Result of FASTA (omim) for pF1KSDA1093
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA1093, 1722 aa
  1>>>pF1KSDA1093 1722 - 1722 aa - 1722 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.3398+/-0.000446; mu= -6.5047+/- 0.028
 mean_var=457.5053+/-93.869, 0's: 0 Z-trim(122.9): 59  B-trim: 217 in 1/58
 Lambda= 0.059962
 statistics sampled from 41819 (41899) to 41819 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.758), E-opt: 0.2 (0.491), width:  16
 Scan time: 22.010

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_055903 (OMIM: 610740) trinucleotide repeat-cont (1723) 12064 1059.6       0
NP_001155973 (OMIM: 610740) trinucleotide repeat-c (1833) 6670 593.0 8.4e-168
NP_001020014 (OMIM: 610740) trinucleotide repeat-c (1029) 5546 495.5  1e-138
XP_016878638 (OMIM: 610739) PREDICTED: trinucleoti (1911) 2476 230.2 1.4e-58
NP_001317449 (OMIM: 610739) trinucleotide repeat-c (1913) 2343 218.7 4.1e-55
XP_016878636 (OMIM: 610739) PREDICTED: trinucleoti (1922) 2343 218.7 4.1e-55
XP_016878640 (OMIM: 610739) PREDICTED: trinucleoti (1863) 2308 215.7 3.3e-54
XP_016878643 (OMIM: 610739) PREDICTED: trinucleoti (1698) 2024 191.1 7.7e-47
XP_016878633 (OMIM: 610739) PREDICTED: trinucleoti (1960) 2024 191.1 8.5e-47
XP_016878637 (OMIM: 610739) PREDICTED: trinucleoti (1912) 2020 190.7 1.1e-46
XP_005255314 (OMIM: 610739) PREDICTED: trinucleoti (1709) 2017 190.4 1.2e-46
XP_016878642 (OMIM: 610739) PREDICTED: trinucleoti (1709) 2017 190.4 1.2e-46
XP_016878641 (OMIM: 610739) PREDICTED: trinucleoti (1829) 2017 190.5 1.2e-46
XP_016878635 (OMIM: 610739) PREDICTED: trinucleoti (1946) 2017 190.5 1.3e-46
NP_055309 (OMIM: 610739) trinucleotide repeat-cont (1962) 2017 190.5 1.3e-46
XP_016878632 (OMIM: 610739) PREDICTED: trinucleoti (1971) 2017 190.5 1.3e-46
XP_016878639 (OMIM: 610739) PREDICTED: trinucleoti (1899) 1990 188.2 6.4e-46
XP_016878634 (OMIM: 610739) PREDICTED: trinucleoti (1948) 1823 173.7 1.5e-41
XP_006722060 (OMIM: 610741) PREDICTED: trinucleoti (1921) 1528 148.2 6.9e-34
XP_016880397 (OMIM: 610741) PREDICTED: trinucleoti (1896) 1453 141.7 6.2e-32
XP_011523390 (OMIM: 610741) PREDICTED: trinucleoti (1729) 1447 141.1 8.2e-32
XP_006722059 (OMIM: 610741) PREDICTED: trinucleoti (1971) 1447 141.2 9.1e-32
NP_001136112 (OMIM: 610741) trinucleotide repeat-c (1726) 1405 137.5   1e-30
XP_016880395 (OMIM: 610741) PREDICTED: trinucleoti (1968) 1405 137.6 1.1e-30
NP_061869 (OMIM: 610741) trinucleotide repeat-cont (1690) 1058 107.5 1.1e-21
XP_016880396 (OMIM: 610741) PREDICTED: trinucleoti (1932) 1058 107.5 1.2e-21
XP_006722063 (OMIM: 610741) PREDICTED: trinucleoti (1929) 1029 105.0 6.9e-21
NP_055023 (OMIM: 125420,125485,125490,125500,60559 (1301)  347 45.9   0.003


>>NP_055903 (OMIM: 610740) trinucleotide repeat-containi  (1723 aa)
 initn: 8547 init1: 8547 opt: 12064  Z-score: 5655.8  bits: 1059.6 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 12064; 99.9% identity (99.9% similar) in 1723 aa overlap (1-1722:1-1723)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MREKEQEREEQLMEDKKRKKEDKKKKEATQKVTEQKTKVPEVTKPSLSQPTAASPIGSSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MREKEQEREEQLMEDKKRKKEDKKKKEATQKVTEQKTKVPEVTKPSLSQPTAASPIGSSP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD SPPVNGGNNAKRVAVPNGQPPSAARYMPREVPPRFRCQQDHKVLLKRGQPPPPSCMLLGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SPPVNGGNNAKRVAVPNGQPPSAARYMPREVPPRFRCQQDHKVLLKRGQPPPPSCMLLGG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD GAGPPPCTAPGANPNNAQVTGALLQSESGTAPDSTLGGAAASNYANSTWGSGASSNNGTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GAGPPPCTAPGANPNNAQVTGALLQSESGTAPDSTLGGAAASNYANSTWGSGASSNNGTS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD PNPIHIWDKVIVDGSDMEEWPCIASKDTESSSENTTDNNSASNPGSEKSTLPGSTTSNKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PNPIHIWDKVIVDGSDMEEWPCIASKDTESSSENTTDNNSASNPGSEKSTLPGSTTSNKG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD KGSQCQSASSGNECNLGVWKSDPKAKSVQSSNSTTENNNGLGNWRNVSGQDRIGPGSGFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KGSQCQSASSGNECNLGVWKSDPKAKSVQSSNSTTENNNGLGNWRNVSGQDRIGPGSGFS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD NFNPNSNPSAWPALVQEGTSRKGALETDNSNSSAQVSTVGQTSREQQSKMENAGVNFVVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 NFNPNSNPSAWPALVQEGTSRKGALETDNSNSSAQVSTVGQTSREQQSKMENAGVNFVVS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD GREQAQIHNTDGPKNGNTNSLNLSSPNPMENKGMPFGMGLGNTSRSTDAPSQSTGDRKTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GREQAQIHNTDGPKNGNTNSLNLSSPNPMENKGMPFGMGLGNTSRSTDAPSQSTGDRKTG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD SVGSWGAARGPSGTDTVSGQSNSGNNGNNGKEREDSWKGASVQKSTGSKNDSWDNNNRST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SVGSWGAARGPSGTDTVSGQSNSGNNGNNGKEREDSWKGASVQKSTGSKNDSWDNNNRST
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD GGSWNFGPQDSNDNKWGEGNKMTSGVSQGEWKQPTGSDELKIGEWSGPNQPNSSTGAWDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GGSWNFGPQDSNDNKWGEGNKMTSGVSQGEWKQPTGSDELKIGEWSGPNQPNSSTGAWDN
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD QKGHPLPENQGNAQAPCWGRSSSSTGSEVGGQSTGSNHKAGSSDSHNSGRRSYRPTHPDC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QKGHPLPENQGNAQAPCWGRSSSSTGSEVGGQSTGSNHKAGSSDSHNSGRRSYRPTHPDC
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD QAVLQTLLSRTDLDPRVLSNTGWGQTQIKQDTVWDIEEVPRPEGKSDKGTEGWESAATQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QAVLQTLLSRTDLDPRVLSNTGWGQTQIKQDTVWDIEEVPRPEGKSDKGTEGWESAATQT
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD KNSGGWGDAPSQSNQMKSGWGELSASTEWKDPKNTGGWNDYKNNNSSNWGGGRPDEKTPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KNSGGWGDAPSQSNQMKSGWGELSASTEWKDPKNTGGWNDYKNNNSSNWGGGRPDEKTPS
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD SWNENPSKDQGWGGGRQPNQGWSSGKNGWGEEVDQTKNSNWESSASKPVSGWGEGGQNEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SWNENPSKDQGWGGGRQPNQGWSSGKNGWGEEVDQTKNSNWESSASKPVSGWGEGGQNEI
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD GTWGNGGNASLASKGGWEDCKRSPAWNETGRQPNSWNKQHQQQQPPQQPPPPQPEASGSW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GTWGNGGNASLASKGGWEDCKRSPAWNETGRQPNSWNKQHQQQQPPQQPPPPQPEASGSW
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD GGPPPPPPGNVRPSNSSWSSGPQPATPKDEEPSGWEEPSPQSISRKMDIDDGTSAWGDPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GGPPPPPPGNVRPSNSSWSSGPQPATPKDEEPSGWEEPSPQSISRKMDIDDGTSAWGDPN
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD SYNYKNVNLWDKNSQGGPAPREPNLPTPMTSKSASDSKSMQDGWGESDGPVTGARHPSWE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SYNYKNVNLWDKNSQGGPAPREPNLPTPMTSKSASDSKSMQDGWGESDGPVTGARHPSWE
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD EEEDGGVWNTTGSQGSASSHNSASWGQGGKKQMKCSLKGGNNDSWMNPLAKQFSNMGLLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 EEEDGGVWNTTGSQGSASSHNSASWGQGGKKQMKCSLKGGNNDSWMNPLAKQFSNMGLLS
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD QTEDNPSSKMDLSVGSLSDKKFDVDKRAMNLGDFNDIMRKDRSGFRPPNSKDMGTTDSGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QTEDNPSSKMDLSVGSLSDKKFDVDKRAMNLGDFNDIMRKDRSGFRPPNSKDMGTTDSGP
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD YFEKGGSHGLFGNSTAQSRGLHTPVQPLNSSPSLRAQVPPQFISPQVSASMLKQFPNSGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 YFEKGGSHGLFGNSTAQSRGLHTPVQPLNSSPSLRAQVPPQFISPQVSASMLKQFPNSGL
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KSD SPGLFNVGPQLSPQQIAMLSQLPQIPQFQLACQLLLQQQQQQQLLQNQRKISQAVRQQQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SPGLFNVGPQLSPQQIAMLSQLPQIPQFQLACQLLLQQQQQQQLLQNQRKISQAVRQQQE
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210       1220      1230      1240      1250         
pF1KSD QQLARMVSALQQQQQQQ-RQPGMKHSPSHPVGPKPHLDNMVPNALNVGLPDLQTKGPIPG
       ::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QQLARMVSALQQQQQQQQRQPGMKHSPSHPVGPKPHLDNMVPNALNVGLPDLQTKGPIPG
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

    1260      1270      1280      1290      1300      1310         
pF1KSD YGSGFSSGGMDYGMVGGKEAGTESRFKQWTSMMEGLPSVATQEANMHKNGAIVAPGKTRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 YGSGFSSGGMDYGMVGGKEAGTESRFKQWTSMMEGLPSVATQEANMHKNGAIVAPGKTRG
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

    1320      1330      1340      1350      1360      1370         
pF1KSD GSPYNQFDIIPGDTLGGHTGPAGDSWLPAKSPPTNKIGSKSSNASWPPEFQPGVPWKGIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GSPYNQFDIIPGDTLGGHTGPAGDSWLPAKSPPTNKIGSKSSNASWPPEFQPGVPWKGIQ
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

    1380      1390      1400      1410      1420      1430         
pF1KSD NIDPESDPYVTPGSVLGGTATSPIVDTDHQLLRDNTTGSNSSLNTSLPSPGAWPYSASDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 NIDPESDPYVTPGSVLGGTATSPIVDTDHQLLRDNTTGSNSSLNTSLPSPGAWPYSASDN
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

    1440      1450      1460      1470      1480      1490         
pF1KSD SFTNVHSTSAKFPDYKSTWSPDPIGHNPTHLSNKMWKNHISSRNTTPLPRPPPGLTNPKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SFTNVHSTSAKFPDYKSTWSPDPIGHNPTHLSNKMWKNHISSRNTTPLPRPPPGLTNPKP
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

    1500      1510      1520      1530      1540      1550         
pF1KSD SSPWSSTAPRSVRGWGTQDSRLASASTWSDGGSVRPSYWLVLHNLTPQIDGSTLRTICMQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SSPWSSTAPRSVRGWGTQDSRLASASTWSDGGSVRPSYWLVLHNLTPQIDGSTLRTICMQ
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

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pF1KSD HGPLLTFHLNLTQGTALIRYSTKQEAAKAQTALHMCVLGNTTILAEFATDDEVSRFLAQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 HGPLLTFHLNLTQGTALIRYSTKQEAAKAQTALHMCVLGNTTILAEFATDDEVSRFLAQA
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

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pF1KSD QPPTPAATPSAPAAGWQSLETGQNQSDPVGPALNLFGGSTGLGQWSSSAGGSSGADLAGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QPPTPAATPSAPAAGWQSLETGQNQSDPVGPALNLFGGSTGLGQWSSSAGGSSGADLAGA
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       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SLWGPPNYSSSLWGVPTVEDPHRMGSPAPLLPGDLLGGGSDSI
             1690      1700      1710      1720   

>>NP_001155973 (OMIM: 610740) trinucleotide repeat-conta  (1833 aa)
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Smith-Waterman score: 11261; 93.6% identity (93.7% similar) in 1754 aa overlap (1-1643:1-1754)

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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MREKEQEREEQLMEDKKRKKEDKKKKEATQKVTEQKTKVPEVTKPSLSQPTAASPIGSSP
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SPPVNGGNNAKRVAVPNGQPPSAARYMPREVPPRFRCQQDHKVLLKRGQPPPPSCMLLGG
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GAGPPPCTAPGANPNNAQVTGALLQSESGTAPDSTLGGAAASNYANSTWGSGASSNNGTS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PNPIHIWDKVIVDGSDMEEWPCIASKDTESSSENTTDNNSASNPGSEKSTLPGSTTSNKG
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pF1KSD KGSQCQSASSGNECNLGVWKSDPKAKSVQSSNSTTENNNGLGNWRNVSGQDRIGPGSGFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KGSQCQSASSGNECNLGVWKSDPKAKSVQSSNSTTENNNGLGNWRNVSGQDRIGPGSGFS
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pF1KSD NFNPNSNPSAWPALVQEGTSRKGALETDNSNSSAQVSTVGQTSREQQSKMENAGVNFVVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NFNPNSNPSAWPALVQEGTSRKGALETDNSNSSAQVSTVGQTSREQQSKMENAGVNFVVS
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pF1KSD GREQAQIHNTDGPKNGNTNSLNLSSPNPMENKGMPFGMGLGNTSRSTDAPSQSTGDRKTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GREQAQIHNTDGPKNGNTNSLNLSSPNPMENKGMPFGMGLGNTSRSTDAPSQSTGDRKTG
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pF1KSD SVGSWGAARGPSGTDTVSGQSNSGNNGNNGKEREDSWKGASVQKSTGSKNDSWDNNNRST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SVGSWGAARGPSGTDTVSGQSNSGNNGNNGKEREDSWKGASVQKSTGSKNDSWDNNNRST
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pF1KSD GGSWNFGPQDSNDNKWGEGNKMTSGVSQGEWKQPTGSDELKIGEWSGPNQPNSSTGAWDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GGSWNFGPQDSNDNKWGEGNKMTSGVSQGEWKQPTGSDELKIGEWSGPNQPNSSTGAWDN
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pF1KSD QKGHPLPENQGNAQAPCWGRSSSSTGSEVGGQSTGSNHKAGSSDSHNSGRRSYRPTHPDC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QKGHPLPENQGNAQAPCWGRSSSSTGSEVGGQSTGSNHKAGSSDSHNSGRRSYRPTHPDC
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pF1KSD QAVLQTLLSRTDLDPRVLSNTGWGQTQIKQDTVWDIEEVPRPEGKSDKGTEGWESAATQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QAVLQTLLSRTDLDPRVLSNTGWGQTQIKQDTVWDIEEVPRPEGKSDKGTEGWESAATQT
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pF1KSD KNSGGWGDAPSQSNQMKSGWGELSASTEWKDPKNTGGWNDYKNNNSSNWGGGRPDEKTPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KNSGGWGDAPSQSNQMKSGWGELSASTEWKDPKNTGGWNDYKNNNSSNWGGGRPDEKTPS
              670       680       690       700       710       720

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pF1KSD SWNENPSKDQGWGGGRQPNQGWSSGKNGWGEEVDQTKNSNWESSASKPVSGWGEGGQNEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SWNENPSKDQGWGGGRQPNQGWSSGKNGWGEEVDQTKNSNWESSASKPVSGWGEGGQNEI
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pF1KSD GTWGNGGNASLASKGGWEDCKRSPAWNETGRQPNSWNKQHQQQQPPQQPPPPQPEASGSW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GTWGNGGNASLASKGGWEDCKRSPAWNETGRQPNSWNKQHQQQQPPQQPPPPQPEASGSW
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pF1KSD GGPPPPPPGNVRPSNSSWSSGPQPATPKDEEPSGWEEPSPQSISRKMDIDDGTSAWGDPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GGPPPPPPGNVRPSNSSWSSGPQPATPKDEEPSGWEEPSPQSISRKMDIDDGTSAWGDPN
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pF1KSD SYNYKNVNLWDKNSQGGPAPREPNLPTPMTSKSAS-------------------------
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::                         
NP_001 SYNYKNVNLWDKNSQGGPAPREPNLPTPMTSKSASVWSKSTPPAPDNGTSAWGEPNESSP
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                                     940       950       960       
pF1KSD ----------------------------DSKSMQDGWGESDGPVTGARHPSWEEEEDGGV
                                   .:::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GWGEMDDTGASTTGWGNTPANAPNAMKPNSKSMQDGWGESDGPVTGARHPSWEEEEDGGV
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       970       980       990      1000      1010      1020       
pF1KSD WNTTGSQGSASSHNSASWGQGGKKQMKCSLKGGNNDSWMNPLAKQFSNMGLLSQTEDNPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WNTTGSQGSASSHNSASWGQGGKKQMKCSLKGGNNDSWMNPLAKQFSNMGLLSQTEDNPS
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

      1030      1040      1050      1060      1070      1080       
pF1KSD SKMDLSVGSLSDKKFDVDKRAMNLGDFNDIMRKDRSGFRPPNSKDMGTTDSGPYFEK---
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::   
NP_001 SKMDLSVGSLSDKKFDVDKRAMNLGDFNDIMRKDRSGFRPPNSKDMGTTDSGPYFEKLTL
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

                                                               1090
pF1KSD ------------------------------------------------------GGSHGL
                                                             ::::::
NP_001 PFSNQDGCLGDEAPCSPFSPSPSYKLSPSGSTLPNVSLGAIGTGLNPQNFAARQGGSHGL
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1100      1110      1120      1130      1140      1150
pF1KSD FGNSTAQSRGLHTPVQPLNSSPSLRAQVPPQFISPQVSASMLKQFPNSGLSPGLFNVGPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FGNSTAQSRGLHTPVQPLNSSPSLRAQVPPQFISPQVSASMLKQFPNSGLSPGLFNVGPQ
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1160      1170      1180      1190      1200      1210
pF1KSD LSPQQIAMLSQLPQIPQFQLACQLLLQQQQQQQLLQNQRKISQAVRQQQEQQLARMVSAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LSPQQIAMLSQLPQIPQFQLACQLLLQQQQQQQLLQNQRKISQAVRQQQEQQLARMVSAL
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

              1220      1230      1240      1250      1260         
pF1KSD QQQQQQQ-RQPGMKHSPSHPVGPKPHLDNMVPNALNVGLPDLQTKGPIPGYGSGFSSGGM
       ::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QQQQQQQQRQPGMKHSPSHPVGPKPHLDNMVPNALNVGLPDLQTKGPIPGYGSGFSSGGM
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

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pF1KSD DYGMVGGKEAGTESRFKQWTSMMEGLPSVATQEANMHKNGAIVAPGKTRGGSPYNQFDII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DYGMVGGKEAGTESRFKQWTSMMEGLPSVATQEANMHKNGAIVAPGKTRGGSPYNQFDII
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

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pF1KSD PGDTLGGHTGPAGDSWLPAKSPPTNKIGSKSSNASWPPEFQPGVPWKGIQNIDPESDPYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PGDTLGGHTGPAGDSWLPAKSPPTNKIGSKSSNASWPPEFQPGVPWKGIQNIDPESDPYV
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

    1390      1400      1410      1420      1430      1440         
pF1KSD TPGSVLGGTATSPIVDTDHQLLRDNTTGSNSSLNTSLPSPGAWPYSASDNSFTNVHSTSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TPGSVLGGTATSPIVDTDHQLLRDNTTGSNSSLNTSLPSPGAWPYSASDNSFTNVHSTSA
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

    1450      1460      1470      1480      1490      1500         
pF1KSD KFPDYKSTWSPDPIGHNPTHLSNKMWKNHISSRNTTPLPRPPPGLTNPKPSSPWSSTAPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KFPDYKSTWSPDPIGHNPTHLSNKMWKNHISSRNTTPLPRPPPGLTNPKPSSPWSSTAPR
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

    1510      1520      1530      1540      1550      1560         
pF1KSD SVRGWGTQDSRLASASTWSDGGSVRPSYWLVLHNLTPQIDGSTLRTICMQHGPLLTFHLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SVRGWGTQDSRLASASTWSDGGSVRPSYWLVLHNLTPQIDGSTLRTICMQHGPLLTFHLN
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

    1570      1580      1590      1600      1610      1620         
pF1KSD LTQGTALIRYSTKQEAAKAQTALHMCVLGNTTILAEFATDDEVSRFLAQAQPPTPAATPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LTQGTALIRYSTKQEAAKAQTALHMCVLGNTTILAEFATDDEVSRFLAQAQPPTPAATPS
             1690      1700      1710      1720      1730      1740

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pF1KSD APAAGWQSLETGQNQSDPVGPALNLFGGSTGLGQWSSSAGGSSGADLAGASLWGPPNYSS
       ::::::::::::::                                              
NP_001 APAAGWQSLETGQNQSDPVGPALNLFGGSTGLGQWSSSAGGSSGADLAGASLWGPPNYSS
             1750      1760      1770      1780      1790      1800

>--
 initn: 557 init1: 557 opt: 557  Z-score: 275.6  bits: 64.2 E(85289): 1.3e-08
Smith-Waterman score: 557; 100.0% identity (100.0% similar) in 79 aa overlap (1644-1722:1755-1833)

          1620      1630      1640      1650      1660      1670   
pF1KSD RFLAQAQPPTPAATPSAPAAGWQSLETGQNQSDPVGPALNLFGGSTGLGQWSSSAGGSSG
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RFLAQAQPPTPAATPSAPAAGWQSLETGQNQSDPVGPALNLFGGSTGLGQWSSSAGGSSG
         1730      1740      1750      1760      1770      1780    

          1680      1690      1700      1710      1720  
pF1KSD ADLAGASLWGPPNYSSSLWGVPTVEDPHRMGSPAPLLPGDLLGGGSDSI
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ADLAGASLWGPPNYSSSLWGVPTVEDPHRMGSPAPLLPGDLLGGGSDSI
         1790      1800      1810      1820      1830   

>>NP_001020014 (OMIM: 610740) trinucleotide repeat-conta  (1029 aa)
 initn: 4683 init1: 3639 opt: 5546  Z-score: 2611.4  bits: 495.5 E(85289): 1e-138
Smith-Waterman score: 5580; 86.9% identity (90.7% similar) in 953 aa overlap (786-1722:93-1029)

         760       770       780       790       800       810     
pF1KSD TKNSNWESSASKPVSGWGEGGQNEIGTWGNGGNASLASKGGWEDCKRSPAWNETGRQPNS
                                     :.. :   .:: .. ::  . :  : :: :
NP_001 EATQKVTEQKTKVPEVTKPSLSQPTAASPIGSSPSPPVNGG-NNAKRVAVPN--G-QPPS
             70        80        90       100        110           

         820                     830       840       850       860 
pF1KSD WNKQHQQQQPPQ--------------QPPPPQPEASGSWGGPPPPPPGNVRPSNSSWSSG
         .   .. ::.              :::::.    :. .::::    .. :.:..  .:
NP_001 AARYMPREVPPRFRCQQDHKVLLKRGQPPPPSCMLLGGGAGPPPCTAPGANPNNAQ-VTG
      120       130       140       150       160       170        

             870       880       890       900       910        920
pF1KSD PQPATPKDEEPSGWEEPSPQSISRKMDIDDGTSAWGDPNSYNYKNVNLWDK-NSQGGPAP
           . .   :  : . .: .       :.::::::.::    ..   : . .. :. . 
NP_001 ALLQSESGTAPV-WSKSTPPAP------DNGTSAWGEPN----ESSPGWGEMDDTGASTT
       180        190             200           210       220      

              930       940       950       960       970       980
pF1KSD REPNLPTPMTSKSASDSKSMQDGWGESDGPVTGARHPSWEEEEDGGVWNTTGSQGSASSH
          : :.   .    .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GWGNTPANAPNAMKPNSKSMQDGWGESDGPVTGARHPSWEEEEDGGVWNTTGSQGSASSH
        230       240       250       260       270       280      

              990      1000      1010      1020      1030      1040
pF1KSD NSASWGQGGKKQMKCSLKGGNNDSWMNPLAKQFSNMGLLSQTEDNPSSKMDLSVGSLSDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NSASWGQGGKKQMKCSLKGGNNDSWMNPLAKQFSNMGLLSQTEDNPSSKMDLSVGSLSDK
        290       300       310       320       330       340      

             1050      1060      1070      1080      1090      1100
pF1KSD KFDVDKRAMNLGDFNDIMRKDRSGFRPPNSKDMGTTDSGPYFEKGGSHGLFGNSTAQSRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KFDVDKRAMNLGDFNDIMRKDRSGFRPPNSKDMGTTDSGPYFEKGGSHGLFGNSTAQSRG
        350       360       370       380       390       400      

             1110      1120      1130      1140      1150      1160
pF1KSD LHTPVQPLNSSPSLRAQVPPQFISPQVSASMLKQFPNSGLSPGLFNVGPQLSPQQIAMLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LHTPVQPLNSSPSLRAQVPPQFISPQVSASMLKQFPNSGLSPGLFNVGPQLSPQQIAMLS
        410       420       430       440       450       460      

             1170      1180      1190      1200      1210          
pF1KSD QLPQIPQFQLACQLLLQQQQQQQLLQNQRKISQAVRQQQEQQLARMVSALQQQQQQQ-RQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
NP_001 QLPQIPQFQLACQLLLQQQQQQQLLQNQRKISQAVRQQQEQQLARMVSALQQQQQQQQRQ
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pF1KSD PGMKHSPSHPVGPKPHLDNMVPNALNVGLPDLQTKGPIPGYGSGFSSGGMDYGMVGGKEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PGMKHSPSHPVGPKPHLDNMVPNALNVGLPDLQTKGPIPGYGSGFSSGGMDYGMVGGKEA
        530       540       550       560       570       580      

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pF1KSD GTESRFKQWTSMMEGLPSVATQEANMHKNGAIVAPGKTRGGSPYNQFDIIPGDTLGGHTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GTESRFKQWTSMMEGLPSVATQEANMHKNGAIVAPGKTRGGSPYNQFDIIPGDTLGGHTG
        590       600       610       620       630       640      

    1340      1350      1360      1370      1380      1390         
pF1KSD PAGDSWLPAKSPPTNKIGSKSSNASWPPEFQPGVPWKGIQNIDPESDPYVTPGSVLGGTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PAGDSWLPAKSPPTNKIGSKSSNASWPPEFQPGVPWKGIQNIDPESDPYVTPGSVLGGTA
        650       660       670       680       690       700      

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pF1KSD TSPIVDTDHQLLRDNTTGSNSSLNTSLPSPGAWPYSASDNSFTNVHSTSAKFPDYKSTWS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TSPIVDTDHQLLRDNTTGSNSSLNTSLPSPGAWPYSASDNSFTNVHSTSAKFPDYKSTWS
        710       720       730       740       750       760      

    1460      1470      1480      1490      1500      1510         
pF1KSD PDPIGHNPTHLSNKMWKNHISSRNTTPLPRPPPGLTNPKPSSPWSSTAPRSVRGWGTQDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PDPIGHNPTHLSNKMWKNHISSRNTTPLPRPPPGLTNPKPSSPWSSTAPRSVRGWGTQDS
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pF1KSD RLASASTWSDGGSVRPSYWLVLHNLTPQIDGSTLRTICMQHGPLLTFHLNLTQGTALIRY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLASASTWSDGGSVRPSYWLVLHNLTPQIDGSTLRTICMQHGPLLTFHLNLTQGTALIRY
        830       840       850       860       870       880      

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pF1KSD STKQEAAKAQTALHMCVLGNTTILAEFATDDEVSRFLAQAQPPTPAATPSAPAAGWQSLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 STKQEAAKAQTALHMCVLGNTTILAEFATDDEVSRFLAQAQPPTPAATPSAPAAGWQSLE
        890       900       910       920       930       940      

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pF1KSD TGQNQSDPVGPALNLFGGSTGLGQWSSSAGGSSGADLAGASLWGPPNYSSSLWGVPTVED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TGQNQSDPVGPALNLFGGSTGLGQWSSSAGGSSGADLAGASLWGPPNYSSSLWGVPTVED
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pF1KSD PHRMGSPAPLLPGDLLGGGSDSI
       :::::::::::::::::::::::
NP_001 PHRMGSPAPLLPGDLLGGGSDSI
       1010      1020         

>>XP_016878638 (OMIM: 610739) PREDICTED: trinucleotide r  (1911 aa)
 initn: 1972 init1: 568 opt: 2476  Z-score: 1172.6  bits: 230.2 E(85289): 1.4e-58
Smith-Waterman score: 3361; 37.7% identity (62.9% similar) in 1798 aa overlap (138-1722:193-1911)

       110       120       130       140       150       160       
pF1KSD GQPPPPSCMLLGGGAGPPPCTAPGANPNNAQVTGALLQSESGTAPDSTLGGAAASNYANS
                                     : .: . .:.. .  . . .:   :.: ::
XP_016 HFPVIAANLGSAVKVLNSQSESSALTNQQPQNNGEVQNSKNQSDINHSTSG---SHYENS
            170       180       190       200       210            

       170       180       190       200       210       220       
pF1KSD TWGSGASSNNGTSPNPIHIWDKVIVDGSDMEEWPCIASKDTESSSENTTDNNSASNPGSE
         :  .::.. .: :     . :. : :. : ::   ..: : .::   : .:::.  ::
XP_016 QRGP-VSSTSDSSTN---CKNAVVSDLSEKEAWPSAPGSDPELASE-CMDADSASSSESE
     220        230          240       250       260        270    

       230                 240             250       260           
pF1KSD KSTL---PGSTTSNK-------GKGSQCQ------SASSGNECNLGVWKSDPKAK-----
       ..      :.: ..:       : ::: .      : . :.  . : :  .  :      
XP_016 RNITIMASGNTGGEKDGLRNSTGLGSQNKFVVGSSSNNVGHGSSTGPWGFSHGAIISTCQ
          280       290       300       310       320       330    

         270        280       290       300       310       320    
pF1KSD -SVQSSNSTTEN-NNGLGNWRNVSGQDRIGPGSGFSNFNPNSNPSAWPALVQEGTSRKGA
        ::.. .: .:. :: .. : .::...  . : . :..:  :: .:::.: ..: . :: 
XP_016 VSVDAPESKSESSNNRMNAWGTVSSSS--NGGLNPSTLNSASNHGAWPVLENNGLALKGP
          340       350       360         370       380       390  

          330       340         350                          360   
pF1KSD LETDNSNSSAQVSTVGQTSREQQ--SKM------------------ENAGVNFV-VSGRE
       . . .:. . : ::.::   .:.  ::.                  : .:.. :  ::. 
XP_016 VGSGSSGINIQCSTIGQMPNNQSINSKVSGGSTHGTWGSLQETCESEVSGTQKVSFSGQP
            400       410       420       430       440       450  

           370       380         390       400             410     
pF1KSD QAQIHNTDGPKNGNTNSLNLSSPNP--MENKGMPFGMGLGNTSRST------DAPSQ---
       :    .  :: :..:: .. : ::   ..:. .: . . :    ::      .:::    
XP_016 QNITTEMTGP-NNTTNFMTSSLPNSGSVQNNELP-SSNTGAWRVSTMNHPQMQAPSGMNG
            460        470       480        490       500       510

                  420       430       440        450       460     
pF1KSD ------STGDRKTGSVGSWGAARGPSGTDTVSGQSNSGNNGN-NGKEREDSWKGASVQKS
             :.:. :.:  ::.:.. :  :..  ::.. :: ::. ::    :. ... .: .
XP_016 TSLSHLSNGESKSG--GSYGTTWGAYGSN-YSGDKCSGPNGQANG----DTVNATLMQPG
              520         530        540       550           560   

          470       480       490       500       510          520 
pF1KSD T-GSKNDSWDNNNRSTGGSWNFGPQDSNDNKWGEGNKMTSGVSQGEWKQP---TGSDELK
       . :  . ... :. . :: :. :  .:....:: ::  .:: :.  :  :   ::.. : 
XP_016 VNGPMGTNFQVNTNKGGGVWESGAANSQSTSWGSGNGANSGGSRRGWGTPAQNTGTN-LP
           570       580       590       600       610       620   

              530       540             550             560        
pF1KSD IGEWSG-PNQPNSSTGAWDNQKGHP------LPENQGNA------QAPCWGRSSSSTGSE
         ::.  :.. .:. .:  : :           :.::.:      :.  :....... :.
XP_016 SVEWNKLPSNQHSNDSANGNGKTFTNGWKSTEEEDQGSATSQTNEQSSVWAKTGGTVESD
            630       640       650       660       670       680  

      570       580       590       600       610       620        
pF1KSD VGGQSTGSNHKAGSSDSHNSGRRSYRPTHPDCQAVLQTLLSRTDLDPRVLSNTGWGQTQI
        . .:::  .. :...:..  ::.      : ...::....:::::::::::.::::: :
XP_016 GSTESTGRLEEKGTGESQSRDRRKI-----DQHTLLQSIVNRTDLDPRVLSNSGWGQTPI
            690       700            710       720       730       

      630       640       650       660         670        680     
pF1KSD KQDTVWDIEEVPRPEGKSDKGTEGWESAATQTKNSGGWGD--APSQSNQMK-SGWGELSA
       ::.:.:: :  :: : :.:.:::.: :.:::: :::.  :  .:. ..  . ::::. . 
XP_016 KQNTAWDTETSPRGERKTDNGTEAWGSSATQTFNSGACIDKTSPNGNDTSSVSGWGDPKP
       740       750       760       770       780       790       

         690          700           710       720       730        
pF1KSD STEWKDPKNT---GGWNDYKNNN----SSNWGGGRPDEKTPSSWNENPSKDQGWGGGRQP
       . .: : :..   :::.: .  .    :..::. . .::  ..::.. .. :::: :.. 
XP_016 ALRWGDSKGSNCQGGWEDDSAATGMVKSNQWGNCK-EEK--AAWNDSQKNKQGWGDGQKS
       800       810       820       830          840       850    

      740        750               760       770       780         
pF1KSD NQGWS-SGKNGWGE--------EVDQTKNSNWESSASKPVSGWGEGGQNEIGTWGNGGNA
       .:::: :....:::        :... :.:.  :.... ::::.: :..   ::::. : 
XP_016 SQGWSVSASDNWGETSRNNHWGEANK-KSSSGGSDSDRSVSGWNELGKTSSFTWGNNINP
          860       870       880        890       900       910   

     790        800         810         820       830       840    
pF1KSD SLASKGGW-EDCKRSPA--WNETGRQPNS--WNKQHQQQQPPQQPPPPQPEASGSWGGPP
       . .:  :: :. : .:.  :..  .. .:  :. . .  . :.     : .  ::::   
XP_016 NNSS--GWDESSKPTPSQGWGDPPKSNQSLGWGDSSKPVSSPDWNK--QQDIVGSWG---
             920       930       940       950         960         

          850       860       870       880       890       900    
pF1KSD PPPPGNVRPSNSSWSSGPQPATPKDEEPSGWEEPSPQSISRKMDIDDGTSAWGDPNSYNY
         ::.. .: ...: .:: ::  :.:::.:::::::.:: :::.:::::::::::..:::
XP_016 -IPPATGKPPGTGWLGGPIPAPAKEEEPTGWEEPSPESIRRKMEIDDGTSAWGDPSKYNY
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pF1KSD KNVNLWDKNSQGG---------------PAPR-----------------EPNLPT-----
       ::::.:.::  .:               ::                   ::. :.     
XP_016 KNVNMWNKNVPNGNSRSDQQAQVHQLLTPASAISNKEASSGSGWGEPWGEPSTPATTVDN
        1030      1040      1050      1060      1070      1080     

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pF1KSD -----------------PMTSKSASDS----------------KSMQDGWGESDGPVTGA
                        :... :....                :::::::  .: :. : 
XP_016 GTSAWGKPIDSGPSWGEPIAAASSTSTWGSSSVGPQALSKSGPKSMQDGWCGDDMPLPGN
        1090      1100      1110      1120      1130      1140     

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pF1KSD RHPSWEEEEDG--GVWNTTGSQGSASSHNSASWGQGGKKQM-KCSLKGGNN--DSWMNPL
       :  .::::::   :.::...::   :: :   :    ::.  :  .::::.  ..:.::.
XP_016 RPTGWEEEEDVEIGMWNSNSSQELNSSLN---WPPYTKKMSSKGMMKGGNKQEEAWINPF
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pF1KSD AKQFSNMGLL--SQTEDNPSSKMDLSVGSLSDKKFDVDKRAMNLGDFNDIMRKDRSGFRP
       .:::::...   :  :.  :.::::: : :.::....::...:.::.:  . :   : ::
XP_016 VKQFSNISFSRDSPEENVQSNKMDLSGGMLQDKRMEIDKHSLNIGDYNRTVGKG-PGSRP
           1210      1220      1230      1240      1250       1260 

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pF1KSD PNSKDMGTTDSGPYFEKGGSHGLFG--NSTAQSRGLHTP-VQPLNSS-PSLRAQVPPQFI
         ::. .. . .:::.:.:. ..::  :..:: ::.. : .:::.:: :.::::::: ..
XP_016 QISKE-SSMERNPYFDKNGNPSMFGVGNTAAQPRGMQQPPAQPLSSSQPNLRAQVPPPLL
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pF1KSD SPQVSASMLKQFPNSGLSPGLFNVGPQLSPQQIAMLSQLPQIPQFQLACQL--LLQQQQQ
       :::: .:.::  ::.:   ::   .: ..:::.:::.:: :. :..   ::  :: :::.
XP_016 SPQVPVSLLKYAPNNG---GL---NPLFGPQQVAMLNQLSQLNQLSQISQLQRLLAQQQR
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pF1KSD QQLLQNQRKISQAVRQQQEQQLARMVSALQQQQQQQRQ-----------PGMKHSPSHPV
           :.::.. .. : ::.:: .: .:. ::..::.::           :  ...: :  
XP_016 A---QSQRSVPSGNRPQQDQQ-GRPLSVQQQMMQQSRQLDPNLLVKQQTPPSQQQPLHQP
            1380      1390       1400      1410      1420      1430

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pF1KSD GPKPHLDNMVPNALNVGLPDLQTKGPIP-----GYGSGFSSG-GMDYGMVGGKEAGTESR
       . :  :::..:..     :.:: ::: :     ..  :..:. .... : . ::   .::
XP_016 AMKSFLDNVMPHTT----PELQ-KGPSPINAFSNFPIGLNSNLNVNMDMNSIKEP--QSR
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pF1KSD FKQWTSMMEGLPSVATQEANMHKNGAIVAPGKTRGGSPYNQFDIIPGDTL-GGHTGPAGD
       ...::.. ...   .. . :  :.::: . :     ::.  .:.. ..:  ..  :  ::
XP_016 LRKWTTV-DSISVNTSLDQNSSKHGAI-SSGFRLEESPFVPYDFMNSSTSPASPPGSIGD
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pF1KSD SWLPAKSPPTNKIGSKSSNASWPPEFQPGVPWKGIQNIDPESDPYVTPGSVLGGTATSPI
       .:  ::::      . ::...:::::.:: ::::  :::::.:::::::::... . . .
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pF1KSD VDTDHQLLRDNTTGSNSSLNTSLPSPGAWP-YSASDNSF---TNVHSTSAKFPDYKSTWS
        ..::  ::: ..::.:::::.::: .::    ::. .    ....::::.  : : :::
XP_016 REVDH--LRDRNSGSSSSLNTTLPSTSAWSSIRASNYNVPLSSTAQSTSARNSDSKLTWS
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pF1KSD PDPIGHNPTHLSNKMWKNHISSRNTTPLPRPPPGLTNPKPS-SPWSSTAPRSVRGWGTQD
       :  . .  : :....::  .  .: :   :::::::. ::  : :...  :   :::..:
XP_016 PGSVTN--TSLAHELWKVPLPPKNITAPSRPPPGLTGQKPPLSTWDNSPLRIGGGWGNSD
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pF1KSD SRLASASTWSDGGSVRPSYWLVLHNLTPQIDGSTLRTICMQHGPLLTFHLNLTQGTALIR
       .: . .:.:....: : . ::::.:::::::::::::.:::::::.:::::: .:.::.:
XP_016 ARYTPGSSWGESSSGRITNWLVLKNLTPQIDGSTLRTLCMQHGPLITFHLNLPHGNALVR
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pF1KSD YSTKQEAAKAQTALHMCVLGNTTILAEFATDDEVSRFLAQAQPPTPAATPSAPAAGWQSL
       ::.:.:..::: .::::::::::::::::...:.:::.::.:  ::  .:     :::::
XP_016 YSSKEEVVKAQKSLHMCVLGNTTILAEFASEEEISRFFAQSQSLTP--SP-----GWQSL
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pF1KSD ETGQNQSDPVGPALNLFGGSTGLGQWSSSA-GGSSGADLAGASLWGPPNYSSSLWGVPTV
        ..:..   .  . . :.. : :..:.... .:.. .:: :.:::: :.::.:::: :. 
XP_016 GSSQSRLGSLDCSHS-FSSRTDLNHWNGAGLSGTNCGDLHGTSLWGTPHYSTSLWGPPSS
         1830       1840      1850      1860      1870      1880   

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pF1KSD EDPHRMGSPAPL---LPGDLLGGGSDSI
        ::. ..::.:.   :  : ::::..:.
XP_016 SDPRGISSPSPINAFLSVDHLGGGGESM
          1890      1900      1910 

>>NP_001317449 (OMIM: 610739) trinucleotide repeat-conta  (1913 aa)
 initn: 1945 init1: 568 opt: 2343  Z-score: 1110.4  bits: 218.7 E(85289): 4.1e-55
Smith-Waterman score: 3358; 37.6% identity (62.8% similar) in 1806 aa overlap (138-1722:184-1913)

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pF1KSD GQPPPPSCMLLGGGAGPPPCTAPGANPNNAQVTGALLQSESGTAPDSTLGGAAASNYANS
                                     : .: . .:.. .  . . .:   :.: ::
NP_001 HFPVIAANLGSAVKVLNSQSESSALTNQQPQNNGEVQNSKNQSDINHSTSG---SHYENS
           160       170       180       190       200          210

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pF1KSD TWGSGASSNNGTSPNPIHIWDKVIVDGSDMEEWPCIASKDTESSSENTTDNNSASNPGSE
         :  .::.. .: :     . :. : :. : ::   ..: : .::   : .:::.  ::
NP_001 QRGP-VSSTSDSSTN---CKNAVVSDLSEKEAWPSAPGSDPELASE-CMDADSASSSESE
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pF1KSD KSTL---PGSTTSNK-------GKGSQCQ------SASSGNECNLGVWKSDPKAK-----
       ..      :.: ..:       : ::: .      : . :.  . : :  .  :      
NP_001 RNITIMASGNTGGEKDGLRNSTGLGSQNKFVVGSSSNNVGHGSSTGPWGFSHGAIISTCQ
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pF1KSD -SVQSSNSTTEN-NNGLGNWRNVSGQDRIGPGSGFSNFNPNSNPSAWPALVQEGTSRKGA
        ::.. .: .:. :: .. : .::...  . : . :..:  :: .:::.: ..: . :: 
NP_001 VSVDAPESKSESSNNRMNAWGTVSSSS--NGGLNPSTLNSASNHGAWPVLENNGLALKGP
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pF1KSD LETDNSNSSAQVSTVGQTSREQQ--SKM------------------ENAGVNFV-VSGRE
       . . .:. . : ::.::   .:.  ::.                  : .:.. :  ::. 
NP_001 VGSGSSGINIQCSTIGQMPNNQSINSKVSGGSTHGTWGSLQETCESEVSGTQKVSFSGQP
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pF1KSD QAQIHNTDGPKNGNTNSLNLSSPNP--MENKGMPFGMGLGNTSRST------DAPSQ---
       :    .  :: :..:: .. : ::   ..:. .: . . :    ::      .:::    
NP_001 QNITTEMTGP-NNTTNFMTSSLPNSGSVQNNELP-SSNTGAWRVSTMNHPQMQAPSGMNG
           450        460       470        480       490       500 

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pF1KSD ------STGDRKTGSVGSWGAARGPSGTDTVSGQSNSGNNGN-NGKEREDSWKGASVQKS
             :.:. :.:  ::.:.. :  :..  ::.. :: ::. ::    :. ... .: .
NP_001 TSLSHLSNGESKSG--GSYGTTWGAYGSN-YSGDKCSGPNGQANG----DTVNATLMQPG
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pF1KSD T-GSKNDSWDNNNRSTGGSWNFGPQDSNDNKWGEGNKMTSGVSQGEWKQP---TGSDELK
       . :  . ... :. . :: :. :  .:....:: ::  .:: :.  :  :   ::.. : 
NP_001 VNGPMGTNFQVNTNKGGGVWESGAANSQSTSWGSGNGANSGGSRRGWGTPAQNTGTN-LP
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pF1KSD IGEWSG-PNQPNSSTGAWDNQKGHP------LPENQGNA------QAPCWGRSSSSTGSE
         ::.  :.. .:. .:  : :           :.::.:      :.  :....... :.
NP_001 SVEWNKLPSNQHSNDSANGNGKTFTNGWKSTEEEDQGSATSQTNEQSSVWAKTGGTVESD
           620       630       640       650       660       670   

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pF1KSD VGGQSTGSNHKAGSSDSHNSGRRSYRPTHPDCQAVLQTLLSRTDLDPRVLSNTGWGQTQI
        . .:::  .. :...:..  ::.      : ...::....:::::::::::.::::: :
NP_001 GSTESTGRLEEKGTGESQSRDRRKI-----DQHTLLQSIVNRTDLDPRVLSNSGWGQTPI
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pF1KSD KQDTVWDIEEVPRPEGKSDKGTEGWESAATQTKNSGGWGD--APSQSNQMK-SGWGELSA
       ::.:.:: :  :: : :.:.:::.: :.:::: :::.  :  .:. ..  . ::::. . 
NP_001 KQNTAWDTETSPRGERKTDNGTEAWGSSATQTFNSGACIDKTSPNGNDTSSVSGWGDPKP
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pF1KSD STEWKDPKNT---GGWNDYKNNN----SSNWGGGRPDEKTPSSWNENPSKDQGWGGGRQP
       . .: : :..   :::.: .  .    :..::. . .::  ..::.. .. :::: :.. 
NP_001 ALRWGDSKGSNCQGGWEDDSAATGMVKSNQWGNCK-EEK--AAWNDSQKNKQGWGDGQKS
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pF1KSD NQGWS-SGKNGWGE--------EVDQTKNSNWESSASKPVSGWGEGGQNEIGTWGNGGNA
       .:::: :....:::        :... :.:.  :.... ::::.: :..   ::::. : 
NP_001 SQGWSVSASDNWGETSRNNHWGEANK-KSSSGGSDSDRSVSGWNELGKTSSFTWGNNINP
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pF1KSD SLASKGGW-EDCKRSPA--WNETGRQPNS--WNKQHQQQQPPQQPPPPQPEASGSWGGPP
       . .:  :: :. : .:.  :..  .. .:  :. . .  . :.     : .  ::::   
NP_001 NNSS--GWDESSKPTPSQGWGDPPKSNQSLGWGDSSKPVSSPDWNK--QQDIVGSWG---
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pF1KSD PPPPGNVRPSNSSWSSGPQPATPKDEEPSGWEEPSPQSISRKMDIDDGTSAWGDPNSYNY
         ::.. .: ...: .:: ::  :.:::.:::::::.:: :::.:::::::::::..:::
NP_001 -IPPATGKPPGTGWLGGPIPAPAKEEEPTGWEEPSPESIRRKMEIDDGTSAWGDPSKYNY
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       ::::.:.::  .:               ::                   ::. :.     
NP_001 KNVNMWNKNVPNGNSRSDQQAQVHQLLTPASAISNKEASSGSGWGEPWGEPSTPATTVDN
       1020      1030      1040      1050      1060      1070      

                        930                       940       950    
pF1KSD -----------------PMTSKSASDS----------------KSMQDGWGESDGPVTGA
                        :... :....                :::::::  .: :. : 
NP_001 GTSAWGKPIDSGPSWGEPIAAASSTSTWGSSSVGPQALSKSGPKSMQDGWCGDDMPLPGN
       1080      1090      1100      1110      1120      1130      

          960         970       980              990        1000   
pF1KSD RHPSWEEEEDG--GVWNTTGSQGSASSHN-------SASWGQGGKKQMKCS--LKGGNN-
       :  .::::::   :.::...::   :: :        .: : .:::. .    .::::. 
NP_001 RPTGWEEEEDVEIGMWNSNSSQELNSSLNWPPYTKKMSSKGLSGKKRRRERGMMKGGNKQ
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pF1KSD -DSWMNPLAKQFSNMGLL--SQTEDNPSSKMDLSVGSLSDKKFDVDKRAMNLGDFNDIMR
        ..:.::..:::::...   :  :.  :.::::: : :.::....::...:.::.:  . 
NP_001 EEAWINPFVKQFSNISFSRDSPEENVQSNKMDLSGGMLQDKRMEIDKHSLNIGDYNRTVG
       1200      1210      1220      1230      1240      1250      

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pF1KSD KDRSGFRPPNSKDMGTTDSGPYFEKGGSHGLFG--NSTAQSRGLHTP-VQPLNSS-PSLR
       :   : ::  ::. .. . .:::.:.:. ..::  :..:: ::.. : .:::.:: :.::
NP_001 KG-PGSRPQISKE-SSMERNPYFDKNGNPSMFGVGNTAAQPRGMQQPPAQPLSSSQPNLR
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pF1KSD AQVPPQFISPQVSASMLKQFPNSGLSPGLFNVGPQLSPQQIAMLSQLPQIPQFQLACQL-
       ::::: ..:::: .:.::  ::.:   ::   .: ..:::.:::.:: :. :..   :: 
NP_001 AQVPPPLLSPQVPVSLLKYAPNNG---GL---NPLFGPQQVAMLNQLSQLNQLSQISQLQ
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pF1KSD -LLQQQQQQQLLQNQRKISQAVRQQQEQQLARMVSALQQQQQQQRQ-----------PGM
        :: :::.    :.::.. .. : ::.:: .: .:. ::..::.::           :  
NP_001 RLLAQQQRA---QSQRSVPSGNRPQQDQQ-GRPLSVQQQMMQQSRQLDPNLLVKQQTPPS
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pF1KSD KHSPSHPVGPKPHLDNMVPNALNVGLPDLQTKGPIP-----GYGSGFSSG-GMDYGMVGG
       ...: :  . :  :::..:..     :.:: ::: :     ..  :..:. .... : . 
NP_001 QQQPLHQPAMKSFLDNVMPHTT----PELQ-KGPSPINAFSNFPIGLNSNLNVNMDMNSI
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pF1KSD KEAGTESRFKQWTSMMEGLPSVATQEANMHKNGAIVAPGKTRGGSPYNQFDIIPGDTL-G
       ::   .::...::.. ...   .. . :  :.::: . :     ::.  .:.. ..:  .
NP_001 KEP--QSRLRKWTTV-DSISVNTSLDQNSSKHGAI-SSGFRLEESPFVPYDFMNSSTSPA
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pF1KSD GHTGPAGDSWLPAKSPPTNKIGSKSSNASWPPEFQPGVPWKGIQNIDPESDPYVTPGSVL
       .  :  ::.:  ::::      . ::...:::::.:: ::::  :::::.:::::::::.
NP_001 SPPGSIGDGWPRAKSP------NGSSSVNWPPEFRPGEPWKGYPNIDPETDPYVTPGSVI
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pF1KSD GGTATSPIVDTDHQLLRDNTTGSNSSLNTSLPSPGAWP-YSASDNSF---TNVHSTSAKF
       .. . . . ..::  ::: ..::.:::::.::: .::    ::. .    ....::::. 
NP_001 NNLSINTVREVDH--LRDRNSGSSSSLNTTLPSTSAWSSIRASNYNVPLSSTAQSTSARN
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pF1KSD PDYKSTWSPDPIGHNPTHLSNKMWKNHISSRNTTPLPRPPPGLTNPKPS-SPWSSTAPRS
        : : ::::  . .  : :....::  .  .: :   :::::::. ::  : :...  : 
NP_001 SDSKLTWSPGSVTN--TSLAHELWKVPLPPKNITAPSRPPPGLTGQKPPLSTWDNSPLRI
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pF1KSD VRGWGTQDSRLASASTWSDGGSVRPSYWLVLHNLTPQIDGSTLRTICMQHGPLLTFHLNL
         :::..:.: . .:.:....: : . ::::.:::::::::::::.:::::::.::::::
NP_001 GGGWGNSDARYTPGSSWGESSSGRITNWLVLKNLTPQIDGSTLRTLCMQHGPLITFHLNL
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pF1KSD TQGTALIRYSTKQEAAKAQTALHMCVLGNTTILAEFATDDEVSRFLAQAQPPTPAATPSA
        .:.::.:::.:.:..::: .::::::::::::::::...:.:::.::.:  ::  .:  
NP_001 PHGNALVRYSSKEEVVKAQKSLHMCVLGNTTILAEFASEEEISRFFAQSQSLTP--SP--
        1770      1780      1790      1800      1810        1820   

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pF1KSD PAAGWQSLETGQNQSDPVGPALNLFGGSTGLGQWSSSA-GGSSGADLAGASLWGPPNYSS
          ::::: ..:..   .  . . :.. : :..:.... .:.. .:: :.:::: :.::.
NP_001 ---GWQSLGSSQSRLGSLDCSHS-FSSRTDLNHWNGAGLSGTNCGDLHGTSLWGTPHYST
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pF1KSD SLWGVPTVEDPHRMGSPAPL---LPGDLLGGGSDSI
       :::: :.  ::. ..::.:.   :  : ::::..:.
NP_001 SLWGPPSSSDPRGISSPSPINAFLSVDHLGGGGESM
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>>XP_016878636 (OMIM: 610739) PREDICTED: trinucleotide r  (1922 aa)
 initn: 1945 init1: 568 opt: 2343  Z-score: 1110.4  bits: 218.7 E(85289): 4.1e-55
Smith-Waterman score: 3358; 37.6% identity (62.8% similar) in 1806 aa overlap (138-1722:193-1922)

       110       120       130       140       150       160       
pF1KSD GQPPPPSCMLLGGGAGPPPCTAPGANPNNAQVTGALLQSESGTAPDSTLGGAAASNYANS
                                     : .: . .:.. .  . . .:   :.: ::
XP_016 HFPVIAANLGSAVKVLNSQSESSALTNQQPQNNGEVQNSKNQSDINHSTSG---SHYENS
            170       180       190       200       210            

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pF1KSD TWGSGASSNNGTSPNPIHIWDKVIVDGSDMEEWPCIASKDTESSSENTTDNNSASNPGSE
         :  .::.. .: :     . :. : :. : ::   ..: : .::   : .:::.  ::
XP_016 QRGP-VSSTSDSSTN---CKNAVVSDLSEKEAWPSAPGSDPELASE-CMDADSASSSESE
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pF1KSD KSTL---PGSTTSNK-------GKGSQCQ------SASSGNECNLGVWKSDPKAK-----
       ..      :.: ..:       : ::: .      : . :.  . : :  .  :      
XP_016 RNITIMASGNTGGEKDGLRNSTGLGSQNKFVVGSSSNNVGHGSSTGPWGFSHGAIISTCQ
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pF1KSD -SVQSSNSTTEN-NNGLGNWRNVSGQDRIGPGSGFSNFNPNSNPSAWPALVQEGTSRKGA
        ::.. .: .:. :: .. : .::...  . : . :..:  :: .:::.: ..: . :: 
XP_016 VSVDAPESKSESSNNRMNAWGTVSSSS--NGGLNPSTLNSASNHGAWPVLENNGLALKGP
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pF1KSD LETDNSNSSAQVSTVGQTSREQQ--SKM------------------ENAGVNFV-VSGRE
       . . .:. . : ::.::   .:.  ::.                  : .:.. :  ::. 
XP_016 VGSGSSGINIQCSTIGQMPNNQSINSKVSGGSTHGTWGSLQETCESEVSGTQKVSFSGQP
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pF1KSD QAQIHNTDGPKNGNTNSLNLSSPNP--MENKGMPFGMGLGNTSRST------DAPSQ---
       :    .  :: :..:: .. : ::   ..:. .: . . :    ::      .:::    
XP_016 QNITTEMTGP-NNTTNFMTSSLPNSGSVQNNELP-SSNTGAWRVSTMNHPQMQAPSGMNG
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pF1KSD ------STGDRKTGSVGSWGAARGPSGTDTVSGQSNSGNNGN-NGKEREDSWKGASVQKS
             :.:. :.:  ::.:.. :  :..  ::.. :: ::. ::    :. ... .: .
XP_016 TSLSHLSNGESKSG--GSYGTTWGAYGSN-YSGDKCSGPNGQANG----DTVNATLMQPG
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pF1KSD T-GSKNDSWDNNNRSTGGSWNFGPQDSNDNKWGEGNKMTSGVSQGEWKQP---TGSDELK
       . :  . ... :. . :: :. :  .:....:: ::  .:: :.  :  :   ::.. : 
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pF1KSD IGEWSG-PNQPNSSTGAWDNQKGHP------LPENQGNA------QAPCWGRSSSSTGSE
         ::.  :.. .:. .:  : :           :.::.:      :.  :....... :.
XP_016 SVEWNKLPSNQHSNDSANGNGKTFTNGWKSTEEEDQGSATSQTNEQSSVWAKTGGTVESD
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pF1KSD VGGQSTGSNHKAGSSDSHNSGRRSYRPTHPDCQAVLQTLLSRTDLDPRVLSNTGWGQTQI
        . .:::  .. :...:..  ::.      : ...::....:::::::::::.::::: :
XP_016 GSTESTGRLEEKGTGESQSRDRRKI-----DQHTLLQSIVNRTDLDPRVLSNSGWGQTPI
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pF1KSD KQDTVWDIEEVPRPEGKSDKGTEGWESAATQTKNSGGWGD--APSQSNQMK-SGWGELSA
       ::.:.:: :  :: : :.:.:::.: :.:::: :::.  :  .:. ..  . ::::. . 
XP_016 KQNTAWDTETSPRGERKTDNGTEAWGSSATQTFNSGACIDKTSPNGNDTSSVSGWGDPKP
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pF1KSD STEWKDPKNT---GGWNDYKNNN----SSNWGGGRPDEKTPSSWNENPSKDQGWGGGRQP
       . .: : :..   :::.: .  .    :..::. . .::  ..::.. .. :::: :.. 
XP_016 ALRWGDSKGSNCQGGWEDDSAATGMVKSNQWGNCK-EEK--AAWNDSQKNKQGWGDGQKS
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pF1KSD NQGWS-SGKNGWGE--------EVDQTKNSNWESSASKPVSGWGEGGQNEIGTWGNGGNA
       .:::: :....:::        :... :.:.  :.... ::::.: :..   ::::. : 
XP_016 SQGWSVSASDNWGETSRNNHWGEANK-KSSSGGSDSDRSVSGWNELGKTSSFTWGNNINP
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pF1KSD SLASKGGW-EDCKRSPA--WNETGRQPNS--WNKQHQQQQPPQQPPPPQPEASGSWGGPP
       . .:  :: :. : .:.  :..  .. .:  :. . .  . :.     : .  ::::   
XP_016 NNSS--GWDESSKPTPSQGWGDPPKSNQSLGWGDSSKPVSSPDWNK--QQDIVGSWG---
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pF1KSD PPPPGNVRPSNSSWSSGPQPATPKDEEPSGWEEPSPQSISRKMDIDDGTSAWGDPNSYNY
         ::.. .: ...: .:: ::  :.:::.:::::::.:: :::.:::::::::::..:::
XP_016 -IPPATGKPPGTGWLGGPIPAPAKEEEPTGWEEPSPESIRRKMEIDDGTSAWGDPSKYNY
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pF1KSD KNVNLWDKNSQGG---------------PAPR-----------------EPNLPT-----
       ::::.:.::  .:               ::                   ::. :.     
XP_016 KNVNMWNKNVPNGNSRSDQQAQVHQLLTPASAISNKEASSGSGWGEPWGEPSTPATTVDN
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pF1KSD -----------------PMTSKSASDS----------------KSMQDGWGESDGPVTGA
                        :... :....                :::::::  .: :. : 
XP_016 GTSAWGKPIDSGPSWGEPIAAASSTSTWGSSSVGPQALSKSGPKSMQDGWCGDDMPLPGN
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pF1KSD RHPSWEEEEDG--GVWNTTGSQGSASSHN-------SASWGQGGKKQMKCS--LKGGNN-
       :  .::::::   :.::...::   :: :        .: : .:::. .    .::::. 
XP_016 RPTGWEEEEDVEIGMWNSNSSQELNSSLNWPPYTKKMSSKGLSGKKRRRERGMMKGGNKQ
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pF1KSD -DSWMNPLAKQFSNMGLL--SQTEDNPSSKMDLSVGSLSDKKFDVDKRAMNLGDFNDIMR
        ..:.::..:::::...   :  :.  :.::::: : :.::....::...:.::.:  . 
XP_016 EEAWINPFVKQFSNISFSRDSPEENVQSNKMDLSGGMLQDKRMEIDKHSLNIGDYNRTVG
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       :   : ::  ::. .. . .:::.:.:. ..::  :..:: ::.. : .:::.:: :.::
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pF1KSD AQVPPQFISPQVSASMLKQFPNSGLSPGLFNVGPQLSPQQIAMLSQLPQIPQFQLACQL-
       ::::: ..:::: .:.::  ::.:   ::   .: ..:::.:::.:: :. :..   :: 
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        :: :::.    :.::.. .. : ::.:: .: .:. ::..::.::           :  
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pF1KSD KHSPSHPVGPKPHLDNMVPNALNVGLPDLQTKGPIP-----GYGSGFSSG-GMDYGMVGG
       ...: :  . :  :::..:..     :.:: ::: :     ..  :..:. .... : . 
XP_016 QQQPLHQPAMKSFLDNVMPHTT----PELQ-KGPSPINAFSNFPIGLNSNLNVNMDMNSI
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pF1KSD KEAGTESRFKQWTSMMEGLPSVATQEANMHKNGAIVAPGKTRGGSPYNQFDIIPGDTL-G
       ::   .::...::.. ...   .. . :  :.::: . :     ::.  .:.. ..:  .
XP_016 KEP--QSRLRKWTTV-DSISVNTSLDQNSSKHGAI-SSGFRLEESPFVPYDFMNSSTSPA
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pF1KSD GHTGPAGDSWLPAKSPPTNKIGSKSSNASWPPEFQPGVPWKGIQNIDPESDPYVTPGSVL
       .  :  ::.:  ::::      . ::...:::::.:: ::::  :::::.:::::::::.
XP_016 SPPGSIGDGWPRAKSP------NGSSSVNWPPEFRPGEPWKGYPNIDPETDPYVTPGSVI
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pF1KSD GGTATSPIVDTDHQLLRDNTTGSNSSLNTSLPSPGAWP-YSASDNSF---TNVHSTSAKF
       .. . . . ..::  ::: ..::.:::::.::: .::    ::. .    ....::::. 
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pF1KSD PDYKSTWSPDPIGHNPTHLSNKMWKNHISSRNTTPLPRPPPGLTNPKPS-SPWSSTAPRS
        : : ::::  . .  : :....::  .  .: :   :::::::. ::  : :...  : 
XP_016 SDSKLTWSPGSVTN--TSLAHELWKVPLPPKNITAPSRPPPGLTGQKPPLSTWDNSPLRI
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pF1KSD VRGWGTQDSRLASASTWSDGGSVRPSYWLVLHNLTPQIDGSTLRTICMQHGPLLTFHLNL
         :::..:.: . .:.:....: : . ::::.:::::::::::::.:::::::.::::::
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pF1KSD TQGTALIRYSTKQEAAKAQTALHMCVLGNTTILAEFATDDEVSRFLAQAQPPTPAATPSA
        .:.::.:::.:.:..::: .::::::::::::::::...:.:::.::.:  ::  .:  
XP_016 PHGNALVRYSSKEEVVKAQKSLHMCVLGNTTILAEFASEEEISRFFAQSQSLTP--SP--
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pF1KSD PAAGWQSLETGQNQSDPVGPALNLFGGSTGLGQWSSSA-GGSSGADLAGASLWGPPNYSS
          ::::: ..:..   .  . . :.. : :..:.... .:.. .:: :.:::: :.::.
XP_016 ---GWQSLGSSQSRLGSLDCSHS-FSSRTDLNHWNGAGLSGTNCGDLHGTSLWGTPHYST
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pF1KSD SLWGVPTVEDPHRMGSPAPL---LPGDLLGGGSDSI
       :::: :.  ::. ..::.:.   :  : ::::..:.
XP_016 SLWGPPSSSDPRGISSPSPINAFLSVDHLGGGGESM
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>>XP_016878640 (OMIM: 610739) PREDICTED: trinucleotide r  (1863 aa)
 initn: 1945 init1: 568 opt: 2308  Z-score: 1094.2  bits: 215.7 E(85289): 3.3e-54
Smith-Waterman score: 3582; 38.9% identity (64.6% similar) in 1814 aa overlap (76-1722:131-1863)

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pF1KSD SLSQPTAASPIGSSPSPPVNGGNNAKRVAVPNGQPPSAARYMPREVPPRFRCQQDHKVLL
                                     :. :: .  :: ::::::::: .:.:: ::
XP_016 NQQPQQQQQQQQPQQQQPQQQPQPQPQQQQPQQQPQALPRY-PREVPPRFR-HQEHKQLL
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pF1KSD KRGQPPPPSCMLLGGGAGPPPCTAPGANPNNAQV--TGALLQSESGTAPDSTLGGAAASN
       ::::  :     ::...      . ..  .: :   .: . .:.. .  . . .:   :.
XP_016 KRGQHFPVIAANLGSAVKVLNSQSESSALTNQQPQNNGEVQNSKNQSDINHSTSG---SH
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pF1KSD YANSTWGSGASSNNGTSPNPIHIWDKVIVDGSDMEEWPCIASKDTESSSENTTDNNSASN
       : ::  :  .::.. .: :     . :. : :. : ::   ..: : .::   : .:::.
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         ::..      :.: ..:       : ::: .      : . :.  . : :  .  :  
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            ::.. .: .:. :: .. : .::...  . : . :..:  :: .:::.: ..: .
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pF1KSD RKGALETDNSNSSAQVSTVGQTSREQQ--SKM------------------ENAGVNFV-V
        :: . . .:. . : ::.::   .:.  ::.                  : .:.. :  
XP_016 LKGPVGSGSSGINIQCSTIGQMPNNQSINSKVSGGSTHGTWGSLQETCESEVSGTQKVSF
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pF1KSD SGREQAQIHNTDGPKNGNTNSLNLSSPNP--MENKGMPFGMGLGNTSRST------DAPS
       ::. :    .  :: :..:: .. : ::   ..:. .: . . :    ::      .:::
XP_016 SGQPQNITTEMTGP-NNTTNFMTSSLPNSGSVQNNELP-SSNTGAWRVSTMNHPQMQAPS
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pF1KSD Q---------STGDRKTGSVGSWGAARGPSGTDTVSGQSNSGNNGN-NGKEREDSWKGAS
                 :.:. :.:  ::.:.. :  :..  ::.. :: ::. ::    :. ... 
XP_016 GMNGTSLSHLSNGESKSG--GSYGTTWGAYGSN-YSGDKCSGPNGQANG----DTVNATL
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pF1KSD VQKST-GSKNDSWDNNNRSTGGSWNFGPQDSNDNKWGEGNKMTSGVSQGEWKQP---TGS
       .: .. :  . ... :. . :: :. :  .:....:: ::  .:: :.  :  :   ::.
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pF1KSD DELKIGEWSG-PNQPNSSTGAWDNQKGHP------LPENQGNA------QAPCWGRSSSS
       . :   ::.  :.. .:. .:  : :           :.::.:      :.  :......
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pF1KSD TGSEVGGQSTGSNHKAGSSDSHNSGRRSYRPTHPDCQAVLQTLLSRTDLDPRVLSNTGWG
       . :. . .:::  .. :...:..  ::.      : ...::....:::::::::::.:::
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pF1KSD QTQIKQDTVWDIEEVPRPEGKSDKGTEGWESAATQTKNSGGWGD--APSQSNQMK-SGWG
       :: :::.:.:: :  :: : :.:.:::.: :.:::: :::.  :  .:. ..  . ::::
XP_016 QTPIKQNTAWDTETSPRGERKTDNGTEAWGSSATQTFNSGACIDKTSPNGNDTSSVSGWG
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pF1KSD ELSASTEWKDPKNT---GGWNDYKNNN----SSNWGGGRPDEKTPSSWNENPSKDQGWGG
       . . . .: : :..   :::.: .  .    :..::. . .::  ..::.. .. :::: 
XP_016 DPKPALRWGDSKGSNCQGGWEDDSAATGMVKSNQWGNCK-EEK--AAWNDSQKNKQGWGD
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pF1KSD GRQPNQGWS-SGKNGWGEEVDQTKNSNWE----------SSASKPVSGWGEGGQNEIGTW
       :.. .:::: :....:::    ..:..:           :.... ::::.: :..   ::
XP_016 GQKSSQGWSVSASDNWGET---SRNNHWGEANKKSSSGGSDSDRSVSGWNELGKTSSFTW
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pF1KSD GNGGNASLASKGGW-EDCKRSPA--WNETGRQPNS--WNKQHQQQQPPQQPP-PPQPEAS
       ::. : . .:  :: :. : .:.  :..  .. .:  :.   ....: ..:    : .  
XP_016 GNNINPNNSS--GWDESSKPTPSQGWGDPPKSNQSLGWG---DSSKPVSSPDWNKQQDIV
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pF1KSD DPNSYNYKNVNLWDKNSQGGPAPREPN-----LPTP---MTSKSASDS---KSMQDGWGE
       ::..:::::::.:.::  .: .  . .     : ::   ...: ::..   :::::::  
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       :.:                                                 .:. ..::
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         :..:: ::.. : .:::.:: :.::::::: ..:::: .:.::  ::.:   ::   .
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       : ..:::.:::.:: :. :..   ::  :: :::.    :.::.. .. : ::.:: .: 
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       : :     ..  :..:. .... : . ::   .::...::.. ...   .. . :  :.:
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       :: . :     ::.  .:.. ..:  ..  :  ::.:  ::::     ::.: :  ::::
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       :.:: ::::  :::::.:::::::::... . . . ..::  ::: ..::.:::::.:::
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        .::    ::. .    ....::::.  : : ::::  . .  : :....::  .  .: 
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       ::::::::::::.:::::::.:::::: .:.::.:::.:.:..::: .::::::::::::
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       ::::...:.:::.::.:  ::  .:     ::::: ..:..   .  . . :.. : :..
XP_016 AEFASEEEISRFFAQSQSLTP--SP-----GWQSLGSSQSRLGSLDCSHS-FSSRTDLNH
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       :.... .:.. .:: :.:::: :.::.:::: :.  ::. ..::.:.   :  : ::::.
XP_016 WNGAGLSGTNCGDLHGTSLWGTPHYSTSLWGPPSSSDPRGISSPSPINAFLSVDHLGGGG
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pF1KSD DSI
       .:.
XP_016 ESM
          

>>XP_016878633 (OMIM: 610739) PREDICTED: trinucleotide r  (1960 aa)
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                  :.::.:      :.  :....... :. . .:::  .. :...:..  :
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pF1KSD N----SSNWGGGRPDEKTPSSWNENPSKDQGWGGGRQPNQGWS-SGKNGWGEEVDQTKNS
       .    :..::. . .::  ..::.. .. :::: :.. .:::: :....:::    ..:.
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pF1KSD NETGRQPNS--WNKQHQQQQPPQQPPPPQPEASGSWGGPPPPPPGNVRPSNSSWSSGPQP
       ..  .. .:  :. . .  . :.     : .  ::::   ::  :  .: ...: .:: :
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pF1KSD ATPKDEEPSGWEEPSPQSISRKMDIDDGTSAWGDPNSYNYKNVNLWDKNSQGG-------
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pF1KSD SKSASDS----------------KSMQDGWGESDGPVTGARHPSWEEEEDG--GVWNTTG
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       .::::: : :.::....::...:.::.:  . :   : ::  ::. .. . .:::.:   
XP_016 NKMDLSGGMLQDKRMEIDKHSLNIGDYNRTVGKG-PGSRPQISKE-SSMERNPYFDKDGI
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XP_016 VADESQNMQFMSSQSMKLPPSNSALPNQALGSIAGLGMQNLNSVRQNGNPSMFGVGNTAA
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pF1KSD QSRGLHTP-VQPLNSS-PSLRAQVPPQFISPQVSASMLKQFPNSGLSPGLFNVGPQLSPQ
       : ::.. : .:::.:: :.::::::: ..:::: .:.::  ::.:   ::   .: ..::
XP_016 QPRGMQQPPAQPLSSSQPNLRAQVPPPLLSPQVPVSLLKYAPNNG---GL---NPLFGPQ
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       :.:::.:: :. :..   ::  :: :::. :   .::.. .. : ::.:: .: .:. ::
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       ..::.::           :  ...: :  . :  :::..:..     :.:: ::: :   
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pF1KSD --GYGSGFSSG-GMDYGMVGGKEAGTESRFKQWTSMMEGLPSVATQEANMHKNGAIVAPG
         ..  :..:. .... : . ::   .::...::.. ...   .. . :  :.::: . :
XP_016 FSNFPIGLNSNLNVNMDMNSIKE--PQSRLRKWTTV-DSISVNTSLDQNSSKHGAI-SSG
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pF1KSD KTRGGSPYNQFDIIPGDTL-GGHTGPAGDSWLPAKSPPTNKIGSKSSNASWPPEFQPGVP
            ::.  .:.. ..:  ..  :  ::.:  ::::     ::.: :  :::::.:: :
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pF1KSD WKGIQNIDPESDPYVTPGSVLGGTATSPIVDTDHQLLRDNTTGSNSSLNTSLPSPGAWP-
       :::  :::::.:::::::::... . . . ..::  ::: ..::.:::::.::: .::  
XP_016 WKGYPNIDPETDPYVTPGSVINNLSINTVREVDH--LRDRNSGSSSSLNTTLPSTSAWSS
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pF1KSD YSASDNSF---TNVHSTSAKFPDYKSTWSPDPIGHNPTHLSNKMWKNHISSRNTTPLPRP
         ::. .    ....::::.  : : ::::  . .  : :....::  .  .: :   ::
XP_016 IRASNYNVPLSSTAQSTSARNSDSKLTWSPGSVTN--TSLAHELWKVPLPPKNITAPSRP
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pF1KSD PPGLTNPKPS-SPWSSTAPRSVRGWGTQDSRLASASTWSDGGSVRPSYWLVLHNLTPQID
       :::::. ::  : :...  :   :::..:.: . .:.:....: : . ::::.:::::::
XP_016 PPGLTGQKPPLSTWDNSPLRIGGGWGNSDARYTPGSSWGESSSGRITNWLVLKNLTPQID
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pF1KSD GSTLRTICMQHGPLLTFHLNLTQGTALIRYSTKQEAAKAQTALHMCVLGNTTILAEFATD
       ::::::.:::::::.:::::: .:.::.:::.:.:..::: .::::::::::::::::..
XP_016 GSTLRTLCMQHGPLITFHLNLPHGNALVRYSSKEEVVKAQKSLHMCVLGNTTILAEFASE
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pF1KSD DEVSRFLAQAQPPTPAATPSAPAAGWQSLETGQNQSDPVGPALNLFGGSTGLGQWSSSA-
       .:.:::.::.:  ::  .:     ::::: ..:..   .  . . :.. : :..:.... 
XP_016 EEISRFFAQSQSLTP--SP-----GWQSLGSSQSRLGSLDCS-HSFSSRTDLNHWNGAGL
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       .:.. .:: :.:::: :.::.:::: :.  ::. ..::.:.   :  : ::::..:.
XP_016 SGTNCGDLHGTSLWGTPHYSTSLWGPPSSSDPRGISSPSPINAFLSVDHLGGGGESM
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>>XP_016878637 (OMIM: 610739) PREDICTED: trinucleotide r  (1912 aa)
 initn: 1933 init1: 568 opt: 2020  Z-score: 959.4  bits: 190.7 E(85289): 1.1e-46
Smith-Waterman score: 3350; 37.7% identity (63.0% similar) in 1796 aa overlap (138-1722:193-1912)

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pF1KSD TWGSGASSNNGTSPNPIHIWDKVIVDGSDMEEWPCIASKDTESSSENTTDNNSASNPGSE
         :  .::.. .: :     . :. : :. : ::   ..: : .::   : .:::.  ::
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pF1KSD KSTL---PGSTTSNK-------GKGSQCQ------SASSGNECNLGVWKSDPKAK-----
       ..      :.: ..:       : ::: .      : . :.  . : :  .  :      
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        ::.. .: .:. :: .. : .::...  . : . :..:  :: .:::.: ..: . :: 
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pF1KSD LETDNSNSSAQVSTVGQTSREQQ--SKM------------------ENAGVNFV-VSGRE
       . . .:. . : ::.::   .:.  ::.                  : .:.. :  ::. 
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pF1KSD QAQIHNTDGPKNGNTNSLNLSSPNP--MENKGMPFGMGLGNTSRST------DAPSQ---
       :    .  :: :..:: .. : ::   ..:. .: . . :    ::      .:::    
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pF1KSD ------STGDRKTGSVGSWGAARGPSGTDTVSGQSNSGNNGN-NGKEREDSWKGASVQKS
             :.:. :.:  ::.:.. :  :..  ::.. :: ::. ::    :. ... .: .
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pF1KSD T-GSKNDSWDNNNRSTGGSWNFGPQDSNDNKWGEGNKMTSGVSQGEWKQP---TGSDELK
       . :  . ... :. . :: :. :  .:....:: ::  .:: :.  :  :   ::.. : 
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pF1KSD IGEWSG-PNQPNSSTGAWDNQKGHP------LPENQGNA------QAPCWGRSSSSTGSE
         ::.  :.. .:. .:  : :           :.::.:      :.  :....... :.
XP_016 SVEWNKLPSNQHSNDSANGNGKTFTNGWKSTEEEDQGSATSQTNEQSSVWAKTGGTVESD
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pF1KSD VGGQSTGSNHKAGSSDSHNSGRRSYRPTHPDCQAVLQTLLSRTDLDPRVLSNTGWGQTQI
        . .:::  .. :...:..  ::.      : ...::....:::::::::::.::::: :
XP_016 GSTESTGRLEEKGTGESQSRDRRKI-----DQHTLLQSIVNRTDLDPRVLSNSGWGQTPI
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pF1KSD KQDTVWDIEEVPRPEGKSDKGTEGWESAATQTKNSGGWGD--APSQSNQMK-SGWGELSA
       ::.:.:: :  :: : :.:.:::.: :.:::: :::.  :  .:. ..  . ::::. . 
XP_016 KQNTAWDTETSPRGERKTDNGTEAWGSSATQTFNSGACIDKTSPNGNDTSSVSGWGDPKP
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pF1KSD STEWKDPKNT---GGWNDYKNNN----SSNWGGGRPDEKTPSSWNENPSKDQGWGGGRQP
       . .: : :..   :::.: .  .    :..::. . .::  ..::.. .. :::: :.. 
XP_016 ALRWGDSKGSNCQGGWEDDSAATGMVKSNQWGNCK-EEK--AAWNDSQKNKQGWGDGQKS
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pF1KSD NQGWS-SGKNGWGE--------EVDQTKNSNWESSASKPVSGWGEGGQNEIGTWGNGGNA
       .:::: :....:::        :... :.:.  :.... ::::.: :..   ::::. : 
XP_016 SQGWSVSASDNWGETSRNNHWGEANK-KSSSGGSDSDRSVSGWNELGKTSSFTWGNNINP
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pF1KSD SLASKGGW-EDCKRSPA--WNETGRQPNS--WNKQHQQQQPPQQPPPPQPEASGSWGGPP
       . .:  :: :. : .:.  :..  .. .:  :. . .  . :.     : .  ::::   
XP_016 NNSS--GWDESSKPTPSQGWGDPPKSNQSLGWGDSSKPVSSPDWNK--QQDIVGSWG---
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pF1KSD PPPPGNVRPSNSSWSSGPQPATPKDEEPSGWEEPSPQSISRKMDIDDGTSAWGDPNSYNY
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XP_016 -IPPATGKPPGTGWLGGPIPAPAKEEEPTGWEEPSPESIRRKMEIDDGTSAWGDPSKYNY
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pF1KSD KNVNLWDKNSQGGPAPREPN-----LPTPMTS------KSASDSKSMQDGWGESDGPVTG
       ::::.:.::  .: .  . .     : :: ..      .:.:  :::::::  .: :. :
XP_016 KNVNMWNKNVPNGNSRSDQQAQVHQLLTPASAISNKEASSGSGPKSMQDGWCGDDMPLPG
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pF1KSD ARHPSWEEEEDG--GVWNTTGSQGSASSHN-------SASWGQGGKKQMKCS--LKGGNN
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XP_016 NRPTGWEEEEDVEIGMWNSNSSQELNSSLNWPPYTKKMSSKGLSGKKRRRERGMMKGGNK
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pF1KSD --DSWMNPLAKQFSNMGLL--SQTEDNPSSKMDLSVGSLSDKKFDVDKRAMNLGDFNDIM
         ..:.::..:::::...   :  :.  :.::::: : :.::....::...:.::.:  .
XP_016 QEEAWINPFVKQFSNISFSRDSPEENVQSNKMDLSGGMLQDKRMEIDKHSLNIGDYNRTV
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pF1KSD RKDRSGFRPPNSKDMGTTDSGPYFEK----------------------------------
        :   : ::  ::. .. . .:::.:                                  
XP_016 GKG-PGSRPQISKE-SSMERNPYFDKDGIVADESQNMQFMSSQSMKLPPSNSALPNQALG
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       :: .:.::  ::.:   ::   .: ..:::.:::.:: :. :..   ::  :: :::.  
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       .::.. ...   .. . :  :.::: . :     ::.  .:.. ..:  ..  :  ::.:
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