Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1044
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1044, 630 aa
1>>>pF1KSDA1044 630 - 630 aa - 630 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9925+/-0.000889; mu= 16.3441+/- 0.053
mean_var=98.6191+/-19.542, 0's: 0 Z-trim(107.7): 97 B-trim: 88 in 1/51
Lambda= 0.129150
statistics sampled from 9590 (9738) to 9590 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.659), E-opt: 0.2 (0.299), width: 16
Scan time: 3.690
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5776.1 KCND2 gene_id:3751|Hs108|chr7 ( 630) 4186 790.9 0
CCDS844.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 636) 3230 612.8 4.5e-175
CCDS14314.1 KCND1 gene_id:3750|Hs108|chrX ( 647) 2797 532.1 8.9e-151
CCDS843.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 655) 2757 524.6 1.6e-148
CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs108|chr8 ( 911) 943 186.8 1.1e-46
CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs108|chr20 ( 858) 918 182.1 2.7e-45
CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs108|chr2 ( 494) 764 153.2 7.7e-37
CCDS828.2 KCNA3 gene_id:3738|Hs108|chr1 ( 575) 660 133.9 5.9e-31
CCDS6314.1 KCNV1 gene_id:27012|Hs108|chr8 ( 500) 659 133.6 6e-31
CCDS12755.1 KCNA7 gene_id:3743|Hs108|chr19 ( 456) 656 133.1 8.3e-31
CCDS8535.1 KCNA1 gene_id:3736|Hs108|chr12 ( 495) 647 131.4 2.8e-30
CCDS826.1 KCNA10 gene_id:3744|Hs108|chr1 ( 511) 638 129.7 9.2e-30
CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs108|chr2 ( 491) 560 115.2 2.1e-25
CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs108|chr8 ( 477) 541 111.6 2.4e-24
CCDS827.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1 ( 499) 537 110.9 4.2e-24
CCDS13342.1 KCNS1 gene_id:3787|Hs108|chr20 ( 526) 512 106.3 1.1e-22
CCDS41629.1 KCNA4 gene_id:3739|Hs108|chr11 ( 653) 510 106.0 1.7e-22
CCDS8536.1 KCNA5 gene_id:3741|Hs108|chr12 ( 613) 509 105.8 1.8e-22
CCDS8534.1 KCNA6 gene_id:3742|Hs108|chr12 ( 529) 508 105.5 1.9e-22
CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 425) 450 94.6 2.8e-19
CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs108|chr18 ( 466) 428 90.6 5.2e-18
CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 436) 395 84.4 3.5e-16
CCDS10945.1 KCNG4 gene_id:93107|Hs108|chr16 ( 519) 393 84.1 5.2e-16
CCDS13436.1 KCNG1 gene_id:3755|Hs108|chr20 ( 513) 386 82.8 1.3e-15
CCDS6447.1 KCNV2 gene_id:169522|Hs108|chr9 ( 545) 364 78.7 2.3e-14
CCDS55625.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1 ( 356) 328 71.9 1.7e-12
CCDS7827.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs108|chr11 ( 511) 310 68.6 2.3e-11
CCDS44547.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs108|chr11 ( 585) 307 68.1 3.8e-11
CCDS9006.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 558) 305 67.7 4.7e-11
CCDS58255.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 583) 305 67.7 4.9e-11
CCDS9005.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 613) 305 67.7 5.1e-11
CCDS58257.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 618) 305 67.8 5.1e-11
CCDS44193.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs108|chr1 ( 626) 305 67.8 5.1e-11
CCDS58256.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 629) 305 67.8 5.2e-11
CCDS821.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs108|chr1 ( 635) 305 67.8 5.2e-11
CCDS9007.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 638) 305 67.8 5.2e-11
CCDS12793.1 KCNC3 gene_id:3748|Hs108|chr19 ( 757) 306 68.0 5.2e-11
>>CCDS5776.1 KCND2 gene_id:3751|Hs108|chr7 (630 aa)
initn: 4186 init1: 4186 opt: 4186 Z-score: 4219.3 bits: 790.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4186; 100.0% identity (100.0% similar) in 630 aa overlap (1-630:1-630)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAAGVAAWLPFARAAAIGWMPVASGPMPAPPRQERKRTQDALIVLNVSGTRFQTWQDTLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 MAAGVAAWLPFARAAAIGWMPVASGPMPAPPRQERKRTQDALIVLNVSGTRFQTWQDTLE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RYPDTLLGSSERDFFYHPETQQYFFDRDPDIFRHILNFYRTGKLHYPRHECISAYDEELA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 RYPDTLLGSSERDFFYHPETQQYFFDRDPDIFRHILNFYRTGKLHYPRHECISAYDEELA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD FFGLIPEIIGDCCYEEYKDRRRENAERLQDDADTDTAGESALPTMTARQRVWRAFENPHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 FFGLIPEIIGDCCYEEYKDRRRENAERLQDDADTDTAGESALPTMTARQRVWRAFENPHT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD STMALVFYYVTGFFIAVSVIANVVETVPCGSSPGHIKELPCGERYAVAFFCLDTACVMIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 STMALVFYYVTGFFIAVSVIANVVETVPCGSSPGHIKELPCGERYAVAFFCLDTACVMIF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD TVEYLLRLAAAPSRYRFVRSVMSIIDVVAILPYYIGLVMTDNEDVSGAFVTLRVFRVFRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 TVEYLLRLAAAPSRYRFVRSVMSIIDVVAILPYYIGLVMTDNEDVSGAFVTLRVFRVFRI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD FKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAIIIFATVMFYAEKGSSASKFTSIPAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 FKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAIIIFATVMFYAEKGSSASKFTSIPAA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD FWYTIVTMTTLGYGDMVPKTIAGKIFGSICSLSGVLVIALPVPVIVSNFSRIYHQNQRAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 FWYTIVTMTTLGYGDMVPKTIAGKIFGSICSLSGVLVIALPVPVIVSNFSRIYHQNQRAD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD KRRAQKKARLARIRAAKSGSANAYMQSKRNGLLSNQLQSSEDEQAFVSKSGSSFETQHHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 KRRAQKKARLARIRAAKSGSANAYMQSKRNGLLSNQLQSSEDEQAFVSKSGSSFETQHHH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LLHCLEKTTNHEFVDEQVFEESCMEVATVNRPSSHSPSLSSQQGVTSTCCSRRHKKTFRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LLHCLEKTTNHEFVDEQVFEESCMEVATVNRPSSHSPSLSSQQGVTSTCCSRRHKKTFRI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD PNANVSGSHQGSIQELSTIQIRCVERTPLSNSRSSLNAKMEECVKLNCEQPYVTTAIISI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 PNANVSGSHQGSIQELSTIQIRCVERTPLSNSRSSLNAKMEECVKLNCEQPYVTTAIISI
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KSD PTPPVTTPEGDDRPESPEYSGGNIVRVSAL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 PTPPVTTPEGDDRPESPEYSGGNIVRVSAL
610 620 630
>>CCDS844.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 (636 aa)
initn: 2161 init1: 1482 opt: 3230 Z-score: 3256.5 bits: 612.8 E(32554): 4.5e-175
Smith-Waterman score: 3237; 76.0% identity (89.7% similar) in 641 aa overlap (1-630:1-636)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAAGVAAWLPFARAAAIGWMPVASGPMPAPPRQERKRTQDALIVLNVSGTRFQTWQDTLE
:::::::::::::::::::::::. ::: : .. :: :: :::::::: :::::. :::
CCDS84 MAAGVAAWLPFARAAAIGWMPVANCPMPLAPADKNKR-QDELIVLNVSGRRFQTWRTTLE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RYPDTLLGSSERDFFYHPETQQYFFDRDPDIFRHILNFYRTGKLHYPRHECISAYDEELA
:::::::::.:..::.. .:..:::::::..:: .:::::::::::::.:::::::.:::
CCDS84 RYPDTLLGSTEKEFFFNEDTKEYFFDRDPEVFRCVLNFYRTGKLHYPRYECISAYDDELA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD FFGLIPEIIGDCCYEEYKDRRRENAERLQDDADTDTAGESALPTMTARQRVWRAFENPHT
:.:..:::::::::::::::.:::::::.:: :... :: .:... :: .:::::::::
CCDS84 FYGILPEIIGDCCYEEYKDRKRENAERLMDDNDSENNQES-MPSLSFRQTMWRAFENPHT
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD STMALVFYYVTGFFIAVSVIANVVETVPCGSSPGHIKELPCGERYAVAFFCLDTACVMIF
::.:::::::::::::::::.:::::::::. :: :::::::::.::::::::::::::
CCDS84 STLALVFYYVTGFFIAVSVITNVVETVPCGTVPGS-KELPCGERYSVAFFCLDTACVMIF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD TVEYLLRLAAAPSRYRFVRSVMSIIDVVAILPYYIGLVMTDNEDVSGAFVTLRVFRVFRI
:::::::: ::::::::.::::::::::::.:::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS84 TVEYLLRLFAAPSRYRFIRSVMSIIDVVAIMPYYIGLVMTNNEDVSGAFVTLRVFRVFRI
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD FKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAIIIFATVMFYAEKGSSASKFTSIPAA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS84 FKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAIIIFATVMFYAEKGSSASKFTSIPAS
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD FWYTIVTMTTLGYGDMVPKTIAGKIFGSICSLSGVLVIALPVPVIVSNFSRIYHQNQRAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 FWYTIVTMTTLGYGDMVPKTIAGKIFGSICSLSGVLVIALPVPVIVSNFSRIYHQNQRAD
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470
pF1KSD KRRAQKKARLARIRAAKSGSANAYMQSKRNGLLSNQLQ-SSEDEQAFVSKSGSSFETQHH
::::::::::::::.::.::.:::..:::::::.. :. .. :. ..:. : .:.:::
CCDS84 KRRAQKKARLARIRVAKTGSSNAYLHSKRNGLLNEALELTGTPEEEHMGKTTSLIESQHH
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD HLLHCLEKTTNHEFVDEQVFEESCMEVATVNRPSSHSPSLSSQQGVTSTCCSRRHKKTFR
::::::::::::::.:::.::..::: . : ::..::::::. :.:.:::::: ::: .
CCDS84 HLLHCLEKTTNHEFIDEQMFEQNCMESSMQNYPSTRSPSLSSHPGLTTTCCSRRSKKTTH
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KSD IPNANVSGSHQGSIQELSTIQIRCVERTPLSNSRSSLNAKMEECVKLNCEQPYVTTAIIS
.::.:. ... :.::::::.:. :. :..:::::: : .. .. ::. .::::::
CCDS84 LPNSNLPATRLRSMQELSTIHIQGSEQPSLTTSRSSLNLKADDGLRPNCKTSQITTAIIS
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630
pF1KSD IPTPPVTTPEGDDRPESPEYSGG----------NIVRVSAL
:::::. ::::..:: : : : :.:.::::
CCDS84 IPTPPALTPEGESRP--PPASPGPNTNIPSIASNVVKVSAL
600 610 620 630
>>CCDS14314.1 KCND1 gene_id:3750|Hs108|chrX (647 aa)
initn: 2012 init1: 1344 opt: 2797 Z-score: 2820.4 bits: 532.1 E(32554): 8.9e-151
Smith-Waterman score: 2797; 67.3% identity (85.8% similar) in 640 aa overlap (1-630:1-632)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAAGVAAWLPFARAAAIGWMPVASGPMPAPPRQERKRTQDALIVLNVSGTRFQTWQDTLE
::::.:.:::::::::.::.:.:. :.: : . .: : ..:.:::: ::.::..::.
CCDS14 MAAGLATWLPFARAAAVGWLPLAQQPLPPAPGVKASRG-DEVLVVNVSGRRFETWKNTLD
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RYPDTLLGSSERDFFYHPETQQYFFDRDPDIFRHILNFYRTGKLHYPRHECISAYDEELA
:::::::::::..::: .. .::::::::.:::.:::::::.:: ::.:::.:.:::::
CCDS14 RYPDTLLGSSEKEFFYDADSGEYFFDRDPDMFRHVLNFYRTGRLHCPRQECIQAFDEELA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KSD FFGLIPEIIGDCCYEEYKDRRRENAERLQDDADTDTAGES-ALPTMTA-RQRVWRAFENP
:.::.::..:::: :::.::..:::::: .: ... ::.. :::. .. :::.:::::::
CCDS14 FYGLVPELVGDCCLEEYRDRKKENAERLAEDEEAEQAGDGPALPAGSSLRQRLWRAFENP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD HTSTMALVFYYVTGFFIAVSVIANVVETVPC-GSSPGHIKELPCGERYAVAFFCLDTACV
:::: :::::::::::::::::::::::.:: ::. .: :::::. ::::.:::::
CCDS14 HTSTAALVFYYVTGFFIAVSVIANVVETIPCRGSARRSSREQPCGERFPQAFFCMDTACV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD MIFTVEYLLRLAAAPSRYRFVRSVMSIIDVVAILPYYIGLVMTDNEDVSGAFVTLRVFRV
.::: :::::: ::::: ::.:::::.:::::::::::::.. :.::::::::::::::
CCDS14 LIFTGEYLLRLFAAPSRCRFLRSVMSLIDVVAILPYYIGLLVPKNDDVSGAFVTLRVFRV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD FRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAIIIFATVMFYAEKGSSASKFTSI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.. ..::::
CCDS14 FRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAIIIFATVMFYAEKGTNKTNFTSI
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD PAAFWYTIVTMTTLGYGDMVPKTIAGKIFGSICSLSGVLVIALPVPVIVSNFSRIYHQNQ
:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PAAFWYTIVTMTTLGYGDMVPSTIAGKIFGSICSLSGVLVIALPVPVIVSNFSRIYHQNQ
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD RADKRRAQKKARLARIRAAKSGSANAYMQSKRNGLLSNQLQSSEDEQAFVSKSGSSFETQ
::::::::.:.:::::: ::::..::..: :.:: : . ..: .:::. .. :.:: :
CCDS14 RADKRRAQQKVRLARIRLAKSGTTNAFLQYKQNGGLED--SGSGEEQALCVRNRSAFEQQ
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD HHHLLHCLEKTTNHEFVDEQVFEESCMEVATVNRPSSHSPSLSSQQ----GVTSTCCSRR
:::::::::::: :::.:: .: :. :. .: .:.: :.::: .. :.:: ::
CCDS14 HHHLLHCLEKTTCHEFTDELTFSEALGAVSPGGR-TSRSTSVSSQPVGPGSLLSSCCPRR
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KSD HKK-TFRIPNANVSGSHQGSIQELSTIQIRCVERTPLSNSRSSLNAKMEECVKLNCEQPY
:. ..:. :...: : .::.:::. . ..:. .:::::::: .. . :::..
CCDS14 AKRRAIRLANSTASVS-RGSMQELDMLA--GLRRSHAPQSRSSLNAKPHDSLDLNCDSRD
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630
pF1KSD VTTAIISIPTPPVTTPEGDDRPESPEYSG--GNIVRVSAL
..:::::::::..::. ...: :: .: :. .: :.:
CCDS14 FVAAIISIPTPPANTPD-ESQPSSPGGGGRAGSTLRNSSLGTPCLFPETVKISSL
600 610 620 630 640
>>CCDS843.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 (655 aa)
initn: 2635 init1: 1482 opt: 2757 Z-score: 2780.1 bits: 524.6 E(32554): 1.6e-148
Smith-Waterman score: 3189; 73.8% identity (87.1% similar) in 660 aa overlap (1-630:1-655)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAAGVAAWLPFARAAAIGWMPVASGPMPAPPRQERKRTQDALIVLNVSGTRFQTWQDTLE
:::::::::::::::::::::::. ::: : .. :: :: :::::::: :::::. :::
CCDS84 MAAGVAAWLPFARAAAIGWMPVANCPMPLAPADKNKR-QDELIVLNVSGRRFQTWRTTLE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RYPDTLLGSSERDFFYHPETQQYFFDRDPDIFRHILNFYRTGKLHYPRHECISAYDEELA
:::::::::.:..::.. .:..:::::::..:: .:::::::::::::.:::::::.:::
CCDS84 RYPDTLLGSTEKEFFFNEDTKEYFFDRDPEVFRCVLNFYRTGKLHYPRYECISAYDDELA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD FFGLIPEIIGDCCYEEYKDRRRENAERLQDDADTDTAGESALPTMTARQRVWRAFENPHT
:.:..:::::::::::::::.:::::::.:: :... :: .:... :: .:::::::::
CCDS84 FYGILPEIIGDCCYEEYKDRKRENAERLMDDNDSENNQES-MPSLSFRQTMWRAFENPHT
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD STMALVFYYVTGFFIAVSVIANVVETVPCGSSPGHIKELPCGERYAVAFFCLDTACVMIF
::.:::::::::::::::::.:::::::::. :: :::::::::.::::::::::::::
CCDS84 STLALVFYYVTGFFIAVSVITNVVETVPCGTVPGS-KELPCGERYSVAFFCLDTACVMIF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD TVEYLLRLAAAPSRYRFVRSVMSIIDVVAILPYYIGLVMTDNEDVSGAFVTLRVFRVFRI
:::::::: ::::::::.::::::::::::.:::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS84 TVEYLLRLFAAPSRYRFIRSVMSIIDVVAIMPYYIGLVMTNNEDVSGAFVTLRVFRVFRI
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD FKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAIIIFATVMFYAEKGSSASKFTSIPAA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS84 FKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAIIIFATVMFYAEKGSSASKFTSIPAS
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD FWYTIVTMTTLGYGDMVPKTIAGKIFGSICSLSGVLVIALPVPVIVSNFSRIYHQNQRAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 FWYTIVTMTTLGYGDMVPKTIAGKIFGSICSLSGVLVIALPVPVIVSNFSRIYHQNQRAD
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470
pF1KSD KRRAQKKARLARIRAAKSGSANAYMQSKRNGLLSNQLQ-SSEDEQAFVSKSGSSFETQHH
::::::::::::::.::.::.:::..:::::::.. :. .. :. ..:. : .:.:::
CCDS84 KRRAQKKARLARIRVAKTGSSNAYLHSKRNGLLNEALELTGTPEEEHMGKTTSLIESQHH
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520
pF1KSD HLLHCLEKTT-------------------NHEFVDEQVFEESCMEVATVNRPSSHSPSLS
:::::::::: ::::.:::.::..::: . : ::..:::::
CCDS84 HLLHCLEKTTGLSYLVDDPLLSVRTSTIKNHEFIDEQMFEQNCMESSMQNYPSTRSPSLS
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KSD SQQGVTSTCCSRRHKKTFRIPNANVSGSHQGSIQELSTIQIRCVERTPLSNSRSSLNAKM
:. :.:.:::::: ::: ..::.:. ... :.::::::.:. :. :..:::::: :
CCDS84 SHPGLTTTCCSRRSKKTTHLPNSNLPATRLRSMQELSTIHIQGSEQPSLTTSRSSLNLKA
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630
pF1KSD EECVKLNCEQPYVTTAIISIPTPPVTTPEGDDRPESPEYSGG----------NIVRVSAL
.. .. ::. .:::::::::::. ::::..:: : : : :.:.::::
CCDS84 DDGLRPNCKTSQITTAIISIPTPPALTPEGESRP--PPASPGPNTNIPSIASNVVKVSAL
600 610 620 630 640 650
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10 20 30 40 50 60
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: : :..: . . .::.: .. ::.
CCDS62 MAEKAPPGLNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKINVGGLNHEVLWRTLD
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KSD RYPDTLLG-----SSERDFF-----YHPETQQYFFDRDPDIFRHILNFYRTGKLHYPRHE
: : : :: ....... :. . ..::::: : : :::::::::::. ..
CCDS62 RLPRTRLGKLRDCNTHESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGKLHMMEEM
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120 130 140 150 160
pF1KSD CISAYDEELAFFGLIPEIIGDCCYEEYKDRRRENAERLQDDADT--DTAGESALPTMTA-
: .. .:: ..:. . .:: .:...... :.:. .:.: . :: :
CCDS62 CALSFGQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELRREAETMREREGEEFDNTCCPD
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD -RQRVWRAFENPHTSTMALVFYYVTGFFIAVSVIANVVETVPCGSSPGHIKELPCGERYA
:...: .:.:..:. : .. :. .::..:.:: ..:.: . .. .: ... :
CCDS62 KRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLPELQETDEFGQLNDNRQLA
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD VAFFCLDTACVMIFTVEYLLRLAAAPSRYRFVRSVMSIIDVVAILPYYIGLVMTDN----
....:. ::.:::::. ..:....: .. ...::..::::::. . .:..
CCDS62 ----HVEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAILPYYVTIFLTESNKSV
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pF1KSD ---EDVSGAFVTLRVFRVFRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAIIIFA
..: . .:..:..::.:..::: ::. ::.::. .:::.:.. :.:.:.::.
CCDS62 LQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFS
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340 350 360 370 380 390
pF1KSD TVMFYAEKGSSASKFTSIPAAFWYTIVTMTTLGYGDMVPKTIAGKIFGSICSLSGVLVIA
...:.::: .:.:::::::.::.. .::::.::::. :::. ::: :..: ..::::::
CCDS62 SLVFFAEKDEDATKFTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIA
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400 410 420 430 440 450
pF1KSD LPVPVIVSNFSRIYHQNQRADKRRAQKKARLARIRAAKSGSANAYMQSKRNGLLSNQLQS
::.:.::.:::..:....: .: : :. : : :: ..:: . :. : : .: .
CCDS62 LPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEK--AIKR-REALERAKRNGSI-VSMNLKDAFARSMELID
420 430 440 450 460
460 470 480 490 500
pF1KSD SEDEQAFVSKSGSSFET-QHHHLLHCLEKTTNH---EFVDEQVFEESCMEVAT------V
:.: ..:... .. . .:: : . . : ... ::.. .::. .
CCDS62 VAVEKA--GESANTKDSADDNHLSPSRWKWARKALSETSSNKSFENKYQEVSQKDSHEQL
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KSD NRPSSHSPS-LSSQQ-GVTSTCCSRRHKKTFRIPNANVSGSHQGSIQE-LSTIQIRCV-E
: :: ::. ::.:. . . .. . .. :. . . . .. .: . .. : :
CCDS62 NNTSSSSPQHLSAQKLEMLYNEITKTQPHSHPNPDCQEKPERPSAYEEEIEMEEVVCPQE
530 540 550 560 570 580
570 580 590 600 610 620
pF1KSD RTPLSNSRSSLNAKMEECVK--LNCEQPYVTTAIISIPTPPVTTPEGDDRPESPEYSGGN
. ..... .. : . .: .. : .: : ..
CCDS62 QLAVAQTEVIVDMKSTSSIDSFTSCATDFTETERSPLPPPSASHLQMKFPTDLPGTEEHQ
590 600 610 620 630 640
630
pF1KSD IVRVSAL
CCDS62 RARGPPFLTLSREKGPAARDGTLEYAPVDITVNLDASGSQCGLHSPLQSDNATDSPKSSL
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: ..: : : : . :... . . :::.: .. ::.
CCDS13 MPAGMTKHGSRSTSSLP-PEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLD
10 20 30 40 50
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: : : ::. :: : . ..::::: : : ::::::::.::. ..
CCDS13 RLPRTRLGKL-RDCNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEE
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pF1KSD ECISAYDEELAFFGLIPEIIGDCCYEEYKDRRRENAERLQDDADT--DTAGESALPTMTA
: ....:: ..:. . .:: .:...... :.:. .:.: . :: : :
CCDS13 MCALSFSQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTCCA
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pF1KSD --RQRVWRAFENPHTSTMALVFYYVTGFFIAVSVIANVVETVPCGSSPGHIKELPCGERY
:...: .:.:..:. : .. .. .::..:.:: ..:.: .: .. . . .
CCDS13 EKRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQL
170 180 190 200 210 220
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pF1KSD AVAFFCLDTACVMIFTVEYLLRLAAAPSRYRFVRSVMSIIDVVAILPYYIGLVMTDN---
: ....:. ::.:::::. ..:....: .. .. ::..::::::. . .:..
CCDS13 A----HVEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESNKS
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330
pF1KSD ----EDVSGAFVTLRVFRVFRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAIIIF
..: . .:..:..::.:..::: ::. ::.::. .:::.:.. :.:.:.::
CCDS13 VLQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIF
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
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....:.::: . .:: ::::.::.. .::::.::::. :::. ::: :..: ..:::::
CCDS13 SSLVFFAEKDEDDTKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVI
350 360 370 380 390 400
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:::.:.::.:::..:....: .: : :. : : :: ..:: . :. : : ...
CCDS13 ALPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEK--AIKR-REALERAKRNGSIVS-MNMKDAFARSIEMM
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. :. . :.. ..: .:: : :.. : . . :: . . : ::
CCDS13 DIVVEKNG-ENMGKKDKVQDNHLSPNKWKWTKRTLSETSSSKSFETKEQGSPEKARSSSS
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pF1KSD SPSLSSQQGVTSTCCSRRHKKTFRIPNANVSGSHQGSIQELSTIQIRCVERTPLSNSRSS
:. ::
CCDS13 PQHLNVQQLEDMYNKMAKTQSQPILNTKESAAQSKPKEELEMESIPSPVAPLPTRTEGVI
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.::.: : :. . : : : ....:::::: :. ... : :..:. .
CCDS16 QYPETRLAELINCLAGGYDTIFSLCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIEVYYFGEVHMKK
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pF1KSD HECISAYDEELAFFGLIPEIIGDCCYEEYKDRRRE---NAERLQDDADTDTAGESALPTM
: . .:. :. . ... ::: . ...:.: :.:.: : : . ..:
CCDS16 GICPICFKNEMDFWKVDLKFLDDCCKSHLSEKREELEEIARRVQLILD-DLGVDAAEGRW
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pF1KSD TARQR-VWRAFENPHTSTMALVFYYVTGFFIAVSVIANVVETVP---CGSSPGHIKELPC
:. ::. .:.:..: : : .. ..: :: .. . :.: .. :. : :
CCDS16 RRCQKCVWKFLEKPESSCPARVVAVLSFLLILVSSVVMCMGTIPELQVLDAEGNRVEHPT
170 180 190 200 210 220
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pF1KSD GERYAVAFFCLDTACVMIFTVEYLLRLAAAPSRYRFVRSVMSIIDVVAILPYYIGLVMT-
: ..:::. ::.:::::: ..:.. .:. : :.:.::.::::.:..:..:
CCDS16 LEN-------VETACIGWFTLEYLLRLFSSPNKLHFALSFMNIVDVLAILPFYVSLTLTH
230 240 250 260 270
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pF1KSD ------DNEDVSGAFVTLRVFRVFRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMA
. .:. : .::..:. ::::..:::.::. : :.:: .:::.::. :...
CCDS16 LGARMMELTNVQQAVQALRIMRIARIFKLARHSSGLQTLTYALKRSFKELGLLLMYLAVG
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:..:... . :.. . : ::: .::..:.::::.::::. ::: ::. ..: : :
CCDS16 IFVFSALGYTMEQSHPETLFKSIPQSFWWAIITMTTVGYGDIYPKTTLGKLNAAISFLCG
340 350 360 370 380 390
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pF1KSD VLVIALPVPVIVSNFSRIYHQNQRADKRRAQKKARLARIRAAKSGSANAYMQSKRNGLLS
:..::::. :..:: : :...::. . :... .: .. ....:
CCDS16 VIAIALPIHPIINNFVR-YYNKQRVLETAAKHELELMELNSSSGGEGKTGGSRSDLDNLP
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pF1KSD NQLQSSEDEQAFVSKSGSSFETQHHHLLHCLEKTTNHEFVDEQVFEESCMEVATVNRPSS
CCDS16 PEPAGKEAPSCSSRLKLSHSDTFIPLLTEEKHHRTRLQSCK
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CCDS82 GDHLLEPEVADGGGAPPQGGCGGGGCDRYEPLPPSLPAAGEQDCCGERVVINISGLRFET
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60 70 80 90 100 110
pF1KSD WQDTLERYPDTLLGSSERDF-FYHPETQQYFFDRDPDIFRHILNFYRTG-KLHYPRHECI
:: ..:.::::. .: . .. : ..:::::. : :: .:..: ... : . :
CCDS82 QLKTLCQFPETLLGDPKRRMRYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYYQSGGRIRRPVNVPI
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120 130 140 150 160 170
pF1KSD SAYDEELAFFGLIPEIIGDCCYEEYKDRRRENAERLQDDADTDTAGESALPTMTARQRVW
. ..::. :. : : :: .. ::. :... : :: ...::
CCDS82 DIFSEEIRFYQL-----G----EEAMEKFREDEGFLREE-------ERPLPRRDFQRQVW
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180 190 200 210 220
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:: :..: : . :. . : .:.. .::.: ..: ..
CCDS82 LLFEYPESSGPARGIAIVSVLVILISIVIFCLETLPEFRDEKDYPASTSQDSFEAAGNST
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230 240 250 260 270
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: : .. :: ..: :.. :. : :.:. : ::. : :..:..::.:::.::.:
CCDS82 SGSRAGASSFSDPFFVVETLCIIWFSFELLVRFFACPSKATFSRNIMNLIDIVAIIPYFI
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280 290 300 310 320
pF1KSD --GLVMTD---NEDVSGAFVTLRVFR---VFRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFL
: ... : . . ... :::.: ::::::.::::.::.::: :::. :::.:
CCDS82 TLGTELAERQGNGQQAMSLAILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTLKASMRELGLL
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.: : ...:.:......:: . .: :.::: :::...:::::.::::: : ::.::: :
CCDS82 IFFLFIGVILFSSAVYFAEADDPTSGFSSIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMHPVTIGGKIVG
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pF1KSD SICSLSGVLVIALPVPVIVSNFSRIYHQNQRADKRRAQKKARLARIRAAK--SGSANAYM
:.:...:::.::::::::::::. .::. . ....... .. . . :.::.
CCDS82 SLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHR-----ETEGEEQSQYMHVGSCQHLSSSAEELR
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pF1KSD QSKRNGLLSNQLQSSEDEQAFVSKSGSSFETQHHHLLHCLEKTTNHEFVDEQVFEESCME
... :. ::
CCDS82 KARSNSTLSKSEYMVIEEGGMNHSAFPQTPFKTGNSTATCTTNNNPNSCVNIKKIFTDV
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.::.:.:: :..: .: : ::
CCDS63 LDSGSLTSLDSSVFCSEGEGEPLALGDCFTVNVGGSRFVLSQQALSCFPHTRLGKLAVVV
20 30 40 50 60 70
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pF1KSD -SSERDFFY-------------HPETQQYFFDRDPDIFRHILNFYRTGKLHYPRHECISA
: .: .: ..:::::. . ::..:..::::.:: .. : .
CCDS63 ASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFDRSSQAFRYVLHYYRTGRLHVMEQLCALS
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pF1KSD YDEELAFFGLIPEIIGDCCYEEYKDRRRENAERL---QDDADTDTAGESAL-----PTMT
. .:. ..:. : .:: ..: ::.: .: : .: : .. :: : :
CCDS63 FLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYF-RRKELSETLDFKKDTEDQESQHESEQDFSQGPCPT
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pF1KSD ARQRVWRAFENPHTSTMALVFYYVTGFFIAVSVIANVVETVPCGSSPGHIKELPCGERYA
.::..: .:.: .:: : .: .. .:..::.: .. .. . .. :.
CCDS63 VRQKLWNILEKPGSSTAARIFGVISIIFVVVSIINMALMSAELSWLDLQLLEI-------
200 210 220 230 240
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pF1KSD VAFFCLDTACVMIFTVEYLLRLAAAPSRYRFVRSVMSIIDVVAILPYYIGLVMT------
:. .:. :: :..::. . .: ::.:.: .:::..::::.:: :..
CCDS63 -----LEYVCISWFTGEFVLRFLCVRDRCRFLRKVPNIIDLLAILPFYITLLVESLSGSQ
250 260 270 280 290
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pF1KSD ---DNEDVSGAFVTLRVFRVFRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAIII
. :.:. .::..:..:..:..::: ::: ::.:. .: :.:.::. :...: :
CCDS63 TTQELENVGRIVQVLRLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMTITQCYEEVGLLLLFLSVGISI
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pF1KSD FATVMFYAEKGSSASKFTSIPAAFWYTIVTMTTLGYGDMVPKTIAGKIFGSICSLSGVLV
:.:: ..::.. . :::.: :.:.. ..:::.::::. : : .::: . .: :::.::
CCDS63 FSTVEYFAEQSIPDTTFTSVPCAWWWATTSMTTVGYGDIRPDTTTGKIVAFMCILSGILV
360 370 380 390 400 410
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