Result of FASTA (omim) for pF1KSDA0736
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0736, 742 aa
  1>>>pF1KSDA0736 742 - 742 aa - 742 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3238+/-0.000453; mu= 16.7935+/- 0.028
 mean_var=136.8017+/-28.629, 0's: 0 Z-trim(113.8): 129  B-trim: 1381 in 2/52
 Lambda= 0.109655
 statistics sampled from 23177 (23312) to 23177 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.621), E-opt: 0.2 (0.273), width:  16
 Scan time: 10.880

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_055664 (OMIM: 185860) synaptic vesicle glycopro ( 742) 5019 806.5       0
NP_001315604 (OMIM: 185860) synaptic vesicle glyco ( 742) 5019 806.5       0
NP_001315603 (OMIM: 185860) synaptic vesicle glyco ( 742) 5019 806.5       0
XP_005255055 (OMIM: 185861) PREDICTED: synaptic ve ( 683) 2849 463.2 1.6e-129
NP_001309961 (OMIM: 185861) synaptic vesicle glyco ( 683) 2849 463.2 1.6e-129
NP_055663 (OMIM: 185861) synaptic vesicle glycopro ( 683) 2849 463.2 1.6e-129
XP_016878250 (OMIM: 185861) PREDICTED: synaptic ve ( 683) 2849 463.2 1.6e-129
NP_001309968 (OMIM: 185861) synaptic vesicle glyco ( 683) 2849 463.2 1.6e-129
XP_016878251 (OMIM: 185861) PREDICTED: synaptic ve ( 683) 2849 463.2 1.6e-129
NP_001309960 (OMIM: 185861) synaptic vesicle glyco ( 683) 2849 463.2 1.6e-129
NP_001309967 (OMIM: 185861) synaptic vesicle glyco ( 683) 2849 463.2 1.6e-129
NP_001309966 (OMIM: 185861) synaptic vesicle glyco ( 683) 2849 463.2 1.6e-129
XP_011541584 (OMIM: 610291) PREDICTED: synaptic ve ( 727) 2822 458.9 3.2e-128
XP_011541583 (OMIM: 610291) PREDICTED: synaptic ve ( 727) 2822 458.9 3.2e-128
NP_055794 (OMIM: 610291) synaptic vesicle glycopro ( 727) 2822 458.9 3.2e-128
NP_001284645 (OMIM: 610291) synaptic vesicle glyco ( 676) 2608 425.0 4.8e-118
NP_001309965 (OMIM: 185861) synaptic vesicle glyco ( 540) 2474 403.7 9.8e-112
NP_001309969 (OMIM: 185861) synaptic vesicle glyco ( 532) 2466 402.5 2.3e-111
NP_001161052 (OMIM: 185861) synaptic vesicle glyco ( 532) 2466 402.5 2.3e-111
NP_001309963 (OMIM: 185861) synaptic vesicle glyco ( 616) 2061 338.5   5e-92
NP_001309962 (OMIM: 185861) synaptic vesicle glyco ( 572) 1875 309.0 3.4e-83
XP_016864733 (OMIM: 610291) PREDICTED: synaptic ve ( 382) 1342 224.5 6.3e-58
NP_001265648 (OMIM: 185860) synaptic vesicle glyco ( 194) 1168 196.7 7.6e-50
NP_061181 (OMIM: 611699) synaptic vesicle 2-relate ( 548)  359 69.2 5.2e-11
XP_005250200 (OMIM: 611700) PREDICTED: putative tr ( 492)  319 62.8 3.9e-09
NP_001132928 (OMIM: 611700) putative transporter S ( 492)  319 62.8 3.9e-09
NP_001318121 (OMIM: 611700) putative transporter S ( 401)  249 51.6 7.3e-06
XP_011534514 (OMIM: 608276) PREDICTED: solute carr ( 347)  195 43.0  0.0025
XP_011534513 (OMIM: 608276) PREDICTED: solute carr ( 417)  195 43.1  0.0028
NP_001135923 (OMIM: 612583) protein spinster homol ( 476)  195 43.2  0.0031
XP_011534508 (OMIM: 608276) PREDICTED: solute carr ( 483)  195 43.2  0.0031
XP_006721159 (OMIM: 612583) PREDICTED: protein spi ( 521)  195 43.2  0.0033
NP_001135920 (OMIM: 612583) protein spinster homol ( 528)  195 43.2  0.0033
NP_114427 (OMIM: 612583) protein spinster homolog  ( 528)  195 43.2  0.0033
XP_016879248 (OMIM: 612583) PREDICTED: protein spi ( 573)  195 43.2  0.0035
XP_016879247 (OMIM: 612583) PREDICTED: protein spi ( 578)  193 42.9  0.0044
XP_016879246 (OMIM: 612583) PREDICTED: protein spi ( 591)  193 42.9  0.0044


>>NP_055664 (OMIM: 185860) synaptic vesicle glycoprotein  (742 aa)
 initn: 5019 init1: 5019 opt: 5019  Z-score: 4301.1  bits: 806.5 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 5019; 100.0% identity (100.0% similar) in 742 aa overlap (1-742:1-742)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MEEGFRDRAAFIRGAKDIAKEVKKHAAKKVVKGLDRVQDEYSRRSYSRFEEEDDDDDFPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MEEGFRDRAAFIRGAKDIAKEVKKHAAKKVVKGLDRVQDEYSRRSYSRFEEEDDDDDFPA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD PSDGYYRGEGTQDEEEGGASSDATEGHDEDDEIYEGEYQGIPRAESGGKGERMADGAPLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PSDGYYRGEGTQDEEEGGASSDATEGHDEDDEIYEGEYQGIPRAESGGKGERMADGAPLA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD GVRGGLSDGEGPPGGRGEAQRRKEREELAQQYEAILRECGHGRFQWTLYFVLGLALMADG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GVRGGLSDGEGPPGGRGEAQRRKEREELAQQYEAILRECGHGRFQWTLYFVLGLALMADG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD VEVFVVGFVLPSAEKDMCLSDSNKGMLGLIVYLGMMVGAFLWGGLADRLGRRQCLLISLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VEVFVVGFVLPSAEKDMCLSDSNKGMLGLIVYLGMMVGAFLWGGLADRLGRRQCLLISLS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD VNSVFAFFSSFVQGYGTFLFCRLLSGVGIGGSIPIVFSYFSEFLAQEKRGEHLSWLCMFW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VNSVFAFFSSFVQGYGTFLFCRLLSGVGIGGSIPIVFSYFSEFLAQEKRGEHLSWLCMFW
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD MIGGVYAAAMAWAIIPHYGWSFQMGSAYQFHSWRVFVLVCAFPSVFAIGALTTQPESPRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MIGGVYAAAMAWAIIPHYGWSFQMGSAYQFHSWRVFVLVCAFPSVFAIGALTTQPESPRF
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD FLENGKHDEAWMVLKQVHDTNMRAKGHPERVFSVTHIKTIHQEDELIEIQSDTGTWYQRW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 FLENGKHDEAWMVLKQVHDTNMRAKGHPERVFSVTHIKTIHQEDELIEIQSDTGTWYQRW
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD GVRALSLGGQVWGNFLSCFGPEYRRITLMMMGVWFTMSFSYYGLTVWFPDMIRHLQAVDY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GVRALSLGGQVWGNFLSCFGPEYRRITLMMMGVWFTMSFSYYGLTVWFPDMIRHLQAVDY
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD ASRTKVFPGERVEHVTFNFTLENQIHRGGQYFNDKFIGLRLKSVSFEDSLFEECYFEDVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ASRTKVFPGERVEHVTFNFTLENQIHRGGQYFNDKFIGLRLKSVSFEDSLFEECYFEDVT
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD SSNTFFRNCTFINTVFYNTDLFEYKFVNSRLINSTFLHNKEGCPLDVTGTGEGAYMVYFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SSNTFFRNCTFINTVFYNTDLFEYKFVNSRLINSTFLHNKEGCPLDVTGTGEGAYMVYFV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD SFLGTLAVLPGNIVSALLMDKIGRLRMLAGSSVMSCVSCFFLSFGNSESAMIALLCLFGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SFLGTLAVLPGNIVSALLMDKIGRLRMLAGSSVMSCVSCFFLSFGNSESAMIALLCLFGG
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD VSIASWNALDVLTVELYPSDKRTTAFGFLNALCKLAAVLGISIFTSFVGITKAAPILFAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VSIASWNALDVLTVELYPSDKRTTAFGFLNALCKLAAVLGISIFTSFVGITKAAPILFAS
              670       680       690       700       710       720

              730       740  
pF1KSD AALALGSSLALKLPETRGQVLQ
       ::::::::::::::::::::::
NP_055 AALALGSSLALKLPETRGQVLQ
              730       740  

>>NP_001315604 (OMIM: 185860) synaptic vesicle glycoprot  (742 aa)
 initn: 5019 init1: 5019 opt: 5019  Z-score: 4301.1  bits: 806.5 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 5019; 100.0% identity (100.0% similar) in 742 aa overlap (1-742:1-742)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MEEGFRDRAAFIRGAKDIAKEVKKHAAKKVVKGLDRVQDEYSRRSYSRFEEEDDDDDFPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MEEGFRDRAAFIRGAKDIAKEVKKHAAKKVVKGLDRVQDEYSRRSYSRFEEEDDDDDFPA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD PSDGYYRGEGTQDEEEGGASSDATEGHDEDDEIYEGEYQGIPRAESGGKGERMADGAPLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PSDGYYRGEGTQDEEEGGASSDATEGHDEDDEIYEGEYQGIPRAESGGKGERMADGAPLA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD GVRGGLSDGEGPPGGRGEAQRRKEREELAQQYEAILRECGHGRFQWTLYFVLGLALMADG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GVRGGLSDGEGPPGGRGEAQRRKEREELAQQYEAILRECGHGRFQWTLYFVLGLALMADG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD VEVFVVGFVLPSAEKDMCLSDSNKGMLGLIVYLGMMVGAFLWGGLADRLGRRQCLLISLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VEVFVVGFVLPSAEKDMCLSDSNKGMLGLIVYLGMMVGAFLWGGLADRLGRRQCLLISLS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD VNSVFAFFSSFVQGYGTFLFCRLLSGVGIGGSIPIVFSYFSEFLAQEKRGEHLSWLCMFW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VNSVFAFFSSFVQGYGTFLFCRLLSGVGIGGSIPIVFSYFSEFLAQEKRGEHLSWLCMFW
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD MIGGVYAAAMAWAIIPHYGWSFQMGSAYQFHSWRVFVLVCAFPSVFAIGALTTQPESPRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MIGGVYAAAMAWAIIPHYGWSFQMGSAYQFHSWRVFVLVCAFPSVFAIGALTTQPESPRF
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD FLENGKHDEAWMVLKQVHDTNMRAKGHPERVFSVTHIKTIHQEDELIEIQSDTGTWYQRW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FLENGKHDEAWMVLKQVHDTNMRAKGHPERVFSVTHIKTIHQEDELIEIQSDTGTWYQRW
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD GVRALSLGGQVWGNFLSCFGPEYRRITLMMMGVWFTMSFSYYGLTVWFPDMIRHLQAVDY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GVRALSLGGQVWGNFLSCFGPEYRRITLMMMGVWFTMSFSYYGLTVWFPDMIRHLQAVDY
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD ASRTKVFPGERVEHVTFNFTLENQIHRGGQYFNDKFIGLRLKSVSFEDSLFEECYFEDVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASRTKVFPGERVEHVTFNFTLENQIHRGGQYFNDKFIGLRLKSVSFEDSLFEECYFEDVT
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD SSNTFFRNCTFINTVFYNTDLFEYKFVNSRLINSTFLHNKEGCPLDVTGTGEGAYMVYFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSNTFFRNCTFINTVFYNTDLFEYKFVNSRLINSTFLHNKEGCPLDVTGTGEGAYMVYFV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD SFLGTLAVLPGNIVSALLMDKIGRLRMLAGSSVMSCVSCFFLSFGNSESAMIALLCLFGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SFLGTLAVLPGNIVSALLMDKIGRLRMLAGSSVMSCVSCFFLSFGNSESAMIALLCLFGG
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD VSIASWNALDVLTVELYPSDKRTTAFGFLNALCKLAAVLGISIFTSFVGITKAAPILFAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VSIASWNALDVLTVELYPSDKRTTAFGFLNALCKLAAVLGISIFTSFVGITKAAPILFAS
              670       680       690       700       710       720

              730       740  
pF1KSD AALALGSSLALKLPETRGQVLQ
       ::::::::::::::::::::::
NP_001 AALALGSSLALKLPETRGQVLQ
              730       740  

>>NP_001315603 (OMIM: 185860) synaptic vesicle glycoprot  (742 aa)
 initn: 5019 init1: 5019 opt: 5019  Z-score: 4301.1  bits: 806.5 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 5019; 100.0% identity (100.0% similar) in 742 aa overlap (1-742:1-742)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MEEGFRDRAAFIRGAKDIAKEVKKHAAKKVVKGLDRVQDEYSRRSYSRFEEEDDDDDFPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MEEGFRDRAAFIRGAKDIAKEVKKHAAKKVVKGLDRVQDEYSRRSYSRFEEEDDDDDFPA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD PSDGYYRGEGTQDEEEGGASSDATEGHDEDDEIYEGEYQGIPRAESGGKGERMADGAPLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PSDGYYRGEGTQDEEEGGASSDATEGHDEDDEIYEGEYQGIPRAESGGKGERMADGAPLA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD GVRGGLSDGEGPPGGRGEAQRRKEREELAQQYEAILRECGHGRFQWTLYFVLGLALMADG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GVRGGLSDGEGPPGGRGEAQRRKEREELAQQYEAILRECGHGRFQWTLYFVLGLALMADG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD VEVFVVGFVLPSAEKDMCLSDSNKGMLGLIVYLGMMVGAFLWGGLADRLGRRQCLLISLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VEVFVVGFVLPSAEKDMCLSDSNKGMLGLIVYLGMMVGAFLWGGLADRLGRRQCLLISLS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD VNSVFAFFSSFVQGYGTFLFCRLLSGVGIGGSIPIVFSYFSEFLAQEKRGEHLSWLCMFW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VNSVFAFFSSFVQGYGTFLFCRLLSGVGIGGSIPIVFSYFSEFLAQEKRGEHLSWLCMFW
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD MIGGVYAAAMAWAIIPHYGWSFQMGSAYQFHSWRVFVLVCAFPSVFAIGALTTQPESPRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MIGGVYAAAMAWAIIPHYGWSFQMGSAYQFHSWRVFVLVCAFPSVFAIGALTTQPESPRF
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD FLENGKHDEAWMVLKQVHDTNMRAKGHPERVFSVTHIKTIHQEDELIEIQSDTGTWYQRW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FLENGKHDEAWMVLKQVHDTNMRAKGHPERVFSVTHIKTIHQEDELIEIQSDTGTWYQRW
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD GVRALSLGGQVWGNFLSCFGPEYRRITLMMMGVWFTMSFSYYGLTVWFPDMIRHLQAVDY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GVRALSLGGQVWGNFLSCFGPEYRRITLMMMGVWFTMSFSYYGLTVWFPDMIRHLQAVDY
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD ASRTKVFPGERVEHVTFNFTLENQIHRGGQYFNDKFIGLRLKSVSFEDSLFEECYFEDVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASRTKVFPGERVEHVTFNFTLENQIHRGGQYFNDKFIGLRLKSVSFEDSLFEECYFEDVT
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD SSNTFFRNCTFINTVFYNTDLFEYKFVNSRLINSTFLHNKEGCPLDVTGTGEGAYMVYFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSNTFFRNCTFINTVFYNTDLFEYKFVNSRLINSTFLHNKEGCPLDVTGTGEGAYMVYFV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD SFLGTLAVLPGNIVSALLMDKIGRLRMLAGSSVMSCVSCFFLSFGNSESAMIALLCLFGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SFLGTLAVLPGNIVSALLMDKIGRLRMLAGSSVMSCVSCFFLSFGNSESAMIALLCLFGG
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD VSIASWNALDVLTVELYPSDKRTTAFGFLNALCKLAAVLGISIFTSFVGITKAAPILFAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VSIASWNALDVLTVELYPSDKRTTAFGFLNALCKLAAVLGISIFTSFVGITKAAPILFAS
              670       680       690       700       710       720

              730       740  
pF1KSD AALALGSSLALKLPETRGQVLQ
       ::::::::::::::::::::::
NP_001 AALALGSSLALKLPETRGQVLQ
              730       740  

>>XP_005255055 (OMIM: 185861) PREDICTED: synaptic vesicl  (683 aa)
 initn: 2988 init1: 2187 opt: 2849  Z-score: 2446.3  bits: 463.2 E(85289): 1.6e-129
Smith-Waterman score: 3027; 64.0% identity (85.9% similar) in 695 aa overlap (49-741:4-682)

       20        30        40        50        60        70        
pF1KSD AKEVKKHAAKKVVKGLDRVQDEYSRRSYSRFEEEDDDDDFPAPSDGYYRGEGTQDEEEGG
                                     .. .:.   . :::::::::. .. ::.  
XP_005                            MDDYKYQDNYGGY-APSDGYYRGNESNPEED--
                                          10         20        30  

       80        90       100        110       120       130       
pF1KSD ASSDATEGHDEDDEIYEGEYQGIPRAES-GGKGERMADGAPLAGVRGGLSDGEGPPGGRG
       :.::.::::::.::::::::::::. ..  .:  .::  . . ..::  .:         
XP_005 AQSDVTEGHDEEDEIYEGEYQGIPHPDDVKAKQAKMAP-SRMDSLRGQ-TDLM-------
               40        50        60         70         80        

       140       150       160       170       180       190       
pF1KSD EAQRRKEREELAQQYEAILRECGHGRFQWTLYFVLGLALMADGVEVFVVGFVLPSAEKDM
        :.: ...:.::.:::.:. ::::::::: :.:::::::::::::::::.:.::::::::
XP_005 -AERLEDEEQLAHQYETIMDECGHGRFQWILFFVLGLALMADGVEVFVVSFALPSAEKDM
               90       100       110       120       130       140

       200       210       220       230       240       250       
pF1KSD CLSDSNKGMLGLIVYLGMMVGAFLWGGLADRLGRRQCLLISLSVNSVFAFFSSFVQGYGT
       :::.:.:::::.:::::::.:::. :::::.:::.. : .::.::. :: .::::::::.
XP_005 CLSSSKKGMLGMIVYLGMMAGAFILGGLADKLGRKRVLSMSLAVNASFASLSSFVQGYGA
              150       160       170       180       190       200

       260       270       280       290       300       310       
pF1KSD FLFCRLLSGVGIGGSIPIVFSYFSEFLAQEKRGEHLSWLCMFWMIGGVYAAAMAWAIIPH
       ::::::.::.::::..::::.::::::..:::::::::: .::: ::.::.::::.::::
XP_005 FLFCRLISGIGIGGALPIVFAYFSEFLSREKRGEHLSWLGIFWMTGGLYASAMAWSIIPH
              210       220       230       240       250       260

       320       330       340       350       360       370       
pF1KSD YGWSFQMGSAYQFHSWRVFVLVCAFPSVFAIGALTTQPESPRFFLENGKHDEAWMVLKQV
       :::.:.::. :.::::::::.:::.: . .. ::  .::::::.:: ::::::::.::::
XP_005 YGWGFSMGTNYHFHSWRVFVIVCALPCTVSMVALKFMPESPRFLLEMGKHDEAWMILKQV
              270       280       290       300       310       320

       380       390       400       410       420       430       
pF1KSD HDTNMRAKGHPERVFSVTHIKTIHQEDELIEIQSDTGTWYQRWGVRALSLGGQVWGNFLS
       ::::::::: ::.::.:..::: .: ::.:::::.:::::::: ::  ..  ::: : : 
XP_005 HDTNMRAKGTPEKVFTVSNIKTPKQMDEFIEIQSSTGTWYQRWLVRFKTIFKQVWDNALY
              330       340       350       360       370       380

        440       450       460       470       480       490      
pF1KSD C-FGPEYRRITLMMMGVWFTMSFSYYGLTVWFPDMIRHLQAVDYASRTKVFPGERVEHVT
       : .:: ::  ::..  :::.:.:::::::::::::::..:  .: :. ::: ::.:  .:
XP_005 CVMGP-YRMNTLILAVVWFAMAFSYYGLTVWFPDMIRYFQDEEYKSKMKVFFGEHVYGAT
               390       400       410       420       430         

        500       510       520       530       540       550      
pF1KSD FNFTLENQIHRGGQYFNDKFIGLRLKSVSFEDSLFEECYFEDVTSSNTFFRNCTFINTVF
       .:::.:::::. :.  ::::  . .: : :::..:.:::::::::..:.:.:::. .:.:
XP_005 INFTMENQIHQHGKLVNDKFTRMYFKHVLFEDTFFDECYFEDVTSTDTYFKNCTIESTIF
     440       450       460       470       480       490         

        560       570       580       590       600       610      
pF1KSD YNTDLFEYKFVNSRLINSTFLHNKEGCPLDVTGTGEGAYMVYFVSFLGTLAVLPGNIVSA
       :::::.:.::.: :.::::::..:::: .:.   ..  ...:.:::::.:.::::::.::
XP_005 YNTDLYEHKFINCRFINSTFLEQKEGCHMDLEQDND--FLIYLVSFLGSLSVLPGNIISA
     500       510       520       530         540       550       

        620       630       640       650       660       670      
pF1KSD LLMDKIGRLRMLAGSSVMSCVSCFFLSFGNSESAMIALLCLFGGVSIASWNALDVLTVEL
       ::::.::::.:..:: ..: : :::: :::::::::.  ::: :.:::.::::::.::::
XP_005 LLMDRIGRLKMIGGSMLISAVCCFFLFFGNSESAMIGWQCLFCGTSIAAWNALDVITVEL
       560       570       580       590       600       610       

        680       690       700       710       720       730      
pF1KSD YPSDKRTTAFGFLNALCKLAAVLGISIFTSFVGITKAAPILFASAALALGSSLALKLPET
       ::...:.::::.::.:::..:.:: .::.:::::::..:::.:.:.:. :. .::.::::
XP_005 YPTNQRATAFGILNGLCKFGAILGNTIFASFVGITKVVPILLAAASLVGGGLIALRLPET
       620       630       640       650       660       670       

        740  
pF1KSD RGQVLQ
       : ::: 
XP_005 REQVLM
       680   

>>NP_001309961 (OMIM: 185861) synaptic vesicle glycoprot  (683 aa)
 initn: 2988 init1: 2187 opt: 2849  Z-score: 2446.3  bits: 463.2 E(85289): 1.6e-129
Smith-Waterman score: 3027; 64.0% identity (85.9% similar) in 695 aa overlap (49-741:4-682)

       20        30        40        50        60        70        
pF1KSD AKEVKKHAAKKVVKGLDRVQDEYSRRSYSRFEEEDDDDDFPAPSDGYYRGEGTQDEEEGG
                                     .. .:.   . :::::::::. .. ::.  
NP_001                            MDDYKYQDNYGGY-APSDGYYRGNESNPEED--
                                          10         20        30  

       80        90       100        110       120       130       
pF1KSD ASSDATEGHDEDDEIYEGEYQGIPRAES-GGKGERMADGAPLAGVRGGLSDGEGPPGGRG
       :.::.::::::.::::::::::::. ..  .:  .::  . . ..::  .:         
NP_001 AQSDVTEGHDEEDEIYEGEYQGIPHPDDVKAKQAKMAP-SRMDSLRGQ-TDLM-------
               40        50        60         70         80        

       140       150       160       170       180       190       
pF1KSD EAQRRKEREELAQQYEAILRECGHGRFQWTLYFVLGLALMADGVEVFVVGFVLPSAEKDM
        :.: ...:.::.:::.:. ::::::::: :.:::::::::::::::::.:.::::::::
NP_001 -AERLEDEEQLAHQYETIMDECGHGRFQWILFFVLGLALMADGVEVFVVSFALPSAEKDM
               90       100       110       120       130       140

       200       210       220       230       240       250       
pF1KSD CLSDSNKGMLGLIVYLGMMVGAFLWGGLADRLGRRQCLLISLSVNSVFAFFSSFVQGYGT
       :::.:.:::::.:::::::.:::. :::::.:::.. : .::.::. :: .::::::::.
NP_001 CLSSSKKGMLGMIVYLGMMAGAFILGGLADKLGRKRVLSMSLAVNASFASLSSFVQGYGA
              150       160       170       180       190       200

       260       270       280       290       300       310       
pF1KSD FLFCRLLSGVGIGGSIPIVFSYFSEFLAQEKRGEHLSWLCMFWMIGGVYAAAMAWAIIPH
       ::::::.::.::::..::::.::::::..:::::::::: .::: ::.::.::::.::::
NP_001 FLFCRLISGIGIGGALPIVFAYFSEFLSREKRGEHLSWLGIFWMTGGLYASAMAWSIIPH
              210       220       230       240       250       260

       320       330       340       350       360       370       
pF1KSD YGWSFQMGSAYQFHSWRVFVLVCAFPSVFAIGALTTQPESPRFFLENGKHDEAWMVLKQV
       :::.:.::. :.::::::::.:::.: . .. ::  .::::::.:: ::::::::.::::
NP_001 YGWGFSMGTNYHFHSWRVFVIVCALPCTVSMVALKFMPESPRFLLEMGKHDEAWMILKQV
              270       280       290       300       310       320

       380       390       400       410       420       430       
pF1KSD HDTNMRAKGHPERVFSVTHIKTIHQEDELIEIQSDTGTWYQRWGVRALSLGGQVWGNFLS
       ::::::::: ::.::.:..::: .: ::.:::::.:::::::: ::  ..  ::: : : 
NP_001 HDTNMRAKGTPEKVFTVSNIKTPKQMDEFIEIQSSTGTWYQRWLVRFKTIFKQVWDNALY
              330       340       350       360       370       380

        440       450       460       470       480       490      
pF1KSD C-FGPEYRRITLMMMGVWFTMSFSYYGLTVWFPDMIRHLQAVDYASRTKVFPGERVEHVT
       : .:: ::  ::..  :::.:.:::::::::::::::..:  .: :. ::: ::.:  .:
NP_001 CVMGP-YRMNTLILAVVWFAMAFSYYGLTVWFPDMIRYFQDEEYKSKMKVFFGEHVYGAT
               390       400       410       420       430         

        500       510       520       530       540       550      
pF1KSD FNFTLENQIHRGGQYFNDKFIGLRLKSVSFEDSLFEECYFEDVTSSNTFFRNCTFINTVF
       .:::.:::::. :.  ::::  . .: : :::..:.:::::::::..:.:.:::. .:.:
NP_001 INFTMENQIHQHGKLVNDKFTRMYFKHVLFEDTFFDECYFEDVTSTDTYFKNCTIESTIF
     440       450       460       470       480       490         

        560       570       580       590       600       610      
pF1KSD YNTDLFEYKFVNSRLINSTFLHNKEGCPLDVTGTGEGAYMVYFVSFLGTLAVLPGNIVSA
       :::::.:.::.: :.::::::..:::: .:.   ..  ...:.:::::.:.::::::.::
NP_001 YNTDLYEHKFINCRFINSTFLEQKEGCHMDLEQDND--FLIYLVSFLGSLSVLPGNIISA
     500       510       520       530         540       550       

        620       630       640       650       660       670      
pF1KSD LLMDKIGRLRMLAGSSVMSCVSCFFLSFGNSESAMIALLCLFGGVSIASWNALDVLTVEL
       ::::.::::.:..:: ..: : :::: :::::::::.  ::: :.:::.::::::.::::
NP_001 LLMDRIGRLKMIGGSMLISAVCCFFLFFGNSESAMIGWQCLFCGTSIAAWNALDVITVEL
       560       570       580       590       600       610       

        680       690       700       710       720       730      
pF1KSD YPSDKRTTAFGFLNALCKLAAVLGISIFTSFVGITKAAPILFASAALALGSSLALKLPET
       ::...:.::::.::.:::..:.:: .::.:::::::..:::.:.:.:. :. .::.::::
NP_001 YPTNQRATAFGILNGLCKFGAILGNTIFASFVGITKVVPILLAAASLVGGGLIALRLPET
       620       630       640       650       660       670       

        740  
pF1KSD RGQVLQ
       : ::: 
NP_001 REQVLM
       680   

>>NP_055663 (OMIM: 185861) synaptic vesicle glycoprotein  (683 aa)
 initn: 2988 init1: 2187 opt: 2849  Z-score: 2446.3  bits: 463.2 E(85289): 1.6e-129
Smith-Waterman score: 3027; 64.0% identity (85.9% similar) in 695 aa overlap (49-741:4-682)

       20        30        40        50        60        70        
pF1KSD AKEVKKHAAKKVVKGLDRVQDEYSRRSYSRFEEEDDDDDFPAPSDGYYRGEGTQDEEEGG
                                     .. .:.   . :::::::::. .. ::.  
NP_055                            MDDYKYQDNYGGY-APSDGYYRGNESNPEED--
                                          10         20        30  

       80        90       100        110       120       130       
pF1KSD ASSDATEGHDEDDEIYEGEYQGIPRAES-GGKGERMADGAPLAGVRGGLSDGEGPPGGRG
       :.::.::::::.::::::::::::. ..  .:  .::  . . ..::  .:         
NP_055 AQSDVTEGHDEEDEIYEGEYQGIPHPDDVKAKQAKMAP-SRMDSLRGQ-TDLM-------
               40        50        60         70         80        

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pF1KSD EAQRRKEREELAQQYEAILRECGHGRFQWTLYFVLGLALMADGVEVFVVGFVLPSAEKDM
        :.: ...:.::.:::.:. ::::::::: :.:::::::::::::::::.:.::::::::
NP_055 -AERLEDEEQLAHQYETIMDECGHGRFQWILFFVLGLALMADGVEVFVVSFALPSAEKDM
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pF1KSD CLSDSNKGMLGLIVYLGMMVGAFLWGGLADRLGRRQCLLISLSVNSVFAFFSSFVQGYGT
       :::.:.:::::.:::::::.:::. :::::.:::.. : .::.::. :: .::::::::.
NP_055 CLSSSKKGMLGMIVYLGMMAGAFILGGLADKLGRKRVLSMSLAVNASFASLSSFVQGYGA
              150       160       170       180       190       200

       260       270       280       290       300       310       
pF1KSD FLFCRLLSGVGIGGSIPIVFSYFSEFLAQEKRGEHLSWLCMFWMIGGVYAAAMAWAIIPH
       ::::::.::.::::..::::.::::::..:::::::::: .::: ::.::.::::.::::
NP_055 FLFCRLISGIGIGGALPIVFAYFSEFLSREKRGEHLSWLGIFWMTGGLYASAMAWSIIPH
              210       220       230       240       250       260

       320       330       340       350       360       370       
pF1KSD YGWSFQMGSAYQFHSWRVFVLVCAFPSVFAIGALTTQPESPRFFLENGKHDEAWMVLKQV
       :::.:.::. :.::::::::.:::.: . .. ::  .::::::.:: ::::::::.::::
NP_055 YGWGFSMGTNYHFHSWRVFVIVCALPCTVSMVALKFMPESPRFLLEMGKHDEAWMILKQV
              270       280       290       300       310       320

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pF1KSD HDTNMRAKGHPERVFSVTHIKTIHQEDELIEIQSDTGTWYQRWGVRALSLGGQVWGNFLS
       ::::::::: ::.::.:..::: .: ::.:::::.:::::::: ::  ..  ::: : : 
NP_055 HDTNMRAKGTPEKVFTVSNIKTPKQMDEFIEIQSSTGTWYQRWLVRFKTIFKQVWDNALY
              330       340       350       360       370       380

        440       450       460       470       480       490      
pF1KSD C-FGPEYRRITLMMMGVWFTMSFSYYGLTVWFPDMIRHLQAVDYASRTKVFPGERVEHVT
       : .:: ::  ::..  :::.:.:::::::::::::::..:  .: :. ::: ::.:  .:
NP_055 CVMGP-YRMNTLILAVVWFAMAFSYYGLTVWFPDMIRYFQDEEYKSKMKVFFGEHVYGAT
               390       400       410       420       430         

        500       510       520       530       540       550      
pF1KSD FNFTLENQIHRGGQYFNDKFIGLRLKSVSFEDSLFEECYFEDVTSSNTFFRNCTFINTVF
       .:::.:::::. :.  ::::  . .: : :::..:.:::::::::..:.:.:::. .:.:
NP_055 INFTMENQIHQHGKLVNDKFTRMYFKHVLFEDTFFDECYFEDVTSTDTYFKNCTIESTIF
     440       450       460       470       480       490         

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pF1KSD YNTDLFEYKFVNSRLINSTFLHNKEGCPLDVTGTGEGAYMVYFVSFLGTLAVLPGNIVSA
       :::::.:.::.: :.::::::..:::: .:.   ..  ...:.:::::.:.::::::.::
NP_055 YNTDLYEHKFINCRFINSTFLEQKEGCHMDLEQDND--FLIYLVSFLGSLSVLPGNIISA
     500       510       520       530         540       550       

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pF1KSD LLMDKIGRLRMLAGSSVMSCVSCFFLSFGNSESAMIALLCLFGGVSIASWNALDVLTVEL
       ::::.::::.:..:: ..: : :::: :::::::::.  ::: :.:::.::::::.::::
NP_055 LLMDRIGRLKMIGGSMLISAVCCFFLFFGNSESAMIGWQCLFCGTSIAAWNALDVITVEL
       560       570       580       590       600       610       

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pF1KSD YPSDKRTTAFGFLNALCKLAAVLGISIFTSFVGITKAAPILFASAALALGSSLALKLPET
       ::...:.::::.::.:::..:.:: .::.:::::::..:::.:.:.:. :. .::.::::
NP_055 YPTNQRATAFGILNGLCKFGAILGNTIFASFVGITKVVPILLAAASLVGGGLIALRLPET
       620       630       640       650       660       670       

        740  
pF1KSD RGQVLQ
       : ::: 
NP_055 REQVLM
       680   

>>XP_016878250 (OMIM: 185861) PREDICTED: synaptic vesicl  (683 aa)
 initn: 2988 init1: 2187 opt: 2849  Z-score: 2446.3  bits: 463.2 E(85289): 1.6e-129
Smith-Waterman score: 3027; 64.0% identity (85.9% similar) in 695 aa overlap (49-741:4-682)

       20        30        40        50        60        70        
pF1KSD AKEVKKHAAKKVVKGLDRVQDEYSRRSYSRFEEEDDDDDFPAPSDGYYRGEGTQDEEEGG
                                     .. .:.   . :::::::::. .. ::.  
XP_016                            MDDYKYQDNYGGY-APSDGYYRGNESNPEED--
                                          10         20        30  

       80        90       100        110       120       130       
pF1KSD ASSDATEGHDEDDEIYEGEYQGIPRAES-GGKGERMADGAPLAGVRGGLSDGEGPPGGRG
       :.::.::::::.::::::::::::. ..  .:  .::  . . ..::  .:         
XP_016 AQSDVTEGHDEEDEIYEGEYQGIPHPDDVKAKQAKMAP-SRMDSLRGQ-TDLM-------
               40        50        60         70         80        

       140       150       160       170       180       190       
pF1KSD EAQRRKEREELAQQYEAILRECGHGRFQWTLYFVLGLALMADGVEVFVVGFVLPSAEKDM
        :.: ...:.::.:::.:. ::::::::: :.:::::::::::::::::.:.::::::::
XP_016 -AERLEDEEQLAHQYETIMDECGHGRFQWILFFVLGLALMADGVEVFVVSFALPSAEKDM
               90       100       110       120       130       140

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pF1KSD CLSDSNKGMLGLIVYLGMMVGAFLWGGLADRLGRRQCLLISLSVNSVFAFFSSFVQGYGT
       :::.:.:::::.:::::::.:::. :::::.:::.. : .::.::. :: .::::::::.
XP_016 CLSSSKKGMLGMIVYLGMMAGAFILGGLADKLGRKRVLSMSLAVNASFASLSSFVQGYGA
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pF1KSD FLFCRLLSGVGIGGSIPIVFSYFSEFLAQEKRGEHLSWLCMFWMIGGVYAAAMAWAIIPH
       ::::::.::.::::..::::.::::::..:::::::::: .::: ::.::.::::.::::
XP_016 FLFCRLISGIGIGGALPIVFAYFSEFLSREKRGEHLSWLGIFWMTGGLYASAMAWSIIPH
              210       220       230       240       250       260

       320       330       340       350       360       370       
pF1KSD YGWSFQMGSAYQFHSWRVFVLVCAFPSVFAIGALTTQPESPRFFLENGKHDEAWMVLKQV
       :::.:.::. :.::::::::.:::.: . .. ::  .::::::.:: ::::::::.::::
XP_016 YGWGFSMGTNYHFHSWRVFVIVCALPCTVSMVALKFMPESPRFLLEMGKHDEAWMILKQV
              270       280       290       300       310       320

       380       390       400       410       420       430       
pF1KSD HDTNMRAKGHPERVFSVTHIKTIHQEDELIEIQSDTGTWYQRWGVRALSLGGQVWGNFLS
       ::::::::: ::.::.:..::: .: ::.:::::.:::::::: ::  ..  ::: : : 
XP_016 HDTNMRAKGTPEKVFTVSNIKTPKQMDEFIEIQSSTGTWYQRWLVRFKTIFKQVWDNALY
              330       340       350       360       370       380

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pF1KSD C-FGPEYRRITLMMMGVWFTMSFSYYGLTVWFPDMIRHLQAVDYASRTKVFPGERVEHVT
       : .:: ::  ::..  :::.:.:::::::::::::::..:  .: :. ::: ::.:  .:
XP_016 CVMGP-YRMNTLILAVVWFAMAFSYYGLTVWFPDMIRYFQDEEYKSKMKVFFGEHVYGAT
               390       400       410       420       430         

        500       510       520       530       540       550      
pF1KSD FNFTLENQIHRGGQYFNDKFIGLRLKSVSFEDSLFEECYFEDVTSSNTFFRNCTFINTVF
       .:::.:::::. :.  ::::  . .: : :::..:.:::::::::..:.:.:::. .:.:
XP_016 INFTMENQIHQHGKLVNDKFTRMYFKHVLFEDTFFDECYFEDVTSTDTYFKNCTIESTIF
     440       450       460       470       480       490         

        560       570       580       590       600       610      
pF1KSD YNTDLFEYKFVNSRLINSTFLHNKEGCPLDVTGTGEGAYMVYFVSFLGTLAVLPGNIVSA
       :::::.:.::.: :.::::::..:::: .:.   ..  ...:.:::::.:.::::::.::
XP_016 YNTDLYEHKFINCRFINSTFLEQKEGCHMDLEQDND--FLIYLVSFLGSLSVLPGNIISA
     500       510       520       530         540       550       

        620       630       640       650       660       670      
pF1KSD LLMDKIGRLRMLAGSSVMSCVSCFFLSFGNSESAMIALLCLFGGVSIASWNALDVLTVEL
       ::::.::::.:..:: ..: : :::: :::::::::.  ::: :.:::.::::::.::::
XP_016 LLMDRIGRLKMIGGSMLISAVCCFFLFFGNSESAMIGWQCLFCGTSIAAWNALDVITVEL
       560       570       580       590       600       610       

        680       690       700       710       720       730      
pF1KSD YPSDKRTTAFGFLNALCKLAAVLGISIFTSFVGITKAAPILFASAALALGSSLALKLPET
       ::...:.::::.::.:::..:.:: .::.:::::::..:::.:.:.:. :. .::.::::
XP_016 YPTNQRATAFGILNGLCKFGAILGNTIFASFVGITKVVPILLAAASLVGGGLIALRLPET
       620       630       640       650       660       670       

        740  
pF1KSD RGQVLQ
       : ::: 
XP_016 REQVLM
       680   

>>NP_001309968 (OMIM: 185861) synaptic vesicle glycoprot  (683 aa)
 initn: 2988 init1: 2187 opt: 2849  Z-score: 2446.3  bits: 463.2 E(85289): 1.6e-129
Smith-Waterman score: 3027; 64.0% identity (85.9% similar) in 695 aa overlap (49-741:4-682)

       20        30        40        50        60        70        
pF1KSD AKEVKKHAAKKVVKGLDRVQDEYSRRSYSRFEEEDDDDDFPAPSDGYYRGEGTQDEEEGG
                                     .. .:.   . :::::::::. .. ::.  
NP_001                            MDDYKYQDNYGGY-APSDGYYRGNESNPEED--
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pF1KSD ASSDATEGHDEDDEIYEGEYQGIPRAES-GGKGERMADGAPLAGVRGGLSDGEGPPGGRG
       :.::.::::::.::::::::::::. ..  .:  .::  . . ..::  .:         
NP_001 AQSDVTEGHDEEDEIYEGEYQGIPHPDDVKAKQAKMAP-SRMDSLRGQ-TDLM-------
               40        50        60         70         80        

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pF1KSD EAQRRKEREELAQQYEAILRECGHGRFQWTLYFVLGLALMADGVEVFVVGFVLPSAEKDM
        :.: ...:.::.:::.:. ::::::::: :.:::::::::::::::::.:.::::::::
NP_001 -AERLEDEEQLAHQYETIMDECGHGRFQWILFFVLGLALMADGVEVFVVSFALPSAEKDM
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       :::.:.:::::.:::::::.:::. :::::.:::.. : .::.::. :: .::::::::.
NP_001 CLSSSKKGMLGMIVYLGMMAGAFILGGLADKLGRKRVLSMSLAVNASFASLSSFVQGYGA
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pF1KSD FLFCRLLSGVGIGGSIPIVFSYFSEFLAQEKRGEHLSWLCMFWMIGGVYAAAMAWAIIPH
       ::::::.::.::::..::::.::::::..:::::::::: .::: ::.::.::::.::::
NP_001 FLFCRLISGIGIGGALPIVFAYFSEFLSREKRGEHLSWLGIFWMTGGLYASAMAWSIIPH
              210       220       230       240       250       260

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pF1KSD YGWSFQMGSAYQFHSWRVFVLVCAFPSVFAIGALTTQPESPRFFLENGKHDEAWMVLKQV
       :::.:.::. :.::::::::.:::.: . .. ::  .::::::.:: ::::::::.::::
NP_001 YGWGFSMGTNYHFHSWRVFVIVCALPCTVSMVALKFMPESPRFLLEMGKHDEAWMILKQV
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pF1KSD HDTNMRAKGHPERVFSVTHIKTIHQEDELIEIQSDTGTWYQRWGVRALSLGGQVWGNFLS
       ::::::::: ::.::.:..::: .: ::.:::::.:::::::: ::  ..  ::: : : 
NP_001 HDTNMRAKGTPEKVFTVSNIKTPKQMDEFIEIQSSTGTWYQRWLVRFKTIFKQVWDNALY
              330       340       350       360       370       380

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pF1KSD C-FGPEYRRITLMMMGVWFTMSFSYYGLTVWFPDMIRHLQAVDYASRTKVFPGERVEHVT
       : .:: ::  ::..  :::.:.:::::::::::::::..:  .: :. ::: ::.:  .:
NP_001 CVMGP-YRMNTLILAVVWFAMAFSYYGLTVWFPDMIRYFQDEEYKSKMKVFFGEHVYGAT
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pF1KSD FNFTLENQIHRGGQYFNDKFIGLRLKSVSFEDSLFEECYFEDVTSSNTFFRNCTFINTVF
       .:::.:::::. :.  ::::  . .: : :::..:.:::::::::..:.:.:::. .:.:
NP_001 INFTMENQIHQHGKLVNDKFTRMYFKHVLFEDTFFDECYFEDVTSTDTYFKNCTIESTIF
     440       450       460       470       480       490         

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pF1KSD YNTDLFEYKFVNSRLINSTFLHNKEGCPLDVTGTGEGAYMVYFVSFLGTLAVLPGNIVSA
       :::::.:.::.: :.::::::..:::: .:.   ..  ...:.:::::.:.::::::.::
NP_001 YNTDLYEHKFINCRFINSTFLEQKEGCHMDLEQDND--FLIYLVSFLGSLSVLPGNIISA
     500       510       520       530         540       550       

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pF1KSD LLMDKIGRLRMLAGSSVMSCVSCFFLSFGNSESAMIALLCLFGGVSIASWNALDVLTVEL
       ::::.::::.:..:: ..: : :::: :::::::::.  ::: :.:::.::::::.::::
NP_001 LLMDRIGRLKMIGGSMLISAVCCFFLFFGNSESAMIGWQCLFCGTSIAAWNALDVITVEL
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pF1KSD YPSDKRTTAFGFLNALCKLAAVLGISIFTSFVGITKAAPILFASAALALGSSLALKLPET
       ::...:.::::.::.:::..:.:: .::.:::::::..:::.:.:.:. :. .::.::::
NP_001 YPTNQRATAFGILNGLCKFGAILGNTIFASFVGITKVVPILLAAASLVGGGLIALRLPET
       620       630       640       650       660       670       

        740  
pF1KSD RGQVLQ
       : ::: 
NP_001 REQVLM
       680   

>>XP_016878251 (OMIM: 185861) PREDICTED: synaptic vesicl  (683 aa)
 initn: 2988 init1: 2187 opt: 2849  Z-score: 2446.3  bits: 463.2 E(85289): 1.6e-129
Smith-Waterman score: 3027; 64.0% identity (85.9% similar) in 695 aa overlap (49-741:4-682)

       20        30        40        50        60        70        
pF1KSD AKEVKKHAAKKVVKGLDRVQDEYSRRSYSRFEEEDDDDDFPAPSDGYYRGEGTQDEEEGG
                                     .. .:.   . :::::::::. .. ::.  
XP_016                            MDDYKYQDNYGGY-APSDGYYRGNESNPEED--
                                          10         20        30  

       80        90       100        110       120       130       
pF1KSD ASSDATEGHDEDDEIYEGEYQGIPRAES-GGKGERMADGAPLAGVRGGLSDGEGPPGGRG
       :.::.::::::.::::::::::::. ..  .:  .::  . . ..::  .:         
XP_016 AQSDVTEGHDEEDEIYEGEYQGIPHPDDVKAKQAKMAP-SRMDSLRGQ-TDLM-------
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       140       150       160       170       180       190       
pF1KSD EAQRRKEREELAQQYEAILRECGHGRFQWTLYFVLGLALMADGVEVFVVGFVLPSAEKDM
        :.: ...:.::.:::.:. ::::::::: :.:::::::::::::::::.:.::::::::
XP_016 -AERLEDEEQLAHQYETIMDECGHGRFQWILFFVLGLALMADGVEVFVVSFALPSAEKDM
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pF1KSD CLSDSNKGMLGLIVYLGMMVGAFLWGGLADRLGRRQCLLISLSVNSVFAFFSSFVQGYGT
       :::.:.:::::.:::::::.:::. :::::.:::.. : .::.::. :: .::::::::.
XP_016 CLSSSKKGMLGMIVYLGMMAGAFILGGLADKLGRKRVLSMSLAVNASFASLSSFVQGYGA
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pF1KSD FLFCRLLSGVGIGGSIPIVFSYFSEFLAQEKRGEHLSWLCMFWMIGGVYAAAMAWAIIPH
       ::::::.::.::::..::::.::::::..:::::::::: .::: ::.::.::::.::::
XP_016 FLFCRLISGIGIGGALPIVFAYFSEFLSREKRGEHLSWLGIFWMTGGLYASAMAWSIIPH
              210       220       230       240       250       260

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pF1KSD YGWSFQMGSAYQFHSWRVFVLVCAFPSVFAIGALTTQPESPRFFLENGKHDEAWMVLKQV
       :::.:.::. :.::::::::.:::.: . .. ::  .::::::.:: ::::::::.::::
XP_016 YGWGFSMGTNYHFHSWRVFVIVCALPCTVSMVALKFMPESPRFLLEMGKHDEAWMILKQV
              270       280       290       300       310       320

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pF1KSD HDTNMRAKGHPERVFSVTHIKTIHQEDELIEIQSDTGTWYQRWGVRALSLGGQVWGNFLS
       ::::::::: ::.::.:..::: .: ::.:::::.:::::::: ::  ..  ::: : : 
XP_016 HDTNMRAKGTPEKVFTVSNIKTPKQMDEFIEIQSSTGTWYQRWLVRFKTIFKQVWDNALY
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pF1KSD C-FGPEYRRITLMMMGVWFTMSFSYYGLTVWFPDMIRHLQAVDYASRTKVFPGERVEHVT
       : .:: ::  ::..  :::.:.:::::::::::::::..:  .: :. ::: ::.:  .:
XP_016 CVMGP-YRMNTLILAVVWFAMAFSYYGLTVWFPDMIRYFQDEEYKSKMKVFFGEHVYGAT
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pF1KSD FNFTLENQIHRGGQYFNDKFIGLRLKSVSFEDSLFEECYFEDVTSSNTFFRNCTFINTVF
       .:::.:::::. :.  ::::  . .: : :::..:.:::::::::..:.:.:::. .:.:
XP_016 INFTMENQIHQHGKLVNDKFTRMYFKHVLFEDTFFDECYFEDVTSTDTYFKNCTIESTIF
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pF1KSD YNTDLFEYKFVNSRLINSTFLHNKEGCPLDVTGTGEGAYMVYFVSFLGTLAVLPGNIVSA
       :::::.:.::.: :.::::::..:::: .:.   ..  ...:.:::::.:.::::::.::
XP_016 YNTDLYEHKFINCRFINSTFLEQKEGCHMDLEQDND--FLIYLVSFLGSLSVLPGNIISA
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pF1KSD LLMDKIGRLRMLAGSSVMSCVSCFFLSFGNSESAMIALLCLFGGVSIASWNALDVLTVEL
       ::::.::::.:..:: ..: : :::: :::::::::.  ::: :.:::.::::::.::::
XP_016 LLMDRIGRLKMIGGSMLISAVCCFFLFFGNSESAMIGWQCLFCGTSIAAWNALDVITVEL
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pF1KSD YPSDKRTTAFGFLNALCKLAAVLGISIFTSFVGITKAAPILFASAALALGSSLALKLPET
       ::...:.::::.::.:::..:.:: .::.:::::::..:::.:.:.:. :. .::.::::
XP_016 YPTNQRATAFGILNGLCKFGAILGNTIFASFVGITKVVPILLAAASLVGGGLIALRLPET
       620       630       640       650       660       670       

        740  
pF1KSD RGQVLQ
       : ::: 
XP_016 REQVLM
       680   

>>NP_001309960 (OMIM: 185861) synaptic vesicle glycoprot  (683 aa)
 initn: 2988 init1: 2187 opt: 2849  Z-score: 2446.3  bits: 463.2 E(85289): 1.6e-129
Smith-Waterman score: 3027; 64.0% identity (85.9% similar) in 695 aa overlap (49-741:4-682)

       20        30        40        50        60        70        
pF1KSD AKEVKKHAAKKVVKGLDRVQDEYSRRSYSRFEEEDDDDDFPAPSDGYYRGEGTQDEEEGG
                                     .. .:.   . :::::::::. .. ::.  
NP_001                            MDDYKYQDNYGGY-APSDGYYRGNESNPEED--
                                          10         20        30  

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pF1KSD ASSDATEGHDEDDEIYEGEYQGIPRAES-GGKGERMADGAPLAGVRGGLSDGEGPPGGRG
       :.::.::::::.::::::::::::. ..  .:  .::  . . ..::  .:         
NP_001 AQSDVTEGHDEEDEIYEGEYQGIPHPDDVKAKQAKMAP-SRMDSLRGQ-TDLM-------
               40        50        60         70         80        

       140       150       160       170       180       190       
pF1KSD EAQRRKEREELAQQYEAILRECGHGRFQWTLYFVLGLALMADGVEVFVVGFVLPSAEKDM
        :.: ...:.::.:::.:. ::::::::: :.:::::::::::::::::.:.::::::::
NP_001 -AERLEDEEQLAHQYETIMDECGHGRFQWILFFVLGLALMADGVEVFVVSFALPSAEKDM
               90       100       110       120       130       140

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pF1KSD CLSDSNKGMLGLIVYLGMMVGAFLWGGLADRLGRRQCLLISLSVNSVFAFFSSFVQGYGT
       :::.:.:::::.:::::::.:::. :::::.:::.. : .::.::. :: .::::::::.
NP_001 CLSSSKKGMLGMIVYLGMMAGAFILGGLADKLGRKRVLSMSLAVNASFASLSSFVQGYGA
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pF1KSD FLFCRLLSGVGIGGSIPIVFSYFSEFLAQEKRGEHLSWLCMFWMIGGVYAAAMAWAIIPH
       ::::::.::.::::..::::.::::::..:::::::::: .::: ::.::.::::.::::
NP_001 FLFCRLISGIGIGGALPIVFAYFSEFLSREKRGEHLSWLGIFWMTGGLYASAMAWSIIPH
              210       220       230       240       250       260

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pF1KSD YGWSFQMGSAYQFHSWRVFVLVCAFPSVFAIGALTTQPESPRFFLENGKHDEAWMVLKQV
       :::.:.::. :.::::::::.:::.: . .. ::  .::::::.:: ::::::::.::::
NP_001 YGWGFSMGTNYHFHSWRVFVIVCALPCTVSMVALKFMPESPRFLLEMGKHDEAWMILKQV
              270       280       290       300       310       320

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       : .:: ::  ::..  :::.:.:::::::::::::::..:  .: :. ::: ::.:  .:
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       .:::.:::::. :.  ::::  . .: : :::..:.:::::::::..:.:.:::. .:.:
NP_001 INFTMENQIHQHGKLVNDKFTRMYFKHVLFEDTFFDECYFEDVTSTDTYFKNCTIESTIF
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       :::::.:.::.: :.::::::..:::: .:.   ..  ...:.:::::.:.::::::.::
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