Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1290
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1290, 1010 aa
1>>>pF1KSDA1290 1010 - 1010 aa - 1010 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8845+/-0.00102; mu= 18.2740+/- 0.061
mean_var=68.3392+/-13.885, 0's: 0 Z-trim(104.0): 28 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.155146
statistics sampled from 7649 (7666) to 7649 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.596), E-opt: 0.2 (0.235), width: 16
Scan time: 4.360
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7234.1 OGDHL gene_id:55753|Hs108|chr10 (1010) 6829 1538.2 0
CCDS44390.1 OGDHL gene_id:55753|Hs108|chr10 ( 953) 6006 1354.0 0
CCDS44391.1 OGDHL gene_id:55753|Hs108|chr10 ( 801) 5448 1229.1 0
CCDS34627.1 OGDH gene_id:4967|Hs108|chr7 (1023) 5389 1215.9 0
CCDS55107.1 OGDH gene_id:4967|Hs108|chr7 (1019) 5281 1191.7 0
CCDS47580.1 OGDH gene_id:4967|Hs108|chr7 ( 427) 1809 414.5 2.4e-115
CCDS7087.1 DHTKD1 gene_id:55526|Hs108|chr10 ( 919) 1555 357.7 6.3e-98
>>CCDS7234.1 OGDHL gene_id:55753|Hs108|chr10 (1010 aa)
initn: 6829 init1: 6829 opt: 6829 Z-score: 8250.7 bits: 1538.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6829; 100.0% identity (100.0% similar) in 1010 aa overlap (1-1010:1-1010)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSQLRLLPSRLGVQAARLLAAHDVPVFGWRSRSSGPPATFPSSKGGGGSSYMEEMYFAWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MSQLRLLPSRLGVQAARLLAAHDVPVFGWRSRSSGPPATFPSSKGGGGSSYMEEMYFAWL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ENPQSVHKSWDSFFREASEEAFSGSAQPRPPSVVHESRSAVSSRTKTSKLVEDHLAVQSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 ENPQSVHKSWDSFFREASEEAFSGSAQPRPPSVVHESRSAVSSRTKTSKLVEDHLAVQSL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD IRAYQIRGHHVAQLDPLGILDADLDSFVPSDLITTIDKLAFYDLQEADLDKEFQLPTTTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 IRAYQIRGHHVAQLDPLGILDADLDSFVPSDLITTIDKLAFYDLQEADLDKEFQLPTTTF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD IGGSENTLSLREIIRRLENTYCQHIGLEFMFINDVEQCQWIRQKFETPGVMQFSSEEKRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 IGGSENTLSLREIIRRLENTYCQHIGLEFMFINDVEQCQWIRQKFETPGVMQFSSEEKRT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LLARLVRSMRFEDFLARKWSSEKRFGLEGCEVMIPALKTIIDKSSEMGIENVILGMPHRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LLARLVRSMRFEDFLARKWSSEKRFGLEGCEVMIPALKTIIDKSSEMGIENVILGMPHRG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD RLNVLANVIRKDLEQIFCQFDPKLEAADEGSGDVKYHLGMYHERINRVTNRNITLSLVAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 RLNVLANVIRKDLEQIFCQFDPKLEAADEGSGDVKYHLGMYHERINRVTNRNITLSLVAN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD PSHLEAVDPVVQGKTKAEQFYRGDAQGKKVMSILVHGDAAFAGQGVVYETFHLSDLPSYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 PSHLEAVDPVVQGKTKAEQFYRGDAQGKKVMSILVHGDAAFAGQGVVYETFHLSDLPSYT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD TNGTVHVVVNNQIGFTTDPRMARSSPYPTDVARVVNAPIFHVNADDPEAVIYVCSVAAEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 TNGTVHVVVNNQIGFTTDPRMARSSPYPTDVARVVNAPIFHVNADDPEAVIYVCSVAAEW
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD RNTFNKDVVVDLVCYRRRGHNEMDEPMFTQPLMYKQIHRQVPVLKKYADKLIAEGTVTLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 RNTFNKDVVVDLVCYRRRGHNEMDEPMFTQPLMYKQIHRQVPVLKKYADKLIAEGTVTLQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD EFEEEIAKYDRICEEAYGRSKDKKILHIKHWLDSPWPGFFNVDGEPKSMTCPATGIPEDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 EFEEEIAKYDRICEEAYGRSKDKKILHIKHWLDSPWPGFFNVDGEPKSMTCPATGIPEDM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LTHIGSVASSVPLEDFKIHTGLSRILRGRADMTKNRTVDWALAEYMAFGSLLKEGIHVRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LTHIGSVASSVPLEDFKIHTGLSRILRGRADMTKNRTVDWALAEYMAFGSLLKEGIHVRL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD SGQDVERGTFSHRHHVLHDQEVDRRTCVPMNHLWPDQAPYTVCNSSLSEYGVLGFELGYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 SGQDVERGTFSHRHHVLHDQEVDRRTCVPMNHLWPDQAPYTVCNSSLSEYGVLGFELGYA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD MASPNALVLWEAQFGDFHNTAQCIIDQFISTGQAKWVRHNGIVLLLPHGMEGMGPEHSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MASPNALVLWEAQFGDFHNTAQCIIDQFISTGQAKWVRHNGIVLLLPHGMEGMGPEHSSA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD RPERFLQMSNDDSDAYPAFTKDFEVSQLYDCNWIVVNCSTPANYFHVLRRQILLPFRKPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 RPERFLQMSNDDSDAYPAFTKDFEVSQLYDCNWIVVNCSTPANYFHVLRRQILLPFRKPL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD IIFTPKSLLRHPEAKSSFDQMVSGTSFQRVIPEDGAAARAPEQVQRLIFCTGKVYYDLVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 IIFTPKSLLRHPEAKSSFDQMVSGTSFQRVIPEDGAAARAPEQVQRLIFCTGKVYYDLVK
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD ERSSQDLEEKVAITRLEQISPFPFDLIKQEAEKYPGAELAWCQEEHKNMGYYDYISPRFM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 ERSSQDLEEKVAITRLEQISPFPFDLIKQEAEKYPGAELAWCQEEHKNMGYYDYISPRFM
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010
pF1KSD TILRRARPIWYVGRDPAAAPATGNRNTHLVSLKKFLDTAFNLQAFEGKTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 TILRRARPIWYVGRDPAAAPATGNRNTHLVSLKKFLDTAFNLQAFEGKTF
970 980 990 1000 1010
>>CCDS44390.1 OGDHL gene_id:55753|Hs108|chr10 (953 aa)
initn: 6001 init1: 6001 opt: 6006 Z-score: 7255.6 bits: 1354.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6341; 94.4% identity (94.4% similar) in 1010 aa overlap (1-1010:1-953)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSQLRLLPSRLGVQAARLLAAHDVPVFGWRSRSSGPPATFPSSKGGGGSSYMEEMYFAWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MSQLRLLPSRLGVQAARLLAAHDVPVFGWRSRSSGPPATFPSSKGGGGSSYMEEMYFAWL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ENPQSVHKSWDSFFREASEEAFSGSAQPRPPSVVHESRSAVSSRTKTSKLVEDHLAVQSL
::::::::
CCDS44 ENPQSVHK----------------------------------------------------
130 140 150 160 170 180
pF1KSD IRAYQIRGHHVAQLDPLGILDADLDSFVPSDLITTIDKLAFYDLQEADLDKEFQLPTTTF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 -----IRGHHVAQLDPLGILDADLDSFVPSDLITTIDKLAFYDLQEADLDKEFQLPTTTF
70 80 90 100 110 120
190 200 210 220 230 240
pF1KSD IGGSENTLSLREIIRRLENTYCQHIGLEFMFINDVEQCQWIRQKFETPGVMQFSSEEKRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 IGGSENTLSLREIIRRLENTYCQHIGLEFMFINDVEQCQWIRQKFETPGVMQFSSEEKRT
130 140 150 160 170 180
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LLARLVRSMRFEDFLARKWSSEKRFGLEGCEVMIPALKTIIDKSSEMGIENVILGMPHRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LLARLVRSMRFEDFLARKWSSEKRFGLEGCEVMIPALKTIIDKSSEMGIENVILGMPHRG
190 200 210 220 230 240
310 320 330 340 350 360
pF1KSD RLNVLANVIRKDLEQIFCQFDPKLEAADEGSGDVKYHLGMYHERINRVTNRNITLSLVAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RLNVLANVIRKDLEQIFCQFDPKLEAADEGSGDVKYHLGMYHERINRVTNRNITLSLVAN
250 260 270 280 290 300
370 380 390 400 410 420
pF1KSD PSHLEAVDPVVQGKTKAEQFYRGDAQGKKVMSILVHGDAAFAGQGVVYETFHLSDLPSYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PSHLEAVDPVVQGKTKAEQFYRGDAQGKKVMSILVHGDAAFAGQGVVYETFHLSDLPSYT
310 320 330 340 350 360
430 440 450 460 470 480
pF1KSD TNGTVHVVVNNQIGFTTDPRMARSSPYPTDVARVVNAPIFHVNADDPEAVIYVCSVAAEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TNGTVHVVVNNQIGFTTDPRMARSSPYPTDVARVVNAPIFHVNADDPEAVIYVCSVAAEW
370 380 390 400 410 420
490 500 510 520 530 540
pF1KSD RNTFNKDVVVDLVCYRRRGHNEMDEPMFTQPLMYKQIHRQVPVLKKYADKLIAEGTVTLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RNTFNKDVVVDLVCYRRRGHNEMDEPMFTQPLMYKQIHRQVPVLKKYADKLIAEGTVTLQ
430 440 450 460 470 480
550 560 570 580 590 600
pF1KSD EFEEEIAKYDRICEEAYGRSKDKKILHIKHWLDSPWPGFFNVDGEPKSMTCPATGIPEDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EFEEEIAKYDRICEEAYGRSKDKKILHIKHWLDSPWPGFFNVDGEPKSMTCPATGIPEDM
490 500 510 520 530 540
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LTHIGSVASSVPLEDFKIHTGLSRILRGRADMTKNRTVDWALAEYMAFGSLLKEGIHVRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LTHIGSVASSVPLEDFKIHTGLSRILRGRADMTKNRTVDWALAEYMAFGSLLKEGIHVRL
550 560 570 580 590 600
670 680 690 700 710 720
pF1KSD SGQDVERGTFSHRHHVLHDQEVDRRTCVPMNHLWPDQAPYTVCNSSLSEYGVLGFELGYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SGQDVERGTFSHRHHVLHDQEVDRRTCVPMNHLWPDQAPYTVCNSSLSEYGVLGFELGYA
610 620 630 640 650 660
730 740 750 760 770 780
pF1KSD MASPNALVLWEAQFGDFHNTAQCIIDQFISTGQAKWVRHNGIVLLLPHGMEGMGPEHSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MASPNALVLWEAQFGDFHNTAQCIIDQFISTGQAKWVRHNGIVLLLPHGMEGMGPEHSSA
670 680 690 700 710 720
790 800 810 820 830 840
pF1KSD RPERFLQMSNDDSDAYPAFTKDFEVSQLYDCNWIVVNCSTPANYFHVLRRQILLPFRKPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RPERFLQMSNDDSDAYPAFTKDFEVSQLYDCNWIVVNCSTPANYFHVLRRQILLPFRKPL
730 740 750 760 770 780
850 860 870 880 890 900
pF1KSD IIFTPKSLLRHPEAKSSFDQMVSGTSFQRVIPEDGAAARAPEQVQRLIFCTGKVYYDLVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 IIFTPKSLLRHPEAKSSFDQMVSGTSFQRVIPEDGAAARAPEQVQRLIFCTGKVYYDLVK
790 800 810 820 830 840
910 920 930 940 950 960
pF1KSD ERSSQDLEEKVAITRLEQISPFPFDLIKQEAEKYPGAELAWCQEEHKNMGYYDYISPRFM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ERSSQDLEEKVAITRLEQISPFPFDLIKQEAEKYPGAELAWCQEEHKNMGYYDYISPRFM
850 860 870 880 890 900
970 980 990 1000 1010
pF1KSD TILRRARPIWYVGRDPAAAPATGNRNTHLVSLKKFLDTAFNLQAFEGKTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TILRRARPIWYVGRDPAAAPATGNRNTHLVSLKKFLDTAFNLQAFEGKTF
910 920 930 940 950
>>CCDS44391.1 OGDHL gene_id:55753|Hs108|chr10 (801 aa)
initn: 5448 init1: 5448 opt: 5448 Z-score: 6581.8 bits: 1229.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5448; 100.0% identity (100.0% similar) in 801 aa overlap (210-1010:1-801)
180 190 200 210 220 230
pF1KSD FIGGSENTLSLREIIRRLENTYCQHIGLEFMFINDVEQCQWIRQKFETPGVMQFSSEEKR
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MFINDVEQCQWIRQKFETPGVMQFSSEEKR
10 20 30
240 250 260 270 280 290
pF1KSD TLLARLVRSMRFEDFLARKWSSEKRFGLEGCEVMIPALKTIIDKSSEMGIENVILGMPHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TLLARLVRSMRFEDFLARKWSSEKRFGLEGCEVMIPALKTIIDKSSEMGIENVILGMPHR
40 50 60 70 80 90
300 310 320 330 340 350
pF1KSD GRLNVLANVIRKDLEQIFCQFDPKLEAADEGSGDVKYHLGMYHERINRVTNRNITLSLVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GRLNVLANVIRKDLEQIFCQFDPKLEAADEGSGDVKYHLGMYHERINRVTNRNITLSLVA
100 110 120 130 140 150
360 370 380 390 400 410
pF1KSD NPSHLEAVDPVVQGKTKAEQFYRGDAQGKKVMSILVHGDAAFAGQGVVYETFHLSDLPSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NPSHLEAVDPVVQGKTKAEQFYRGDAQGKKVMSILVHGDAAFAGQGVVYETFHLSDLPSY
160 170 180 190 200 210
420 430 440 450 460 470
pF1KSD TTNGTVHVVVNNQIGFTTDPRMARSSPYPTDVARVVNAPIFHVNADDPEAVIYVCSVAAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TTNGTVHVVVNNQIGFTTDPRMARSSPYPTDVARVVNAPIFHVNADDPEAVIYVCSVAAE
220 230 240 250 260 270
480 490 500 510 520 530
pF1KSD WRNTFNKDVVVDLVCYRRRGHNEMDEPMFTQPLMYKQIHRQVPVLKKYADKLIAEGTVTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 WRNTFNKDVVVDLVCYRRRGHNEMDEPMFTQPLMYKQIHRQVPVLKKYADKLIAEGTVTL
280 290 300 310 320 330
540 550 560 570 580 590
pF1KSD QEFEEEIAKYDRICEEAYGRSKDKKILHIKHWLDSPWPGFFNVDGEPKSMTCPATGIPED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QEFEEEIAKYDRICEEAYGRSKDKKILHIKHWLDSPWPGFFNVDGEPKSMTCPATGIPED
340 350 360 370 380 390
600 610 620 630 640 650
pF1KSD MLTHIGSVASSVPLEDFKIHTGLSRILRGRADMTKNRTVDWALAEYMAFGSLLKEGIHVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MLTHIGSVASSVPLEDFKIHTGLSRILRGRADMTKNRTVDWALAEYMAFGSLLKEGIHVR
400 410 420 430 440 450
660 670 680 690 700 710
pF1KSD LSGQDVERGTFSHRHHVLHDQEVDRRTCVPMNHLWPDQAPYTVCNSSLSEYGVLGFELGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LSGQDVERGTFSHRHHVLHDQEVDRRTCVPMNHLWPDQAPYTVCNSSLSEYGVLGFELGY
460 470 480 490 500 510
720 730 740 750 760 770
pF1KSD AMASPNALVLWEAQFGDFHNTAQCIIDQFISTGQAKWVRHNGIVLLLPHGMEGMGPEHSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AMASPNALVLWEAQFGDFHNTAQCIIDQFISTGQAKWVRHNGIVLLLPHGMEGMGPEHSS
520 530 540 550 560 570
780 790 800 810 820 830
pF1KSD ARPERFLQMSNDDSDAYPAFTKDFEVSQLYDCNWIVVNCSTPANYFHVLRRQILLPFRKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ARPERFLQMSNDDSDAYPAFTKDFEVSQLYDCNWIVVNCSTPANYFHVLRRQILLPFRKP
580 590 600 610 620 630
840 850 860 870 880 890
pF1KSD LIIFTPKSLLRHPEAKSSFDQMVSGTSFQRVIPEDGAAARAPEQVQRLIFCTGKVYYDLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LIIFTPKSLLRHPEAKSSFDQMVSGTSFQRVIPEDGAAARAPEQVQRLIFCTGKVYYDLV
640 650 660 670 680 690
900 910 920 930 940 950
pF1KSD KERSSQDLEEKVAITRLEQISPFPFDLIKQEAEKYPGAELAWCQEEHKNMGYYDYISPRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KERSSQDLEEKVAITRLEQISPFPFDLIKQEAEKYPGAELAWCQEEHKNMGYYDYISPRF
700 710 720 730 740 750
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD MTILRRARPIWYVGRDPAAAPATGNRNTHLVSLKKFLDTAFNLQAFEGKTF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MTILRRARPIWYVGRDPAAAPATGNRNTHLVSLKKFLDTAFNLQAFEGKTF
760 770 780 790 800
>>CCDS34627.1 OGDH gene_id:4967|Hs108|chr7 (1023 aa)
initn: 5200 init1: 4123 opt: 5389 Z-score: 6508.7 bits: 1215.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5389; 78.6% identity (93.3% similar) in 981 aa overlap (34-1006:41-1020)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD LRLLPSRLGVQAARLLAAHDVPVFGWRSRSSGPPATFPSSKGGGGSSYMEEMYFAWLENP
:.: :. : .: . :.:.:::: ::::::
CCDS34 LRPLTASQTVKTFSQNRPAAARTFQQIRCYSAPVAAEPFLSGTS-SNYVEEMYCAWLENP
20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KSD QSVHKSWDSFFREASEEAFSGSAQPRP-P------SVVHESRSAVSSRTKTSKLVEDHLA
.::::::: :::... : :.: : : ..: ...: : .. ...::::::::
CCDS34 KSVHKSWDIFFRNTNAGAPPGTAYQSPLPLSRGSLAAVAHAQSLVEAQPNVDKLVEDHLA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD VQSLIRAYQIRGHHVAQLDPLGILDADLDSFVPSDLITTIDKLAFYDLQEADLDKEFQLP
:::::::::::::::::::::::::::::: ::.:.:.. :::.:: :.:.:::: :.::
CCDS34 VQSLIRAYQIRGHHVAQLDPLGILDADLDSSVPADIISSTDKLGFYGLDESDLDKVFHLP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD TTTFIGGSENTLSLREIIRRLENTYCQHIGLEFMFINDVEQCQWIRQKFETPGVMQFSSE
:::::::.:..: ::::::::: .::::::.:::::::.::::::::::::::.:::..:
CCDS34 TTTFIGGQESALPLREIIRRLEMAYCQHIGVEFMFINDLEQCQWIRQKFETPGIMQFTNE
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD EKRTLLARLVRSMRFEDFLARKWSSEKRFGLEGCEVMIPALKTIIDKSSEMGIENVILGM
:::::::::::: :::.:: ::::::::::::::::.::::::::::::: :.. ::.::
CCDS34 EKRTLLARLVRSTRFEEFLQRKWSSEKRFGLEGCEVLIPALKTIIDKSSENGVDYVIMGM
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300 310 320 330 340 350
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:::::::::::::::.::::::::: ::::::::::::::::::::.::::::.::::::
CCDS34 PHRGRLNVLANVIRKELEQIFCQFDSKLEAADEGSGDVKYHLGMYHRRINRVTDRNITLS
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::::::::::.::::.::::::::: ::..::::::::.::::::::::.::::::::::
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:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.:::.:
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:::::.::.:::::::::::: :::::::::::::::::::..: :::.:::. :...:.
CCDS34 AAEWRSTFHKDVVVDLVCYRRNGHNEMDEPMFTQPLMYKQIRKQKPVLQKYAELLVSQGV
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:. :.::::.:::.:::::..::::.:::::::::::::::::..::.:.::.::.::.
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::.:::::.::::::.:.: :: ::::::. :..:.:::::::::::::::::::::::
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:.::::::::::::::::::::::.::.:::.:::::::.::::::::::::::::::::
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::.:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.:::::::::::::::::
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:::::::::::: ::: :. : . . .:...:::::::.:::::::.:.:::::::::::
CCDS34 HSSARPERFLQMCNDDPDVLPDLKEANFDINQLYDCNWVVVNCSTPGNFFHVLRRQILLP
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:::::::::::::::::::.::::.:. :: ::::::::: ::. ::.:.::.:::::::
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pF1KSD YDLVKERSSQDLEEKVAITRLEQISPFPFDLIKQEAEKYPGAELAWCQEEHKNMGYYDYI
:::..::...:. .:::::.::.:::::::. .:..:::.::::::::::::.:::::.
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960 970 980 990 1000 1010
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.::. : . ::.:.::.::::::::::::..:::. :...:::::.:..:.
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240 250 260 270 280 290
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CCDS55 EKRTLLARLVRSTRFEEFLQRKWSSEKRFGLEGCEVLIPALKTIIDKSSENGVDYVIMGM
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:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.:::.:
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:::::.::.:::::::::::: :::::::::::::::::::..: :::.:::. :...:.
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::.:::::.::::::.:.: :: ::::::. :..:.:::::::::::::::::::::::
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:.::::::::::::::::::::::.::.:::.:::::::.::::::::::::::::::::
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::.:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.:::::::::::::::::
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:::::::::::: ::: :. : . . .:...:::::::.:::::::.:.:::::::::::
CCDS55 HSSARPERFLQMCNDDPDVLPDLKEANFDINQLYDCNWVVVNCSTPGNFFHVLRRQILLP
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pF1KSD FRKPLIIFTPKSLLRHPEAKSSFDQMVSGTSFQRVIPEDGAAARAPEQVQRLIFCTGKVY
:::::::::::::::::::.::::.:. :: ::::::::: ::. ::.:.::.:::::::
CCDS55 FRKPLIIFTPKSLLRHPEARSSFDEMLPGTHFQRVIPEDGPAAQNPENVKRLLFCTGKVY
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pF1KSD YDLVKERSSQDLEEKVAITRLEQISPFPFDLIKQEAEKYPGAELAWCQEEHKNMGYYDYI
:::..::...:. .:::::.::.:::::::. .:..:::.::::::::::::.:::::.
CCDS55 YDLTRERKARDMVGQVAITRIEQLSPFPFDLLLKEVQKYPNAELAWCQEEHKNQGYYDYV
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.::. : . ::.:.::.::::::::::::..:::. :...:::::.:..:.
CCDS55 KPRLRTTISRAKPVWYAGRDPAAAPATGNKKTHLTELQRLLDTAFDLDVFKNFS
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.::::::: :::... : :.: : : ..: ...: : .. ...::::::::
CCDS47 KSVHKSWDIFFRNTNAGAPPGTAYQSPLPLSRGSLAAVAHAQSLVEAQPNVDKLVEDHLA
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CCDS47 TTTFIGGQESALPLREIIRRLEMAYCQHIGVEFMFINDLEQCQWIRQKFETPGIMQFTNE
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CCDS47 EKRTLLARLVRSTRFEEFLQRKWSSEKRFGLEGCEVLIPALKTIIDKSSENGVDYVIMGM
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CCDS47 PHRGRLNVLANVIRKELEQIFCQFDSKLEAADEGSGDVKYHLGMYHRRINRVTDRNITLS
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::::::::::.::::.::::::::: ::..::::
CCDS47 LVANPSHLEAADPVVMGKTKAEQFYCGDTEGKKVRPRERRARQIVKAPCSSMEFRSPT
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CCDS70 MASATAAAARRGLGRALPLFWRGYQTERGVYGYRPRKP----ESREPQG
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. . :: .. :. .: .::..:...:: .: :.. :: :. :.
CCDS70 ALERPP---VDH-GLARLVTVYCEHGHKAAKINPLFTGQALLEN-VPE-----IQALV--
50 60 70 80 90
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pF1KSD DLQEADLDKEFQLPTTTFIGGSENTLSLREIIRRLENTYCQHIGLEFMFINDVEQCQWIR
:. :. .: : ::.:.. :.. :: .:..: ... .. .:.
CCDS70 ----QTLQGPFHTAGLLNMGKEEA--SLEEVLVYLNQIYCGQISIETSQLQSQDEKDWFA
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pF1KSD QKFETPGVMQFSSEEKRTLLARLVRSMRFEDFLARKWSSEKRFGLEGCEVMIPALKTIID
..:: :..::.. : ...:..:. ::: :.:. ::.: :: : :. .. ..
CCDS70 KRFEELQKETFTTEERKHLSKLMLESQEFDHFLATKFSTVKRYGGEGAESMMGFFHELLK
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pF1KSD KSSEMGIENVILGMPHRGRLNVLANVIRKDLEQIFCQFDPKLEAADE--GSGDVKYHLGM
:. :: .::.:::::::::.:..... : .: .. : .. ..::: ::
CCDS70 MSAYSGITDVIIGMPHRGRLNLLTGLLQFPPELMFRKMRGLSEFPENFSATGDVLSHLTS
210 220 230 240 250 260
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. . ... . .... ::::::::.::. :::...: : : :: : .:.
CCDS70 SVD-LYFGAHHPLHVTMLPNPSHLEAVNPVAVGKTRGRQQSRQDGDYSPDNSAQPGDRVI
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pF1KSD SILVHGDAAFAGQGVVYETFHLSDLPSYTTNGTVHVVVNNQIGFTTDPRMARSSPYPTDV
. :::::.: :::.: ::: ::.:: . .:.::..::::.:.:: . .::: : .:.
CCDS70 CLQVHGDASFCGQGIVPETFTLSNLPHFRIGGSVHLIVNNQLGYTTPAERGRSSLYCSDI
330 340 350 360 370 380
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pF1KSD ARVVNAPIFHVNADDPEAVIYVCSVAAEWRNTFNKDVVVDLVCYRRRGHNEMDEPMFTQP
...:. :.:::.:.:: :. . .: :.. : :::..::.:::. ::::.:::..:.:
CCDS70 GKLVGCAIIHVNGDSPEEVVRATRLAFEYQRQFRKDVIIDLLCYRQWGHNELDEPFYTNP
390 400 410 420 430 440
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pF1KSD LMYKQIHRQVPVLKKYADKLIAEGTVTLQEFEEEIAKYDRICEEAYGRSKDKKILHIKHW
.::: :. . . ::..::: : .: .: : ..: :.. .:. . .. :.
CCDS70 IMYKIIRARKSIPDTYAEHLIAGGLMTQEEVSEIKSSY-------YAKLNDH-LNNMAHY
450 460 470 480 490
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pF1KSD ------LDSPWPGFFNVDGEPKS-MTCPATGIPEDMLTHIGSVASSVPLEDFKIHTGLSR
:.. : :. ..:.. .: .::.: :.: .: . :: : ...:. : .
CCDS70 RPPALNLQAHWQGL----AQPEAQITTWSTGVPLDLLRFVGMKSVEVPRE-LQMHSHLLK
500 510 520 530 540 550
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pF1KSD I-LRGRAD-MTKNRTVDWALAEYMAFGSLLKEGIHVRLSGQDVERGTFSHRHHVLHDQEV
...: . : . .::: :: .:.:::: .:..:::::::: :::::.:: .. ::.
CCDS70 THVQSRMEKMMDGIKLDWATAEALALGSLLAQGFNVRLSGQDVGRGTFSQRHAIVVCQET
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: : .:.::. :.: . : :: ::: .::::: :... ::. : ::::::::: : :
CCDS70 DD-TYIPLNHMDPNQKGFLEVSNSPLSEEAVLGFEYGMSIESPKLLPLWEAQFGDFFNGA
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CCDS70 QIIFDTFISGGEAKWLLQSGIVILLPHGYDGAGPDHSSCRIERFLQMCDSAEEGVDGDT-
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CCDS70 ---------VNMFVVHPTTPAQYFHLLRRQMVRNFRKPLIVASPKMLLRLPAAVSTLQEM
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pF1KSD VSGTSFQRVIPEDGAAARAPEQVQRLIFCTGKVYYDLVKERSSQDLEEK-VAITRLEQIS
. ::.:. :: : .. :..:. :.::.:: .:.:::.: : ... :: :.:..
CCDS70 APGTTFNPVI---GDSSVDPKKVKTLVFCSGKHFYSLVKQRESLGAKKHDFAIIRVEELC
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pF1KSD PFPFDLIKQEAEKYPGA-ELAWCQEEHKNMGYYDYISPRFMTILRRARPIWYVGRDPAAA
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CCDS70 PFPLDSLQQEMSKYKHVKDHIWSQEEPQNMGPWSFVSPRFEKQL--ACKLRLVGRPPLPV
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::.: ..:: . . .: .:
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