seq1 = pF1KSDA0677.tfa, 3192 bp
seq2 = pF1KSDA0677/gi568815597f_43553176.tfa (gi568815597f:43553176_43804367), 251192 bp

>pF1KSDA0677 3192
>gi568815597f:43553176_43804367 (Chr1)

1-138  (100001-100138)   100% ->
139-314  (102416-102591)   100% ->
315-429  (107123-107237)   100% ->
430-623  (109719-109912)   100% ->
624-673  (112521-112570)   100% ->
674-777  (113277-113380)   100% ->
778-915  (113779-113916)   100% ->
916-1163  (114597-114844)   100% ->
1164-1363  (115925-116124)   100% ->
1364-1734  (118330-118700)   99% ->
1735-1855  (130509-130629)   100% ->
1856-2037  (135739-135920)   100% ->
2038-2242  (137670-137874)   100% ->
2243-2319  (138321-138397)   100% ->
2320-2375  (139081-139136)   100% ->
2376-2484  (140819-140927)   100% ->
2485-2670  (141534-141719)   100% ->
2671-2841  (144668-144838)   100% ->
2842-2961  (150442-150561)   100% ->
2962-3054  (150845-150937)   100% ->
3055-3192  (151055-151192)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTTCTGAGTCTGAAACTCTGAATCCCAGTGCTAGGATAATGACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTTCTGAGTCTGAAACTCTGAATCCCAGTGCTAGGATAATGACCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTATCCAACTATGGAAGAGTTCCGAAACTTCAGTAGATACATTGCCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTATCCAACTATGGAAGAGTTCCGAAACTTCAGTAGATACATTGCCTACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTGAATCCCAAGGAGCTCATCGGGCAGGGCTAGCCAAG         GTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100101 TTGAATCCCAAGGAGCTCATCGGGCAGGGCTAGCCAAGGTA...CAGGTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTTCCTCCAAAAGAGTGGAAGCCACGAGCATCCTATGATGACATTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102419 GTTCCTCCAAAAGAGTGGAAGCCACGAGCATCCTATGATGACATTGATGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TTTGGTCATTCCTGCCCCCATTCAACAGCTGGTGACGGGGCAGTCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102469 TTTGGTCATTCCTGCCCCCATTCAACAGCTGGTGACGGGGCAGTCTGGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCTTTACTCAGTACAACATACAGAAGAAAGCCATGACTGTTCGAGAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102519 TCTTTACTCAGTACAACATACAGAAGAAAGCCATGACTGTTCGAGAGTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CGCAAGATAGCCAATAGCGATAA         GTACTGTACCCCACGCTA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 102569 CGCAAGATAGCCAATAGCGATAAGTG...AAGGTACTGTACCCCACGCTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TAGTGAGTTTGAAGAGCTCGAGCGGAAATACTGGAAAAATCTTACATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107141 TAGTGAGTTTGAAGAGCTCGAGCGGAAATACTGGAAAAATCTTACATTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATCCTCCAATCTATGGTGCAGATGTGAATGGTACCCTCTATGAAAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 107191 ATCCTCCAATCTATGGTGCAGATGTGAATGGTACCCTCTATGAAAAGGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    430       CATGTTGATGAGTGGAATATTGGCCGGCTGAGAACAATCCTGGA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107241 ...CAGCATGTTGATGAGTGGAATATTGGCCGGCTGAGAACAATCCTGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTTGGTGGAAAAGGAGAGTGGGATCACCATTGAGGGTGTGAACACCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109763 CTTGGTGGAAAAGGAGAGTGGGATCACCATTGAGGGTGTGAACACCCCAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ACCTGTACTTTGGCATGTGGAAGACATCCTTTGCTTGGCACACTGAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109813 ACCTGTACTTTGGCATGTGGAAGACATCCTTTGCTTGGCACACTGAAGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ATGGACCTCTACAGCATCAACTACCTGCACTTTGGAGAACCAAAGTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109863 ATGGACCTCTACAGCATCAACTACCTGCACTTTGGAGAACCAAAGTCCTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624          GTACTCTGTTCCACCTGAGCATGGAAAGCGGTTGGAACGCC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109913 GTA...CAGGTACTCTGTTCCACCTGAGCATGGAAAGCGGTTGGAACGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TCGCCAAAG         GCTTTTTCCCAGGAAGTGCTCAAAGCTGTGAG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 112562 TCGCCAAAGGTA...TAGGCTTTTTCCCAGGAAGTGCTCAAAGCTGTGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GCATTTCTCCGCCACAAGATGACCCTGATTTCCCCGTTAATGCTGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113309 GCATTTCTCCGCCACAAGATGACCCTGATTTCCCCGTTAATGCTGAAGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 ATATGGAATTCCCTTTGACAAG         GTGACTCAAGAGGCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 113359 ATATGGAATTCCCTTTGACAAGGTG...CAGGTGACTCAAGAGGCTGGAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AGTTTATGATCACTTTCCCTTATGGTTACCATGCCGGCTTTAACCATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113798 AGTTTATGATCACTTTCCCTTATGGTTACCATGCCGGCTTTAACCATGGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TTTAACTGTGCGGAGTCTACCAATTTTGCTACCCGTCGGTGGATTGAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113848 TTTAACTGTGCGGAGTCTACCAATTTTGCTACCCGTCGGTGGATTGAGTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CGGCAAGCAAGCTGTGCTG         TGCTCCTGTAGAAAGGACATGG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 113898 CGGCAAGCAAGCTGTGCTGGTA...CAGTGCTCCTGTAGAAAGGACATGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TGAAGATCTCCATGGATGTGTTTGTGAGAAAGTTCCAGCCAGAAAGGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114619 TGAAGATCTCCATGGATGTGTTTGTGAGAAAGTTCCAGCCAGAAAGGTAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 AAACTTTGGAAAGCTGGGAAGGACAACACAGTTATTGACCATACTCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114669 AAACTTTGGAAAGCTGGGAAGGACAACACAGTTATTGACCATACTCTGCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CACGCCAGAAGCAGCTGAGTTTCTTAAGGAGAGTGAACTGCCTCCAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114719 CACGCCAGAAGCAGCTGAGTTTCTTAAGGAGAGTGAACTGCCTCCAAGAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 CTGGCAACGAGGAGGAGTGCCCAGAGGAGGACATGGAAGGGGTGGAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114769 CTGGCAACGAGGAGGAGTGCCCAGAGGAGGACATGGAAGGGGTGGAGGAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GGAGAGGAAGGAGACCTGAAGACAAG         CCTGGCCAAGCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 114819 GGAGAGGAAGGAGACCTGAAGACAAGGTA...CAGCCTGGCCAAGCACCG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 AATAGGGACAAAGAGGCACCGAGTTTGTCTTGAAATACCACAGGAGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115940 AATAGGGACAAAGAGGCACCGAGTTTGTCTTGAAATACCACAGGAGGTGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 GTCAGAGTGAGCTCTTCCCCAAGGAGGATCTGAGTTCTGAGCAGTATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115990 GTCAGAGTGAGCTCTTCCCCAAGGAGGATCTGAGTTCTGAGCAGTATGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 ATGACGGAGTGCCCGGCAGCCCTCGCCCCTGTGAGGCCCACCCATAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116040 ATGACGGAGTGCCCGGCAGCCCTCGCCCCTGTGAGGCCCACCCATAGCTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 TGTGCGGCAAGTTGAGGATGGTCTTACCTTCCCAG         ATTATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 116090 TGTGCGGCAAGTTGAGGATGGTCTTACCTTCCCAGGTT...CAGATTATT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 CTGACTCCACTGAAGTCAAATTTGAAGAGCTTAAAAATGTCAAACTAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118336 CTGACTCCACTGAAGTCAAATTTGAAGAGCTTAAAAATGTCAAACTAGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 GAGGAGGATGAGGAGGAAGAACAAGAAGCAGCTGCCTTGGATCTTTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 118386 GAGGAGGATGAGGAGGAAGAACAAGCAGCAGCTGCCTTGGATCTTTCTGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 GAATCCTGCGTCTGTAGGGGGACGCCTTGTCTTCTCAGGCTCCAAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118436 GAATCCTGCGTCTGTAGGGGGACGCCTTGTCTTCTCAGGCTCCAAAAAGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 AATCATCTTCTAGCCTGGGCTCTGGCTCTTCACGGGATTCTATCTCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118486 AATCATCTTCTAGCCTGGGCTCTGGCTCTTCACGGGATTCTATCTCTTCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 GATTCAGAAACTAGTGAGCCTCTCTCCTGCCGAGCCCAAGGGCAAACGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118536 GATTCAGAAACTAGTGAGCCTCTCTCCTGCCGAGCCCAAGGGCAAACGGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 AGTTCTCACTGTGCACAGTTATGCCAAAGGGGATGGCAGGGTCACTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118586 AGTTCTCACTGTGCACAGTTATGCCAAAGGGGATGGCAGGGTCACTGTGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670 GAGAGCCATGCACGAGGAAGAAAGGAAGCGCCGCTAGAAGTTTCAGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118636 GAGAGCCATGCACGAGGAAGAAAGGAAGCGCCGCTAGAAGTTTCAGTGAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1720 CGGGAGCTGGCAGAG         GTTGCAGATGAATACATGTTTTCCCT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 118686 CGGGAGCTGGCAGAGGTA...CAGGTTGCAGATGAATACATGTTTTCCCT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 AGAAGAGAATAAGAAGTCCAAGGGACGCCGTCAGCCTTTAAGCAAGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130535 AGAAGAGAATAAGAAGTCCAAGGGACGCCGTCAGCCTTTAAGCAAGCTCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1811 CCCGCCATCACCCACTTGTGCTGCAGGAGTGTGTCAGTGATGATG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 130585 CCCGCCATCACCCACTTGTGCTGCAGGAGTGTGTCAGTGATGATGGTA..

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1856     AGACATCTGAACAGCTGACCCCTGAGGAAGAGGCTGAGGAGACAGA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130635 .TAGAGACATCTGAACAGCTGACCCCTGAGGAAGAGGCTGAGGAGACAGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 GGCCTGGGCCAAGCCTCTGAGCCAACTGTGGCAGAACCGACCTCCAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135785 GGCCTGGGCCAAGCCTCTGAGCCAACTGTGGCAGAACCGACCTCCAAACT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1952 TTGAGGCTGAGAAGGAATTCAATGAGACCATGGCCCAACAGGCCCCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135835 TTGAGGCTGAGAAGGAATTCAATGAGACCATGGCCCAACAGGCCCCTCAC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2002 TGCGCTGTCTGTATGATCTTCCAGACTTATCATCAG         GTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 135885 TGCGCTGTCTGTATGATCTTCCAGACTTATCATCAGGTA...TAGGTTGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2043 ATTTGGAGGCTTTAATCAGAACTGTGGAAATGCTTCAGATTTAGCCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137675 ATTTGGAGGCTTTAATCAGAACTGTGGAAATGCTTCAGATTTAGCCCCCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2093 AGAAGCAGAGGACCAAGCCATTGATTCCAGAAATGTGCTTCACTTCGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137725 AGAAGCAGAGGACCAAGCCATTGATTCCAGAAATGTGCTTCACTTCGACT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2143 GGCTGCAGCACGGACATCAACCTTTCTACTCCTTATCTTGAGGAGGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137775 GGCTGCAGCACGGACATCAACCTTTCTACTCCTTATCTTGAGGAGGATGG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2193 CACCAGCATACTCGTTTCCTGCAAGAAGTGCAGCGTCCGGGTCCATGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137825 CACCAGCATACTCGTTTCCTGCAAGAAGTGCAGCGTCCGGGTCCATGCCA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2243          GTTGCTATGGGGTCCCCCCTGCAAAGGCTTCTGAAGACTGG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137875 GTG...TAGGTTGCTATGGGGTCCCCCCTGCAAAGGCTTCTGAAGACTGG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2284 ATGTGTTCTCGGTGTTCAGCCAATGCCCTAGAGGAG         GACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 138362 ATGTGTTCTCGGTGTTCAGCCAATGCCCTAGAGGAGGTG...CAGGACTG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2325 CTGTTTATGCTCATTACGAGGAGGGGCCCTGCAGAGAGCAAATGATGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139086 CTGTTTATGCTCATTACGAGGAGGGGCCCTGCAGAGAGCAAATGATGACA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2375 G         GTGGGTCCACGTTTCATGTGCTGTGGCAATTCTGGAAGCA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139136 GGTA...CAGGTGGGTCCACGTTTCATGTGCTGTGGCAATTCTGGAAGCA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2416 AGGTTTGTCAACATTGCAGAAAGAAGTCCGGTGGATGTGAGCAAAATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140859 AGGTTTGTCAACATTGCAGAAAGAAGTCCGGTGGATGTGAGCAAAATCCC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2466 CCTGCCCCGCTTCAAACTG         AAATGTATCTTCTGTAAGAAGC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 140909 CCTGCCCCGCTTCAAACTGGTA...CAGAAATGTATCTTCTGTAAGAAGC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2507 GGAGGAAAAGAACTGCTGGCTGCTGTGTGCAGTGTTCTCACGGCCGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141556 GGAGGAAAAGAACTGCTGGCTGCTGTGTGCAGTGTTCTCACGGCCGCTGC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2557 CCAACTGCCTTCCATGTGAGCTGCGCCCAGGCTGCCGGTGTGATGATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141606 CCAACTGCCTTCCATGTGAGCTGCGCCCAGGCTGCCGGTGTGATGATGCA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2607 GCCTGACGACTGGCCTTTTGTGGTCTTCATTACCTGCTTTCGGCACAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141656 GCCTGACGACTGGCCTTTTGTGGTCTTCATTACCTGCTTTCGGCACAAGA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2657 TTCCTAATTTGGAG         CGTGCCAAGGGGGCCTTGCAAAGCATC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 141706 TTCCTAATTTGGAGGTG...CAGCGTGCCAAGGGGGCCTTGCAAAGCATC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2698 ACTGCAGGCCAGAAAGTCATTAGCAAGCATAAGAACGGGCGCTTCTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144695 ACTGCAGGCCAGAAAGTCATTAGCAAGCATAAGAACGGGCGCTTCTACCA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2748 GTGTGAAGTGGTCAGGCTCACCACCGAGACCTTCTATGAAGTCAACTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144745 GTGTGAAGTGGTCAGGCTCACCACCGAGACCTTCTATGAAGTCAACTTTG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2798 ATGATGGCTCCTTCAGCGACAATCTTTATCCTGAGGACATAGTG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 144795 ATGATGGCTCCTTCAGCGACAATCTTTATCCTGAGGACATAGTGGTA...

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2842    AGCCAGGACTGTCTCCAGTTTGGTCCTCCTGCTGAAGGGGAAGTGGT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150439 CAGAGCCAGGACTGTCTCCAGTTTGGTCCTCCTGCTGAAGGGGAAGTGGT

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2889 CCAAGTGAGATGGACAGACGGCCAAGTCTATGGAGCCAAGTTTGTGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150489 CCAAGTGAGATGGACAGACGGCCAAGTCTATGGAGCCAAGTTTGTGGCCT

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2939 CCCACCCTATCCAAATGTACCAG         GTGGAGTTTGAGGATGGC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 150539 CCCACCCTATCCAAATGTACCAGGTA...TAGGTGGAGTTTGAGGATGGC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2980 TCACAACTTGTGGTTAAGAGAGATGATGTATACACACTGGATGAAGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150863 TCACAACTTGTGGTTAAGAGAGATGATGTATACACACTGGATGAAGAGCT

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3030 TCCCAAGAGAGTCAAATCTAGACTG         TCAGTAGCCTCAGACA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 150913 TCCCAAGAGAGTCAAATCTAGACTGGTG...TAGTCAGTAGCCTCAGACA

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3071 TGCGCTTCAATGAGATTTTCACAGAGAAAGAGGTTAAGCAAGAAAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151071 TGCGCTTCAATGAGATTTTCACAGAGAAAGAGGTTAAGCAAGAAAAGAAA

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3121 CGGCAACGAGTTATCAACTCAAGATACCGGGAAGATTATATTGAGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151121 CGGCAACGAGTTATCAACTCAAGATACCGGGAAGATTATATTGAGCCTGC

   3350     .    :    .    :
   3171 ACTATACCGGGCCATCATGGAG
        ||||||||||||||||||||||
 151171 ACTATACCGGGCCATCATGGAG