Result of SIM4 for pF1KSDA0964

seq1 = pF1KSDA0964.tfa, 2967 bp
seq2 = pF1KSDA0964/gi568815578f_36331718.tfa (gi568815578f:36331718_36627028), 295311 bp

>pF1KSDA0964 2967
>gi568815578f:36331718_36627028 (Chr20)

1-999  (100001-100999)   99% ->
1000-1241  (104392-104633)   100% ->
1242-1356  (108037-108151)   100% ->
1357-1407  (111010-111060)   100% ->
1408-1648  (114980-115220)   100% ->
1649-2010  (164988-165349)   100% ->
2011-2090  (167525-167604)   100% ->
2091-2503  (168482-168894)   100% ->
2504-2595  (192533-192624)   100% ->
2596-2751  (194134-194289)   100% ->
2752-2967  (195096-195311)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAAGGCCTCGGTGACAGCCGCCCCCGCCACCTCTCCGACAGCCTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAAGGCCTCGGTGACAGCCGCCCCCGCCACCTCTCCGACAGCCTAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCACCCCACGAGCCCCTGTTTGCAGGGACCGACCGCAACCCCTACCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCACCCCACGAGCCCCTGTTTGCAGGGACCGACCGCAACCCCTACCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGTCGCCCACGGAGGCCTTCGCCCGCGAGGCCCGCTTCCCCGGGCAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGTCGCCCACGGAGGCCTTCGCCCGCGAGGCCCGCTTCCCCGGGCAGAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACCCTGCCAGGAGATGGCCTCTTTCCCCTCAACAACCAGCTGCCCCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACCCTGCCAGGAGATGGCCTCTTTCCCCTCAACAACCAGCTGCCCCCGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAGCAGCACCTTTCCCCGCATCCACTACAACTCCCACTTCGAGGTGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAGCAGCACCTTTCCCCGCATCCACTACAACTCCCACTTCGAGGTGCCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGAGAGCCCCTTCCCCAGCCATGCCCAAGCCACCAAGATCAACCGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGGAGAGCCCCTTCCCCAGCCATGCCCAAGCCACCAAGATCAACCGGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCCGCCAACCTCCTGGACCAGTTTGAGAAGCAGCTGCCCATCCACCGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCCGCCAACCTCCTGGACCAGTTTGAGAAGCAGCTGCCCATCCACCGTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGGCTTCAGCACCCTCCAATTTCCCCGTGGCGAGGCCAAGGCCCGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGGCTTCAGCACCCTCCAATTTCCCCGTGGCGAGGCCAAGGCCCGTGGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGAGCCCTGGCCGCATCCGCCACCTGGTCCACTCAGTCCAGCGGCTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGAGCCCTGGCCGCATCCGCCACCTGGTCCACTCAGTCCAGCGGCTTTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTCACCAAGGCACCCTCACTGGAGGGCACAGCGGGCAAGGTCGGTGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTCACCAAGGCACCCTCACTGGAGGGCACAGCGGGCAAGGTCGGTGGCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGGCAGCAAGAAGGGTGGCATGGAGGACGGCAAGGGCCGGAGGGCCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGGCAGCAAGAAGGGTGGCATGGAGGACGGCAAGGGCCGGAGGGCCAAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCAAGGAGCGGGCCAAGGCTGGGGAGCCCAAACGGCGCAGCCGCTCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCAAGGAGCGGGCCAAGGCTGGGGAGCCCAAACGGCGCAGCCGCTCCAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATCTCAGGCTGGTGGAGCTCCGATGACAACTTGGACGGCGAGGCCGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATCTCAGGCTGGTGGAGCTCCGATGACAACTTGGACGGCGAGGCCGGCGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTTCCGCAGCAGTGGCCCAGCCTCTGGGCTGATGATACTAGGCCGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 100651 CTTCCGCAGCAGTGGCCCAGCCTCTGGGCTGATGACACTAGGCCGCCAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CAGAACGCAGCCAGCCACGCTACTTCATGCACGCCTACAACACCATCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CAGAACGCAGCCAGCCACGCTACTTCATGCACGCCTACAACACCATCAGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GGGCACATGCTCAAAACCACCAAGAACAACACTACTGAGCTGACTGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GGGCACATGCTCAAAACCACCAAGAACAACACTACTGAGCTGACTGCCCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 ACCACCCCCGCCCGCACCCCCAGCCACCTGCCCCAGCCTTGGGGTGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 ACCACCCCCGCCCGCACCCCCAGCCACCTGCCCCAGCCTTGGGGTGGGCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CTGACACCAACTACGTCAAACGGGGCTCCTGGTCCACTCTGACCCTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CTGACACCAACTACGTCAAACGGGGCTCCTGGTCCACTCTGACCCTCAGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CACGCCCACGAGGTCTGCCAGAAGACCTCAGCCACCTTGGATAAGAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CACGCCCACGAGGTCTGCCAGAAGACCTCAGCCACCTTGGATAAGAGCCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GCTCAAGTCCAAATCCTGCCACCAGGGTCTAGCCTACCATTACCTGCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100951 GCTCAAGTCCAAATCCTGCCACCAGGGTCTAGCCTACCATTACCTGCAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1000         GTGCCCGGCGGCGGCGGCGAGTGGAGCACCACGCTGCTGTCC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TG...CAGGTGCCCGGCGGCGGCGGCGAGTGGAGCACCACGCTGCTGTCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 CCACGCGAGACGGATGCCGCGGCCGAGGGCCCTATCCCGTGCCGGCGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104434 CCACGCGAGACGGATGCCGCGGCCGAGGGCCCTATCCCGTGCCGGCGCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 GCGCAGCGGCAGCTACATCAAGGCCATGGGCGACGAGGACAGCGACGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104484 GCGCAGCGGCAGCTACATCAAGGCCATGGGCGACGAGGACAGCGACGAGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 CCGGCGGCAGCCCCAAGCCCTCACCCAAGACCGCGGCGCGGCGCCAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104534 CCGGCGGCAGCCCCAAGCCCTCACCCAAGACCGCGGCGCGGCGCCAGAGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 TATCTGAGGGCCACGCAGCAGTCGCTGGGAGAGCAGAGCAACCCCCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104584 TATCTGAGGGCCACGCAGCAGTCGCTGGGAGAGCAGAGCAACCCCCGCAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242          GAGTCTGGACCGCCTGGATTCAGTGGACATGCTGCTGCCCT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104634 GTA...CAGGAGTCTGGACCGCCTGGATTCAGTGGACATGCTGCTGCCCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 CCAAGTGTCCGAGCTGGGAAGAGGACTACACCCCCGTCAGCGACAGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108078 CCAAGTGTCCGAGCTGGGAAGAGGACTACACCCCCGTCAGCGACAGCCTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 AACGACTCCAGCTGCATCAGCCAG         ATTTTTGGACAGGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 108128 AACGACTCCAGCTGCATCAGCCAGGTG...CAGATTTTTGGACAGGCCTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 CCTGATCCCCCAGTTGTTTGGCCATGAGCAGCAG         GTACGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 111027 CCTGATCCCCCAGTTGTTTGGCCATGAGCAGCAGGTC...CAGGTACGGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1415 AGGCAGAGCTGAGTGACCAGTATGAGGCGGCCTGCGAGTCAGCCTGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114987 AGGCAGAGCTGAGTGACCAGTATGAGGCGGCCTGCGAGTCAGCCTGCAGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1465 GAAGCGGAGTCCACAGCGGCAGAGACGCTTGACTTGCCACTGCCCAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115037 GAAGCGGAGTCCACAGCGGCAGAGACGCTTGACTTGCCACTGCCCAGCTA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1515 CTTCCGCTCCCGCAGCCACAGCTACCTGCGTGCCATCCAGGCAGGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115087 CTTCCGCTCCCGCAGCCACAGCTACCTGCGTGCCATCCAGGCAGGCTGCT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1565 CGCAGGAGGAGGACAGTGTCTCCCTGCAGTCCCTCTCCCCACCGCCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115137 CGCAGGAGGAGGACAGTGTCTCCCTGCAGTCCCTCTCCCCACCGCCCAGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1615 ACCGGCAGCCTCAGCAATAGTCGCACGCTTCCGA         GTTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 115187 ACCGGCAGCCTCAGCAATAGTCGCACGCTTCCGAGTG...CAGGTTCATC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1656 ATGCCTAGTGGCGTATAAGAAGACCCCGCCACCGGTCCCTCCACGCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164995 ATGCCTAGTGGCGTATAAGAAGACCCCGCCACCGGTCCCTCCACGCACCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1706 CTTCAAAGCCGTTCATCTCAGTCACAGTCCAGAGCAGTACTGAGTCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165045 CTTCAAAGCCGTTCATCTCAGTCACAGTCCAGAGCAGTACTGAGTCTGCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1756 CAGGACACCTACCTGGACAGCCAGGACCACAAGAGCGAGGTGACTAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165095 CAGGACACCTACCTGGACAGCCAGGACCACAAGAGCGAGGTGACTAGCCA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1806 GTCGGGCCTGAGCAACTCGTCGGACAGCCTGGACAGCAGTACCCGACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165145 GTCGGGCCTGAGCAACTCGTCGGACAGCCTGGACAGCAGTACCCGACCGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1856 CCAGCGTGACACGGGGTGGAGTCGCCCCAGCCCCTGAGGCCCCAGAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165195 CCAGCGTGACACGGGGTGGAGTCGCCCCAGCCCCTGAGGCCCCAGAGCCA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1906 CCCCCAAAACATGCAGCTCTGAAAAGTGAACAAGGGACGCTGACCAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165245 CCCCCAAAACATGCAGCTCTGAAAAGTGAACAAGGGACGCTGACCAGCTC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1956 TGAGTCCCACCCCGAGGCCGCCCCCAAAAGGAAACTGTCATCGATAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165295 TGAGTCCCACCCCGAGGCCGCCCCCAAAAGGAAACTGTCATCGATAGGAA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2006 TACAA         GAGAGGACTAGAAGGAACGGTTCCCACCTCTCGGAG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165345 TACAAGTA...AAGGAGAGGACTAGAAGGAACGGTTCCCACCTCTCGGAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2047 GACAACGGACCCAAAGCGATCGATGTGATGGCACCCTCCTCAGA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 167561 GACAACGGACCCAAAGCGATCGATGTGATGGCACCCTCCTCAGAGTA...

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2091    AAGCAGCGTCCCCTCTCACAGTATGTCCTCCCGACGGGACACAGACT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168479 CAGAAGCAGCGTCCCCTCTCACAGTATGTCCTCCCGACGGGACACAGACT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2138 CGGATACCCAGGATGCCAATGACTCAAGCTGTAAGTCATCTGAGAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168529 CGGATACCCAGGATGCCAATGACTCAAGCTGTAAGTCATCTGAGAGGAGC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2188 CTCCCGGACTGTACCCCTCACCCCAACTCCATCAGCATCGATGCCGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168579 CTCCCGGACTGTACCCCTCACCCCAACTCCATCAGCATCGATGCCGGTCC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2238 CCGGCAGGCCCCCAAGATTGCCCAGATCAAGCGCAACCTCTCCTATGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168629 CCGGCAGGCCCCCAAGATTGCCCAGATCAAGCGCAACCTCTCCTATGGAG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2288 ACAACAGCGACCCTGCCCTAGAGGCGTCCTCGCTGCCCCCACCCGACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168679 ACAACAGCGACCCTGCCCTAGAGGCGTCCTCGCTGCCCCCACCCGACCCC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2338 TGGCTCGAGACCTCCTCCAGCTCCCCAGCAGAGCCGGCACAGCCAGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168729 TGGCTCGAGACCTCCTCCAGCTCCCCAGCAGAGCCGGCACAGCCAGGGGC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2388 CTGCCGCCGAGACGGCTACTGGTTCCTAAAGCTACTGCAGGCAGAAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168779 CTGCCGCCGAGACGGCTACTGGTTCCTAAAGCTACTGCAGGCAGAAACAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2438 AGCGGCTGGAAGGCTGGTGCTGCCAGATGGACAAGGAGACCAAAGAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168829 AGCGGCTGGAAGGCTGGTGCTGCCAGATGGACAAGGAGACCAAAGAGAAC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2488 AACCTCTCTGAAGAAG         TCTTAGGAAAAGTCCTCAGTGCTGT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 168879 AACCTCTCTGAAGAAGGTG...CAGTCTTAGGAAAAGTCCTCAGTGCTGT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2529 GGGCAGTGCCCAGCTACTGATGTCCCAGAAATTCCAGCAGTTCCGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192558 GGGCAGTGCCCAGCTACTGATGTCCCAGAAATTCCAGCAGTTCCGGGGCC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2579 TCTGTGAGCAAAACTTG         AACCCTGATGCCAACCCACGCCCC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 192608 TCTGTGAGCAAAACTTGGTG...CAGAACCCTGATGCCAACCCACGCCCC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2620 ACAGCCCAGGACCTGGCAGGGTTCTGGGACCTGCTACAGCTGTCCATCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194158 ACAGCCCAGGACCTGGCAGGGTTCTGGGACCTGCTACAGCTGTCCATCGA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2670 GGATATCAGCATGAAGTTCGATGAACTCTACCACCTCAAGGCCAACAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194208 GGATATCAGCATGAAGTTCGATGAACTCTACCACCTCAAGGCCAACAGCT

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2720 GGCAGCTGGTGGAGACCCCCGAGAAGAGGAAG         GAAGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 194258 GGCAGCTGGTGGAGACCCCCGAGAAGAGGAAGGTG...AAGGAAGAGAAG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2761 AAACCACCCCCTCCGGTCCCAAAGAAGCCAGCCAAATCCAAGCCGGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195105 AAACCACCCCCTCCGGTCCCAAAGAAGCCAGCCAAATCCAAGCCGGCAGT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2811 GAGCCGCGACAAGGCCTCAGACGCCAGCGACAAGCAGCGCCAGGAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195155 GAGCCGCGACAAGGCCTCAGACGCCAGCGACAAGCAGCGCCAGGAGGCCC

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2861 GCAAGAGACTCCTGGCGGCCAAGCGGGCAGCTTCTGTGCGGCAGAACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195205 GCAAGAGACTCCTGGCGGCCAAGCGGGCAGCTTCTGTGCGGCAGAACTCA

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 195305 CAGGCTC

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