Result of SIM4 for pF1KSDA0843

seq1 = pF1KSDA0843.tfa, 2049 bp
seq2 = pF1KSDA0843/gi568815593f_149083452.tfa (gi568815593f:149083452_149358401), 274950 bp

>pF1KSDA0843 2049
>gi568815593f:149083452_149358401 (Chr5)

9-151  (99996-100138)   98% ->
152-335  (114768-114951)   100% ->
336-448  (116865-116977)   100% ->
449-575  (123557-123683)   100% ->
576-669  (127275-127368)   100% ->
670-757  (133508-133595)   100% ->
758-816  (147198-147256)   100% ->
817-888  (149778-149849)   100% ->
889-1044  (153997-154152)   100% ->
1045-1074  (155797-155826)   100% ->
1075-1204  (156308-156437)   100% ->
1205-1303  (157225-157323)   100% ->
1304-1351  (159040-159087)   100% ->
1352-1486  (161430-161564)   100% ->
1487-1551  (163031-163095)   100% ->
1552-1699  (164331-164478)   100% ->
1700-1729  (166364-166393)   100% ->
1730-1788  (166996-167054)   100% ->
1789-1857  (167908-167972)   92% ->
1858-1938  (169306-169386)   100% ->
1939-2049  (174840-174950)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      9 TAGCA TTCCTTATCAGCAGAATCCTTACAATCCACGGGGCAGCTCCAAT
        ||-||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99996 TA CAGTTCCTTATCAGCAGAATCCTTACAATCCACGGGGCAGCTCCAAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     58 GTCATCCAGTGCTACCGCTGTGGAGACACCTGCAAAGGGGAAGTGGTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100045 GTCATCCAGTGCTACCGCTGTGGAGACACCTGCAAAGGGGAAGTGGTCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    108 CGTGCACAACAACCACTTCCACATCAGATGCTTCACCTGTCAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100095 CGTGCACAACAACCACTTCCACATCAGATGCTTCACCTGTCAAGGTA...

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    152    TATGTGGCTGTGGCCTGGCCCAGTCAGGCTTCTTCTTCAAGAACCAG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114765 AAGTATGTGGCTGTGGCCTGGCCCAGTCAGGCTTCTTCTTCAAGAACCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    199 GAGTACATCTGCACCCAGGACTACCAGCAACTCTATGGCACCCGCTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114815 GAGTACATCTGCACCCAGGACTACCAGCAACTCTATGGCACCCGCTGTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    249 CAGCTGCCGGGACTTCATCACAGGCGAAGTCATCTCGGCCCTGGGCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114865 CAGCTGCCGGGACTTCATCACAGGCGAAGTCATCTCGGCCCTGGGCCGCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    299 CTTACCACCCCAAGTGCTTCGTGTGCAGCTTGTGCAG         GAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 114915 CTTACCACCCCAAGTGCTTCGTGTGCAGCTTGTGCAGGTG...CAGGAAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    340 CCTTTCCCCATTGGAGACAAGGTGACCTTCAGCGGTAAAGAATGTGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116869 CCTTTCCCCATTGGAGACAAGGTGACCTTCAGCGGTAAAGAATGTGTGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    390 CCAAACGTGCTCCCAGTCCATGGCCAGCAGTAAGCCCATCAAGATTCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116919 CCAAACGTGCTCCCAGTCCATGGCCAGCAGTAAGCCCATCAAGATTCGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    440 GACCAAGCC         ACTGTGCCGGGTGCAAGGAGGAGATCAAGCAC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 116969 GACCAAGCCGTG...CAGACTGTGCCGGGTGCAAGGAGGAGATCAAGCAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    481 GGCCAGTCACTCCTGGCTCTGGACAAGCAGTGGCACGTCAGCTGCTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123589 GGCCAGTCACTCCTGGCTCTGGACAAGCAGTGGCACGTCAGCTGCTTCAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    531 GTGCCAGACCTGCAGCGTCATCCTCACCGGGGAGTATATCAGCAA     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 123639 GTGCCAGACCTGCAGCGTCATCCTCACCGGGGAGTATATCAGCAAGTG..

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    576     GGATGGTGTTCCATACTGTGAGTCCGACTACCATGCCCAGTTTGGC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123689 .CAGGGATGGTGTTCCATACTGTGAGTCCGACTACCATGCCCAGTTTGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    622 ATTAAATGTGAGACTTGTGACCGATACATCAGTGGCAGAGTCTTGGAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 127321 ATTAAATGTGAGACTTGTGACCGATACATCAGTGGCAGAGTCTTGGAGGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    670        GCAGGAGGGAAGCACTACCACCCAACCTGTGCCAGGTGTGTAC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127371 G...TAGGCAGGAGGGAAGCACTACCACCCAACCTGTGCCAGGTGTGTAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    713 GCTGCCACCAGATGTTCACCGAAGGAGAGGAAATGTACCTCACAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 133551 GCTGCCACCAGATGTTCACCGAAGGAGAGGAAATGTACCTCACAGGTA..

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    758     GTTCCGAGGTTTGGCACCCCATCTGCAAACAGGCAGCCCGGGCAGA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133601 .TAGGTTCCGAGGTTTGGCACCCCATCTGCAAACAGGCAGCCCGGGCAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    804 GAAGAAGTTAAAG         CATAGACGGACATCTGAAACCTCCATCT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 147244 GAAGAAGTTAAAGGTA...CAGCATAGACGGACATCTGAAACCTCCATCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    845 CACCCCCTGGATCCAGCATTGGGTCACCCAACCGAGTCATCTGC      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 149806 CACCCCCTGGATCCAGCATTGGGTCACCCAACCGAGTCATCTGCGTA...

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    889    GCTAAAGTGGATAATGAGATCCTTAATTACAAAGACCTGGCGGCTCT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153994 TAGGCTAAAGTGGATAATGAGATCCTTAATTACAAAGACCTGGCGGCTCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    936 CCCCAAGGTTAAGTCTATCTACGAGGTACAACGCCCCGACCTCATTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154044 CCCCAAGGTTAAGTCTATCTACGAGGTACAACGCCCCGACCTCATTTCCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    986 ATGAGCCTCATTCCAGATACATGTCCGACGAGATGCTGGAGAGATGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154094 ATGAGCCTCATTCCAGATACATGTCCGACGAGATGCTGGAGAGATGTGGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1036 TATGGAGAG         TCGCTGGGAACATTATCTCCCTACTCCCAG  
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||>>
 154144 TATGGAGAGGTA...AAGTCGCTGGGAACATTATCTCCCTACTCCCAGGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1075        GACATCTACGAGAACCTGGACCTCCGGCAGAGACGGGCCTCCA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155829 A...CAGGACATCTACGAGAACCTGGACCTCCGGCAGAGACGGGCCTCCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1118 GCCCGGGGTACATAGACTCCCCCACCTACAGCCGGCAGGGCATGTCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156351 GCCCGGGGTACATAGACTCCCCCACCTACAGCCGGCAGGGCATGTCCCCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1168 ACCTTCTCCCGCTCACCTCACCACTACTACCGCTCTG         GGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 156401 ACCTTCTCCCGCTCACCTCACCACTACTACCGCTCTGGTA...CAGGGCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1209 CGAGAGTGGCCGGAGCTCTCCATACCATAGCCAGTTAGATGTGAGGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157229 CGAGAGTGGCCGGAGCTCTCCATACCATAGCCAGTTAGATGTGAGGTCCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1259 CCACTCCAACCTCTTACCAGGCTCCCAAGCACTTTCACATCCCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 157279 CCACTCCAACCTCTTACCAGGCTCCCAAGCACTTTCACATCCCAGGTA..

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1304     CTGGAGACAGTAACATCTACCGGAAACCCCCGATCTACAAACGGCA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157329 .CAGCTGGAGACAGTAACATCTACCGGAAACCCCCGATCTACAAACGGCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1350 TG         GTGATTTGTCTACAGCAACCAAGAGCAAAACAAGTGAAG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159086 TGGTA...CAGGTGATTTGTCTACAGCAACCAAGAGCAAAACAAGTGAAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1391 ACATCAGCCAGACCTCCAAGTACAGTCCCATCTACTCGCCAGACCCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161469 ACATCAGCCAGACCTCCAAGTACAGTCCCATCTACTCGCCAGACCCCTAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1441 TATGCTTCGGAGTCTGAGTACTGGACCTACCATGGGTCCCCCAAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 161519 TATGCTTCGGAGTCTGAGTACTGGACCTACCATGGGTCCCCCAAAGGTA.

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1487      TGCCCCGAGCCAGAAGGTTCTCGTCTGGAGGAGAGGAGGATGATT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161569 ..CAGTGCCCCGAGCCAGAAGGTTCTCGTCTGGAGGAGAGGAGGATGATT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1532 TTGACCGCAGCATGCACAAG         CTCCAAAGTGGAATTGGCCGG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 163076 TTGACCGCAGCATGCACAAGGTG...CAGCTCCAAAGTGGAATTGGCCGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1573 CTGATTCTGAAGGAAGAAATGAAGGCCCGGTCGAGCTCCTATGCAGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164352 CTGATTCTGAAGGAAGAAATGAAGGCCCGGTCGAGCTCCTATGCAGATCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1623 CTGGACCCCTCCCCGGAGCTCCACCAGCAGCCGGGAAGCCCTGCACACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164402 CTGGACCCCTCCCCGGAGCTCCACCAGCAGCCGGGAAGCCCTGCACACAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1673 CTGGCTATGAGATGTCCCTCAATGGCT         CCCCTCGGTCGCAC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 164452 CTGGCTATGAGATGTCCCTCAATGGCTGTA...CAGCCCCTCGGTCGCAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1714 TACCTGGCTGACAGTG         ATCCTCTCATCTCCAAATCTGCCTC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 166378 TACCTGGCTGACAGTGGTA...CAGATCCTCTCATCTCCAAATCTGCCTC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1755 CCTGCCTGCCTACCGAAGAAATGGGCTGCACAGG         ACACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 167021 CCTGCCTGCCTACCGAAGAAATGGGCTGCACAGGGTA...CAGACACCCA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1796 GCGCAGACCTCTTCCACTACGACAGCATGAACGCAGTCAACTGGGGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167915 GCGCAGACCTCTTCCACTACGACAGCATGAACGCAGTCAACTGGGGCATG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1846 CGAGAGTACAAG         ATCTACCCTTATGAACTGCTGCTGGTGAC
        ||||-|| -|-->>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 167965 CGAG GTG A  GTG...TAGATCTACCCTTATGAACTGCTGCTGGTGAC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1887 TACAAGAGGAAGAAACCGACTGCCCAAGGATGTAGACAGGACCCGTTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169335 TACAAGAGGAAGAAACCGACTGCCCAAGGATGTAGACAGGACCCGTTTAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1937 AG         CGCCACCTGTCCCAGGAAGAGTTCTACCAAGTCTTTGGC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169385 AGGTA...CAGCGCCACCTGTCCCAGGAAGAGTTCTACCAAGTCTTTGGC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1978 ATGACCATCTCTGAGTTTGACCGGCTGGCCCTCTGGAAGAGGAATGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174879 ATGACCATCTCTGAGTTTGACCGGCTGGCCCTCTGGAAGAGGAATGAACT

   2200     .    :    .    :
   2028 GAAGAAGCAAGCCCGGCTGTTC
        ||||||||||||||||||||||
 174929 GAAGAAGCAAGCCCGGCTGTTC

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