ITNHINKLDKYDSVEAIKAFNKNNLILEERNKYFNPHLTGKTYSNAYF-TDLNNYDEY  
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             1150 
pF1KSD ASPGQRCFPNS

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XP_011  MKGTCVIAWLFSSLGLWRLAHPEAQGTTQCQRTEHPVISYKEIGPWLREFRAKNAVDFS
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pF1KSD QLALDPSGNQLIVGARNYLFRLSLANVSLLQATEWASSEDTRRSCQSKGKTEEECQNYVR
       ::..::. ..:.::::::::::.: ..::.::.::  .: :...: ::::..::::::.:
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pF1KSD VLIVAGRKVFMCGTNAFSPMCTSRQVGNLSRTTEKINGVARCPYDPRHNSTAVISSQGEL
       ::.:.: ..: ::::::.:.::.:...::..  ..:.:.:::::.:.:::::.... :::
XP_011 VLLVGGDRLFTCGTNAFTPVCTNRSLSNLTEIHDQISGMARCPYSPQHNSTALLTAGGEL
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       ::::..:: :::::::::::  :::::::::::::::::::..:::: :.:::.::::::
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pF1KSD HDCGRTVYSRVARVCKNDVGGRFLLEDTWTTFMKARLNCSRPGEVPFYYNELQSAFHLPE
       ::::.::.::.:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.: :::
XP_011 HDCGKTVFSRAARVCKNDIGGRFLLEDTWTTFMKARLNCSRPGEVPFYYNELQSTFFLPE
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pF1KSD QDLIYGVFTTNVNSIAASAVCAFNLSAISQAFNGPFRYQENPRAAWLPIANPIPNFQCGT
        :::::.::::::::::::::.::::::.:::.:::.:::: :.::::  :: :.:::::
XP_011 LDLIYGIFTTNVNSIAASAVCVFNLSAIAQAFSGPFKYQENSRSAWLPYPNPNPHFQCGT
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pF1KSD LPETGPNENLTERSLQDAQRLFLMSEAVQPVTPEPCVTQDSVRFSHLVVDLVQAKDTLYH
       . . :   :::::.:::::...:: :.:::::  :   .:. ::::..::.::....: :
XP_011 V-DQGLYVNLTERNLQDAQKFILMHEVVQPVTTVPSFMEDNSRFSHVAVDVVQGREALVH
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pF1KSD VLYIGTESGTILKALSTASRSLHGCYLEELHVLPPGRREPLRSLRILHSARALFVGLRDG
       ..:..:. ::: :.    ...  .: :::....:  ::::.:::.::::  .::::::. 
XP_011 IIYLATDYGTIKKVRVPLNQTSSSCLLEEIELFPERRREPIRSLQILHSQSVLFVGLREH
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pF1KSD VLRVPLERCAAYRSQGACLGARDPYCGWDGKQQRCSTLEDSSNMSLWTQNITACPVRNVT
       :...::.::  ::....:.::.:::::::  ...:..::.: .:. : :.:.:::.::.:
XP_011 VVKIPLKRCQFYRTRSTCIGAQDPYCGWDVVMKKCTSLEESLSMTQWEQSISACPTRNLT
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pF1KSD RDGGFGPWSPWQPCEHLDGDNSGSCLCRARSCDSPRPRCGGLDCLGPAIHIANCSRNGAW
        :: :: :::: :: : ::.  ::::::.:::::: :.::: .: ::...::::::::.:
XP_011 VDGHFGVWSPWTPCTHTDGSAVGSCLCRTRSCDSPAPQCGGWQCEGPGMEIANCSRNGGW
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pF1KSD TPWSSWALCSTSCGIGFQVRQRSCSNPAPRHGGRICVGKSREERFCNENTPCPVPIFWAS
       :::.::. :::.:::::::::::::::.::::::.:::..::::.:::.  ::  .::..
XP_011 TPWTSWSPCSTTCGIGFQVRQRSCSNPTPRHGGRVCVGQNREERYCNEHLLCPPHMFWTG
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pF1KSD WGSWSKCSSNCGGGMQSRRRACENGNSCLGCGVEFKTCNPEGCPEVRRNTPWTPWLPVNV
       :: : .:...::::.:.::: :::: .: ::.::...:: . :::....:::::: :::.
XP_011 WGPWERCTAQCGGGIQARRRICENGPDCAGCNVEYQSCNTNPCPELKKTTPWTPWTPVNI
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pF1KSD TQGGARQEQRFRFTCRAPLADPHGLQFGRRRTETRTCPADGSGSCDTDALVEDLLRSGST
       ...:.. :::::.::.: ::::. :. ::.: : : : .::...:.::.:  :.::.:  
XP_011 SDNGGHYEQRFRYTCKARLADPNLLEVGRQRIEMRYCSSDGTSGCSTDGLSGDFLRAGRY
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pF1KSD SPHTVSGGWAAWGPWSSCSRDCELGFRVRKRTCTNPEPRNGGLPCVGDAAEYQDCNPQAC
       : :::.:.:.::  ::.:::::  :.: :::.:.::::. ::.::.: . :::.::   :
XP_011 SAHTVNGAWSAWTSWSQCSRDCSRGIRNRKRVCNNPEPKYGGMPCLGPSLEYQECNILPC
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pF1KSD PVRGAWSCWTSWSPCSASCGGGHYQRTRSCTSPAPSPGEDICLGLHTEEALCATQACPEG
       :: :.::::. :. :::.::::::.:::::..:::. : ::::::::::::: :: :::.
XP_011 PVDGVWSCWSPWTKCSATCGGGHYMRTRSCSNPAPAYGGDICLGLHTEEALCNTQPCPES
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pF1KSD WSPWSEWSKCTDDGAQSRSRHCEELLPGSSACAGNSSQSRPCPYSE--IPVILPA--SSM
       :: ::.::.:  .:.: :.:.:  :.: .: :.::...:::: ..   :: .  :  ::.
XP_011 WSEWSDWSECEASGVQVRARQCILLFPMGSQCSGNTTESRPCVFDSNFIPEVSVARSSSV
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pF1KSD EEATGCAGFNLIHLVATGISCFLGSGLLTLAVYLSCQHCQRQSQESTLVHPATPNHLHYK
       ::   :. ::..:..:.:.:  . . :::: ::  ::. :.::...:..::..:  :. .
XP_011 EEKR-CGEFNMFHMIAVGLSSSILGCLLTLLVYTYCQRYQQQSHDATVIHPVSPAPLNTS
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pF1KSD -GGGTPKNEKYTPME-FKTLNKNNLIPDDRANFY-PLQQTNVYTTTYYPSPLNKHSFRPE
         .   : .::  .: .:..:::::: ..: ... :    ..:...:. . ::..     
XP_011 ITNHINKLDKYDSVEAIKAFNKNNLILEERNKYFNPHLTGKTYSNAYF-TDLNNYDEY  
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             1150 
pF1KSD ASPGQRCFPNS

>>NP_003957 (OMIM: 609297) semaphorin-5A precursor [Homo  (1074 aa)
 initn: 4667 init1: 2810 opt: 4734  Z-score: 4246.0  bits: 797.5 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4734; 59.2% identity (83.9% similar) in 1045 aa overlap (98-1135:30-1071)

        70        80        90       100       110       120       
pF1KSD SLLLPSLTLLVSHLSSSQDVSSEPSSEQQLCALSKHPTVAFEDLQPWVSNFTYPGARDFS
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NP_003  MKGTCVIAWLFSSLGLWRLAHPEAQGTTQCQRTEHPVISYKEIGPWLREFRAKNAVDFS
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pF1KSD QLALDPSGNQLIVGARNYLFRLSLANVSLLQATEWASSEDTRRSCQSKGKTEEECQNYVR
       ::..::. ..:.::::::::::.: ..::.::.::  .: :...: ::::..::::::.:
NP_003 QLTFDPGQKELVVGARNYLFRLQLEDLSLIQAVEWECDEATKKACYSKGKSKEECQNYIR
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pF1KSD VLIVAGRKVFMCGTNAFSPMCTSRQVGNLSRTTEKINGVARCPYDPRHNSTAVISSQGEL
       ::.:.: ..: ::::::.:.::.:...::..  ..:.:.:::::.:.:::::.... :::
NP_003 VLLVGGDRLFTCGTNAFTPVCTNRSLSNLTEIHDQISGMARCPYSPQHNSTALLTAGGEL
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       ::::..:: :::::::::::  :::::::::::::::::::..:::: :.:::.::::::
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       ::::.::.::.:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.: :::
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       :: :.::::. :. :::.::::::.:::::..:::. : ::::::::::::: :: :::.
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pF1KSD ASPGQRCFPNS




1151 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 06:21:13 2016 done: Thu Nov  3 06:21:15 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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