Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0636
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0636, 537 aa
  1>>>pF1KSDA0636 537 - 537 aa - 537 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1415+/-0.000941; mu= 13.1792+/- 0.056
 mean_var=69.5592+/-14.051, 0's: 0 Z-trim(103.8): 65  B-trim: 84 in 2/49
 Lambda= 0.153779
 statistics sampled from 7531 (7596) to 7531 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.599), E-opt: 0.2 (0.233), width:  16
 Scan time:  3.010

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS6243.1 CPNE3 gene_id:8895|Hs108|chr8           ( 537) 3621 812.9       0
CCDS13260.1 CPNE1 gene_id:8904|Hs108|chr20         ( 537) 2510 566.4 2.9e-161
CCDS46595.1 CPNE1 gene_id:8904|Hs108|chr20         ( 542) 2510 566.4 2.9e-161
CCDS10774.1 CPNE2 gene_id:221184|Hs108|chr16       ( 548) 2446 552.2 5.5e-157
CCDS3072.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3         ( 557) 2035 461.1 1.6e-129
CCDS75010.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3        ( 575) 2035 461.1 1.6e-129
CCDS10981.1 CPNE7 gene_id:27132|Hs108|chr16        ( 558) 2027 459.3 5.4e-129
CCDS9607.1 CPNE6 gene_id:9362|Hs108|chr14          ( 557) 1935 438.9 7.5e-123
CCDS61413.1 CPNE6 gene_id:9362|Hs108|chr14         ( 612) 1935 438.9 8.2e-123
CCDS8733.1 CPNE8 gene_id:144402|Hs108|chr12        ( 564) 1848 419.6 4.9e-117
CCDS2574.2 CPNE9 gene_id:151835|Hs108|chr3         ( 553) 1735 394.5 1.7e-109
CCDS10980.1 CPNE7 gene_id:27132|Hs108|chr16        ( 633) 1696 385.9 7.7e-107
CCDS77695.1 CPNE9 gene_id:151835|Hs108|chr3        ( 503) 1634 372.1 8.6e-103
CCDS4825.1 CPNE5 gene_id:57699|Hs108|chr6          ( 593) 1453 331.9 1.2e-90
CCDS83078.1 CPNE5 gene_id:57699|Hs108|chr6         ( 301)  995 230.3 2.5e-60


>>CCDS6243.1 CPNE3 gene_id:8895|Hs108|chr8                (537 aa)
 initn: 3621 init1: 3621 opt: 3621  Z-score: 4340.9  bits: 812.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3621; 100.0% identity (100.0% similar) in 537 aa overlap (1-537:1-537)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAAQCVTKVALNVSCANLLDKDIGSKSDPLCVLFLNTSGQQWYEVERTERIKNCLNPQFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 MAAQCVTKVALNVSCANLLDKDIGSKSDPLCVLFLNTSGQQWYEVERTERIKNCLNPQFS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD KTFIIDYYFEVVQKLKFGVYDIDNKTIELSDDDFLGECECTLGQIVSSKKLTRPLVMKTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 KTFIIDYYFEVVQKLKFGVYDIDNKTIELSDDDFLGECECTLGQIVSSKKLTRPLVMKTG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD RPAGKGSITISAEEIKDNRVVLFEMEARKLDNKDLFGKSDPYLEFHKQTSDGNWLMVHRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 RPAGKGSITISAEEIKDNRVVLFEMEARKLDNKDLFGKSDPYLEFHKQTSDGNWLMVHRT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD EVVKNNLNPVWRPFKISLNSLCYGDMDKTIKVECYDYDNDGSHDLIGTFQTTMTKLKEAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 EVVKNNLNPVWRPFKISLNSLCYGDMDKTIKVECYDYDNDGSHDLIGTFQTTMTKLKEAS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD RSSPVEFECINEKKRQKKKSYKNSGVISVKQCEITVECTFLDYIMGGCQLNFTVGVDFTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 RSSPVEFECINEKKRQKKKSYKNSGVISVKQCEITVECTFLDYIMGGCQLNFTVGVDFTG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD SNGDPRSPDSLHYISPNGVNEYLTALWSVGLVIQDYDADKMFPAFGFGAQIPPQWQVSHE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 SNGDPRSPDSLHYISPNGVNEYLTALWSVGLVIQDYDADKMFPAFGFGAQIPPQWQVSHE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD FPMNFNPSNPYCNGIQGIVEAYRSCLPQIKLYGPTNFSPIINHVARFAAAATQQQTASQY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 FPMNFNPSNPYCNGIQGIVEAYRSCLPQIKLYGPTNFSPIINHVARFAAAATQQQTASQY
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD FVLLIITDGVITDLDETRQAIVNASRLPMSIIIVGVGGADFSAMEFLDGDGGSLRSPLGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 FVLLIITDGVITDLDETRQAIVNASRLPMSIIIVGVGGADFSAMEFLDGDGGSLRSPLGE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       
pF1KSD VAIRDIVQFVPFRQFQNAPKEALAQCVLAEIPQQVVGYFNTYKLLPPKNPATKQQKQ
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 VAIRDIVQFVPFRQFQNAPKEALAQCVLAEIPQQVVGYFNTYKLLPPKNPATKQQKQ
              490       500       510       520       530       

>>CCDS13260.1 CPNE1 gene_id:8904|Hs108|chr20              (537 aa)
 initn: 2495 init1: 1470 opt: 2510  Z-score: 3008.8  bits: 566.4 E(32554): 2.9e-161
Smith-Waterman score: 2510; 65.9% identity (86.9% similar) in 540 aa overlap (3-535:2-536)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAAQCVTKVALNVSCANLLDKDIGSKSDPLCVLFLNTSGQQWYEVERTERIKNCLNPQFS
         :.::: : :..:: .:.::::::::::::::. ...: .: :. ::::..:: .:.::
CCDS13  MAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVLLQDVGGGSWAELGRTERVRNCSSPEFS
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD KTFIIDYYFEVVQKLKFGVYDIDNKTIELSDDDFLGECECTLGQIVSSKKLTRPLVMKTG
       ::. ..: ::.::::.::.::::::: :: ::::::  ::.:::::::. :: ::..: :
CCDS13 KTLQLEYRFETVQKLRFGIYDIDNKTPELRDDDFLGGAECSLGQIVSSQVLTLPLMLKPG
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD RPAGKGSITISAEEIKDNRVVLFEMEARKLDNKDLFGKSDPYLEFHKQTSDGNWLMVHRT
       .:::.:.::.::.:.:::::: .:.:::.::.::..:::::.::: .: .::.: .:.:.
CCDS13 KPAGRGTITVSAQELKDNRVVTMEVEARNLDKKDFLGKSDPFLEFFRQ-GDGKWHLVYRS
     120       130       140       150       160        170        

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD EVVKNNLNPVWRPFKISLNSLCYGDMDKTIKVECYDYDNDGSHDLIGTFQTTMTKLKEAS
       ::.::::::.:. :.. .. .: :. .  :.:.: :::.::::::::::.:....:.   
CCDS13 EVIKNNLNPTWKRFSVPVQHFCGGNPSTPIQVQCSDYDSDGSHDLIGTFHTSLAQLQ---
      180       190       200       210       220       230        

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD RSSPVEFECINEKKRQKKKSYKNSGVISVKQCEITVECTFLDYIMGGCQLNFTVGVDFTG
        . :.:::::. .:.::::::::::.: :: :.. .: .::::.:::::.::::::::::
CCDS13 -AVPAEFECIHPEKQQKKKSYKNSGTIRVKICRVETEYSFLDYVMGGCQINFTVGVDFTG
          240       250       260       270       280       290    

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD SNGDPRSPDSLHYISPNGVNEYLTALWSVGLVIQDYDADKMFPAFGFGAQIPPQWQVSHE
       ::::: :::::::.::.:::::: :::::: :.::::.::.:::::::::.::.::::::
CCDS13 SNGDPSSPDSLHYLSPTGVNEYLMALWSVGSVVQDYDSDKLFPAFGFGAQVPPDWQVSHE
          300       310       320       330       340       350    

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD FPMNFNPSNPYCNGIQGIVEAYRSCLPQIKLYGPTNFSPIINHVARFAAAATQQQTASQY
       : .::::::::: ::::::.:::. :::..:::::::.::::::::::: :..: :::::
CCDS13 FALNFNPSNPYCAGIQGIVDAYRQALPQVRLYGPTNFAPIINHVARFAAQAAHQGTASQY
          360       370       380       390       400       410    

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD FVLLIITDGVITDLDETRQAIVNASRLPMSIIIVGVGGADFSAMEFLDGDGGSLRSPLGE
       :.::..:::..::.. ::.:.: :: ::::.:::::::::: ::: ::.::: :..  :.
CCDS13 FMLLLLTDGAVTDVEATREAVVRASNLPMSVIIVGVGGADFEAMEQLDADGGPLHTRSGQ
          420       430       440       450       460       470    

              490       500       510       520              530   
pF1KSD VAIRDIVQFVPFRQFQNAPKEALAQCVLAEIPQQVVGYFNTY-----KLLPP--KNPATK
       .: ::::::::.:.:::::.::::: ::::.: :.:.:: .      : :::  :.::  
CCDS13 AAARDIVQFVPYRRFQNAPREALAQTVLAEVPTQLVSYFRAQGWAPLKPLPPSAKDPAQA
          480       490       500       510       520       530    

           
pF1KSD QQKQ
        :  
CCDS13 PQA 
           

>>CCDS46595.1 CPNE1 gene_id:8904|Hs108|chr20              (542 aa)
 initn: 2495 init1: 1470 opt: 2510  Z-score: 3008.7  bits: 566.4 E(32554): 2.9e-161
Smith-Waterman score: 2510; 65.9% identity (86.9% similar) in 540 aa overlap (3-535:7-541)

                   10        20        30        40        50      
pF1KSD     MAAQCVTKVALNVSCANLLDKDIGSKSDPLCVLFLNTSGQQWYEVERTERIKNCLN
             :.::: : :..:: .:.::::::::::::::. ...: .: :. ::::..:: .
CCDS46 MKMMHMAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVLLQDVGGGSWAELGRTERVRNCSS
               10        20        30        40        50        60

         60        70        80        90       100       110      
pF1KSD PQFSKTFIIDYYFEVVQKLKFGVYDIDNKTIELSDDDFLGECECTLGQIVSSKKLTRPLV
       :.::::. ..: ::.::::.::.::::::: :: ::::::  ::.:::::::. :: ::.
CCDS46 PEFSKTLQLEYRFETVQKLRFGIYDIDNKTPELRDDDFLGGAECSLGQIVSSQVLTLPLM
               70        80        90       100       110       120

        120       130       140       150       160       170      
pF1KSD MKTGRPAGKGSITISAEEIKDNRVVLFEMEARKLDNKDLFGKSDPYLEFHKQTSDGNWLM
       .: :.:::.:.::.::.:.:::::: .:.:::.::.::..:::::.::: .: .::.: .
CCDS46 LKPGKPAGRGTITVSAQELKDNRVVTMEVEARNLDKKDFLGKSDPFLEFFRQ-GDGKWHL
              130       140       150       160       170          

        180       190       200       210       220       230      
pF1KSD VHRTEVVKNNLNPVWRPFKISLNSLCYGDMDKTIKVECYDYDNDGSHDLIGTFQTTMTKL
       :.:.::.::::::.:. :.. .. .: :. .  :.:.: :::.::::::::::.:....:
CCDS46 VYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPVQHFCGGNPSTPIQVQCSDYDSDGSHDLIGTFHTSLAQL
     180       190       200       210       220       230         

        240       250       260       270       280       290      
pF1KSD KEASRSSPVEFECINEKKRQKKKSYKNSGVISVKQCEITVECTFLDYIMGGCQLNFTVGV
       .    . :.:::::. .:.::::::::::.: :: :.. .: .::::.:::::.::::::
CCDS46 Q----AVPAEFECIHPEKQQKKKSYKNSGTIRVKICRVETEYSFLDYVMGGCQINFTVGV
     240           250       260       270       280       290     

        300       310       320       330       340       350      
pF1KSD DFTGSNGDPRSPDSLHYISPNGVNEYLTALWSVGLVIQDYDADKMFPAFGFGAQIPPQWQ
       ::::::::: :::::::.::.:::::: :::::: :.::::.::.:::::::::.::.::
CCDS46 DFTGSNGDPSSPDSLHYLSPTGVNEYLMALWSVGSVVQDYDSDKLFPAFGFGAQVPPDWQ
         300       310       320       330       340       350     

        360       370       380       390       400       410      
pF1KSD VSHEFPMNFNPSNPYCNGIQGIVEAYRSCLPQIKLYGPTNFSPIINHVARFAAAATQQQT
       ::::: .::::::::: ::::::.:::. :::..:::::::.::::::::::: :..: :
CCDS46 VSHEFALNFNPSNPYCAGIQGIVDAYRQALPQVRLYGPTNFAPIINHVARFAAQAAHQGT
         360       370       380       390       400       410     

        420       430       440       450       460       470      
pF1KSD ASQYFVLLIITDGVITDLDETRQAIVNASRLPMSIIIVGVGGADFSAMEFLDGDGGSLRS
       :::::.::..:::..::.. ::.:.: :: ::::.:::::::::: ::: ::.::: :..
CCDS46 ASQYFMLLLLTDGAVTDVEATREAVVRASNLPMSVIIVGVGGADFEAMEQLDADGGPLHT
         420       430       440       450       460       470     

        480       490       500       510       520                
pF1KSD PLGEVAIRDIVQFVPFRQFQNAPKEALAQCVLAEIPQQVVGYFNTY-----KLLPP--KN
         :..: ::::::::.:.:::::.::::: ::::.: :.:.:: .      : :::  :.
CCDS46 RSGQAAARDIVQFVPYRRFQNAPREALAQTVLAEVPTQLVSYFRAQGWAPLKPLPPSAKD
         480       490       500       510       520       530     

     530       
pF1KSD PATKQQKQ
       ::   :  
CCDS46 PAQAPQA 
         540   

>>CCDS10774.1 CPNE2 gene_id:221184|Hs108|chr16            (548 aa)
 initn: 2513 init1: 2267 opt: 2446  Z-score: 2931.9  bits: 552.2 E(32554): 5.5e-157
Smith-Waterman score: 2446; 64.4% identity (87.3% similar) in 534 aa overlap (1-531:17-548)

                                10        20        30        40   
pF1KSD                 MAAQ-CVTKVALNVSCANLLDKDIGSKSDPLCVLFLNTSGQQWY
                       :. : :: :: :.::  ::::.:. :::::.:::: ...:. : 
CCDS10 MAHIPSGGAPAAGAAPMGPQYCVCKVELSVSGQNLLDRDVTSKSDPFCVLFTENNGR-WI
               10        20        30        40        50          

            50        60        70        80        90       100   
pF1KSD EVERTERIKNCLNPQFSKTFIIDYYFEVVQKLKFGVYDIDNKTIELSDDDFLGECECTLG
       : .:::   : ::: ::: :..::.:: ::::::...: :.....:.. ::::.  :.::
CCDS10 EYDRTETAINNLNPAFSKKFVLDYHFEEVQKLKFALFDQDKSSMRLDEHDFLGQFSCSLG
      60        70        80        90       100       110         

           110       120       130       140       150       160   
pF1KSD QIVSSKKLTRPLVMKTGRPAGKGSITISAEEIKDNRVVLFEMEARKLDNKDLFGKSDPYL
        ::::::.::::.. . .::::: :::.:.:..::::. . . .:.::.:::::::::.:
CCDS10 TIVSSKKITRPLLLLNDKPAGKGLITIAAQELSDNRVITLSLAGRRLDKKDLFGKSDPFL
     120       130       140       150       160       170         

           170       180       190       200       210       220   
pF1KSD EFHKQTSDGNWLMVHRTEVVKNNLNPVWRPFKISLNSLCYGDMDKTIKVECYDYDNDGSH
       ::.:  .::.:..::::::.: .:.:::.:: . : ::: :::.: :.: ::::::::.:
CCDS10 EFYKPGDDGKWMLVHRTEVIKYTLDPVWKPFTVPLVSLCDGDMEKPIQVMCYDYDNDGGH
     180       190       200       210       220       230         

           230       240       250       260       270       280   
pF1KSD DLIGTFQTTMTKLKEASRSSPVEFECINEKKRQKKKSYKNSGVISVKQCEITVECTFLDY
       :.:: :::..... ::  : :.:::::: ::..:::.:::::.: ...:.:. . .::::
CCDS10 DFIGEFQTSVSQMCEARDSVPLEFECINPKKQRKKKNYKNSGIIILRSCKINRDYSFLDY
     240       250       260       270       280       290         

           290       300       310       320       330       340   
pF1KSD IMGGCQLNFTVGVDFTGSNGDPRSPDSLHYISPNGVNEYLTALWSVGLVIQDYDADKMFP
       :.::::: ::::.:::.:::.: .:.:::::.: :.::::.:.:.:: .:::::.:::::
CCDS10 ILGGCQLMFTVGIDFTASNGNPLDPSSLHYINPMGTNEYLSAIWAVGQIIQDYDSDKMFP
     300       310       320       330       340       350         

           350       360       370       380       390       400   
pF1KSD AFGFGAQIPPQWQVSHEFPMNFNPSNPYCNGIQGIVEAYRSCLPQIKLYGPTNFSPIINH
       :.:::::.::.:.::::: .::::.::.:.:..::..:: .:::.:..:::::::::.::
CCDS10 ALGFGAQLPPDWKVSHEFAINFNPTNPFCSGVDGIAQAYSACLPHIRFYGPTNFSPIVNH
     360       370       380       390       400       410         

           410       420       430       440       450       460   
pF1KSD VARFAAAATQQQTASQYFVLLIITDGVITDLDETRQAIVNASRLPMSIIIVGVGGADFSA
       :::::: ::::.::.:::.:::::::::.:..:::.:.:.::.:::::::::::.:::.:
CCDS10 VARFAAQATQQRTATQYFILLIITDGVISDMEETRHAVVQASKLPMSIIIVGVGNADFAA
     420       430       440       450       460       470         

           470       480       490       500       510       520   
pF1KSD MEFLDGDGGSLRSPLGEVAIRDIVQFVPFRQFQNAPKEALAQCVLAEIPQQVVGYFNTYK
       :::::::.  :::  :: : ::::::::::.:.:: ::.::. ::::.::::: ::. .:
CCDS10 MEFLDGDSRMLRSHTGEEAARDIVQFVPFREFRNAAKETLAKAVLAELPQQVVQYFK-HK
     480       490       500       510       520       530         

             530       
pF1KSD LLPPKN--PATKQQKQ
        ::: :  ::      
CCDS10 NLPPTNSEPA      
      540              

>>CCDS3072.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3              (557 aa)
 initn: 2070 init1: 1897 opt: 2035  Z-score: 2439.0  bits: 461.1 E(32554): 1.6e-129
Smith-Waterman score: 2035; 57.1% identity (81.3% similar) in 525 aa overlap (5-528:22-543)

                                10        20        30        40   
pF1KSD                  MAAQCVTKVALNVSCANLLDKDIGSKSDPLCVLFLNTSGQQWY
                            :.::: : :.: .. :.:  :: :: ::..   :  ::.
CCDS30 MKKMSNIYESAANTLGIFNSPCLTKVELRVACKGISDRDALSKPDP-CVILKMQSHGQWF
               10        20        30        40         50         

            50        60        70        80        90       100   
pF1KSD EVERTERIKNCLNPQFSKTFIIDYYFEVVQKLKFGVYDIDNKTIELSDDDFLGECECTLG
       ::.::: :..:.:: .:: : .:.::: ::.:.: :.::...   :.. ::::  :::::
CCDS30 EVDRTEVIRTCINPVYSKLFTVDFYFEEVQRLRFEVHDISSNHNGLKEADFLGGMECTLG
      60        70        80        90       100       110         

           110       120       130        140       150       160  
pF1KSD QIVSSKKLTRPLVMKTGRPAGKGSITISAEEIKDNR-VVLFEMEARKLDNKDLFGKSDPY
       ::::..::.. : .: :  :::.:::. :::.. :   : . ..:::::.::.:.::::.
CCDS30 QIVSQRKLSKSL-LKHGNTAGKSSITVIAEELSGNDDYVELAFNARKLDDKDFFSKSDPF
     120       130        140       150       160       170        

            170       180       190       200       210       220  
pF1KSD LEFHKQTSDGNWLMVHRTEVVKNNLNPVWRPFKISLNSLCYGDMDKTIKVECYDYDNDGS
       ::. ....:..  .::::::: :::.:.:. ::.:.:::: :: :. .:   .:.:..:.
CCDS30 LEIFRMNDDATQQLVHRTEVVMNNLSPAWKSFKVSVNSLCSGDPDRRLKCIVWDWDSNGK
      180       190       200       210       220       230        

            230       240       250       260       270       280  
pF1KSD HDLIGTFQTTMTKLKEASRSSPVEFECINEKKRQKKKSYKNSGVISVKQCEITVECTFLD
       ::.:: : .:. ... : ... :..:::: : . :::.:::::.. .. :.:    .:::
CCDS30 HDFIGEFTSTFKEMRGAMEGKQVQWECINPKYKAKKKNYKNSGTVILNLCKIHKMHSFLD
      240       250       260       270       280       290        

            290       300       310       320       330       340  
pF1KSD YIMGGCQLNFTVGVDFTGSNGDPRSPDSLHYISPNGVNEYLTALWSVGLVIQDYDADKMF
       :::::::..:::..:::.::::::.  ::::: :   :::: :: .:: . ::::.::::
CCDS30 YIMGGCQIQFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYIHPYQPNEYLKALVAVGEICQDYDSDKMF
      300       310       320       330       340       350        

            350       360       370       380       390       400  
pF1KSD PAFGFGAQIPPQWQVSHEFPMNFNPSNPYCNGIQGIVEAYRSCLPQIKLYGPTNFSPIIN
       :::::::.:::.. :::.: .::: .:: : ::::.::::.::::...::::::..:::.
CCDS30 PAFGFGARIPPEYTVSHDFAINFNEDNPECAGIQGVVEAYQSCLPKLQLYGPTNIAPIIQ
      360       370       380       390       400       410        

            410       420       430       440       450       460  
pF1KSD HVARFAAAATQQQTASQYFVLLIITDGVITDLDETRQAIVNASRLPMSIIIVGVGGADFS
       .::. :.  :. . :::::.:::.:::::::. .::.:::.::.::::.::::::.::::
CCDS30 KVAKSASEETNTKEASQYFILLILTDGVITDMADTREAIVHASHLPMSVIIVGVGNADFS
      420       430       440       450       460       470        

            470       480       490       500       510       520  
pF1KSD AMEFLDGDGGSLRSPLGEVAIRDIVQFVPFRQFQNAPKEALAQCVLAEIPQQVVGYFNTY
        :..:::: : :::: :: ..::::::::::.:..:   :::. ::::.:.::: :.:  
CCDS30 DMQMLDGDDGILRSPKGEPVLRDIVQFVPFRNFKHASPAALAKSVLAEVPNQVVDYYNG-
      480       490       500       510       520       530        

            530            
pF1KSD KLLPPKNPATKQQKQ     
       : . ::              
CCDS30 KGIKPKCSSEMYESSRTLAP
       540       550       

>>CCDS75010.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3             (575 aa)
 initn: 2070 init1: 1897 opt: 2035  Z-score: 2438.7  bits: 461.1 E(32554): 1.6e-129
Smith-Waterman score: 2035; 57.1% identity (81.3% similar) in 525 aa overlap (5-528:40-561)

                                         10        20        30    
pF1KSD                           MAAQCVTKVALNVSCANLLDKDIGSKSDPLCVLF
                                     :.::: : :.: .. :.:  :: :: ::..
CCDS75 SIKRRAGRRMKKMSNIYESAANTLGIFNSPCLTKVELRVACKGISDRDALSKPDP-CVIL
      10        20        30        40        50        60         

           40        50        60        70        80        90    
pF1KSD LNTSGQQWYEVERTERIKNCLNPQFSKTFIIDYYFEVVQKLKFGVYDIDNKTIELSDDDF
          :  ::.::.::: :..:.:: .:: : .:.::: ::.:.: :.::...   :.. ::
CCDS75 KMQSHGQWFEVDRTEVIRTCINPVYSKLFTVDFYFEEVQRLRFEVHDISSNHNGLKEADF
       70        80        90       100       110       120        

          100       110       120       130        140       150   
pF1KSD LGECECTLGQIVSSKKLTRPLVMKTGRPAGKGSITISAEEIKDNR-VVLFEMEARKLDNK
       ::  :::::::::..::.. : .: :  :::.:::. :::.. :   : . ..:::::.:
CCDS75 LGGMECTLGQIVSQRKLSKSL-LKHGNTAGKSSITVIAEELSGNDDYVELAFNARKLDDK
      130       140        150       160       170       180       

           160       170       180       190       200       210   
pF1KSD DLFGKSDPYLEFHKQTSDGNWLMVHRTEVVKNNLNPVWRPFKISLNSLCYGDMDKTIKVE
       :.:.::::.::. ....:..  .::::::: :::.:.:. ::.:.:::: :: :. .:  
CCDS75 DFFSKSDPFLEIFRMNDDATQQLVHRTEVVMNNLSPAWKSFKVSVNSLCSGDPDRRLKCI
       190       200       210       220       230       240       

           220       230       240       250       260       270   
pF1KSD CYDYDNDGSHDLIGTFQTTMTKLKEASRSSPVEFECINEKKRQKKKSYKNSGVISVKQCE
        .:.:..:.::.:: : .:. ... : ... :..:::: : . :::.:::::.. .. :.
CCDS75 VWDWDSNGKHDFIGEFTSTFKEMRGAMEGKQVQWECINPKYKAKKKNYKNSGTVILNLCK
       250       260       270       280       290       300       

           280       290       300       310       320       330   
pF1KSD ITVECTFLDYIMGGCQLNFTVGVDFTGSNGDPRSPDSLHYISPNGVNEYLTALWSVGLVI
       :    .::::::::::..:::..:::.::::::.  ::::: :   :::: :: .:: . 
CCDS75 IHKMHSFLDYIMGGCQIQFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYIHPYQPNEYLKALVAVGEIC
       310       320       330       340       350       360       

           340       350       360       370       380       390   
pF1KSD QDYDADKMFPAFGFGAQIPPQWQVSHEFPMNFNPSNPYCNGIQGIVEAYRSCLPQIKLYG
       ::::.:::::::::::.:::.. :::.: .::: .:: : ::::.::::.::::...:::
CCDS75 QDYDSDKMFPAFGFGARIPPEYTVSHDFAINFNEDNPECAGIQGVVEAYQSCLPKLQLYG
       370       380       390       400       410       420       

           400       410       420       430       440       450   
pF1KSD PTNFSPIINHVARFAAAATQQQTASQYFVLLIITDGVITDLDETRQAIVNASRLPMSIII
       :::..:::..::. :.  :. . :::::.:::.:::::::. .::.:::.::.::::.::
CCDS75 PTNIAPIIQKVAKSASEETNTKEASQYFILLILTDGVITDMADTREAIVHASHLPMSVII
       430       440       450       460       470       480       

           460       470       480       490       500       510   
pF1KSD VGVGGADFSAMEFLDGDGGSLRSPLGEVAIRDIVQFVPFRQFQNAPKEALAQCVLAEIPQ
       ::::.:::: :..:::: : :::: :: ..::::::::::.:..:   :::. ::::.:.
CCDS75 VGVGNADFSDMQMLDGDDGILRSPKGEPVLRDIVQFVPFRNFKHASPAALAKSVLAEVPN
       490       500       510       520       530       540       

           520       530            
pF1KSD QVVGYFNTYKLLPPKNPATKQQKQ     
       ::: :.:  : . ::              
CCDS75 QVVDYYNG-KGIKPKCSSEMYESSRTLAP
       550        560       570     

>>CCDS10981.1 CPNE7 gene_id:27132|Hs108|chr16             (558 aa)
 initn: 1800 init1: 1553 opt: 2027  Z-score: 2429.4  bits: 459.3 E(32554): 5.4e-129
Smith-Waterman score: 2027; 56.1% identity (81.4% similar) in 531 aa overlap (1-529:16-544)

                              10        20        30        40     
pF1KSD                MAAQCVTKVALNVSCANLLDKDIGSKSDPLCVLFLNTSGQQWYEV
                      . : :..:: : .:: .:::.:  .::::  .:. ...:: : .:
CCDS10 MSAGSERGAAATPGGLPAPCASKVELRLSCRHLLDRDPLTKSDPSVALLQQAQGQ-WVQV
               10        20        30        40        50          

          50        60        70        80         90       100    
pF1KSD ERTERIKNCLNPQFSKTFIIDYYFEVVQKLKFGVYDIDNKT-IELSDDDFLGECECTLGQ
        ::: ... :.: :::.: .::::: ::.:.: :::  . . .  ..:::::  ::::::
CCDS10 GRTEVVRSSLHPVFSKVFTVDYYFEEVQRLRFEVYDTHGPSGFSCQEDDFLGGMECTLGQ
      60        70        80        90       100       110         

          110       120       130        140       150       160   
pF1KSD IVSSKKLTRPLVMKTGRPAGKGSITISAEEIK-DNRVVLFEMEARKLDNKDLFGKSDPYL
       ::..::.::::..: :: :::..::. ::.:. .:  : . ..:::::.::::.::::.:
CCDS10 IVAQKKVTRPLLLKFGRNAGKSTITVIAEDISGNNGYVELSFRARKLDDKDLFSKSDPFL
     120       130       140       150       160       170         

           170       180       190       200       210       220   
pF1KSD EFHKQTSDGNWLMVHRTEVVKNNLNPVWRPFKISLNSLCYGDMDKTIKVECYDYDNDGSH
       :... ..: .  .:.:::::::::::::. ::.::.:::  .  . .:   .:::. :.:
CCDS10 ELYRVNDDQGLQLVYRTEVVKNNLNPVWEAFKVSLSSLCSCEETRPLKCLVWDYDSRGKH
     180       190       200       210       220       230         

           230       240       250       260       270       280   
pF1KSD DLIGTFQTTMTKLKEASRSSPVEFECINEKKRQKKKSYKNSGVISVKQCEITVECTFLDY
       :.:: :.::. ....: . . ....:.: : .::..:::::::. . . ..    .::::
CCDS10 DFIGEFSTTFEEMQKAFEEGQAQWDCVNPKYKQKRRSYKNSGVVVLADLKFHRVYSFLDY
     240       250       260       270       280       290         

           290       300       310       320       330       340   
pF1KSD IMGGCQLNFTVGVDFTGSNGDPRSPDSLHYISPNGVNEYLTALWSVGLVIQDYDADKMFP
       ::::::..:::..:::.::::::.  :::::.:   :::: :: ::: . ::::.:: : 
CCDS10 IMGGCQIHFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYINPYQPNEYLKALVSVGEICQDYDSDKRFS
     300       310       320       330       340       350         

           350       360       370       380       390       400   
pF1KSD AFGFGAQIPPQWQVSHEFPMNFNPSNPYCNGIQGIVEAYRSCLPQIKLYGPTNFSPIINH
       :.::::.:::...:::.: .:::: .  :.::::.::::..:::...:::::: .:::..
CCDS10 ALGFGARIPPKYEVSHDFAINFNPEDDECEGIQGVVEAYQNCLPRVQLYGPTNVAPIISK
     360       370       380       390       400       410         

           410       420       430       440       450       460   
pF1KSD VARFAAAATQQQTASQYFVLLIITDGVITDLDETRQAIVNASRLPMSIIIVGVGGADFSA
       ::: :::  .   ::::..:::.::::.::. .::.::: ::::::::::::::.:::. 
CCDS10 VARVAAAEESTGKASQYYILLILTDGVVTDMADTREAIVRASRLPMSIIIVGVGNADFTD
     420       430       440       450       460       470         

           470       480       490       500       510       520   
pF1KSD MEFLDGDGGSLRSPLGEVAIRDIVQFVPFRQFQNAPKEALAQCVLAEIPQQVVGYFNTYK
       :. :::: : :::: :: :.::::::::::...::   :::.:::::.:.::: :. ...
CCDS10 MQVLDGDDGVLRSPRGEPALRDIVQFVPFRELKNASPAALAKCVLAEVPKQVVEYY-SHR
     480       490       500       510       520       530         

           530             
pF1KSD LLPPKNPATKQQKQ      
        :::..              
CCDS10 GLPPRSLGVPAGEASPGCTP
      540       550        

>>CCDS9607.1 CPNE6 gene_id:9362|Hs108|chr14               (557 aa)
 initn: 1911 init1: 1178 opt: 1935  Z-score: 2319.1  bits: 438.9 E(32554): 7.5e-123
Smith-Waterman score: 1935; 54.4% identity (77.6% similar) in 531 aa overlap (7-532:20-548)

                            10        20        30        40       
pF1KSD              MAAQCVTKVALNVSCANLLDKDIGSKSDPLCVLFLNTSGQQWYEVER
                          ..: : ::: .:::.:  .:  : :::.   : .:: ::::
CCDS96 MSDPEMGWVPEPPTMTLGASRVELRVSCHGLLDRDTLTKPHP-CVLLKLYSDEQWVEVER
               10        20        30        40         50         

        50        60        70        80        90       100       
pF1KSD TERIKNCLNPQFSKTFIIDYYFEVVQKLKFGVYDIDNKTIELSDDDFLGECECTLGQIVS
       :: ...: .: ::... ..:.::  : :.: :.: .. .    .: :::  :::::::::
CCDS96 TEVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPLQFHVFDAEDGATSPRNDTFLGSTECTLGQIVS
      60        70        80        90       100       110         

       110       120       130        140       150       160      
pF1KSD SKKLTRPLVMKTGRPAGKGSITISAEEIKD-NRVVLFEMEARKLDNKDLFGKSDPYLEFH
       . :.:.::..:.:. :::..::: :::..  :  : . ..: ::::::::.::::..:..
CCDS96 QTKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGTNDYVQLTFRAYKLDNKDLFSKSDPFMEIY
     120       130       140       150       160       170         

        170       180       190       200       210       220      
pF1KSD KQTSDGNWLMVHRTEVVKNNLNPVWRPFKISLNSLCYGDMDKTIKVECYDYDNDGSHDLI
       : . : .  .: ::::::::::: :.::..::.:::  :. . .:   ::::..:.::.:
CCDS96 KTNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLSLHSLCSCDVHRPLKFLVYDYDSSGKHDFI
     180       190       200       210       220       230         

        230         240       250       260       270       280    
pF1KSD GTFQTTMTKLKE--ASRSSPVEFECINEKKRQKKKSYKNSGVISVKQCEITVECTFLDYI
       : : .:. ...:  :. .. ....::: : :.:::.::.::.. . :: .    ::::::
CCDS96 GEFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYRDKKKNYKSSGTVVLAQCTVEKVHTFLDYI
     240       250       260       270       280       290         

          290       300       310       320       330       340    
pF1KSD MGGCQLNFTVGVDFTGSNGDPRSPDSLHYISPNGVNEYLTALWSVGLVIQDYDADKMFPA
       :::::..:::..:::.::::::: .::: .::   :.:: :: .:: . ::::.:: :::
CCDS96 MGGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLSPRQPNHYLQALRAVGGICQDYDSDKRFPA
     300       310       320       330       340       350         

          350       360       370       380       390       400    
pF1KSD FGFGAQIPPQWQVSHEFPMNFNPSNPYCNGIQGIVEAYRSCLPQIKLYGPTNFSPIINHV
       :::::.:::...:::.: .::.: :: :. :.:.. .:: :::::.:::::: .::::.:
CCDS96 FGFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEISGVIASYRRCLPQIQLYGPTNVAPIINRV
     360       370       380       390       400       410         

          410       420       430       440       450       460    
pF1KSD ARFAAAATQQQTASQYFVLLIITDGVITDLDETRQAIVNASRLPMSIIIVGVGGADFSAM
       :. :    .   :..: :::..::::..:. ::: ::: ::::::::::::::.:::: :
CCDS96 AEPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMAETRTAIVRASRLPMSIIIVGVGNADFSDM
     420       430       440       450       460       470         

          470       480       490       500       510       520    
pF1KSD EFLDGDGGSLRSPLGEVAIRDIVQFVPFRQFQNAPKEALAQCVLAEIPQQVVGYFNTYKL
       ..:::: : :: : :  : ::::::::::.:..:   :::.:::::.:.::: :. .  .
CCDS96 RLLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDFKDAAPSALAKCVLAEVPRQVVEYYASQGI
     480       490       500       510       520       530         

            530           
pF1KSD LP--PKNPATKQQKQ    
        :  :. : :         
CCDS96 SPGAPR-PCTLATTPSPSP
     540        550       

>>CCDS61413.1 CPNE6 gene_id:9362|Hs108|chr14              (612 aa)
 initn: 1911 init1: 1178 opt: 1935  Z-score: 2318.4  bits: 438.9 E(32554): 8.2e-123
Smith-Waterman score: 1935; 54.4% identity (77.6% similar) in 531 aa overlap (7-532:75-603)

                                       10        20        30      
pF1KSD                         MAAQCVTKVALNVSCANLLDKDIGSKSDPLCVLFLN
                                     ..: : ::: .:::.:  .:  : :::.  
CCDS61 ERGAPDREPSDMSDPEMGWVPEPPTMTLGASRVELRVSCHGLLDRDTLTKPHP-CVLLKL
           50        60        70        80        90        100   

         40        50        60        70        80        90      
pF1KSD TSGQQWYEVERTERIKNCLNPQFSKTFIIDYYFEVVQKLKFGVYDIDNKTIELSDDDFLG
        : .:: :::::: ...: .: ::... ..:.::  : :.: :.: .. .    .: :::
CCDS61 YSDEQWVEVERTEVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPLQFHVFDAEDGATSPRNDTFLG
           110       120       130       140       150       160   

        100       110       120       130        140       150     
pF1KSD ECECTLGQIVSSKKLTRPLVMKTGRPAGKGSITISAEEIKD-NRVVLFEMEARKLDNKDL
         :::::::::. :.:.::..:.:. :::..::: :::..  :  : . ..: :::::::
CCDS61 STECTLGQIVSQTKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGTNDYVQLTFRAYKLDNKDL
           170       180       190       200       210       220   

         160       170       180       190       200       210     
pF1KSD FGKSDPYLEFHKQTSDGNWLMVHRTEVVKNNLNPVWRPFKISLNSLCYGDMDKTIKVECY
       :.::::..:..: . : .  .: ::::::::::: :.::..::.:::  :. . .:   :
CCDS61 FSKSDPFMEIYKTNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLSLHSLCSCDVHRPLKFLVY
           230       240       250       260       270       280   

         220       230         240       250       260       270   
pF1KSD DYDNDGSHDLIGTFQTTMTKLKE--ASRSSPVEFECINEKKRQKKKSYKNSGVISVKQCE
       :::..:.::.:: : .:. ...:  :. .. ....::: : :.:::.::.::.. . :: 
CCDS61 DYDSSGKHDFIGEFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYRDKKKNYKSSGTVVLAQCT
           290       300       310       320       330       340   

           280       290       300       310       320       330   
pF1KSD ITVECTFLDYIMGGCQLNFTVGVDFTGSNGDPRSPDSLHYISPNGVNEYLTALWSVGLVI
       .    :::::::::::..:::..:::.::::::: .::: .::   :.:: :: .:: . 
CCDS61 VEKVHTFLDYIMGGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLSPRQPNHYLQALRAVGGIC
           350       360       370       380       390       400   

           340       350       360       370       380       390   
pF1KSD QDYDADKMFPAFGFGAQIPPQWQVSHEFPMNFNPSNPYCNGIQGIVEAYRSCLPQIKLYG
       ::::.:: ::::::::.:::...:::.: .::.: :: :. :.:.. .:: :::::.:::
CCDS61 QDYDSDKRFPAFGFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEISGVIASYRRCLPQIQLYG
           410       420       430       440       450       460   

           400       410       420       430       440       450   
pF1KSD PTNFSPIINHVARFAAAATQQQTASQYFVLLIITDGVITDLDETRQAIVNASRLPMSIII
       ::: .::::.::. :    .   :..: :::..::::..:. ::: ::: ::::::::::
CCDS61 PTNVAPIINRVAEPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMAETRTAIVRASRLPMSIII
           470       480       490       500       510       520   

           460       470       480       490       500       510   
pF1KSD VGVGGADFSAMEFLDGDGGSLRSPLGEVAIRDIVQFVPFRQFQNAPKEALAQCVLAEIPQ
       ::::.:::: :..:::: : :: : :  : ::::::::::.:..:   :::.:::::.:.
CCDS61 VGVGNADFSDMRLLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDFKDAAPSALAKCVLAEVPR
           530       540       550       560       570       580   

           520         530           
pF1KSD QVVGYFNTYKLLP--PKNPATKQQKQ    
       ::: :. .  . :  :. : :         
CCDS61 QVVEYYASQGISPGAPR-PCTLATTPSPSP
           590       600        610  

>>CCDS8733.1 CPNE8 gene_id:144402|Hs108|chr12             (564 aa)
 initn: 944 init1: 837 opt: 1848  Z-score: 2214.7  bits: 419.6 E(32554): 4.9e-117
Smith-Waterman score: 1848; 52.4% identity (78.0% similar) in 540 aa overlap (2-530:19-550)

                                10        20        30         40  
pF1KSD                  MAAQCVTKVALNVSCANLLDKDIGSKSDPLCVLFLNTSG-QQW
                         ::  .:.: ..::: ::::.:  :::::.:::...  : ..:
CCDS87 MDSRYNSTAGIGDLNQLSAAIPATRVEVSVSCRNLLDRDTFSKSDPICVLYVQGVGNKEW
               10        20        30        40        50        60

             50        60        70        80        90       100  
pF1KSD YEVERTERIKNCLNPQFSKTFIIDYYFEVVQKLKFGVYDIDNKTIELSDDDFLGECECTL
        :  ::: : : :::.: . ::.::.::  ..:.: .::.:.:. .::  ::::.  :::
CCDS87 REFGRTEVIDNTLNPDFVRKFILDYFFEERENLRFDLYDVDSKSPNLSKHDFLGQVFCTL
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