Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA1214
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA1214, 396 aa
  1>>>pF1KSDA1214 396 - 396 aa - 396 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3080+/-0.000848; mu= 12.3075+/- 0.051
 mean_var=96.8995+/-19.370, 0's: 0 Z-trim(109.0): 92  B-trim: 0 in 0/49
 Lambda= 0.130291
 statistics sampled from 10503 (10605) to 10503 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.694), E-opt: 0.2 (0.326), width:  16
 Scan time:  3.030

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS34065.1 RNF150 gene_id:57484|Hs108|chr4        ( 438) 1363 266.5 3.3e-71
CCDS4451.1 RNF130 gene_id:55819|Hs108|chr5         ( 419)  591 121.4 1.5e-27
CCDS64340.1 RNF130 gene_id:55819|Hs108|chr5        ( 384)  588 120.8 2.1e-27
CCDS14520.1 RNF128 gene_id:79589|Hs108|chrX        ( 402)  451 95.1 1.2e-19
CCDS14521.1 RNF128 gene_id:79589|Hs108|chrX        ( 428)  451 95.1 1.3e-19
CCDS2051.1 RNF149 gene_id:284996|Hs108|chr2        ( 400)  398 85.1 1.2e-16
CCDS47692.1 RNF148 gene_id:378925|Hs108|chr7       ( 305)  375 80.7   2e-15
CCDS5784.1 RNF133 gene_id:168433|Hs108|chr7        ( 376)  371 80.0 3.9e-15


>>CCDS34065.1 RNF150 gene_id:57484|Hs108|chr4             (438 aa)
 initn: 2654 init1: 1363 opt: 1363  Z-score: 1391.9  bits: 266.5 E(32554): 3.3e-71
Smith-Waterman score: 2505; 90.2% identity (90.2% similar) in 428 aa overlap (1-386:1-428)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAMSLIQACCSLALSTWLLSFCFVHLLCLDFTVAEKEEWYTAFVNITYAEPAPDPGAGAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MAMSLIQACCSLALSTWLLSFCFVHLLCLDFTVAEKEEWYTAFVNITYAEPAPDPGAGAA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD GGGGAELHTEKTECGRYGEHSPKQDARGEVVMASSAHDRLACDPNTKFAAPTRGKNWIAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GGGGAELHTEKTECGRYGEHSPKQDARGEVVMASSAHDRLACDPNTKFAAPTRGKNWIAL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD IPKGNCTYRDKIRNAFLQNASAVVIFNVGSNTNETITMPHAGVEDIVAIMIPEPKGKEIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IPKGNCTYRDKIRNAFLQNASAVVIFNVGSNTNETITMPHAGVEDIVAIMIPEPKGKEIV
              130       140       150       160       170       180

              190       200                                        
pF1KSD SLLERNITVTMYITIGTRNLQKY-------------------------------------
       :::::::::::::::::::::::                                     
CCDS34 SLLERNITVTMYITIGTRNLQKYVSRTSVVFVSISFIVLMIISLAWLVFYYIQRFRYANA
              190       200       210       220       230       240

                210       220       230       240       250        
pF1KSD -----RRLGDAAKKAISKLQIRTIKKGDKETESDFDNCAVCIEGYKPNDVVRILPCRHLF
            :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RDRNQRRLGDAAKKAISKLQIRTIKKGDKETESDFDNCAVCIEGYKPNDVVRILPCRHLF
              250       260       270       280       290       300

      260       270       280       290       300       310        
pF1KSD HKSCVDPWLLDHRTCPMCKMNILKALGIPPNADCMDDLPTDFEGSLGGPPTNQITGASDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HKSCVDPWLLDHRTCPMCKMNILKALGIPPNADCMDDLPTDFEGSLGGPPTNQITGASDT
              310       320       330       340       350       360

      320       330       340       350       360       370        
pF1KSD TVNESSVTLDPAVRTVGALQVVQDTDPIPQEGDVIFTTNSEQEPAVSSDSDISLIMAMEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TVNESSVTLDPAVRTVGALQVVQDTDPIPQEGDVIFTTNSEQEPAVSSDSDISLIMAMEV
              370       380       390       400       410       420

      380       390      
pF1KSD GLSDVELSTDQDCEEVKS
       ::::::::          
CCDS34 GLSDVELSTDQDCEEVKS
              430        

>>CCDS4451.1 RNF130 gene_id:55819|Hs108|chr5              (419 aa)
 initn: 980 init1: 545 opt: 591  Z-score: 607.9  bits: 121.4 E(32554): 1.5e-27
Smith-Waterman score: 955; 45.4% identity (64.9% similar) in 368 aa overlap (37-359:32-385)

         10        20        30        40        50        60      
pF1KSD QACCSLALSTWLLSFCFVHLLCLDFTVAEKEEWYTAFVNITYAEPAPDPGAGAAGGGGAE
                                     .:.:::..:.:  ::          : :: 
CCDS44 SCAGRAGPARLAALALLTCSLWPARADNASQEYYTALINVTVQEP----------GRGAP
              10        20        30        40                  50 

         70        80        90          100       110       120   
pF1KSD LHTEKTECGRYGEHSPKQDARGEVVMASSAH---DRLACDPNTKFAAPTRGKNWIALIPK
       : : . . ::::  ::: ..::.:.     :   :.:.:::.:.: .:   :.::::. .
CCDS44 L-TFRIDRGRYGLDSPKAEVRGQVLAPLPLHGVADHLGCDPQTRFFVPPNIKQWIALLQR
               60        70        80        90       100       110

           130       140       150       160       170       180   
pF1KSD GNCTYRDKIRNAFLQNASAVVIFNVGSNTNETITMPHAGVEDIVAIMIPEPKGKEIVSLL
       ::::...::  : ..:: ::::.:  :. .: .:: : :. ::.:.:: : .::.:.: :
CCDS44 GNCTFKEKISRAAFHNAVAVVIYNNKSK-EEPVTMTHPGTGDIIAVMITELRGKDILSYL
              120       130        140       150       160         

           190                                       200           
pF1KSD ERNITVTMYITIGTRN--------------------------------LQKYR-------
       :.::.: : :..:::                                 .:: :       
CCDS44 EKNISVQMTIAVGTRMPPKNFSRGSLVFVSISFIVLMIISSAWLIFYFIQKIRYTNARDR
     170       180       190       200       210       220         

             210       220       230       240       250       260 
pF1KSD ---RLGDAAKKAISKLQIRTIKKGDKETESDFDNCAVCIEGYKPNDVVRILPCRHLFHKS
          :::::::::::::  ::.:::::::. :::.::::::.:: :::::::::.:.::::
CCDS44 NQRRLGDAAKKAISKLTTRTVKKGDKETDPDFDHCAVCIESYKQNDVVRILPCKHVFHKS
     230       240       250       260       270       280         

             270       280       290       300       310       320 
pF1KSD CVDPWLLDHRTCPMCKMNILKALGIPPNADCMDDLPTDFEGSLGGPPTNQITGASDTTVN
       :::::: .: ::::::.:::::::: ::  : :..  :.:       .:. .. .: . .
CCDS44 CVDPWLSEHCTCPMCKLNILKALGIVPNLPCTDNVAFDMERLTRTQAVNRRSALGDLA-G
     290       300       310       320       330       340         

             330       340       350       360       370       380 
pF1KSD ESSVTLDPAVRTVGALQVVQDTDPIPQEGDVIFTTNSEQEPAVSSDSDISLIMAMEVGLS
       ..:. :.: .:: :   . :: .  :. :.. .....:                      
CCDS44 DNSLGLEP-LRTSGISPLPQDGELTPRTGEINIAVTKEWFIIASFGLLSALTLCYMIIRA
      350        360       370       380       390       400       

             390      
pF1KSD DVELSTDQDCEEVKS
                      
CCDS44 TASLNANEVEWF   
       410            

>>CCDS64340.1 RNF130 gene_id:55819|Hs108|chr5             (384 aa)
 initn: 980 init1: 545 opt: 588  Z-score: 605.4  bits: 120.8 E(32554): 2.1e-27
Smith-Waterman score: 952; 45.7% identity (64.8% similar) in 361 aa overlap (37-352:32-378)

         10        20        30        40        50        60      
pF1KSD QACCSLALSTWLLSFCFVHLLCLDFTVAEKEEWYTAFVNITYAEPAPDPGAGAAGGGGAE
                                     .:.:::..:.:  ::          : :: 
CCDS64 SCAGRAGPARLAALALLTCSLWPARADNASQEYYTALINVTVQEP----------GRGAP
              10        20        30        40                  50 

         70        80        90          100       110       120   
pF1KSD LHTEKTECGRYGEHSPKQDARGEVVMASSAH---DRLACDPNTKFAAPTRGKNWIALIPK
       : : . . ::::  ::: ..::.:.     :   :.:.:::.:.: .:   :.::::. .
CCDS64 L-TFRIDRGRYGLDSPKAEVRGQVLAPLPLHGVADHLGCDPQTRFFVPPNIKQWIALLQR
               60        70        80        90       100       110

           130       140       150       160       170       180   
pF1KSD GNCTYRDKIRNAFLQNASAVVIFNVGSNTNETITMPHAGVEDIVAIMIPEPKGKEIVSLL
       ::::...::  : ..:: ::::.: ... .: .:: : :. ::.:.:: : .::.:.: :
CCDS64 GNCTFKEKISRAAFHNAVAVVIYN-NKSKEEPVTMTHPGTGDIIAVMITELRGKDILSYL
              120       130        140       150       160         

           190                                       200           
pF1KSD ERNITVTMYITIGTRN--------------------------------LQKYR-------
       :.::.: : :..:::                                 .:: :       
CCDS64 EKNISVQMTIAVGTRMPPKNFSRGSLVFVSISFIVLMIISSAWLIFYFIQKIRYTNARDR
     170       180       190       200       210       220         

             210       220       230       240       250       260 
pF1KSD ---RLGDAAKKAISKLQIRTIKKGDKETESDFDNCAVCIEGYKPNDVVRILPCRHLFHKS
          :::::::::::::  ::.:::::::. :::.::::::.:: :::::::::.:.::::
CCDS64 NQRRLGDAAKKAISKLTTRTVKKGDKETDPDFDHCAVCIESYKQNDVVRILPCKHVFHKS
     230       240       250       260       270       280         

             270       280       290       300       310       320 
pF1KSD CVDPWLLDHRTCPMCKMNILKALGIPPNADCMDDLPTDFEGSLGGPPTNQITGASDTTVN
       :::::: .: ::::::.:::::::: ::  : :..  :.:       .:. .. .: . .
CCDS64 CVDPWLSEHCTCPMCKLNILKALGIVPNLPCTDNVAFDMERLTRTQAVNRRSALGDLA-G
     290       300       310       320       330       340         

             330       340       350       360       370       380 
pF1KSD ESSVTLDPAVRTVGALQVVQDTDPIPQEGDVIFTTNSEQEPAVSSDSDISLIMAMEVGLS
       ..:. :.: .:: :   . :: .  :. :..                             
CCDS64 DNSLGLEP-LRTSGISPLPQDGELTPRTGEINIAVTR                       
      350        360       370       380                           

             390      
pF1KSD DVELSTDQDCEEVKS

>>CCDS14520.1 RNF128 gene_id:79589|Hs108|chrX             (402 aa)
 initn: 750 init1: 429 opt: 451  Z-score: 466.0  bits: 95.1 E(32554): 1.2e-19
Smith-Waterman score: 715; 39.4% identity (58.5% similar) in 386 aa overlap (17-360:11-363)

               10        20         30        40        50         
pF1KSD MAMSLIQACCSLALSTWLLS-FCFVHLLCLDFTVAEKEEWYTAFVNITYAEPAPDPGAGA
                       :::  : :.  .  .:..       .:.:..:: . . .  :  
CCDS14       MNQENRSSFFWLLVIFTFLLKITASFSM-------SAYVTVTYYNETSNYTA--
                     10        20               30        40       

      60        70        80        90       100       110         
pF1KSD AGGGGAELHTEKTECGRYGEHSPKQDARGEVVMASSAHDRLACDPNTKFAAPTRGKNWIA
                 :  ::: ::  ::  .: : ::   . ..  ::: ::.:.     : :::
CCDS14 ---------IETCECGVYGLASPVANAMG-VVGIPKNNNYQACDHNTEFSNTK--KPWIA
                   50        60         70        80          90   

     120       130       140       150       160       170         
pF1KSD LIPKGNCTYRDKIRNAFLQNASAVVIFNVGSNTNETITMPHAGVEDIVAIMIPEPKGKEI
       :: .::::. .::..:  .::.::::.:.  . :.:: : . :. ::::::: . :: .:
CCDS14 LIERGNCTFSEKIQTAGRRNADAVVIYNAPETGNQTIQMANFGAVDIVAIMIGNLKGTKI
           100       110       120       130       140       150   

     180       190          200                                    
pF1KSD VSLLERNITVTMYITIGTRN---LQKY-------------------------RRLGDA--
       .. ..:.: ::: : .: ..   ...:                         ::: .:  
CCDS14 LQSIQRGIQVTMVIEVGKKHGPWVNHYSIFFVSVSFFIITAATVGYFIFYSARRLRNARA
           160       170       180       190       200       210   

                210       220       230       240       250        
pF1KSD -----------AKKAISKLQIRTIKKGDKETESDFDNCAVCIEGYKPNDVVRILPCRHLF
                  :::::..::.::.:.::::   : :.:::::: :::::.:::: : :.:
CCDS14 QSRKQRQLKADAKKAIGRLQLRTLKQGDKEIGPDGDSCAVCIELYKPNDLVRILTCNHIF
           220       230       240       250       260       270   

      260       270       280       290       300       310        
pF1KSD HKSCVDPWLLDHRTCPMCKMNILKALGIPPNADCMDDLPTDFEGSLGGPPTNQITGASDT
       ::.:::::::.:::::::: .:::::::  ...       :   ::  : .:.:......
CCDS14 HKTCVDPWLLEHRTCPMCKCDILKALGIEVDVE-------DGSVSLQVPVSNEISNSASS
           280       290       300              310       320      

      320       330       340       350       360       370        
pF1KSD TVNESSVTLDPAVRTVGALQVVQDTDPIPQEGDVIFTTNSEQEPAVSSDSDISLIMAMEV
         .: .   . :    ..   :: ::  : :  :  :..: :                  
CCDS14 --HEEDNRSETASSGYAS---VQGTDEPPLEEHVQSTNESLQLVNHEANSVAVDVIPHVD
          330       340          350       360       370       380 

      380       390         
pF1KSD GLSDVELSTDQDCEEVKS   
                            
CCDS14 NPTFEEDETPNQETAVREIKS
             390       400  

>>CCDS14521.1 RNF128 gene_id:79589|Hs108|chrX             (428 aa)
 initn: 744 init1: 429 opt: 451  Z-score: 465.6  bits: 95.1 E(32554): 1.3e-19
Smith-Waterman score: 695; 38.3% identity (59.4% similar) in 392 aa overlap (18-360:20-389)

                 10        20        30          40        50      
pF1KSD   MAMSLIQACCSLALSTWLLSFCFVHLLCLDFTVAEKEE--WYTAFVNITYAEPAPDPG
                          ::..::.  :  .   ..  :  : ::..:...  :     
CCDS14 MGPPPGAGVSCRGGCGFSRLLAWCFLLALSPQAPGSRGAEAVW-TAYLNVSWRVPHT---
               10        20        30        40         50         

         60        70        80        90       100       110      
pF1KSD AGAAGGGGAELHTEKTECGRYGEHSPKQDARGEVVMASSAHDRLACDPNTKFAAPTR-GK
             :  .   : .: : ::. :: . . : .:  ..     ::.:.:.:..::  :.
CCDS14 ------GVNRTVWELSEEGVYGQDSPLEPVAGVLVPPDGPGALNACNPHTNFTVPTVWGS
               60        70        80        90       100       110

             120        130       140       150       160       170
pF1KSD ----NWIALIPKGN-CTYRDKIRNAFLQNASAVVIFNVGSNTNETITMPHAGVEDIVAIM
           .:.::: .:. ::. :::. :. ..::..::::  .. ::.: : : :. ::::::
CCDS14 TVQVSWLALIQRGGGCTFADKIHLAYERGASGAVIFNFPGTRNEVIPMSHPGAVDIVAIM
              120       130       140       150       160       170

              180       190          200                           
pF1KSD IPEPKGKEIVSLLERNITVTMYITIGTRN---LQKY------------------------
       : . :: .:.. ..:.: ::: : .: ..   ...:                        
CCDS14 IGNLKGTKILQSIQRGIQVTMVIEVGKKHGPWVNHYSIFFVSVSFFIITAATVGYFIFYS
              180       190       200       210       220       230

                         210       220       230       240         
pF1KSD -RRLGDA-------------AKKAISKLQIRTIKKGDKETESDFDNCAVCIEGYKPNDVV
        ::: .:             :::::..::.::.:.::::   : :.:::::: :::::.:
CCDS14 ARRLRNARAQSRKQRQLKADAKKAIGRLQLRTLKQGDKEIGPDGDSCAVCIELYKPNDLV
              240       250       260       270       280       290

     250       260       270       280       290       300         
pF1KSD RILPCRHLFHKSCVDPWLLDHRTCPMCKMNILKALGIPPNADCMDDLPTDFEGSLGGPPT
       ::: : :.:::.:::::::.:::::::: .:::::::  ...       :   ::  : .
CCDS14 RILTCNHIFHKTCVDPWLLEHRTCPMCKCDILKALGIEVDVE-------DGSVSLQVPVS
              300       310       320       330              340   

     310       320       330       340       350       360         
pF1KSD NQITGASDTTVNESSVTLDPAVRTVGALQVVQDTDPIPQEGDVIFTTNSEQEPAVSSDSD
       :.:......  .: .   . :    ..   :: ::  : :  :  :..: :         
CCDS14 NEISNSASS--HEEDNRSETASSGYAS---VQGTDEPPLEEHVQSTNESLQLVNHEANSV
           350         360          370       380       390        

     370       380       390         
pF1KSD ISLIMAMEVGLSDVELSTDQDCEEVKS   
                                     
CCDS14 AVDVIPHVDNPTFEEDETPNQETAVREIKS
      400       410       420        

>>CCDS2051.1 RNF149 gene_id:284996|Hs108|chr2             (400 aa)
 initn: 763 init1: 382 opt: 398  Z-score: 412.2  bits: 85.1 E(32554): 1.2e-16
Smith-Waterman score: 711; 35.7% identity (61.5% similar) in 353 aa overlap (27-330:25-365)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAMSLIQACCSLALSTWLLSFCFVHLLCLDFTVAEKEEWYTAFVNITYAEPAPDPGAGAA
                                 ::.  . ..  ::..: ::: :..:  .  . ..
CCDS20   MAWRRREASVGARGVLALALLALALCVPGARGRALEWFSAVVNIEYVDPQTNLTVWSV
                 10        20        30        40        50        

               70        80        90        100       110         
pF1KSD GGGGAELHTEKTECGRYGEHSPKQDARGEV-VMASSAHDRLACDPNTKFAAPT---RGKN
                  .: ::.:. :::. :.: : :  . . :  .: :.:.: .:    ::  
CCDS20 -----------SESGRFGDSSPKEGAHGLVGVPWAPGGDLEGCAPDTRFFVPEPGGRGAA
                  60        70        80        90       100       

         120       130       140       150       160       170     
pF1KSD -WIALIPKGNCTYRDKIRNAFLQNASAVVIFNVGSNTNETITMPHAGVEDIVAIMIPEPK
        :.::. .:.::..::.  :  .::::::..:     : :. : :::. .::.:::  ::
CCDS20 PWVALVARGGCTFKDKVLVAARRNASAVVLYNEERYGNITLPMSHAGTGNIVVIMISYPK
       110       120       130       140       150       160       

         180       190       200                                   
pF1KSD GKEIVSLLERNITVTMYITIGTRNLQKY--------------------------------
       :.::. :....: ::: : .:::..:..                                
CCDS20 GREILELVQKGIPVTMTIGVGTRHVQEFISGQSVVFVAIAFITMMIISLAWLIFYYIQRF
       170       180       190       200       210       220       

               210            220       230       240       250    
pF1KSD ----RRLGDAA-----KKAISKLQIRTIKKGDKETESDFDNCAVCIEGYKPNDVVRILPC
            ..:. .     ::.:..: ..:.:.:.:  . : .:::::::..: .:..:::::
CCDS20 LYTGSQIGSQSHRKETKKVIGQLLLHTVKHGEKGIDVDAENCAVCIENFKVKDIIRILPC
       230       240       250       260       270       280       

          260       270       280       290       300       310    
pF1KSD RHLFHKSCVDPWLLDHRTCPMCKMNILKALGIPPNADCMDDLPTDFEGSLGGPPTNQITG
       .:.::. :.::::::::::::::....::::   .   ....:.  :.  :  :. ... 
CCDS20 KHIFHRICIDPWLLDHRTCPMCKLDVIKALGYWGEPGDVQEMPAP-ESPPGRDPAANLSL
       290       300       310       320       330        340      

             320       330       340       350       360       370 
pF1KSD A---SDTTVNESSVTLDPAVRTVGALQVVQDTDPIPQEGDVIFTTNSEQEPAVSSDSDIS
       :   .: . . :  . .::                                         
CCDS20 ALPDDDGSDDSSPPSASPAESEPQCDPSFKGDAGENTALLEAGRSDSRHGGPIS      
        350       360       370       380       390       400      

>>CCDS47692.1 RNF148 gene_id:378925|Hs108|chr7            (305 aa)
 initn: 624 init1: 375 opt: 375  Z-score: 390.5  bits: 80.7 E(32554): 2e-15
Smith-Waterman score: 608; 36.0% identity (61.4% similar) in 308 aa overlap (13-282:13-304)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAMSLIQACCSLALSTWLLSFCFVHLLCLDFTVAEKEEWYTAFVNITYAEPAPDPGAGAA
                   ..:. :: . .  .: :.:  .. .  .:: .:::.            
CCDS47 MSFLRITPSTHSSVSSGLLRLSI--FLLLSFPDSNGKAIWTAHLNITFQV----------
               10        20          30        40                  

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD GGGGAELHTEKTECGRYGEHSPKQDARGEVVMASSAHDRLACDPNTKFAAPTRGKNWIAL
          : :. .:  : : .:.::: . . : ::    . .. :: : :.:. : .. .:.::
CCDS47 ---GNEITSELGESGVFGNHSPLERVSG-VVALPEGWNQNACHPLTNFSRPKQADSWLAL
          50        60        70         80        90       100    

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD IPKGNCTYRDKIRNAFLQNASAVVIFNVGSNTNETITMPHAGVEDIVAIMIPEPKGKEIV
       : .:.::.  ::  :  ..:..:.:.:  .. .... : : :.:.:::.:: . :: ::.
CCDS47 IERGGCTFTHKINVAAEKGANGVIIYNYQGTGSKVFPMSHQGTENIVAVMISNLKGMEIL
          110       120       130       140       150       160    

              190       200                                        
pF1KSD SLLERNITVTMYITIGTRNLQ---KY--------------------------------RR
         ..... ::. : .:  ..:   .:                                ::
CCDS47 HSIQKGVYVTVIIEVGRMHMQWVSHYIMYLFTFLAATIAYFYLDCVWRLTPRVPNSFTRR
          170       180       190       200       210       220    

            210       220       230       240       250       260  
pF1KSD ---LGDAAKKAISKLQIRTIKKGDKETESDFDNCAVCIEGYKPNDVVRILPCRHLFHKSC
          .   .::::..::.:..:.::.: . . :::.::.. :::.:::::: :.:.:::.:
CCDS47 RSQIKTDVKKAIDQLQLRVLKEGDEELDLNEDNCVVCFDTYKPQDVVRILTCKHFFHKAC
          230       240       250       260       270       280    

            270       280       290       300       310       320  
pF1KSD VDPWLLDHRTCPMCKMNILKALGIPPNADCMDDLPTDFEGSLGGPPTNQITGASDTTVNE
       .::::: :::::::: .:::                                        
CCDS47 IDPWLLAHRTCPMCKCDILKT                                       
          290       300                                            

>>CCDS5784.1 RNF133 gene_id:168433|Hs108|chr7             (376 aa)
 initn: 656 init1: 371 opt: 371  Z-score: 385.1  bits: 80.0 E(32554): 3.9e-15
Smith-Waterman score: 606; 29.8% identity (59.2% similar) in 382 aa overlap (15-347:15-376)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAMSLIQACCSLALSTWLLSFCFVHLLCLDFTVAEKEEWYTAFVNITYAEPAPDPGAGAA
                     :.::..:  . :.  .   : .  :. :..::..            
CCDS57 MHLLKVGTWRNNTASSWLMKFSVLWLVSQNCCRA-SVVWM-AYMNISFHV----------
               10        20        30          40                  

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD GGGGAELHTEKTECGRYGEHSPKQDARGEVVMASSAHDRLACDPNTKFAAPTRGKNWIAL
          : .. .:  : : .:. :  . . : :..   .. . ::.::: :.    ...:.::
CCDS57 ---GNHVLSELGETGVFGRSSTLKRVAG-VIVPPEGKIQNACNPNTIFSRSKYSETWLAL
          50        60        70         80        90       100    

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD IPKGNCTYRDKIRNAFLQNASAVVIFNVGSNTNETITMPHAGVEDIVAIMIPEPKGKEIV
       : .:.::. .::. :  ..::.:.:.:: .. :... : : . ::.:..:: . :: :: 
CCDS57 IERGGCTFTQKIKVATEKGASGVIIYNVPGTGNQVFPMFHQAFEDVVVVMIGNLKGTEIF
          110       120       130       140       150       160    

              190       200                                        
pF1KSD SLLERNITVTMYITIGTRNL------------------------------------QKYR
        :..... .:  . .: ...                                    ....
CCDS57 HLIKKGVLITAVVEVGRKHIIWMNHYLVSFVIVTTATLAYFIFYHIHRLCLARIQNRRWQ
          170       180       190       200       210       220    

          210       220       230       240       250       260    
pF1KSD RLGDAAKKAISKLQIRTIKKGDKETESDFDNCAVCIEGYKPNDVVRILPCRHLFHKSCVD
       ::    ......::.:..:.::.: . . :.:..:.: :::::.:::: :.:.:::.:.:
CCDS57 RLTTDLQNTFGQLQLRVVKEGDEEINPNGDSCVICFERYKPNDIVRILTCKHFFHKNCID
          230       240       250       260       270       280    

          270       280                290       300       310     
pF1KSD PWLLDHRTCPMCKMNILKALGI---------PPNADCMDDLPTDFEGSLGGPPTNQIT--
       ::.: : :::.:: .:::.:::         : ..   ..::  .  :     .:...  
CCDS57 PWILPHGTCPICKCDILKVLGIQVVVENGTEPLQVLMSNELPETLSPSEE-ETNNEVSPA
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