Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0558
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0558, 1145 aa
  1>>>pF1KSDA0558 1145 - 1145 aa - 1145 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1133+/-0.00107; mu= 14.9989+/- 0.065
 mean_var=140.3742+/-28.155, 0's: 0 Z-trim(108.9): 22  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.108251
 statistics sampled from 10480 (10497) to 10480 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.662), E-opt: 0.2 (0.322), width:  16
 Scan time:  5.020

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS63647.1 CACNA2D2 gene_id:9254|Hs108|chr3       (1145) 7789 1229.1       0
CCDS33763.1 CACNA2D2 gene_id:9254|Hs108|chr3       (1143) 7748 1222.6       0
CCDS54588.1 CACNA2D2 gene_id:9254|Hs108|chr3       (1150) 7715 1217.5       0
CCDS77748.1 CACNA2D2 gene_id:9254|Hs108|chr3       (1076) 7268 1147.7       0
CCDS5598.1 CACNA2D1 gene_id:781|Hs108|chr7         (1091) 3937 627.5 5.3e-179
CCDS44785.1 CACNA2D4 gene_id:93589|Hs108|chr12     (1137) 1539 253.0   3e-66
CCDS54598.1 CACNA2D3 gene_id:55799|Hs108|chr3      (1091) 1430 235.9 3.9e-61
CCDS78253.1 CACNA2D1 gene_id:781|Hs108|chr7        ( 309) 1040 174.6 3.2e-43


>>CCDS63647.1 CACNA2D2 gene_id:9254|Hs108|chr3            (1145 aa)
 initn: 7789 init1: 7789 opt: 7789  Z-score: 6578.0  bits: 1229.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7789; 100.0% identity (100.0% similar) in 1145 aa overlap (1-1145:1-1145)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAVPARTCGASRPGPARTARPWPGCGPHPGPGTRRPTSGPPRPLWLLLPLLPLLAAPGAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 MAVPARTCGASRPGPARTARPWPGCGPHPGPGTRRPTSGPPRPLWLLLPLLPLLAAPGAS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD AYSFPQQHTMQHWARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYKDNRNLFEVQENEPQKLVEKVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 AYSFPQQHTMQHWARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYKDNRNLFEVQENEPQKLVEKVA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD GDIESLLDRKVQALKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDIVYYDAKADAELDDPESEDVER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 GDIESLLDRKVQALKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDIVYYDAKADAELDDPESEDVER
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD GSKASTLRLDFIEDPNFKNKVNYSYAAVQIPTDIYKGSTVILNELNWTEALENVFMENRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 GSKASTLRLDFIEDPNFKNKVNYSYAAVQIPTDIYKGSTVILNELNWTEALENVFMENRR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD QDPTLLWQVFGSATGVTRYYPATPWRAPKKIDLYDVRRRPWYIQGASSPKDMVIIVDVSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 QDPTLLWQVFGSATGVTRYYPATPWRAPKKIDLYDVRRRPWYIQGASSPKDMVIIVDVSG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD SVSGLTLKLMKTSVCEMLDTLSDDDYVNVASFNEKAQPVSCFTHLVQANVRNKKVFKEAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 SVSGLTLKLMKTSVCEMLDTLSDDDYVNVASFNEKAQPVSCFTHLVQANVRNKKVFKEAV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD QGMVAKGTTGYKAGFEYAFDQLQNSNITRANCNKMIMMFTDGGEDRVQDVFEKYNWPNRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 QGMVAKGTTGYKAGFEYAFDQLQNSNITRANCNKMIMMFTDGGEDRVQDVFEKYNWPNRT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD VRVFTFSVGQHNYDVTPLQWMACANKGYYFEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGKEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 VRVFTFSVGQHNYDVTPLQWMACANKGYYFEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGKEA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD KQVQWTNVYEDALGLGLVVTGTLPVFNLTQDGPGEKKNQLILGVMGIDVALNDIKRLTPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 KQVQWTNVYEDALGLGLVVTGTLPVFNLTQDGPGEKKNQLILGVMGIDVALNDIKRLTPN
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD YTLGANGYVFAIDLNGYVLLHPNLKPQTTNFREPVTLDFLDAELEDENKEEIRRSMIDGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 YTLGANGYVFAIDLNGYVLLHPNLKPQTTNFREPVTLDFLDAELEDENKEEIRRSMIDGN
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD KGHKQIRTLVKSLDERYIDEVTRNYTWVPIRSTNYSLGLVLPPYSTFYLQANLSDQILQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 KGHKQIRTLVKSLDERYIDEVTRNYTWVPIRSTNYSLGLVLPPYSTFYLQANLSDQILQV
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD KYFEFLLPSSFESEGHVFIAPREYCKDLNASDNNTEFLKNFIELMEKVTPDSKQCNNFLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 KYFEFLLPSSFESEGHVFIAPREYCKDLNASDNNTEFLKNFIELMEKVTPDSKQCNNFLL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD HNLILDTGITQQLVERVWRDQDLNTYSLLAVFAATDGGITRVFPNKAAEDWTENPEPFNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 HNLILDTGITQQLVERVWRDQDLNTYSLLAVFAATDGGITRVFPNKAAEDWTENPEPFNA
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD SFYRRSLDNHGYVFKPPHQDALLRPLELENDTVGILVSTAVELSLGRRTLRPAVVGVKLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 SFYRRSLDNHGYVFKPPHQDALLRPLELENDTVGILVSTAVELSLGRRTLRPAVVGVKLD
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD LEAWAEKFKVLASNRTHQDQPQKCGPNSHCEMDCEVNNEDLLCVLIDDGGFLVLSNQNHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 LEAWAEKFKVLASNRTHQDQPQKCGPNSHCEMDCEVNNEDLLCVLIDDGGFLVLSNQNHQ
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD WDQVGRFFSEVDANLMLALYNNSFYTRKESYDYQAACAPQPPGNLGAAPRGVFVPTVADF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 WDQVGRFFSEVDANLMLALYNNSFYTRKESYDYQAACAPQPPGNLGAAPRGVFVPTVADF
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD LNLAWWTSAAAWSLFQQLLYGLIYHSWFQADPAEAEGSPETRESSCVMKQTQYYFGSVNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 LNLAWWTSAAAWSLFQQLLYGLIYHSWFQADPAEAEGSPETRESSCVMKQTQYYFGSVNA
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD SYNAIIDCGNCSRLFHAQRLTNTNLLFVVAEKPLCSQCEAGRLLQKETHCPADGPEQCEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 SYNAIIDCGNCSRLFHAQRLTNTNLLFVVAEKPLCSQCEAGRLLQKETHCPADGPEQCEL
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD VQRPRYRRGPHICFDYNATEDTSDCGRGASFPPSLGVLVSLQLLLLLGLPPRPQPQVLVH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 VQRPRYRRGPHICFDYNATEDTSDCGRGASFPPSLGVLVSLQLLLLLGLPPRPQPQVLVH
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

            
pF1KSD ASRRL
       :::::
CCDS63 ASRRL
            

>>CCDS33763.1 CACNA2D2 gene_id:9254|Hs108|chr3            (1143 aa)
 initn: 7748 init1: 7244 opt: 7748  Z-score: 6543.4  bits: 1222.6 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7748; 99.7% identity (99.8% similar) in 1145 aa overlap (1-1145:1-1143)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAVPARTCGASRPGPARTARPWPGCGPHPGPGTRRPTSGPPRPLWLLLPLLPLLAAPGAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MAVPARTCGASRPGPARTARPWPGCGPHPGPGTRRPTSGPPRPLWLLLPLLPLLAAPGAS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD AYSFPQQHTMQHWARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYKDNRNLFEVQENEPQKLVEKVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AYSFPQQHTMQHWARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYKDNRNLFEVQENEPQKLVEKVA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD GDIESLLDRKVQALKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDIVYYDAKADAELDDPESEDVER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GDIESLLDRKVQALKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDIVYYDAKADAELDDPESEDVER
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD GSKASTLRLDFIEDPNFKNKVNYSYAAVQIPTDIYKGSTVILNELNWTEALENVFMENRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GSKASTLRLDFIEDPNFKNKVNYSYAAVQIPTDIYKGSTVILNELNWTEALENVFMENRR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD QDPTLLWQVFGSATGVTRYYPATPWRAPKKIDLYDVRRRPWYIQGASSPKDMVIIVDVSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QDPTLLWQVFGSATGVTRYYPATPWRAPKKIDLYDVRRRPWYIQGASSPKDMVIIVDVSG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD SVSGLTLKLMKTSVCEMLDTLSDDDYVNVASFNEKAQPVSCFTHLVQANVRNKKVFKEAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SVSGLTLKLMKTSVCEMLDTLSDDDYVNVASFNEKAQPVSCFTHLVQANVRNKKVFKEAV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD QGMVAKGTTGYKAGFEYAFDQLQNSNITRANCNKMIMMFTDGGEDRVQDVFEKYNWPNRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QGMVAKGTTGYKAGFEYAFDQLQNSNITRANCNKMIMMFTDGGEDRVQDVFEKYNWPNRT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD VRVFTFSVGQHNYDVTPLQWMACANKGYYFEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGKEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VRVFTFSVGQHNYDVTPLQWMACANKGYYFEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGKEA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD KQVQWTNVYEDALGLGLVVTGTLPVFNLTQDGPGEKKNQLILGVMGIDVALNDIKRLTPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KQVQWTNVYEDALGLGLVVTGTLPVFNLTQDGPGEKKNQLILGVMGIDVALNDIKRLTPN
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD YTLGANGYVFAIDLNGYVLLHPNLKPQTTNFREPVTLDFLDAELEDENKEEIRRSMIDGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YTLGANGYVFAIDLNGYVLLHPNLKPQTTNFREPVTLDFLDAELEDENKEEIRRSMIDGN
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD KGHKQIRTLVKSLDERYIDEVTRNYTWVPIRSTNYSLGLVLPPYSTFYLQANLSDQILQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KGHKQIRTLVKSLDERYIDEVTRNYTWVPIRSTNYSLGLVLPPYSTFYLQANLSDQILQV
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD KYFEFLLPSSFESEGHVFIAPREYCKDLNASDNNTEFLKNFIELMEKVTPDSKQCNNFLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KYFEFLLPSSFESEGHVFIAPREYCKDLNASDNNTEFLKNFIELMEKVTPDSKQCNNFLL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD HNLILDTGITQQLVERVWRDQDLNTYSLLAVFAATDGGITRVFPNKAAEDWTENPEPFNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 HNLILDTGITQQLVERVWRDQDLNTYSLLAVFAATDGGITRVFPNKAAEDWTENPEPFNA
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD SFYRRSLDNHGYVFKPPHQDALLRPLELENDTVGILVSTAVELSLGRRTLRPAVVGVKLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SFYRRSLDNHGYVFKPPHQDALLRPLELENDTVGILVSTAVELSLGRRTLRPAVVGVKLD
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD LEAWAEKFKVLASNRTHQDQPQKCGPNSHCEMDCEVNNEDLLCVLIDDGGFLVLSNQNHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LEAWAEKFKVLASNRTHQDQPQKCGPNSHCEMDCEVNNEDLLCVLIDDGGFLVLSNQNHQ
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD WDQVGRFFSEVDANLMLALYNNSFYTRKESYDYQAACAPQPPGNLGAAPRGVFVPTVADF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 WDQVGRFFSEVDANLMLALYNNSFYTRKESYDYQAACAPQPPGNLGAAPRGVFVPTVADF
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD LNLAWWTSAAAWSLFQQLLYGLIYHSWFQADPAEAEGSPETRESSCVMKQTQYYFGSVNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LNLAWWTSAAAWSLFQQLLYGLIYHSWFQADPAEAEGSPETRESSCVMKQTQYYFGSVNA
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD SYNAIIDCGNCSRLFHAQRLTNTNLLFVVAEKPLCSQCEAGRLLQKETHCPADGPEQCEL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::  .::::::::
CCDS33 SYNAIIDCGNCSRLFHAQRLTNTNLLFVVAEKPLCSQCEAGRLLQKETH--SDGPEQCEL
             1030      1040      1050      1060        1070        

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD VQRPRYRRGPHICFDYNATEDTSDCGRGASFPPSLGVLVSLQLLLLLGLPPRPQPQVLVH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VQRPRYRRGPHICFDYNATEDTSDCGRGASFPPSLGVLVSLQLLLLLGLPPRPQPQVLVH
     1080      1090      1100      1110      1120      1130        

            
pF1KSD ASRRL
       :::::
CCDS33 ASRRL
     1140   

>>CCDS54588.1 CACNA2D2 gene_id:9254|Hs108|chr3            (1150 aa)
 initn: 4953 init1: 4449 opt: 7715  Z-score: 6515.5  bits: 1217.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7715; 99.0% identity (99.1% similar) in 1152 aa overlap (1-1145:1-1150)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAVPARTCGASRPGPARTARPWPGCGPHPGPGTRRPTSGPPRPLWLLLPLLPLLAAPGAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MAVPARTCGASRPGPARTARPWPGCGPHPGPGTRRPTSGPPRPLWLLLPLLPLLAAPGAS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD AYSFPQQHTMQHWARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYKDNRNLFEVQENEPQKLVEKVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AYSFPQQHTMQHWARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYKDNRNLFEVQENEPQKLVEKVA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD GDIESLLDRKVQALKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDIVYYDAKADAELDDPESEDVER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GDIESLLDRKVQALKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDIVYYDAKADAELDDPESEDVER
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD GSKASTLRLDFIEDPNFKNKVNYSYAAVQIPTDIYKGSTVILNELNWTEALENVFMENRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GSKASTLRLDFIEDPNFKNKVNYSYAAVQIPTDIYKGSTVILNELNWTEALENVFMENRR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD QDPTLLWQVFGSATGVTRYYPATPWRAPKKIDLYDVRRRPWYIQGASSPKDMVIIVDVSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QDPTLLWQVFGSATGVTRYYPATPWRAPKKIDLYDVRRRPWYIQGASSPKDMVIIVDVSG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD SVSGLTLKLMKTSVCEMLDTLSDDDYVNVASFNEKAQPVSCFTHLVQANVRNKKVFKEAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SVSGLTLKLMKTSVCEMLDTLSDDDYVNVASFNEKAQPVSCFTHLVQANVRNKKVFKEAV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD QGMVAKGTTGYKAGFEYAFDQLQNSNITRANCNKMIMMFTDGGEDRVQDVFEKYNWPNRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QGMVAKGTTGYKAGFEYAFDQLQNSNITRANCNKMIMMFTDGGEDRVQDVFEKYNWPNRT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD VRVFTFSVGQHNYDVTPLQWMACANKGYYFEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGKEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VRVFTFSVGQHNYDVTPLQWMACANKGYYFEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGKEA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD KQVQWTNVYEDALGLGLVVTGTLPVFNLTQDGPGEKKNQLILGVMGIDVALNDIKRLTPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KQVQWTNVYEDALGLGLVVTGTLPVFNLTQDGPGEKKNQLILGVMGIDVALNDIKRLTPN
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD YTLGANGYVFAIDLNGYVLLHPNLKPQTTNFREPVTLDFLDAELEDENKEEIRRSMIDGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YTLGANGYVFAIDLNGYVLLHPNLKPQTTNFREPVTLDFLDAELEDENKEEIRRSMIDGN
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD KGHKQIRTLVKSLDERYIDEVTRNYTWVPIRSTNYSLGLVLPPYSTFYLQANLSDQILQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KGHKQIRTLVKSLDERYIDEVTRNYTWVPIRSTNYSLGLVLPPYSTFYLQANLSDQILQV
              610       620       630       640       650       660

                     670       680       690       700       710   
pF1KSD KY-------FEFLLPSSFESEGHVFIAPREYCKDLNASDNNTEFLKNFIELMEKVTPDSK
       :        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KLPISKLKDFEFLLPSSFESEGHVFIAPREYCKDLNASDNNTEFLKNFIELMEKVTPDSK
              670       680       690       700       710       720

           720       730       740       750       760       770   
pF1KSD QCNNFLLHNLILDTGITQQLVERVWRDQDLNTYSLLAVFAATDGGITRVFPNKAAEDWTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QCNNFLLHNLILDTGITQQLVERVWRDQDLNTYSLLAVFAATDGGITRVFPNKAAEDWTE
              730       740       750       760       770       780

           780       790       800       810       820       830   
pF1KSD NPEPFNASFYRRSLDNHGYVFKPPHQDALLRPLELENDTVGILVSTAVELSLGRRTLRPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NPEPFNASFYRRSLDNHGYVFKPPHQDALLRPLELENDTVGILVSTAVELSLGRRTLRPA
              790       800       810       820       830       840

           840       850       860       870       880       890   
pF1KSD VVGVKLDLEAWAEKFKVLASNRTHQDQPQKCGPNSHCEMDCEVNNEDLLCVLIDDGGFLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VVGVKLDLEAWAEKFKVLASNRTHQDQPQKCGPNSHCEMDCEVNNEDLLCVLIDDGGFLV
              850       860       870       880       890       900

           900       910       920       930       940       950   
pF1KSD LSNQNHQWDQVGRFFSEVDANLMLALYNNSFYTRKESYDYQAACAPQPPGNLGAAPRGVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LSNQNHQWDQVGRFFSEVDANLMLALYNNSFYTRKESYDYQAACAPQPPGNLGAAPRGVF
              910       920       930       940       950       960

           960       970       980       990      1000      1010   
pF1KSD VPTVADFLNLAWWTSAAAWSLFQQLLYGLIYHSWFQADPAEAEGSPETRESSCVMKQTQY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VPTVADFLNLAWWTSAAAWSLFQQLLYGLIYHSWFQADPAEAEGSPETRESSCVMKQTQY
              970       980       990      1000      1010      1020

          1020      1030      1040      1050      1060      1070   
pF1KSD YFGSVNASYNAIIDCGNCSRLFHAQRLTNTNLLFVVAEKPLCSQCEAGRLLQKETHCPAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::  .:
CCDS54 YFGSVNASYNAIIDCGNCSRLFHAQRLTNTNLLFVVAEKPLCSQCEAGRLLQKETH--SD
             1030      1040      1050      1060      1070          

          1080      1090      1100      1110      1120      1130   
pF1KSD GPEQCELVQRPRYRRGPHICFDYNATEDTSDCGRGASFPPSLGVLVSLQLLLLLGLPPRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GPEQCELVQRPRYRRGPHICFDYNATEDTSDCGRGASFPPSLGVLVSLQLLLLLGLPPRP
     1080      1090      1100      1110      1120      1130        

          1140     
pF1KSD QPQVLVHASRRL
       ::::::::::::
CCDS54 QPQVLVHASRRL
     1140      1150

>>CCDS77748.1 CACNA2D2 gene_id:9254|Hs108|chr3            (1076 aa)
 initn: 7268 init1: 7268 opt: 7268  Z-score: 6138.6  bits: 1147.7 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7268; 100.0% identity (100.0% similar) in 1076 aa overlap (70-1145:1-1076)

      40        50        60        70        80        90         
pF1KSD PPRPLWLLLPLLPLLAAPGASAYSFPQQHTMQHWARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYK
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77                               MQHWARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYK
                                             10        20        30

     100       110       120       130       140       150         
pF1KSD DNRNLFEVQENEPQKLVEKVAGDIESLLDRKVQALKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DNRNLFEVQENEPQKLVEKVAGDIESLLDRKVQALKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDI
               40        50        60        70        80        90

     160       170       180       190       200       210         
pF1KSD VYYDAKADAELDDPESEDVERGSKASTLRLDFIEDPNFKNKVNYSYAAVQIPTDIYKGST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 VYYDAKADAELDDPESEDVERGSKASTLRLDFIEDPNFKNKVNYSYAAVQIPTDIYKGST
              100       110       120       130       140       150

     220       230       240       250       260       270         
pF1KSD VILNELNWTEALENVFMENRRQDPTLLWQVFGSATGVTRYYPATPWRAPKKIDLYDVRRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 VILNELNWTEALENVFMENRRQDPTLLWQVFGSATGVTRYYPATPWRAPKKIDLYDVRRR
              160       170       180       190       200       210

     280       290       300       310       320       330         
pF1KSD PWYIQGASSPKDMVIIVDVSGSVSGLTLKLMKTSVCEMLDTLSDDDYVNVASFNEKAQPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PWYIQGASSPKDMVIIVDVSGSVSGLTLKLMKTSVCEMLDTLSDDDYVNVASFNEKAQPV
              220       230       240       250       260       270

     340       350       360       370       380       390         
pF1KSD SCFTHLVQANVRNKKVFKEAVQGMVAKGTTGYKAGFEYAFDQLQNSNITRANCNKMIMMF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SCFTHLVQANVRNKKVFKEAVQGMVAKGTTGYKAGFEYAFDQLQNSNITRANCNKMIMMF
              280       290       300       310       320       330

     400       410       420       430       440       450         
pF1KSD TDGGEDRVQDVFEKYNWPNRTVRVFTFSVGQHNYDVTPLQWMACANKGYYFEIPSIGAIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TDGGEDRVQDVFEKYNWPNRTVRVFTFSVGQHNYDVTPLQWMACANKGYYFEIPSIGAIR
              340       350       360       370       380       390

     460       470       480       490       500       510         
pF1KSD INTQEYLDVLGRPMVLAGKEAKQVQWTNVYEDALGLGLVVTGTLPVFNLTQDGPGEKKNQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 INTQEYLDVLGRPMVLAGKEAKQVQWTNVYEDALGLGLVVTGTLPVFNLTQDGPGEKKNQ
              400       410       420       430       440       450

     520       530       540       550       560       570         
pF1KSD LILGVMGIDVALNDIKRLTPNYTLGANGYVFAIDLNGYVLLHPNLKPQTTNFREPVTLDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LILGVMGIDVALNDIKRLTPNYTLGANGYVFAIDLNGYVLLHPNLKPQTTNFREPVTLDF
              460       470       480       490       500       510

     580       590       600       610       620       630         
pF1KSD LDAELEDENKEEIRRSMIDGNKGHKQIRTLVKSLDERYIDEVTRNYTWVPIRSTNYSLGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LDAELEDENKEEIRRSMIDGNKGHKQIRTLVKSLDERYIDEVTRNYTWVPIRSTNYSLGL
              520       530       540       550       560       570

     640       650       660       670       680       690         
pF1KSD VLPPYSTFYLQANLSDQILQVKYFEFLLPSSFESEGHVFIAPREYCKDLNASDNNTEFLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 VLPPYSTFYLQANLSDQILQVKYFEFLLPSSFESEGHVFIAPREYCKDLNASDNNTEFLK
              580       590       600       610       620       630

     700       710       720       730       740       750         
pF1KSD NFIELMEKVTPDSKQCNNFLLHNLILDTGITQQLVERVWRDQDLNTYSLLAVFAATDGGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 NFIELMEKVTPDSKQCNNFLLHNLILDTGITQQLVERVWRDQDLNTYSLLAVFAATDGGI
              640       650       660       670       680       690

     760       770       780       790       800       810         
pF1KSD TRVFPNKAAEDWTENPEPFNASFYRRSLDNHGYVFKPPHQDALLRPLELENDTVGILVST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TRVFPNKAAEDWTENPEPFNASFYRRSLDNHGYVFKPPHQDALLRPLELENDTVGILVST
              700       710       720       730       740       750

     820       830       840       850       860       870         
pF1KSD AVELSLGRRTLRPAVVGVKLDLEAWAEKFKVLASNRTHQDQPQKCGPNSHCEMDCEVNNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 AVELSLGRRTLRPAVVGVKLDLEAWAEKFKVLASNRTHQDQPQKCGPNSHCEMDCEVNNE
              760       770       780       790       800       810

     880       890       900       910       920       930         
pF1KSD DLLCVLIDDGGFLVLSNQNHQWDQVGRFFSEVDANLMLALYNNSFYTRKESYDYQAACAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DLLCVLIDDGGFLVLSNQNHQWDQVGRFFSEVDANLMLALYNNSFYTRKESYDYQAACAP
              820       830       840       850       860       870

     940       950       960       970       980       990         
pF1KSD QPPGNLGAAPRGVFVPTVADFLNLAWWTSAAAWSLFQQLLYGLIYHSWFQADPAEAEGSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 QPPGNLGAAPRGVFVPTVADFLNLAWWTSAAAWSLFQQLLYGLIYHSWFQADPAEAEGSP
              880       890       900       910       920       930

    1000      1010      1020      1030      1040      1050         
pF1KSD ETRESSCVMKQTQYYFGSVNASYNAIIDCGNCSRLFHAQRLTNTNLLFVVAEKPLCSQCE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 ETRESSCVMKQTQYYFGSVNASYNAIIDCGNCSRLFHAQRLTNTNLLFVVAEKPLCSQCE
              940       950       960       970       980       990

    1060      1070      1080      1090      1100      1110         
pF1KSD AGRLLQKETHCPADGPEQCELVQRPRYRRGPHICFDYNATEDTSDCGRGASFPPSLGVLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 AGRLLQKETHCPADGPEQCELVQRPRYRRGPHICFDYNATEDTSDCGRGASFPPSLGVLV
             1000      1010      1020      1030      1040      1050

    1120      1130      1140     
pF1KSD SLQLLLLLGLPPRPQPQVLVHASRRL
       ::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SLQLLLLLGLPPRPQPQVLVHASRRL
             1060      1070      

>>CCDS5598.1 CACNA2D1 gene_id:781|Hs108|chr7              (1091 aa)
 initn: 3345 init1: 779 opt: 3937  Z-score: 3327.1  bits: 627.5 E(32554): 5.3e-179
Smith-Waterman score: 3937; 54.3% identity (78.6% similar) in 1098 aa overlap (44-1126:7-1080)

            20        30        40        50        60        70   
pF1KSD GPARTARPWPGCGPHPGPGTRRPTSGPPRPLWLLLPLLPLLAAPGASAYSFPQQHTMQHW
                                     : : : :.  :    .:   ::.  :.. :
CCDS55                         MAAGCLLALTLTLFQSLLIGPSSEEPFPSAVTIKSW
                                       10        20        30      

            80        90       100       110       120       130   
pF1KSD ARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYKDNRNLFEVQENEPQKLVEKVAGDIESLLDRKVQA
       . ......  . .  .::.:: .::.  ..:. :. :. ..::: .: :::.::. . .:
CCDS55 VDKMQEDLVTLAKTASGVNQLVDIYEKYQDLYTVEPNNARQLVEIAARDIEKLLSNRSKA
         40        50        60        70        80        90      

           140       150       160       170       180       190   
pF1KSD LKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDIVYYDAKADAELDDPESEDVERGSKASTLRLDFIE
       : :::  ::. : ::.:....  ...:::.:: :    :::..: : ::.   ..  :::
CCDS55 LVRLALEAEKVQAAHQWREDFASNEVVYYNAKDDL---DPEKNDSEPGSQ--RIKPVFIE
        100       110       120       130          140         150 

           200       210       220       230       240       250   
pF1KSD DPNFKNKVNYSYAAVQIPTDIYKGSTVILNELNWTEALENVFMENRRQDPTLLWQVFGSA
       : ::  ...:..:::.::::::.:::..::::::: ::..:: .::..::.:::::::::
CCDS55 DANFGRQISYQHAAVHIPTDIYEGSTIVLNELNWTSALDEVFKKNREEDPSLLWQVFGSA
             160       170       180       190       200       210 

           260           270       280       290       300         
pF1KSD TGVTRYYPATPW----RAPKKIDLYDVRRRPWYIQGASSPKDMVIIVDVSGSVSGLTLKL
       ::..:::::.::    :.:.:::::::::::::::::.:::::.:.::::::::::::::
CCDS55 TGLARYYPASPWVDNSRTPNKIDLYDVRRRPWYIQGAASPKDMLILVDVSGSVSGLTLKL
             220       230       240       250       260       270 

     310       320       330       340       350       360         
pF1KSD MKTSVCEMLDTLSDDDYVNVASFNEKAQPVSCFTHLVQANVRNKKVFKEAVQGMVAKGTT
       ..::: :::.::::::.::::::: .:: :::: ::::::::::::.:.::....::: :
CCDS55 IRTSVSEMLETLSDDDFVNVASFNSNAQDVSCFQHLVQANVRNKKVLKDAVNNITAKGIT
             280       290       300       310       320       330 

     370       380       390       400       410       420         
pF1KSD GYKAGFEYAFDQLQNSNITRANCNKMIMMFTDGGEDRVQDVFEKYNWPNRTVRVFTFSVG
        :: :: .::.:: : :..::::::.::.::::::.:.:..:.:::  .. :::::::::
CCDS55 DYKKGFSFAFEQLLNYNVSRANCNKIIMLFTDGGEERAQEIFNKYN-KDKKVRVFTFSVG
             340       350       360       370        380       390

     430       440       450       460       470       480         
pF1KSD QHNYDVTPLQWMACANKGYYFEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGKEAKQVQWTNVY
       :::::  :.::::: :::::.::::::::::::::::::::::::::: .::::::::::
CCDS55 QHNYDRGPIQWMACENKGYYYEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGDKAKQVQWTNVY
              400       410       420       430       440       450

     490       500       510         520       530       540       
pF1KSD EDALGLGLVVTGTLPVFNLTQ--DGPGEKKNQLILGVMGIDVALNDIKRLTPNYTLGANG
        ::: ::::.::::::::.:   ..  . ::::::::::.::.:.::::::: .::  ::
CCDS55 LDALELGLVITGTLPVFNITGQFENKTNLKNQLILGVMGVDVSLEDIKRLTPRFTLCPNG
              460       470       480       490       500       510

       550       560       570       580       590       600       
pF1KSD YVFAIDLNGYVLLHPNLKPQTTNFREPVTLDFLDAELEDENKEEIRRSMIDGNKGHKQIR
       : :::: ::::::::::.:.. . .:::::::::::::.. : ::: .::::..:.: .:
CCDS55 YYFAIDPNGYVLLHPNLQPKNPKSQEPVTLDFLDAELENDIKVEIRNKMIDGESGEKTFR
              520       530       540       550       560       570

       610       620       630       640       650              660
pF1KSD TLVKSLDERYIDEVTRNYTWVPIRSTNYSLGLVLPPYSTFYLQANLSDQILQ-------V
       ::::: ::::::. .:.:::.:. .:.:::.:::: :: .:..:.: . : :       .
CCDS55 TLVKSQDERYIDKGNRTYTWTPVNGTDYSLALVLPTYSFYYIKAKLEETITQARSKKGKM
              580       590       600       610       620       630

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD KYFEFLLPSSFESEGHVFIAPREYCKDLNASDNNTEFLKNFIELMEKVTPDSKQCNNFLL
       :  : : :..::  :..:::::.::.::. :::::::: :: :.... ::.. .::  :.
CCDS55 KDSETLKPDNFEESGYTFIAPRDYCNDLKISDNNTEFLLNFNEFIDRKTPNNPSCNADLI
              640       650       660       670       680       690

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD HNLILDTGITQQLVERVWRDQDLNTYSLLAVFAATDGGITRVFPNKAAEDWTENPEPFNA
       . ..::.:.:..::.  :  :  :  .. : :..::::::::.:..:.:.: :::: .. 
CCDS55 NRVLLDAGFTNELVQNYWSKQK-NIKGVKARFVVTDGGITRVYPKEAGENWQENPETYED
              700       710        720       730       740         

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD SFYRRSLDNHGYVFKPPHQDALLRPLELENDTVGILVSTAVELSLGRRTLRPAVVGVKLD
       :::.::::: .:::  :. .    :   :.   ::.:: :::. .  . :.:::::.:.:
CCDS55 SFYKRSLDNDNYVFTAPYFNKS-GPGAYES---GIMVSKAVEIYIQGKLLKPAVVGIKID
     750       760       770           780       790       800     

              850       860        870       880       890         
pF1KSD LEAWAEKFKVLASNRTHQDQPQKC-GPNSHCEMDCEVNNEDLLCVLIDDGGFLVLSNQNH
       ...: :.:     ..:   .:  : ::   :  ::. :.. . ::..::::::...:.. 
CCDS55 VNSWIENF-----TKTSIRDP--CAGPV--C--DCKRNSDVMDCVILDDGGFLLMANHDD
         810            820             830       840       850    

     900       910       920       930       940       950         
pF1KSD QWDQVGRFFSEVDANLMLALYNNSFYTRKESYDYQAACAPQPPGNLGAAPRGVFVPTVAD
         .:.::::.:.: .::  : : : :. ..:::::..: :    . ::. :...::.:::
CCDS55 YTNQIGRFFGEIDPSLMRHLVNISVYAFNKSYDYQSVCEPGAAPKQGAGHRSAYVPSVAD
          860       870       880       890       900       910    

     960       970       980       990       1000      1010        
pF1KSD FLNLAWWTSAAAWSLFQQLLYGLIYHSWFQADPAEAEG-SPETRESSCVMKQTQYYFGSV
       .:...::..:::::..::.: .: .   ..:   : .  .    ..::. .::::.: . 
CCDS55 ILQIGWWATAAAWSILQQFLLSLTFPRLLEAVEMEDDDFTASLSKQSCITEQTQYFFDND
          920       930       940       950       960       970    

     1020      1030      1040      1050      1060      1070        
pF1KSD NASYNAIIDCGNCSRLFHAQRLTNTNLLFVVAEKPLCSQCEAGRLLQKETHCPADGPEQC
       . :.....:::::::.::...: ::::.:...:.     :..  :.: :    .:::. :
CCDS55 SKSFSGVLDCGNCSRIFHGEKLMNTNLIFIMVESKGTCPCDTRLLIQAEQ--TSDGPNPC
          980       990      1000      1010      1020        1030  

     1080      1090      1100      1110      1120      1130        
pF1KSD ELVQRPRYRRGPHICFDYNATEDTSDCGRGASFPPSLGVLVSLQLLLLLGLPPRPQPQVL
       ..:..::::.:: .::: :. :: .:::  ... :::  ....:.:::            
CCDS55 DMVKQPRYRKGPDVCFDNNVLEDYTDCGGVSGLNPSLWYIIGIQFLLLWLVSGSTHRLL 
           1040      1050      1060      1070      1080      1090  

     1140     
pF1KSD VHASRRL

>>CCDS44785.1 CACNA2D4 gene_id:93589|Hs108|chr12          (1137 aa)
 initn: 1171 init1: 287 opt: 1539  Z-score: 1302.9  bits: 253.0 E(32554): 3e-66
Smith-Waterman score: 1609; 29.8% identity (60.0% similar) in 1180 aa overlap (8-1115:3-1122)

               10            20        30         40               
pF1KSD MAVPARTCGASR----PGPARTARPWPGCGPHPGPGTRR-PTSGPPRP----------LW
              :: :     :.:  :    :.   .:. ..:  : .  :            ::
CCDS44      MVCGCSALLPLPNPRPTMPATPNFLANPSSSSRWIPLQPMPVAWAFVQKTSALLW
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          50        60        70        80        90       100     
pF1KSD LLLPLLPLLAAPGASAYSFPQQHTMQHWARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYKDNRNLF
       ::  ::    .:. .  ..: . :.. ::  .  .. ...  ..:   :.. ::: .. .
CCDS44 LL--LLGTSLSPAWGQAKIPLE-TVKLWADTFGGDLYNTVTKYSGSLLLQKKYKDVESSL
            60        70         80        90       100       110  

         110       120       130       140       150       160     
pF1KSD EVQENEPQKLVEKVAGDIESLLDRKVQALKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDIVYYDAK
       ...: .  .::.: . :.:..: :::.:.. :..:::. .  :......  .   ::.. 
CCDS44 KIEEVDGLELVRKFSEDMENMLRRKVEAVQNLVEAAEEADLNHEFNESLVFD---YYNSV
            120       130       140       150       160            

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pF1KSD ADAELDDPESEDVERGSKASTLRLDFIEDPN--FKN-KVNYSYAAVQIPTDIYKGSTVIL
          : :. ... :: :.       .:. . :  :.:  :: : ..::.::..:. .  ::
CCDS44 LINERDE-KGNFVELGA-------EFLLESNAHFSNLPVNTSISSVQLPTNVYNKDPDIL
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pF1KSD NELNWTEALENVFMENRRQDPTLLWQVFGSATGVTRYYPATPWRAPKK-IDLYDVRRRPW
       : .  .:::. ::.:: ..:::: :: ::::::  : ::.  :   .. .  .: : : :
CCDS44 NGVYMSEALNAVFVENFQRDPTLTWQYFGSATGFFRIYPGIKWTPDENGVITFDCRNRGW
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pF1KSD YIQGASSPKDMVIIVDVSGSVSGLTLKLMKTSVCEMLDTLSDDDYVNVASFNEKAQPVS-
       :::.:.::::.::.::::::..:: . . : ..  .::::...:..:. ..:. .. .  
CCDS44 YIQAATSPKDIVILVDVSGSMKGLRMTIAKHTITTILDTLGENDFINIIAYNDYVHYIEP
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pF1KSD CFTH-LVQANVRNKKVFKEAVQGMVAKGTTGYKAGFEYAFDQLQNSNITRAN--CNKMIM
       ::   ::::.  :.. ::  :. ...::.     ... ::. :.. . .. .  ::. ::
CCDS44 CFKGILVQADRDNREHFKLLVEELMVKGVGVVDQALREAFQILKQFQEAKQGSLCNQAIM
             350       360       370       380       390       400 

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pF1KSD MFTDGGEDRVQDVFEKYNWPNRTVRVFTFSVGQHNYDVTPLQWMACANKGYYFEIPSIGA
       ...::. .  . ::::::::.  :::::. .:..   .  ..:.:: ::::: .: ... 
CCDS44 LISDGAVEDYEPVFEKYNWPDCKVRVFTYLIGREVSFADRMKWIACNNKGYYTQISTLAD
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pF1KSD IRINTQEYLDVLGRPMVLAGKEAKQVQWTNVYED-------ALGLGLVVTGTLPVFNLTQ
        . :..::: ::.::::.  .. ... ::..: :       : .: :..: ..:::.  .
CCDS44 TQENVMEYLHVLSRPMVI--NHDHDIIWTEAYMDSKLLSSQAQSLTLLTTVAMPVFSKKN
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pF1KSD DGPGEKKNQLILGVMGIDVALNDIKRLTPNYTLGANGYVFAIDLNGYVLLHPNLKPQTTN
       .    ... ..:::.: :::: .. .:.: : ::..::.:    :::.: ::.:.:   .
CCDS44 E---TRSHGILLGVVGSDVALRELMKLAPRYKLGVHGYAFLNTNNGYILSHPDLRPLYRE
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pF1KSD FRE--PV----TLDFLDAELEDENKEEIRRSMIDGNKGHKQIRTLVKSLDERYIDEVTRN
        ..  :     ..:. ..: ::.  : .: .::. . :  .. . :     . .  .: .
CCDS44 GKKLKPKPNYNSVDLSEVEWEDQA-ESLRTAMINRETGTLSMDVKVPMDKGKRVLFLTND
        580       590       600        610       620       630     

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pF1KSD YTWVPIRSTNYSLGLVLP-PYSTFYLQANLSDQILQVKYFEFLLPSSFESEGHVFIAPRE
       : .. : .: .:::.::   .. . : .: :   ..    ..: :. .   :  .     
CCDS44 YFFTDISDTPFSLGVVLSRGHGEYILLGNTS---VEEGLHDLLHPD-LALAGDWI-----
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pF1KSD YC-KDLNASDNNTEFLKNFIELMEKVTPDSKQCNNFLLHNLILDTGITQQLVERVWRDQD
       ::  :.. .  .   :. .:... .  ::  .:.. :......:. .:  . :  :    
CCDS44 YCITDIDPDHRKLSQLEAMIRFLTRKDPDL-ECDEELVREVLFDAVVTAPM-EAYWTALA
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pF1KSD LNT-----YSLLAVFAATDGGITR----VFPNKAAEDWTENPEPFNASF-------YRRS
       ::      . .  .: .: .:. :    :  .:...    .::   . :       . :.
CCDS44 LNMSEESEHVVDMAFLGTRAGLLRSSLFVGSEKVSDRKFLTPEDEASVFTLDRFPLWYRQ
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pF1KSD LDNH---GYVFKPPHQDALLRPLELENDTVGILVSTAVELSLGRRTLRPAVVGVKLDLEA
        ..:   ..::.    ..   : :  .. . . .:::: ... .::   :..::.. :: 
CCDS44 ASEHPAGSFVFNLRWAEG---P-ESAGEPMVVTASTAVAVTVDKRTAIAAAAGVQMKLEF
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pF1KSD WAEKFKVLASNRTHQDQPQKCGPNSHCEMDCEVNNEDLLCVLIDDGGFLVLSNQNHQWDQ
         .:: . . . .  : :        : ..::  . :: : .::..::...:....   .
CCDS44 LQRKFWAATRQCSTVDGP--------CTQSCE--DSDLDCFVIDNNGFILISKRSR---E
              870               880         890       900          

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pF1KSD VGRFFSEVDANLMLALYNNSFYTRKESYDYQAACAPQPPGNLGAAPRGVFVPTVADFLNL
       .:::..:::. ..  : . . ...   ::::: : :.   . .: :   .:  .. ::  
CCDS44 TGRFLGEVDGAVLTQLLSMGVFSQVTMYDYQAMCKPSSHHHSAAQP---LVSPISAFL--
       910       920       930       940       950          960    

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pF1KSD AWWTSAAAWSLFQQLLYGL---IYHSWFQADPAEAEG----SPETRESS----CVMKQTQ
           .:. : : . .:. :   .. ::..   :::..    : . ....    :  .   
CCDS44 ----TATRWLLQELVLFLLEWSVWGSWYDRG-AEAKSVFHHSHKHKKQDPLQPCDTEYPV
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           1020      1030      1040      1050      1060      1070  
pF1KSD YYFGSVNASYNAIIDCGNCSRLFHAQRLTNTNLLFVVAEKPLCSQCEAGRLLQKETHCPA
       . .  .    :.:..:: :...: .:.. :.:::..:.. : :.      .::. :.   
CCDS44 FVYQPAIREANGIVECGPCQKVFVVQQIPNSNLLLLVTD-PTCDCSIFPPVLQEATEVKY
      1020      1030      1040      1050       1060      1070      

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pF1KSD DGPEQCELVQRPRYRRGPHICFDYNATEDTSDCGRGAS----FPPSLGVLVSLQLLLLLG
       ..  .:. ..  . :: :  :  ..  :...::: :::     :: :             
CCDS44 NASVKCDRMRSQKLRRRPDSCHAFHPEENAQDCG-GASDTSASPPLLLLPVCAWGLLPQL
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     1130      1140     
pF1KSD LPPRPQPQVLVHASRRL
                        
CCDS44 LR               
                        

>>CCDS54598.1 CACNA2D3 gene_id:55799|Hs108|chr3           (1091 aa)
 initn: 1120 init1: 295 opt: 1430  Z-score: 1211.1  bits: 235.9 E(32554): 3.9e-61
Smith-Waterman score: 1582; 30.1% identity (60.9% similar) in 1153 aa overlap (30-1127:3-1088)

               10        20        30         40        50         
pF1KSD MAVPARTCGASRPGPARTARPWPGCGPHPGPGT-RRPTSGPPRPLWLLLPLLPLLAAPGA
                                    :::. :: . :       ::    : :: : 
CCDS54                            MAGPGSPRRASRGASA----LLAAALLYAALGD
                                          10            20         

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pF1KSD SAYSFPQ--QHTMQHWARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYKDNRNLFEVQENEPQKLVE
        . :  :    ... ::  .  :. ..   ..: : :.. ::. ..   ..: .  .::.
CCDS54 VVRSEQQIPLSVVKLWASAFGGEIKSIAAKYSGSQLLQKKYKEYEKDVAIEEIDGLQLVK
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pF1KSD KVAGDIESLLDRKVQALKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDIVYYDAKADAELDDPESED
       :.: ..: .. .: .:..::..:::. .  :... ... :   :..:    :  : ... 
CCDS54 KLAKNMEEMFHKKSEAVRRLVEAAEEAHLKHEFDADLQYE---YFNAVLINE-RDKDGNF
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pF1KSD VERGSKASTLRLDFIEDPN--FKN-KVNYSYAAVQIPTDIYKGSTVILNELNWTEALENV
       .: :.       .::  ::  :.:  :: : . ::.::..:. . .:.: . :.:.:..:
CCDS54 LELGK-------EFILAPNDHFNNLPVNISLSDVQVPTNMYNKDPAIVNGVYWSESLNKV
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pF1KSD FMENRRQDPTLLWQVFGSATGVTRYYPATPWRAPKK-IDLYDVRRRPWYIQGASSPKDMV
       :..:  .::.:.:: :::: :  : ::.  :.  .. .  .: : : ::::.:.::::.:
CCDS54 FVDNFDRDPSLIWQYFGSAKGFFRQYPGIKWEPDENGVIAFDCRNRKWYIQAATSPKDVV
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pF1KSD IIVDVSGSVSGLTLKLMKTSVCEMLDTLSDDDYVNVASFNEKAQPVS-CFTH-LVQANVR
       :.::::::..:: : . : .:  .::::.:::. :. ..::. . :  :..  ::::.  
CCDS54 ILVDVSGSMKGLRLTIAKQTVSSILDTLGDDDFFNIIAYNEELHYVEPCLNGTLVQADRT
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pF1KSD NKKVFKEAVQGMVAKGTTGYKAGFEYAFDQLQNSNITRAN--CNKMIMMFTDGGEDRVQD
       ::. :.: .. . :::      ... ::. :.. : :  .  :.. ::..:::. :  . 
CCDS54 NKEHFREHLDKLFAKGIGMLDIALNEAFNILSDFNHTGQGSICSQAIMLITDGAVDTYDT
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       .: :::::.: ::.::. .:..   .  :.::::::::.. .: ... .. :..::: ::
CCDS54 IFAKYNWPDRKVRIFTYLIGREAAFADNLKWMACANKGFFTQISTLADVQENVMEYLHVL
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pF1KSD GRPMVLAGKEAKQVQWTNVYEDAL-----------GLGLVVTGTLPVFNLTQDGPGEKKN
       .:: :.   . ..: ::..: :.            :  :..: ..:::.  ..    ...
CCDS54 SRPKVI--DQEHDVVWTEAYIDSTLPQAQKLTDDQGPVLMTTVAMPVFSKQNE---TRSK
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pF1KSD QLILGVMGIDVALNDIKRLTPNYTLGANGYVFAIDLNGYVLLHPNLK---PQTTNFREP-
        ..:::.: :: .... .  :.: :: .::.:::  :::.: ::.:.    .  . :.: 
CCDS54 GILLGVVGTDVPVKELLKTIPKYKLGIHGYAFAITNNGYILTHPELRLLYEEGKKRRKPN
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pF1KSD -VTLDFLDAELEDENKEEIRRSMIDGNKGHKQIRTLVKSLDE-RYIDEVTRNYTWVPIRS
         ..:. ..: ::.. . .: .:.. . :. ... . :..:. . .  .: .: .. :..
CCDS54 YSSVDLSEVEWEDRD-DVLRNAMVNRKTGKFSME-VKKTVDKGKRVLVMTNDYYYTDIKG
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pF1KSD TNYSLGLVLP-PYSTFYLQANLSDQILQVKYFEFLLPSSFESEGHVFIAPR-EYCK-DLN
       : .:::..:   .. .....:..   ..    ..  :.       : .: .  ::. ::.
CCDS54 TPFSLGVALSRGHGKYFFRGNVT---IEEGLHDLEHPD-------VSLADEWSYCNTDLH
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pF1KSD ASDNNTEFLKNFIELMEKVTPDSKQCNNFLLHNLILDTGITQQLVERVWRDQDLNTY---
           .   :.  :.:. :      ::.. :......:. ..   .:  : .  ::     
CCDS54 PEHRHLSQLEA-IKLYLKGKEPLLQCDKELIQEVLFDAVVSAP-IEAYWTSLALNKSENS
             670        680       690       700        710         

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pF1KSD --SLLAVFAATDGGITRVFPNKAAEDWT--------ENPEPFNAS----FYRRSLDN--H
         .. ..: .:  :..:.    .::. :        .. . :::.    .:::. ..   
CCDS54 DKGVEVAFLGTRTGLSRINLFVGAEQLTNQDFLKAGDKENIFNADHFPLWYRRAAEQIPG
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pF1KSD GYVFKPPHQDALLRPLELENDTVGILVSTAVELSLGRRTLRPAVVGVKLDLEAWAEKFKV
       ..:.. : . .   :.   : .  . .::...:   :..   :.::... :: . .:: .
CCDS54 SFVYSIPFSTG---PV---NKSNVVTASTSIQLLDERKSPVVAAVGIQMKLEFFQRKFWT
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pF1KSD LASNRTHQDQPQKCGP-NSHCEMDCEVNNEDLLCVLIDDGGFLVLSNQNHQWDQVGRFFS
        ::        ..:.  ...: ..:.  .: . : :::..::...:   ... :.: ::.
CCDS54 -AS--------RQCASLDGKCSISCD--DETVNCYLIDNNGFILVS---EDYTQTGDFFG
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pF1KSD EVDANLMLALYNNSFYTRKESYDYQAACAPQPPGNLGAAPRGVFVPTVADFLNLAWWTSA
       :... .:  : . . . :   ::::: :  .  .. ::  .:.. :  : ::      ::
CCDS54 EIEGAVMNKLLTMGSFKRITLYDYQAMCRANKESSDGA--HGLLDPYNA-FL------SA
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pF1KSD AAWSLFQQLLYGLIYH--SWFQAD-PAEAEGSPETRESSCVMKQTQYYFGSVNASYNAII
       . : . . .:. . ..  ::...:  :.:.   .: :  :  .   .    .    .. :
CCDS54 VKWIMTELVLFLVEFNLCSWWHSDMTAKAQKLKQTLEP-CDTEYPAFVSERTIKETTGNI
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pF1KSD DCGNCSRLFHAQRLTNTNLLFVVAEKPLCSQCEA-GRLLQKETHCPADGPEQCELVQRPR
        : .::. :  :.. ..::..::...  :  ::. . . .   .   .   .:: ..  .
CCDS54 ACEDCSKSFVIQQIPSSNLFMVVVDSS-C-LCESVAPITMAPIEIRYNESLKCERLKAQK
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pF1KSD YRRGPHICFDYNATEDTSDCGRGASFPPSLGVLVSLQLLLLLGLPPRPQPQVLVHASRRL
        :: :. :  ..  :.. .:: ::    .  ::. : :::.:                  
CCDS54 IRRRPESCHGFHPEENARECG-GAPSLQAQTVLLLLPLLLMLFSR               
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>>CCDS78253.1 CACNA2D1 gene_id:781|Hs108|chr7             (309 aa)
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            20        30        40        50        60        70   
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                                     : : : :.  :    .:   ::.  :.. :
CCDS78                         MAAGCLLALTLTLFQSLLIGPSSEEPFPSAVTIKSW
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pF1KSD ARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYKDNRNLFEVQENEPQKLVEKVAGDIESLLDRKVQA
       . ......  . .  .::.:: .::.  ..:. :. :. ..::: .: :::.::. . .:
CCDS78 VDKMQEDLVTLAKTASGVNQLVDIYEKYQDLYTVEPNNARQLVEIAARDIEKLLSNRSKA
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pF1KSD LKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDIVYYDAKADAELDDPESEDVERGSKASTLRLDFIE
       : :::  ::. : ::.:....  ...:::.:: :    :::..: : ::.   ..  :::
CCDS78 LVRLALEAEKVQAAHQWREDFASNEVVYYNAKDDL---DPEKNDSEPGSQ--RIKPVFIE
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pF1KSD DPNFKNKVNYSYAAVQIPTDIYKGSTVILNELNWTEALENVFMENRRQDPTLLWQVFGSA
       : ::  ...:..:::.::::::.:::..::::::: ::..:: .::..::.:::::::::
CCDS78 DANFGRQISYQHAAVHIPTDIYEGSTIVLNELNWTSALDEVFKKNREEDPSLLWQVFGSA
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       ::..:::::.::    :.:.:::::::::::::::::.:::::.:.::::::::::::::
CCDS78 TGLARYYPASPWVDNSRTPNKIDLYDVRRRPWYIQGAASPKDMLILVDVSGSVSGLTLKL
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CCDS78 IRTSVSEMLETLSDDDFVNVASDSKEISPSPEEIFNAE                      
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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