Result of FASTA (omim) for pF1KSDA0745
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0745, 905 aa
  1>>>pF1KSDA0745 905 - 905 aa - 905 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4199+/-0.000525; mu= 20.3398+/- 0.033
 mean_var=64.7505+/-12.764, 0's: 0 Z-trim(106.2): 42  B-trim: 23 in 1/49
 Lambda= 0.159387
 statistics sampled from 14284 (14320) to 14284 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.49), E-opt: 0.2 (0.168), width:  16
 Scan time:  9.670

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_055839 (OMIM: 606140) exportin-7 [Homo sapiens] (1087) 4183 971.8       0
XP_016868735 (OMIM: 606140) PREDICTED: exportin-7  (1088) 4183 971.8       0
XP_016868734 (OMIM: 606140) PREDICTED: exportin-7  (1096) 4183 971.8       0
XP_016868733 (OMIM: 606140) PREDICTED: exportin-7  (1097) 4183 971.8       0
XP_016865229 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding ( 999) 2913 679.7 1.8e-194
XP_016865228 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding (1039) 2913 679.8 1.9e-194
NP_075048 (OMIM: 606141) ran-binding protein 17 [H (1088) 2913 679.8  2e-194
XP_011532933 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding (1090) 2913 679.8  2e-194
XP_016865234 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding ( 792) 2895 675.6 2.6e-193
XP_016865232 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding (1010) 2895 675.6 3.3e-193
XP_016865227 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding (1043) 2895 675.6 3.4e-193
XP_016865225 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding (1052) 2895 675.6 3.4e-193
XP_011532929 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding (1092) 2895 675.6 3.5e-193
XP_016865226 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding (1094) 2895 675.6 3.5e-193
XP_016865231 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding ( 986) 2449 573.0 2.4e-162
XP_016865230 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding ( 990) 2431 568.9 4.2e-161
XP_016865236 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding ( 549) 2331 545.8 2.1e-154
XP_016868736 (OMIM: 606140) PREDICTED: exportin-7  ( 754) 1738 409.5 3.1e-113
XP_016865233 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding ( 746) 1377 326.5   3e-88
XP_011532939 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding ( 576) 1168 278.4   7e-74
XP_016865235 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding ( 580) 1168 278.4 7.1e-74
XP_011532938 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding ( 588) 1168 278.4 7.2e-74


>>NP_055839 (OMIM: 606140) exportin-7 [Homo sapiens]      (1087 aa)
 initn: 4183 init1: 4183 opt: 4183  Z-score: 5189.9  bits: 971.8 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4534; 80.6% identity (80.6% similar) in 937 aa overlap (151-905:151-1087)

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD FDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIASS
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 FDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIASS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD FRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDESS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 FRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDESS
              190       200       210       220       230       240

              250       260                                        
pF1KSD DDLCTVQIPTSWRSAFLDSSTLQL------------------------------------
       ::::::::::::::::::::::::                                    
NP_055 DDLCTVQIPTSWRSAFLDSSTLQLFFDLYHSIPPSFSPLVLSCLVQIASVRRSLFNNAER
              250       260       270       280       290       300

                                                                   
pF1KSD ------------------------------------------------------------
                                                                   
NP_055 AKFLSHLVDGVKRILENPQSLSDPNNYHEFCRLLARLKSNYQLGELVKVENYPEVIRLIA
              310       320       330       340       350       360

                                                                   
pF1KSD ------------------------------------------------------------
                                                                   
NP_055 NFTVTSLQHWEFAPNSVHYLLSLWQRLAASVPYVKATEPHMLETYTPEVTKAYITSRLES
              370       380       390       400       410       420

                                    270       280       290        
pF1KSD --------------------------STIGRCEYEKTCALLVQLFDQSAQSYQELLQSAS
                                 ::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VHIILRDGLEDPLEDTGLVQQQLDQLSTIGRCEYEKTCALLVQLFDQSAQSYQELLQSAS
              430       440       450       460       470       480

      300       310       320       330       340       350        
pF1KSD ASPMDIAVQEGRLTWLVYIIGAVIGGRVSFASTDEQDAMDGELVCRVLQLMNLTDSRLAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ASPMDIAVQEGRLTWLVYIIGAVIGGRVSFASTDEQDAMDGELVCRVLQLMNLTDSRLAQ
              490       500       510       520       530       540

      360       370       380       390       400       410        
pF1KSD AGNEKLELAMLSFFEQFRKIYIGDQVQKSSKLYRRLSEVLGLNDETMVLSVFIGKIITNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 AGNEKLELAMLSFFEQFRKIYIGDQVQKSSKLYRRLSEVLGLNDETMVLSVFIGKIITNL
              550       560       570       580       590       600

      420       430       440       450       460       470        
pF1KSD KYWGRCEPITSKTLQLLNDLSIGYSSVRKLVKLSAVQFMLNNHTSEHFSFLGINNQSNLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KYWGRCEPITSKTLQLLNDLSIGYSSVRKLVKLSAVQFMLNNHTSEHFSFLGINNQSNLT
              610       620       630       640       650       660

      480       490       500       510       520       530        
pF1KSD DMRCRTTFYTALGRLLMVDLGEDEDQYEQFMLPLTAAFEAVAQMFSTNSFNEQEAKRTLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DMRCRTTFYTALGRLLMVDLGEDEDQYEQFMLPLTAAFEAVAQMFSTNSFNEQEAKRTLV
              670       680       690       700       710       720

      540       550       560       570       580       590        
pF1KSD GLVRDLRGIAFAFNAKTSFMMLFEWIYPSYMPILQRAIELWYHDPACTTPVLKLMAELVH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GLVRDLRGIAFAFNAKTSFMMLFEWIYPSYMPILQRAIELWYHDPACTTPVLKLMAELVH
              730       740       750       760       770       780

      600       610       620       630       640       650        
pF1KSD NRSQRLQFDVSSPNGILLFRETSKMITMYGNRILTLGEVPKDQVYALKLKGISICFSMLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 NRSQRLQFDVSSPNGILLFRETSKMITMYGNRILTLGEVPKDQVYALKLKGISICFSMLK
              790       800       810       820       830       840

      660       670       680       690       700       710        
pF1KSD AALSGSYVNFGVFRLYGDDALDNALQTFIKLLLSIPHSDLLDYPKLSQSYYSLLEVLTQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 AALSGSYVNFGVFRLYGDDALDNALQTFIKLLLSIPHSDLLDYPKLSQSYYSLLEVLTQD
              850       860       870       880       890       900

      720       730       740       750       760       770        
pF1KSD HMNFIASLEPHVIMYILSSISEGLTALDTMVCTGCCSCLDHIVTYLFKQLSRSTKKRTTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 HMNFIASLEPHVIMYILSSISEGLTALDTMVCTGCCSCLDHIVTYLFKQLSRSTKKRTTP
              910       920       930       940       950       960

      780       790       800       810       820       830        
pF1KSD LNQESDRFLHIMQQHPEMIQQMLSTVLNIIIFEDCRNQWSMSRPLLGLILLNEKYFSDLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LNQESDRFLHIMQQHPEMIQQMLSTVLNIIIFEDCRNQWSMSRPLLGLILLNEKYFSDLR
              970       980       990      1000      1010      1020

      840       850       860       870       880       890        
pF1KSD NSIVNSQPPEKQQAMHLCFENLMEGIERNLLTKNRDRFTQNLSAFRREVNDSMKNSTYGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 NSIVNSQPPEKQQAMHLCFENLMEGIERNLLTKNRDRFTQNLSAFRREVNDSMKNSTYGV
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

      900     
pF1KSD NSNDMMS
       :::::::
NP_055 NSNDMMS
              

>--
 initn: 972 init1: 972 opt: 972  Z-score: 1199.5  bits: 233.4 E(85289): 4.5e-60
Smith-Waterman score: 972; 100.0% identity (100.0% similar) in 150 aa overlap (1-150:1-150)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MADHVQSLAQLENLCKQLYETTDTTTRLQAEKALVEFTNSPDCLSKCQLLLERGSSSYSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MADHVQSLAQLENLCKQLYETTDTTTRLQAEKALVEFTNSPDCLSKCQLLLERGSSSYSQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD LLAATCLTKLVSRTNNPLPLEQRIDIRNYVLNYLATRPKLATFVTQALIQLYARITKLGW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LLAATCLTKLVSRTNNPLPLEQRIDIRNYVLNYLATRPKLATFVTQALIQLYARITKLGW
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD FDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIASS
       ::::::::::::::::::::::::::::::                              
NP_055 FDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIASS
              130       140       150       160       170       180

>>XP_016868735 (OMIM: 606140) PREDICTED: exportin-7 isof  (1088 aa)
 initn: 4183 init1: 4183 opt: 4183  Z-score: 5189.9  bits: 971.8 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4534; 80.6% identity (80.6% similar) in 937 aa overlap (151-905:152-1088)

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD FDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIASS
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIASS
             130       140       150       160       170       180 

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD FRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDESS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDESS
             190       200       210       220       230       240 

              250       260                                        
pF1KSD DDLCTVQIPTSWRSAFLDSSTLQL------------------------------------
       ::::::::::::::::::::::::                                    
XP_016 DDLCTVQIPTSWRSAFLDSSTLQLFFDLYHSIPPSFSPLVLSCLVQIASVRRSLFNNAER
             250       260       270       280       290       300 

                                                                   
pF1KSD ------------------------------------------------------------
                                                                   
XP_016 AKFLSHLVDGVKRILENPQSLSDPNNYHEFCRLLARLKSNYQLGELVKVENYPEVIRLIA
             310       320       330       340       350       360 

                                                                   
pF1KSD ------------------------------------------------------------
                                                                   
XP_016 NFTVTSLQHWEFAPNSVHYLLSLWQRLAASVPYVKATEPHMLETYTPEVTKAYITSRLES
             370       380       390       400       410       420 

                                    270       280       290        
pF1KSD --------------------------STIGRCEYEKTCALLVQLFDQSAQSYQELLQSAS
                                 ::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VHIILRDGLEDPLEDTGLVQQQLDQLSTIGRCEYEKTCALLVQLFDQSAQSYQELLQSAS
             430       440       450       460       470       480 

      300       310       320       330       340       350        
pF1KSD ASPMDIAVQEGRLTWLVYIIGAVIGGRVSFASTDEQDAMDGELVCRVLQLMNLTDSRLAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ASPMDIAVQEGRLTWLVYIIGAVIGGRVSFASTDEQDAMDGELVCRVLQLMNLTDSRLAQ
             490       500       510       520       530       540 

      360       370       380       390       400       410        
pF1KSD AGNEKLELAMLSFFEQFRKIYIGDQVQKSSKLYRRLSEVLGLNDETMVLSVFIGKIITNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AGNEKLELAMLSFFEQFRKIYIGDQVQKSSKLYRRLSEVLGLNDETMVLSVFIGKIITNL
             550       560       570       580       590       600 

      420       430       440       450       460       470        
pF1KSD KYWGRCEPITSKTLQLLNDLSIGYSSVRKLVKLSAVQFMLNNHTSEHFSFLGINNQSNLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KYWGRCEPITSKTLQLLNDLSIGYSSVRKLVKLSAVQFMLNNHTSEHFSFLGINNQSNLT
             610       620       630       640       650       660 

      480       490       500       510       520       530        
pF1KSD DMRCRTTFYTALGRLLMVDLGEDEDQYEQFMLPLTAAFEAVAQMFSTNSFNEQEAKRTLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DMRCRTTFYTALGRLLMVDLGEDEDQYEQFMLPLTAAFEAVAQMFSTNSFNEQEAKRTLV
             670       680       690       700       710       720 

      540       550       560       570       580       590        
pF1KSD GLVRDLRGIAFAFNAKTSFMMLFEWIYPSYMPILQRAIELWYHDPACTTPVLKLMAELVH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLVRDLRGIAFAFNAKTSFMMLFEWIYPSYMPILQRAIELWYHDPACTTPVLKLMAELVH
             730       740       750       760       770       780 

      600       610       620       630       640       650        
pF1KSD NRSQRLQFDVSSPNGILLFRETSKMITMYGNRILTLGEVPKDQVYALKLKGISICFSMLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NRSQRLQFDVSSPNGILLFRETSKMITMYGNRILTLGEVPKDQVYALKLKGISICFSMLK
             790       800       810       820       830       840 

      660       670       680       690       700       710        
pF1KSD AALSGSYVNFGVFRLYGDDALDNALQTFIKLLLSIPHSDLLDYPKLSQSYYSLLEVLTQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AALSGSYVNFGVFRLYGDDALDNALQTFIKLLLSIPHSDLLDYPKLSQSYYSLLEVLTQD
             850       860       870       880       890       900 

      720       730       740       750       760       770        
pF1KSD HMNFIASLEPHVIMYILSSISEGLTALDTMVCTGCCSCLDHIVTYLFKQLSRSTKKRTTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HMNFIASLEPHVIMYILSSISEGLTALDTMVCTGCCSCLDHIVTYLFKQLSRSTKKRTTP
             910       920       930       940       950       960 

      780       790       800       810       820       830        
pF1KSD LNQESDRFLHIMQQHPEMIQQMLSTVLNIIIFEDCRNQWSMSRPLLGLILLNEKYFSDLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LNQESDRFLHIMQQHPEMIQQMLSTVLNIIIFEDCRNQWSMSRPLLGLILLNEKYFSDLR
             970       980       990      1000      1010      1020 

      840       850       860       870       880       890        
pF1KSD NSIVNSQPPEKQQAMHLCFENLMEGIERNLLTKNRDRFTQNLSAFRREVNDSMKNSTYGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NSIVNSQPPEKQQAMHLCFENLMEGIERNLLTKNRDRFTQNLSAFRREVNDSMKNSTYGV
            1030      1040      1050      1060      1070      1080 

      900     
pF1KSD NSNDMMS
       :::::::
XP_016 NSNDMMS
              

>--
 initn: 932 init1: 932 opt: 932  Z-score: 1149.8  bits: 224.2 E(85289): 2.6e-57
Smith-Waterman score: 932; 99.3% identity (100.0% similar) in 145 aa overlap (6-150:7-151)

                10        20        30        40        50         
pF1KSD  MADHVQSLAQLENLCKQLYETTDTTTRLQAEKALVEFTNSPDCLSKCQLLLERGSSSYS
             .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MRDPGRKSLAQLENLCKQLYETTDTTTRLQAEKALVEFTNSPDCLSKCQLLLERGSSSYS
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KSD QLLAATCLTKLVSRTNNPLPLEQRIDIRNYVLNYLATRPKLATFVTQALIQLYARITKLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QLLAATCLTKLVSRTNNPLPLEQRIDIRNYVLNYLATRPKLATFVTQALIQLYARITKLG
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KSD WFDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIAS
       :::::::::::::::::::::::::::::::                             
XP_016 WFDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIAS
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KSD SFRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDES
                                                                   
XP_016 SFRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDES
              190       200       210       220       230       240

>>XP_016868734 (OMIM: 606140) PREDICTED: exportin-7 isof  (1096 aa)
 initn: 5228 init1: 4183 opt: 4183  Z-score: 5189.8  bits: 971.8 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4456; 79.6% identity (79.6% similar) in 937 aa overlap (160-905:160-1096)

     130       140       150       160                170       180
pF1KSD FRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQ---------ADTTHPLTKHRKIASS
                                     :::::         ::::::::::::::::
XP_016 FRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQVSATAFLIEADTTHPLTKHRKIASS
     130       140       150       160       170       180         

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD FRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDESS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDESS
     190       200       210       220       230       240         

              250       260                                        
pF1KSD DDLCTVQIPTSWRSAFLDSSTLQL------------------------------------
       ::::::::::::::::::::::::                                    
XP_016 DDLCTVQIPTSWRSAFLDSSTLQLFFDLYHSIPPSFSPLVLSCLVQIASVRRSLFNNAER
     250       260       270       280       290       300         

                                                                   
pF1KSD ------------------------------------------------------------
                                                                   
XP_016 AKFLSHLVDGVKRILENPQSLSDPNNYHEFCRLLARLKSNYQLGELVKVENYPEVIRLIA
     310       320       330       340       350       360         

                                                                   
pF1KSD ------------------------------------------------------------
                                                                   
XP_016 NFTVTSLQHWEFAPNSVHYLLSLWQRLAASVPYVKATEPHMLETYTPEVTKAYITSRLES
     370       380       390       400       410       420         

                                    270       280       290        
pF1KSD --------------------------STIGRCEYEKTCALLVQLFDQSAQSYQELLQSAS
                                 ::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VHIILRDGLEDPLEDTGLVQQQLDQLSTIGRCEYEKTCALLVQLFDQSAQSYQELLQSAS
     430       440       450       460       470       480         

      300       310       320       330       340       350        
pF1KSD ASPMDIAVQEGRLTWLVYIIGAVIGGRVSFASTDEQDAMDGELVCRVLQLMNLTDSRLAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ASPMDIAVQEGRLTWLVYIIGAVIGGRVSFASTDEQDAMDGELVCRVLQLMNLTDSRLAQ
     490       500       510       520       530       540         

      360       370       380       390       400       410        
pF1KSD AGNEKLELAMLSFFEQFRKIYIGDQVQKSSKLYRRLSEVLGLNDETMVLSVFIGKIITNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AGNEKLELAMLSFFEQFRKIYIGDQVQKSSKLYRRLSEVLGLNDETMVLSVFIGKIITNL
     550       560       570       580       590       600         

      420       430       440       450       460       470        
pF1KSD KYWGRCEPITSKTLQLLNDLSIGYSSVRKLVKLSAVQFMLNNHTSEHFSFLGINNQSNLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KYWGRCEPITSKTLQLLNDLSIGYSSVRKLVKLSAVQFMLNNHTSEHFSFLGINNQSNLT
     610       620       630       640       650       660         

      480       490       500       510       520       530        
pF1KSD DMRCRTTFYTALGRLLMVDLGEDEDQYEQFMLPLTAAFEAVAQMFSTNSFNEQEAKRTLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DMRCRTTFYTALGRLLMVDLGEDEDQYEQFMLPLTAAFEAVAQMFSTNSFNEQEAKRTLV
     670       680       690       700       710       720         

      540       550       560       570       580       590        
pF1KSD GLVRDLRGIAFAFNAKTSFMMLFEWIYPSYMPILQRAIELWYHDPACTTPVLKLMAELVH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLVRDLRGIAFAFNAKTSFMMLFEWIYPSYMPILQRAIELWYHDPACTTPVLKLMAELVH
     730       740       750       760       770       780         

      600       610       620       630       640       650        
pF1KSD NRSQRLQFDVSSPNGILLFRETSKMITMYGNRILTLGEVPKDQVYALKLKGISICFSMLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NRSQRLQFDVSSPNGILLFRETSKMITMYGNRILTLGEVPKDQVYALKLKGISICFSMLK
     790       800       810       820       830       840         

      660       670       680       690       700       710        
pF1KSD AALSGSYVNFGVFRLYGDDALDNALQTFIKLLLSIPHSDLLDYPKLSQSYYSLLEVLTQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AALSGSYVNFGVFRLYGDDALDNALQTFIKLLLSIPHSDLLDYPKLSQSYYSLLEVLTQD
     850       860       870       880       890       900         

      720       730       740       750       760       770        
pF1KSD HMNFIASLEPHVIMYILSSISEGLTALDTMVCTGCCSCLDHIVTYLFKQLSRSTKKRTTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HMNFIASLEPHVIMYILSSISEGLTALDTMVCTGCCSCLDHIVTYLFKQLSRSTKKRTTP
     910       920       930       940       950       960         

      780       790       800       810       820       830        
pF1KSD LNQESDRFLHIMQQHPEMIQQMLSTVLNIIIFEDCRNQWSMSRPLLGLILLNEKYFSDLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LNQESDRFLHIMQQHPEMIQQMLSTVLNIIIFEDCRNQWSMSRPLLGLILLNEKYFSDLR
     970       980       990      1000      1010      1020         

      840       850       860       870       880       890        
pF1KSD NSIVNSQPPEKQQAMHLCFENLMEGIERNLLTKNRDRFTQNLSAFRREVNDSMKNSTYGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NSIVNSQPPEKQQAMHLCFENLMEGIERNLLTKNRDRFTQNLSAFRREVNDSMKNSTYGV
    1030      1040      1050      1060      1070      1080         

      900     
pF1KSD NSNDMMS
       :::::::
XP_016 NSNDMMS
    1090      

>--
 initn: 1022 init1: 1022 opt: 1022  Z-score: 1261.6  bits: 244.9 E(85289): 1.6e-63
Smith-Waterman score: 1022; 100.0% identity (100.0% similar) in 159 aa overlap (1-159:1-159)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MADHVQSLAQLENLCKQLYETTDTTTRLQAEKALVEFTNSPDCLSKCQLLLERGSSSYSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MADHVQSLAQLENLCKQLYETTDTTTRLQAEKALVEFTNSPDCLSKCQLLLERGSSSYSQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD LLAATCLTKLVSRTNNPLPLEQRIDIRNYVLNYLATRPKLATFVTQALIQLYARITKLGW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LLAATCLTKLVSRTNNPLPLEQRIDIRNYVLNYLATRPKLATFVTQALIQLYARITKLGW
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD FDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIASS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                     
XP_016 FDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQVSATAFLIEADTTHPL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD FRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDESS
                                                                   
XP_016 TKHRKIASSFRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDF
              190       200       210       220       230       240

>>XP_016868733 (OMIM: 606140) PREDICTED: exportin-7 isof  (1097 aa)
 initn: 5188 init1: 4183 opt: 4183  Z-score: 5189.8  bits: 971.8 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4456; 79.6% identity (79.6% similar) in 937 aa overlap (160-905:161-1097)

     130       140       150       160                170       180
pF1KSD FRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQ---------ADTTHPLTKHRKIASS
                                     :::::         ::::::::::::::::
XP_016 FRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQVSATAFLIEADTTHPLTKHRKIASS
              140       150       160       170       180       190

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD FRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDESS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDESS
              200       210       220       230       240       250

              250       260                                        
pF1KSD DDLCTVQIPTSWRSAFLDSSTLQL------------------------------------
       ::::::::::::::::::::::::                                    
XP_016 DDLCTVQIPTSWRSAFLDSSTLQLFFDLYHSIPPSFSPLVLSCLVQIASVRRSLFNNAER
              260       270       280       290       300       310

                                                                   
pF1KSD ------------------------------------------------------------
                                                                   
XP_016 AKFLSHLVDGVKRILENPQSLSDPNNYHEFCRLLARLKSNYQLGELVKVENYPEVIRLIA
              320       330       340       350       360       370

                                                                   
pF1KSD ------------------------------------------------------------
                                                                   
XP_016 NFTVTSLQHWEFAPNSVHYLLSLWQRLAASVPYVKATEPHMLETYTPEVTKAYITSRLES
              380       390       400       410       420       430

                                    270       280       290        
pF1KSD --------------------------STIGRCEYEKTCALLVQLFDQSAQSYQELLQSAS
                                 ::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VHIILRDGLEDPLEDTGLVQQQLDQLSTIGRCEYEKTCALLVQLFDQSAQSYQELLQSAS
              440       450       460       470       480       490

      300       310       320       330       340       350        
pF1KSD ASPMDIAVQEGRLTWLVYIIGAVIGGRVSFASTDEQDAMDGELVCRVLQLMNLTDSRLAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ASPMDIAVQEGRLTWLVYIIGAVIGGRVSFASTDEQDAMDGELVCRVLQLMNLTDSRLAQ
              500       510       520       530       540       550

      360       370       380       390       400       410        
pF1KSD AGNEKLELAMLSFFEQFRKIYIGDQVQKSSKLYRRLSEVLGLNDETMVLSVFIGKIITNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AGNEKLELAMLSFFEQFRKIYIGDQVQKSSKLYRRLSEVLGLNDETMVLSVFIGKIITNL
              560       570       580       590       600       610

      420       430       440       450       460       470        
pF1KSD KYWGRCEPITSKTLQLLNDLSIGYSSVRKLVKLSAVQFMLNNHTSEHFSFLGINNQSNLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KYWGRCEPITSKTLQLLNDLSIGYSSVRKLVKLSAVQFMLNNHTSEHFSFLGINNQSNLT
              620       630       640       650       660       670

      480       490       500       510       520       530        
pF1KSD DMRCRTTFYTALGRLLMVDLGEDEDQYEQFMLPLTAAFEAVAQMFSTNSFNEQEAKRTLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DMRCRTTFYTALGRLLMVDLGEDEDQYEQFMLPLTAAFEAVAQMFSTNSFNEQEAKRTLV
              680       690       700       710       720       730

      540       550       560       570       580       590        
pF1KSD GLVRDLRGIAFAFNAKTSFMMLFEWIYPSYMPILQRAIELWYHDPACTTPVLKLMAELVH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLVRDLRGIAFAFNAKTSFMMLFEWIYPSYMPILQRAIELWYHDPACTTPVLKLMAELVH
              740       750       760       770       780       790

      600       610       620       630       640       650        
pF1KSD NRSQRLQFDVSSPNGILLFRETSKMITMYGNRILTLGEVPKDQVYALKLKGISICFSMLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NRSQRLQFDVSSPNGILLFRETSKMITMYGNRILTLGEVPKDQVYALKLKGISICFSMLK
              800       810       820       830       840       850

      660       670       680       690       700       710        
pF1KSD AALSGSYVNFGVFRLYGDDALDNALQTFIKLLLSIPHSDLLDYPKLSQSYYSLLEVLTQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AALSGSYVNFGVFRLYGDDALDNALQTFIKLLLSIPHSDLLDYPKLSQSYYSLLEVLTQD
              860       870       880       890       900       910

      720       730       740       750       760       770        
pF1KSD HMNFIASLEPHVIMYILSSISEGLTALDTMVCTGCCSCLDHIVTYLFKQLSRSTKKRTTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HMNFIASLEPHVIMYILSSISEGLTALDTMVCTGCCSCLDHIVTYLFKQLSRSTKKRTTP
              920       930       940       950       960       970

      780       790       800       810       820       830        
pF1KSD LNQESDRFLHIMQQHPEMIQQMLSTVLNIIIFEDCRNQWSMSRPLLGLILLNEKYFSDLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LNQESDRFLHIMQQHPEMIQQMLSTVLNIIIFEDCRNQWSMSRPLLGLILLNEKYFSDLR
              980       990      1000      1010      1020      1030

      840       850       860       870       880       890        
pF1KSD NSIVNSQPPEKQQAMHLCFENLMEGIERNLLTKNRDRFTQNLSAFRREVNDSMKNSTYGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NSIVNSQPPEKQQAMHLCFENLMEGIERNLLTKNRDRFTQNLSAFRREVNDSMKNSTYGV
             1040      1050      1060      1070      1080      1090

      900     
pF1KSD NSNDMMS
       :::::::
XP_016 NSNDMMS
              

>--
 initn: 982 init1: 982 opt: 982  Z-score: 1211.9  bits: 235.7 E(85289): 9.2e-61
Smith-Waterman score: 982; 99.4% identity (100.0% similar) in 154 aa overlap (6-159:7-160)

                10        20        30        40        50         
pF1KSD  MADHVQSLAQLENLCKQLYETTDTTTRLQAEKALVEFTNSPDCLSKCQLLLERGSSSYS
             .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MRDPGRKSLAQLENLCKQLYETTDTTTRLQAEKALVEFTNSPDCLSKCQLLLERGSSSYS
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KSD QLLAATCLTKLVSRTNNPLPLEQRIDIRNYVLNYLATRPKLATFVTQALIQLYARITKLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QLLAATCLTKLVSRTNNPLPLEQRIDIRNYVLNYLATRPKLATFVTQALIQLYARITKLG
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KSD WFDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                    
XP_016 WFDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQVSATAFLIEADTTHP
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KSD SFRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDES
                                                                   
XP_016 LTKHRKIASSFRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFD
              190       200       210       220       230       240

>>XP_016865229 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding pro  (999 aa)
 initn: 2535 init1: 1209 opt: 2913  Z-score: 3612.2  bits: 679.7 E(85289): 1.8e-194
Smith-Waterman score: 3622; 58.7% identity (80.6% similar) in 941 aa overlap (61-905:61-999)

               40        50        60        70        80        90
pF1KSD EKALVEFTNSPDCLSKCQLLLERGSSSYSQLLAATCLTKLVSRTNNPLPLEQRIDIRNYV
                                     :::::::.:::::.. :::.:::.:::::.
XP_016 EKALLELIDSPECLSKCQLLLEQGTTSYAQLLAATCLSKLVSRVS-PLPVEQRMDIRNYI
               40        50        60        70         80         

              100       110       120       130       140       150
pF1KSD LNYLATRPKLATFVTQALIQLYARITKLGWFDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCII
       :::.:..:::: :: :::::. :.:::::::. :::..:::. :.:: .::: .::.:::
XP_016 LNYVASQPKLAPFVIQALIQVIAKITKLGWFEVQKDQFVFREIIADVKKFLQGTVEHCII
      90       100       110       120       130       140         

              160       170       180       190       200       210
pF1KSD GVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIASSFRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDE
       :: :::.::.:.: .: ..: .::::::.::::.:: :...:.:.:::.. .: :::.:.
XP_016 GVIILSELTQEMNLVDYSRPSAKHRKIATSFRDTSLKDVLVLACSLLKEVFAKPLNLQDQ
     150       160       170       180       190       200         

              220       230       240       250       260          
pF1KSD SQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDESSDDLCTVQIPTSWRSAFLDSSTL--------
        :..:.::.:::. :::::::::.:.:::.::::::::::.::. ::.  ::        
XP_016 CQQNLVMQVLKLVLNCLNFDFIGSSADESADDLCTVQIPTTWRTIFLEPETLDLFFNLYH
     210       220       230       240       250       260         

                                                                   
pF1KSD ------------------------------------------------------------
                                                                   
XP_016 SLPPLLSQLHWEFAPNSVHYLLTLWQRMVASVPFVKSTEPHLLDTYAPEITKAFITSRLD
     270       280       290       300       310       320         

                                     270       280       290       
pF1KSD -------------------------QLSTIGRCEYEKTCALLVQLFDQSAQSYQELLQSA
                                :: :..:::::::::::::::::.::.::.::.  
XP_016 SVAIVVRDHLDDPLDDTATVFQQLEQLCTVSRCEYEKTCALLVQLFDQNAQNYQKLLHPY
     330       340       350       360       370       380         

       300       310       320       330       340       350       
pF1KSD SASPMDIAVQEGRLTWLVYIIGAVIGGRVSFASTDEQDAMDGELVCRVLQLMNLTDSRLA
       :.  .::..:::::.::::..:.:.:::....::::.::::::: :::.::..: :. : 
XP_016 SGVTVDITIQEGRLAWLVYLVGTVVGGRLTYTSTDEHDAMDGELSCRVFQLISLMDTGLP
     390       400       410       420       430       440         

       360       370       380       390       400       410       
pF1KSD QAGNEKLELAMLSFFEQFRKIYIGDQVQKSSKLYRRLSEVLGLNDETMVLSVFIGKIITN
       .  :::.:::.: :..:::: :.:::.:..::.: :.:::::..:.. :: .:. ::.::
XP_016 RCCNEKIELAILWFLDQFRKTYVGDQLQRTSKVYARMSEVLGITDDNHVLETFMTKIVTN
     450       460       470       480       490       500         

       420       430       440       450       460       470       
pF1KSD LKYWGRCEPITSKTLQLLNDLSIGYSSVRKLVKLSAVQFMLNNHTSEHFSFLGINNQSNL
       :::::: ::. :.:::.:::::.::  ..::::..::.:::.::::::: ::::... .:
XP_016 LKYWGRYEPVISRTLQFLNDLSVGYILLKKLVKIDAVKFMLKNHTSEHFPFLGISDNHSL
     510       520       530       540       550       560         

       480       490       500       510       520       530       
pF1KSD TDMRCRTTFYTALGRLLMVDLGEDEDQYEQFMLPLTAAFEAVAQMFSTNSFNEQEAKRTL
       .:.:::::::::: ::::::::::::..:.::::::.:::.: :.:. :.:.....:: :
XP_016 SDFRCRTTFYTALTRLLMVDLGEDEDEFENFMLPLTVAFETVLQIFN-NNFKQEDVKRML
     570       580       590       600       610        620        

       540       550       560       570       580       590       
pF1KSD VGLVRDLRGIAFAFNAKTSFMMLFEWIYPSYMPILQRAIELWYHDPACTTPVLKLMAELV
       .::.:::::::::.:.:::. :::.:.::.:.:.:: :.: :: .:.::::.:::::::.
XP_016 IGLARDLRGIAFALNTKTSYTMLFDWMYPTYLPLLQNAVERWYGEPTCTTPILKLMAELM
      630       640       650       660       670       680        

       600       610       620       630       640       650       
pF1KSD HNRSQRLQFDVSSPNGILLFRETSKMITMYGNRILTLGEVPKDQVYALKLKGISICFSML
       .::::::.::::::::::::::.:::.  :::.::.:: . :::.: .::::::::.: :
XP_016 QNRSQRLNFDVSSPNGILLFREASKMVCTYGNQILSLGSLSKDQIYPMKLKGISICYSAL
      690       700       710       720       730       740        

       660       670       680       690       700       710       
pF1KSD KAALSGSYVNFGVFRLYGDDALDNALQTFIKLLLSIPHSDLLDYPKLSQSYYSLLEVLTQ
       :.:: :.::.::::.::::. .::.::.:.:.:::. :::::.: ::::::: ::: :::
XP_016 KSALCGNYVSFGVFKLYGDNHFDNVLQAFVKMLLSVSHSDLLQYRKLSQSYYPLLECLTQ
      750       760       770       780       790       800        

       720       730       740       750       760       770       
pF1KSD DHMNFIASLEPHVIMYILSSISEGLTALDTMVCTGCCSCLDHIVTYLFKQLSRSTKK--R
       :::.:: .::: :.::.:.:::::::.:::.: ..::. ::.:::::::....  ::  :
XP_016 DHMSFIINLEPPVLMYVLTSISEGLTTLDTVVSSSCCTSLDYIVTYLFKHIAKEGKKPLR
      810       820       830       840       850       860        

         780       790       800       810       820       830     
pF1KSD TTPLNQESDRFLHIMQQHPEMIQQMLSTVLNIIIFEDCRNQWSMSRPLLGLILLNEKYFS
           .: ..:.::.:::.:...:::.:...: :.:::::::::.::::::::::::::::
XP_016 CREATQAGQRLLHFMQQNPDVLQQMMSVLMNTIVFEDCRNQWSVSRPLLGLILLNEKYFS
      870       880       890       900       910       920        

         840       850       860       870       880       890     
pF1KSD DLRNSIVNSQPPEKQQAMHLCFENLMEGIERNLLTKNRDRFTQNLSAFRREVNDSMK-NS
       .:: :..::::  ::...  ::.:::::.:.:: .:::::::::::.:::.: .... ..
XP_016 ELRASLINSQPLPKQEVLAQCFRNLMEGVEQNLSVKNRDRFTQNLSVFRRDVAEALRSDG
      930       940       950       960       970       980        

          900     
pF1KSD TYGVNSNDMMS
       .    : ::::
XP_016 NTEPCSLDMMS
      990         

>--
 initn: 258 init1: 258 opt: 258  Z-score: 312.7  bits: 69.2 E(85289): 1.1e-10
Smith-Waterman score: 258; 65.0% identity (85.0% similar) in 60 aa overlap (1-60:1-60)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MADHVQSLAQLENLCKQLYETTDTTTRLQAEKALVEFTNSPDCLSKCQLLLERGSSSYSQ
       :: : ::::.:: :: .::  :: : :..:::::.:. .::.::::::::::.:..::.:
XP_016 MALHFQSLAELEVLCTHLYIGTDLTQRIEAEKALLELIDSPECLSKCQLLLEQGTTSYAQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD LLAATCLTKLVSRTNNPLPLEQRIDIRNYVLNYLATRPKLATFVTQALIQLYARITKLGW
                                                                   
XP_016 LLAATCLSKLVSRVSPLPVEQRMDIRNYILNYVASQPKLAPFVIQALIQVIAKITKLGWF
               70        80        90       100       110       120

>>XP_016865228 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding pro  (1039 aa)
 initn: 2535 init1: 1209 opt: 2913  Z-score: 3611.9  bits: 679.8 E(85289): 1.9e-194
Smith-Waterman score: 3339; 55.5% identity (76.5% similar) in 939 aa overlap (103-905:102-1039)

             80        90       100       110       120       130  
pF1KSD RTNNPLPLEQRIDIRNYVLNYLATRPKLATFVTQALIQLYARITKLGWFDCQKDDYVFRN
                                     :: :::::. :.:::::::. :::..:::.
XP_016 SRVSPLPVEQRMDIRNYILNYVASQPKLAPFVIQALIQVIAKITKLGWFEVQKDQFVFRE
              80        90       100       110       120       130 

            140       150       160       170       180       190  
pF1KSD AITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIASSFRDSSLFDIFTL
        :.:: .::: .::.::::: :::.::.:.: .: ..: .::::::.::::.:: :...:
XP_016 IIADVKKFLQGTVEHCIIGVIILSELTQEMNLVDYSRPSAKHRKIATSFRDTSLKDVLVL
             140       150       160       170       180       190 

            200       210       220       230       240       250  
pF1KSD SCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDESSDDLCTVQIPTSW
       .:.:::.. .: :::.:. :..:.::.:::. :::::::::.:.:::.::::::::::.:
XP_016 ACSLLKEVFAKPLNLQDQCQQNLVMQVLKLVLNCLNFDFIGSSADESADDLCTVQIPTTW
             200       210       220       230       240       250 

            260                                                    
pF1KSD RSAFLDSSTL--------------------------------------------------
       :. ::.  ::                                                  
XP_016 RTIFLEPETLDLFFNLYHSLPPLLSQLALSCLVQFASTRRSLFNSPERAKYLGNLIKGVK
             260       270       280       290       300       310 

                                                                   
pF1KSD ------------------------------------------------------------
                                                                   
XP_016 RILENPQHWEFAPNSVHYLLTLWQRMVASVPFVKSTEPHLLDTYAPEITKAFITSRLDSV
             320       330       340       350       360       370 

                                   270       280       290         
pF1KSD -----------------------QLSTIGRCEYEKTCALLVQLFDQSAQSYQELLQSASA
                              :: :..:::::::::::::::::.::.::.::.  :.
XP_016 AIVVRDHLDDPLDDTATVFQQLEQLCTVSRCEYEKTCALLVQLFDQNAQNYQKLLHPYSG
             380       390       400       410       420       430 

     300       310       320       330       340       350         
pF1KSD SPMDIAVQEGRLTWLVYIIGAVIGGRVSFASTDEQDAMDGELVCRVLQLMNLTDSRLAQA
         .::..:::::.::::..:.:.:::....::::.::::::: :::.::..: :. : . 
XP_016 VTVDITIQEGRLAWLVYLVGTVVGGRLTYTSTDEHDAMDGELSCRVFQLISLMDTGLPRC
             440       450       460       470       480       490 

     360       370       380       390       400       410         
pF1KSD GNEKLELAMLSFFEQFRKIYIGDQVQKSSKLYRRLSEVLGLNDETMVLSVFIGKIITNLK
        :::.:::.: :..:::: :.:::.:..::.: :.:::::..:.. :: .:. ::.::::
XP_016 CNEKIELAILWFLDQFRKTYVGDQLQRTSKVYARMSEVLGITDDNHVLETFMTKIVTNLK
             500       510       520       530       540       550 

     420       430       440       450       460       470         
pF1KSD YWGRCEPITSKTLQLLNDLSIGYSSVRKLVKLSAVQFMLNNHTSEHFSFLGINNQSNLTD
       :::: ::. :.:::.:::::.::  ..::::..::.:::.::::::: ::::... .:.:
XP_016 YWGRYEPVISRTLQFLNDLSVGYILLKKLVKIDAVKFMLKNHTSEHFPFLGISDNHSLSD
             560       570       580       590       600       610 

     480       490       500       510       520       530         
pF1KSD MRCRTTFYTALGRLLMVDLGEDEDQYEQFMLPLTAAFEAVAQMFSTNSFNEQEAKRTLVG
       .:::::::::: ::::::::::::..:.::::::.:::.: :.:. :.:.....:: :.:
XP_016 FRCRTTFYTALTRLLMVDLGEDEDEFENFMLPLTVAFETVLQIFN-NNFKQEDVKRMLIG
             620       630       640       650        660       670

     540       550       560       570       580       590         
pF1KSD LVRDLRGIAFAFNAKTSFMMLFEWIYPSYMPILQRAIELWYHDPACTTPVLKLMAELVHN
       :.:::::::::.:.:::. :::.:.::.:.:.:: :.: :: .:.::::.:::::::..:
XP_016 LARDLRGIAFALNTKTSYTMLFDWMYPTYLPLLQNAVERWYGEPTCTTPILKLMAELMQN
              680       690       700       710       720       730

     600       610       620       630       640       650         
pF1KSD RSQRLQFDVSSPNGILLFRETSKMITMYGNRILTLGEVPKDQVYALKLKGISICFSMLKA
       :::::.::::::::::::::.:::.  :::.::.:: . :::.: .::::::::.: ::.
XP_016 RSQRLNFDVSSPNGILLFREASKMVCTYGNQILSLGSLSKDQIYPMKLKGISICYSALKS
              740       750       760       770       780       790

     660       670       680       690       700       710         
pF1KSD ALSGSYVNFGVFRLYGDDALDNALQTFIKLLLSIPHSDLLDYPKLSQSYYSLLEVLTQDH
       :: :.::.::::.::::. .::.::.:.:.:::. :::::.: ::::::: ::: :::::
XP_016 ALCGNYVSFGVFKLYGDNHFDNVLQAFVKMLLSVSHSDLLQYRKLSQSYYPLLECLTQDH
              800       810       820       830       840       850

     720       730       740       750       760       770         
pF1KSD MNFIASLEPHVIMYILSSISEGLTALDTMVCTGCCSCLDHIVTYLFKQLSRSTKK--RTT
       :.:: .::: :.::.:.:::::::.:::.: ..::. ::.:::::::....  ::  :  
XP_016 MSFIINLEPPVLMYVLTSISEGLTTLDTVVSSSCCTSLDYIVTYLFKHIAKEGKKPLRCR
              860       870       880       890       900       910

       780       790       800       810       820       830       
pF1KSD PLNQESDRFLHIMQQHPEMIQQMLSTVLNIIIFEDCRNQWSMSRPLLGLILLNEKYFSDL
         .: ..:.::.:::.:...:::.:...: :.:::::::::.::::::::::::::::.:
XP_016 EATQAGQRLLHFMQQNPDVLQQMMSVLMNTIVFEDCRNQWSVSRPLLGLILLNEKYFSEL
              920       930       940       950       960       970

       840       850       860       870       880       890       
pF1KSD RNSIVNSQPPEKQQAMHLCFENLMEGIERNLLTKNRDRFTQNLSAFRREVNDSMK-NSTY
       : :..::::  ::...  ::.:::::.:.:: .:::::::::::.:::.: .... ... 
XP_016 RASLINSQPLPKQEVLAQCFRNLMEGVEQNLSVKNRDRFTQNLSVFRRDVAEALRSDGNT
              980       990      1000      1010      1020      1030

        900     
pF1KSD GVNSNDMMS
          : ::::
XP_016 EPCSLDMMS
                

>--
 initn: 476 init1: 332 opt: 462  Z-score: 566.0  bits: 116.2 E(85289): 8.7e-25
Smith-Waterman score: 462; 69.3% identity (90.1% similar) in 101 aa overlap (1-101:1-100)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MADHVQSLAQLENLCKQLYETTDTTTRLQAEKALVEFTNSPDCLSKCQLLLERGSSSYSQ
       :: : ::::.:: :: .::  :: : :..:::::.:. .::.::::::::::.:..::.:
XP_016 MALHFQSLAELEVLCTHLYIGTDLTQRIEAEKALLELIDSPECLSKCQLLLEQGTTSYAQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD LLAATCLTKLVSRTNNPLPLEQRIDIRNYVLNYLATRPKLATFVTQALIQLYARITKLGW
       :::::::.:::::.. :::.:::.:::::.:::.:..::::                   
XP_016 LLAATCLSKLVSRVS-PLPVEQRMDIRNYILNYVASQPKLAPFVIQALIQVIAKITKLGW
               70         80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD FDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIASS
                                                                   
XP_016 FEVQKDQFVFREIIADVKKFLQGTVEHCIIGVIILSELTQEMNLVDYSRPSAKHRKIATS
     120       130       140       150       160       170         

>>NP_075048 (OMIM: 606141) ran-binding protein 17 [Homo   (1088 aa)
 initn: 2535 init1: 1209 opt: 2913  Z-score: 3611.6  bits: 679.8 E(85289): 2e-194
Smith-Waterman score: 3018; 52.0% identity (71.9% similar) in 940 aa overlap (151-905:150-1088)

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD FDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIASS
                                     :: :::.::.:.: .: ..: .::::::.:
NP_075 FEVQKDQFVFREIIADVKKFLQGTVEHCIIGVIILSELTQEMNLVDYSRPSAKHRKIATS
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD FRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDESS
       :::.:: :...:.:.:::.. .: :::.:. :..:.::.:::. :::::::::.:.:::.
NP_075 FRDTSLKDVLVLACSLLKEVFAKPLNLQDQCQQNLVMQVLKLVLNCLNFDFIGSSADESA
     180       190       200       210       220       230         

              250       260                                        
pF1KSD DDLCTVQIPTSWRSAFLDSSTL--------------------------------------
       ::::::::::.::. ::.  ::                                      
NP_075 DDLCTVQIPTTWRTIFLEPETLDLFFNLYHSLPPLLSQLALSCLVQFASTRRSLFNSPER
     240       250       260       270       280       290         

                                                                   
pF1KSD ------------------------------------------------------------
                                                                   
NP_075 AKYLGNLIKGVKRILENPQGLSDPGNYHEFCRFLARLKTNYQLGELVMVKEYPEVIRLIA
     300       310       320       330       340       350         

                                                                   
pF1KSD ------------------------------------------------------------
                                                                   
NP_075 NFTITSLQHWEFAPNSVHYLLTLWQRMVASVPFVKSTEPHLLDTYAPEITKAFITSRLDS
     360       370       380       390       400       410         

                                    270       280       290        
pF1KSD ------------------------QLSTIGRCEYEKTCALLVQLFDQSAQSYQELLQSAS
                               :: :..:::::::::::::::::.::.::.::.  :
NP_075 VAIVVRDHLDDPLDDTATVFQQLEQLCTVSRCEYEKTCALLVQLFDQNAQNYQKLLHPYS
     420       430       440       450       460       470         

      300       310       320       330       340       350        
pF1KSD ASPMDIAVQEGRLTWLVYIIGAVIGGRVSFASTDEQDAMDGELVCRVLQLMNLTDSRLAQ
       .  .::..:::::.::::..:.:.:::....::::.::::::: :::.::..: :. : .
NP_075 GVTVDITIQEGRLAWLVYLVGTVVGGRLTYTSTDEHDAMDGELSCRVFQLISLMDTGLPR
     480       490       500       510       520       530         

      360       370       380       390       400       410        
pF1KSD AGNEKLELAMLSFFEQFRKIYIGDQVQKSSKLYRRLSEVLGLNDETMVLSVFIGKIITNL
         :::.:::.: :..:::: :.:::.:..::.: :.:::::..:.. :: .:. ::.:::
NP_075 CCNEKIELAILWFLDQFRKTYVGDQLQRTSKVYARMSEVLGITDDNHVLETFMTKIVTNL
     540       550       560       570       580       590         

      420       430       440       450       460       470        
pF1KSD KYWGRCEPITSKTLQLLNDLSIGYSSVRKLVKLSAVQFMLNNHTSEHFSFLGINNQSNLT
       ::::: ::. :.:::.:::::.::  ..::::..::.:::.::::::: ::::... .:.
NP_075 KYWGRYEPVISRTLQFLNDLSVGYILLKKLVKIDAVKFMLKNHTSEHFPFLGISDNHSLS
     600       610       620       630       640       650         

      480       490       500       510       520       530        
pF1KSD DMRCRTTFYTALGRLLMVDLGEDEDQYEQFMLPLTAAFEAVAQMFSTNSFNEQEAKRTLV
       :.:::::::::: ::::::::::::..:.::::::.:::.: :.:. :.:.....:: :.
NP_075 DFRCRTTFYTALTRLLMVDLGEDEDEFENFMLPLTVAFETVLQIFN-NNFKQEDVKRMLI
     660       670       680       690       700        710        

      540       550       560       570       580       590        
pF1KSD GLVRDLRGIAFAFNAKTSFMMLFEWIYPSYMPILQRAIELWYHDPACTTPVLKLMAELVH
       ::.:::::::::.:.:::. :::.:.::.:.:.:: :.: :: .:.::::.:::::::..
NP_075 GLARDLRGIAFALNTKTSYTMLFDWMYPTYLPLLQNAVERWYGEPTCTTPILKLMAELMQ
      720       730       740       750       760       770        

      600       610       620       630       640       650        
pF1KSD NRSQRLQFDVSSPNGILLFRETSKMITMYGNRILTLGEVPKDQVYALKLKGISICFSMLK
       ::::::.::::::::::::::.:::.  :::.::.:: . :::.: .::::::::.: ::
NP_075 NRSQRLNFDVSSPNGILLFREASKMVCTYGNQILSLGSLSKDQIYPMKLKGISICYSALK
      780       790       800       810       820       830        

      660       670       680       690       700       710        
pF1KSD AALSGSYVNFGVFRLYGDDALDNALQTFIKLLLSIPHSDLLDYPKLSQSYYSLLEVLTQD
       .:: :.::.::::.::::. .::.::.:.:.:::. :::::.: ::::::: ::: ::::
NP_075 SALCGNYVSFGVFKLYGDNHFDNVLQAFVKMLLSVSHSDLLQYRKLSQSYYPLLECLTQD
      840       850       860       870       880       890        

      720       730       740       750       760       770        
pF1KSD HMNFIASLEPHVIMYILSSISEGLTALDTMVCTGCCSCLDHIVTYLFKQLSRSTKK--RT
       ::.:: .::: :.::.:.:::::::.:::.: ..::. ::.:::::::....  ::  : 
NP_075 HMSFIINLEPPVLMYVLTSISEGLTTLDTVVSSSCCTSLDYIVTYLFKHIAKEGKKPLRC
      900       910       920       930       940       950        

        780       790       800       810       820       830      
pF1KSD TPLNQESDRFLHIMQQHPEMIQQMLSTVLNIIIFEDCRNQWSMSRPLLGLILLNEKYFSD
          .: ..:.::.:::.:...:::.:...: :.:::::::::.::::::::::::::::.
NP_075 REATQAGQRLLHFMQQNPDVLQQMMSVLMNTIVFEDCRNQWSVSRPLLGLILLNEKYFSE
      960       970       980       990      1000      1010        

        840       850       860       870       880       890      
pF1KSD LRNSIVNSQPPEKQQAMHLCFENLMEGIERNLLTKNRDRFTQNLSAFRREVNDSMK-NST
       :: :..::::  ::...  ::.:::::.:.:: .:::::::::::.:::.: .... ...
NP_075 LRASLINSQPLPKQEVLAQCFRNLMEGVEQNLSVKNRDRFTQNLSVFRRDVAEALRSDGN
     1020      1030      1040      1050      1060      1070        

         900     
pF1KSD YGVNSNDMMS
           : ::::
NP_075 TEPCSLDMMS
     1080        

>--
 initn: 698 init1: 365 opt: 684  Z-score: 841.6  bits: 167.2 E(85289): 3.9e-40
Smith-Waterman score: 684; 68.0% identity (88.7% similar) in 150 aa overlap (1-150:1-149)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MADHVQSLAQLENLCKQLYETTDTTTRLQAEKALVEFTNSPDCLSKCQLLLERGSSSYSQ
       :: : ::::.:: :: .::  :: : :..:::::.:. .::.::::::::::.:..::.:
NP_075 MALHFQSLAELEVLCTHLYIGTDLTQRIEAEKALLELIDSPECLSKCQLLLEQGTTSYAQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD LLAATCLTKLVSRTNNPLPLEQRIDIRNYVLNYLATRPKLATFVTQALIQLYARITKLGW
       :::::::.:::::.. :::.:::.:::::.:::.:..:::: :: :::::. :.::::::
NP_075 LLAATCLSKLVSRVS-PLPVEQRMDIRNYILNYVASQPKLAPFVIQALIQVIAKITKLGW
               70         80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD FDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIASS
       :. :::..:::. :.:: .::: .::.:::                              
NP_075 FEVQKDQFVFREIIADVKKFLQGTVEHCIIGVIILSELTQEMNLVDYSRPSAKHRKIATS
     120       130       140       150       160       170         

>>XP_011532933 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding pro  (1090 aa)
 initn: 2829 init1: 1209 opt: 2913  Z-score: 3611.6  bits: 679.8 E(85289): 2e-194
Smith-Waterman score: 3018; 52.0% identity (71.9% similar) in 940 aa overlap (151-905:152-1090)

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD FDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIASS
                                     :: :::.::.:.: .: ..: .::::::.:
XP_011 FEVQKDQFVFREIIADVKKFLQGTVEHCIIGVIILSELTQEMNLVDYSRPSAKHRKIATS
             130       140       150       160       170       180 

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD FRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDESS
       :::.:: :...:.:.:::.. .: :::.:. :..:.::.:::. :::::::::.:.:::.
XP_011 FRDTSLKDVLVLACSLLKEVFAKPLNLQDQCQQNLVMQVLKLVLNCLNFDFIGSSADESA
             190       200       210       220       230       240 

              250       260                                        
pF1KSD DDLCTVQIPTSWRSAFLDSSTL--------------------------------------
       ::::::::::.::. ::.  ::                                      
XP_011 DDLCTVQIPTTWRTIFLEPETLDLFFNLYHSLPPLLSQLALSCLVQFASTRRSLFNSPER
             250       260       270       280       290       300 

                                                                   
pF1KSD ------------------------------------------------------------
                                                                   
XP_011 AKYLGNLIKGVKRILENPQGLSDPGNYHEFCRFLARLKTNYQLGELVMVKEYPEVIRLIA
             310       320       330       340       350       360 

                                                                   
pF1KSD ------------------------------------------------------------
                                                                   
XP_011 NFTITSLQHWEFAPNSVHYLLTLWQRMVASVPFVKSTEPHLLDTYAPEITKAFITSRLDS
             370       380       390       400       410       420 

                                    270       280       290        
pF1KSD ------------------------QLSTIGRCEYEKTCALLVQLFDQSAQSYQELLQSAS
                               :: :..:::::::::::::::::.::.::.::.  :
XP_011 VAIVVRDHLDDPLDDTATVFQQLEQLCTVSRCEYEKTCALLVQLFDQNAQNYQKLLHPYS
             430       440       450       460       470       480 

      300       310       320       330       340       350        
pF1KSD ASPMDIAVQEGRLTWLVYIIGAVIGGRVSFASTDEQDAMDGELVCRVLQLMNLTDSRLAQ
       .  .::..:::::.::::..:.:.:::....::::.::::::: :::.::..: :. : .
XP_011 GVTVDITIQEGRLAWLVYLVGTVVGGRLTYTSTDEHDAMDGELSCRVFQLISLMDTGLPR
             490       500       510       520       530       540 

      360       370       380       390       400       410        
pF1KSD AGNEKLELAMLSFFEQFRKIYIGDQVQKSSKLYRRLSEVLGLNDETMVLSVFIGKIITNL
         :::.:::.: :..:::: :.:::.:..::.: :.:::::..:.. :: .:. ::.:::
XP_011 CCNEKIELAILWFLDQFRKTYVGDQLQRTSKVYARMSEVLGITDDNHVLETFMTKIVTNL
             550       560       570       580       590       600 

      420       430       440       450       460       470        
pF1KSD KYWGRCEPITSKTLQLLNDLSIGYSSVRKLVKLSAVQFMLNNHTSEHFSFLGINNQSNLT
       ::::: ::. :.:::.:::::.::  ..::::..::.:::.::::::: ::::... .:.
XP_011 KYWGRYEPVISRTLQFLNDLSVGYILLKKLVKIDAVKFMLKNHTSEHFPFLGISDNHSLS
             610       620       630       640       650       660 

      480       490       500       510       520       530        
pF1KSD DMRCRTTFYTALGRLLMVDLGEDEDQYEQFMLPLTAAFEAVAQMFSTNSFNEQEAKRTLV
       :.:::::::::: ::::::::::::..:.::::::.:::.: :.:. :.:.....:: :.
XP_011 DFRCRTTFYTALTRLLMVDLGEDEDEFENFMLPLTVAFETVLQIFN-NNFKQEDVKRMLI
             670       680       690       700        710       720

      540       550       560       570       580       590        
pF1KSD GLVRDLRGIAFAFNAKTSFMMLFEWIYPSYMPILQRAIELWYHDPACTTPVLKLMAELVH
       ::.:::::::::.:.:::. :::.:.::.:.:.:: :.: :: .:.::::.:::::::..
XP_011 GLARDLRGIAFALNTKTSYTMLFDWMYPTYLPLLQNAVERWYGEPTCTTPILKLMAELMQ
              730       740       750       760       770       780

      600       610       620       630       640       650        
pF1KSD NRSQRLQFDVSSPNGILLFRETSKMITMYGNRILTLGEVPKDQVYALKLKGISICFSMLK
       ::::::.::::::::::::::.:::.  :::.::.:: . :::.: .::::::::.: ::
XP_011 NRSQRLNFDVSSPNGILLFREASKMVCTYGNQILSLGSLSKDQIYPMKLKGISICYSALK
              790       800       810       820       830       840

      660       670       680       690       700       710        
pF1KSD AALSGSYVNFGVFRLYGDDALDNALQTFIKLLLSIPHSDLLDYPKLSQSYYSLLEVLTQD
       .:: :.::.::::.::::. .::.::.:.:.:::. :::::.: ::::::: ::: ::::
XP_011 SALCGNYVSFGVFKLYGDNHFDNVLQAFVKMLLSVSHSDLLQYRKLSQSYYPLLECLTQD
              850       860       870       880       890       900

      720       730       740       750       760       770        
pF1KSD HMNFIASLEPHVIMYILSSISEGLTALDTMVCTGCCSCLDHIVTYLFKQLSRSTKK--RT
       ::.:: .::: :.::.:.:::::::.:::.: ..::. ::.:::::::....  ::  : 
XP_011 HMSFIINLEPPVLMYVLTSISEGLTTLDTVVSSSCCTSLDYIVTYLFKHIAKEGKKPLRC
              910       920       930       940       950       960

        780       790       800       810       820       830      
pF1KSD TPLNQESDRFLHIMQQHPEMIQQMLSTVLNIIIFEDCRNQWSMSRPLLGLILLNEKYFSD
          .: ..:.::.:::.:...:::.:...: :.:::::::::.::::::::::::::::.
XP_011 REATQAGQRLLHFMQQNPDVLQQMMSVLMNTIVFEDCRNQWSVSRPLLGLILLNEKYFSE
              970       980       990      1000      1010      1020

        840       850       860       870       880       890      
pF1KSD LRNSIVNSQPPEKQQAMHLCFENLMEGIERNLLTKNRDRFTQNLSAFRREVNDSMK-NST
       :: :..::::  ::...  ::.:::::.:.:: .:::::::::::.:::.: .... ...
XP_011 LRASLINSQPLPKQEVLAQCFRNLMEGVEQNLSVKNRDRFTQNLSVFRRDVAEALRSDGN
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

         900     
pF1KSD YGVNSNDMMS
           : ::::
XP_011 TEPCSLDMMS
             1090

>--
 initn: 674 init1: 365 opt: 663  Z-score: 815.5  bits: 162.4 E(85289): 1.1e-38
Smith-Waterman score: 663; 67.1% identity (89.7% similar) in 146 aa overlap (5-150:7-151)

                 10        20        30        40        50        
pF1KSD   MADHVQSLAQLENLCKQLYETTDTTTRLQAEKALVEFTNSPDCLSKCQLLLERGSSSY
             ..:::.:: :: .::  :: : :..:::::.:. .::.::::::::::.:..::
XP_011 MLIFFSLKSLAELEVLCTHLYIGTDLTQRIEAEKALLELIDSPECLSKCQLLLEQGTTSY
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
pF1KSD SQLLAATCLTKLVSRTNNPLPLEQRIDIRNYVLNYLATRPKLATFVTQALIQLYARITKL
       .::::::::.:::::.. :::.:::.:::::.:::.:..:::: :: :::::. :.::::
XP_011 AQLLAATCLSKLVSRVS-PLPVEQRMDIRNYILNYVASQPKLAPFVIQALIQVIAKITKL
               70         80        90       100       110         

      120       130       140       150       160       170        
pF1KSD GWFDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIA
       :::. :::..:::. :.:: .::: .::.:::                            
XP_011 GWFEVQKDQFVFREIIADVKKFLQGTVEHCIIGVIILSELTQEMNLVDYSRPSAKHRKIA
     120       130       140       150       160       170         

      180       190       200       210       220       230        
pF1KSD SSFRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDE
                                                                   
XP_011 TSFRDTSLKDVLVLACSLLKEVFAKPLNLQDQCQQNLVMQVLKLVLNCLNFDFIGSSADE
     180       190       200       210       220       230         

>>XP_016865234 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding pro  (792 aa)
 initn: 2715 init1: 1209 opt: 2895  Z-score: 3591.4  bits: 675.6 E(85289): 2.6e-193
Smith-Waterman score: 2895; 64.5% identity (88.6% similar) in 650 aa overlap (263-905:144-792)

            240       250       260       270       280       290  
pF1KSD GTSTDESSDDLCTVQIPTSWRSAFLDSSTLQLSTIGRCEYEKTCALLVQLFDQSAQSYQE
                                     :: :..:::::::::::::::::.::.::.
XP_016 TSRLDSVAIVVRDHLDDPLDDTATVFQQLEQLCTVSRCEYEKTCALLVQLFDQNAQNYQK
           120       130       140       150       160       170   

            300       310       320       330       340       350  
pF1KSD LLQSASASPMDIAVQEGRLTWLVYIIGAVIGGRVSFASTDEQDAMDGELVCRVLQLMNLT
       ::.  :.  .::..:::::.::::..:.:.:::....::::.::::::: :::.::..: 
XP_016 LLHPYSGVTVDITIQEGRLAWLVYLVGTVVGGRLTYTSTDEHDAMDGELSCRVFQLISLM
           180       190       200       210       220       230   

            360       370       380       390       400       410  
pF1KSD DSRLAQAGNEKLELAMLSFFEQFRKIYIGDQVQKSSKLYRRLSEVLGLNDETMVLSVFIG
       :. : .  :::.:::.: :..:::: :.:::.:..::.: :.:::::..:.. :: .:. 
XP_016 DTGLPRCCNEKIELAILWFLDQFRKTYVGDQLQRTSKVYARMSEVLGITDDNHVLETFMT
           240       250       260       270       280       290   

            420       430       440       450       460       470  
pF1KSD KIITNLKYWGRCEPITSKTLQLLNDLSIGYSSVRKLVKLSAVQFMLNNHTSEHFSFLGIN
       ::.:::::::: ::. :.:::.:::::.::  ..::::..::.:::.::::::: ::::.
XP_016 KIVTNLKYWGRYEPVISRTLQFLNDLSVGYILLKKLVKIDAVKFMLKNHTSEHFPFLGIS
           300       310       320       330       340       350   

            480       490       500       510       520       530  
pF1KSD NQSNLTDMRCRTTFYTALGRLLMVDLGEDEDQYEQFMLPLTAAFEAVAQMFSTNSFNEQE
       .. .:.:.:::::::::: ::::::::::::..:.::::::.:::.: :.:. :.:....
XP_016 DNHSLSDFRCRTTFYTALTRLLMVDLGEDEDEFENFMLPLTVAFETVLQIFN-NNFKQED
           360       370       380       390       400        410  

            540       550       560           570       580        
pF1KSD AKRTLVGLVRDLRGIAFAFNAKTSFMMLFEWI----YPSYMPILQRAIELWYHDPACTTP
       .:: :.::.:::::::::.:.:::. :::.:.    ::.:.:.:: :.: :: .:.::::
XP_016 VKRMLIGLARDLRGIAFALNTKTSYTMLFDWMLYKRYPTYLPLLQNAVERWYGEPTCTTP
            420       430       440       450       460       470  

      590       600       610       620       630       640        
pF1KSD VLKLMAELVHNRSQRLQFDVSSPNGILLFRETSKMITMYGNRILTLGEVPKDQVYALKLK
       .:::::::..::::::.::::::::::::::.:::.  :::.::.:: . :::.: .:::
XP_016 ILKLMAELMQNRSQRLNFDVSSPNGILLFREASKMVCTYGNQILSLGSLSKDQIYPMKLK
            480       490       500       510       520       530  

      650       660       670       680       690       700        
pF1KSD GISICFSMLKAALSGSYVNFGVFRLYGDDALDNALQTFIKLLLSIPHSDLLDYPKLSQSY
       :::::.: ::.:: :.::.::::.::::. .::.::.:.:.:::. :::::.: ::::::
XP_016 GISICYSALKSALCGNYVSFGVFKLYGDNHFDNVLQAFVKMLLSVSHSDLLQYRKLSQSY
            540       550       560       570       580       590  

      710       720       730       740       750       760        
pF1KSD YSLLEVLTQDHMNFIASLEPHVIMYILSSISEGLTALDTMVCTGCCSCLDHIVTYLFKQL
       : ::: ::::::.:: .::: :.::.:.:::::::.:::.: ..::. ::.:::::::..
XP_016 YPLLECLTQDHMSFIINLEPPVLMYVLTSISEGLTTLDTVVSSSCCTSLDYIVTYLFKHI
            600       610       620       630       640       650  

      770         780       790       800       810       820      
pF1KSD SRSTKK--RTTPLNQESDRFLHIMQQHPEMIQQMLSTVLNIIIFEDCRNQWSMSRPLLGL
       ..  ::  :    .: ..:.::.:::.:...:::.:...: :.:::::::::.:::::::
XP_016 AKEGKKPLRCREATQAGQRLLHFMQQNPDVLQQMMSVLMNTIVFEDCRNQWSVSRPLLGL
            660       670       680       690       700       710  

        830       840       850       860       870       880      
pF1KSD ILLNEKYFSDLRNSIVNSQPPEKQQAMHLCFENLMEGIERNLLTKNRDRFTQNLSAFRRE
       :::::::::.:: :..::::  ::...  ::.:::::.:.:: .:::::::::::.:::.
XP_016 ILLNEKYFSELRASLINSQPLPKQEVLAQCFRNLMEGVEQNLSVKNRDRFTQNLSVFRRD
            720       730       740       750       760       770  

        890        900     
pF1KSD VNDSMK-NSTYGVNSNDMMS
       : .... ...    : ::::
XP_016 VAEALRSDGNTEPCSLDMMS
            780       790  

>>XP_016865232 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding pro  (1010 aa)
 initn: 2715 init1: 1209 opt: 2895  Z-score: 3589.8  bits: 675.6 E(85289): 3.3e-193
Smith-Waterman score: 3000; 51.8% identity (71.6% similar) in 944 aa overlap (151-905:68-1010)

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD FDCQKDDYVFRNAITDVTRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQADTTHPLTKHRKIASS
                                     :: :::.::.:.: .: ..: .::::::.:
XP_016 FEVQKDQFVFREIIADVKKFLQGTVEHCIIGVIILSELTQEMNLVDYSRPSAKHRKIATS
        40        50        60        70        80        90       

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD FRDSSLFDIFTLSCNLLKQASGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDESS
       :::.:: :...:.:.:::.. .: :::.:. :..:.::.:::. :::::::::.:.:::.
XP_016 FRDTSLKDVLVLACSLLKEVFAKPLNLQDQCQQNLVMQVLKLVLNCLNFDFIGSSADESA
       100       110       120       130       140       150       

              250       260                                        
pF1KSD DDLCTVQIPTSWRSAFLDSSTL--------------------------------------
       ::::::::::.::. ::.  ::                                      
XP_016 DDLCTVQIPTTWRTIFLEPETLDLFFNLYHSLPPLLSQLALSCLVQFASTRRSLFNSPER
       160       170       180       190       200       210       

                                                                   
pF1KSD ------------------------------------------------------------
                                                                   
XP_016 AKYLGNLIKGVKRILENPQGLSDPGNYHEFCRFLARLKTNYQLGELVMVKEYPEVIRLIA
       220       230       240       250       260       270       

                                                                   
pF1KSD ------------------------------------------------------------
                                                                   
XP_016 NFTITSLQHWEFAPNSVHYLLTLWQRMVASVPFVKSTEPHLLDTYAPEITKAFITSRLDS
       280       290       300       310       320       330       

                                    270       280       290        
pF1KSD ------------------------QLSTIGRCEYEKTCALLVQLFDQSAQSYQELLQSAS
                               :: :..:::::::::::::::::.::.::.::.  :
XP_016 VAIVVRDHLDDPLDDTATVFQQLEQLCTVSRCEYEKTCALLVQLFDQNAQNYQKLLHPYS
       340       350       360       370       380       390       

      300       310       320       330       340       350        
pF1KSD ASPMDIAVQEGRLTWLVYIIGAVIGGRVSFASTDEQDAMDGELVCRVLQLMNLTDSRLAQ
       .  .::..:::::.::::..:.:.:::....::::.::::::: :::.::..: :. : .
XP_016 GVTVDITIQEGRLAWLVYLVGTVVGGRLTYTSTDEHDAMDGELSCRVFQLISLMDTGLPR
       400       410       420       430       440       450       

      360       370       380       390       400       410        
pF1KSD AGNEKLELAMLSFFEQFRKIYIGDQVQKSSKLYRRLSEVLGLNDETMVLSVFIGKIITNL
         :::.:::.: :..:::: :.:::.:..::.: :.:::::..:.. :: .:. ::.:::
XP_016 CCNEKIELAILWFLDQFRKTYVGDQLQRTSKVYARMSEVLGITDDNHVLETFMTKIVTNL
       460       470       480       490       500       510       

      420       430       440       450       460       470        
pF1KSD KYWGRCEPITSKTLQLLNDLSIGYSSVRKLVKLSAVQFMLNNHTSEHFSFLGINNQSNLT
       ::::: ::. :.:::.:::::.::  ..::::..::.:::.::::::: ::::... .:.
XP_016 KYWGRYEPVISRTLQFLNDLSVGYILLKKLVKIDAVKFMLKNHTSEHFPFLGISDNHSLS
       520       530       540       550       560       570       

      480       490       500       510       520       530        
pF1KSD DMRCRTTFYTALGRLLMVDLGEDEDQYEQFMLPLTAAFEAVAQMFSTNSFNEQEAKRTLV
       :.:::::::::: ::::::::::::..:.::::::.:::.: :.:. :.:.....:: :.
XP_016 DFRCRTTFYTALTRLLMVDLGEDEDEFENFMLPLTVAFETVLQIFN-NNFKQEDVKRMLI
       580       590       600       610       620        630      

      540       550       560           570       580       590    
pF1KSD GLVRDLRGIAFAFNAKTSFMMLFEWI----YPSYMPILQRAIELWYHDPACTTPVLKLMA
       ::.:::::::::.:.:::. :::.:.    ::.:.:.:: :.: :: .:.::::.:::::
XP_016 GLARDLRGIAFALNTKTSYTMLFDWMLYKRYPTYLPLLQNAVERWYGEPTCTTPILKLMA
        640       650       660       670       680       690      

          600       610       620       630       640       650    
pF1KSD ELVHNRSQRLQFDVSSPNGILLFRETSKMITMYGNRILTLGEVPKDQVYALKLKGISICF
       ::..::::::.::::::::::::::.:::.  :::.::.:: . :::.: .::::::::.
XP_016 ELMQNRSQRLNFDVSSPNGILLFREASKMVCTYGNQILSLGSLSKDQIYPMKLKGISICY
        700       710       720       730       740       750      

          660       670       680       690       700       710    
pF1KSD SMLKAALSGSYVNFGVFRLYGDDALDNALQTFIKLLLSIPHSDLLDYPKLSQSYYSLLEV
       : ::.:: :.::.::::.::::. .::.::.:.:.:::. :::::.: ::::::: ::: 
XP_016 SALKSALCGNYVSFGVFKLYGDNHFDNVLQAFVKMLLSVSHSDLLQYRKLSQSYYPLLEC
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       ::::::.:: .::: :.::.:.:::::::.:::.: ..::. ::.:::::::....  ::
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         :    .: ..:.::.:::.:...:::.:...: :.:::::::::.:::::::::::::
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        ...    : ::::
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>--
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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