Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0694
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0694, 593 aa
  1>>>pF1KSDA0694 593 - 593 aa - 593 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1349+/-0.000894; mu= 14.8880+/- 0.054
 mean_var=77.0813+/-15.476, 0's: 0 Z-trim(106.5): 41  B-trim: 2 in 1/51
 Lambda= 0.146083
 statistics sampled from 8977 (9008) to 8977 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.636), E-opt: 0.2 (0.277), width:  16
 Scan time:  2.930

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS46528.1 DOCK10 gene_id:55619|Hs108|chr2        (2186) 3712 792.2       0
CCDS74661.1 DOCK10 gene_id:55619|Hs108|chr2        (2180) 3460 739.1 1.3e-212
CCDS35373.1 DOCK11 gene_id:139818|Hs108|chrX       (2073)  612 138.9 6.2e-32
CCDS45063.1 DOCK9 gene_id:23348|Hs108|chr13        (1253)  548 125.3 4.6e-28
CCDS76645.1 DOCK9 gene_id:23348|Hs108|chr13        (1254)  548 125.3 4.6e-28
CCDS45062.1 DOCK9 gene_id:23348|Hs108|chr13        (2068)  548 125.4 7.1e-28


>>CCDS46528.1 DOCK10 gene_id:55619|Hs108|chr2             (2186 aa)
 initn: 3712 init1: 3712 opt: 3712  Z-score: 4217.3  bits: 792.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3712; 99.8% identity (99.8% similar) in 564 aa overlap (1-564:1-564)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAGERTRRFTRSLLRPGQAAELRHSAASAAAVAVSSRQQQRQEKPRLLEPLDYETVIEEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MAGERTRRFTRSLLRPGQAAELRHSAASAAAVAVSSRQQQRQEKPRLLEPLDYETVIEEL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD EKTYRNDPLQDLLFFPSDDFSAATVSWDIRTLYSTVPEDAEHKAENLLVKEACKFYSSQW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EKTYRNDPLQDLLFFPSDDFSAATVSWDIRTLYSTVPEDAEHKAENLLVKEACKFYSSQW
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD HVVNYKYEQYSGDIRQLPRAEYKPEKLPSHSFEIDHEDADKDEDTTSHSSSKGGGGAGGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HVVNYKYEQYSGDIRQLPRAEYKPEKLPSHSFEIDHEDADKDEDTTSHSSSKGGGGAGGT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD GVFKSGWLYKGNFNSTVNNTVTVRSFKKRYFQLTQLPDNSYIMNFYKDEKISKEPKGCIF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GVFKSGWLYKGNFNSTVNNTVTVRSFKKRYFQLTQLPDNSYIMNFYKDEKISKEPKGCIF
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD LDSCTGVVQNNRLRKYAFELKMNDLTYFVLAAETESDMDEWIHTLNRILQISPEGPLQGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LDSCTGVVQNNRLRKYAFELKMNDLTYFVLAAETESDMDEWIHTLNRILQISPEGPLQGR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD RSTELTDLGLDSLDNSVTCECTPEETDSSENNLHADFAKYLTETEDTVKTTRNMERLNLF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RSTELTDLGLDSLDNSVTCECTPEETDSSENNLHADFAKYLTETEDTVKTTRNMERLNLF
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD SLDPDIDTLKLQKKDLLEPESVIKPFEEKAAKRIMIICKALNSNLQGCVTENENDPITNI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SLDPDIDTLKLQKKDLLEPESVIKPFEEKAAKRIMIICKALNSNLQGCVTENENDPITNI
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD EPFFVSVALYDLRDSRKISADFHVDLNHAAVRQMLLGASVALENGNIDTITPRQSEEPHI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EPFFVSVALYDLRDSRKISADFHVDLNHAAVRQMLLGASVALENGNIDTITPRQSEEPHI
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD KGLPEEWLKFPKQAVFSVSNPHSEIVLVAKIEKVLMGNIASGAEPYIKNPDSNKYAQKIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KGLPEEWLKFPKQAVFSVSNPHSEIVLVAKIEKVLMGNIASGAEPYIKNPDSNKYAQKIL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590          
pF1KSD KSNRQFCSKLGKYRMPFAWAVRYVDSCSQQTRNTFNGGIGSFSFERFCVAYYF       
       :::::::::::::::::::::: :                                    
CCDS46 KSNRQFCSKLGKYRMPFAWAVRSVFKDNQGNVDRDSRFSPLFRQESSKISTEDLVKLVSD
              550       560       570       580       590       600

>>CCDS74661.1 DOCK10 gene_id:55619|Hs108|chr2             (2180 aa)
 initn: 3460 init1: 3460 opt: 3460  Z-score: 3930.3  bits: 739.1 E(32554): 1.3e-212
Smith-Waterman score: 3460; 99.8% identity (99.8% similar) in 523 aa overlap (42-564:36-558)

              20        30        40        50        60        70 
pF1KSD SLLRPGQAAELRHSAASAAAVAVSSRQQQRQEKPRLLEPLDYETVIEELEKTYRNDPLQD
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KVFKREPSEFWKKRRTVRRVNQEEIHRFSSQEKPRLLEPLDYETVIEELEKTYRNDPLQD
          10        20        30        40        50        60     

              80        90       100       110       120       130 
pF1KSD LLFFPSDDFSAATVSWDIRTLYSTVPEDAEHKAENLLVKEACKFYSSQWHVVNYKYEQYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LLFFPSDDFSAATVSWDIRTLYSTVPEDAEHKAENLLVKEACKFYSSQWHVVNYKYEQYS
          70        80        90       100       110       120     

             140       150       160       170       180       190 
pF1KSD GDIRQLPRAEYKPEKLPSHSFEIDHEDADKDEDTTSHSSSKGGGGAGGTGVFKSGWLYKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GDIRQLPRAEYKPEKLPSHSFEIDHEDADKDEDTTSHSSSKGGGGAGGTGVFKSGWLYKG
         130       140       150       160       170       180     

             200       210       220       230       240       250 
pF1KSD NFNSTVNNTVTVRSFKKRYFQLTQLPDNSYIMNFYKDEKISKEPKGCIFLDSCTGVVQNN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 NFNSTVNNTVTVRSFKKRYFQLTQLPDNSYIMNFYKDEKISKEPKGCIFLDSCTGVVQNN
         190       200       210       220       230       240     

             260       270       280       290       300       310 
pF1KSD RLRKYAFELKMNDLTYFVLAAETESDMDEWIHTLNRILQISPEGPLQGRRSTELTDLGLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RLRKYAFELKMNDLTYFVLAAETESDMDEWIHTLNRILQISPEGPLQGRRSTELTDLGLD
         250       260       270       280       290       300     

             320       330       340       350       360       370 
pF1KSD SLDNSVTCECTPEETDSSENNLHADFAKYLTETEDTVKTTRNMERLNLFSLDPDIDTLKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SLDNSVTCECTPEETDSSENNLHADFAKYLTETEDTVKTTRNMERLNLFSLDPDIDTLKL
         310       320       330       340       350       360     

             380       390       400       410       420       430 
pF1KSD QKKDLLEPESVIKPFEEKAAKRIMIICKALNSNLQGCVTENENDPITNIEPFFVSVALYD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QKKDLLEPESVIKPFEEKAAKRIMIICKALNSNLQGCVTENENDPITNIEPFFVSVALYD
         370       380       390       400       410       420     

             440       450       460       470       480       490 
pF1KSD LRDSRKISADFHVDLNHAAVRQMLLGASVALENGNIDTITPRQSEEPHIKGLPEEWLKFP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LRDSRKISADFHVDLNHAAVRQMLLGASVALENGNIDTITPRQSEEPHIKGLPEEWLKFP
         430       440       450       460       470       480     

             500       510       520       530       540       550 
pF1KSD KQAVFSVSNPHSEIVLVAKIEKVLMGNIASGAEPYIKNPDSNKYAQKILKSNRQFCSKLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KQAVFSVSNPHSEIVLVAKIEKVLMGNIASGAEPYIKNPDSNKYAQKILKSNRQFCSKLG
         490       500       510       520       530       540     

             560       570       580       590                     
pF1KSD KYRMPFAWAVRYVDSCSQQTRNTFNGGIGSFSFERFCVAYYF                  
       ::::::::::: :                                               
CCDS74 KYRMPFAWAVRSVFKDNQGNVDRDSRFSPLFRQESSKISTEDLVKLVSDYRRADRISKMQ
         550       560       570       580       590       600     

>>CCDS35373.1 DOCK11 gene_id:139818|Hs108|chrX            (2073 aa)
 initn: 1601 init1: 438 opt: 612  Z-score: 686.8  bits: 138.9 E(32554): 6.2e-32
Smith-Waterman score: 1695; 48.9% identity (74.1% similar) in 560 aa overlap (7-564:5-534)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAGERTRRFTRSLLRPGQAAELRHSAASAAAVAVSSRQQQRQEKPRLLEPLDYETVIEEL
             :.::. : .:: :::::.:.. :.      : .   :: ...::::::.:: . 
CCDS35   MAEVRKFTKRLSKPGTAAELRQSVSEAV------RGSVVLEKAKVVEPLDYENVIAQR
                 10        20              30        40        50  

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD EKTYRNDPLQDLLFFPSDDFSAATVSWDIRTLYSTVPEDAEHKAENLLVKEACKFYSSQW
       .    .:::.:::.:: .:.: .... . ::. ::::::::..:..:.:::  : ::..:
CCDS35 KTQIYSDPLRDLLMFPMEDISISVIGRQRRTVQSTVPEDAEKRAQSLFVKECIKTYSTDW
             60        70        80        90       100       110  

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD HVVNYKYEQYSGDIRQLPRAEYKPEKLPSHSFEIDHEDADKDEDTTSHSSSKGGGGAGGT
       ::::::::..:::.:.::    .:::.:.: :::: :: .::::..:  :.::       
CCDS35 HVVNYKYEDFSGDFRMLPCKSLRPEKIPNHVFEID-EDCEKDEDSSSLCSQKG-------
            120       130       140        150       160           

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD GVFKSGWLYKGNFNSTVNNTVTVRSFKKRYFQLTQLPDNSYIMNFYKDEKISKEPKGCIF
       ::.:.:::.:.: :::.  :::.. ::.::: ::::::.:::.: ::::: ::: ::::.
CCDS35 GVIKQGWLHKANVNSTI--TVTMKVFKRRYFYLTQLPDGSYILNSYKDEKNSKESKGCIY
          170       180         190       200       210       220  

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD LDSCTGVVQNNRLRKYAFELKMNDLTYFVLAAETESDMDEWIHTLNRILQISPEGPLQGR
       ::.:  :::  ..:..:::::: :     ::::::..:.::. ::..:.::. .. .: .
CCDS35 LDACIDVVQCPKMRRHAFELKMLDKYSHYLAAETEQEMEEWLITLKKIIQINTDSLVQEK
            230       240       250       260       270       280  

              310       320        330       340       350         
pF1KSD RSTELTDLGLDSLDNSVTCECTPEETDSS-ENNLHADFAKYLTETEDTVKTTRNMERLNL
       . :  :     . :. .. .   :.  .: : ..: .. ::  :::.  : .:.  : ::
CCDS35 KETVET-----AQDDETSSQGKAENIMASLERSMHPELMKYGRETEQLNKLSRGDGRQNL
                 290       300       310       320       330       

     360       370       380       390       400       410         
pF1KSD FSLDPDIDTLKLQKKDLLEPESVIKPFEEKAAKRIMIICKALNSNLQGCVTENENDPITN
       ::.: ... : ..    .::.  :::::::  ::... :. :. :. : . .: . : ::
CCDS35 FSFDSEVQRLDFSG---IEPD--IKPFEEKCNKRFLVNCHDLTFNILGQIGDNAKGPPTN
       340       350            360       370       380       390  

     420       430       440       450       460       470         
pF1KSD IEPFFVSVALYDLRDSRKISADFHVDLNHAAVRQMLLGASVALENGNIDTITPR-QSEEP
       .::::...::.:.... :::::::::::  .::.:: :.:. : . .    .:. .: : 
CCDS35 VEPFFINLALFDVKNNCKISADFHVDLNPPSVREMLWGSSTQLASDG----SPKGSSPES
            400       410       420       430           440        

      480       490       500       510       520       530        
pF1KSD HIKGLPEEWLKFPKQAVFSVSNPHSEIVLVAKIEKVLMGNIASGAEPYIKNPDSNKYAQK
       .:.:. :  :.. .:..:::.::: :: :::.:::::.:::.  ::::::: :  : :::
CCDS35 YIHGIAESQLRYIQQGIFSVTNPHPEIFLVARIEKVLQGNITHCAEPYIKNSDPVKTAQK
      450       460       470       480       490       500        

      540       550       560       570       580       590        
pF1KSD ILKSNRQFCSKLGKYRMPFAWAVRYVDSCSQQTRNTFNGGIGSFSFERFCVAYYF     
       . .. .: ::.::.::::::::.: .                                  
CCDS35 VHRTAKQVCSRLGQYRMPFAWAARPIFKDTQGSLDLDGRFSPLYKQDSSKLSSEDILKLL
      510       520       530       540       550       560        

>>CCDS45063.1 DOCK9 gene_id:23348|Hs108|chr13             (1253 aa)
 initn: 1525 init1: 449 opt: 548  Z-score: 617.4  bits: 125.3 E(32554): 4.6e-28
Smith-Waterman score: 1622; 47.2% identity (71.6% similar) in 578 aa overlap (1-573:1-542)

               10         20        30        40        50         
pF1KSD MAGERTRRFTRSLLRPGQA-AELRHSAASAAAVAVSSRQQQRQEKPRLLEPLDYETVIEE
       : ... :  .::. .     . :... :. . : . :       ::.:.::::::.:: .
CCDS45 MQADKCRTSSRSVKKELVIESPLQYKDAAQGEVEAES-PGPVPAKPKLIEPLDYENVIVQ
               10        20        30         40        50         

      60        70        80        90       100       110         
pF1KSD LEKTYRNDPLQDLLFFPSDDFSAATVSWDIRTLYSTVPEDAEHKAENLLVKEACKFYSSQ
        .    :: :...:.:: :::..: .  . : . ::::  ::..:..:.: :  : :.:.
CCDS45 KKTQILNDCLREMLLFPYDDFQTAILRRQGRYICSTVPAKAEEEAQSLFVTECIKTYNSD
      60        70        80        90       100       110         

     120       130       140       150       160       170         
pF1KSD WHVVNYKYEQYSGDIRQLPRAEYKPEKLPSHSFEIDHEDADKDEDTTSHSSSKGGGGAGG
       ::.::::::.:::..::::    : .::: : .:.: :..:::::..: .:.:::     
CCDS45 WHLVNYKYEDYSGEFRQLPNKVVKLDKLPVHVYEVD-EEVDKDEDAASLGSQKGG-----
     120       130       140       150        160       170        

     180       190       200       210       220       230         
pF1KSD TGVFKSGWLYKGNFNSTVNNTVTVRSFKKRYFQLTQLPDNSYIMNFYKDEKISKEPKGCI
         . : :::::::.::..  .::.::::.:.:.: :: :.:: .:::::::::::::: :
CCDS45 --ITKHGWLYKGNMNSAI--SVTMRSFKRRFFHLIQLGDGSYNLNFYKDEKISKEPKGSI
             180         190       200       210       220         

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pF1KSD FLDSCTGVVQNNRLRKYAFELKMNDLTYFVLAAETESDMDEWIHTLNRILQISPEGPLQG
       ::::: ::::::..:..::::::.: . ..:::..: .:.:::  ::.:::.. :. .: 
CCDS45 FLDSCMGVVQNNKVRRFAFELKMQDKSSYLLAADSEVEMEEWITILNKILQLNFEAAMQE
     230       240       250       260       270       280         

     300       310       320       330       340       350         
pF1KSD RRSTELTDLGLDSLDNSVTCECTPEETDSSENNLHADFAKYLTETEDTVKTTRNMERLNL
       .:.        :: ...   .   : . :. ..   ..::   :.:  .:.     :..:
CCDS45 KRNG-------DSHEDDEQSKL--EGSGSGLDSYLPELAKSAREAEIKLKSES---RVKL
     290              300         310       320       330          

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pF1KSD FSLDPDIDTLKLQKKDLLEPESVIKPFEEKAAKRIMIICKALNSNLQGCVTENENDPITN
       : ::::      :: :.   :  .: :::: .:::.. :. :. ::: ::.:::. : ::
CCDS45 FYLDPDA-----QKLDFSSAEPEVKSFEEKFGKRILVKCNDLSFNLQCCVAENEEGPTTN
       340            350       360       370       380       390  

     420       430       440       450       460       470         
pF1KSD IEPFFVSVALYDLRDSRKISADFHVDLNHAAVRQMLLGASVALENGNIDTITPRQSEEPH
       .:::::...:.:.. .::::::::::::: .:::::  .: :: ::.        .. : 
CCDS45 VEPFFVTLSLFDIKYNRKISADFHVDLNHFSVRQMLATTSPALMNGS--------GQSPS
            400       410       420       430               440    

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pF1KSD I-KG-LPEEWLKFPKQAVFSVSNPHSEIVLVAKIEKVLMGNIASGAEPYIKNPDSNKYAQ
       . :: : :  ...:::..:::. :: .: :::.:::::.:.:.  ::::.:. ::.: ::
CCDS45 VLKGILHEAAMQYPKQGIFSVTCPHPDIFLVARIEKVLQGSITHCAEPYMKSSDSSKVAQ
          450       460       470       480       490       500    

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pF1KSD KILKSNRQFCSKLGKYRMPFAWAVR--YVDSCSQQTRNTFNGGIGSFSFERFCVAYYF  
       :.::. .: :..::.::::::::.:  . :. ..  .:                      
CCDS45 KVLKNAKQACQRLGQYRMPFAWAARTLFKDASGNLDKNARFSAIYRQDSNKLSNDDMLKL
          510       520       530       540       550       560    

CCDS45 LADFRKPEKMAKLPVILGNLDITIDNVSSDFPNYVNSSYIPTKQFETCSKTPITFEVEEF
          570       580       590       600       610       620    

>>CCDS76645.1 DOCK9 gene_id:23348|Hs108|chr13             (1254 aa)
 initn: 1604 init1: 449 opt: 548  Z-score: 617.4  bits: 125.3 E(32554): 4.6e-28
Smith-Waterman score: 1688; 48.8% identity (72.9% similar) in 576 aa overlap (2-573:9-543)

                      10        20        30        40        50   
pF1KSD        MAGERTRRFTRSLLRPGQAAELRHSAASAAAVAVSSRQQQRQEKPRLLEPLDY
               :. .::.:::.: .:: :::::.:.. ..      : .    ::.:.:::::
CCDS76 MSQPPLLPASAETRKFTRALSKPGTAAELRQSVSEVV------RGSVLLAKPKLIEPLDY
               10        20        30              40        50    

            60        70        80        90       100       110   
pF1KSD ETVIEELEKTYRNDPLQDLLFFPSDDFSAATVSWDIRTLYSTVPEDAEHKAENLLVKEAC
       :.:: . .    :: :...:.:: :::..: .  . : . ::::  ::..:..:.: :  
CCDS76 ENVIVQKKTQILNDCLREMLLFPYDDFQTAILRRQGRYICSTVPAKAEEEAQSLFVTECI
           60        70        80        90       100       110    

           120       130       140       150       160       170   
pF1KSD KFYSSQWHVVNYKYEQYSGDIRQLPRAEYKPEKLPSHSFEIDHEDADKDEDTTSHSSSKG
       : :.:.::.::::::.:::..::::    : .::: : .:.: :..:::::..: .:.::
CCDS76 KTYNSDWHLVNYKYEDYSGEFRQLPNKVVKLDKLPVHVYEVD-EEVDKDEDAASLGSQKG
          120       130       140       150        160       170   

           180       190       200       210       220       230   
pF1KSD GGGAGGTGVFKSGWLYKGNFNSTVNNTVTVRSFKKRYFQLTQLPDNSYIMNFYKDEKISK
       :       . : :::::::.::..  .::.::::.:.:.: :: :.:: .::::::::::
CCDS76 G-------ITKHGWLYKGNMNSAI--SVTMRSFKRRFFHLIQLGDGSYNLNFYKDEKISK
                  180       190         200       210       220    

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pF1KSD EPKGCIFLDSCTGVVQNNRLRKYAFELKMNDLTYFVLAAETESDMDEWIHTLNRILQISP
       :::: :::::: ::::::..:..::::::.: . ..:::..: .:.:::  ::.:::.. 
CCDS76 EPKGSIFLDSCMGVVQNNKVRRFAFELKMQDKSSYLLAADSEVEMEEWITILNKILQLNF
          230       240       250       260       270       280    

           300       310       320       330       340       350   
pF1KSD EGPLQGRRSTELTDLGLDSLDNSVTCECTPEETDSSENNLHADFAKYLTETEDTVKTTRN
       :. .: .:.        :: ...   .   : . :. ..   ..::   :.:  .:.   
CCDS76 EAAMQEKRNG-------DSHEDDEQSKL--EGSGSGLDSYLPELAKSAREAEIKLKSES-
          290              300         310       320       330     

           360       370       380       390       400       410   
pF1KSD MERLNLFSLDPDIDTLKLQKKDLLEPESVIKPFEEKAAKRIMIICKALNSNLQGCVTENE
         :..:: ::::      :: :.   :  .: :::: .:::.. :. :. ::: ::.:::
CCDS76 --RVKLFYLDPDA-----QKLDFSSAEPEVKSFEEKFGKRILVKCNDLSFNLQCCVAENE
            340            350       360       370       380       

           420       430       440       450       460       470   
pF1KSD NDPITNIEPFFVSVALYDLRDSRKISADFHVDLNHAAVRQMLLGASVALENGNIDTITPR
       . : ::.:::::...:.:.. .::::::::::::: .:::::  .: :: ::.       
CCDS76 EGPTTNVEPFFVTLSLFDIKYNRKISADFHVDLNHFSVRQMLATTSPALMNGS-------
       390       400       410       420       430       440       

           480         490       500       510       520       530 
pF1KSD QSEEPHI-KG-LPEEWLKFPKQAVFSVSNPHSEIVLVAKIEKVLMGNIASGAEPYIKNPD
        .. : . :: : :  ...:::..:::. :: .: :::.:::::.:.:.  ::::.:. :
CCDS76 -GQSPSVLKGILHEAAMQYPKQGIFSVTCPHPDIFLVARIEKVLQGSITHCAEPYMKSSD
               450       460       470       480       490         

             540       550       560         570       580         
pF1KSD SNKYAQKILKSNRQFCSKLGKYRMPFAWAVR--YVDSCSQQTRNTFNGGIGSFSFERFCV
       :.: :::.::. .: :..::.::::::::.:  . :. ..  .:                
CCDS76 SSKVAQKVLKNAKQACQRLGQYRMPFAWAARTLFKDASGNLDKNARFSAIYRQDSNKLSN
     500       510       520       530       540       550         

     590                                                           
pF1KSD AYYF                                                        
                                                                   
CCDS76 DDMLKLLADFRKPEKMAKLPVILGNLDITIDNVSSDFPNYVNSSYIPTKQFETCSKTPIT
     560       570       580       590       600       610         

>>CCDS45062.1 DOCK9 gene_id:23348|Hs108|chr13             (2068 aa)
 initn: 1525 init1: 449 opt: 548  Z-score: 613.9  bits: 125.4 E(32554): 7.1e-28
Smith-Waterman score: 1622; 47.2% identity (71.6% similar) in 578 aa overlap (1-573:1-542)

               10         20        30        40        50         
pF1KSD MAGERTRRFTRSLLRPGQA-AELRHSAASAAAVAVSSRQQQRQEKPRLLEPLDYETVIEE
       : ... :  .::. .     . :... :. . : . :       ::.:.::::::.:: .
CCDS45 MQADKCRTSSRSVKKELVIESPLQYKDAAQGEVEAES-PGPVPAKPKLIEPLDYENVIVQ
               10        20        30         40        50         

      60        70        80        90       100       110         
pF1KSD LEKTYRNDPLQDLLFFPSDDFSAATVSWDIRTLYSTVPEDAEHKAENLLVKEACKFYSSQ
        .    :: :...:.:: :::..: .  . : . ::::  ::..:..:.: :  : :.:.
CCDS45 KKTQILNDCLREMLLFPYDDFQTAILRRQGRYICSTVPAKAEEEAQSLFVTECIKTYNSD
      60        70        80        90       100       110         

     120       130       140       150       160       170         
pF1KSD WHVVNYKYEQYSGDIRQLPRAEYKPEKLPSHSFEIDHEDADKDEDTTSHSSSKGGGGAGG
       ::.::::::.:::..::::    : .::: : .:.: :..:::::..: .:.:::     
CCDS45 WHLVNYKYEDYSGEFRQLPNKVVKLDKLPVHVYEVD-EEVDKDEDAASLGSQKGG-----
     120       130       140       150        160       170        

     180       190       200       210       220       230         
pF1KSD TGVFKSGWLYKGNFNSTVNNTVTVRSFKKRYFQLTQLPDNSYIMNFYKDEKISKEPKGCI
         . : :::::::.::..  .::.::::.:.:.: :: :.:: .:::::::::::::: :
CCDS45 --ITKHGWLYKGNMNSAI--SVTMRSFKRRFFHLIQLGDGSYNLNFYKDEKISKEPKGSI
             180         190       200       210       220         

     240       250       260       270       280       290         
pF1KSD FLDSCTGVVQNNRLRKYAFELKMNDLTYFVLAAETESDMDEWIHTLNRILQISPEGPLQG
       ::::: ::::::..:..::::::.: . ..:::..: .:.:::  ::.:::.. :. .: 
CCDS45 FLDSCMGVVQNNKVRRFAFELKMQDKSSYLLAADSEVEMEEWITILNKILQLNFEAAMQE
     230       240       250       260       270       280         

     300       310       320       330       340       350         
pF1KSD RRSTELTDLGLDSLDNSVTCECTPEETDSSENNLHADFAKYLTETEDTVKTTRNMERLNL
       .:.        :: ...   .   : . :. ..   ..::   :.:  .:.     :..:
CCDS45 KRNG-------DSHEDDEQSKL--EGSGSGLDSYLPELAKSAREAEIKLKSES---RVKL
     290              300         310       320       330          

     360       370       380       390       400       410         
pF1KSD FSLDPDIDTLKLQKKDLLEPESVIKPFEEKAAKRIMIICKALNSNLQGCVTENENDPITN
       : ::::      :: :.   :  .: :::: .:::.. :. :. ::: ::.:::. : ::
CCDS45 FYLDPDA-----QKLDFSSAEPEVKSFEEKFGKRILVKCNDLSFNLQCCVAENEEGPTTN
       340            350       360       370       380       390  

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pF1KSD IEPFFVSVALYDLRDSRKISADFHVDLNHAAVRQMLLGASVALENGNIDTITPRQSEEPH
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