seq1 = pF1KSDA1187.tfa, 2409 bp seq2 = pF1KSDA1187/gi568815597f_36056418.tfa (gi568815597f:36056418_36280067), 223650 bp >pF1KSDA1187 2409 >gi568815597f:36056418_36280067 (Chr1) 1-46 (100001-100046) 100% -> 47-391 (114554-114898) 100% -> 392-460 (115096-115164) 100% -> 461-624 (116047-116210) 100% -> 625-739 (116947-117061) 100% -> 740-1122 (119782-120164) 100% -> 1123-1268 (120280-120425) 99% -> 1269-1597 (121456-121784) 100% -> 1598-1775 (122002-122179) 100% -> 1776-1914 (122268-122406) 100% -> 1915-2019 (122504-122608) 100% -> 2020-2073 (122845-122898) 100% -> 2074-2116 (123098-123140) 100% -> 2117-2207 (123249-123339) 100% -> 2208-2405 (123457-123652) 98% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGAGAGCGGCCCGCGTGCGGAGCTGGGGGCGGGCGCACCCCCAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>. 100001 ATGGAGAGCGGCCCGCGTGCGGAGCTGGGGGCGGGCGCACCCCCAGGTA. 50 . : . : . : . : . : 47 CTGTGGTCGCCAGGACCCCCCCAGAGCCAAGACCTTCTCCAGAAG ..>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 ..CAGCTGTGGTCGCCAGGACCCCCCCAGAGCCAAGACCTTCTCCAGAAG 100 . : . : . : . : . : 92 GTGACCCTTCCCCCCCACCACCACCAATGTCAGCCCTGGTCCCCGACACT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114599 GTGACCCTTCCCCCCCACCACCACCAATGTCAGCCCTGGTCCCCGACACT 150 . : . : . : . : . : 142 CCCCCGGACACCCCTCCTGCCATGAAGAATGCCACTAGCTCTAAGCAGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114649 CCCCCGGACACCCCTCCTGCCATGAAGAATGCCACTAGCTCTAAGCAGCT 200 . : . : . : . : . : 192 CCCACTGGAACCAGAGAGCCCCTCAGGGCAGGTCGGGCCTAGGCCAGCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114699 CCCACTGGAACCAGAGAGCCCCTCAGGGCAGGTCGGGCCTAGGCCAGCCC 250 . : . : . : . : . : 242 CCCCGCAGGAAGAGTCCCCTTCCTCTGAAGCAAAGAGCAGAGGACCCACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114749 CCCCGCAGGAAGAGTCCCCTTCCTCTGAAGCAAAGAGCAGAGGACCCACC 300 . : . : . : . : . : 292 CCACCAGCCATGGGCCCACGGGATGCCAGACCTCCTCGAAGGAGCAGCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114799 CCACCAGCCATGGGCCCACGGGATGCCAGACCTCCTCGAAGGAGCAGCCA 350 . : . : . : . : . : 342 GCCATCTCCAACAGCAGTGCCAGCCTCCGACAGCCCTCCCACCAAGCAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114849 GCCATCTCCAACAGCAGTGCCAGCCTCCGACAGCCCTCCCACCAAGCAAG 400 . : . : . : . : . : 392 AGGTGAAGAAGGCAGGAGAGAGACACAAGCTGGCAAAGGAG >>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114899 GTG...CAGAGGTGAAGAAGGCAGGAGAGAGACACAAGCTGGCAAAGGAG 450 . : . : . : . : . : 433 CGGCGAGAAGAGCGGGCCAAGTACCTGG CGGCCAAGAAGGC ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||| 115137 CGGCGAGAAGAGCGGGCCAAGTACCTGGGTG...CAGCGGCCAAGAAGGC 500 . : . : . : . : . : 474 AGTGTGGCTGGAGAAGGAGGAGAAGGCCAAGGCGCTGCGGGAGAAGCAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116060 AGTGTGGCTGGAGAAGGAGGAGAAGGCCAAGGCGCTGCGGGAGAAGCAGC 550 . : . : . : . : . : 524 TCCAGGAGCGCCGGCGCCGGCTGGAGGAGCAACGTCTTAAAGCCGAGCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116110 TCCAGGAGCGCCGGCGCCGGCTGGAGGAGCAACGTCTTAAAGCCGAGCAA 600 . : . : . : . : . : 574 CGCCGTGCAGCCCTGGAGGAACGGCAGCGGCAGAAGCTCGAGAAAAACAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116160 CGCCGTGCAGCCCTGGAGGAACGGCAGCGGCAGAAGCTCGAGAAAAACAA 650 . : . : . : . : . : 624 G GAGCGCTATGAAGCAGCCATCCAACGGTCAGTGAAGAAGA |>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116210 GGTG...CAGGAGCGCTATGAAGCAGCCATCCAACGGTCAGTGAAGAAGA 700 . : . : . : . : . : 665 CGTGGGCCGAAATCCGGCAGCAGCGCTGGTCCTGGGCAGGGGCCCTGCAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116987 CGTGGGCCGAAATCCGGCAGCAGCGCTGGTCCTGGGCAGGGGCCCTGCAC 750 . : . : . : . : . : 715 CACAGCTCTCCAGGACATAAGACCA ATCGCAGCCTGCAGCT |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||| 117037 CACAGCTCTCCAGGACATAAGACCAGTG...CAGATCGCAGCCTGCAGCT 800 . : . : . : . : . : 756 GAGCGCATGGGAGAGCAGCATCGTGGATCGTCTGATGACGCCCACTCTCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 119798 GAGCGCATGGGAGAGCAGCATCGTGGATCGTCTGATGACGCCCACTCTCT 850 . : . : . : . : . : 806 CCTTCCTTGCTCGGAGTCGCAGCGCGGTCACACTGCCCCGCAACGGCCGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 119848 CCTTCCTTGCTCGGAGTCGCAGCGCGGTCACACTGCCCCGCAACGGCCGG 900 . : . : . : . : . : 856 GACCAGGGTAGGGGCTGCGACCCTGGGAGAGGCCCCACGTGGGGCCGGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 119898 GACCAGGGTAGGGGCTGCGACCCTGGGAGAGGCCCCACGTGGGGCCGGGC 950 . : . : . : . : . : 906 AGGGGCCAGCCTGGCGCGCGGGCCGCAACCCGACCGCACTCATCCCTCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 119948 AGGGGCCAGCCTGGCGCGCGGGCCGCAACCCGACCGCACTCATCCCTCTG 1000 . : . : . : . : . : 956 CAGCCGTGCCGGTGTGCCCGCGCTCGGCCTCCGCCAGCCCCCTGACGCCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 119998 CAGCCGTGCCGGTGTGCCCGCGCTCGGCCTCCGCCAGCCCCCTGACGCCG 1050 . : . : . : . : . : 1006 TGCAGCGTCACCCGAAGCGTGCACCGCTGCGCCCCCGCCGGTGAGCGCGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120048 TGCAGCGTCACCCGAAGCGTGCACCGCTGCGCCCCCGCCGGTGAGCGCGG 1100 . : . : . : . : . : 1056 GGAGCGCCGCAAGCCCAACGCCGGGGGCAGCCCCGCTCCGGTGCGCCGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120098 GGAGCGCCGCAAGCCCAACGCCGGGGGCAGCCCCGCTCCGGTGCGCCGCC 1150 . : . : . : . : . : 1106 GGCCGGAGGCCTCGCCG GTGCAGAAAAAGGAGAAGAAGGAC |||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||| 120148 GGCCGGAGGCCTCGCCGGTG...CAGGTGCAGAAAAAGGAGAAGAAGGAC 1200 . : . : . : . : . : 1147 AAGGAGCGGGAAAACGAGAAGGAGAAGAGTGCCCTAGCCCGGGAGCGCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120304 AAGGAGCGGGAAAACGAGAAGGAGAAGAGTGCCCTAGCCCGGGAGCGCAG 1250 . : . : . : . : . : 1197 CCTCAAGAAGCGCCAGTCGCTGCCCGCCTCCCCACGTGCCCGCCTCTCCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | 120354 CCTCAAGAAGCGCCAGTCGCTGCCCGCCTCCCCACGTGCCCGCCTCTCTG 1300 . : . : . : . : . : 1247 CCAGCACCGCCTCTGAGCTCAG CCCCAAATCCAAGGCCAGG ||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||| 120404 CCAGCACCGCCTCTGAGCTCAGGTG...TAGCCCCAAATCCAAGGCCAGG 1350 . : . : . : . : . : 1288 CCATCCTCTCCCTCCACATCCTGGCACAGGCCTGCCTCCCCCTGCCCCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 121475 CCATCCTCTCCCTCCACATCCTGGCACAGGCCTGCCTCCCCCTGCCCCAG 1400 . : . : . : . : . : 1338 CCCAGGGCCAGGCCACACTCTGCCTCCAAAGCCACCGTCCCCCCGAGGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 121525 CCCAGGGCCAGGCCACACTCTGCCTCCAAAGCCACCGTCCCCCCGAGGCA 1450 . : . : . : . : . : 1388 CCACTGCATCCCCCAAGGGGCGGGTTCGGAGGAAGGAGGAGGCAAAGGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 121575 CCACTGCATCCCCCAAGGGGCGGGTTCGGAGGAAGGAGGAGGCAAAGGAG 1500 . : . : . : . : . : 1438 AGCCCCAGCGCCGCAGGGCCCGAGGACAAGAGCCAGAGCAAGCGCAGGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 121625 AGCCCCAGCGCCGCAGGGCCCGAGGACAAGAGCCAGAGCAAGCGCAGGGC 1550 . : . : . : . : . : 1488 CAGTAACGAGAAGGAGTCAGCAGCCCCAGCCTCACCGGCACCTTCGCCGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 121675 CAGTAACGAGAAGGAGTCAGCAGCCCCAGCCTCACCGGCACCTTCGCCGG 1600 . : . : . : . : . : 1538 CGCCCTCGCCCACCCCAGCCCCGCCCCAGAAGGAGCAGCCCCCCGCGGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 121725 CGCCCTCGCCCACCCCAGCCCCGCCCCAGAAGGAGCAGCCCCCCGCGGAG 1650 . : . : . : . : . : 1588 ACCCCTACAG ACGCTGCTGTCTTGACCTCACCCCCAGCCCC ||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||| 121775 ACCCCTACAGGTA...CAGACGCTGCTGTCTTGACCTCACCCCCAGCCCC 1700 . : . : . : . : . : 1629 TGCTCCCCCGGTGACCCCTAGCAAACCAATGGCCGGCACCACAGACCGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 122033 TGCTCCCCCGGTGACCCCTAGCAAACCAATGGCCGGCACCACAGACCGAG 1750 . : . : . : . : . : 1679 AAGAAGCCACTCGGCTCTTGGCTGAGAAGCGGCGCCAGGCCCGGGAGCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 122083 AAGAAGCCACTCGGCTCTTGGCTGAGAAGCGGCGCCAGGCCCGGGAGCAG 1800 . : . : . : . : . : 1729 CGGGAGCGCGAGGAGCAGGAGCGGAGGCTGCAGGCAGAAAGGGACAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>> 122133 CGGGAGCGCGAGGAGCAGGAGCGGAGGCTGCAGGCAGAAAGGGACAAGTG 1850 . : . : . : . : . : 1776 GCGAATGCGAGAGGAGCAGCTGGCACGGGAGGCCGAGGCCCGGG ...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 122183 ...CAGGCGAATGCGAGAGGAGCAGCTGGCACGGGAGGCCGAGGCCCGGG 1900 . : . : . : . : . : 1820 CGGAGCGGGAGGCGGAGGCCCGGAGGCGGGAGGAGCAGGAGGCACGAGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 122312 CGGAGCGGGAGGCGGAGGCCCGGAGGCGGGAGGAGCAGGAGGCACGAGAG 1950 . : . : . : . : . : 1870 AAGGCGCAGGCCGAGCAGGAGGAGCAGGAGCGGCTGCAGAAGCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.. 122362 AAGGCGCAGGCCGAGCAGGAGGAGCAGGAGCGGCTGCAGAAGCAGGTG.. 2000 . : . : . : . : . : 1915 AAAGAGGAGGCCGAAGCTCGGTCGCGGGAAGAGGCGGAGCGGCAGC .>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 122412 .CAGAAAGAGGAGGCCGAAGCTCGGTCGCGGGAAGAGGCGGAGCGGCAGC 2050 . : . : . : . : . : 1961 GTCTGGAGCGGGAAAAGCACTTCCAGCAGCAGGAGCAAGAGCGGCAAGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 122550 GTCTGGAGCGGGAAAAGCACTTCCAGCAGCAGGAGCAAGAGCGGCAAGAG 2100 . : . : . : . : . : 2011 CGCAGAAAG CGTCTGGAGGAGATCATGAAGAGGACTCGGAA |||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||| 122600 CGCAGAAAGGTG...CAGCGTCTGGAGGAGATCATGAAGAGGACTCGGAA 2150 . : . : . : . : . : 2052 GTCAGAAGTTTCTGAAACCAAG AAGCAGGACAGCAAGGAGG ||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||| 122877 GTCAGAAGTTTCTGAAACCAAGGTC...CAGAAGCAGGACAGCAAGGAGG 2200 . : . : . : . : . : 2093 CCAACGCCAACGGTTCCAGCCCAG AGCCTGTGAAAGCTGTG ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||| 123117 CCAACGCCAACGGTTCCAGCCCAGGTA...CAGAGCCTGTGAAAGCTGTG 2250 . : . : . : . : . : 2134 GAGGCTCGGTCCCCAGGGCTGCAGAAGGAGGCTGTGCAGAAAGAGGAGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123266 GAGGCTCGGTCCCCAGGGCTGCAGAAGGAGGCTGTGCAGAAAGAGGAGCC 2300 . : . : . : . : . : 2184 CATCCCACAGGAGCCTCAGTGGAG TCTCCCAAGCAAGGAGT ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||| 123316 CATCCCACAGGAGCCTCAGTGGAGGTA...CAGTCTCCCAAGCAAGGAGT 2350 . : . : . : . : . : 2225 TGCCAGCGTCCCTGGTGAATGGCCTGCAGCCTCTCCCAGCACACCAGGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123474 TGCCAGCGTCCCTGGTGAATGGCCTGCAGCCTCTCCCAGCACACCAGGAG 2400 . : . : . : . : . : 2275 AATGGCTTCTCCACCAACGGACCCTCTGGGGACAAGAGTCTGAGCCGAAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123524 AATGGCTTCTCCACCAACGGACCCTCTGGGGACAAGAGTCTGAGCCGAAC 2450 . : . : . : . : . : 2325 ACCAGAGACACTCCTGCCCTTTGCAGAGGCAGAAGCCTTCCTCAAGAAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123574 ACCAGAGACACTCCTGCCCTTTGCAGAGGCAGAAGCCTTCCTCAAGAAAG 2500 . : . : . : 2375 CTGTGGTGCAGTCCCCGCAGGTCACAGAAGT |||||||||||||||||||||||||||--|| 123624 CTGTGGTGCAGTCCCCGCAGGTCACAG GT