Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA1093
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA1093, 1722 aa
  1>>>pF1KSDA1093 1722 - 1722 aa - 1722 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.7719+/-0.00112; mu= -3.3912+/- 0.068
 mean_var=401.4363+/-81.658, 0's: 0 Z-trim(115.0): 44  B-trim: 121 in 1/51
 Lambda= 0.064013
 statistics sampled from 15473 (15514) to 15473 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.753), E-opt: 0.2 (0.477), width:  16
 Scan time:  5.200

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS46713.1 TNRC6B gene_id:23112|Hs108|chr22       (1723) 12064 1129.7       0
CCDS54533.1 TNRC6B gene_id:23112|Hs108|chr22       (1833) 6670 631.6 7.5e-180
CCDS46712.1 TNRC6B gene_id:23112|Hs108|chr22       (1029) 5546 527.6 8.6e-149
CCDS81959.1 TNRC6A gene_id:27327|Hs108|chr16       (1913) 2343 232.0 1.5e-59
CCDS10624.2 TNRC6A gene_id:27327|Hs108|chr16       (1962) 2017 201.9 1.8e-50
CCDS45799.1 TNRC6C gene_id:57690|Hs108|chr17       (1726) 1405 145.4 1.7e-33
CCDS45798.1 TNRC6C gene_id:57690|Hs108|chr17       (1690) 1058 113.3 7.3e-24


>>CCDS46713.1 TNRC6B gene_id:23112|Hs108|chr22            (1723 aa)
 initn: 8547 init1: 8547 opt: 12064  Z-score: 6034.9  bits: 1129.7 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 12064; 99.9% identity (99.9% similar) in 1723 aa overlap (1-1722:1-1723)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MREKEQEREEQLMEDKKRKKEDKKKKEATQKVTEQKTKVPEVTKPSLSQPTAASPIGSSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MREKEQEREEQLMEDKKRKKEDKKKKEATQKVTEQKTKVPEVTKPSLSQPTAASPIGSSP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD SPPVNGGNNAKRVAVPNGQPPSAARYMPREVPPRFRCQQDHKVLLKRGQPPPPSCMLLGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SPPVNGGNNAKRVAVPNGQPPSAARYMPREVPPRFRCQQDHKVLLKRGQPPPPSCMLLGG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD GAGPPPCTAPGANPNNAQVTGALLQSESGTAPDSTLGGAAASNYANSTWGSGASSNNGTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GAGPPPCTAPGANPNNAQVTGALLQSESGTAPDSTLGGAAASNYANSTWGSGASSNNGTS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD PNPIHIWDKVIVDGSDMEEWPCIASKDTESSSENTTDNNSASNPGSEKSTLPGSTTSNKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PNPIHIWDKVIVDGSDMEEWPCIASKDTESSSENTTDNNSASNPGSEKSTLPGSTTSNKG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD KGSQCQSASSGNECNLGVWKSDPKAKSVQSSNSTTENNNGLGNWRNVSGQDRIGPGSGFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KGSQCQSASSGNECNLGVWKSDPKAKSVQSSNSTTENNNGLGNWRNVSGQDRIGPGSGFS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD NFNPNSNPSAWPALVQEGTSRKGALETDNSNSSAQVSTVGQTSREQQSKMENAGVNFVVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NFNPNSNPSAWPALVQEGTSRKGALETDNSNSSAQVSTVGQTSREQQSKMENAGVNFVVS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD GREQAQIHNTDGPKNGNTNSLNLSSPNPMENKGMPFGMGLGNTSRSTDAPSQSTGDRKTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GREQAQIHNTDGPKNGNTNSLNLSSPNPMENKGMPFGMGLGNTSRSTDAPSQSTGDRKTG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD SVGSWGAARGPSGTDTVSGQSNSGNNGNNGKEREDSWKGASVQKSTGSKNDSWDNNNRST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SVGSWGAARGPSGTDTVSGQSNSGNNGNNGKEREDSWKGASVQKSTGSKNDSWDNNNRST
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD GGSWNFGPQDSNDNKWGEGNKMTSGVSQGEWKQPTGSDELKIGEWSGPNQPNSSTGAWDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GGSWNFGPQDSNDNKWGEGNKMTSGVSQGEWKQPTGSDELKIGEWSGPNQPNSSTGAWDN
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD QKGHPLPENQGNAQAPCWGRSSSSTGSEVGGQSTGSNHKAGSSDSHNSGRRSYRPTHPDC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QKGHPLPENQGNAQAPCWGRSSSSTGSEVGGQSTGSNHKAGSSDSHNSGRRSYRPTHPDC
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD QAVLQTLLSRTDLDPRVLSNTGWGQTQIKQDTVWDIEEVPRPEGKSDKGTEGWESAATQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QAVLQTLLSRTDLDPRVLSNTGWGQTQIKQDTVWDIEEVPRPEGKSDKGTEGWESAATQT
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD KNSGGWGDAPSQSNQMKSGWGELSASTEWKDPKNTGGWNDYKNNNSSNWGGGRPDEKTPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KNSGGWGDAPSQSNQMKSGWGELSASTEWKDPKNTGGWNDYKNNNSSNWGGGRPDEKTPS
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD SWNENPSKDQGWGGGRQPNQGWSSGKNGWGEEVDQTKNSNWESSASKPVSGWGEGGQNEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SWNENPSKDQGWGGGRQPNQGWSSGKNGWGEEVDQTKNSNWESSASKPVSGWGEGGQNEI
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD GTWGNGGNASLASKGGWEDCKRSPAWNETGRQPNSWNKQHQQQQPPQQPPPPQPEASGSW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GTWGNGGNASLASKGGWEDCKRSPAWNETGRQPNSWNKQHQQQQPPQQPPPPQPEASGSW
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD GGPPPPPPGNVRPSNSSWSSGPQPATPKDEEPSGWEEPSPQSISRKMDIDDGTSAWGDPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GGPPPPPPGNVRPSNSSWSSGPQPATPKDEEPSGWEEPSPQSISRKMDIDDGTSAWGDPN
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD SYNYKNVNLWDKNSQGGPAPREPNLPTPMTSKSASDSKSMQDGWGESDGPVTGARHPSWE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SYNYKNVNLWDKNSQGGPAPREPNLPTPMTSKSASDSKSMQDGWGESDGPVTGARHPSWE
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD EEEDGGVWNTTGSQGSASSHNSASWGQGGKKQMKCSLKGGNNDSWMNPLAKQFSNMGLLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EEEDGGVWNTTGSQGSASSHNSASWGQGGKKQMKCSLKGGNNDSWMNPLAKQFSNMGLLS
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD QTEDNPSSKMDLSVGSLSDKKFDVDKRAMNLGDFNDIMRKDRSGFRPPNSKDMGTTDSGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QTEDNPSSKMDLSVGSLSDKKFDVDKRAMNLGDFNDIMRKDRSGFRPPNSKDMGTTDSGP
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD YFEKGGSHGLFGNSTAQSRGLHTPVQPLNSSPSLRAQVPPQFISPQVSASMLKQFPNSGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YFEKGGSHGLFGNSTAQSRGLHTPVQPLNSSPSLRAQVPPQFISPQVSASMLKQFPNSGL
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KSD SPGLFNVGPQLSPQQIAMLSQLPQIPQFQLACQLLLQQQQQQQLLQNQRKISQAVRQQQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SPGLFNVGPQLSPQQIAMLSQLPQIPQFQLACQLLLQQQQQQQLLQNQRKISQAVRQQQE
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210       1220      1230      1240      1250         
pF1KSD QQLARMVSALQQQQQQQ-RQPGMKHSPSHPVGPKPHLDNMVPNALNVGLPDLQTKGPIPG
       ::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QQLARMVSALQQQQQQQQRQPGMKHSPSHPVGPKPHLDNMVPNALNVGLPDLQTKGPIPG
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

    1260      1270      1280      1290      1300      1310         
pF1KSD YGSGFSSGGMDYGMVGGKEAGTESRFKQWTSMMEGLPSVATQEANMHKNGAIVAPGKTRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YGSGFSSGGMDYGMVGGKEAGTESRFKQWTSMMEGLPSVATQEANMHKNGAIVAPGKTRG
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

    1320      1330      1340      1350      1360      1370         
pF1KSD GSPYNQFDIIPGDTLGGHTGPAGDSWLPAKSPPTNKIGSKSSNASWPPEFQPGVPWKGIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GSPYNQFDIIPGDTLGGHTGPAGDSWLPAKSPPTNKIGSKSSNASWPPEFQPGVPWKGIQ
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

    1380      1390      1400      1410      1420      1430         
pF1KSD NIDPESDPYVTPGSVLGGTATSPIVDTDHQLLRDNTTGSNSSLNTSLPSPGAWPYSASDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NIDPESDPYVTPGSVLGGTATSPIVDTDHQLLRDNTTGSNSSLNTSLPSPGAWPYSASDN
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

    1440      1450      1460      1470      1480      1490         
pF1KSD SFTNVHSTSAKFPDYKSTWSPDPIGHNPTHLSNKMWKNHISSRNTTPLPRPPPGLTNPKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SFTNVHSTSAKFPDYKSTWSPDPIGHNPTHLSNKMWKNHISSRNTTPLPRPPPGLTNPKP
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

    1500      1510      1520      1530      1540      1550         
pF1KSD SSPWSSTAPRSVRGWGTQDSRLASASTWSDGGSVRPSYWLVLHNLTPQIDGSTLRTICMQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SSPWSSTAPRSVRGWGTQDSRLASASTWSDGGSVRPSYWLVLHNLTPQIDGSTLRTICMQ
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

    1560      1570      1580      1590      1600      1610         
pF1KSD HGPLLTFHLNLTQGTALIRYSTKQEAAKAQTALHMCVLGNTTILAEFATDDEVSRFLAQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HGPLLTFHLNLTQGTALIRYSTKQEAAKAQTALHMCVLGNTTILAEFATDDEVSRFLAQA
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

    1620      1630      1640      1650      1660      1670         
pF1KSD QPPTPAATPSAPAAGWQSLETGQNQSDPVGPALNLFGGSTGLGQWSSSAGGSSGADLAGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QPPTPAATPSAPAAGWQSLETGQNQSDPVGPALNLFGGSTGLGQWSSSAGGSSGADLAGA
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

    1680      1690      1700      1710      1720  
pF1KSD SLWGPPNYSSSLWGVPTVEDPHRMGSPAPLLPGDLLGGGSDSI
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SLWGPPNYSSSLWGVPTVEDPHRMGSPAPLLPGDLLGGGSDSI
             1690      1700      1710      1720   

>>CCDS54533.1 TNRC6B gene_id:23112|Hs108|chr22            (1833 aa)
 initn: 11267 init1: 6616 opt: 6670  Z-score: 3342.4  bits: 631.6 E(32554): 7.5e-180
Smith-Waterman score: 11261; 93.6% identity (93.7% similar) in 1754 aa overlap (1-1643:1-1754)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MREKEQEREEQLMEDKKRKKEDKKKKEATQKVTEQKTKVPEVTKPSLSQPTAASPIGSSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MREKEQEREEQLMEDKKRKKEDKKKKEATQKVTEQKTKVPEVTKPSLSQPTAASPIGSSP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD SPPVNGGNNAKRVAVPNGQPPSAARYMPREVPPRFRCQQDHKVLLKRGQPPPPSCMLLGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SPPVNGGNNAKRVAVPNGQPPSAARYMPREVPPRFRCQQDHKVLLKRGQPPPPSCMLLGG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD GAGPPPCTAPGANPNNAQVTGALLQSESGTAPDSTLGGAAASNYANSTWGSGASSNNGTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GAGPPPCTAPGANPNNAQVTGALLQSESGTAPDSTLGGAAASNYANSTWGSGASSNNGTS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD PNPIHIWDKVIVDGSDMEEWPCIASKDTESSSENTTDNNSASNPGSEKSTLPGSTTSNKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PNPIHIWDKVIVDGSDMEEWPCIASKDTESSSENTTDNNSASNPGSEKSTLPGSTTSNKG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD KGSQCQSASSGNECNLGVWKSDPKAKSVQSSNSTTENNNGLGNWRNVSGQDRIGPGSGFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KGSQCQSASSGNECNLGVWKSDPKAKSVQSSNSTTENNNGLGNWRNVSGQDRIGPGSGFS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD NFNPNSNPSAWPALVQEGTSRKGALETDNSNSSAQVSTVGQTSREQQSKMENAGVNFVVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NFNPNSNPSAWPALVQEGTSRKGALETDNSNSSAQVSTVGQTSREQQSKMENAGVNFVVS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD GREQAQIHNTDGPKNGNTNSLNLSSPNPMENKGMPFGMGLGNTSRSTDAPSQSTGDRKTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GREQAQIHNTDGPKNGNTNSLNLSSPNPMENKGMPFGMGLGNTSRSTDAPSQSTGDRKTG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD SVGSWGAARGPSGTDTVSGQSNSGNNGNNGKEREDSWKGASVQKSTGSKNDSWDNNNRST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SVGSWGAARGPSGTDTVSGQSNSGNNGNNGKEREDSWKGASVQKSTGSKNDSWDNNNRST
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD GGSWNFGPQDSNDNKWGEGNKMTSGVSQGEWKQPTGSDELKIGEWSGPNQPNSSTGAWDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GGSWNFGPQDSNDNKWGEGNKMTSGVSQGEWKQPTGSDELKIGEWSGPNQPNSSTGAWDN
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD QKGHPLPENQGNAQAPCWGRSSSSTGSEVGGQSTGSNHKAGSSDSHNSGRRSYRPTHPDC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QKGHPLPENQGNAQAPCWGRSSSSTGSEVGGQSTGSNHKAGSSDSHNSGRRSYRPTHPDC
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD QAVLQTLLSRTDLDPRVLSNTGWGQTQIKQDTVWDIEEVPRPEGKSDKGTEGWESAATQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QAVLQTLLSRTDLDPRVLSNTGWGQTQIKQDTVWDIEEVPRPEGKSDKGTEGWESAATQT
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD KNSGGWGDAPSQSNQMKSGWGELSASTEWKDPKNTGGWNDYKNNNSSNWGGGRPDEKTPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KNSGGWGDAPSQSNQMKSGWGELSASTEWKDPKNTGGWNDYKNNNSSNWGGGRPDEKTPS
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD SWNENPSKDQGWGGGRQPNQGWSSGKNGWGEEVDQTKNSNWESSASKPVSGWGEGGQNEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SWNENPSKDQGWGGGRQPNQGWSSGKNGWGEEVDQTKNSNWESSASKPVSGWGEGGQNEI
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD GTWGNGGNASLASKGGWEDCKRSPAWNETGRQPNSWNKQHQQQQPPQQPPPPQPEASGSW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GTWGNGGNASLASKGGWEDCKRSPAWNETGRQPNSWNKQHQQQQPPQQPPPPQPEASGSW
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD GGPPPPPPGNVRPSNSSWSSGPQPATPKDEEPSGWEEPSPQSISRKMDIDDGTSAWGDPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GGPPPPPPGNVRPSNSSWSSGPQPATPKDEEPSGWEEPSPQSISRKMDIDDGTSAWGDPN
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930                              
pF1KSD SYNYKNVNLWDKNSQGGPAPREPNLPTPMTSKSAS-------------------------
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::                         
CCDS54 SYNYKNVNLWDKNSQGGPAPREPNLPTPMTSKSASVWSKSTPPAPDNGTSAWGEPNESSP
              910       920       930       940       950       960

                                     940       950       960       
pF1KSD ----------------------------DSKSMQDGWGESDGPVTGARHPSWEEEEDGGV
                                   .:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GWGEMDDTGASTTGWGNTPANAPNAMKPNSKSMQDGWGESDGPVTGARHPSWEEEEDGGV
              970       980       990      1000      1010      1020

       970       980       990      1000      1010      1020       
pF1KSD WNTTGSQGSASSHNSASWGQGGKKQMKCSLKGGNNDSWMNPLAKQFSNMGLLSQTEDNPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 WNTTGSQGSASSHNSASWGQGGKKQMKCSLKGGNNDSWMNPLAKQFSNMGLLSQTEDNPS
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

      1030      1040      1050      1060      1070      1080       
pF1KSD SKMDLSVGSLSDKKFDVDKRAMNLGDFNDIMRKDRSGFRPPNSKDMGTTDSGPYFEK---
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::   
CCDS54 SKMDLSVGSLSDKKFDVDKRAMNLGDFNDIMRKDRSGFRPPNSKDMGTTDSGPYFEKLTL
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

                                                               1090
pF1KSD ------------------------------------------------------GGSHGL
                                                             ::::::
CCDS54 PFSNQDGCLGDEAPCSPFSPSPSYKLSPSGSTLPNVSLGAIGTGLNPQNFAARQGGSHGL
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1100      1110      1120      1130      1140      1150
pF1KSD FGNSTAQSRGLHTPVQPLNSSPSLRAQVPPQFISPQVSASMLKQFPNSGLSPGLFNVGPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FGNSTAQSRGLHTPVQPLNSSPSLRAQVPPQFISPQVSASMLKQFPNSGLSPGLFNVGPQ
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1160      1170      1180      1190      1200      1210
pF1KSD LSPQQIAMLSQLPQIPQFQLACQLLLQQQQQQQLLQNQRKISQAVRQQQEQQLARMVSAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LSPQQIAMLSQLPQIPQFQLACQLLLQQQQQQQLLQNQRKISQAVRQQQEQQLARMVSAL
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

              1220      1230      1240      1250      1260         
pF1KSD QQQQQQQ-RQPGMKHSPSHPVGPKPHLDNMVPNALNVGLPDLQTKGPIPGYGSGFSSGGM
       ::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QQQQQQQQRQPGMKHSPSHPVGPKPHLDNMVPNALNVGLPDLQTKGPIPGYGSGFSSGGM
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

    1270      1280      1290      1300      1310      1320         
pF1KSD DYGMVGGKEAGTESRFKQWTSMMEGLPSVATQEANMHKNGAIVAPGKTRGGSPYNQFDII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DYGMVGGKEAGTESRFKQWTSMMEGLPSVATQEANMHKNGAIVAPGKTRGGSPYNQFDII
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

    1330      1340      1350      1360      1370      1380         
pF1KSD PGDTLGGHTGPAGDSWLPAKSPPTNKIGSKSSNASWPPEFQPGVPWKGIQNIDPESDPYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PGDTLGGHTGPAGDSWLPAKSPPTNKIGSKSSNASWPPEFQPGVPWKGIQNIDPESDPYV
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

    1390      1400      1410      1420      1430      1440         
pF1KSD TPGSVLGGTATSPIVDTDHQLLRDNTTGSNSSLNTSLPSPGAWPYSASDNSFTNVHSTSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TPGSVLGGTATSPIVDTDHQLLRDNTTGSNSSLNTSLPSPGAWPYSASDNSFTNVHSTSA
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

    1450      1460      1470      1480      1490      1500         
pF1KSD KFPDYKSTWSPDPIGHNPTHLSNKMWKNHISSRNTTPLPRPPPGLTNPKPSSPWSSTAPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KFPDYKSTWSPDPIGHNPTHLSNKMWKNHISSRNTTPLPRPPPGLTNPKPSSPWSSTAPR
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

    1510      1520      1530      1540      1550      1560         
pF1KSD SVRGWGTQDSRLASASTWSDGGSVRPSYWLVLHNLTPQIDGSTLRTICMQHGPLLTFHLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SVRGWGTQDSRLASASTWSDGGSVRPSYWLVLHNLTPQIDGSTLRTICMQHGPLLTFHLN
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

    1570      1580      1590      1600      1610      1620         
pF1KSD LTQGTALIRYSTKQEAAKAQTALHMCVLGNTTILAEFATDDEVSRFLAQAQPPTPAATPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LTQGTALIRYSTKQEAAKAQTALHMCVLGNTTILAEFATDDEVSRFLAQAQPPTPAATPS
             1690      1700      1710      1720      1730      1740

    1630      1640      1650      1660      1670      1680         
pF1KSD APAAGWQSLETGQNQSDPVGPALNLFGGSTGLGQWSSSAGGSSGADLAGASLWGPPNYSS
       ::::::::::::::                                              
CCDS54 APAAGWQSLETGQNQSDPVGPALNLFGGSTGLGQWSSSAGGSSGADLAGASLWGPPNYSS
             1750      1760      1770      1780      1790      1800

>>CCDS46712.1 TNRC6B gene_id:23112|Hs108|chr22            (1029 aa)
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         760       770       780       790       800       810     
pF1KSD TKNSNWESSASKPVSGWGEGGQNEIGTWGNGGNASLASKGGWEDCKRSPAWNETGRQPNS
                                     :.. :   .:: .. ::  . :  : :: :
CCDS46 EATQKVTEQKTKVPEVTKPSLSQPTAASPIGSSPSPPVNGG-NNAKRVAVPN--G-QPPS
             70        80        90       100        110           

         820                     830       840       850       860 
pF1KSD WNKQHQQQQPPQ--------------QPPPPQPEASGSWGGPPPPPPGNVRPSNSSWSSG
         .   .. ::.              :::::.    :. .::::    .. :.:..  .:
CCDS46 AARYMPREVPPRFRCQQDHKVLLKRGQPPPPSCMLLGGGAGPPPCTAPGANPNNAQ-VTG
      120       130       140       150       160       170        

             870       880       890       900       910        920
pF1KSD PQPATPKDEEPSGWEEPSPQSISRKMDIDDGTSAWGDPNSYNYKNVNLWDK-NSQGGPAP
           . .   :  : . .: .       :.::::::.::    ..   : . .. :. . 
CCDS46 ALLQSESGTAPV-WSKSTPPAP------DNGTSAWGEPN----ESSPGWGEMDDTGASTT
       180        190             200           210       220      

              930       940       950       960       970       980
pF1KSD REPNLPTPMTSKSASDSKSMQDGWGESDGPVTGARHPSWEEEEDGGVWNTTGSQGSASSH
          : :.   .    .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GWGNTPANAPNAMKPNSKSMQDGWGESDGPVTGARHPSWEEEEDGGVWNTTGSQGSASSH
        230       240       250       260       270       280      

              990      1000      1010      1020      1030      1040
pF1KSD NSASWGQGGKKQMKCSLKGGNNDSWMNPLAKQFSNMGLLSQTEDNPSSKMDLSVGSLSDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NSASWGQGGKKQMKCSLKGGNNDSWMNPLAKQFSNMGLLSQTEDNPSSKMDLSVGSLSDK
        290       300       310       320       330       340      

             1050      1060      1070      1080      1090      1100
pF1KSD KFDVDKRAMNLGDFNDIMRKDRSGFRPPNSKDMGTTDSGPYFEKGGSHGLFGNSTAQSRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KFDVDKRAMNLGDFNDIMRKDRSGFRPPNSKDMGTTDSGPYFEKGGSHGLFGNSTAQSRG
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LHTPVQPLNSSPSLRAQVPPQFISPQVSASMLKQFPNSGLSPGLFNVGPQLSPQQIAMLS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS46 QLPQIPQFQLACQLLLQQQQQQQLLQNQRKISQAVRQQQEQQLARMVSALQQQQQQQQRQ
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PGMKHSPSHPVGPKPHLDNMVPNALNVGLPDLQTKGPIPGYGSGFSSGGMDYGMVGGKEA
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GTESRFKQWTSMMEGLPSVATQEANMHKNGAIVAPGKTRGGSPYNQFDIIPGDTLGGHTG
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CCDS46 PAGDSWLPAKSPPTNKIGSKSSNASWPPEFQPGVPWKGIQNIDPESDPYVTPGSVLGGTA
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PDPIGHNPTHLSNKMWKNHISSRNTTPLPRPPPGLTNPKPSSPWSSTAPRSVRGWGTQDS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RLASASTWSDGGSVRPSYWLVLHNLTPQIDGSTLRTICMQHGPLLTFHLNLTQGTALIRY
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 STKQEAAKAQTALHMCVLGNTTILAEFATDDEVSRFLAQAQPPTPAATPSAPAAGWQSLE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       :::::::::::::::::::::::
CCDS46 PHRMGSPAPLLPGDLLGGGSDSI
       1010      1020         

>>CCDS81959.1 TNRC6A gene_id:27327|Hs108|chr16            (1913 aa)
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         :  .::.. .: :     . :. : :. : ::   ..: : .::   : .:::.  ::
CCDS81 QRGP-VSSTSDSSTN---CKNAVVSDLSEKEAWPSAPGSDPELASE-CMDADSASSSESE
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pF1KSD KSTL---PGSTTSNK-------GKGSQCQ------SASSGNECNLGVWKSDPKAK-----
       ..      :.: ..:       : ::: .      : . :.  . : :  .  :      
CCDS81 RNITIMASGNTGGEKDGLRNSTGLGSQNKFVVGSSSNNVGHGSSTGPWGFSHGAIISTCQ
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pF1KSD -SVQSSNSTTEN-NNGLGNWRNVSGQDRIGPGSGFSNFNPNSNPSAWPALVQEGTSRKGA
        ::.. .: .:. :: .. : .::...  . : . :..:  :: .:::.: ..: . :: 
CCDS81 VSVDAPESKSESSNNRMNAWGTVSSSS--NGGLNPSTLNSASNHGAWPVLENNGLALKGP
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pF1KSD LETDNSNSSAQVSTVGQTSREQQ--SKM------------------ENAGVNFV-VSGRE
       . . .:. . : ::.::   .:.  ::.                  : .:.. :  ::. 
CCDS81 VGSGSSGINIQCSTIGQMPNNQSINSKVSGGSTHGTWGSLQETCESEVSGTQKVSFSGQP
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pF1KSD QAQIHNTDGPKNGNTNSLNLSSPNP--MENKGMPFGMGLGNTSRST------DAPSQ---
       :    .  :: :..:: .. : ::   ..:. .: . . :    ::      .:::    
CCDS81 QNITTEMTGP-NNTTNFMTSSLPNSGSVQNNELP-SSNTGAWRVSTMNHPQMQAPSGMNG
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pF1KSD ------STGDRKTGSVGSWGAARGPSGTDTVSGQSNSGNNGN-NGKEREDSWKGASVQKS
             :.:. :.:  ::.:.. :  :..  ::.. :: ::. ::    :. ... .: .
CCDS81 TSLSHLSNGESKSG--GSYGTTWGAYGSN-YSGDKCSGPNGQANG----DTVNATLMQPG
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pF1KSD T-GSKNDSWDNNNRSTGGSWNFGPQDSNDNKWGEGNKMTSGVSQGEWKQP---TGSDELK
       . :  . ... :. . :: :. :  .:....:: ::  .:: :.  :  :   ::.. : 
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pF1KSD IGEWSG-PNQPNSSTGAWDNQKGHP------LPENQGNA------QAPCWGRSSSSTGSE
         ::.  :.. .:. .:  : :           :.::.:      :.  :....... :.
CCDS81 SVEWNKLPSNQHSNDSANGNGKTFTNGWKSTEEEDQGSATSQTNEQSSVWAKTGGTVESD
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pF1KSD VGGQSTGSNHKAGSSDSHNSGRRSYRPTHPDCQAVLQTLLSRTDLDPRVLSNTGWGQTQI
        . .:::  .. :...:..  ::.      : ...::....:::::::::::.::::: :
CCDS81 GSTESTGRLEEKGTGESQSRDRRKI-----DQHTLLQSIVNRTDLDPRVLSNSGWGQTPI
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pF1KSD KQDTVWDIEEVPRPEGKSDKGTEGWESAATQTKNSGGWGD--APSQSNQMK-SGWGELSA
       ::.:.:: :  :: : :.:.:::.: :.:::: :::.  :  .:. ..  . ::::. . 
CCDS81 KQNTAWDTETSPRGERKTDNGTEAWGSSATQTFNSGACIDKTSPNGNDTSSVSGWGDPKP
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       . .: : :..   :::.: .  .    :..::. . .::  ..::.. .. :::: :.. 
CCDS81 ALRWGDSKGSNCQGGWEDDSAATGMVKSNQWGNCK-EEK--AAWNDSQKNKQGWGDGQKS
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pF1KSD NQGWS-SGKNGWGE--------EVDQTKNSNWESSASKPVSGWGEGGQNEIGTWGNGGNA
       .:::: :....:::        :... :.:.  :.... ::::.: :..   ::::. : 
CCDS81 SQGWSVSASDNWGETSRNNHWGEANK-KSSSGGSDSDRSVSGWNELGKTSSFTWGNNINP
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pF1KSD SLASKGGW-EDCKRSPA--WNETGRQPNS--WNKQHQQQQPPQQPPPPQPEASGSWGGPP
       . .:  :: :. : .:.  :..  .. .:  :. . .  . :.     : .  ::::   
CCDS81 NNSS--GWDESSKPTPSQGWGDPPKSNQSLGWGDSSKPVSSPDWNK--QQDIVGSWG---
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pF1KSD PPPPGNVRPSNSSWSSGPQPATPKDEEPSGWEEPSPQSISRKMDIDDGTSAWGDPNSYNY
         ::.. .: ...: .:: ::  :.:::.:::::::.:: :::.:::::::::::..:::
CCDS81 -IPPATGKPPGTGWLGGPIPAPAKEEEPTGWEEPSPESIRRKMEIDDGTSAWGDPSKYNY
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          910                      920                             
pF1KSD KNVNLWDKNSQGG---------------PAPR-----------------EPNLPT-----
       ::::.:.::  .:               ::                   ::. :.     
CCDS81 KNVNMWNKNVPNGNSRSDQQAQVHQLLTPASAISNKEASSGSGWGEPWGEPSTPATTVDN
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pF1KSD -----------------PMTSKSASDS----------------KSMQDGWGESDGPVTGA
                        :... :....                :::::::  .: :. : 
CCDS81 GTSAWGKPIDSGPSWGEPIAAASSTSTWGSSSVGPQALSKSGPKSMQDGWCGDDMPLPGN
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pF1KSD RHPSWEEEEDG--GVWNTTGSQGSASSHN-------SASWGQGGKKQMKCS--LKGGNN-
       :  .::::::   :.::...::   :: :        .: : .:::. .    .::::. 
CCDS81 RPTGWEEEEDVEIGMWNSNSSQELNSSLNWPPYTKKMSSKGLSGKKRRRERGMMKGGNKQ
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            1010        1020      1030      1040      1050         
pF1KSD -DSWMNPLAKQFSNMGLL--SQTEDNPSSKMDLSVGSLSDKKFDVDKRAMNLGDFNDIMR
        ..:.::..:::::...   :  :.  :.::::: : :.::....::...:.::.:  . 
CCDS81 EEAWINPFVKQFSNISFSRDSPEENVQSNKMDLSGGMLQDKRMEIDKHSLNIGDYNRTVG
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pF1KSD KDRSGFRPPNSKDMGTTDSGPYFEKGGSHGLFG--NSTAQSRGLHTP-VQPLNSS-PSLR
       :   : ::  ::. .. . .:::.:.:. ..::  :..:: ::.. : .:::.:: :.::
CCDS81 KG-PGSRPQISKE-SSMERNPYFDKNGNPSMFGVGNTAAQPRGMQQPPAQPLSSSQPNLR
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       ::::: ..:::: .:.::  ::.:   ::   .: ..:::.:::.:: :. :..   :: 
CCDS81 AQVPPPLLSPQVPVSLLKYAPNNG---GL---NPLFGPQQVAMLNQLSQLNQLSQISQLQ
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pF1KSD -LLQQQQQQQLLQNQRKISQAVRQQQEQQLARMVSALQQQQQQQRQ-----------PGM
        :: :::.    :.::.. .. : ::.:: .: .:. ::..::.::           :  
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       ...: :  . :  :::..:..     :.:: ::: :     ..  :..:. .... : . 
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       ::   .::...::.. ...   .. . :  :.::: . :     ::.  .:.. ..:  .
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       .  :  ::.:  ::::      . ::...:::::.:: ::::  :::::.:::::::::.
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       .. . . . ..::  ::: ..::.:::::.::: .::    ::. .    ....::::. 
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        : : ::::  . .  : :....::  .  .: :   :::::::. ::  : :...  : 
CCDS81 SDSKLTWSPGSVTN--TSLAHELWKVPLPPKNITAPSRPPPGLTGQKPPLSTWDNSPLRI
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         :::..:.: . .:.:....: : . ::::.:::::::::::::.:::::::.::::::
CCDS81 GGGWGNSDARYTPGSSWGESSSGRITNWLVLKNLTPQIDGSTLRTLCMQHGPLITFHLNL
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        .:.::.:::.:.:..::: .::::::::::::::::...:.:::.::.:  ::  .:  
CCDS81 PHGNALVRYSSKEEVVKAQKSLHMCVLGNTTILAEFASEEEISRFFAQSQSLTP--SP--
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          ::::: ..:..   .  . . :.. : :..:.... .:.. .:: :.:::: :.::.
CCDS81 ---GWQSLGSSQSRLGSLDCSHS-FSSRTDLNHWNGAGLSGTNCGDLHGTSLWGTPHYST
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       :::: :.  ::. ..::.:.   :  : ::::..:.
CCDS81 SLWGPPSSSDPRGISSPSPINAFLSVDHLGGGGESM
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       :.  . : :  .  :       ::.. .: .:. :: .. : .::...  . : . :..:
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              : .:.. :  ::. :    .  ::.: .:: .. : ::   ..:. .: . . 
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       :    ::      .:::          :.:. :.:  ::.:.. :  :..  ::.. :: 
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             :.  :....... :. . .:::  .. :...:..  ::.      : ...::..
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       :  .:. ..  . ::::. . . .: : :..   :::.: .  .    :..::. . .::
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         ..::.. .. :::: :.. .:::: :....:::        :... :.:.  :.... 
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       ::::.: :..   ::::. : . .:  :: :. : .:.  :..  .. .:  :.   ...
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CCDS10 KPVSSPDWNKQQDIVGSWG----IPPATGKPPGTGWLGGPIPAPAKEEEPTGWEEPSPES
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CCDS10 SKGLSGKKRRRERGMMKGGNKQEEAWINPFVKQFSNISFSRDSPEENVQSNKMDLSGGML
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       .::....::...:.::.:  . :   : ::  ::. .. . .:::.:             
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CCDS10 NLLVKQQTPPSQQQPLHQPAMKSFLDNVMPHTT----PELQ-KGPSPINAFSNFPIGLNS
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pF1KSD G-GMDYGMVGGKEAGTESRFKQWTSMMEGLPSVATQEANMHKNGAIVAPGKTRGGSPYNQ
       . .... : . ::   .::...::.. ...   .. . :  :.::: . :     ::.  
CCDS10 NLNVNMDMNSIKE--PQSRLRKWTTV-DSISVNTSLDQNSSKHGAI-SSGFRLEESPFVP
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pF1KSD FDIIPGDTL-GGHTGPAGDSWLPAKSPPTNKIGSKSSNASWPPEFQPGVPWKGIQNIDPE
       .:.. ..:  ..  :  ::.:  ::::      . ::...:::::.:: ::::  :::::
CCDS10 YDFMNSSTSPASPPGSIGDGWPRAKSP------NGSSSVNWPPEFRPGEPWKGYPNIDPE
          1580      1590      1600            1610      1620       

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pF1KSD SDPYVTPGSVLGGTATSPIVDTDHQLLRDNTTGSNSSLNTSLPSPGAWP-YSASDNSF--
       .:::::::::... . . . ..::  ::: ..::.:::::.::: .::    ::. .   
CCDS10 TDPYVTPGSVINNLSINTVREVDH--LRDRNSGSSSSLNTTLPSTSAWSSIRASNYNVPL
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pF1KSD -TNVHSTSAKFPDYKSTWSPDPIGHNPTHLSNKMWKNHISSRNTTPLPRPPPGLTNPKPS
        ....::::.  : : ::::  . .  : :....::  .  .: :   :::::::. :: 
CCDS10 SSTAQSTSARNSDSKLTWSPGSVTN--TSLAHELWKVPLPPKNITAPSRPPPGLTGQKPP
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pF1KSD -SPWSSTAPRSVRGWGTQDSRLASASTWSDGGSVRPSYWLVLHNLTPQIDGSTLRTICMQ
        : :...  :   :::..:.: . .:.:....: : . ::::.:::::::::::::.:::
CCDS10 LSTWDNSPLRIGGGWGNSDARYTPGSSWGESSSGRITNWLVLKNLTPQIDGSTLRTLCMQ
          1750      1760      1770      1780      1790      1800   

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pF1KSD HGPLLTFHLNLTQGTALIRYSTKQEAAKAQTALHMCVLGNTTILAEFATDDEVSRFLAQA
       ::::.:::::: .:.::.:::.:.:..::: .::::::::::::::::...:.:::.::.
CCDS10 HGPLITFHLNLPHGNALVRYSSKEEVVKAQKSLHMCVLGNTTILAEFASEEEISRFFAQS
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pF1KSD QPPTPAATPSAPAAGWQSLETGQNQSDPVGPALNLFGGSTGLGQWSSSA-GGSSGADLAG
       :  ::  .:     ::::: ..:..   .  . . :.. : :..:.... .:.. .:: :
CCDS10 QSLTP--SP-----GWQSLGSSQSRLGSLDCSHS-FSSRTDLNHWNGAGLSGTNCGDLHG
            1870           1880      1890       1900      1910     

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pF1KSD ASLWGPPNYSSSLWGVPTVEDPHRMGSPAPL---LPGDLLGGGSDSI
       .:::: :.::.:::: :.  ::. ..::.:.   :  : ::::..:.
CCDS10 TSLWGTPHYSTSLWGPPSSSDPRGISSPSPINAFLSVDHLGGGGESM
        1920      1930      1940      1950      1960  

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CCDS45                MATGSAQGNFTGHTKKTNGNNGTNGALVQSPSNQSALGAGGANSN
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pF1KSD KGKGSQCQSASSGNECNLGVWKSDPKAKSVQSSNSTTENNNGLGNWRNVSGQDRIGPGSG
        :....  ....:.  .:.         ::.....  ..  : :  .:  : .  . : .
CCDS45 -GSAARVWGVATGSSSGLA-------HCSVSGGDGKMDTMIGDGRSQNCWGASNSNAGIN
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pF1KSD FSNFNPNSNPSAWPALVQEGTSRKGALETDNSNSSAQVSTVGQTSRE-------------
       . :.:::.::.:::.: .:::   :   .  :  ::  ...:. . .             
CCDS45 L-NLNPNANPAAWPVLGHEGTVATGNPSSICSPVSAIGQNMGNQNGNPTGTLGAWGNLLP
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       :.:   .....  ::   : :  :::::.:  :: .: :::::   :...:.: .::  :
CCDS45 QESTEPQTSTSQNVSFSAQPQNLNTDGPNN--TNPMN-SSPNPINAMQTNGLPNWGMAVG
        160       170       180         190        200       210   

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pF1KSD LGNT---------SRSTDAPSQSTGDRKTGSVGS-WGAARGPSGTDTVSGQSNSGNNGNN
       .:           . . .. :: .:    :  .: :: . :    . ..:.:::: . .:
CCDS45 MGAIIPPHLQGLPGANGSSVSQVSGGSAEGISNSVWGLSPG----NPATGNSNSGFSQGN
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pF1KSD GKEREDSWKGASVQKSTGSKNDSWDNNNRSTGGSWNFGPQDSNDN-KWGEG--NKMTSGV
       :    :. ..:   :..::.  :  ... : :..:. ::  .     ::.:  :. ....
CCDS45 G----DTVNSALSAKQNGSS--SAVQKEGSGGNAWDSGPPAGPGILAWGRGSGNNGVGNI
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pF1KSD SQGEWKQPTGSDELKI-GEWSGPNQPNSSTGAWDNQKGH-----PLPENQ------GNAQ
        .: : .:. :    . :::. :  ::. ...  : ::      :   .:      :. .
CCDS45 HSGAWGHPSRSTSNGVNGEWGKP--PNQHSNSDINGKGSTGWESPSVTSQNPTVQPGGEH
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          :....::  .   :.: :: ::. ::.  ...:.   :      :. .:  : :.::
CCDS45 MNSWAKAASSGTTASEGSSDGSGNHNEGSTGREGTGEGRRRDKGIIDQGHIQ--LPRNDL
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pF1KSD DPRVLSNTGWGQTQIKQDTVWDIEEVPRPEGKSDKGTEGWESAATQTKNSGGWGDAP---
       ::::::::::::: .::.:.:..:: :: : :.:.:::.:  ::::..:::: .:.    
CCDS45 DPRVLSNTGWGQTPVKQNTAWEFEESPRSERKNDNGTEAWGCAATQASNSGGKNDGSIMN
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pF1KSD SQSNQMKSGW-----GELSASTEWKD-----PKNTGGWNDYKNNNSSN----------WG
       : ...  :::     . . :.: : :     :.. : :.:  .... .          :.
CCDS45 STNTSSVSGWVNAPPAAVPANTGWGDSNNKAPSGPGVWGDSISSTAVSTAAAAKSGHAWS
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pF1KSD GGRPDEKTPSSWNENPS-KDQGWGGGRQPNQGWSSGKNGW-------GEEVDQTKN-SNW
       :.  .:    .:.: :. :.: :: :.. : .::.: . :       :.  :  :: :.:
CCDS45 GAANQEDKSPTWGEPPKPKSQHWGDGQRSNPAWSAGGGDWADSSSVLGHLGDGKKNGSGW
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pF1KSD ESSASKPVSGWGEGGQNEIGTWGNGGNASLASKGGW-EDCKRSPAWNETGRQPNSWNKQH
       ......  :::..  ..  . :::. :..     .: :  : .:  :        : .. 
CCDS45 DADSNRSGSGWNDTTRSGNSGWGNSTNTKANPGTNWGETLKPGPQQN--------WASK-
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              830       840       850       860       870          
pF1KSD QQQQPPQQPPPPQPEASGSWGGPPPPPPGNVRPSNSSWSSGPQPATPKDE-EPSGWEEPS
                  :: .  ..:::      ..:. ....: .:: :.  ::  : .::::::
CCDS45 -----------PQDNNVSNWGGA-----ASVKQTGTGWIGGPVPVKQKDSSEATGWEEPS
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pF1KSD PQSISRKMDIDDGTSAWGDPNSYNYKNVNLWDKN--------------------------
       : :: :::.:::::::::::..:: :.::.::.:                          
CCDS45 PPSIRRKMEIDDGTSAWGDPSNYNNKTVNMWDRNNPVIQSSTTTNTTTTTTTTTSNTTHR
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                                  920                              
pF1KSD ----------------------SQG-GPAPR----------EPNLPT------------P
                             :.: :  :           ::. :.            :
CCDS45 VETPPPHQAGTQLNRSPLLGPVSSGWGEMPNVHSKTENSWGEPSSPSTLVDNGTAAWGKP
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      930                                 940       950       960  
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        .: :. .:                         :::::.::: : :   .    .::.:
CCDS45 PSSGSGWGDHPAEPPVAFGRAGAPVAASALCKPASKSMQEGWG-SGGDEMNLSTSQWEDE
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pF1KSD EDGGVWNTTGSQGSASSHNSASWGQGGKKQMKCSLK--GGNNDSW-MNPLAKQFSNMGLL
       : : :::...:: :.::   .:::.. :: .. ..:  : ....: :. : ::...::. 
CCDS45 E-GDVWNNAASQESTSS--CSSWGNAPKKGLQKGMKTSGKQDEAWIMSRLIKQLTDMGFP
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pF1KSD SQTEDNP--SSKMDL--SVGSLSDKKFDVDKRAMNLGDFNDIMRKDRSGFRPPNSKDMGT
        .  ..   :..:.:  ....: .:: :::::.... : : .  :   : ::: ::. ..
CCDS45 REPAEEALKSNNMNLDQAMSALLEKKVDVDKRGLGVTDHNGMAAKPL-GCRPPISKE-SS
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pF1KSD TDSGPYFEKGG---------------------SH--------------------------
       .:   ...: :                     ::                          
CCDS45 VDRPTFLDKDGGLVEEPTPSPFLPSPSLKLPLSHSALPSQALGGIASGLGMQNLNSSRQI
     1010      1020      1030      1040      1050      1060        

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pF1KSD -----GLFGNS-TAQSRGLHTP----VQPLNSS-PSLRAQVPPQFISPQVSASMLKQFP-
            :.:::: .::.: .. :    ::::::: :::::::: ::.::::.:..: ::  
CCDS45 PSGNLGMFGNSGAAQARTMQQPPQPPVQPLNSSQPSLRAQVP-QFLSPQVQAQLL-QFAA
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CCDS45 KNIGLNPALLT-SP-INPQHMTMLNQLYQL---QLAYQRL---QIQQQMLQAQRNVSGSM
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CCDS45 RQQ-EQQVARTITNLQQQIQQHQRQLAQALLVKQPPPPPPPPHLSLHPSAGKSAMDSFPS
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pF1KSD NALNVGLPDLQTK---------GPIP--GYGSGFSSGGMDYGMVGG---KEAG-TESRFK
       .  . ::::::::         .: :  : . ... ..::  :.::   :. . ..::. 
CCDS45 HPQTPGLPDLQTKEQQSSPNTFAPYPLAGLNPNMNVNSMD--MTGGLSVKDPSQSQSRLP
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pF1KSD QWT--SMMEGLPSVATQ-EANMHKNGAIVA------PGKTRGGSPYNQFDIIPGDTLGGH
       :::  . :..:::.:.  : :  :.::: .      :::.   . :...:.:  .. .  
CCDS45 QWTHPNSMDNLPSAASPLEQNPSKHGAIPGGLSIGPPGKSSIDDSYGRYDLIQ-NSESPA
        1300      1310      1320      1330      1340       1350    

      1340        1350      1360      1370      1380      1390     
pF1KSD TGPAG--DSWLPAKSPPTNKIGSKSSNASWPPEFQPGVPWKGIQNIDPESDPYVTPGSV-
       . :..   ::  :::  ..:: :..:. .:::::.:::::::.::::::.:: :::::: 
CCDS45 SPPVAVPHSWSRAKSD-SDKI-SNGSSINWPPEFHPGVPWKGLQNIDPENDPDVTPGSVP
         1360      1370        1380      1390      1400      1410  

         1400      1410      1420      1430        1440            
pF1KSD LGGTATSPIVDTDHQLLRDNTTGSNSSLNTSLPSPGAWPYSAS--DNSFTNVHST---SA
        : : .. : :... ::... ..  :: :..::: .::: :::  ..::... :.   ..
CCDS45 TGPTINTTIQDVNRYLLKSGGSSPPSSQNATLPSSSAWPLSASGYSSSFSSIASAPSVAG
           1420      1430      1440      1450      1460      1470  

    1450      1460      1470      1480      1490      1500         
pF1KSD KFPDYKSTWSPDPIGHNPTHLSNKMWKNHISSRNTTPLPRPPPGLTNPKPSSPWSSTAPR
       :. : :::::  : .:. . ::...::     ::.:   ::::::::::::: :... : 
CCDS45 KLSDIKSTWSSGPTSHTQASLSHELWK---VPRNSTAPTRPPPGLTNPKPSSTWGAS-PL
           1480      1490         1500      1510      1520         

    1510      1520      1530      1540      1550      1560         
pF1KSD SVRGWGTQDSRLASASTWSDGGSVRPSYWLVLHNLTPQIDGSTLRTICMQHGPLLTFHLN
          ::    :  .:.:.::   : : : ::::.:::::::::::::.:.:::::.:::::
CCDS45 ---GW---TSSYSSGSAWSTDTSGRTSSWLVLRNLTPQIDGSTLRTLCLQHGPLITFHLN
        1530         1540      1550      1560      1570      1580  

    1570      1580      1590      1600      1610      1620         
pF1KSD LTQGTALIRYSTKQEAAKAQTALHMCVLGNTTILAEFATDDEVSRFLAQAQPPTPAATPS
       ::::.:..:::.:.:::::: .:::::::::::::::: ..::.:::::.:     : : 
CCDS45 LTQGNAVVRYSSKEEAAKAQKSLHMCVLGNTTILAEFAGEEEVNRFLAQGQ-----ALP-
           1590      1600      1610      1620      1630            

    1630      1640      1650      1660            1670      1680   
pF1KSD APAAGWQSLETGQNQSDPVGPALNLFGGSTGL-----GQWSSSA-GGSSGADLAGASLWG
        :...:::  ....:     : :.  :.: ::     :.:..   ::.....:    :::
CCDS45 -PTSSWQS-SSASSQ-----PRLSAAGSSHGLVRSDAGHWNAPCLGGKGSSEL----LWG
        1640            1650      1660      1670      1680         

           1690      1700         1710      1720  
pF1KSD P-PNYSSSLWGVPTVEDPHRMGSPAPL---LPGDLLGGGSDSI
         :.::::::: :...: . .:::.::   ::::::.: :   
CCDS45 GVPQYSSSLWGPPSADDSRVIGSPTPLTTLLPGDLLSGESL  
        1690      1700      1710      1720        

>>CCDS45798.1 TNRC6C gene_id:57690|Hs108|chr17            (1690 aa)
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CCDS45                MATGSAQGNFTGHTKKTNGNNGTNGALVQSPSNQSALGAGGANSN
                              10        20        30        40     

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pF1KSD KGKGSQCQSASSGNECNLGVWKSDPKAKSVQSSNSTTENNNGLGNWRNVSGQDRIGPGSG
        :....  ....:.  .:.         ::.....  ..  : :  .:  : .  . : .
CCDS45 -GSAARVWGVATGSSSGLA-------HCSVSGGDGKMDTMIGDGRSQNCWGASNSNAGIN
           50        60               70        80        90       

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pF1KSD FSNFNPNSNPSAWPALVQEGTSRKGALETDNSNSSAQVSTVGQTSRE-------------
       . :.:::.::.:::.: .:::   :   .  :  ::  ...:. . .             
CCDS45 L-NLNPNANPAAWPVLGHEGTVATGNPSSICSPVSAIGQNMGNQNGNPTGTLGAWGNLLP
        100       110       120       130       140       150      

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pF1KSD QQSKMENAGVNFVVSGREQAQIHNTDGPKNGNTNSLNLSSPNP---MENKGMP-FGM--G
       :.:   .....  ::   : :  :::::.:  :: .: :::::   :...:.: .::  :
CCDS45 QESTEPQTSTSQNVSFSAQPQNLNTDGPNN--TNPMN-SSPNPINAMQTNGLPNWGMAVG
        160       170       180         190        200       210   

     400                410       420        430       440         
pF1KSD LGNT---------SRSTDAPSQSTGDRKTGSVGS-WGAARGPSGTDTVSGQSNSGNNGNN
       .:           . . .. :: .:    :  .: :: . :    . ..:.:::: . .:
CCDS45 MGAIIPPHLQGLPGANGSSVSQVSGGSAEGISNSVWGLSPG----NPATGNSNSGFSQGN
           220       230       240       250           260         

     450       460       470       480       490          500      
pF1KSD GKEREDSWKGASVQKSTGSKNDSWDNNNRSTGGSWNFGPQDSNDN-KWGEG--NKMTSGV
       :    :. ..:   :..::.  :  ... : :..:. ::  .     ::.:  :. ....
CCDS45 G----DTVNSALSAKQNGSS--SAVQKEGSGGNAWDSGPPAGPGILAWGRGSGNNGVGNI
     270           280         290       300       310       320   

        510       520        530       540            550          
pF1KSD SQGEWKQPTGSDELKI-GEWSGPNQPNSSTGAWDNQKGH-----PLPENQ------GNAQ
        .: : .:. :    . :::. :  ::. ...  : ::      :   .:      :. .
CCDS45 HSGAWGHPSRSTSNGVNGEWGKP--PNQHSNSDINGKGSTGWESPSVTSQNPTVQPGGEH
           330       340         350       360       370       380 

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pF1KSD APCWGRSSSSTGSEVGGQSTGS-NHKAGSSDSHNSGRRSYRPTHPDCQAVLQTLLSRTDL
          :....::  .   :.: :: ::. ::.  ...:.   :      :. .:  : :.::
CCDS45 MNSWAKAASSGTTASEGSSDGSGNHNEGSTGREGTGEGRRRDKGIIDQGHIQ--LPRNDL
             390       400       410       420       430           

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pF1KSD DPRVLSNTGWGQTQIKQDTVWDIEEVPRPEGKSDKGTEGWESAATQTKNSGGWGDAP---
       ::::::::::::: .::.:.:..:: :: : :.:.:::.:  ::::..:::: .:.    
CCDS45 DPRVLSNTGWGQTPVKQNTAWEFEESPRSERKNDNGTEAWGCAATQASNSGGKNDGSIMN
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pF1KSD SQSNQMKSGW-----GELSASTEWKD-----PKNTGGWNDYKNNNSSN----------WG
       : ...  :::     . . :.: : :     :.. : :.:  .... .          :.
CCDS45 STNTSSVSGWVNAPPAAVPANTGWGDSNNKAPSGPGVWGDSISSTAVSTAAAAKSGHAWS
     500       510       520       530       540       550         

              720        730       740              750        760 
pF1KSD GGRPDEKTPSSWNENPS-KDQGWGGGRQPNQGWSSGKNGW-------GEEVDQTKN-SNW
       :.  .:    .:.: :. :.: :: :.. : .::.: . :       :.  :  :: :.:
CCDS45 GAANQEDKSPTWGEPPKPKSQHWGDGQRSNPAWSAGGGDWADSSSVLGHLGDGKKNGSGW
     560       570       580       590       600       610         

             770       780       790        800       810       820
pF1KSD ESSASKPVSGWGEGGQNEIGTWGNGGNASLASKGGW-EDCKRSPAWNETGRQPNSWNKQH
       ......  :::..  ..  . :::. :..     .: :  : .:  :        : .. 
CCDS45 DADSNRSGSGWNDTTRSGNSGWGNSTNTKANPGTNWGETLKPGPQQN--------WASK-
     620       630       640       650       660               670 

              830       840       850       860       870          
pF1KSD QQQQPPQQPPPPQPEASGSWGGPPPPPPGNVRPSNSSWSSGPQPATPKDE-EPSGWEEPS
                  :: .  ..:::      ..:. ....: .:: :.  ::  : .::::::
CCDS45 -----------PQDNNVSNWGGA-----ASVKQTGTGWIGGPVPVKQKDSSEATGWEEPS
                         680            690       700       710    

     880       890       900       910                             
pF1KSD PQSISRKMDIDDGTSAWGDPNSYNYKNVNLWDKN--------------------------
       : :: :::.:::::::::::..:: :.::.::.:                          
CCDS45 PPSIRRKMEIDDGTSAWGDPSNYNNKTVNMWDRNNPVIQSSTTTNTTTTTTTTTSNTTHR
          720       730       740       750       760       770    

                                     920                           
pF1KSD -------------------------SQG-GPAPR----------EPNLPT----------
                                :.: :  :           ::. :.          
CCDS45 VETPPPHQAGTQLNRSPLLGPGRKVSSGWGEMPNVHSKTENSWGEPSSPSTLVDNGTAAW
          780       790       800       810       820       830    

         930                                 940       950         
pF1KSD --PMTSKSA-SD-------------------------SKSMQDGWGESDGPVTGARHPSW
         : .: :. .:                         :::::.::: : :   .    .:
CCDS45 GKPPSSGSGWGDHPAEPPVAFGRAGAPVAASALCKPASKSMQEGWG-SGGDEMNLSTSQW
          840       850       860       870       880        890   

     960       970       980       990        1000       1010      
pF1KSD EEEEDGGVWNTTGSQGSASSHNSASWGQGGKKQMKCSLK--GGNNDSW-MNPLAKQFSNM
       :.:: : :::...:: :.::   .:::.. :: .. ..:  : ....: :. : ::...:
CCDS45 EDEE-GDVWNNAASQESTSS--CSSWGNAPKKGLQKGMKTSGKQDEAWIMSRLIKQLTDM
            900       910         920       930       940       950

       1020        1030        1040      1050      1060      1070  
pF1KSD GLLSQTEDNP--SSKMDL--SVGSLSDKKFDVDKRAMNLGDFNDIMRKDRSGFRPPNSKD
       :.  .  ..   :..:.:  ....: .:: :::::.... : : .  :   : ::: ::.
CCDS45 GFPREPAEEALKSNNMNLDQAMSALLEKKVDVDKRGLGVTDHNGMAAKPL-GCRPPISKE
              960       970       980       990      1000          

           1080                                                    
pF1KSD MGTTDSGPYFEKGG---------------------SH-----------------------
        ...:   ...: :                     ::                       
CCDS45 -SSVDRPTFLDKDGGLVEEPTPSPFLPSPSLKLPLSHSALPSQALGGIASGLGMQNLNSS
     1010      1020      1030      1040      1050      1060        

             1090       1100          1110       1120      1130    
pF1KSD --------GLFGNS-TAQSRGLHTP----VQPLNSS-PSLRAQVPPQFISPQVSASMLKQ
               :.:::: .::.: .. :    ::::::: :::::::: ::.::::.:..: :
CCDS45 RQIPSGNLGMFGNSGAAQARTMQQPPQPPVQPLNSSQPSLRAQVP-QFLSPQVQAQLL-Q
     1070      1080      1090      1100      1110       1120       

           1140      1150      1160      1170      1180      1190  
pF1KSD FP--NSGLSPGLFNVGPQLSPQQIAMLSQLPQIPQFQLACQLLLQQQQQQQLLQNQRKIS
       :   : ::.:.:.. .: ..::...::.:: :.   ::: : :   : :::.:: ::..:
CCDS45 FAAKNIGLNPALLT-SP-INPQHMTMLNQLYQL---QLAYQRL---QIQQQMLQAQRNVS
       1130      1140        1150         1160         1170        

           1200      1210                    1220      1230        
pF1KSD QAVRQQQEQQLARMVSALQQQ-QQQQRQ-------------PGMKHSPSHPVGPKPHLDN
        ..::: :::.:: .. :::: ::.:::             :   :   :: . :  .:.
CCDS45 GSMRQQ-EQQVARTITNLQQQIQQHQRQLAQALLVKQPPPPPPPPHLSLHPSAGKSAMDS
     1180       1190      1200      1210      1220      1230       

     1240      1250                 1260      1270         1280    
pF1KSD MVPNALNVGLPDLQTK---------GPIP--GYGSGFSSGGMDYGMVGG---KEAG-TES
       .  .  . ::::::::         .: :  : . ... ..::  :.::   :. . ..:
CCDS45 FPSHPQTPGLPDLQTKEQQSSPNTFAPYPLAGLNPNMNVNSMD--MTGGLSVKDPSQSQS
      1240      1250      1260      1270      1280        1290     

            1290      1300       1310            1320      1330    
pF1KSD RFKQWT--SMMEGLPSVATQ-EANMHKNGAIVA------PGKTRGGSPYNQFDIIPGDTL
       :. :::  . :..:::.:.  : :  :.::: .      :::.   . :...:.:  .. 
CCDS45 RLPQWTHPNSMDNLPSAASPLEQNPSKHGAIPGGLSIGPPGKSSIDDSYGRYDLIQ-NSE
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       .  . :..   ::  :::  ..:: :..:. .:::::.:::::::.::::::.:: ::::
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       ::  : : .. : :... ::.                                  ...:.
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