Result of SIM4 for pF1KSDA1218

seq1 = pF1KSDA1218.tfa, 2499 bp
seq2 = pF1KSDA1218/gi568815591r_105510529.tfa (gi568815591r:105510529_105976474), 465946 bp

>pF1KSDA1218 2499
>gi568815591r:105510529_105976474 (Chr7)

(complement)

1-97  (100001-100097)   100% ->
98-166  (100595-100663)   100% ==
271-494  (311186-311409)   100% ->
495-778  (333354-333637)   100% ->
779-861  (336906-336988)   100% ->
862-1118  (337866-338122)   100% ->
1119-1311  (352208-352400)   100% ->
1312-1433  (356154-356275)   100% ->
1434-2388  (361659-362613)   100% ->
2389-2463  (365872-365946)   100% ->
2464-2499  (368585-368620)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGACACTGGATCGCAAAGTGCCCAGTCCGGAGGCGTTTCTGGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGACACTGGATCGCAAAGTGCCCAGTCCGGAGGCGTTTCTGGGCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACCCTGGTCCTCCTGGATCGACGCCGCCAAATTACACTGCTCCGACA   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100051 ACCCTGGTCCTCCTGGATCGACGCCGCCAAATTACACTGCTCCGACAGTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     98       ATGTAGATTTAGAAGAGGCTGGAAAAGAGGGTGGAAAAAGCAGG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ...CAGATGTAGATTTAGAAGAGGCTGGAAAAGAGGGTGGAAAAAGCAGG

    150     .    :    .    :    .
    142 GAGGTTATGAGGCTTAATAAAGAAG
        |||||||||||||||||||||||||
 100639 GAGGTTATGAGGCTTAATAAAGAAG

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    271 GAGAGAAGACACGGTTCAATGTGTAGACCTTCTCCCTCTCCAGTGTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 311186 GAGAGAAGACACGGTTCAATGTGTAGACCTTCTCCCTCTCCAGTGTCTCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    321 AGCCTCCAATCCCAGGACATCACTAGTACAGGTGAAAACAAAAGCCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 311236 AGCCTCCAATCCCAGGACATCACTAGTACAGGTGAAAACAAAAGCCTGTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    371 TCAGCGGCCATCACTCTGCCAGCAGCACCTCAAAGCCATTCAAAACGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 311286 TCAGCGGCCATCACTCTGCCAGCAGCACCTCAAAGCCATTCAAAACGCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    421 AAAGACAATCTACTTACCTCCAGCAGCAAACAGCACACAGTCTTTCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 311336 AAAGACAATCTACTTACCTCCAGCAGCAAACAGCACACAGTCTTTCCTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    471 GAAAGGATCAAGGGATAAACCATG         TGTTCCAGTTCCTGTAG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 311386 GAAAGGATCAAGGGATAAACCATGGTG...CAGTGTTCCAGTTCCTGTAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    512 TCAGTTTAGAGAAAATTCCTAACCTAGTGAAGGCAGATGGTGCCAATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 333371 TCAGTTTAGAGAAAATTCCTAACCTAGTGAAGGCAGATGGTGCCAATGTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    562 AAAATGAACTCCACAACCACTACTGCAGTTTCTGCCTCCTCCACCTCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 333421 AAAATGAACTCCACAACCACTACTGCAGTTTCTGCCTCCTCCACCTCGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    612 CTCTGCCGTCTCCACCCCTCCTTTAATTAAGCCTGTCCTGATGTCCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 333471 CTCTGCCGTCTCCACCCCTCCTTTAATTAAGCCTGTCCTGATGTCCAAGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    662 CAGTGCCACCTTCACCAGAGAAGATCTTAAATGGCAAAGGAATTCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 333521 CAGTGCCACCTTCACCAGAGAAGATCTTAAATGGCAAAGGAATTCTGCCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    712 ACCACCATAGACAAGAAACACCAAAATGGCACCAAAAACAGCAACAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 333571 ACCACCATAGACAAGAAACACCAAAATGGCACCAAAAACAGCAACAAGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    762 TTACAGGAGACTTTCAG         AGAGAGAATTTGACCCAAATAAAC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 333621 TTACAGGAGACTTTCAGGTA...CAGAGAGAGAATTTGACCCAAATAAAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    803 ACTGTGGAGTATTGGATCCCGAGACAAAGAAACCTTGCACAAGATCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 336930 ACTGTGGAGTATTGGATCCCGAGACAAAGAAACCTTGCACAAGATCCCTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    853 ACCTGCAAG         ACACATTCGCTAAGCCATCGGAGGGCAGTCCC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 336980 ACCTGCAAGGTA...TAGACACATTCGCTAAGCCATCGGAGGGCAGTCCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    894 AGGCCGGAAAAAGCAATTTGACCTCCTCCTGGCAGAACACAAAGCAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 337898 AGGCCGGAAAAAGCAATTTGACCTCCTCCTGGCAGAACACAAAGCAAAGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    944 CCCGGGAAAAAGAAGTTAAAGATAAAGAGCATCTCCTGACTTCCACGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 337948 CCCGGGAAAAAGAAGTTAAAGATAAAGAGCATCTCCTGACTTCCACGAGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    994 GAAATACTTCCAAGCCAATCCGGGCCGGCACAGGATTCTCTGCTAGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 337998 GAAATACTTCCAAGCCAATCCGGGCCGGCACAGGATTCTCTGCTAGGGTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1044 TTCAGGGAGCTCTGGGCCAGAACCAAAAGTTGCATCCCCTGCAAAATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 338048 TTCAGGGAGCTCTGGGCCAGAACCAAAAGTTGCATCCCCTGCAAAATCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1094 GACCACCCAACTCTGTACTTCCTAG         ACCATCATCTGCAAAT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 338098 GACCACCCAACTCTGTACTTCCTAGGTA...TAGACCATCATCTGCAAAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1135 AGCATAAGCAGCAGCACATCTTCAAATCATAGCGGCCACACTCCAGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 352224 AGCATAAGCAGCAGCACATCTTCAAATCATAGCGGCCACACTCCAGAGCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1185 CCCACTCCCACCGGTTGGAGGTGACCTCGCCAGCCGACTGTCCAGTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 352274 CCCACTCCCACCGGTTGGAGGTGACCTCGCCAGCCGACTGTCCAGTGATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1235 AAGGGGAGATGGACGGAGCCGACGAATCCGAGAAGCTAGACTGTCAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 352324 AAGGGGAGATGGACGGAGCCGACGAATCCGAGAAGCTAGACTGTCAGTTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1285 TCCACGCACCACCCCAGACCTCTGGCG         TTTTGCTCATTTGG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 352374 TCCACGCACCACCCCAGACCTCTGGCGGTA...CAGTTTTGCTCATTTGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1326 GAGTCGCCTCATGGGACGAGGGTACTATGTGTTTGATAGAAGATGGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 356168 GAGTCGCCTCATGGGACGAGGGTACTATGTGTTTGATAGAAGATGGGATC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1376 GTTTTCGATTCGCACTAAACTCCATGGTAGAAAAACACCTGAATTCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 356218 GTTTTCGATTCGCACTAAACTCCATGGTAGAAAAACACCTGAATTCACAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1426 ATGTGGAA         GAAGATCCCTCCTGCGGCAGATAGCCCCCTGCC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 356268 ATGTGGAAGTA...TAGGAAGATCCCTCCTGCGGCAGATAGCCCCCTGCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1467 CTCGCCAGCAGCCCACATCACCACCCCCGTTCCAGCATCCGTTTTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 361692 CTCGCCAGCAGCCCACATCACCACCCCCGTTCCAGCATCCGTTTTGCAGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1517 CTTTCAGCAACCCCAGTGCTGTGTATCTTCCTTCAGCTCCCATCAGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 361742 CTTTCAGCAACCCCAGTGCTGTGTATCTTCCTTCAGCTCCCATCAGCTCG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1567 AGGCTCACCTCTTCTTACATAATGACATCAGCCATGCTCTCAAACGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 361792 AGGCTCACCTCTTCTTACATAATGACATCAGCCATGCTCTCAAACGCAGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1617 TTTCGTGACATCGCCGGACCCGAGCGCCCTCATGTCCCACACCACAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 361842 TTTCGTGACATCGCCGGACCCGAGCGCCCTCATGTCCCACACCACAGCTT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1667 TCCCTCATGTGGCCGCAACCCTCAGCATCATGGACTCAACCTTCAAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 361892 TCCCTCATGTGGCCGCAACCCTCAGCATCATGGACTCAACCTTCAAGGCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1717 CCATCCGCCGTGTCCCCGATACCAGCCGTCATCCCTTCCCCATCCCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 361942 CCATCCGCCGTGTCCCCGATACCAGCCGTCATCCCTTCCCCATCCCACAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1767 GCCATCCAAAACCAAAACCAGCAAATCCTCAAAAGTCAAAGACCTGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 361992 GCCATCCAAAACCAAAACCAGCAAATCCTCAAAAGTCAAAGACCTGTCCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1817 CCCGTAGCGACGAGTCTCCAAGTAACAAAAAAAGGAAGCCACAGTCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 362042 CCCGTAGCGACGAGTCTCCAAGTAACAAAAAAAGGAAGCCACAGTCTTCG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1867 ACTTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTTGCAGACATCCCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 362092 ACTTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTTGCAGACATCCCTCTC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1917 GTCTCCACTGTCAGGGCCTCACAAAAAGAACTGTGTTTTGAATGCCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 362142 GTCTCCACTGTCAGGGCCTCACAAAAAGAACTGTGTTTTGAATGCCAGTT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1967 CTGCTTTGAACTCCTATCAGGCGGCCCCTCCCTATAACAGCCTGTCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 362192 CTGCTTTGAACTCCTATCAGGCGGCCCCTCCCTATAACAGCCTGTCTGTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2017 CACAACTCAAACAATGGGGTGAGCCCACTCAGTGCCAAACTGGAGCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 362242 CACAACTCAAACAATGGGGTGAGCCCACTCAGTGCCAAACTGGAGCCCTC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2067 AGGACGGACCTCGCTGCCCGGCGGCCCCGCGGACATAGTGAGACAGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 362292 AGGACGGACCTCGCTGCCCGGCGGCCCCGCGGACATAGTGAGACAGGTGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2117 GCGCGGTGGGAGGCAGCAGTGACTCCTGTCCCCTCTCTGTGCCCTCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 362342 GCGCGGTGGGAGGCAGCAGTGACTCCTGTCCCCTCTCTGTGCCCTCCCTT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2167 GCGCTCCACGCAGGGGACCTCTCTCTGGCCTCACACAATGCTGTGTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 362392 GCGCTCCACGCAGGGGACCTCTCTCTGGCCTCACACAATGCTGTGTCTTC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2217 TCTGCCCCTCTCTTTTGACAAATCAGAAGGAAAAAAGCGTAAGAACTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 362442 TCTGCCCCTCTCTTTTGACAAATCAGAAGGAAAAAAGCGTAAGAACTCGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2267 GTTCTAGTAGCAAAGCCTGTAAAATCACTAAAATGCCTGGTATGAATAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 362492 GTTCTAGTAGCAAAGCCTGTAAAATCACTAAAATGCCTGGTATGAATAGC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2317 GTTCACAAAAAGAACCCGCCCAGCCTTCTCGCACCGGTGCCCGATCCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 362542 GTTCACAAAAAGAACCCGCCCAGCCTTCTCGCACCGGTGCCCGATCCCGT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2367 TAACAGCACCTCCTCTCGGCAG         GTTGGGAAAAATAGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 362592 TAACAGCACCTCCTCTCGGCAGGTA...CAGGTTGGGAAAAATAGCAGCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2408 TAGCTTTGTCACAATCCAGTCCTTCAAGTATATCCAGCCCAGGACACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 365891 TAGCTTTGTCACAATCCAGTCCTTCAAGTATATCCAGCCCAGGACACAGC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2458 CGACAG         AACACAAACAGAACGGGCAGGATAAGGACTCTTCC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 365941 CGACAGGTA...AAGAACACAAACAGAACGGGCAGGATAAGGACTCTTCC

   2300 
   2499 A
        |
 368620 A

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