Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0934
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0934, 1556 aa
  1>>>pF1KSDA0934 1556 - 1556 aa - 1556 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8259+/-0.00118; mu= 16.1609+/- 0.071
 mean_var=101.1390+/-20.354, 0's: 0 Z-trim(104.5): 40  B-trim: 97 in 2/49
 Lambda= 0.127531
 statistics sampled from 7912 (7938) to 7912 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.609), E-opt: 0.2 (0.244), width:  16
 Scan time:  5.350

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS7054.1 DIP2C gene_id:22982|Hs108|chr10         (1556) 10431 1931.1       0
CCDS54490.1 DIP2A gene_id:23181|Hs108|chr21        (1567) 7767 1440.9       0
CCDS31799.1 DIP2B gene_id:57609|Hs108|chr12        (1576) 7653 1419.9       0
CCDS46655.1 DIP2A gene_id:23181|Hs108|chr21        (1571) 7472 1386.6       0
CCDS46656.1 DIP2A gene_id:23181|Hs108|chr21        ( 889) 3468 649.8 1.1e-185
CCDS46657.1 DIP2A gene_id:23181|Hs108|chr21        ( 841) 3239 607.7  5e-173
CCDS54491.1 DIP2A gene_id:23181|Hs108|chr21        ( 798) 3038 570.7 6.4e-162


>>CCDS7054.1 DIP2C gene_id:22982|Hs108|chr10              (1556 aa)
 initn: 10431 init1: 10431 opt: 10431  Z-score: 10367.1  bits: 1931.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 10431; 100.0% identity (100.0% similar) in 1556 aa overlap (1-1556:1-1556)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MADRSLEGMALPLEVRARLAELELELSEGDITQKGYEKKRSKLIGAYLPQPPRVDQALPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 MADRSLEGMALPLEVRARLAELELELSEGDITQKGYEKKRSKLIGAYLPQPPRVDQALPQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD ERRAPVTPSSASRYHRRRSSGSRDERYRSDVHTEAVQAALAKHKERKMAVPMPSKRRSLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 ERRAPVTPSSASRYHRRRSSGSRDERYRSDVHTEAVQAALAKHKERKMAVPMPSKRRSLV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD VQTSMDAYTPPDTSSGSEDEGSVQGDSQGTPTSSQGSINMEHWISQAIHGSTTSTTSSSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 VQTSMDAYTPPDTSSGSEDEGSVQGDSQGTPTSSQGSINMEHWISQAIHGSTTSTTSSSS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD TQSGGSGAAHRLADVMAQTHIENHSAPPDVTTYTSEHSIQVERPQGSTGSRTAPKYGNAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 TQSGGSGAAHRLADVMAQTHIENHSAPPDVTTYTSEHSIQVERPQGSTGSRTAPKYGNAE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD LMETGDGVPVSSRVSAKIQQLVNTLKRPKRPPLREFFVDDFEELLEVQQPDPNQPKPEGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 LMETGDGVPVSSRVSAKIQQLVNTLKRPKRPPLREFFVDDFEELLEVQQPDPNQPKPEGA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD QMLAMRGEQLGVVTNWPPSLEAALQRWGTISPKAPCLTTMDTNGKPLYILTYGKLWTRSM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 QMLAMRGEQLGVVTNWPPSLEAALQRWGTISPKAPCLTTMDTNGKPLYILTYGKLWTRSM
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD KVAYSILHKLGTKQEPMVRPGDRVALVFPNNDPAAFMAAFYGCLLAEVVPVPIEVPLTRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 KVAYSILHKLGTKQEPMVRPGDRVALVFPNNDPAAFMAAFYGCLLAEVVPVPIEVPLTRK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD DAGSQQIGFLLGSCGVTVALTSDACHKGLPKSPTGEIPQFKGWPKLLWFVTESKHLSKPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 DAGSQQIGFLLGSCGVTVALTSDACHKGLPKSPTGEIPQFKGWPKLLWFVTESKHLSKPP
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD RDWFPHIKDANNDTAYIEYKTCKDGSVLGVTVTRTALLTHCQALTQACGYTEAETIVNVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 RDWFPHIKDANNDTAYIEYKTCKDGSVLGVTVTRTALLTHCQALTQACGYTEAETIVNVL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD DFKKDVGLWHGILTSVMNMMHVISIPYSLMKVNPLSWIQKVCQYKAKVACVKSRDMHWAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 DFKKDVGLWHGILTSVMNMMHVISIPYSLMKVNPLSWIQKVCQYKAKVACVKSRDMHWAL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD VAHRDQRDINLSSLRMLIVADGANPWSISSCDAFLNVFQSKGLRQEVICPCASSPEALTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 VAHRDQRDINLSSLRMLIVADGANPWSISSCDAFLNVFQSKGLRQEVICPCASSPEALTV
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD AIRRPTDDSNQPPGRGVLSMHGLTYGVIRVDSEEKLSVLTVQDVGLVMPGAIMCSVKPDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 AIRRPTDDSNQPPGRGVLSMHGLTYGVIRVDSEEKLSVLTVQDVGLVMPGAIMCSVKPDG
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD VPQLCRTDEIGELCVCAVATGTSYYGLSGMTKNTFEVFPMTSSGAPISEYPFIRTGLLGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 VPQLCRTDEIGELCVCAVATGTSYYGLSGMTKNTFEVFPMTSSGAPISEYPFIRTGLLGF
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD VGPGGLVFVVGKMDGLMVVSGRRHNADDIVATALAVEPMKFVYRGRIAVFSVTVLHDERI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 VGPGGLVFVVGKMDGLMVVSGRRHNADDIVATALAVEPMKFVYRGRIAVFSVTVLHDERI
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD VIVAEQRPDSTEEDSFQWMSRVLQAIDSIHQVGVYCLALVPANTLPKTPLGGIHLSETKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 VIVAEQRPDSTEEDSFQWMSRVLQAIDSIHQVGVYCLALVPANTLPKTPLGGIHLSETKQ
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD LFLEGSLHPCNVLMCPHTCVTNLPKPRQKQPEIGPASVMVGNLVSGKRIAQASGRDLGQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 LFLEGSLHPCNVLMCPHTCVTNLPKPRQKQPEIGPASVMVGNLVSGKRIAQASGRDLGQI
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD EDNDQARKFLFLSEVLQWRAQTTPDHILYTLLNCRGAIANSLTCVQLHKRAEKIAVMLME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 EDNDQARKFLFLSEVLQWRAQTTPDHILYTLLNCRGAIANSLTCVQLHKRAEKIAVMLME
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD RGHLQDGDHVALVYPPGIDLIAAFYGCLYAGCVPITVRPPHPQNIATTLPTVKMIVEVSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 RGHLQDGDHVALVYPPGIDLIAAFYGCLYAGCVPITVRPPHPQNIATTLPTVKMIVEVSR
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD SACLMTTQLICKLLRSREAAAAVDVRTWPLILDTDDLPKKRPAQICKPCNPDTLAYLDFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 SACLMTTQLICKLLRSREAAAAVDVRTWPLILDTDDLPKKRPAQICKPCNPDTLAYLDFS
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KSD VSTTGMLAGVKMSHAATSAFCRSIKLQCELYPSREVAICLDPYCGLGFVLWCLCSVYSGH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 VSTTGMLAGVKMSHAATSAFCRSIKLQCELYPSREVAICLDPYCGLGFVLWCLCSVYSGH
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KSD QSILIPPSELETNPALWLLAVSQYKVRDTFCSYSVMELCTKGLGSQTESLKARGLDLSRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 QSILIPPSELETNPALWLLAVSQYKVRDTFCSYSVMELCTKGLGSQTESLKARGLDLSRV
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KSD RTCVVVAEERPRIALTQSFSKLFKDLGLHPRAVSTSFGCRVNLAICLQGTSGPDPTTVYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 RTCVVVAEERPRIALTQSFSKLFKDLGLHPRAVSTSFGCRVNLAICLQGTSGPDPTTVYV
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KSD DMRALRHDRVRLVERGSPHSLPLMESGKILPGVRIIIANPETKGPLGDSHLGEIWVHSAH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 DMRALRHDRVRLVERGSPHSLPLMESGKILPGVRIIIANPETKGPLGDSHLGEIWVHSAH
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KSD NASGYFTIYGDESLQSDHFNSRLSFGDTQTIWARTGYLGFLRRTELTDANGERHDALYVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 NASGYFTIYGDESLQSDHFNSRLSFGDTQTIWARTGYLGFLRRTELTDANGERHDALYVV
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KSD GALDEAMELRGMRYHPIDIETSVIRAHKSVTECAVFTWTNLLVVVVELDGSEQEALDLVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 GALDEAMELRGMRYHPIDIETSVIRAHKSVTECAVFTWTNLLVVVVELDGSEQEALDLVP
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      
pF1KSD LVTNVVLEEHYLIVGVVVVVDIGVIPINSRGEKQRMHLRDGFLADQLDPIYVAYNM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 LVTNVVLEEHYLIVGVVVVVDIGVIPINSRGEKQRMHLRDGFLADQLDPIYVAYNM
             1510      1520      1530      1540      1550      

>>CCDS54490.1 DIP2A gene_id:23181|Hs108|chr21             (1567 aa)
 initn: 7714 init1: 6999 opt: 7767  Z-score: 7718.1  bits: 1440.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7992; 74.3% identity (90.3% similar) in 1575 aa overlap (1-1556:1-1567)

                 10        20        30        40        50        
pF1KSD MADRS--LEGMALPLEVRARLAELELELSEGDITQKGYEKKRSKLIGAYLPQPPRVDQAL
       ::::.  ::.  :: :::  ::::::::::::::::::::::.::.. :.:    .: .:
CCDS54 MADRGCPLEAAPLPAEVRESLAELELELSEGDITQKGYEKKRAKLLARYIPLIQGIDPSL
               10        20        30        40        50        60

       60           70        80        90       100       110     
pF1KSD PQERRAP---VTPSSASRYHRRRSSGSRDERYRSDVHTEAVQAALAKHKERKMAVPMPSK
         : : :    : ..: . .. : ..:::::.:::::::::::::::.:::::  :::::
CCDS54 QAENRIPGPSQTTAAAPKQQKSRPTASRDERFRSDVHTEAVQAALAKYKERKM--PMPSK
               70        80        90       100       110          

         120       130       140       150       160       170     
pF1KSD RRSLVVQTSMDAYTPPDTSSGSEDEGSVQGDSQGTPTSSQGSINMEHWISQAIHGSTTST
       :::..:..:...::::::::.::::::..  .. : :  :.  ..: :....:.::.::.
CCDS54 RRSVLVHSSVETYTPPDTSSASEDEGSLRRPGRLTSTPLQSHSSVEPWLDRVIQGSSTSS
      120       130       140       150       160       170        

          180                  190         200       210       220 
pF1KSD T-SSSSTQSGGS-----------GAAHR--LADVMAQTHIENHSAPPDVTTYTSEHSIQV
       . ::.:.. ::            :::    :: . :.:::. :::::::::   :::   
CCDS54 SASSTSSHPGGRPTTAPSAAATPGAAATTALAGLEAHTHIDLHSAPPDVTTGLVEHSY-F
      180       190       200       210       220       230        

             230       240       250       260       270       280 
pF1KSD ERPQGSTGSRTAPKYGNAELMETGDGVPVSSRVSAKIQQLVNTLKRPKRPPLREFFVDDF
       :::: ..  :..:.  .. ..::.:::::.::::.:::::.:::::::::::.:::::::
CCDS54 ERPQVAS-VRSVPRGCSGSMLETADGVPVNSRVSSKIQQLLNTLKRPKRPPLKEFFVDDF
       240        250       260       270       280       290      

             290       300       310       320       330       340 
pF1KSD EELLEVQQPDPNQPKPEGAQMLAMRGEQLGVVTNWPPSLEAALQRWGTISPKAPCLTTMD
       :::::    :::::::::..  ..::: : . .  :::: :.:::::: .::.::::..:
CCDS54 EELLE----DPNQPKPEGSETSVLRGEPLTAGVPRPPSLLATLQRWGTTQPKSPCLTALD
        300           310       320       330       340       350  

             350       360       370       380       390       400 
pF1KSD TNGKPLYILTYGKLWTRSMKVAYSILHKLGTKQEPMVRPGDRVALVFPNNDPAAFMAAFY
       :.:: .: :::::::.::.:.::..:.:: .:.::...:::::::::::.::. ::.:::
CCDS54 TTGKAVYTLTYGKLWSRSLKLAYTLLNKLTSKNEPLLKPGDRVALVFPNSDPVMFMVAFY
            360       370       380       390       400       410  

             410       420       430       440       450       460 
pF1KSD GCLLAEVVPVPIEVPLTRKDAGSQQIGFLLGSCGVTVALTSDACHKGLPKSPTGEIPQFK
       ::::::.::::::::::::::::::.::::::::: .:::.:::.:::::. :::.  ::
CCDS54 GCLLAELVPVPIEVPLTRKDAGSQQVGFLLGSCGVFLALTTDACQKGLPKAQTGEVAAFK
            420       430       440       450       460       470  

             470       480       490       500       510       520 
pF1KSD GWPKLLWFVTESKHLSKPPRDWFPHIKDANNDTAYIEYKTCKDGSVLGVTVTRTALLTHC
       ::: : :.: ..:::.:::.:: :  .:... :::::::: :.::..::::....::..:
CCDS54 GWPPLSWLVIDGKHLAKPPKDWHPLAQDTGTGTAYIEYKTSKEGSTVGVTVSHASLLAQC
            480       490       500       510       520       530  

             530       540       550       560       570       580 
pF1KSD QALTQACGYTEAETIVNVLDFKKDVGLWHGILTSVMNMMHVISIPYSLMKVNPLSWIQKV
       .::::::::.::::..::::::.:.:::::.:::::: :::.:.::.:::.:::::::::
CCDS54 RALTQACGYSEAETLTNVLDFKRDAGLWHGVLTSVMNRMHVVSVPYALMKANPLSWIQKV
            540       550       560       570       580       590  

             590       600       610       620       630       640 
pF1KSD CQYKAKVACVKSRDMHWALVAHRDQRDINLSSLRMLIVADGANPWSISSCDAFLNVFQSK
       : :::..: ::::::::.:.:.: :::..::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS54 CFYKARAALVKSRDMHWSLLAQRGQRDVSLSSLRMLIVADGANPWSISSCDAFLNVFQSR
            600       610       620       630       640       650  

             650       660       670       680       690       700 
pF1KSD GLRQEVICPCASSPEALTVAIRRPTDDSNQPPGRGVLSMHGLTYGVIRVDSEEKLSVLTV
       ::: :::::::::::::::::::: : .. :: ..::::.::.:::::::.:::::::::
CCDS54 GLRPEVICPCASSPEALTVAIRRPPDLGGPPPRKAVLSMNGLSYGVIRVDTEEKLSVLTV
            660       670       680       690       700       710  

             710       720       730       740       750       760 
pF1KSD QDVGLVMPGAIMCSVKPDGVPQLCRTDEIGELCVCAVATGTSYYGLSGMTKNTFEVFPMT
       :::: ::::: .: :: .:.: ::.:::.::.:: . ::::.:::: :.:::.::. :.:
CCDS54 QDVGQVMPGANVCVVKLEGTPYLCKTDEVGEICVSSSATGTAYYGLLGITKNVFEAVPVT
            720       730       740       750       760       770  

             770       780       790       800       810       820 
pF1KSD SSGAPISEYPFIRTGLLGFVGPGGLVFVVGKMDGLMVVSGRRHNADDIVATALAVEPMKF
       ..:::: . :: :::::::.:: .:::.:::.:::::.. :::::::.::::::::::::
CCDS54 TGGAPIFDRPFTRTGLLGFIGPDNLVFIVGKLDGLMVTGVRRHNADDVVATALAVEPMKF
            780       790       800       810       820       830  

             830       840       850       860       870       880 
pF1KSD VYRGRIAVFSVTVLHDERIVIVAEQRPDSTEEDSFQWMSRVLQAIDSIHQVGVYCLALVP
       ::::::::::::::::.:::.:::::::..::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VYRGRIAVFSVTVLHDDRIVLVAEQRPDASEEDSFQWMSRVLQAIDSIHQVGVYCLALVP
            840       850       860       870       880       890  

             890       900       910       920       930       940 
pF1KSD ANTLPKTPLGGIHLSETKQLFLEGSLHPCNVLMCPHTCVTNLPKPRQKQPEIGPASVMVG
       ::::::.::::::.::::: ::::.::::::::::::::::::::::::::.::::..::
CCDS54 ANTLPKAPLGGIHISETKQRFLEGTLHPCNVLMCPHTCVTNLPKPRQKQPEVGPASMIVG
            900       910       920       930       940       950  

             950       960       970       980       990      1000 
pF1KSD NLVSGKRIAQASGRDLGQIEDNDQARKFLFLSEVLQWRAQTTPDHILYTLLNCRGAIANS
       :::.::::::::::.:...::.:::::::::..::::::.::::: :. ::: .:.....
CCDS54 NLVAGKRIAQASGRELAHLEDSDQARKFLFLADVLQWRAHTTPDHPLFLLLNAKGTVTST
            960       970       980       990      1000      1010  

            1010      1020      1030      1040      1050      1060 
pF1KSD LTCVQLHKRAEKIAVMLMERGHLQDGDHVALVYPPGIDLIAAFYGCLYAGCVPITVRPPH
        ::::::::::..:. :::.:.:. :::::::::::.::::::::::: ::::.::::::
CCDS54 ATCVQLHKRAERVAAALMEKGRLSVGDHVALVYPPGVDLIAAFYGCLYCGCVPVTVRPPH
           1020      1030      1040      1050      1060      1070  

            1070      1080      1090      1100      1110      1120 
pF1KSD PQNIATTLPTVKMIVEVSRSACLMTTQLICKLLRSREAAAAVDVRTWPLILDTDDLPKKR
       :::..:::::::::::::.:::..::: . .::::.:::::::.:::: ::::::.:::.
CCDS54 PQNLGTTLPTVKMIVEVSKSACVLTTQAVTRLLRSKEAAAAVDIRTWPTILDTDDIPKKK
           1080      1090      1100      1110      1120      1130  

            1130      1140      1150      1160      1170      1180 
pF1KSD PAQICKPCNPDTLAYLDFSVSTTGMLAGVKMSHAATSAFCRSIKLQCELYPSREVAICLD
        :.. .: .::.::::::::::::.:::::::::::::.::::::::::::::..:::::
CCDS54 IASVFRPPSPDVLAYLDFSVSTTGILAGVKMSHAATSALCRSIKLQCELYPSRQIAICLD
           1140      1150      1160      1170      1180      1190  

            1190      1200      1210      1220      1230      1240 
pF1KSD PYCGLGFVLWCLCSVYSGHQSILIPPSELETNPALWLLAVSQYKVRDTFCSYSVMELCTK
       :::::::.:::::::::::::.:.:: :::.: .::: ::::::.: :::::::::.:::
CCDS54 PYCGLGFALWCLCSVYSGHQSVLVPPLELESNVSLWLSAVSQYKARVTFCSYSVMEMCTK
           1200      1210      1220      1230      1240      1250  

            1250      1260      1270      1280      1290      1300 
pF1KSD GLGSQTESLKARGLDLSRVRTCVVVAEERPRIALTQSFSKLFKDLGLHPRAVSTSFGCRV
       :::.::  :. .:..:: ::::.::::::::::::::::::::::::  :::::.:::::
CCDS54 GLGAQTGVLRMKGVNLSCVRTCMVVAEERPRIALTQSFSKLFKDLGLPARAVSTTFGCRV
           1260      1270      1280      1290      1300      1310  

            1310      1320      1330      1340      1350      1360 
pF1KSD NLAICLQGTSGPDPTTVYVDMRALRHDRVRLVERGSPHSLPLMESGKILPGVRIIIANPE
       :.:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::. :
CCDS54 NVAICLQGTAGPDPTTVYVDMRALRHDRVRLVERGSPHSLPLMESGKILPGVKVIIAHTE
           1320      1330      1340      1350      1360      1370  

            1370      1380      1390      1400      1410      1420 
pF1KSD TKGPLGDSHLGEIWVHSAHNASGYFTIYGDESLQSDHFNSRLSFGDTQTIWARTGYLGFL
       ::::::::::::::: : :::.::.:.::.:.:..:::..::::::::::::::::::::
CCDS54 TKGPLGDSHLGEIWVSSPHNATGYYTVYGEEALHADHFSARLSFGDTQTIWARTGYLGFL
           1380      1390      1400      1410      1420      1430  

            1430      1440      1450      1460      1470      1480 
pF1KSD RRTELTDANGERHDALYVVGALDEAMELRGMRYHPIDIETSVIRAHKSVTECAVFTWTNL
       ::::::::.: :::::::::.:::..::::::::::::::::::::.:..::::::::::
CCDS54 RRTELTDASGGRHDALYVVGSLDETLELRGMRYHPIDIETSVIRAHRSIAECAVFTWTNL
           1440      1450      1460      1470      1480      1490  

            1490      1500      1510      1520      1530      1540 
pF1KSD LVVVVELDGSEQEALDLVPLVTNVVLEEHYLIVGVVVVVDIGVIPINSRGEKQRMHLRDG
       ::::::::: ::.::::: ::::::::::::.:::::.:: :::::::::::::::::::
CCDS54 LVVVVELDGLEQDALDLVALVTNVVLEEHYLVVGVVVIVDPGVIPINSRGEKQRMHLRDG
           1500      1510      1520      1530      1540      1550  

            1550      
pF1KSD FLADQLDPIYVAYNM
       :::::::::::::::
CCDS54 FLADQLDPIYVAYNM
           1560       

>>CCDS31799.1 DIP2B gene_id:57609|Hs108|chr12             (1576 aa)
 initn: 7690 init1: 6250 opt: 7653  Z-score: 7604.7  bits: 1419.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7880; 72.8% identity (90.1% similar) in 1576 aa overlap (1-1556:1-1576)

                    10        20        30        40        50     
pF1KSD MADRSLEG-----MALPLEVRARLAELELELSEGDITQKGYEKKRSKLIGAYLPQPPRVD
       ::.:.::       ::: ::::.:::::::::::::::::::::::::.. : ::  ..:
CCDS31 MAERGLEPSPAAVAALPPEVRAQLAELELELSEGDITQKGYEKKRSKLLSPYSPQTQETD
               10        20        30        40        50        60

          60         70             80        90       100         
pF1KSD QALPQERRAPV-TPSSA-----SRYHRRRSSGSRDERYRSDVHTEAVQAALAKHKERKMA
       .:. .: :  . .::.:     :.::: ::.:.::::::::.::::::::::::::.:::
CCDS31 SAVQKELRNQTPAPSAAQTSAPSKYHRTRSGGARDERYRSDIHTEAVQAALAKHKEQKMA
               70        80        90       100       110       120

     110       120       130       140       150       160         
pF1KSD VPMPSKRRSLVVQTSMDAYTPPDTSSGSEDEGSVQGDSQGTPTSSQGSINMEHWISQAIH
       .:::.::::  ::.  :: :::::::.::::::.. ..  . . .:.  : : ::...:.
CCDS31 LPMPTKRRSTFVQSPADACTPPDTSSASEDEGSLRRQAALSAALQQSLQNAESWINRSIQ
              130       140       150       160       170       180

     170       180        190       200       210       220        
pF1KSD GSTTSTTSSSSTQSGG-SGAAHRLADVMAQTHIENHSAPPDVTTYTSEHSIQVE-RPQG-
       ::.::...::. . :  .:..  ::::.:.:.::: :::::::: ::  : .   :: . 
CCDS31 GSSTSSSASSTLSHGEVKGTSGSLADVFANTRIENFSAPPDVTTTTSSSSSSSSIRPANI
              190       200       210       220       230       240

           230         240       250       260       270       280 
pF1KSD ---STGSRTAPKYGN--AELMETGDGVPVSSRVSAKIQQLVNTLKRPKRPPLREFFVDDF
           .:   . . :.  . ::.:.::::::::::.:::::.:::::::::::.:::::: 
CCDS31 DLPPSGIVKGMHKGSNRSSLMDTADGVPVSSRVSTKIQQLLNTLKRPKRPPLKEFFVDDS
              250       260       270       280       290       300

             290       300       310       320       330       340 
pF1KSD EELLEVQQPDPNQPKPEGAQMLAMRGEQLGVVTNWPPSLEAALQRWGTISPKAPCLTTMD
       ::..:: ::::::::::: ::  ..:: :::. ::::.::.::::::: . :  :::..:
CCDS31 EEIVEVPQPDPNQPKPEGRQMTPVKGEPLGVICNWPPALESALQRWGTTQAKCSCLTALD
              310       320       330       340       350       360

             350       360       370       380       390       400 
pF1KSD TNGKPLYILTYGKLWTRSMKVAYSILHKLGTKQEPMVRPGDRVALVFPNNDPAAFMAAFY
        .:::.: :::::::.::.:.::..:.:::::.::...::::::::.:::::. ::.:::
CCDS31 MTGKPVYTLTYGKLWSRSLKLAYTLLNKLGTKNEPVLKPGDRVALVYPNNDPVMFMVAFY
              370       380       390       400       410       420

             410       420       430       440       450       460 
pF1KSD GCLLAEVVPVPIEVPLTRKDAGSQQIGFLLGSCGVTVALTSDACHKGLPKSPTGEIPQFK
       :::::::.::::::::::::::.:::::::::::...::::..: :::::. .::: :::
CCDS31 GCLLAEVIPVPIEVPLTRKDAGGQQIGFLLGSCGIALALTSEVCLKGLPKTQNGEIVQFK
              430       440       450       460       470       480

             470       480       490       500       510       520 
pF1KSD GWPKLLWFVTESKHLSKPPRDWFPHIKDANNDTAYIEYKTCKDGSVLGVTVTRTALLTHC
       :::.: : ::.::.:::::.:: :::. :... ::::::: :.:::.::::.: :.:.::
CCDS31 GWPRLKWVVTDSKYLSKPPKDWQPHISPAGTEPAYIEYKTSKEGSVMGVTVSRLAMLSHC
              490       500       510       520       530       540

             530       540       550       560       570       580 
pF1KSD QALTQACGYTEAETIVNVLDFKKDVGLWHGILTSVMNMMHVISIPYSLMKVNPLSWIQKV
       :::.:::.:.:.::::::::::::.:::::....::: ::.::.:::.::. ::::.:.:
CCDS31 QALSQACNYSEGETIVNVLDFKKDAGLWHGMFANVMNKMHTISVPYSVMKTCPLSWVQRV
              550       560       570       580       590       600

             590       600       610       620       630       640 
pF1KSD CQYKAKVACVKSRDMHWALVAHRDQRDINLSSLRMLIVADGANPWSISSCDAFLNVFQSK
         .::::: :: ::.:::..:::::::..:::::::::.:::::::.:::::::..:::.
CCDS31 HAHKAKVALVKCRDLHWAMMAHRDQRDVSLSSLRMLIVTDGANPWSVSSCDAFLSLFQSH
              610       620       630       640       650       660

             650       660       670       680       690       700 
pF1KSD GLRQEVICPCASSPEALTVAIRRPTDDSNQPPGRGVLSMHGLTYGVIRVDSEEKLSVLTV
       ::. :.:::::.: ::.:::::::   .   :::..:::.::.::::::..:.: :.:::
CCDS31 GLKPEAICPCATSAEAMTVAIRRPGVPGAPLPGRAILSMNGLSYGVIRVNTEDKNSALTV
              670       680       690       700       710       720

             710       720       730       740       750       760 
pF1KSD QDVGLVMPGAIMCSVKPDGVPQLCRTDEIGELCVCAVATGTSYYGLSGMTKNTFEVFPMT
       :::: ::::..:: ::::: ::::.::::::.:: . . :  :.::.:.:::::::.:..
CCDS31 QDVGHVMPGGMMCIVKPDGPPQLCKTDEIGEICVSSRTGGMMYFGLAGVTKNTFEVIPVN
              730       740       750       760       770       780

             770       780       790       800       810       820 
pF1KSD SSGAPISEYPFIRTGLLGFVGPGGLVFVVGKMDGLMVVSGRRHNADDIVATALAVEPMKF
       :.:.:... ::::.:::::::::.:::::::::::..::::::::::::::.:::: .: 
CCDS31 SAGSPVGDVPFIRSGLLGFVGPGSLVFVVGKMDGLLMVSGRRHNADDIVATGLAVESIKT
              790       800       810       820       830       840

             830       840       850       860       870       880 
pF1KSD VYRGRIAVFSVTVLHDERIVIVAEQRPDSTEEDSFQWMSRVLQAIDSIHQVGVYCLALVP
       :::::::::::.:..:::::.:::::::..::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VYRGRIAVFSVSVFYDERIVVVAEQRPDASEEDSFQWMSRVLQAIDSIHQVGVYCLALVP
              850       860       870       880       890       900

             890       900       910       920       930       940 
pF1KSD ANTLPKTPLGGIHLSETKQLFLEGSLHPCNVLMCPHTCVTNLPKPRQKQPEIGPASVMVG
       :::::::::::::.:.::::::::::::::.::::::::::::::::::: .::::::::
CCDS31 ANTLPKTPLGGIHISQTKQLFLEGSLHPCNILMCPHTCVTNLPKPRQKQPGVGPASVMVG
              910       920       930       940       950       960

             950       960       970       980       990      1000 
pF1KSD NLVSGKRIAQASGRDLGQIEDNDQARKFLFLSEVLQWRAQTTPDHILYTLLNCRGAIANS
       :::.:::::::.::::::::.:: .::  ::.:.::::::.::::.:. ::: .:. . .
CCDS31 NLVAGKRIAQAAGRDLGQIEENDLVRKHQFLAEILQWRAQATPDHVLFMLLNAKGTTVCT
              970       980       990      1000      1010      1020

            1010      1020      1030      1040      1050      1060 
pF1KSD LTCVQLHKRAEKIAVMLMERGHLQDGDHVALVYPPGIDLIAAFYGCLYAGCVPITVRPPH
        .:.:::::::.:: .: ..:::. ::.:.:.:::::.:::::::::::::.:.::::::
CCDS31 ASCLQLHKRAERIASVLGDKGHLNAGDNVVLLYPPGIELIAAFYGCLYAGCIPVTVRPPH
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

            1070      1080      1090      1100      1110      1120 
pF1KSD PQNIATTLPTVKMIVEVSRSACLMTTQLICKLLRSREAAAAVDVRTWPLILDTDDLPKKR
        ::...:::::.:::.::..::..:.: . .:::::::::::::.::: :.::::::.::
CCDS31 AQNLTATLPTVRMIVDVSKAACILTSQTLMRLLRSREAAAAVDVKTWPTIIDTDDLPRKR
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

            1130      1140      1150      1160      1170      1180 
pF1KSD PAQICKPCNPDTLAYLDFSVSTTGMLAGVKMSHAATSAFCRSIKLQCELYPSREVAICLD
         :. :: .:. ::::::::::::::.::::::.:..:.::.:::::::: ::..:::::
CCDS31 LPQLYKPPTPEMLAYLDFSVSTTGMLTGVKMSHSAVNALCRAIKLQCELYSSRQIAICLD
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

            1190      1200      1210      1220      1230      1240 
pF1KSD PYCGLGFVLWCLCSVYSGHQSILIPPSELETNPALWLLAVSQYKVRDTFCSYSVMELCTK
       :::::::.:::::::::::::.:::: :::.:  ::: .:.:::.:::::::::::::::
CCDS31 PYCGLGFALWCLCSVYSGHQSVLIPPMELENNLFLWLSTVNQYKIRDTFCSYSVMELCTK
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

            1250      1260      1270      1280      1290      1300 
pF1KSD GLGSQTESLKARGLDLSRVRTCVVVAEERPRIALTQSFSKLFKDLGLHPRAVSTSFGCRV
       :::.:.: ::.::..:: :::::::::::::.:: :::::::::.:: ::::::.:: ::
CCDS31 GLGNQVEVLKTRGINLSCVRTCVVVAEERPRVALQQSFSKLFKDIGLSPRAVSTTFGSRV
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

            1310      1320      1330      1340      1350      1360 
pF1KSD NLAICLQGTSGPDPTTVYVDMRALRHDRVRLVERGSPHSLPLMESGKILPGVRIIIANPE
       :.::::::::::::::::::...::::::::::::.:.:: : :::::::::...:.:::
CCDS31 NVAICLQGTSGPDPTTVYVDLKSLRHDRVRLVERGAPQSLLLSESGKILPGVKVVIVNPE
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

            1370      1380      1390      1400       1410      1420
pF1KSD TKGPLGDSHLGEIWVHSAHNASGYFTIYGDESLQSDHFNSRLSFGDT-QTIWARTGYLGF
       ::::.::::::::::.: :.::::.::: .:.::.::::.::::::. ::.:::::::::
CCDS31 TKGPVGDSHLGEIWVNSPHTASGYYTIYDSETLQADHFNTRLSFGDAAQTLWARTGYLGF
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1430      1440      1450      1460      1470      1480
pF1KSD LRRTELTDANGERHDALYVVGALDEAMELRGMRYHPIDIETSVIRAHKSVTECAVFTWTN
       .:::::: :.:::::::::::::::..::::.::::::::::: : :.:..:::::::::
CCDS31 VRRTELTAATGERHDALYVVGALDETLELRGLRYHPIDIETSVSRIHRSIAECAVFTWTN
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1490      1500      1510      1520      1530      1540
pF1KSD LLVVVVELDGSEQEALDLVPLVTNVVLEEHYLIVGVVVVVDIGVIPINSRGEKQRMHLRD
       :::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::
CCDS31 LLVVVVELCGSEQEALDLVPLVTNVVLEEHYLIVGVVVVVDPGVIPINSRGEKQRMHLRD
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1550      
pF1KSD GFLADQLDPIYVAYNM
       .:::::::::::::::
CCDS31 SFLADQLDPIYVAYNM
             1570      

>>CCDS46655.1 DIP2A gene_id:23181|Hs108|chr21             (1571 aa)
 initn: 7757 init1: 7296 opt: 7472  Z-score: 7424.8  bits: 1386.6 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 8039; 74.5% identity (90.5% similar) in 1575 aa overlap (1-1556:1-1571)

                 10        20        30        40        50        
pF1KSD MADRS--LEGMALPLEVRARLAELELELSEGDITQKGYEKKRSKLIGAYLPQPPRVDQAL
       ::::.  ::.  :: :::  ::::::::::::::::::::::.::.. :.:    .: .:
CCDS46 MADRGCPLEAAPLPAEVRESLAELELELSEGDITQKGYEKKRAKLLARYIPLIQGIDPSL
               10        20        30        40        50        60

       60           70        80        90       100       110     
pF1KSD PQERRAP---VTPSSASRYHRRRSSGSRDERYRSDVHTEAVQAALAKHKERKMAVPMPSK
         : : :    : ..: . .. : ..:::::.:::::::::::::::.:::::  :::::
CCDS46 QAENRIPGPSQTTAAAPKQQKSRPTASRDERFRSDVHTEAVQAALAKYKERKM--PMPSK
               70        80        90       100       110          

         120       130       140       150       160       170     
pF1KSD RRSLVVQTSMDAYTPPDTSSGSEDEGSVQGDSQGTPTSSQGSINMEHWISQAIHGSTTST
       :::..:..:...::::::::.::::::..  .. : :  :.  ..: :....:.::.::.
CCDS46 RRSVLVHSSVETYTPPDTSSASEDEGSLRRPGRLTSTPLQSHSSVEPWLDRVIQGSSTSS
      120       130       140       150       160       170        

          180                  190         200       210       220 
pF1KSD T-SSSSTQSGGS-----------GAAHR--LADVMAQTHIENHSAPPDVTTYTSEHSIQV
       . ::.:.. ::            :::    :: . :.:::. :::::::::   :::   
CCDS46 SASSTSSHPGGRPTTAPSAAATPGAAATTALAGLEAHTHIDLHSAPPDVTTGLVEHSY-F
      180       190       200       210       220       230        

             230       240       250       260       270       280 
pF1KSD ERPQGSTGSRTAPKYGNAELMETGDGVPVSSRVSAKIQQLVNTLKRPKRPPLREFFVDDF
       :::: ..  :..:.  .. ..::.:::::.::::.:::::.:::::::::::.:::::::
CCDS46 ERPQVAS-VRSVPRGCSGSMLETADGVPVNSRVSSKIQQLLNTLKRPKRPPLKEFFVDDF
       240        250       260       270       280       290      

             290       300       310       320       330       340 
pF1KSD EELLEVQQPDPNQPKPEGAQMLAMRGEQLGVVTNWPPSLEAALQRWGTISPKAPCLTTMD
       ::::::::::::::::::..  ..::: : . .  :::: :.:::::: .::.::::..:
CCDS46 EELLEVQQPDPNQPKPEGSETSVLRGEPLTAGVPRPPSLLATLQRWGTTQPKSPCLTALD
        300       310       320       330       340       350      

             350       360       370       380       390       400 
pF1KSD TNGKPLYILTYGKLWTRSMKVAYSILHKLGTKQEPMVRPGDRVALVFPNNDPAAFMAAFY
       :.:: .: :::::::.::.:.::..:.:: .:.::...:::::::::::.::. ::.:::
CCDS46 TTGKAVYTLTYGKLWSRSLKLAYTLLNKLTSKNEPLLKPGDRVALVFPNSDPVMFMVAFY
        360       370       380       390       400       410      

             410       420       430       440       450       460 
pF1KSD GCLLAEVVPVPIEVPLTRKDAGSQQIGFLLGSCGVTVALTSDACHKGLPKSPTGEIPQFK
       ::::::.::::::::::::::::::.::::::::: .:::.:::.:::::. :::.  ::
CCDS46 GCLLAELVPVPIEVPLTRKDAGSQQVGFLLGSCGVFLALTTDACQKGLPKAQTGEVAAFK
        420       430       440       450       460       470      

             470       480       490       500       510       520 
pF1KSD GWPKLLWFVTESKHLSKPPRDWFPHIKDANNDTAYIEYKTCKDGSVLGVTVTRTALLTHC
       ::: : :.: ..:::.:::.:: :  .:... :::::::: :.::..::::....::..:
CCDS46 GWPPLSWLVIDGKHLAKPPKDWHPLAQDTGTGTAYIEYKTSKEGSTVGVTVSHASLLAQC
        480       490       500       510       520       530      

             530       540       550       560       570       580 
pF1KSD QALTQACGYTEAETIVNVLDFKKDVGLWHGILTSVMNMMHVISIPYSLMKVNPLSWIQKV
       .::::::::.::::..::::::.:.:::::.:::::: :::.:.::.:::.:::::::::
CCDS46 RALTQACGYSEAETLTNVLDFKRDAGLWHGVLTSVMNRMHVVSVPYALMKANPLSWIQKV
        540       550       560       570       580       590      

             590       600       610       620       630       640 
pF1KSD CQYKAKVACVKSRDMHWALVAHRDQRDINLSSLRMLIVADGANPWSISSCDAFLNVFQSK
       : :::..: ::::::::.:.:.: :::..::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS46 CFYKARAALVKSRDMHWSLLAQRGQRDVSLSSLRMLIVADGANPWSISSCDAFLNVFQSR
        600       610       620       630       640       650      

             650       660       670       680       690       700 
pF1KSD GLRQEVICPCASSPEALTVAIRRPTDDSNQPPGRGVLSMHGLTYGVIRVDSEEKLSVLTV
       ::: :::::::::::::::::::: : .. :: ..::::.::.:::::::.:::::::::
CCDS46 GLRPEVICPCASSPEALTVAIRRPPDLGGPPPRKAVLSMNGLSYGVIRVDTEEKLSVLTV
        660       670       680       690       700       710      

             710       720       730       740       750       760 
pF1KSD QDVGLVMPGAIMCSVKPDGVPQLCRTDEIGELCVCAVATGTSYYGLSGMTKNTFEVFPMT
       :::: ::::: .: :: .:.: ::.:::.::.:: . ::::.:::: :.:::.::. :.:
CCDS46 QDVGQVMPGANVCVVKLEGTPYLCKTDEVGEICVSSSATGTAYYGLLGITKNVFEAVPVT
        720       730       740       750       760       770      

             770       780       790       800       810       820 
pF1KSD SSGAPISEYPFIRTGLLGFVGPGGLVFVVGKMDGLMVVSGRRHNADDIVATALAVEPMKF
       ..:::: . :: :::::::.:: .:::.:::.:::::.. :::::::.::::::::::::
CCDS46 TGGAPIFDRPFTRTGLLGFIGPDNLVFIVGKLDGLMVTGVRRHNADDVVATALAVEPMKF
        780       790       800       810       820       830      

             830       840       850       860       870       880 
pF1KSD VYRGRIAVFSVTVLHDERIVIVAEQRPDSTEEDSFQWMSRVLQAIDSIHQVGVYCLALVP
       ::::::::::::::::.:::.:::::::..::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VYRGRIAVFSVTVLHDDRIVLVAEQRPDASEEDSFQWMSRVLQAIDSIHQVGVYCLALVP
        840       850       860       870       880       890      

             890       900       910       920       930       940 
pF1KSD ANTLPKTPLGGIHLSETKQLFLEGSLHPCNVLMCPHTCVTNLPKPRQKQPEIGPASVMVG
       ::::::.::::::.::::: ::::.::::::::::::::::::::::::::.::::..::
CCDS46 ANTLPKAPLGGIHISETKQRFLEGTLHPCNVLMCPHTCVTNLPKPRQKQPEVGPASMIVG
        900       910       920       930       940       950      

             950       960       970       980       990      1000 
pF1KSD NLVSGKRIAQASGRDLGQIEDNDQARKFLFLSEVLQWRAQTTPDHILYTLLNCRGAIANS
       :::.::::::::::.:...::.:::::::::..::::::.::::: :. ::: .:.....
CCDS46 NLVAGKRIAQASGRELAHLEDSDQARKFLFLADVLQWRAHTTPDHPLFLLLNAKGTVTST
        960       970       980       990      1000      1010      

            1010      1020      1030      1040      1050      1060 
pF1KSD LTCVQLHKRAEKIAVMLMERGHLQDGDHVALVYPPGIDLIAAFYGCLYAGCVPITVRPPH
        ::::::::::..:. :::.:.:. :::::::::::.::::::::::: ::::.::::::
CCDS46 ATCVQLHKRAERVAAALMEKGRLSVGDHVALVYPPGVDLIAAFYGCLYCGCVPVTVRPPH
       1020      1030      1040      1050      1060      1070      

            1070      1080      1090      1100      1110      1120 
pF1KSD PQNIATTLPTVKMIVEVSRSACLMTTQLICKLLRSREAAAAVDVRTWPLILDTDDLPKKR
       :::..:::::::::::::.:::..::: . .::::.:::::::.:::: ::::::.:::.
CCDS46 PQNLGTTLPTVKMIVEVSKSACVLTTQAVTRLLRSKEAAAAVDIRTWPTILDTDDIPKKK
       1080      1090      1100      1110      1120      1130      

            1130      1140      1150      1160      1170      1180 
pF1KSD PAQICKPCNPDTLAYLDFSVSTTGMLAGVKMSHAATSAFCRSIKLQCELYPSREVAICLD
        :.. .: .::.::::::::::::.:::::::::::::.::::::::::::::..:::::
CCDS46 IASVFRPPSPDVLAYLDFSVSTTGILAGVKMSHAATSALCRSIKLQCELYPSRQIAICLD
       1140      1150      1160      1170      1180      1190      

            1190      1200      1210      1220      1230      1240 
pF1KSD PYCGLGFVLWCLCSVYSGHQSILIPPSELETNPALWLLAVSQYKVRDTFCSYSVMELCTK
       :::::::.:::::::::::::.:.:: :::.: .::: ::::::.: :::::::::.:::
CCDS46 PYCGLGFALWCLCSVYSGHQSVLVPPLELESNVSLWLSAVSQYKARVTFCSYSVMEMCTK
       1200      1210      1220      1230      1240      1250      

            1250      1260      1270      1280      1290      1300 
pF1KSD GLGSQTESLKARGLDLSRVRTCVVVAEERPRIALTQSFSKLFKDLGLHPRAVSTSFGCRV
       :::.::  :. .:..:: ::::.::::::::::::::::::::::::  :::::.:::::
CCDS46 GLGAQTGVLRMKGVNLSCVRTCMVVAEERPRIALTQSFSKLFKDLGLPARAVSTTFGCRV
       1260      1270      1280      1290      1300      1310      

            1310      1320      1330      1340      1350      1360 
pF1KSD NLAICLQGTSGPDPTTVYVDMRALRHDRVRLVERGSPHSLPLMESGKILPGVRIIIANPE
       :.:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::. :
CCDS46 NVAICLQGTAGPDPTTVYVDMRALRHDRVRLVERGSPHSLPLMESGKILPGVKVIIAHTE
       1320      1330      1340      1350      1360      1370      

            1370      1380      1390      1400      1410      1420 
pF1KSD TKGPLGDSHLGEIWVHSAHNASGYFTIYGDESLQSDHFNSRLSFGDTQTIWARTGYLGFL
       ::::::::::::::: : :::.::.:.::.:.:..:::..::::::::::::::::::::
CCDS46 TKGPLGDSHLGEIWVSSPHNATGYYTVYGEEALHADHFSARLSFGDTQTIWARTGYLGFL
       1380      1390      1400      1410      1420      1430      

            1430      1440      1450      1460      1470      1480 
pF1KSD RRTELTDANGERHDALYVVGALDEAMELRGMRYHPIDIETSVIRAHKSVTECAVFTWTNL
       ::::::::.: :::::::::.:::..::::::::::::::::::::.:..::::::::::
CCDS46 RRTELTDASGGRHDALYVVGSLDETLELRGMRYHPIDIETSVIRAHRSIAECAVFTWTNL
       1440      1450      1460      1470      1480      1490      

            1490      1500      1510      1520      1530      1540 
pF1KSD LVVVVELDGSEQEALDLVPLVTNVVLEEHYLIVGVVVVVDIGVIPINSRGEKQRMHLRDG
       ::::::::: ::.::::: ::::::::::::.:::::.:: :::::::::::::::::::
CCDS46 LVVVVELDGLEQDALDLVALVTNVVLEEHYLVVGVVVIVDPGVIPINSRGEKQRMHLRDG
       1500      1510      1520      1530      1540      1550      

            1550      
pF1KSD FLADQLDPIYVAYNM
       :::::::::::::::
CCDS46 FLADQLDPIYVAYNM
       1560      1570 

>>CCDS46656.1 DIP2A gene_id:23181|Hs108|chr21             (889 aa)
 initn: 3753 init1: 3292 opt: 3468  Z-score: 3447.3  bits: 649.8 E(32554): 1.1e-185
Smith-Waterman score: 4035; 68.1% identity (86.6% similar) in 883 aa overlap (1-864:1-879)

                 10        20        30        40        50        
pF1KSD MADRS--LEGMALPLEVRARLAELELELSEGDITQKGYEKKRSKLIGAYLPQPPRVDQAL
       ::::.  ::.  :: :::  ::::::::::::::::::::::.::.. :.:    .: .:
CCDS46 MADRGCPLEAAPLPAEVRESLAELELELSEGDITQKGYEKKRAKLLARYIPLIQGIDPSL
               10        20        30        40        50        60

       60           70        80        90       100       110     
pF1KSD PQERRAP---VTPSSASRYHRRRSSGSRDERYRSDVHTEAVQAALAKHKERKMAVPMPSK
         : : :    : ..: . .. : ..:::::.:::::::::::::::.:::::  :::::
CCDS46 QAENRIPGPSQTTAAAPKQQKSRPTASRDERFRSDVHTEAVQAALAKYKERKM--PMPSK
               70        80        90       100       110          

         120       130       140       150       160       170     
pF1KSD RRSLVVQTSMDAYTPPDTSSGSEDEGSVQGDSQGTPTSSQGSINMEHWISQAIHGSTTST
       :::..:..:...::::::::.::::::..  .. : :  :.  ..: :....:.::.::.
CCDS46 RRSVLVHSSVETYTPPDTSSASEDEGSLRRPGRLTSTPLQSHSSVEPWLDRVIQGSSTSS
      120       130       140       150       160       170        

          180                  190         200       210       220 
pF1KSD T-SSSSTQSGGS-----------GAAHR--LADVMAQTHIENHSAPPDVTTYTSEHSIQV
       . ::.:.. ::            :::    :: . :.:::. :::::::::   :::   
CCDS46 SASSTSSHPGGRPTTAPSAAATPGAAATTALAGLEAHTHIDLHSAPPDVTTGLVEHSY-F
      180       190       200       210       220       230        

             230       240       250       260       270       280 
pF1KSD ERPQGSTGSRTAPKYGNAELMETGDGVPVSSRVSAKIQQLVNTLKRPKRPPLREFFVDDF
       :::: ..  :..:.  .. ..::.:::::.::::.:::::.:::::::::::.:::::::
CCDS46 ERPQVAS-VRSVPRGCSGSMLETADGVPVNSRVSSKIQQLLNTLKRPKRPPLKEFFVDDF
       240        250       260       270       280       290      

             290       300       310       320       330       340 
pF1KSD EELLEVQQPDPNQPKPEGAQMLAMRGEQLGVVTNWPPSLEAALQRWGTISPKAPCLTTMD
       ::::::::::::::::::..  ..::: : . .  :::: :.:::::: .::.::::..:
CCDS46 EELLEVQQPDPNQPKPEGSETSVLRGEPLTAGVPRPPSLLATLQRWGTTQPKSPCLTALD
        300       310       320       330       340       350      

             350       360       370       380       390       400 
pF1KSD TNGKPLYILTYGKLWTRSMKVAYSILHKLGTKQEPMVRPGDRVALVFPNNDPAAFMAAFY
       :.:: .: :::::::.::.:.::..:.:: .:.::...:::::::::::.::. ::.:::
CCDS46 TTGKAVYTLTYGKLWSRSLKLAYTLLNKLTSKNEPLLKPGDRVALVFPNSDPVMFMVAFY
        360       370       380       390       400       410      

             410       420       430       440       450       460 
pF1KSD GCLLAEVVPVPIEVPLTRKDAGSQQIGFLLGSCGVTVALTSDACHKGLPKSPTGEIPQFK
       ::::::.::::::::::::::::::.::::::::: .:::.:::.:::::. :::.  ::
CCDS46 GCLLAELVPVPIEVPLTRKDAGSQQVGFLLGSCGVFLALTTDACQKGLPKAQTGEVAAFK
        420       430       440       450       460       470      

             470       480       490       500       510       520 
pF1KSD GWPKLLWFVTESKHLSKPPRDWFPHIKDANNDTAYIEYKTCKDGSVLGVTVTRTALLTHC
       ::: : :.: ..:::.:::.:: :  .:... :::::::: :.::..::::....::..:
CCDS46 GWPPLSWLVIDGKHLAKPPKDWHPLAQDTGTGTAYIEYKTSKEGSTVGVTVSHASLLAQC
        480       490       500       510       520       530      

             530       540       550       560       570       580 
pF1KSD QALTQACGYTEAETIVNVLDFKKDVGLWHGILTSVMNMMHVISIPYSLMKVNPLSWIQKV
       .::::::::.::::..::::::.:.:::::.:::::: :::.:.::.:::.:::::::::
CCDS46 RALTQACGYSEAETLTNVLDFKRDAGLWHGVLTSVMNRMHVVSVPYALMKANPLSWIQKV
        540       550       560       570       580       590      

             590       600       610       620       630       640 
pF1KSD CQYKAKVACVKSRDMHWALVAHRDQRDINLSSLRMLIVADGANPWSISSCDAFLNVFQSK
       : :::..: ::::::::.:.:.: :::..::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS46 CFYKARAALVKSRDMHWSLLAQRGQRDVSLSSLRMLIVADGANPWSISSCDAFLNVFQSR
        600       610       620       630       640       650      

             650       660       670       680       690       700 
pF1KSD GLRQEVICPCASSPEALTVAIRRPTDDSNQPPGRGVLSMHGLTYGVIRVDSEEKLSVLTV
       ::: :::::::::::::::::::: : .. :: ..::::.::.:::::::.:::::::::
CCDS46 GLRPEVICPCASSPEALTVAIRRPPDLGGPPPRKAVLSMNGLSYGVIRVDTEEKLSVLTV
        660       670       680       690       700       710      

             710       720       730       740       750       760 
pF1KSD QDVGLVMPGAIMCSVKPDGVPQLCRTDEIGELCVCAVATGTSYYGLSGMTKNTFEVFPMT
       :::: ::::: .: :: .:.: ::.:::.::.:: . ::::.:::: :.:::.::. :.:
CCDS46 QDVGQVMPGANVCVVKLEGTPYLCKTDEVGEICVSSSATGTAYYGLLGITKNVFEAVPVT
        720       730       740       750       760       770      

             770       780       790       800       810       820 
pF1KSD SSGAPISEYPFIRTGLLGFVGPGGLVFVVGKMDGLMVVSGRRHNADDIVATALAVEPMKF
       ..:::: . :: :::::::.:: .:::.:::.:::::.. :::::::.::::::::::::
CCDS46 TGGAPIFDRPFTRTGLLGFIGPDNLVFIVGKLDGLMVTGVRRHNADDVVATALAVEPMKF
        780       790       800       810       820       830      

             830       840       850       860       870       880 
pF1KSD VYRGRIAVFSVTVLHDERIVIVAEQRPDSTEEDSFQWMSRVLQAIDSIHQVGVYCLALVP
       ::::::::::::::::.:::.:::::::..:::::::::::::                 
CCDS46 VYRGRIAVFSVTVLHDDRIVLVAEQRPDASEEDSFQWMSRVLQVGAPARPMVR       
        840       850       860       870       880                

             890       900       910       920       930       940 
pF1KSD ANTLPKTPLGGIHLSETKQLFLEGSLHPCNVLMCPHTCVTNLPKPRQKQPEIGPASVMVG

>>CCDS46657.1 DIP2A gene_id:23181|Hs108|chr21             (841 aa)
 initn: 3524 init1: 3063 opt: 3239  Z-score: 3219.9  bits: 607.7 E(32554): 5e-173
Smith-Waterman score: 3806; 67.1% identity (86.0% similar) in 845 aa overlap (1-826:1-841)

                 10        20        30        40        50        
pF1KSD MADRS--LEGMALPLEVRARLAELELELSEGDITQKGYEKKRSKLIGAYLPQPPRVDQAL
       ::::.  ::.  :: :::  ::::::::::::::::::::::.::.. :.:    .: .:
CCDS46 MADRGCPLEAAPLPAEVRESLAELELELSEGDITQKGYEKKRAKLLARYIPLIQGIDPSL
               10        20        30        40        50        60

       60           70        80        90       100       110     
pF1KSD PQERRAP---VTPSSASRYHRRRSSGSRDERYRSDVHTEAVQAALAKHKERKMAVPMPSK
         : : :    : ..: . .. : ..:::::.:::::::::::::::.:::::  :::::
CCDS46 QAENRIPGPSQTTAAAPKQQKSRPTASRDERFRSDVHTEAVQAALAKYKERKM--PMPSK
               70        80        90       100       110          

         120       130       140       150       160       170     
pF1KSD RRSLVVQTSMDAYTPPDTSSGSEDEGSVQGDSQGTPTSSQGSINMEHWISQAIHGSTTST
       :::..:..:...::::::::.::::::..  .. : :  :.  ..: :....:.::.::.
CCDS46 RRSVLVHSSVETYTPPDTSSASEDEGSLRRPGRLTSTPLQSHSSVEPWLDRVIQGSSTSS
      120       130       140       150       160       170        

          180                  190         200       210       220 
pF1KSD T-SSSSTQSGGS-----------GAAHR--LADVMAQTHIENHSAPPDVTTYTSEHSIQV
       . ::.:.. ::            :::    :: . :.:::. :::::::::   :::   
CCDS46 SASSTSSHPGGRPTTAPSAAATPGAAATTALAGLEAHTHIDLHSAPPDVTTGLVEHSY-F
      180       190       200       210       220       230        

             230       240       250       260       270       280 
pF1KSD ERPQGSTGSRTAPKYGNAELMETGDGVPVSSRVSAKIQQLVNTLKRPKRPPLREFFVDDF
       :::: ..  :..:.  .. ..::.:::::.::::.:::::.:::::::::::.:::::::
CCDS46 ERPQVAS-VRSVPRGCSGSMLETADGVPVNSRVSSKIQQLLNTLKRPKRPPLKEFFVDDF
       240        250       260       270       280       290      

             290       300       310       320       330       340 
pF1KSD EELLEVQQPDPNQPKPEGAQMLAMRGEQLGVVTNWPPSLEAALQRWGTISPKAPCLTTMD
       ::::::::::::::::::..  ..::: : . .  :::: :.:::::: .::.::::..:
CCDS46 EELLEVQQPDPNQPKPEGSETSVLRGEPLTAGVPRPPSLLATLQRWGTTQPKSPCLTALD
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             350       360       370       380       390       400 
pF1KSD TNGKPLYILTYGKLWTRSMKVAYSILHKLGTKQEPMVRPGDRVALVFPNNDPAAFMAAFY
       :.:: .: :::::::.::.:.::..:.:: .:.::...:::::::::::.::. ::.:::
CCDS46 TTGKAVYTLTYGKLWSRSLKLAYTLLNKLTSKNEPLLKPGDRVALVFPNSDPVMFMVAFY
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       ::::::.::::::::::::::::::.::::::::: .:::.:::.:::::. :::.  ::
CCDS46 GCLLAELVPVPIEVPLTRKDAGSQQVGFLLGSCGVFLALTTDACQKGLPKAQTGEVAAFK
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       ::: : :.: ..:::.:::.:: :  .:... :::::::: :.::..::::....::..:
CCDS46 GWPPLSWLVIDGKHLAKPPKDWHPLAQDTGTGTAYIEYKTSKEGSTVGVTVSHASLLAQC
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pF1KSD QALTQACGYTEAETIVNVLDFKKDVGLWHGILTSVMNMMHVISIPYSLMKVNPLSWIQKV
       .::::::::.::::..::::::.:.:::::.:::::: :::.:.::.:::.:::::::::
CCDS46 RALTQACGYSEAETLTNVLDFKRDAGLWHGVLTSVMNRMHVVSVPYALMKANPLSWIQKV
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       : :::..: ::::::::.:.:.: :::..::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS46 CFYKARAALVKSRDMHWSLLAQRGQRDVSLSSLRMLIVADGANPWSISSCDAFLNVFQSR
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       ::: :::::::::::::::::::: : .. :: ..::::.::.:::::::.:::::::::
CCDS46 GLRPEVICPCASSPEALTVAIRRPPDLGGPPPRKAVLSMNGLSYGVIRVDTEEKLSVLTV
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       :::: ::::: .: :: .:.: ::.:::.::.:: . ::::.:::: :.:::.::. :.:
CCDS46 QDVGQVMPGANVCVVKLEGTPYLCKTDEVGEICVSSSATGTAYYGLLGITKNVFEAVPVT
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       ..:::: . :: :::::::.:: .:::.:::.:::::.. :::::::.::::::::::::
CCDS46 TGGAPIFDRPFTRTGLLGFIGPDNLVFIVGKLDGLMVTGVRRHNADDVVATALAVEPMKF
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       :::::                                                       
CCDS46 VYRGR                                                       
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       ::::.  ::.  :: :::  ::::::::::::::::::::::.::.. :.:    .: .:
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       :::..:..:...::::::::.::::::..  .. : :  :.  ..: :....:.::.::.
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       . ::.:.. ::             :   . .: : ... :.  .....            
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                :  ::::.::::.:::::.:::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS54 ---------THIGVPVNSRVSSKIQQLLNTLKRPKRPPLKEFFVDDFEELLEVQQPDPNQ
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       :::::..  ..::: : . .  :::: :.:::::: .::.::::..::.:: .: :::::
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       ::.::.:.::..:.:: .:.::...:::::::::::.::. ::.:::::::::.::::::
CCDS54 LWSRSLKLAYTLLNKLTSKNEPLLKPGDRVALVFPNSDPVMFMVAFYGCLLAELVPVPIE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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