Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0876
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0876, 1096 aa
  1>>>pF1KSDA0876 1096 - 1096 aa - 1096 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.2712+/-0.00114; mu= -4.7374+/- 0.068
 mean_var=337.6207+/-67.803, 0's: 0 Z-trim(112.5): 43  B-trim: 57 in 1/52
 Lambda= 0.069801
 statistics sampled from 13248 (13288) to 13248 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.725), E-opt: 0.2 (0.408), width:  16
 Scan time:  5.330

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS12138.1 KDM4B gene_id:23030|Hs108|chr19        (1096) 7580 778.2       0
CCDS55286.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9         ( 813) 2145 230.8 9.9e-60
CCDS55285.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9         ( 835) 2145 230.8   1e-59
CCDS6471.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9          (1056) 2145 230.8 1.2e-59
CCDS491.1 KDM4A gene_id:9682|Hs108|chr1            (1064) 2010 217.3 1.5e-55
CCDS8302.1 KDM4D gene_id:55693|Hs108|chr11         ( 523) 1909 206.9   1e-52
CCDS44713.1 KDM4E gene_id:390245|Hs108|chr11       ( 506) 1810 196.9 9.7e-50
CCDS78379.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9         ( 151)  807 95.5 9.6e-20


>>CCDS12138.1 KDM4B gene_id:23030|Hs108|chr19             (1096 aa)
 initn: 7580 init1: 7580 opt: 7580  Z-score: 4141.9  bits: 778.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7580; 100.0% identity (100.0% similar) in 1096 aa overlap (1-1096:1-1096)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MGSEDHGAQNPSCKIMTFRPTMEEFKDFNKYVAYIESQGAHRAGLAKIIPPKEWKPRQTY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MGSEDHGAQNPSCKIMTFRPTMEEFKDFNKYVAYIESQGAHRAGLAKIIPPKEWKPRQTY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD DDIDDVVIPAPIQQVVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVGEYRRLANSEKYCTPRHQDFDDLER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DDIDDVVIPAPIQQVVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVGEYRRLANSEKYCTPRHQDFDDLER
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD KYWKNLTFVSPIYGADISGSLYDDDVAQWNIGSLRTILDMVERECGTIIEGVNTPYLYFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KYWKNLTFVSPIYGADISGSLYDDDVAQWNIGSLRTILDMVERECGTIIEGVNTPYLYFG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD MWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAIGFFPGSSQGCDAFLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAIGFFPGSSQGCDAFLR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD HKMTLISPIILKKYGIPFSRITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATLRWIDY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HKMTLISPIILKKYGIPFSRITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATLRWIDY
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD GKVATQCTCRKDMVKISMDVFVRILQPERYELWKQGKDLTVLDHTRPTALTSPELSSWSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GKVATQCTCRKDMVKISMDVFVRILQPERYELWKQGKDLTVLDHTRPTALTSPELSSWSA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD SRASLKAKLLRRSHRKRSQPKKPKPEDPKFPGEGTAGAALLEEAGGSVKEEAGPEVDPEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SRASLKAKLLRRSHRKRSQPKKPKPEDPKFPGEGTAGAALLEEAGGSVKEEAGPEVDPEE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD EEEEPQPLPHGREAEGAEEDGRGKLRPTKAKSERKKKSFGLLPPQLPPPPAHFPSEEALW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EEEEPQPLPHGREAEGAEEDGRGKLRPTKAKSERKKKSFGLLPPQLPPPPAHFPSEEALW
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD LPSPLEPPVLGPGPAAMEESPLPAPLNVVPPEVPSEELEAKPRPIIPMLYVVPRPGKAAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LPSPLEPPVLGPGPAAMEESPLPAPLNVVPPEVPSEELEAKPRPIIPMLYVVPRPGKAAF
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD NQEHVSCQQAFEHFAQKGPTWKEPVSPMELTGPEDGAASSGAGRMETKARAGEGQAPSTF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NQEHVSCQQAFEHFAQKGPTWKEPVSPMELTGPEDGAASSGAGRMETKARAGEGQAPSTF
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD SKLKMEIKKSRRHPLGRPPTRSPLSVVKQEASSDEEASPFSGEEDVSDPDALRPLLSLQW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SKLKMEIKKSRRHPLGRPPTRSPLSVVKQEASSDEEASPFSGEEDVSDPDALRPLLSLQW
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD KNRAASFQAERKFNAAAARTEPYCAICTLFYPYCQALQTEKEAPIASLGEGCPATLPSKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KNRAASFQAERKFNAAAARTEPYCAICTLFYPYCQALQTEKEAPIASLGEGCPATLPSKS
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD RQKTRPLIPEMCFTSGGENTEPLPANSYIGDDGTSPLIACGKCCLQVHASCYGIRPELVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RQKTRPLIPEMCFTSGGENTEPLPANSYIGDDGTSPLIACGKCCLQVHASCYGIRPELVN
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD EGWTCSRCAAHAWTAECCLCNLRGGALQMTTDRRWIHVICAIAVPEARFLNVIERHPVDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EGWTCSRCAAHAWTAECCLCNLRGGALQMTTDRRWIHVICAIAVPEARFLNVIERHPVDI
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD SAIPEQRWKLKCVYCRKRMKKVSGACIQCSYEHCSTSFHVTCAHAAGVLMEPDDWPYVVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SAIPEQRWKLKCVYCRKRMKKVSGACIQCSYEHCSTSFHVTCAHAAGVLMEPDDWPYVVS
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD ITCLKHKSGGHAVQLLRAVSLGQVVITKNRNGLYYRCRVIGAASQTCYEVNFDDGSYSDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ITCLKHKSGGHAVQLLRAVSLGQVVITKNRNGLYYRCRVIGAASQTCYEVNFDDGSYSDN
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD LYPESITSRDCVQLGPPSEGELVELRWTDGNLYKAKFISSVTSHIYQVEFEDGSQLTVKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LYPESITSRDCVQLGPPSEGELVELRWTDGNLYKAKFISSVTSHIYQVEFEDGSQLTVKR
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD GDIFTLEEELPKRVRSRLSLSTGAPQEPAFSGEEAKAAKRPRVGTPLATEDSGRSQDYVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GDIFTLEEELPKRVRSRLSLSTGAPQEPAFSGEEAKAAKRPRVGTPLATEDSGRSQDYVA
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      
pF1KSD FVESLLQVQGRPGAPF
       ::::::::::::::::
CCDS12 FVESLLQVQGRPGAPF
             1090      

>>CCDS55286.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9              (813 aa)
 initn: 2964 init1: 2109 opt: 2145  Z-score: 1185.8  bits: 230.8 E(32554): 9.9e-60
Smith-Waterman score: 2951; 54.0% identity (73.6% similar) in 844 aa overlap (10-850:11-808)

                10        20        30        40        50         
pF1KSD  MGSEDHGAQNPSCKIMTFRPTMEEFKDFNKYVAYIESQGAHRAGLAKIIPPKEWKPRQT
                 :::::::::::.::::..::::.::.::.:::::::::.:::::::::: 
CCDS55 MEVAEVESPLNPSCKIMTFRPSMEEFREFNKYLAYMESKGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQC
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KSD YDDIDDVVIPAPIQQVVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVGEYRRLANSEKYCTPRHQDFDDLE
       :::::...:::::::.:::::::::::::::::::: :.:.:::: ::::::. :..:::
CCDS55 YDDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGKYCTPRYLDYEDLE
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KSD RKYWKNLTFVSPIYGADISGSLYDDDVAQWNIGSLRTILDMVERECGTIIEGVNTPYLYF
       ::::::::::.:::::::.::.::. : .:::. : :.::.::.:::  :::::::::::
CCDS55 RKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTVLDVVEEECGISIEGVNTPYLYF
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KSD GMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAIGFFPGSSQGCDAFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::.:::::::::
CCDS55 GMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAQGFFPSSSQGCDAFL
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KSD RHKMTLISPIILKKYGIPFSRITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATLRWID
       ::::::::: .::::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS55 RHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATVRWID
              250       260       270       280       290       300

     300       310       320       330       340       350         
pF1KSD YGKVATQCTCRKDMVKISMDVFVRILQPERYELWKQGKDLTVLDHTRPTALTSPELSSWS
       :::::  :::::::::::::.::: .::.::.:::::::. ..:::.::  ..::...: 
CCDS55 YGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVRKFQPDRYQLWKQGKDIYTIDHTKPTPASTPEVKAWL
              310       320       330       340       350       360

     360       370       380       390       400       410         
pF1KSD ASRASLKAKLLRRSHRKRSQPKKPKPEDPKFPGEGTAGAALLEEAGGSVKEEAGPEVDPE
         : ... :  :  .  ::  :.:: ..                     .::.. :::  
CCDS55 QRRRKVR-KASRSFQCARSTSKRPKADE---------------------EEEVSDEVDGA
               370       380                            390        

     420       430        440       450       460       470        
pF1KSD EEEEEPQPLPHGREAEGAEE-DGRGKLRPTKAKSERKKKSFGLLPPQLPPPPAHFPSEEA
          : :.:     . . .:. ..  ::: :.:.::.....  .   :      .. ..  
CCDS55 ---EVPNPDSVTDDLKVSEKSEAAVKLRNTEASSEEESSASRMQVEQNLSDHIKLSGNSC
         400       410       420       430       440       450     

      480       490       500       510       520       530        
pF1KSD LWLPSPLEPPVLGPGPAAMEESPLPAPLNVVPPEVPSEELEAKPRPIIPMLYVVPRPGKA
       :   . .   .      :.    .:.  . .   .:      ::.   :     :.  . 
CCDS55 L--STSVTEDIKTEDDKAYAYRSVPSISSEADDSIPLSSGYEKPEKSDPSELSWPKSPE-
           460       470       480       490       500       510   

      540       550       560       570       580       590        
pF1KSD AFNQEHVSCQQAFEHFAQKGPTWKEPVSPMELTGPEDGAASSGAGRMETKARAGEGQAPS
              ::... :   ..:   .   : .:  :  .:   .    . .  : .  ..::
CCDS55 -------SCSSVAE---SNGVLTEGEESDVESHG--NGLEPGEIPAVPSGERNSF-KVPS
                      520       530         540       550          

      600       610       620       630        640       650       
pF1KSD TFSKLKMEIKKSRRHPLGRPPTRSPLSVVKQEASSDEEASP-FSGEEDVSDPDAL-RPLL
        ... . . .:: ::::.:::.:::...:::.: ::::    .: ::.: . ..  .::.
CCDS55 -IAEGENKTSKSWRHPLSRPPARSPMTLVKQQAPSDEELPEVLSIEEEVEETESWAKPLI
      560       570       580       590       600       610        

        660       670       680       690       700       710      
pF1KSD SLQWKNRAASFQAERKFNAAAARTEPYCAICTLFYPYCQALQTEKEAPIASLGEGCPATL
        : :.... .: ::...::..:: .:.::::::..:: .  ....:   :        ..
CCDS55 HL-WQTKSPNFAAEQEYNATVARMKPHCAICTLLMPYHKPDSSNEEND-ARWETKLDEVV
      620        630       640       650       660        670      

        720       730       740       750       760       770      
pF1KSD PSKSRQKTRPLIPEMCFTSGGENTEPLPANSYIGDDGTSPLIACGKCCLQVHASCYGIRP
        :..  ::.::::::::  . :: :  : :... .:::: ::.:.:::..::::::::  
CCDS55 TSEG--KTKPLIPEMCFIYSEENIEYSPPNAFLEEDGTSLLISCAKCCVRVHASCYGIPS
        680         690       700       710       720       730    

        780       790       800       810       820       830      
pF1KSD ELVNEGWTCSRCAAHAWTAECCLCNLRGGALQMTTDRRWIHVICAIAVPEARFLNVIERH
       . . .:: :.::  .::::::::::::::::..: . .: ::.::.::::.:: :: :: 
CCDS55 HEICDGWLCARCKRNAWTAECCLCNLRGGALKQTKNNKWAHVMCAVAVPEVRFTNVPERT
          740       750       760       770       780       790    

        840       850       860       870       880       890      
pF1KSD PVDISAIPEQRWKLKCVYCRKRMKKVSGACIQCSYEHCSTSFHVTCAHAAGVLMEPDDWP
        .:.. :: :: ::                                              
CCDS55 QIDVGRIPLQRLKLGRLGI                                         
          800       810                                            

>>CCDS55285.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9              (835 aa)
 initn: 2964 init1: 2109 opt: 2145  Z-score: 1185.7  bits: 230.8 E(32554): 1e-59
Smith-Waterman score: 2951; 54.0% identity (73.6% similar) in 844 aa overlap (10-850:33-830)

                                    10        20        30         
pF1KSD                      MGSEDHGAQNPSCKIMTFRPTMEEFKDFNKYVAYIESQG
                                     :::::::::::.::::..::::.::.::.:
CCDS55 HYGLPWKRTEEAAADTALTIMEVAEVESPLNPSCKIMTFRPSMEEFREFNKYLAYMESKG
             10        20        30        40        50        60  

      40        50        60        70        80        90         
pF1KSD AHRAGLAKIIPPKEWKPRQTYDDIDDVVIPAPIQQVVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVGEYR
       ::::::::.:::::::::: :::::...:::::::.:::::::::::::::::::: :.:
CCDS55 AHRAGLAKVIPPKEWKPRQCYDDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFR
             70        80        90       100       110       120  

     100       110       120       130       140       150         
pF1KSD RLANSEKYCTPRHQDFDDLERKYWKNLTFVSPIYGADISGSLYDDDVAQWNIGSLRTILD
       .:::: ::::::. :..:::::::::::::.:::::::.::.::. : .:::. : :.::
CCDS55 QLANSGKYCTPRYLDYEDLERKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTVLD
            130       140       150       160       170       180  

     160       170       180       190       200       210         
pF1KSD MVERECGTIIEGVNTPYLYFGMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKR
       .::.:::  :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VVEEECGISIEGVNTPYLYFGMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKR
            190       200       210       220       230       240  

     220       230       240       250       260       270         
pF1KSD LERLAIGFFPGSSQGCDAFLRHKMTLISPIILKKYGIPFSRITQEAGEFMITFPYGYHAG
       ::::: ::::.:::::::::::::::::: .::::::::..:::::::::::::::::::
CCDS55 LERLAQGFFPSSSQGCDAFLRHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYHAG
            250       260       270       280       290       300  

     280       290       300       310       320       330         
pF1KSD FNHGFNCAESTNFATLRWIDYGKVATQCTCRKDMVKISMDVFVRILQPERYELWKQGKDL
       :::::::::::::::.:::::::::  :::::::::::::.::: .::.::.:::::::.
CCDS55 FNHGFNCAESTNFATVRWIDYGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVRKFQPDRYQLWKQGKDI
            310       320       330       340       350       360  

     340       350       360       370       380       390         
pF1KSD TVLDHTRPTALTSPELSSWSASRASLKAKLLRRSHRKRSQPKKPKPEDPKFPGEGTAGAA
        ..:::.::  ..::...:   : ... :  :  .  ::  :.:: ..            
CCDS55 YTIDHTKPTPASTPEVKAWLQRRRKVR-KASRSFQCARSTSKRPKADE------------
            370       380        390       400                     

     400       410       420       430        440       450        
pF1KSD LLEEAGGSVKEEAGPEVDPEEEEEEPQPLPHGREAEGAEE-DGRGKLRPTKAKSERKKKS
                .::.. :::     : :.:     . . .:. ..  ::: :.:.::.....
CCDS55 ---------EEEVSDEVDGA---EVPNPDSVTDDLKVSEKSEAAVKLRNTEASSEEESSA
              410       420          430       440       450       

      460       470       480       490       500       510        
pF1KSD FGLLPPQLPPPPAHFPSEEALWLPSPLEPPVLGPGPAAMEESPLPAPLNVVPPEVPSEEL
         .   :      .. ..  :   . .   .      :.    .:.  . .   .:    
CCDS55 SRMQVEQNLSDHIKLSGNSCL--STSVTEDIKTEDDKAYAYRSVPSISSEADDSIPLSSG
       460       470         480       490       500       510     

      520       530       540       550       560       570        
pF1KSD EAKPRPIIPMLYVVPRPGKAAFNQEHVSCQQAFEHFAQKGPTWKEPVSPMELTGPEDGAA
         ::.   :     :.  .        ::... :   ..:   .   : .:  :  .:  
CCDS55 YEKPEKSDPSELSWPKSPE--------SCSSVAE---SNGVLTEGEESDVESHG--NGLE
         520       530               540          550         560  

      580       590       600       610       620       630        
pF1KSD SSGAGRMETKARAGEGQAPSTFSKLKMEIKKSRRHPLGRPPTRSPLSVVKQEASSDEEAS
        .    . .  : .  ..:: ... . . .:: ::::.:::.:::...:::.: ::::  
CCDS55 PGEIPAVPSGERNSF-KVPS-IAEGENKTSKSWRHPLSRPPARSPMTLVKQQAPSDEELP
            570        580        590       600       610       620

       640       650        660       670       680       690      
pF1KSD P-FSGEEDVSDPDAL-RPLLSLQWKNRAASFQAERKFNAAAARTEPYCAICTLFYPYCQA
         .: ::.: . ..  .::. : :.... .: ::...::..:: .:.::::::..:: . 
CCDS55 EVLSIEEEVEETESWAKPLIHL-WQTKSPNFAAEQEYNATVARMKPHCAICTLLMPYHKP
              630       640        650       660       670         

        700       710       720       730       740       750      
pF1KSD LQTEKEAPIASLGEGCPATLPSKSRQKTRPLIPEMCFTSGGENTEPLPANSYIGDDGTSP
        ....:   :        .. :..  ::.::::::::  . :: :  : :... .:::: 
CCDS55 DSSNEEND-ARWETKLDEVVTSEG--KTKPLIPEMCFIYSEENIEYSPPNAFLEEDGTSL
     680        690       700         710       720       730      

        760       770       780       790       800       810      
pF1KSD LIACGKCCLQVHASCYGIRPELVNEGWTCSRCAAHAWTAECCLCNLRGGALQMTTDRRWI
       ::.:.:::..::::::::  . . .:: :.::  .::::::::::::::::..: . .: 
CCDS55 LISCAKCCVRVHASCYGIPSHEICDGWLCARCKRNAWTAECCLCNLRGGALKQTKNNKWA
        740       750       760       770       780       790      

        820       830       840       850       860       870      
pF1KSD HVICAIAVPEARFLNVIERHPVDISAIPEQRWKLKCVYCRKRMKKVSGACIQCSYEHCST
       ::.::.::::.:: :: ::  .:.. :: :: ::                          
CCDS55 HVMCAVAVPEVRFTNVPERTQIDVGRIPLQRLKLGRLGI                     
        800       810       820       830                          

        880       890       900       910       920       930      
pF1KSD SFHVTCAHAAGVLMEPDDWPYVVSITCLKHKSGGHAVQLLRAVSLGQVVITKNRNGLYYR

>>CCDS6471.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9               (1056 aa)
 initn: 3852 init1: 2113 opt: 2145  Z-score: 1184.2  bits: 230.8 E(32554): 1.2e-59
Smith-Waterman score: 3857; 54.9% identity (75.8% similar) in 1058 aa overlap (10-1062:11-1022)

                10        20        30        40        50         
pF1KSD  MGSEDHGAQNPSCKIMTFRPTMEEFKDFNKYVAYIESQGAHRAGLAKIIPPKEWKPRQT
                 :::::::::::.::::..::::.::.::.:::::::::.:::::::::: 
CCDS64 MEVAEVESPLNPSCKIMTFRPSMEEFREFNKYLAYMESKGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQC
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KSD YDDIDDVVIPAPIQQVVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVGEYRRLANSEKYCTPRHQDFDDLE
       :::::...:::::::.:::::::::::::::::::: :.:.:::: ::::::. :..:::
CCDS64 YDDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGKYCTPRYLDYEDLE
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KSD RKYWKNLTFVSPIYGADISGSLYDDDVAQWNIGSLRTILDMVERECGTIIEGVNTPYLYF
       ::::::::::.:::::::.::.::. : .:::. : :.::.::.:::  :::::::::::
CCDS64 RKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTVLDVVEEECGISIEGVNTPYLYF
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KSD GMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAIGFFPGSSQGCDAFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::.:::::::::
CCDS64 GMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAQGFFPSSSQGCDAFL
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KSD RHKMTLISPIILKKYGIPFSRITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATLRWID
       ::::::::: .::::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS64 RHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATVRWID
              250       260       270       280       290       300

     300       310       320       330       340       350         
pF1KSD YGKVATQCTCRKDMVKISMDVFVRILQPERYELWKQGKDLTVLDHTRPTALTSPELSSWS
       :::::  :::::::::::::.::: .::.::.:::::::. ..:::.::  ..::...: 
CCDS64 YGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVRKFQPDRYQLWKQGKDIYTIDHTKPTPASTPEVKAWL
              310       320       330       340       350       360

     360       370       380       390       400       410         
pF1KSD ASRASLKAKLLRRSHRKRSQPKKPKPEDPKFPGEGTAGAALLEEAGGSVKEEAGPEVDPE
         : ... :  :  .  ::  :.:: ..                     .::.. :::  
CCDS64 QRRRKVR-KASRSFQCARSTSKRPKADE---------------------EEEVSDEVDGA
               370       380                            390        

     420       430        440       450       460       470        
pF1KSD EEEEEPQPLPHGREAEGAEE-DGRGKLRPTKAKSERKKKSFGLLPPQLPPPPAHFPSEEA
       :    :.:     . . .:. ..  ::: :.:.::.....  .   :      .. ..  
CCDS64 EV---PNPDSVTDDLKVSEKSEAAVKLRNTEASSEEESSASRMQVEQNLSDHIKLSGNSC
      400          410       420       430       440       450     

      480       490       500       510       520       530        
pF1KSD LWLPSPLEPPVLGPGPAAMEESPLPAPLNVVPPEVPSEELEAKPRPIIPMLYVVPRPGKA
       :   . .   .      :.    .:.  . .   .:      ::.   :     :.  . 
CCDS64 L--STSVTEDIKTEDDKAYAYRSVPSISSEADDSIPLSSGYEKPEKSDPSELSWPKSPE-
           460       470       480       490       500       510   

      540       550       560       570       580       590        
pF1KSD AFNQEHVSCQQAFEHFAQKGPTWKEPVSPMELTGPEDGAASSGAGRMETKARAGEGQAPS
              ::... :   ..:   .   : .:  :  .:   .    . .  : .  ..::
CCDS64 -------SCSSVAE---SNGVLTEGEESDVESHG--NGLEPGEIPAVPSGERNSF-KVPS
                      520       530         540       550          

      600       610       620       630        640       650       
pF1KSD TFSKLKMEIKKSRRHPLGRPPTRSPLSVVKQEASSDEEASP-FSGEEDVSDPDAL-RPLL
        ... . . .:: ::::.:::.:::...:::.: ::::    .: ::.: . ..  .::.
CCDS64 -IAEGENKTSKSWRHPLSRPPARSPMTLVKQQAPSDEELPEVLSIEEEVEETESWAKPLI
      560       570       580       590       600       610        

        660       670       680       690       700       710      
pF1KSD SLQWKNRAASFQAERKFNAAAARTEPYCAICTLFYPYCQALQTEKEAPIASLGEGCPATL
        : :.... .: ::...::..:: .:.::::::..:: .  ....:   :        ..
CCDS64 HL-WQTKSPNFAAEQEYNATVARMKPHCAICTLLMPYHKPDSSNEEND-ARWETKLDEVV
      620        630       640       650       660        670      

        720       730       740       750       760       770      
pF1KSD PSKSRQKTRPLIPEMCFTSGGENTEPLPANSYIGDDGTSPLIACGKCCLQVHASCYGIRP
        :..  ::.::::::::  . :: :  : :... .:::: ::.:.:::..::::::::  
CCDS64 TSEG--KTKPLIPEMCFIYSEENIEYSPPNAFLEEDGTSLLISCAKCCVRVHASCYGIPS
        680         690       700       710       720       730    

        780       790       800       810       820       830      
pF1KSD ELVNEGWTCSRCAAHAWTAECCLCNLRGGALQMTTDRRWIHVICAIAVPEARFLNVIERH
       . . .:: :.::  .::::::::::::::::..: . .: ::.::.::::.:: :: :: 
CCDS64 HEICDGWLCARCKRNAWTAECCLCNLRGGALKQTKNNKWAHVMCAVAVPEVRFTNVPERT
          740       750       760       770       780       790    

        840       850       860       870       880       890      
pF1KSD PVDISAIPEQRWKLKCVYCRKRMKKVSGACIQCSYEHCSTSFHVTCAHAAGVLMEPDDWP
        .:.. :: :: ::::..::.:.:.:::::::::: .: .::::::::::::::::::::
CCDS64 QIDVGRIPLQRLKLKCIFCRHRVKRVSGACIQCSYGRCPASFHVTCAHAAGVLMEPDDWP
          800       810       820       830       840       850    

        900       910         920       930       940       950    
pF1KSD YVVSITCLKHKSGGHAVQLL--RAVSLGQVVITKNRNGLYYRCRVIGAASQTCYEVNFDD
       :::.:::..:: . .. .    ...:.::.::::.::  :: :::....::: ::: :::
CCDS64 YVVNITCFRHKVNPNVKSKACEKVISVGQTVITKHRNTRYYSCRVMAVTSQTFYEVMFDD
          860       870       880       890       900       910    

          960       970       980       990      1000      1010    
pF1KSD GSYSDNLYPESITSRDCVQLGPPSEGELVELRWTDGNLYKAKFISSVTSHIYQVEFEDGS
       ::.: . .::.:.::::..::::.:::.:...: ::.:: ::...:  .:.:::::::::
CCDS64 GSFSRDTFPEDIVSRDCLKLGPPAEGEVVQVKWPDGKLYGAKYFGSNIAHMYQVEFEDGS
          920       930       940       950       960       970    

         1020      1030      1040      1050      1060      1070    
pF1KSD QLTVKRGDIFTLEEELPKRVRSRLSLSTGAPQEPAFSGEEAKAAKRPRVGTPLATEDSGR
       :...:: ::.::.:::::::..:.: ..    : .: : .   ..: :            
CCDS64 QIAMKREDIYTLDEELPKRVKARFSTASDMRFEDTFYGADIIQGERKRQRVLSSRFKNEY
          980       990      1000      1010      1020      1030    

         1080      1090      
pF1KSD SQDYVAFVESLLQVQGRPGAPF
                             
CCDS64 VADPVYRTFLKSSFQKKCQKRQ
         1040      1050      

>>CCDS491.1 KDM4A gene_id:9682|Hs108|chr1                 (1064 aa)
 initn: 3625 init1: 2006 opt: 2010  Z-score: 1110.7  bits: 217.3 E(32554): 1.5e-55
Smith-Waterman score: 3619; 50.9% identity (74.1% similar) in 1092 aa overlap (1-1083:1-1064)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MGSEDHGAQNPSCKIMTFRPTMEEFKDFNKYVAYIESQGAHRAGLAKIIPPKEWKPRQTY
       :.::.. . ::: .:::: ::::::..:..:.:::::::::::::::..:::::::: .:
CCDS49 MASESE-TLNPSARIMTFYPTMEEFRNFSRYIAYIESQGAHRAGLAKVVPPKEWKPRASY
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD DDIDDVVIPAPIQQVVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVGEYRRLANSEKYCTPRHQDFDDLER
       :::::.::::::::.:::::::::::::::::::: :.:..:::.::::::...:..:::
CCDS49 DDIDDLVIPAPIQQLVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVREFRKIANSDKYCTPRYSEFEELER
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD KYWKNLTFVSPIYGADISGSLYDDDVAQWNIGSLRTILDMVERECGTIIEGVNTPYLYFG
       ::::::::  ::::::..:.::.  : .:::: ::::::.::.: :  ::::::::::::
CCDS49 KYWKNLTFNPPIYGADVNGTLYEKHVDEWNIGRLRTILDLVEKESGITIEGVNTPYLYFG
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD MWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAIGFFPGSSQGCDAFLR
       ::::.:::::::::::::::::::::::::..:::::::::::: ::::::.:.:.::::
CCDS49 MWKTSFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYSVPPEHGKRLERLAKGFFPGSAQSCEAFLR
     180       190       200       210       220       230         

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD HKMTLISPIILKKYGIPFSRITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATLRWIDY
       ::::::::..::::::::...::::::::::::::::::::::::::::::::: :::.:
CCDS49 HKMTLISPLMLKKYGIPFDKVTQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATRRWIEY
     240       250       260       270       280       290         

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD GKVATQCTCRKDMVKISMDVFVRILQPERYELWKQGKDLTVLDHTRPTALTSPELSSWSA
       :: :. :.::::::::::::::: .:::::.::: ::: ::.::: ::    ::     :
CCDS49 GKQAVLCSCRKDMVKISMDVFVRKFQPERYKLWKAGKDNTVIDHTLPT----PE-----A
     300       310       320       330       340                350

              370       380         390       400       410        
pF1KSD SRASLKAKLLRRSHRKRSQPKKPKP--EDPKFPGEGTAGAALLEEAGGSVKEEAGPEVDP
       ..   ...:  :.  ..  :..     :: .   ::   ..: ..  :. ....  :.  
CCDS49 AEFLKESELPPRAGNEEECPEEDMEGVEDGE---EGDLKTSLAKHRIGTKRHRVCLEIPQ
              360       370       380          390       400       

      420         430       440        450       460       470     
pF1KSD EEEEEE--PQPLPHGREAEGAEEDGR-GKLRPTKAKSERKKKSFGLLPPQLPPPPAHFPS
       :  . :  :.    ... : .:  .  . .:::.. : :. ..   .:       ..:  
CCDS49 EVSQSELFPKEDLSSEQYEMTECPAALAPVRPTHS-SVRQVEDGLTFPDYSDSTEVKFEE
       410       420       430       440        450       460      

         480       490       500       510       520       530     
pF1KSD EEALWLPSPLEPPVLGPGPAAMEESPLPAPLNVVPPEVPSEELEAKPRPIIPMLYVVPRP
        . . :    :      . ::.. :  ::    :  ..     . :    .         
CCDS49 LKNVKLEEEDEEEE--QAAAALDLSVNPAS---VGGRLVFSGSKKKSSSSLGSGSSRDSI
        470       480         490          500       510       520 

         540       550       560       570       580       590     
pF1KSD GKAAFNQEHVSCQQAFEHFAQKGPTWKEPVSPMELTGPEDGAASSGAGRMETKARAGEGQ
       .. . ..: .::.   .  .    .. .  . . .  :     .:.: :  .. . .:  
CCDS49 SSDSETSEPLSCRAQGQTGVLTVHSYAKGDGRVTVGEPCTRKKGSAA-RSFSERELAEVA
             530       540       550       560        570       580

         600       610       620       630       640       650     
pF1KSD APSTFSKLKMEIKKSRRHPLGRPPTRSPLSVVKQEASSDEEASPFSGEEDVSDPDALRPL
           ::  . . .:.::.::.. : . :: :... .:.:: .  .. ::.. . .:    
CCDS49 DEYMFSLEENKKSKGRRQPLSKLPRHHPL-VLQECVSDDETSEQLTPEEEAEETEAWAKP
              590       600        610       620       630         

         660       670       680       690       700       710     
pF1KSD LSLQWKNRAASFQAERKFNAAAARTEPYCAICTLFYPYCQALQTEKEAPIASLGEGCP-A
       ::  :.::  .:.::..:: . :.  :.::.: .:       :: ... .......:  :
CCDS49 LSQLWQNRPPNFEAEKEFNETMAQQAPHCAVCMIF-------QTYHQVEFGGFNQNCGNA
     640       650       660       670              680       690  

          720       730       740       750       760       770    
pF1KSD TLPSKSRQKTRPLIPEMCFTSGGENTEPLPANSYIGDDGTSPLIACGKCCLQVHASCYGI
       .  . ..:.:.:::::::::: : .:.   .. :. .:::: :..: :: ..:::::::.
CCDS49 SDLAPQKQRTKPLIPEMCFTSTGCSTDINLSTPYLEEDGTSILVSCKKCSVRVHASCYGV
            700       710       720       730       740       750  

          780       790       800       810       820       830    
pF1KSD RPELVNEGWTCSRCAAHAWTAECCLCNLRGGALQMTTDRRWIHVICAIAVPEARFLNVIE
        :  ..: : ::::.:.:   .::::.::::::: ..: ::.:: ::.:. ::::.:. :
CCDS49 PPAKASEDWMCSRCSANALEEDCCLCSLRGGALQRANDDRWVHVSCAVAILEARFVNIAE
            760       770       780       790       800       810  

          840       850       860       870       880       890    
pF1KSD RHPVDISAIPEQRWKLKCVYCRKRMKKVSGACIQCSYEHCSTSFHVTCAHAAGVLMEPDD
       : :::.: ::  :.::::..:.:: :...: :.:::. .: :.:::.::.::::.:.:::
CCDS49 RSPVDVSKIPLPRFKLKCIFCKKRRKRTAGCCVQCSHGRCPTAFHVSCAQAAGVMMQPDD
            820       830       840       850       860       870  

          900       910         920       930       940       950  
pF1KSD WPYVVSITCLKHKSGG--HAVQLLRAVSLGQVVITKNRNGLYYRCRVIGAASQTCYEVNF
       ::.:: :::..::  .  .:   :.... :: ::.:..:: .:.:.:.  ...: :::::
CCDS49 WPFVVFITCFRHKIPNLERAKGALQSITAGQKVISKHKNGRFYQCEVVRLTTETFYEVNF
            880       890       900       910       920       930  

            960       970       980       990      1000      1010  
pF1KSD DDGSYSDNLYPESITSRDCVQLGPPSEGELVELRWTDGNLYKAKFISSVTSHIYQVEFED
       ::::.:::::::.:.:.::.:.:::.:::.:..:::::..: :::..:   ..:::::::
CCDS49 DDGSFSDNLYPEDIVSQDCLQFGPPAEGEVVQVRWTDGQVYGAKFVASHPIQMYQVEFED
            940       950       960       970       980       990  

           1020      1030      1040      1050       1060      1070 
pF1KSD GSQLTVKRGDIFTLEEELPKRVRSRLSLSTGAPQEPAFSGEEAKAAK-RPRVGTPLATED
       ::::.::: :..::.:::::::.::::...    .  :. .:.:  : : :: .    ::
CCDS49 GSQLVVKRDDVYTLDEELPKRVKSRLSVASDMRFNEIFTEKEVKQEKKRQRVINSRYRED
           1000      1010      1020      1030      1040      1050  

            1080      1090      
pF1KSD SGRSQDYVAFVESLLQVQGRPGAPF
         .   : :..:             
CCDS49 YIEPALYRAIME             
           1060                 

>>CCDS8302.1 KDM4D gene_id:55693|Hs108|chr11              (523 aa)
 initn: 1962 init1: 1882 opt: 1909  Z-score: 1060.1  bits: 206.9 E(32554): 1e-52
Smith-Waterman score: 1929; 54.8% identity (74.9% similar) in 546 aa overlap (1-539:4-515)

                  10        20        30        40        50       
pF1KSD    MGSEDHGAQNPSCKIMTFRPTMEEFKDFNKYVAYIESQGAHRAGLAKIIPPKEWKPR
          : :. . ::::.:.:: :.:: :::.::.::.::.:::::::::::::::::::: :
CCDS83 METMKSKANCAQNPNCNIMIFHPTKEEFNDFDKYIAYMESQGAHRAGLAKIIPPKEWKAR
               10        20        30        40        50        60

        60        70        80        90       100       110       
pF1KSD QTYDDIDDVVIPAPIQQVVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVGEYRRLANSEKYCTPRHQDFDD
       .:::.:....: .:.:::..:..:.::::. .::::::::::.::::.:: :: ::.:.:
CCDS83 ETYDNISEILIATPLQQVASGRAGVFTQYHKKKKAMTVGEYRHLANSKKYQTPPHQNFED
               70        80        90       100       110       120

       120       130       140       150       160       170       
pF1KSD LERKYWKNLTFVSPIYGADISGSLYDDDVAQWNIGSLRTILDMVERECGTIIEGVNTPYL
       ::::::::  . ::::::::::::.:... :::.: : :: :..:.:::..:::::::::
CCDS83 LERKYWKNRIYNSPIYGADISGSLFDENTKQWNLGHLGTIQDLLEKECGVVIEGVNTPYL
              130       140       150       160       170       180

       180       190       200       210       220       230       
pF1KSD YFGMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAIGFFPGSSQGCDA
       :::::::::::::::::::::::::.::::.::..:::::.::::::  .:::::.:: :
CCDS83 YFGMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHLGEPKTWYVVPPEHGQRLERLARELFPGSSRGCGA
              190       200       210       220       230       240

       240       250       260       270       280       290       
pF1KSD FLRHKMTLISPIILKKYGIPFSRITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATLRW
       :::::..:::: .::. ::::.::::::::::.::::::::::::::::::. :::: ::
CCDS83 FLRHKVALISPTVLKENGIPFNRITQEAGEFMVTFPYGYHAGFNHGFNCAEAINFATPRW
              250       260       270       280       290       300

       300       310       320       330       340       350       
pF1KSD IDYGKVATQCTCRKDMVKISMDVFVRILQPERYELWKQGKDLTVLDHTRPTALTSPELSS
       :::::.:.::.: .  : .:::.::::::::::.:::.:.: .:.:: .: . .: :::.
CCDS83 IDYGKMASQCSCGEARVTFSMDAFVRILQPERYDLWKRGQDRAVVDHMEPRVPASQELST
              310       320       330       340       350       360

       360        370         380       390       400       410    
pF1KSD WSASRASLKAKL-LRR--SHRKRSQPKKPKPEDPKFPGEGTAGAALLEEAGGSVKEEAGP
        .  .   .: : ::.  ::  : .:       :     ::   .:.  .    .  .: 
CCDS83 QKEVQLPRRAALGLRQLPSHWARHSPW------PMAARSGTRCHTLVCSSLPRRSAVSGT
              370       380             390       400       410    

              420       430       440       450       460       470
pF1KSD EVDPE----EEEEEPQPLPHGREAEGAEEDGRGKLRPTKAKSERKKKSFGLLPPQLPPPP
        ..:.    .  ..:.  : .  . .:.      ..:....  : .            ::
CCDS83 ATQPRAAAVHSSKKPSSTPSSTPGPSAQ-----IIHPSNGRRGRGR------------PP
          420       430       440            450                   

              480       490       500       510       520       530
pF1KSD AHFPSEEALWLPSPLEPPVLGPGPAAMEESPLPAPLNVVPPEVPSEELEAKPRPIIPMLY
        .. ..: : : .: . :.:. : .    .: : ::    ::  .  :  :: :. : : 
CCDS83 QKLRAQE-LTLQTPAKRPLLA-GTTCTASGPEPEPL----PE--DGALMDKPVPLSPGLQ
       460        470        480       490             500         

              540       550       560       570       580       590
pF1KSD VVPRPGKAAFNQEHVSCQQAFEHFAQKGPTWKEPVSPMELTGPEDGAASSGAGRMETKAR
          .: ::.                                                   
CCDS83 ---HPVKASGCSWAPVP                                           
        510       520                                              

>>CCDS44713.1 KDM4E gene_id:390245|Hs108|chr11            (506 aa)
 initn: 1799 init1: 1799 opt: 1810  Z-score: 1006.4  bits: 196.9 E(32554): 9.7e-50
Smith-Waterman score: 1810; 63.5% identity (82.7% similar) in 411 aa overlap (1-404:1-411)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MGSEDHGAQNPSCKIMTFRPTMEEFKDFNKYVAYIESQGAHRAGLAKIIPPKEWKPRQTY
       : :   . :: :  :::: :::::: ::: ::::.::::::.:::::.::::::: :: :
CCDS44 MKSVHSSPQNTSHTIMTFYPTMEEFADFNTYVAYMESQGAHQAGLAKVIPPKEWKARQMY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD DDIDDVVIPAPIQQVVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVGEYRRLANSEKYCTPRHQDFDDLER
       :::.:..: .:.:::..::.:.::::. .:::: ::.:::::::.:: :: ::.: :::.
CCDS44 DDIEDILIATPLQQVTSGQGGVFTQYHKKKKAMRVGQYRRLANSKKYQTPPHQNFADLEQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD KYWKNLTFVSPIYGADISGSLYDDDVAQWNIGSLRTILDMVERECGTIIEGVNTPYLYFG
       .:::.     :::::::::::..... :::.: : ::::..:.:::..::::::::::::
CCDS44 RYWKSHPGNPPIYGADISGSLFEESTKQWNLGHLGTILDLLEQECGVVIEGVNTPYLYFG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD MWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAIGFFPGSSQGCDAFLR
       :::::::::::::::::::::::::::.::..:::::..:::::  .::  :.::.::::
CCDS44 MWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKTWYVVPPEHGQHLERLARELFPDISRGCEAFLR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD HKMTLISPIILKKYGIPFSRITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATLRWIDY
       ::..:::: .::. ::::. .::::::::.::::::::::::::::::. :::: :::::
CCDS44 HKVALISPTVLKENGIPFNCMTQEAGEFMVTFPYGYHAGFNHGFNCAEAINFATPRWIDY
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD GKVATQCTCRKDMVKISMDVFVRILQPERYELWKQGKDLTVLDHTRPTALTSPELSSWSA
       ::.:.::.: .. : .::: ::::.::: :::::. .::....::.: .  : :::.:  
CCDS44 GKMASQCSCGESTVTFSMDPFVRIVQPESYELWKHRQDLAIVEHTEPRVAESQELSNWRD
              310       320       330       340       350       360

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pF1KSD S----RASLKAKLLRR-SHRKRSQP-KKPKPEDPKFPG-EGTAGAALLEEAGGSVKEEAG
       .    ::.:  .::   . .  .:: .. .  .::  : ... :.:.   :         
CCDS44 DIVLRRAALGLRLLPNLTAQCPTQPVSSGHCYNPKGCGTDAVPGSAFQSSAYHTQTQSLT
              370       380       390       400       410       420

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pF1KSD PEVDPEEEEEEPQPLPHGREAEGAEEDGRGKLRPTKAKSERKKKSFGLLPPQLPPPPAHF
                                                                   
CCDS44 LGMSARVLLPSTGSWGSGRGRGRGQGQGRGCSRGRGHGCCTRELGTEEPTVQPASKRRLL
              430       440       450       460       470       480

>>CCDS78379.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9              (151 aa)
 initn: 807 init1: 807 opt: 807  Z-score: 468.0  bits: 95.5 E(32554): 9.6e-20
Smith-Waterman score: 807; 82.2% identity (97.0% similar) in 135 aa overlap (10-144:11-145)

                10        20        30        40        50         
pF1KSD  MGSEDHGAQNPSCKIMTFRPTMEEFKDFNKYVAYIESQGAHRAGLAKIIPPKEWKPRQT
                 :::::::::::.::::..::::.::.::.:::::::::.:::::::::: 
CCDS78 MEVAEVESPLNPSCKIMTFRPSMEEFREFNKYLAYMESKGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQC
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KSD YDDIDDVVIPAPIQQVVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVGEYRRLANSEKYCTPRHQDFDDLE
       :::::...:::::::.:::::::::::::::::::: :.:.:::: ::::::. :..:::
CCDS78 YDDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGKYCTPRYLDYEDLE
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
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       ::::::::::.:::::::.::.::.                                   
CCDS78 RKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEVHSYLQ                             
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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