seq1 = pF1KSDA1276.tfa, 3180 bp seq2 = pF1KSDA1276/gi568815594r_17532535.tfa (gi568815594r:17532535_17881299), 348765 bp >pF1KSDA1276 3180 >gi568815594r:17532535_17881299 (Chr4) (complement) 1-141 (100001-100141) 100% -> 142-894 (171656-172408) 99% -> 895-1030 (173516-173651) 99% -> 1031-1170 (175409-175548) 100% -> 1171-1377 (176094-176300) 100% -> 1378-1488 (187888-187998) 99% -> 1489-1596 (192769-192876) 100% -> 1597-1694 (216641-216738) 100% -> 1695-1824 (221213-221342) 100% -> 1825-2037 (222738-222950) 99% -> 2038-2191 (228317-228470) 100% -> 2192-2346 (233509-233663) 100% -> 2347-2519 (239072-239244) 99% -> 2520-2666 (241904-242050) 100% -> 2667-2784 (244655-244772) 100% -> 2785-2889 (246187-246291) 100% -> 2890-3089 (247412-247611) 100% -> 3090-3180 (248675-248765) 98% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGCTTCTGCTCTCAACAGCAAAATTAACCCGCCCGGCACTTGCCAGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGGCTTCTGCTCTCAACAGCAAAATTAACCCGCCCGGCACTTGCCAGGG 50 . : . : . : . : . : 51 CTCCAAAGCCGACGGTGGCGCCGGCTGGAGAATGGACTGTGATCCCCAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 CTCCAAAGCCGACGGTGGCGCCGGCTGGAGAATGGACTGTGATCCCCAGA 100 . : . : . : . : . : 101 TGCACGTGAAAATGTGCAAGAAGATCGCCCAGCTCACCAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>> 100101 TGCACGTGAAAATGTGCAAGAAGATCGCCCAGCTCACCAAGGTA...CAG 150 . : . : . : . : . : 142 GTGATTTATGCCCTGAACACCCGCCAGGATGAGGCTGAGGCCAGCATGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 171656 GTGATTTATGCCCTGAACACCCGCCAGGATGAGGCTGAGGCCAGCATGGA 200 . : . : . : . : . : 192 GGCGCTGCGGGAAGCGCACCAGGAGGAGCTCCAGAATGCGGTGGCAGAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 171706 GGCGCTGCGGGAAGCGCACCAGGAGGAGCTCCAGAATGCGGTGGCAGAGA 250 . : . : . : . : . : 242 CCAAGGCCAGGCTCCTGCAGGAACAGGGCTGCGCAGAGGAGGAAGCCCTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 171756 CCAAGGCCAGGCTCCTGCAGGAACAGGGCTGCGCAGAGGAGGAAGCCCTT 300 . : . : . : . : . : 292 CTACAGCGCATCCAGGCCCTGGAGAGCGCCCTGGAGCTGCAGAAGAGGCT ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| 171806 CTACAGCGCATCCAGGCCCTGGAGAGCGCCCTGGAGCTGCAAAAGAGGCT 350 . : . : . : . : . : 342 GACGGAGGAGGCGCTGGCTGAGTCGGCCTCGTGCAGGCTGGAGACGAAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 171856 GACGGAGGAGGCGCTGGCTGAGTCGGCCTCGTGCAGGCTGGAGACGAAGG 400 . : . : . : . : . : 392 AGAGAGAGCTGAGGGTGGAGGCAGAGCACGCCGAGCGAGTCCTCACGCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 171906 AGAGAGAGCTGAGGGTGGAGGCAGAGCACGCCGAGCGAGTCCTCACGCTC 450 . : . : . : . : . : 442 TCCAGGGAAATGCTGGAGCTCAAGGCTGACTACGAGAGGAGGCTCCAGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 171956 TCCAGGGAAATGCTGGAGCTCAAGGCTGACTACGAGAGGAGGCTCCAGCA 500 . : . : . : . : . : 492 CCTGACGAGCCACGAGGCTACCCCGCAGGGCCGGCTGCCCCAGGAGAGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 172006 CCTGACGAGCCACGAGGCTACCCCGCAGGGCCGGCTGCCCCAGGAGAGCC 550 . : . : . : . : . : 542 CTGAAACCAAGTCGGAGCCAGGCCAGGGCCCGGAGATGCAGGAGGTCCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 172056 CTGAAACCAAGTCGGAGCCAGGCCAGGGCCCGGAGATGCAGGAGGTCCTG 600 . : . : . : . : . : 592 CTAGAGGTGCAGCGGCTGCGAGTGGAGAACCAGCAGCTGAGCAAGGACTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 172106 CTAGAGGTGCAGCGGCTGCGAGTGGAGAACCAGCAGCTGAGCAAGGACTA 650 . : . : . : . : . : 642 CGCCCGCAAGGCCGAGGAGCTGCAGGCCACCTACGAGAGGGAAAACGAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 172156 CGCCCGCAAGGCCGAGGAGCTGCAGGCCACCTACGAGAGGGAAAACGAGG 700 . : . : . : . : . : 692 CCATCCGGCAGGCCATGCAGCAGTCGGTGAGCCAGGCCCTGTGGCAGTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 172206 CCATCCGGCAGGCCATGCAGCAGTCGGTGAGCCAGGCCCTGTGGCAGTGG 750 . : . : . : . : . : 742 CAGGAGAAGGAGTCGGACCTCCGCAAGAACTTCCAGGTCCAGGAGTCAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 172256 CAGGAGAAGGAGTCGGACCTCCGCAAGAACTTCCAGGTCCAGGAGTCAGC 800 . : . : . : . : . : 792 CCTGCAGGCTCAGGTCCGGAAGCTGGAAGGAGACCTGGAGCACAGAGGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 172306 CCTGCAGGCTCAGGTCCGGAAGCTGGAAGGAGACCTGGAGCACAGAGGCC 850 . : . : . : . : . : 842 GCAAGATAAGTGACCTGAAGAAGTACGCCCAGAAGCTGAAGGAGAGGATT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 172356 GCAAGATAAGTGACCTGAAGAAGTACGCCCAGAAGCTGAAGGAGAGGATT 900 . : . : . : . : . : 892 CAG CACCTGGATGTGCAGCTTAAGGAGGCTCGACAGGAGAA |||>>>...>>> ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 172406 CAGGTA...TAGGACCTGGATGTGCAGCTTAAGGAGGCTCGACAGGAGAA 950 . : . : . : . : . : 933 TTCAGAGTTGAAAGGCACTGCAAAAAAACTTGGGGAGAAGCTGGCTGTTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 173554 TTCAGAGTTGAAAGGCACTGCAAAAAAACTTGGGGAGAAGCTGGCTGTTG 1000 . : . : . : . : . : 983 CCAAAGACAGAATGATGCTGCAGGAGTGTCGTGGGACACAGCAGACAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>> 173604 CCAAAGACAGAATGATGCTGCAGGAGTGTCGTGGGACACAGCAGACAGGT 1050 . : . : . : . : . : 1031 ATGCCATGAAGACTGAGTTAGTTTCAGAGAACAAAGTCCTGCG >...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 173654 G...CAGATGCCATGAAGACTGAGTTAGTTTCAGAGAACAAAGTCCTGCG 1100 . : . : . : . : . : 1074 GGAAGAGAATGACTTGGAAGCCGGCAATCTTCATCCTCAGCAGGATCAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 175452 GGAAGAGAATGACTTGGAAGCCGGCAATCTTCATCCTCAGCAGGATCAAA 1150 . : . : . : . : . : 1124 GCTGTCTCAAGGAGTGCCCTTGCATGAAAGGAGGCACAGATATGCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>> 175502 GCTGTCTCAAGGAGTGCCCTTGCATGAAAGGAGGCACAGATATGCAGGTA 1200 . : . : . : . : . : 1171 ACCAAGAAAGAGGCAAGTGCTGAGACAGAATATATGAAGCAACA ...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 175552 ...TAGACCAAGAAAGAGGCAAGTGCTGAGACAGAATATATGAAGCAACA 1250 . : . : . : . : . : 1215 ATATGAAGAAGACCTTCGTAAAATCAAACATCAGACAGAAGAGGAGAAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 176138 ATATGAAGAAGACCTTCGTAAAATCAAACATCAGACAGAAGAGGAGAAGA 1300 . : . : . : . : . : 1265 AACATCTCAAAGACCAGCTAGTGAAGCGACTAGAAGACTTGGTAAAGAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 176188 AACATCTCAAAGACCAGCTAGTGAAGCGACTAGAAGACTTGGTAAAGAAG 1350 . : . : . : . : . : 1315 CACACCGTGGAAATCAAATCCGTTCGCTCGTCCGTGGAGGCTGAAAGAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 176238 CACACCGTGGAAATCAAATCCGTTCGCTCGTCCGTGGAGGCTGAAAGAAA 1400 . : . : . : . : . : 1365 GAAACTGCAGAGG GAAGTAGAAGCACAGTTGGAGGAAGTGA |||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||| 176288 GAAACTGCAGAGGGTG...TAGGAAGTAGAAGCACAGTTGGAGGAAGTGA 1450 . : . : . : . : . : 1406 GGAAGAAATCAGAAAAGGAGATAAAGCAGCTGGAAGAAGAGAAAGCAGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 187916 GGAAGAAATCAGAAAAGGAGATAAAGCAGCTGGAAGAAGAGAAAGCAGCC 1500 . : . : . : . : . : 1456 CTCAATGTGAAGCTCCAGAATTCTCTGCTTGAG GTTTTAAG |||||||||||||| ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||| 187966 CTCAATGTGAAGCTTCAGAATTCTCTGCTTGAGGTG...TAGGTTTTAAG 1550 . : . : . : . : . : 1497 GCTGGAAGAATTTATCCAACAAAATAAGACACGCCCCACAGGAGCTGAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 192777 GCTGGAAGAATTTATCCAACAAAATAAGACACGCCCCACAGGAGCTGAGG 1600 . : . : . : . : . : 1547 AAAGTCCCCAGGAATTAGGCCGCCAGCACTGCAGCATTCTGGAGACCCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 192827 AAAGTCCCCAGGAATTAGGCCGCCAGCACTGCAGCATTCTGGAGACCCAG 1650 . : . : . : . : . : 1597 GATCCATGCTTGAAGCTGGATGAAACTTCGCCGAGAGGAGA >>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 192877 GTA...TAGGATCCATGCTTGAAGCTGGATGAAACTTCGCCGAGAGGAGA 1700 . : . : . : . : . : 1638 GGAGTATCAAGATAAGTTAGCAGCTGAAGAAGGAACCAGCAGTGATGAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 216682 GGAGTATCAAGATAAGTTAGCAGCTGAAGAAGGAACCAGCAGTGATGAAG 1750 . : . : . : . : . : 1688 AAGAAAG GACCAAAGTGCTTCTCAAGGAGGGAAGTGACCCA |||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||| 216732 AAGAAAGGTA...AAGGACCAAAGTGCTTCTCAAGGAGGGAAGTGACCCA 1800 . : . : . : . : . : 1729 CAACCTCCACTGGGCTCTTTGTTGAAGGAGAAAACATCCAAAATCCAGCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 221247 CAACCTCCACTGGGCTCTTTGTTGAAGGAGAAAACATCCAAAATCCAGCG 1850 . : . : . : . : . : 1779 TCTAGAGGAGGACTGGCAAAGCCAGAAGGCCAAATTGCAAGCCCAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>. 221297 TCTAGAGGAGGACTGGCAAAGCCAGAAGGCCAAATTGCAAGCCCAGGTA. 1900 . : . : . : . : . : 1825 GTCTCACAGATGCAGCAGGCTCTGGAGCAGTGCACCAGCAACTAC ..>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 221347 ..CAGGTCTCACAGATGCAGCAGGCTCTGGAGCAGTGCACCAGCAACTAC 1950 . : . : . : . : . : 1870 AGGGAGGACCTGCAGGCACTCAAGCAGCTCTCGGACCTGGAGAGGGAGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 222783 AGGGAGGACCTGCAGGCACTCAAGCAGCTCTCGGACCTGGAGAGGGAGAA 2000 . : . : . : . : . : 1920 GCTGCAGCATGAGCTCCAGGAGACCACTCAGCAGAACCACGCCATGAAAG |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 222833 GCTGCAGCGTGAGCTCCAGGAGACCACTCAGCAGAACCACGCCATGAAAG 2050 . : . : . : . : . : 1970 CCCAGCTCGAGGCTTCCCACCAGAGAGCCCTGCGCATGCTGGAGAAGGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 222883 CCCAGCTCGAGGCTTCCCACCAGAGAGCCCTGCGCATGCTGGAGAAGGCC 2100 . : . : . : . : . : 2020 AGACATCAGGAACTCAAG GCCACAGAGGAACGCTTGAAGAA ||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||| 222933 AGACATCAGGAACTCAAGGTG...CAGGCCACAGAGGAACGCTTGAAGAA 2150 . : . : . : . : . : 2061 GGAATCCAGCCACAGCCTCCAGATCCAACACCAGACACACCGACTGGAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 228340 GGAATCCAGCCACAGCCTCCAGATCCAACACCAGACACACCGACTGGAGC 2200 . : . : . : . : . : 2111 TCCAGGCCTTGGAGGAAAAGGCCAGGCAAGAGCTGCAGGAGGAGCGTGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 228390 TCCAGGCCTTGGAGGAAAAGGCCAGGCAAGAGCTGCAGGAGGAGCGTGAG 2250 . : . : . : . : . : 2161 AGGATGCAGGCACAGCAGGCCCTGCTGCTAG AGTCGCTCAG |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||| 228440 AGGATGCAGGCACAGCAGGCCCTGCTGCTAGGTA...CAGAGTCGCTCAG 2300 . : . : . : . : . : 2202 ACAGGAGCTGTCGGAGCAGCAAGCTGCCTGTTCTGGGCACCAGAAGGACT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 233519 ACAGGAGCTGTCGGAGCAGCAAGCTGCCTGTTCTGGGCACCAGAAGGACT 2350 . : . : . : . : . : 2252 TGGAGGCACTGCAGGCCGAGCTGAGGGCTCTGGGCAGACAGCAAGCCAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 233569 TGGAGGCACTGCAGGCCGAGCTGAGGGCTCTGGGCAGACAGCAAGCCAGC 2400 . : . : . : . : . : 2302 AGCCAGTGTCCAGGAGACAGCAAGGATCACATAATCGCCACAGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.. 233619 AGCCAGTGTCCAGGAGACAGCAAGGATCACATAATCGCCACAGAGGTC.. 2450 . : . : . : . : . : 2347 GAGTGGGGCGGCCCGGGCCAGGCCGGCTCCCCACCGGGCGCTGCTG .>>>||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 233669 .CAGGAGCGGGGCGGCCCGGGCCAGGCCGGCTCCCCACCGGGCGCTGCTG 2500 . : . : . : . : . : 2393 GGCAGGGTTCCGGCGAGGGATGCGGGCTCTGGGAGGAGAACGCGCAGCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 239118 GGCAGGGTTCCGGCGAGGGATGCGGGCTCTGGGAGGAGAACGCGCAGCTC 2550 . : . : . : . : . : 2443 CAGGACGCGGTGCGGCGGCTGCGCGCGGAGGTGGAGCAGCATCAGCAGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 239168 CAGGACGCGGTGCGGCGGCTGCGCGCGGAGGTGGAGCAGCATCAGCAGGA 2600 . : . : . : . : . : 2493 GGCGCAGAAGCTCCGAGACCAGCGCAG GTTCCTGGAGGAGA |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||| 239218 GGCGCAGAAGCTCCGAGACCAGCGCAGGTG...CAGGTTCCTGGAGGAGA 2650 . : . : . : . : . : 2534 CTCAGCAAGCCCAGCGGGCCAGGGAGGTGGAGACACTGCGCCAGGAACAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 241918 CTCAGCAAGCCCAGCGGGCCAGGGAGGTGGAGACACTGCGCCAGGAACAC 2700 . : . : . : . : . : 2584 CGGAAGGAGATGCAGGCCATGGTGGCAGATTTCAGTAGTGCCCAGGCCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 241968 CGGAAGGAGATGCAGGCCATGGTGGCAGATTTCAGTAGTGCCCAGGCCCA 2750 . : . : . : . : . : 2634 GCTCCAGGCCCGGCTGGCTGCCCTGGAAGCCGA ACTGAAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||| 242018 GCTCCAGGCCCGGCTGGCTGCCCTGGAAGCCGAGTA...CAGACTGAAAG 2800 . : . : . : . : . : 2675 ATTCCGGAGAGAAGCCAGGGAAGGGAGCGTCCAGGCCCGAGGACCTTCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 244663 ATTCCGGAGAGAAGCCAGGGAAGGGAGCGTCCAGGCCCGAGGACCTTCAG 2850 . : . : . : . : . : 2725 CTCATTGGCCGCCTGCAGACCCGCCTGAAGGAGAGAGAGGACATCATCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 244713 CTCATTGGCCGCCTGCAGACCCGCCTGAAGGAGAGAGAGGACATCATCAA 2900 . : . : . : . : . : 2775 GCAGCTCACG GAAGAGAGAAGATTTCACTACGCAGCATTCC ||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||| 244763 GCAGCTCACGGTG...TAGGAAGAGAGAAGATTTCACTACGCAGCATTCC 2950 . : . : . : . : . : 2816 CCAGTGCCATGTCCCACCGGAATCGGTCTTTCTCTTTCAATCCTCACCCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 246218 CCAGTGCCATGTCCCACCGGAATCGGTCTTTCTCTTTCAATCCTCACCCG 3000 . : . : . : . : . : 2866 GGATATTTGACCCCTTCCATGAAG AAAAAGAAGGTGGAGGA ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||| 246268 GGATATTTGACCCCTTCCATGAAGGTA...CAGAAAAAGAAGGTGGAGGA 3050 . : . : . : . : . : 2907 CGTGCCCAGCCGCGTGGTCAGCGTGCCGAACCTCGCCTCCTATGCAAAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 247429 CGTGCCCAGCCGCGTGGTCAGCGTGCCGAACCTCGCCTCCTATGCAAAGA 3100 . : . : . : . : . : 2957 ACTTTCTGAGTGGCGATCTGAGTTCCAGGATTAATGCCCCTCCAATAACT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 247479 ACTTTCTGAGTGGCGATCTGAGTTCCAGGATTAATGCCCCTCCAATAACT 3150 . : . : . : . : . : 3007 ACATCACCCAGCTTGGACCCAAGCCCCAGCTGTGGCCGGACCTACAAACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 247529 ACATCACCCAGCTTGGACCCAAGCCCCAGCTGTGGCCGGACCTACAAACC 3200 . : . : . : . : . : 3057 CAACCAGTCTACAGATGCAAAAACTGCCACAAG GACCCCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||| 247579 CAACCAGTCTACAGATGCAAAAACTGCCACAAGGTT...TAGGACCCCAG 3250 . : . : . : . : . : 3098 ATGGTGAAACGGCCCAAGCCAAAGAAGCCCAGCAGAAACAGGGCTCTCCG ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| 248683 ATGGTGAAACGGCCCAAGCCAAAGAAGTCCAGCAGAAACAGGGCTCTCCG 3300 . : . : . : 3148 CACCAGGAATGGTTCACCAAGTACTTTTCTTTC ||||||||||||||||||||||||||||||||| 248733 CACCAGGAATGGTTCACCAAGTACTTTTCTTTC