Result of FASTA (omim) for pF1KSDA0915
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0915, 841 aa
  1>>>pF1KSDA0915 841 - 841 aa - 841 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.3832+/-0.000439; mu= -21.3264+/- 0.027
 mean_var=585.9028+/-123.328, 0's: 0 Z-trim(124.3): 73  B-trim: 0 in 0/58
 Lambda= 0.052986
 statistics sampled from 45525 (45614) to 45525 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.808), E-opt: 0.2 (0.535), width:  16
 Scan time: 17.090

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_079290 (OMIM: 608504) rho guanine nucleotide ex ( 841) 5756 455.4 4.9e-127
NP_776089 (OMIM: 608504) rho guanine nucleotide ex ( 841) 5756 455.4 4.9e-127
XP_011522038 (OMIM: 608504) PREDICTED: rho guanine ( 792) 3906 314.0 1.8e-84
XP_011522037 (OMIM: 608504) PREDICTED: rho guanine ( 856) 3906 314.0 1.9e-84
XP_011522036 (OMIM: 608504) PREDICTED: rho guanine ( 856) 3906 314.0 1.9e-84
XP_011522039 (OMIM: 608504) PREDICTED: rho guanine ( 439) 1857 157.1 1.6e-37
NP_001107562 (OMIM: 605991) ephexin-1 isoform 2 [H ( 618)  979 90.1 3.3e-17
XP_011509225 (OMIM: 605991) PREDICTED: ephexin-1 i ( 710)  979 90.2 3.7e-17
NP_062824 (OMIM: 605991) ephexin-1 isoform 1 [Homo ( 710)  979 90.2 3.7e-17
NP_005426 (OMIM: 600888) rho guanine nucleotide ex (1597)  951 88.3   3e-16
XP_011539008 (OMIM: 612496) PREDICTED: rho guanine ( 802)  896 83.9 3.3e-15
NP_694945 (OMIM: 612496) rho guanine nucleotide ex ( 802)  896 83.9 3.3e-15
XP_011509226 (OMIM: 605991) PREDICTED: ephexin-1 i ( 433)  852 80.3 2.1e-14
XP_011509227 (OMIM: 605991) PREDICTED: ephexin-1 i ( 433)  852 80.3 2.1e-14


>>NP_079290 (OMIM: 608504) rho guanine nucleotide exchan  (841 aa)
 initn: 5756 init1: 5756 opt: 5756  Z-score: 2401.7  bits: 455.4 E(85289): 4.9e-127
Smith-Waterman score: 5756; 99.9% identity (99.9% similar) in 841 aa overlap (1-841:1-841)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSAQSLPAATPPTQKPPRIIRPRPPSRSRAAQSPGPPHNGSSPQELPRNSNDAPTPMCTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 MSAQSLPAATPPTQKPPRIIRPRPPSRSRAAQSPGPPHNGSSPQELPRNSNDAPTPMCTP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD IFWEPPAASLKPPALLPPSASRASLDSQTSPDSPSSTPTPSPVSRRSASPEPAPRSPVPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 IFWEPPAASLKPPALLPPSASRASLDSQTSPDSPSSTPTPSPVSRRSASPEPAPRSPVPP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD PKPSGSPCTPLLPMAGVLAQNGSASAPGTVRRLAGRFEGGAEGRAQDADAPEPGLQARAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 PKPSGSPCTPLLPMAGVLAQNGSASAPGTVRRLAGRFEGGAEGRAQDADAPEPGLQARAD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD VNGEREAPLTGSGSQENGAPDAGLACPPCCPCVCHTTRPGLELRWVPVGGYEEVPRVPRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 VNGEREAPLTGSGSQENGAPDAGLACPPCCPCVCHTTRPGLELRWVPVGGYEEVPRVPRR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD ASPLRTSRSRPHPPSIGHPAVVLTSYRSTAERKLLPLLKPPKPTRVRQDATIFGDPPQPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 ASPLRTSRSRPHPPSIGHPAVVLTSYRSTAERKLLPLLKPPKPTRVRQDATIFGDPPQPD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD LDLLSEDGIQTGDSPDEAPQNTPPATVEGREEEGLEVLKEQNWELPLQDEPLYQTYRAAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 LDLLSEDGIQTGDSPDEAPQNTPPATVEGREEEGLEVLKEQNWELPLQDEPLYQTYRAAV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD LSEELWGVGEDGSPSPANAGDAPTFPRPPGPRNTLWQELPAVQASGLLDTLSPQERRMQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 LSEELWGVGEDGSPSPANAGDAPTFPRPPGPRNTLWQELPAVQASGLLDTLSPQERRMQE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD SLFEVVTSEASYLRSLRLLTDTFVLSQALRDTLTPRDHHTLFSNVQRVQGVSERFLATLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 SLFEVVTSEASYLRSLRLLTDTFVLSQALRDTLTPRDHHTLFSNVQRVQGVSERFLATLL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD SRVRSSPHISDLCDVVHAHAVGPFSVYVDYVRNQQYQEETYSRLMDTNVRFSAELRRLQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 SRVRSSPHISDLCDVVHAHAVGPFSVYVDYVRNQQYQEETYSRLMDTNVRFSAELRRLQS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD LPKCERLPLPSFLLLPFQRITRLRMLLQNILRQTEEGSSRQENAQKALGAVSKIIERCSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 LPKCERLPLPSFLLLPFQRITRLRMLLQNILRQTEEGSSRQENAQKALGAVSKIIERCSA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD EVGRMKQTEELIRLTQRLRFHKVKALPLVSWSRRLEFQGELTELGCRRGGVLFASRPRFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 EVGRMKQTEELIRLTQRLRFHKVKALPLVSWSRRLEFQGELTELGCRRGGVLFASRPRFT
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD PLCLLLFSDLLLITQPKSGQRLQVLDYAHRSLVQAQQVPDPSGPPTFRLSLLSNHQGRPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 PLCLLLFSDLLLITQPKSGQRLQVLDYAHRSLVQAQQVPDPSGPPTFRLSLLSNHQGRPT
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD HRLLQASSLSDMQRWLGAFPTPGPLPCSPDTIYEDCDCSQELCSESSAPAKTEGRSLESR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 HRLLQASSLSDMQRWLGAFPTPGPLPCSPDTIYEDCDCSQELCSESSAPAKTEGRSLESR
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD AAPKHLHKTPEGWLKGLPGAFPAQLVCEVTGEHERRRHLRQNQRLLEAVGPSSGTPNAPP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::
NP_079 AAPKHLHKTPEGWLKGLPGAFPAQLVCEVTGEHERRRHLRQNQRLLEAVGSSSGTPNAPP
              790       800       810       820       830       840

        
pF1KSD P
       :
NP_079 P
        

>>NP_776089 (OMIM: 608504) rho guanine nucleotide exchan  (841 aa)
 initn: 5756 init1: 5756 opt: 5756  Z-score: 2401.7  bits: 455.4 E(85289): 4.9e-127
Smith-Waterman score: 5756; 99.9% identity (99.9% similar) in 841 aa overlap (1-841:1-841)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSAQSLPAATPPTQKPPRIIRPRPPSRSRAAQSPGPPHNGSSPQELPRNSNDAPTPMCTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_776 MSAQSLPAATPPTQKPPRIIRPRPPSRSRAAQSPGPPHNGSSPQELPRNSNDAPTPMCTP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD IFWEPPAASLKPPALLPPSASRASLDSQTSPDSPSSTPTPSPVSRRSASPEPAPRSPVPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_776 IFWEPPAASLKPPALLPPSASRASLDSQTSPDSPSSTPTPSPVSRRSASPEPAPRSPVPP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD PKPSGSPCTPLLPMAGVLAQNGSASAPGTVRRLAGRFEGGAEGRAQDADAPEPGLQARAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_776 PKPSGSPCTPLLPMAGVLAQNGSASAPGTVRRLAGRFEGGAEGRAQDADAPEPGLQARAD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD VNGEREAPLTGSGSQENGAPDAGLACPPCCPCVCHTTRPGLELRWVPVGGYEEVPRVPRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_776 VNGEREAPLTGSGSQENGAPDAGLACPPCCPCVCHTTRPGLELRWVPVGGYEEVPRVPRR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD ASPLRTSRSRPHPPSIGHPAVVLTSYRSTAERKLLPLLKPPKPTRVRQDATIFGDPPQPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_776 ASPLRTSRSRPHPPSIGHPAVVLTSYRSTAERKLLPLLKPPKPTRVRQDATIFGDPPQPD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD LDLLSEDGIQTGDSPDEAPQNTPPATVEGREEEGLEVLKEQNWELPLQDEPLYQTYRAAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_776 LDLLSEDGIQTGDSPDEAPQNTPPATVEGREEEGLEVLKEQNWELPLQDEPLYQTYRAAV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD LSEELWGVGEDGSPSPANAGDAPTFPRPPGPRNTLWQELPAVQASGLLDTLSPQERRMQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_776 LSEELWGVGEDGSPSPANAGDAPTFPRPPGPRNTLWQELPAVQASGLLDTLSPQERRMQE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD SLFEVVTSEASYLRSLRLLTDTFVLSQALRDTLTPRDHHTLFSNVQRVQGVSERFLATLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_776 SLFEVVTSEASYLRSLRLLTDTFVLSQALRDTLTPRDHHTLFSNVQRVQGVSERFLATLL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD SRVRSSPHISDLCDVVHAHAVGPFSVYVDYVRNQQYQEETYSRLMDTNVRFSAELRRLQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_776 SRVRSSPHISDLCDVVHAHAVGPFSVYVDYVRNQQYQEETYSRLMDTNVRFSAELRRLQS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD LPKCERLPLPSFLLLPFQRITRLRMLLQNILRQTEEGSSRQENAQKALGAVSKIIERCSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_776 LPKCERLPLPSFLLLPFQRITRLRMLLQNILRQTEEGSSRQENAQKALGAVSKIIERCSA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD EVGRMKQTEELIRLTQRLRFHKVKALPLVSWSRRLEFQGELTELGCRRGGVLFASRPRFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_776 EVGRMKQTEELIRLTQRLRFHKVKALPLVSWSRRLEFQGELTELGCRRGGVLFASRPRFT
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD PLCLLLFSDLLLITQPKSGQRLQVLDYAHRSLVQAQQVPDPSGPPTFRLSLLSNHQGRPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_776 PLCLLLFSDLLLITQPKSGQRLQVLDYAHRSLVQAQQVPDPSGPPTFRLSLLSNHQGRPT
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD HRLLQASSLSDMQRWLGAFPTPGPLPCSPDTIYEDCDCSQELCSESSAPAKTEGRSLESR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_776 HRLLQASSLSDMQRWLGAFPTPGPLPCSPDTIYEDCDCSQELCSESSAPAKTEGRSLESR
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD AAPKHLHKTPEGWLKGLPGAFPAQLVCEVTGEHERRRHLRQNQRLLEAVGPSSGTPNAPP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::
NP_776 AAPKHLHKTPEGWLKGLPGAFPAQLVCEVTGEHERRRHLRQNQRLLEAVGSSSGTPNAPP
              790       800       810       820       830       840

        
pF1KSD P
       :
NP_776 P
        

>>XP_011522038 (OMIM: 608504) PREDICTED: rho guanine nuc  (792 aa)
 initn: 4614 init1: 3906 opt: 3906  Z-score: 1637.7  bits: 314.0 E(85289): 1.8e-84
Smith-Waterman score: 4593; 89.5% identity (91.8% similar) in 781 aa overlap (1-760:1-763)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSAQSLPAATPPTQKPPRIIRPRPPSRSRAAQSPGPPHNGSSPQELPRNSNDAPTPMCTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MSAQSLPAATPPTQKPPRIIRPRPPSRSRAAQSPGPPHNGSSPQELPRNSNDAPTPMCTP
               10        20        30        40        50        60

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pF1KSD IFWEPPAASLKPPALLPPSASRASLDSQTSPDSPSSTPTPSPVSRRSASPEPAPRSPVPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IFWEPPAASLKPPALLPPSASRASLDSQTSPDSPSSTPTPSPVSRRSASPEPAPRSPVPP
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pF1KSD PKPSGSPCTPLLPMAGVLAQNGSASAPGTVRRLAGRFEGGAEGRAQDADAPEPGLQARAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PKPSGSPCTPLLPMAGVLAQNGSASAPGTVRRLAGRFEGGAEGRAQDADAPEPGLQARAD
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VNGEREAPLTGSGSQENGAPDAGLACPPCCPCVCHTTRPGLELRWVPVGGYEEVPRVPRR
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ASPLRTSRSRPHPPSIGHPAVVLTSYRSTAERKLLPLLKPPKPTRVRQDATIFGDPPQPD
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LDLLSEDGIQTGDSPDEAPQNTPPATVEGREEEGLEVLKEQNWELPLQDEPLYQTYRAAV
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LSEELWGVGEDGSPSPANAGDAPTFPRPPGPRNTLWQELPAVQASGLLDTLSPQERRMQE
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pF1KSD SLFEVVTSEASYLRSLRLLTDTFVLSQALRDTLTPRDHHTLFSNVQRVQGVSERFLATLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SLFEVVTSEASYLRSLRLLTDTFVLSQALRDTLTPRDHHTLFSNVQRVQGVSERFLATLL
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pF1KSD SRVRSSPHISDLCDVVHAHAVGPFSVYVDYVRNQQYQEETYSRLMDTNVRFSAELRRLQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SRVRSSPHISDLCDVVHAHAVGPFSVYVDYVRNQQYQEETYSRLMDTNVRFSAELRRLQS
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              550       560                      570       580     
pF1KSD LPKCERLPLPSFLLLPFQRITRLRMLLQ---------------NILRQTEEGSSRQENAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::               :::::::::::::::::
XP_011 LPKCERLPLPSFLLLPFQRITRLRMLLQGHRAGGPVTLPPCPQNILRQTEEGSSRQENAQ
              550       560       570       580       590       600

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pF1KSD KALGAVSKIIERCSAEVGRMKQTEELIRLTQRLRFHKVKALPLVSWSRRLEFQGELTELG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KALGAVSKIIERCSAEVGRMKQTEELIRLTQRLRFHKVKALPLVSWSRRLEFQGELTELG
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pF1KSD CRRGGVLFASRPRFTPLCLLLFSDLLLITQPKSGQRLQV-LDYAHRSLVQAQQVPDPSGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::  .:... ::            : ::. 
XP_011 CRRGGVLFASRPRFTPLCLLLFSDLLLITQPKRPSRFRIHLD------------PLPSAS
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pF1KSD PTFRLSLLSNHQGRPTH--RLLQASSLSDMQRWLGAFP-TPGPLPCSPD--TIYEDCDCS
       : :     ... . ::   .::  .. :    :  . : .: : : .:.  :.    .: 
XP_011 P-FSA---TTRAAPPTDYSKLLPYQTCS--AGWEPSQPQAPFPAPQTPSMRTVTVPRNCV
       710          720       730         740       750       760  

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pF1KSD QELCSESSAPAKTEGRSLESRAAPKHLHKTPEGWLKGLPGAFPAQLVCEVTGEHERRRHL
       :                                                           
XP_011 QSRLHLPRLKDGVWSPGLPPNTCTRPLKVG                              
            770       780       790                                

>>XP_011522037 (OMIM: 608504) PREDICTED: rho guanine nuc  (856 aa)
 initn: 3906 init1: 3906 opt: 3906  Z-score: 1637.3  bits: 314.0 E(85289): 1.9e-84
Smith-Waterman score: 5716; 98.1% identity (98.1% similar) in 856 aa overlap (1-841:1-856)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSAQSLPAATPPTQKPPRIIRPRPPSRSRAAQSPGPPHNGSSPQELPRNSNDAPTPMCTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MSAQSLPAATPPTQKPPRIIRPRPPSRSRAAQSPGPPHNGSSPQELPRNSNDAPTPMCTP
               10        20        30        40        50        60

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pF1KSD IFWEPPAASLKPPALLPPSASRASLDSQTSPDSPSSTPTPSPVSRRSASPEPAPRSPVPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IFWEPPAASLKPPALLPPSASRASLDSQTSPDSPSSTPTPSPVSRRSASPEPAPRSPVPP
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pF1KSD PKPSGSPCTPLLPMAGVLAQNGSASAPGTVRRLAGRFEGGAEGRAQDADAPEPGLQARAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PKPSGSPCTPLLPMAGVLAQNGSASAPGTVRRLAGRFEGGAEGRAQDADAPEPGLQARAD
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pF1KSD VNGEREAPLTGSGSQENGAPDAGLACPPCCPCVCHTTRPGLELRWVPVGGYEEVPRVPRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VNGEREAPLTGSGSQENGAPDAGLACPPCCPCVCHTTRPGLELRWVPVGGYEEVPRVPRR
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pF1KSD ASPLRTSRSRPHPPSIGHPAVVLTSYRSTAERKLLPLLKPPKPTRVRQDATIFGDPPQPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ASPLRTSRSRPHPPSIGHPAVVLTSYRSTAERKLLPLLKPPKPTRVRQDATIFGDPPQPD
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pF1KSD LDLLSEDGIQTGDSPDEAPQNTPPATVEGREEEGLEVLKEQNWELPLQDEPLYQTYRAAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LDLLSEDGIQTGDSPDEAPQNTPPATVEGREEEGLEVLKEQNWELPLQDEPLYQTYRAAV
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pF1KSD LSEELWGVGEDGSPSPANAGDAPTFPRPPGPRNTLWQELPAVQASGLLDTLSPQERRMQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LSEELWGVGEDGSPSPANAGDAPTFPRPPGPRNTLWQELPAVQASGLLDTLSPQERRMQE
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pF1KSD SLFEVVTSEASYLRSLRLLTDTFVLSQALRDTLTPRDHHTLFSNVQRVQGVSERFLATLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SLFEVVTSEASYLRSLRLLTDTFVLSQALRDTLTPRDHHTLFSNVQRVQGVSERFLATLL
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pF1KSD SRVRSSPHISDLCDVVHAHAVGPFSVYVDYVRNQQYQEETYSRLMDTNVRFSAELRRLQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SRVRSSPHISDLCDVVHAHAVGPFSVYVDYVRNQQYQEETYSRLMDTNVRFSAELRRLQS
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pF1KSD LPKCERLPLPSFLLLPFQRITRLRMLLQ---------------NILRQTEEGSSRQENAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::               :::::::::::::::::
XP_011 LPKCERLPLPSFLLLPFQRITRLRMLLQGHRAGGPVTLPPCPQNILRQTEEGSSRQENAQ
              550       560       570       580       590       600

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pF1KSD KALGAVSKIIERCSAEVGRMKQTEELIRLTQRLRFHKVKALPLVSWSRRLEFQGELTELG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KALGAVSKIIERCSAEVGRMKQTEELIRLTQRLRFHKVKALPLVSWSRRLEFQGELTELG
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pF1KSD CRRGGVLFASRPRFTPLCLLLFSDLLLITQPKSGQRLQVLDYAHRSLVQAQQVPDPSGPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CRRGGVLFASRPRFTPLCLLLFSDLLLITQPKSGQRLQVLDYAHRSLVQAQQVPDPSGPP
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pF1KSD TFRLSLLSNHQGRPTHRLLQASSLSDMQRWLGAFPTPGPLPCSPDTIYEDCDCSQELCSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TFRLSLLSNHQGRPTHRLLQASSLSDMQRWLGAFPTPGPLPCSPDTIYEDCDCSQELCSE
              730       740       750       760       770       780

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pF1KSD SSAPAKTEGRSLESRAAPKHLHKTPEGWLKGLPGAFPAQLVCEVTGEHERRRHLRQNQRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SSAPAKTEGRSLESRAAPKHLHKTPEGWLKGLPGAFPAQLVCEVTGEHERRRHLRQNQRL
              790       800       810       820       830       840

         830       840 
pF1KSD LEAVGPSSGTPNAPPP
       ::::: ::::::::::
XP_011 LEAVGSSSGTPNAPPP
              850      

>>XP_011522036 (OMIM: 608504) PREDICTED: rho guanine nuc  (856 aa)
 initn: 3906 init1: 3906 opt: 3906  Z-score: 1637.3  bits: 314.0 E(85289): 1.9e-84
Smith-Waterman score: 5716; 98.1% identity (98.1% similar) in 856 aa overlap (1-841:1-856)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSAQSLPAATPPTQKPPRIIRPRPPSRSRAAQSPGPPHNGSSPQELPRNSNDAPTPMCTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MSAQSLPAATPPTQKPPRIIRPRPPSRSRAAQSPGPPHNGSSPQELPRNSNDAPTPMCTP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD IFWEPPAASLKPPALLPPSASRASLDSQTSPDSPSSTPTPSPVSRRSASPEPAPRSPVPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IFWEPPAASLKPPALLPPSASRASLDSQTSPDSPSSTPTPSPVSRRSASPEPAPRSPVPP
               70        80        90       100       110       120

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pF1KSD PKPSGSPCTPLLPMAGVLAQNGSASAPGTVRRLAGRFEGGAEGRAQDADAPEPGLQARAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PKPSGSPCTPLLPMAGVLAQNGSASAPGTVRRLAGRFEGGAEGRAQDADAPEPGLQARAD
              130       140       150       160       170       180

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pF1KSD VNGEREAPLTGSGSQENGAPDAGLACPPCCPCVCHTTRPGLELRWVPVGGYEEVPRVPRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VNGEREAPLTGSGSQENGAPDAGLACPPCCPCVCHTTRPGLELRWVPVGGYEEVPRVPRR
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pF1KSD ASPLRTSRSRPHPPSIGHPAVVLTSYRSTAERKLLPLLKPPKPTRVRQDATIFGDPPQPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ASPLRTSRSRPHPPSIGHPAVVLTSYRSTAERKLLPLLKPPKPTRVRQDATIFGDPPQPD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD LDLLSEDGIQTGDSPDEAPQNTPPATVEGREEEGLEVLKEQNWELPLQDEPLYQTYRAAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LDLLSEDGIQTGDSPDEAPQNTPPATVEGREEEGLEVLKEQNWELPLQDEPLYQTYRAAV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD LSEELWGVGEDGSPSPANAGDAPTFPRPPGPRNTLWQELPAVQASGLLDTLSPQERRMQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LSEELWGVGEDGSPSPANAGDAPTFPRPPGPRNTLWQELPAVQASGLLDTLSPQERRMQE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD SLFEVVTSEASYLRSLRLLTDTFVLSQALRDTLTPRDHHTLFSNVQRVQGVSERFLATLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SLFEVVTSEASYLRSLRLLTDTFVLSQALRDTLTPRDHHTLFSNVQRVQGVSERFLATLL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD SRVRSSPHISDLCDVVHAHAVGPFSVYVDYVRNQQYQEETYSRLMDTNVRFSAELRRLQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SRVRSSPHISDLCDVVHAHAVGPFSVYVDYVRNQQYQEETYSRLMDTNVRFSAELRRLQS
              490       500       510       520       530       540

              550       560                      570       580     
pF1KSD LPKCERLPLPSFLLLPFQRITRLRMLLQ---------------NILRQTEEGSSRQENAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::               :::::::::::::::::
XP_011 LPKCERLPLPSFLLLPFQRITRLRMLLQGHRAGGPVTLPPCPQNILRQTEEGSSRQENAQ
              550       560       570       580       590       600

         590       600       610       620       630       640     
pF1KSD KALGAVSKIIERCSAEVGRMKQTEELIRLTQRLRFHKVKALPLVSWSRRLEFQGELTELG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KALGAVSKIIERCSAEVGRMKQTEELIRLTQRLRFHKVKALPLVSWSRRLEFQGELTELG
              610       620       630       640       650       660

         650       660       670       680       690       700     
pF1KSD CRRGGVLFASRPRFTPLCLLLFSDLLLITQPKSGQRLQVLDYAHRSLVQAQQVPDPSGPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CRRGGVLFASRPRFTPLCLLLFSDLLLITQPKSGQRLQVLDYAHRSLVQAQQVPDPSGPP
              670       680       690       700       710       720

         710       720       730       740       750       760     
pF1KSD TFRLSLLSNHQGRPTHRLLQASSLSDMQRWLGAFPTPGPLPCSPDTIYEDCDCSQELCSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TFRLSLLSNHQGRPTHRLLQASSLSDMQRWLGAFPTPGPLPCSPDTIYEDCDCSQELCSE
              730       740       750       760       770       780

         770       780       790       800       810       820     
pF1KSD SSAPAKTEGRSLESRAAPKHLHKTPEGWLKGLPGAFPAQLVCEVTGEHERRRHLRQNQRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SSAPAKTEGRSLESRAAPKHLHKTPEGWLKGLPGAFPAQLVCEVTGEHERRRHLRQNQRL
              790       800       810       820       830       840

         830       840 
pF1KSD LEAVGPSSGTPNAPPP
       ::::: ::::::::::
XP_011 LEAVGSSSGTPNAPPP
              850      

>>XP_011522039 (OMIM: 608504) PREDICTED: rho guanine nuc  (439 aa)
 initn: 1857 init1: 1857 opt: 1857  Z-score: 794.7  bits: 157.1 E(85289): 1.6e-37
Smith-Waterman score: 2782; 96.4% identity (96.4% similar) in 439 aa overlap (418-841:1-439)

       390       400       410       420       430       440       
pF1KSD PPGPRNTLWQELPAVQASGLLDTLSPQERRMQESLFEVVTSEASYLRSLRLLTDTFVLSQ
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011                               MQESLFEVVTSEASYLRSLRLLTDTFVLSQ
                                             10        20        30

       450       460       470       480       490       500       
pF1KSD ALRDTLTPRDHHTLFSNVQRVQGVSERFLATLLSRVRSSPHISDLCDVVHAHAVGPFSVY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ALRDTLTPRDHHTLFSNVQRVQGVSERFLATLLSRVRSSPHISDLCDVVHAHAVGPFSVY
               40        50        60        70        80        90

       510       520       530       540       550       560       
pF1KSD VDYVRNQQYQEETYSRLMDTNVRFSAELRRLQSLPKCERLPLPSFLLLPFQRITRLRMLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VDYVRNQQYQEETYSRLMDTNVRFSAELRRLQSLPKCERLPLPSFLLLPFQRITRLRMLL
              100       110       120       130       140       150

                      570       580       590       600       610  
pF1KSD Q---------------NILRQTEEGSSRQENAQKALGAVSKIIERCSAEVGRMKQTEELI
       :               ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QGHRAGGPVTLPPCPQNILRQTEEGSSRQENAQKALGAVSKIIERCSAEVGRMKQTEELI
              160       170       180       190       200       210

            620       630       640       650       660       670  
pF1KSD RLTQRLRFHKVKALPLVSWSRRLEFQGELTELGCRRGGVLFASRPRFTPLCLLLFSDLLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RLTQRLRFHKVKALPLVSWSRRLEFQGELTELGCRRGGVLFASRPRFTPLCLLLFSDLLL
              220       230       240       250       260       270

            680       690       700       710       720       730  
pF1KSD ITQPKSGQRLQVLDYAHRSLVQAQQVPDPSGPPTFRLSLLSNHQGRPTHRLLQASSLSDM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ITQPKSGQRLQVLDYAHRSLVQAQQVPDPSGPPTFRLSLLSNHQGRPTHRLLQASSLSDM
              280       290       300       310       320       330

            740       750       760       770       780       790  
pF1KSD QRWLGAFPTPGPLPCSPDTIYEDCDCSQELCSESSAPAKTEGRSLESRAAPKHLHKTPEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QRWLGAFPTPGPLPCSPDTIYEDCDCSQELCSESSAPAKTEGRSLESRAAPKHLHKTPEG
              340       350       360       370       380       390

            800       810       820       830       840 
pF1KSD WLKGLPGAFPAQLVCEVTGEHERRRHLRQNQRLLEAVGPSSGTPNAPPP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::
XP_011 WLKGLPGAFPAQLVCEVTGEHERRRHLRQNQRLLEAVGSSSGTPNAPPP
              400       410       420       430         

>>NP_001107562 (OMIM: 605991) ephexin-1 isoform 2 [Homo   (618 aa)
 initn: 870 init1: 689 opt: 979  Z-score: 430.0  bits: 90.1 E(85289): 3.3e-17
Smith-Waterman score: 980; 32.9% identity (60.1% similar) in 601 aa overlap (246-831:20-601)

         220       230       240       250        260        270   
pF1KSD TTRPGLELRWVPVGGYEEVPRVPRRASPLRTSRSRPHPPSIGH-PAVVLTSYRST-AERK
                                     ::.:  .  . :: :.   .:  .. :  .
NP_001            MELLAAAFSAACAVDHDSSTSESDARDSAAGHLPGSESSSTPGNGATPE
                          10        20        30        40         

           280       290       300       310       320       330   
pF1KSD LLPLLKPPKPTRVRQDATIFGDPPQPDLDLLSEDGIQTGDSPDEAPQNTPPATVEGREEE
         : :   .:: . .   ..   :  .   : :   : :   .:  ...    .: :...
NP_001 EWPALAD-SPTTLTEALRMIHPIPADSWRNLIE---QIGLLYQEYRDKSTLQEIETRRQQ
      50         60        70        80           90       100     

           340       350       360       370       380             
pF1KSD GLEVLKEQNWELPLQDEPLYQTYRAAVLSEELWGVGEDGSPSPANAGDAPTFPR-----P
         :.  . :     .: :  .        ::     :.    ::.  .  :.:.      
NP_001 DAEIEDNTNGSPASEDTPEEE--------EE-----EEEEEEPASPPERKTLPQICLLSN
         110       120                    130       140       150  

      390       400       410       420       430       440        
pF1KSD PGPRNTLWQELPAVQASGLLDTLSPQERRMQESLFEVVTSEASYLRSLRLLTDTFVLSQA
       :  : .:::.:: ...::.:. :.:.: ..::..::.::::::: .:: ::.. :. .. 
NP_001 PHSRFNLWQDLPEIRSSGVLEILQPEEIKLQEAMFELVTSEASYYKSLNLLVSHFMENER
            160       170       180       190       200       210  

      450       460       470       480       490       500        
pF1KSD LRDTLTPRDHHTLFSNVQRVQGVSERFLATLLSRVRSSPHISDLCDVVHAHAVGPFSVYV
       .:  : : . : :::::  : .::::::  :  :.. .  :::.::.:. .:.  ::::.
NP_001 IRKILHPSEAHILFSNVLDVLAVSERFLLELEHRMEENIVISDVCDIVYRYAADHFSVYI
            220       230       240       250       260       270  

      510       520       530       540       550       560        
pF1KSD DYVRNQQYQEETYSRLMDTNVRFSAELRRLQSLPKCERLPLPSFLLLPFQRITRLRMLLQ
        :: :: :::.::..:.. .. :   . .:.  :::. ::. :::.:::::::::..:.:
NP_001 TYVSNQTYQERTYKQLLQEKAAFRELIAQLELDPKCRGLPFSSFLILPFQRITRLKLLVQ
            280       290       300       310       320       330  

      570       580       590       600       610       620        
pF1KSD NILRQTEEGSSRQENAQKALGAVSKIIERCSAEVGRMKQTEELIRLTQRLRFHKVKALPL
       :::...:: : :. .:  :   .  ... :.  : .:..::..: . ....: :.:..:.
NP_001 NILKRVEERSERECTALDAHKELEMVVKACNEGVRKMSRTEQMISIQKKMEF-KIKSVPI
            340       350       360       370       380        390 

      630       640       650       660       670       680        
pF1KSD VSWSRRLEFQGELTELGCRRGGVLFASRPRFTPLCLLLFSDLLLITQPKSGQRLQVLDYA
       .: :: :  :::: ...  . .  . ..  :  . :.::.:::.: .   :.. ::.: :
NP_001 ISHSRWLLKQGELQQMSGPKTSRTLRTKKLFHEIYLFLFNDLLVICRQIPGDKYQVFDSA
             400       410       420       430       440       450 

      690       700         710       720       730       740      
pF1KSD HRSLVQAQQVPDPSGP--PTFRLSLLSNHQGRPTHRLLQASSLSDMQRWLGAFPTPGPLP
        :.:...... : .     .: : :: : . : .  .:.::: :.:.::. .. .:.   
NP_001 PRGLLRVEELEDQGQTLANVFILRLLENADDREATYMLKASSQSEMKRWMTSL-APNRRT
             460       470       480       490       500        510

        750       760       770       780       790             800
pF1KSD CSPDTIYEDCDCSQELCSESSAPAKTEGRSLESRAAPKHLHKTPEGWLKGLP------GA
          .   .  :: :  : .  .  . .  .::     . : :: .::. :        : 
NP_001 KFVSFTSRLLDCPQVQCVHPYVAQQPDELTLELADILNILDKTDDGWIFGERLHDQERGW
              520       530       540       550       560       570

              810       820       830       840        
pF1KSD FPAQLVCEVTGEHERRRHLRQNQRLLEAVGPSSGTPNAPPP       
       ::.... :. . . : ..:..  :. .   :                 
NP_001 FPSSMTEEILNPKIRSQNLKECFRVHKMDDPQRSQNKDRRKLGSRNRQ
              580       590       600       610        

>>XP_011509225 (OMIM: 605991) PREDICTED: ephexin-1 isofo  (710 aa)
 initn: 870 init1: 689 opt: 979  Z-score: 429.1  bits: 90.2 E(85289): 3.7e-17
Smith-Waterman score: 979; 36.2% identity (65.1% similar) in 475 aa overlap (370-831:221-693)

     340       350       360       370       380            390    
pF1KSD EQNWELPLQDEPLYQTYRAAVLSEELWGVGEDGSPSPANAGDAPTFPR-----PPGPRNT
                                     :.    ::.  .  :.:.      :  : .
XP_011 IETRRQQDAEIEDNTNGSPASEDTPEEEEEEEEEEEPASPPERKTLPQICLLSNPHSRFN
              200       210       220       230       240       250

          400       410       420       430       440       450    
pF1KSD LWQELPAVQASGLLDTLSPQERRMQESLFEVVTSEASYLRSLRLLTDTFVLSQALRDTLT
       :::.:: ...::.:. :.:.: ..::..::.::::::: .:: ::.. :. .. .:  : 
XP_011 LWQDLPEIRSSGVLEILQPEEIKLQEAMFELVTSEASYYKSLNLLVSHFMENERIRKILH
              260       270       280       290       300       310

          460       470       480       490       500       510    
pF1KSD PRDHHTLFSNVQRVQGVSERFLATLLSRVRSSPHISDLCDVVHAHAVGPFSVYVDYVRNQ
       : . : :::::  : .::::::  :  :.. .  :::.::.:. .:.  ::::. :: ::
XP_011 PSEAHILFSNVLDVLAVSERFLLELEHRMEENIVISDVCDIVYRYAADHFSVYITYVSNQ
              320       330       340       350       360       370

          520       530       540       550       560       570    
pF1KSD QYQEETYSRLMDTNVRFSAELRRLQSLPKCERLPLPSFLLLPFQRITRLRMLLQNILRQT
        :::.::..:.. .. :   . .:.  :::. ::. :::.:::::::::..:.::::...
XP_011 TYQERTYKQLLQEKAAFRELIAQLELDPKCRGLPFSSFLILPFQRITRLKLLVQNILKRV
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pF1KSD EEGSSRQENAQKALGAVSKIIERCSAEVGRMKQTEELIRLTQRLRFHKVKALPLVSWSRR
       :: : :. .:  :   .  ... :.  : .:..::..: . ....: :.:..:..: :: 
XP_011 EERSERECTALDAHKELEMVVKACNEGVRKMSRTEQMISIQKKMEF-KIKSVPIISHSRW
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pF1KSD LEFQGELTELGCRRGGVLFASRPRFTPLCLLLFSDLLLITQPKSGQRLQVLDYAHRSLVQ
       :  :::: ...  . .  . ..  :  . :.::.:::.: .   :.. ::.: : :.:..
XP_011 LLKQGELQQMSGPKTSRTLRTKKLFHEIYLFLFNDLLVICRQIPGDKYQVFDSAPRGLLR
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pF1KSD AQQVPDPSGP--PTFRLSLLSNHQGRPTHRLLQASSLSDMQRWLGAFPTPGPLPCSPDTI
       .... : .     .: : :: : . : .  .:.::: :.:.::. .. .:.      .  
XP_011 VEELEDQGQTLANVFILRLLENADDREATYMLKASSQSEMKRWMTSL-APNRRTKFVSFT
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pF1KSD YEDCDCSQELCSESSAPAKTEGRSLESRAAPKHLHKTPEGWLKGLP------GAFPAQLV
        .  :: :  : .  .  . .  .::     . : :: .::. :        : ::....
XP_011 SRLLDCPQVQCVHPYVAQQPDELTLELADILNILDKTDDGWIFGERLHDQERGWFPSSMT
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pF1KSD CEVTGEHERRRHLRQNQRLLEAVGPSSGTPNAPPP       
        :. . . : ..:..  :. .   :                 
XP_011 EEILNPKIRSQNLKECFRVHKMDDPQRSQNKDRRKLGSRNRQ
      670       680       690       700       710

>>NP_062824 (OMIM: 605991) ephexin-1 isoform 1 [Homo sap  (710 aa)
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Smith-Waterman score: 979; 36.2% identity (65.1% similar) in 475 aa overlap (370-831:221-693)

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pF1KSD EQNWELPLQDEPLYQTYRAAVLSEELWGVGEDGSPSPANAGDAPTFPR-----PPGPRNT
                                     :.    ::.  .  :.:.      :  : .
NP_062 IETRRQQDAEIEDNTNGSPASEDTPEEEEEEEEEEEPASPPERKTLPQICLLSNPHSRFN
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pF1KSD LWQELPAVQASGLLDTLSPQERRMQESLFEVVTSEASYLRSLRLLTDTFVLSQALRDTLT
       :::.:: ...::.:. :.:.: ..::..::.::::::: .:: ::.. :. .. .:  : 
NP_062 LWQDLPEIRSSGVLEILQPEEIKLQEAMFELVTSEASYYKSLNLLVSHFMENERIRKILH
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pF1KSD PRDHHTLFSNVQRVQGVSERFLATLLSRVRSSPHISDLCDVVHAHAVGPFSVYVDYVRNQ
       : . : :::::  : .::::::  :  :.. .  :::.::.:. .:.  ::::. :: ::
NP_062 PSEAHILFSNVLDVLAVSERFLLELEHRMEENIVISDVCDIVYRYAADHFSVYITYVSNQ
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        :::.::..:.. .. :   . .:.  :::. ::. :::.:::::::::..:.::::...
NP_062 TYQERTYKQLLQEKAAFRELIAQLELDPKCRGLPFSSFLILPFQRITRLKLLVQNILKRV
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pF1KSD EEGSSRQENAQKALGAVSKIIERCSAEVGRMKQTEELIRLTQRLRFHKVKALPLVSWSRR
       :: : :. .:  :   .  ... :.  : .:..::..: . ....: :.:..:..: :: 
NP_062 EERSERECTALDAHKELEMVVKACNEGVRKMSRTEQMISIQKKMEF-KIKSVPIISHSRW
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pF1KSD LEFQGELTELGCRRGGVLFASRPRFTPLCLLLFSDLLLITQPKSGQRLQVLDYAHRSLVQ
       :  :::: ...  . .  . ..  :  . :.::.:::.: .   :.. ::.: : :.:..
NP_062 LLKQGELQQMSGPKTSRTLRTKKLFHEIYLFLFNDLLVICRQIPGDKYQVFDSAPRGLLR
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pF1KSD AQQVPDPSGP--PTFRLSLLSNHQGRPTHRLLQASSLSDMQRWLGAFPTPGPLPCSPDTI
       .... : .     .: : :: : . : .  .:.::: :.:.::. .. .:.      .  
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pF1KSD YEDCDCSQELCSESSAPAKTEGRSLESRAAPKHLHKTPEGWLKGLP------GAFPAQLV
        .  :: :  : .  .  . .  .::     . : :: .::. :        : ::....
NP_062 SRLLDCPQVQCVHPYVAQQPDELTLELADILNILDKTDDGWIFGERLHDQERGWFPSSMT
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pF1KSD CEVTGEHERRRHLRQNQRLLEAVGPSSGTPNAPPP       
        :. . . : ..:..  :. .   :                 
NP_062 EEILNPKIRSQNLKECFRVHKMDDPQRSQNKDRRKLGSRNRQ
      670       680       690       700       710

>>NP_005426 (OMIM: 600888) rho guanine nucleotide exchan  (1597 aa)
 initn: 827 init1: 665 opt: 951  Z-score: 412.7  bits: 88.3 E(85289): 3e-16
Smith-Waterman score: 1025; 29.4% identity (54.9% similar) in 874 aa overlap (22-828:726-1588)

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pF1KSD          MSAQSLPAATPPTQKPPRIIRPRPPSRSRAAQSPGPPHNGSSPQELPR-NS
                                     : :: . : ..      .: .   .:  ..
NP_005 HNPAFATESPAYGSSPSFVSMEDVRIHEPLPPPPPQRRDTHPSVVETDGHARVVVPTLKQ
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pF1KSD NDAPTPMCTPIFWEPPAASLKPPALLPPSASRASLDSQTSPDSPSSTPTPSPVSRRSASP
       .. : :.      . :  .  : :   :...:      ..::: :     .:  : .   
NP_005 HSHPPPLALGSGLHAPHKGPLPQAS-DPAVARQHRPLPSTPDS-SHHAQATPRWRYNKPL
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pF1KSD EPAPRSPVPPPKPSGSPCT-----PLLPMAGVLAQNGSASAP----GTVRRL-AGRFEGG
        :.:  : :   : ..: .     :: :.  .   .     :    :  :   .:....:
NP_005 PPTPDLPQPHLPPISAPGSSRIYRPLPPLPIIDPPTEPPPLPPKSRGRSRSTRGGHMNSG
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pF1KSD AEGRA----QDADAPEPGLQARAD----VNGEREAPLTGSGSQENGAPDAGLACPPCCPC
       .....    ::  .: :.  .:..    .    :.  . : :. . .:  ...      :
NP_005 GHAKTRPACQDWTVPLPASAGRTSWPPATARSTESFTSTSRSKSEVSPGMAFSNMTNFLC
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pF1KSD VCHTTRPGLELRWVPVG----GYEEVPRVPRRASPLRTSRSRPHPPSIGHPAVVLTSYRS
           : :       :..    :  : :..: :  :::  :. :.  . :     . . :.
NP_005 PSSPTTPWTPELQGPTSKDEAGVSEHPEAPARE-PLR--RTTPQQGASGPGRSPVGQARQ
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pF1KSD TAERKLLPLLKPPKPTRVRQDATIFGDP------PQPDLDL---LSEDGIQT------GD
         . . : : :  .  . :...   ::       :.   .     :..:..       :.
NP_005 PEKPSHLHLEKASSWPHRRDSGRPPGDSSGQAVAPSEGANKHKGWSRQGLRRPSILPEGS
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pF1KSD SPDEAP----QNTPPATVEGREEEGLEVL---KEQNWELPLQDEPLYQTYRAAVLSEELW
       : ...:    .  :  ::  ::..  ::.   ...  .:  ... ::: :  .::..:. 
NP_005 SDSRGPAVEKHPGPSDTVVFREKKPKEVMGGFSRRCSKLINSSQLLYQEYSDVVLNKEIQ
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pF1KSD GVGEDGSPSPANAGDAPTFPRPP-------------GPRNTLWQELPAVQASGLLDTLSP
       .  .  : : . . ..:  ::               .  ..::::.:.:. : .: ... 
NP_005 SQQRLESLSETPGPSSPRQPRKALVSSESYLQRLSMASSGSLWQEIPVVRNSTVLLSMTH
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pF1KSD QERRMQESLFEVVTSEASYLRSLRLLTDTFVLSQALRDTLTPRDHHTLFSNVQRVQGVSE
       .....::  ::...::::::::: . .: : :: .:: ::. ..:. ::: .: :. :: 
NP_005 EDQKLQEVKFELIVSEASYLRSLNIAVDHFQLSTSLRATLSNQEHQWLFSRLQDVRDVSA
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pF1KSD RFLATLLSRVRSSPHISDLCDVVHAHAVGPFSVYVDYVRNQQYQEETYSRLMDTNVRFSA
        ::. :    ...    ..::::  ::     ::. :: :: :::.:.. ::..:  :  
NP_005 TFLSDLEENFENNIFSFQVCDVVLNHAPDFRRVYLPYVTNQTYQERTFQSLMNSNSNFRE
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pF1KSD ELRRLQSLPKCERLPLPSFLLLPFQRITRLRMLLQNILRQTEEGSSRQENAQKALGAVSK
        :..:.: : :.:: : :::.:::::::::..::::::..:. :::.. .: ::  :. .
NP_005 VLEKLESDPVCQRLSLKSFLILPFQRITRLKLLLQNILKRTQPGSSEEAEATKAHHALEQ
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pF1KSD IIERCSAEVGRMKQTEELIRLTQRLRFHKVKALPLVSWSRRLEFQGELTELGCRRGGVLF
       .:. :. .:  :..::::: :.:...: . : .::.: :: :  .:::: :    .  : 
NP_005 LIRDCNNNVQSMRRTEELIYLSQKIEF-ECKIFPLISQSRWLVKSGELTALEFSASPGL-
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pF1KSD ASRPRFTPLCLLLFSDLLLITQPKSGQRLQVLDYAHRSLVQAQQVPDP-SGPPT--FRLS
         .    :. : ::.: ::...:. :.:. :.:.:  : .....      ::    ::: 
NP_005 RRKLNTRPVHLHLFNDCLLLSRPREGSRFLVFDHAPFSSIRGEKCEMKLHGPHKNLFRLF
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pF1KSD LLSNHQGRPTHRLLQASSLSDMQRWLGAFPTPGPLPCSPDTIYEDCDCSQELCSESSAPA
       : .: ::  .. :... . :.  ::..:.     .:     . :  .  :  : ..  : 
NP_005 LRQNTQGAQAEFLFRTETQSEKLRWISALA----MPREELDLLECYNSPQVQCLRAYKPR
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pF1KSD KTEGRSLESRAAPKHLHKTPEGWLKGLP------GAFPAQLVCEVTGEHERRRHLRQNQR
       ...  .::.  .    ... .:::.:.       : ::.: :  ... . : ..:.. .:
NP_005 ENDELALEKADVVMVTQQSSDGWLEGVRLSDGERGWFPVQQVEFISNPEVRAQNLKEAHR
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pF1KSD LLEAVGPSSGTPNAPPP
       .  :             
NP_005 VKTAKLQLVEQQA    
         1590           




841 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 04:11:30 2016 done: Thu Nov  3 04:11:32 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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