Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0293
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0293, 1486 aa
  1>>>pF1KSDA0293 1486 - 1486 aa - 1486 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.0334+/-0.00101; mu= 1.9740+/- 0.061
 mean_var=394.2047+/-80.325, 0's: 0 Z-trim(116.5): 21  B-trim: 479 in 1/53
 Lambda= 0.064597
 statistics sampled from 17116 (17131) to 17116 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.781), E-opt: 0.2 (0.526), width:  16
 Scan time:  5.790

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS41837.1 CUX2 gene_id:23316|Hs108|chr12         (1486) 9830 931.2       0
CCDS56498.1 CUX1 gene_id:1523|Hs108|chr7           (1516) 1208 127.7 2.6e-28
CCDS5720.1 CUX1 gene_id:1523|Hs108|chr7            ( 678) 1162 123.1 2.9e-27
CCDS47672.1 CUX1 gene_id:1523|Hs108|chr7           ( 676) 1161 123.0 3.1e-27
CCDS5721.1 CUX1 gene_id:1523|Hs108|chr7            (1505) 1048 112.8   8e-24
CCDS59071.1 CUX1 gene_id:1523|Hs108|chr7           ( 639)  889 97.6 1.3e-19
CCDS56500.1 CUX1 gene_id:1523|Hs108|chr7           ( 662)  828 92.0 6.6e-18


>>CCDS41837.1 CUX2 gene_id:23316|Hs108|chr12              (1486 aa)
 initn: 9830 init1: 9830 opt: 9830  Z-score: 4964.4  bits: 931.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 9830; 99.9% identity (100.0% similar) in 1486 aa overlap (1-1486:1-1486)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAANVGSMFQYWKRFDLRRLQKELNSVASELSARQEESEHSHKHLIELRREFKKNVPEEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MAANVGSMFQYWKRFDLRRLQKELNSVASELSARQEESEHSHKHLIELRREFKKNVPEEI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD REMVAPVLKSFQAEVVALSKRSQEAEAAFLSVYKQLIEAPDPVPVFEAARSLDDRLQPPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 REMVAPVLKSFQAEVVALSKRSQEAEAAFLSVYKQLIEAPDPVPVFEAARSLDDRLQPPS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD FDPSGQPRRDLHTSWKRNPELLSPKEQREGTSPAGPTLTEGSRLPGIPGKALLTETLLQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 FDPSGQPRRDLHTSWKRNPELLSPKEQREGTSPAGPTLTEGSRLPGIPGKALLTETLLQR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD NEAEKQKGLQEVQITLAARLGEAEEKIKVLHSALKATQAELLELRRKYDEEAASKADEVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NEAEKQKGLQEVQITLAARLGEAEEKIKVLHSALKATQAELLELRRKYDEEAASKADEVG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD LIMTNLEKANQRAEAAQREVESLREQLASVNSSIRLACCSPQGPSGDKVNFTLCSGPRLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LIMTNLEKANQRAEAAQREVESLREQLASVNSSIRLACCSPQGPSGDKVNFTLCSGPRLE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD AALASKDREILRLLKDVQHLQSSLQELEEASANQIADLERQLTAKSEAIEKLEEKLQAQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AALASKDREILRLLKDVQHLQSSLQELEEASANQIADLERQLTAKSEAIEKLEEKLQAQS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD DYEEIKTELSILKAMKLASSTCSLPQGMAKPEDSLLIAKEAFFPTQKFLLEKPSLLASPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DYEEIKTELSILKAMKLASSTCSLPQGMAKPEDSLLIAKEAFFPTQKFLLEKPSLLASPE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD EDPSEDDSIKDSLGTEQSYPSPQQLPPPPGPEDPLSPSPGQPLLGPSLGPDGTRTFSLSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EDPSEDDSIKDSLGTEQSYPSPQQLPPPPGPEDPLSPSPGQPLLGPSLGPDGTRTFSLSP
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD FPSLASGERLMMPPAAFKGEAGGLLVFPPAFYGAKPPTAPATPAPGPEPLGGPEPADGGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 FPSLASGERLMMPPAAFKGEAGGLLVFPPAFYGAKPPTAPATPAPGPEPLGGPEPADGGG
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD GGAAGPGAEEEQLDTAEIAFQVKEQLLKHNIGQRVFGHYVLGLSQGSVSEILARPKPWRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GGAAGPGAEEEQLDTAEIAFQVKEQLLKHNIGQRVFGHYVLGLSQGSVSEILARPKPWRK
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD LTVKGKEPFIKMKQFLSDEQNVLALRTIQVRQRGSITPRIRTPETGSDDAIKSILEQAKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LTVKGKEPFIKMKQFLSDEQNVLALRTIQVRQRGSITPRIRTPETGSDDAIKSILEQAKK
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD EIESQKGGEPKTSVAPLSIANGTTPASTSEDAIKSILEQARREMQAQQQALLEMEVAPRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EIESQKGGEPKTSVAPLSIANGTTPASTSEDAIKSILEQARREMQAQQQALLEMEVAPRG
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD RSVPPSPPERPSLATASQNGAPALVKQEEGSGGPAQAPLPVLSPAAFVQSIIRKVKSEIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RSVPPSPPERPSLATASQNGAPALVKQEEGSGGPAQAPLPVLSPAAFVQSIIRKVKSEIG
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD DAGYFDHHWASDRGLLSRPYASVSPSLSSSSSSGYSGQPNGRAWPRGDEAPVPPEDEAAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DAGYFDHHWASDRGLLSRPYASVSPSLSSSSSSGYSGQPNGRAWPRGDEAPVPPEDEAAA
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD GAEDEPPRTGELKAEGATAEAGARLPYYPAYVPRTLKPTVPPLTPEQYELYMYREVDTLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GAEDEPPRTGELKAEGATAEAGARLPYYPAYVPRTLKPTVPPLTPEQYELYMYREVDTLE
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD LTRQVKEKLAKNGICQRIFGEKVLGLSQGSVSDMLSRPKPWSKLTQKGREPFIRMQLWLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LTRQVKEKLAKNGICQRIFGEKVLGLSQGSVSDMLSRPKPWSKLTQKGREPFIRMQLWLS
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD DQLGQAVGQQPGASQASPTEPRSSPSPPPSPTEPEKSSQEPLSLSLESSKENQQPEGRSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DQLGQAVGQQPGASQASPTEPRSSPSPPPSPTEPEKSSQEPLSLSLESSKENQQPEGRSS
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD SSLSGKMYSGSQAPGGIQEIVAMSPELDTYSITKRVKEVLTDNNLGQRLFGESILGLTQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SSLSGKMYSGSQAPGGIQEIVAMSPELDTYSITKRVKEVLTDNNLGQRLFGESILGLTQG
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD SVSDLLSRPKPWHKLSLKGREPFVRMQLWLNDPHNVEKLRDMKKLEKKAYLKRRYGLIST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SVSDLLSRPKPWHKLSLKGREPFVRMQLWLNDPHNVEKLRDMKKLEKKAYLKRRYGLIST
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KSD GSDSESPATRSECPSPCLQPQDLSLLQIKKPRVVLAPEEKEALRKAYQLEPYPSQQTIEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GSDSESPATRSECPSPCLQPQDLSLLQIKKPRVVLAPEEKEALRKAYQLEPYPSQQTIEL
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KSD LSFQLNLKTNTVINWFHNYRSRMRREMLVEGTQDEPDLDPSGGPGILPPGHSHPDPTPQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LSFQLNLKTNTVINWFHNYRSRMRREMLVEGTQDEPDLDPSGGPGILPPGHSHPDPTPQS
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KSD PDSETEDQKPTVKELELQEGPEENSTPLTTQDKAQVRIKQEQMEEDAEEEAGSQPQDSGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PDSETEDQKPTVKELELQEGPEENSTPLTTQDKAQVRIKQEQMEEDAEEEAGSQPQDSGE
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KSD LDKGQGPPKEEHPDPPGNDGLPKVAPGPLLPGGSTPDCPSLHPQQESEAGERLHPDPLSF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LDKGQGPPKEEHPDPPGNDGLPKVAPGPLLPGGSTPDCPSLHPQQESEAGERLHPDPLSF
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KSD KSASESSRCSLEVSLNSPSAASSPGLMMSVSPVPSSSAPISPSPPGAPPAKVPSASPTAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KSASESSRCSLEVSLNSPSAASSPGLMMSVSPVPSSSAPISPSPPGAPPAKVPSASPTAD
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      
pF1KSD MAGALHPSAKVNPNLQRRHEKMANLNNIIYRLERAANREEALEWEF
       :::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS41 MAGALHPSAKVNPNLQRRHEKMANLNNIIYRVERAANREEALEWEF
             1450      1460      1470      1480      

>>CCDS56498.1 CUX1 gene_id:1523|Hs108|chr7                (1516 aa)
 initn: 2691 init1: 693 opt: 1208  Z-score: 621.7  bits: 127.7 E(32554): 2.6e-28
Smith-Waterman score: 3724; 45.6% identity (67.7% similar) in 1596 aa overlap (1-1486:1-1516)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAANVGSMFQYWKRFDLRRLQKELNSVASELSARQEESEHSHKHLIELRREFKKNVPEEI
       :::::::::::::::::..::.::...:. :. ::.:::.:.:.:::  ::::::.::..
CCDS56 MAANVGSMFQYWKRFDLQQLQRELDATATVLANRQDESEQSRKRLIEQSREFKKNTPEDL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110          
pF1KSD REMVAPVLKSFQAEVVALSKRSQEAEAAFLSVYKQLIEAPDPVPVFEAARSLDDRLQP-P
       :..:::.:::::.:. ::::::.:::::::.:::.::..:::::... ...:. ..:   
CCDS56 RKQVAPLLKSFQGEIDALSKRSKEAEAAFLNVYKRLIDVPDPVPALDLGQQLQLKVQRLH
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KSD SFDPSGQPRRDLHTSWKRNPELLSPKEQREGTSPAGPTLTEGSRLPGIPGK--ALLTETL
       ...  .:  :.  :  . : :.   :.:.   .     . :  .     ..  ::  :  
CCDS56 DIETENQKLRE--TLEEYNKEFAEVKNQEVTIKALKEKIREYEQTLKNQAETIALEKEQK
              130         140       150       160       170        

       180       190       200       210       220       230       
pF1KSD LQRNEAEKQKGLQEVQITLAARLGEAEEKIKVLHSALKATQAELLELRRKYDEEAASKAD
       :: . :::.. :::.:.. ...: :::.:.. :..::. :..::..:. :::::...:::
CCDS56 LQNDFAEKERKLQETQMSTTSKLEEAEHKVQSLQTALEKTRTELFDLKTKYDEETTAKAD
      180       190       200       210       220       230        

       240       250       260       270       280       290       
pF1KSD EVGLIMTNLEKANQRAEAAQREVESLREQLASVNSSIRLACCSPQGPSGDKVNFTLCSGP
       :. .:::.::.::::::.::::.:.:::::.:.: :..::    ..:. ...  .: .  
CCDS56 EIEMIMTDLERANQRAEVAQREAETLREQLSSANHSLQLASQIQKAPDVEQAIEVL-TRS
      240       250       260       270       280       290        

       300       310       320       330       340       350       
pF1KSD RLEAALASKDREILRLLKDVQHLQSSLQELEEASANQIADLERQLTAKSEAIEKLEEKLQ
        ::. ::.:.::: .:..:::.::.:: .:.: ::.::..::.::.::. ....:::::.
CCDS56 SLEVELAAKEREIAQLVEDVQRLQASLTKLRENSASQISQLEQQLSAKNSTLKQLEEKLK
       300       310       320       330       340       350       

       360       370       380       390       400       410       
pF1KSD AQSDYEEIKTELSILKAMKLASSTCSLPQGMAKPEDSLLIAKEAFFPTQKFLLE-KPSLL
       .:.::::.: ::.:::.:..: :  .  :  ::: . ::. :.  . ...  :. . : :
CCDS56 GQADYEEVKKELNILKSMEFAPSEGAGTQDAAKPLEVLLLEKNRSLQSENAALRISNSDL
       360       370       380       390       400       410       

        420       430       440       450       460        470     
pF1KSD ASPEEDPSEDDSIKDSLGTEQSYPSPQQLPPPPGPEDPLSPSPGQPLLGPS-LGPDGTRT
       ..  .  ..:.  .   :.  . : :.:::  :: .   : . :   ..:. :. :   .
CCDS56 SGSARRKGKDQPESRRPGSLPA-PPPSQLPRNPGEQA--SNTNGTHQFSPAGLSQDFFSS
       420       430        440       450         460       470    

         480                490         500        510       520   
pF1KSD FSLSP-FPSLASG--------ERLMMPPAAFKG--EAGGL-LVFPPAFYGAKPPTAPATP
          :: .:  ..:        .: .:     :.  :::.  ..:  . :...  .. .  
CCDS56 SLASPSLPLASTGKFALNSLLQRQLMQSFYSKAMQEAGSTSMIFSTGPYSTNSISSQSPL
          480       490       500       510       520       530    

           530        540       550       560       570       580  
pF1KSD APGPEPLG-GPEPADGGGGGAAGPGAEEEQLDTAEIAFQVKEQLLKHNIGQRVFGHYVLG
         .:.  : .: :... ..:... :   :..:::::: ::::::.:::::::.:::::::
CCDS56 QQSPDVNGMAPSPSQSESAGSVSEG---EEMDTAEIARQVKEQLIKHNIGQRIFGHYVLG
          540       550          560       570       580       590 

            590       600       610       620       630            
pF1KSD LSQGSVSEILARPKPWRKLTVKGKEPFIKMKQFLSDEQNVLALRTIQVRQR---------
       :::::::::::::::: ::::.::::: :::::::::::.::::.:: :::         
CCDS56 LSQGSVSEILARPKPWNKLTVRGKEPFHKMKQFLSDEQNILALRSIQGRQRENPGQSLNR
             600       610       620       630       640       650 

                        640       650       660       670       680
pF1KSD -------------GSITPRIRTPETGSDDAIKSILEQAKKEIESQKGGEPKTSVAPLSIA
                    :.:: :::. :::::.::::::::::.:.. :: .::    :  : :
CCDS56 LFQEVPKRRNGSEGNITTRIRASETGSDEAIKSILEQAKRELQVQKTAEP----AQPSSA
             660       670       680       690       700           

              690       700       710                   720        
pF1KSD NGTTPASTSEDAIKSILEQARREMQAQQQAL---LEME---------VAPRGRSVPPSPP
       .:.   ..:.:::.:::.::::::.::: ::   :..          ..:.  :. : : 
CCDS56 SGS---GNSDDAIRSILQQARREMEAQQAALDPALKQAPLSQSDITILTPKLLSTSPMPT
       710          720       730       740       750       760    

        730              740       750        760       770        
pF1KSD --ERPSLA-------TASQNGAPALVKQEEGSGGPAQAP-LPVLSPAAFVQSIIRKVKSE
           : ::       .: . :: :: .    .    .:: :   . :  .:...:.::.:
CCDS56 VSSYPPLAISLKKPSAAPEAGASALPNPPALKKEAQDAPGLDPQGAADCAQGVLRQVKNE
          770       780       790       800       810       820    

      780       790       800       810          820       830     
pF1KSD IGDAGYFDHHWASDRGLLSRPYASVSPSLSSSSSSGY---SGQPNGRAWPRGDEAPV--P
       .: .: .  :: :      :  ::   . .  ...:    ::  .: . ::.... .  :
CCDS56 VGRSGAWKDHWWSAVQPERRNAASSEEAKAEETGGGKEKGSGGSGGGSQPRAERSQLQGP
          830       840       850       860       870       880    

              840       850          860       870         880     
pF1KSD PEDE---AAAGAEDEPPRTGELKAEGAT---AEAGARLPYYPAYVP--RTLKPTVPPLTP
         .:      .::.   ...::.  ::.   .  .. ::  :  ::  .  ::.::::::
CCDS56 SSSEYWKEWPSAESPYSQSSELSLTGASRSETPQNSPLPSSPI-VPMSKPTKPSVPPLTP
          890       900       910       920        930       940   

         890       900       910       920       930       940     
pF1KSD EQYELYMYREVDTLELTRQVKEKLAKNGICQRIFGEKVLGLSQGSVSDMLSRPKPWSKLT
       ::::.:::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 EQYEVYMYQEVDTIELTRQVKEKLAKNGICQRIFGEKVLGLSQGSVSDMLSRPKPWSKLT
           950       960       970       980       990      1000   

         950       960           970             980               
pF1KSD QKGREPFIRMQLWLSDQLGQAV----GQQPG------ASQASPTE---------PRSSPS
       ::::::::::::::. .:::.:    ::: :      .:  .: .         :..: :
CCDS56 QKGREPFIRMQLWLNGELGQGVLPVQGQQQGPVLHSVTSLQDPLQQGCVSSESTPKTSAS
          1010      1020      1030      1040      1050      1060   

        990      1000               1010          1020      1030   
pF1KSD PPPSPTEPEKSSQEPLSLS---------LESSKENQQPEGR----SSSSLSGKMYSGSQA
         :.:  : .::.   ::.         .:.::... ::      :.:. .  .  ....
CCDS56 CSPAPESPMSSSESVKSLTELVQQPCPPIEASKDSKPPEPSDPPASDSQPTTPLPLSGHS
          1070      1080      1090      1100      1110      1120   

          1040      1050      1060      1070      1080      1090   
pF1KSD PGGIQEIVAMSPELDTYSITKRVKEVLTDNNLGQRLFGESILGLTQGSVSDLLSRPKPWH
         .:::.::::::::::.:::::::::::::::::::::.:::::::::::::.::::::
CCDS56 ALSIQELVAMSPELDTYGITKRVKEVLTDNNLGQRLFGETILGLTQGSVSDLLARPKPWH
          1130      1140      1150      1160      1170      1180   

          1100      1110      1120      1130      1140         1150
pF1KSD KLSLKGREPFVRMQLWLNDPHNVEKLRDMKKLEKKAYLKRRYGLISTGSDSESPAT---R
       ::::::::::::::::::::.::::: :::..:::::.:::.. .: ..  : :..    
CCDS56 KLSLKGREPFVRMQLWLNDPNNVEKLMDMKRMEKKAYMKRRHSSVSDSQPCEPPSVGTEY
          1190      1200      1210      1220      1230      1240   

             1160      1170      1180      1190      1200      1210
pF1KSD SECPSPCLQPQDLSLLQIKKPRVVLAPEEKEALRKAYQLEPYPSQQTIELLSFQLNLKTN
       :.  ::  :::     :.:::::::::::::::..::: .:::: .::: :. ::::::.
CCDS56 SQGASP--QPQH----QLKKPRVVLAPEEKEALKRAYQQKPYPSPKTIEDLATQLNLKTS
            1250          1260      1270      1280      1290       

             1220      1230      1240      1250      1260      1270
pF1KSD TVINWFHNYRSRMRREMLVEGTQDEPDLDPSGGPGILPPGHSHPDPTPQSPDSETEDQKP
       ::::::::::::.:::...:  :       .:. :    : :  .:. .:  .   ..  
CCDS56 TVINWFHNYRSRIRRELFIEEIQ-------AGSQG--QAGASD-SPSARSGRAAPSSEGD
      1300      1310      1320               1330       1340       

             1280      1290      1300      1310      1320      1330
pF1KSD TVKELELQEGPEENSTPLTTQDKAQVRIKQEQMEEDAEEEAGSQPQDSGELDKGQGPPKE
       .   .:  :::   ..  : . :.: . ..:.. . ::.   ..:  ::      ::   
CCDS56 SCDGVEATEGP---GSADTEEPKSQGEAEREEVPRPAEQ---TEPPPSGT----PGPDDA
      1350         1360      1370      1380         1390           

             1340      1350      1360      1370      1380      1390
pF1KSD EHPDPPGNDGLPKVAPGPLLPGGSTPDCPSLHPQQESEAGERLHPDPLSFKSASESSRCS
       .  :   ..: :  .::::         ::  : . . ..    :.  . ..:.  ..  
CCDS56 RDDD---HEGGPVEGPGPL---------PS--PASATATAAPAAPEDAATSAAAAPGE--
      1400         1410                 1420      1430      1440   

             1400      1410      1420      1430      1440      1450
pF1KSD LEVSLNSPSAASSPGLMMSVSPVPSSSAPISPSPPGAPPAKVPSASPTADMAGALHPSAK
             .:.: ::       .: ::.:.  : : :  : ... :     . :::   ...
CCDS56 ------GPAAPSS-------APPPSNSS--SSSAPRRP-SSLQSLFGLPEAAGAR--DSR
                         1450        1460       1470      1480     

             1460      1470      1480      
pF1KSD VNPNLQRRHEKMANLNNIIYRLERAANREEALEWEF
        ::    :..: ::::.::.:::.::.::: .::::
CCDS56 DNP---LRKKKAANLNSIIHRLEKAASREEPIEWEF
             1490      1500      1510      

>>CCDS5720.1 CUX1 gene_id:1523|Hs108|chr7                 (678 aa)
 initn: 1028 init1: 667 opt: 1162  Z-score: 603.0  bits: 123.1 E(32554): 2.9e-27
Smith-Waterman score: 1162; 49.5% identity (79.6% similar) in 402 aa overlap (1-399:1-399)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAANVGSMFQYWKRFDLRRLQKELNSVASELSARQEESEHSHKHLIELRREFKKNVPEEI
       :::::::::::::::::..::.::...:. :. ::.:::.:.:.:::  ::::::.::..
CCDS57 MAANVGSMFQYWKRFDLQQLQRELDATATVLANRQDESEQSRKRLIEQSREFKKNTPEDL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110          
pF1KSD REMVAPVLKSFQAEVVALSKRSQEAEAAFLSVYKQLIEAPDPVPVFEAARSLDDRLQP-P
       :..:::.:::::.:. ::::::.:::::::.:::.::..:::::... ...:. ..:   
CCDS57 RKQVAPLLKSFQGEIDALSKRSKEAEAAFLNVYKRLIDVPDPVPALDLGQQLQLKVQRLH
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KSD SFDPSGQPRRDLHTSWKRNPELLSPKEQREGTSPAGPTLTEGSRLPGIPGK--ALLTETL
       ...  .:  :.  :  . : :.   :.:.   .     . :  .     ..  ::  :  
CCDS57 DIETENQKLRE--TLEEYNKEFAEVKNQEVTIKALKEKIREYEQTLKNQAETIALEKEQK
              130         140       150       160       170        

       180       190       200       210       220       230       
pF1KSD LQRNEAEKQKGLQEVQITLAARLGEAEEKIKVLHSALKATQAELLELRRKYDEEAASKAD
       :: . :::.. :::.:.. ...: :::.:.. :..::. :..::..:. :::::...:::
CCDS57 LQNDFAEKERKLQETQMSTTSKLEEAEHKVQSLQTALEKTRTELFDLKTKYDEETTAKAD
      180       190       200       210       220       230        

       240       250       260       270       280       290       
pF1KSD EVGLIMTNLEKANQRAEAAQREVESLREQLASVNSSIRLACCSPQGPSGDKVNFTLCSGP
       :. .:::.::.::::::.::::.:.:::::.:.: :..::    ..:. ...  .: .  
CCDS57 EIEMIMTDLERANQRAEVAQREAETLREQLSSANHSLQLASQIQKAPDVEQAIEVL-TRS
      240       250       260       270       280       290        

       300       310       320       330       340       350       
pF1KSD RLEAALASKDREILRLLKDVQHLQSSLQELEEASANQIADLERQLTAKSEAIEKLEEKLQ
        ::. ::.:.::: .:..:::.::.:: .:.: ::.::..::.::.::. ....:::::.
CCDS57 SLEVELAAKEREIAQLVEDVQRLQASLTKLRENSASQISQLEQQLSAKNSTLKQLEEKLK
       300       310       320       330       340       350       

       360       370       380       390       400       410       
pF1KSD AQSDYEEIKTELSILKAMKLASSTCSLPQGMAKPEDSLLIAKEAFFPTQKFLLEKPSLLA
       .:.::::.: ::.:::.:..: :  .  :  ::: . ::. :                  
CCDS57 GQADYEEVKKELNILKSMEFAPSEGAGTQDAAKPLEVLLLEKNRSLQSENAALRISNSDL
       360       370       380       390       400       410       

       420       430       440       450       460       470       
pF1KSD SPEEDPSEDDSIKDSLGTEQSYPSPQQLPPPPGPEDPLSPSPGQPLLGPSLGPDGTRTFS
                                                                   
CCDS57 SGRCAELQVRITEAVATATEQRELIARLEQDLSIIQSIQRPDAEGAAEHRLEKIPEPIKE
       420       430       440       450       460       470       

>>CCDS47672.1 CUX1 gene_id:1523|Hs108|chr7                (676 aa)
 initn: 1183 init1: 510 opt: 1161  Z-score: 602.6  bits: 123.0 E(32554): 3.1e-27
Smith-Waterman score: 1161; 49.5% identity (79.1% similar) in 402 aa overlap (1-399:1-397)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAANVGSMFQYWKRFDLRRLQKELNSVASELSARQEESEHSHKHLIELRREFKKNVPEEI
       :::::::::::::::::..::.::...:. :. ::.:::.:.:.:::  ::::::.::..
CCDS47 MAANVGSMFQYWKRFDLQQLQRELDATATVLANRQDESEQSRKRLIEQSREFKKNTPEDL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110          
pF1KSD REMVAPVLKSFQAEVVALSKRSQEAEAAFLSVYKQLIEAPDPVPVFEAARSLDDRLQP-P
       :..:::.:::::.:. ::::::.:::::::.:::.::..:::::... ...:. ..:   
CCDS47 RKQVAPLLKSFQGEIDALSKRSKEAEAAFLNVYKRLIDVPDPVPALDLGQQLQLKVQRLH
               70        80        90       100       110       120

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pF1KSD SFDPSGQPRRDLHTSWKRNPELLSPKEQREGTSPAGPTLTEGSRLPGIPGK--ALLTETL
       ...  .:  :.  :  . : :.   :.:.   .     . :  .     ..  ::  :  
CCDS47 DIETENQKLRE--TLEEYNKEFAEVKNQEVTIKALKEKIREYEQTLKNQAETIALEKEQK
              130         140       150       160       170        

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pF1KSD LQRNEAEKQKGLQEVQITLAARLGEAEEKIKVLHSALKATQAELLELRRKYDEEAASKAD
       :: . :::.. :::.:.. ...: :::.:.. :..::. :..::..:. :::::...:::
CCDS47 LQNDFAEKERKLQETQMSTTSKLEEAEHKVQSLQTALEKTRTELFDLKTKYDEETTAKAD
      180       190       200       210       220       230        

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pF1KSD EVGLIMTNLEKANQRAEAAQREVESLREQLASVNSSIRLACCSPQGPSGDKVNFTLCSGP
       :. .:::.::.::::::.::::.:.:::::.:.: :..::    ..:.   : . . .  
CCDS47 EIEMIMTDLERANQRAEVAQREAETLREQLSSANHSLQLASQIQKAPD---VAIEVLTRS
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pF1KSD RLEAALASKDREILRLLKDVQHLQSSLQELEEASANQIADLERQLTAKSEAIEKLEEKLQ
        ::. ::.:.::: .:..:::.::.:: .:.: ::.::..::.::.::. ....:::::.
CCDS47 SLEVELAAKEREIAQLVEDVQRLQASLTKLRENSASQISQLEQQLSAKNSTLKQLEEKLK
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pF1KSD AQSDYEEIKTELSILKAMKLASSTCSLPQGMAKPEDSLLIAKEAFFPTQKFLLEKPSLLA
       .:.::::.: ::.:::.:..: :  .  :  ::: . ::. :                  
CCDS47 GQADYEEVKKELNILKSMEFAPSEGAGTQDAAKPLEVLLLEKNRSLQSENAALRISNSDL
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pF1KSD SPEEDPSEDDSIKDSLGTEQSYPSPQQLPPPPGPEDPLSPSPGQPLLGPSLGPDGTRTFS
                                                                   
CCDS47 SGRCAELQVRITEAVATATEQRELIARLEQDLSIIQSIQRPDAEGAAEHRLEKIPEPIKE
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>>CCDS5721.1 CUX1 gene_id:1523|Hs108|chr7                 (1505 aa)
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CCDS57 TVLANRQDESEQSRKRLIEQSREFKKNTPEDLRKQVAPLLKSFQGEIDALSKRSKEAEAA
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       ::.:::.::..:::::... ...:. ..:   ...  .:  :.  :  . : :.   :.:
CCDS57 FLNVYKRLIDVPDPVPALDLGQQLQLKVQRLHDIETENQKLRE--TLEEYNKEFAEVKNQ
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       .   .     . :  .     ..  ::  :  :: . :::.. :::.:.. ...: :::.
CCDS57 EVTIKALKEKIREYEQTLKNQAETIALEKEQKLQNDFAEKERKLQETQMSTTSKLEEAEH
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       :.. :..::. :..::..:. :::::...::::. .:::.::.::::::.::::.:.:::
CCDS57 KVQSLQTALEKTRTELFDLKTKYDEETTAKADEIEMIMTDLERANQRAEVAQREAETLRE
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       ::.:.: :..::    ..:. ...  .:  .  ::. ::.:.::: .:..:::.::.:: 
CCDS57 QLSSANHSLQLASQIQKAPDVEQAIEVLTRSS-LEVELAAKEREIAQLVEDVQRLQASLT
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pF1KSD ELEEASANQIADLERQLTAKSEAIEKLEEKLQAQSDYEEIKTELSILKAMKLASSTCSLP
       .:.: ::.::..::.::.::. ....:::::..:.::::.: ::.:::.:..: :  .  
CCDS57 KLRENSASQISQLEQQLSAKNSTLKQLEEKLKGQADYEEVKKELNILKSMEFAPSEGAGT
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pF1KSD QGMAKPEDSLLIAKEAFFPTQKFLLE-KPSLLASPEEDPSEDDSIKDSLGTEQSYPSPQQ
       :  ::: . ::. :.  . ...  :. . : :..  .  ..:.  .   :.  . : :.:
CCDS57 QDAAKPLEVLLLEKNRSLQSENAALRISNSDLSGSARRKGKDQPESRRPGSLPA-PPPSQ
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pF1KSD LPPPPGPEDPLSPSPGQPLLGPS-LGPDGTRTFSLSP-FPSLASG--------ERLMMPP
       ::  :: .   : . :   ..:. :. :   .   :: .:  ..:        .: .:  
CCDS57 LPRNPGEQA--SNTNGTHQFSPAGLSQDFFSSSLASPSLPLASTGKFALNSLLQRQLMQS
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pF1KSD AAFKG--EAGGL-LVFPPAFYGAKPPTAPATPAPGPEPLG-GPEPADGGGGGAAGPGAEE
          :.  :::.  ..:  . :...  .. .    .:.  : .: :... ..:... :   
CCDS57 FYSKAMQEAGSTSMIFSTGPYSTNSISSQSPLQQSPDVNGMAPSPSQSESAGSVSEG---
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pF1KSD EQLDTAEIAFQVKEQLLKHNIGQRVFGHYVLGLSQGSVSEILARPKPWRKLTVKGKEPFI
       :..:::::: ::::::.:::::::.::::::::::::::::::::::: ::::.::::: 
CCDS57 EEMDTAEIARQVKEQLIKHNIGQRIFGHYVLGLSQGSVSEILARPKPWNKLTVRGKEPFH
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pF1KSD KMKQFLSDEQNVLALRTIQVRQR----------------------GSITPRIRTPETGSD
       :::::::::::.::::.:: :::                      :.:: :::. :::::
CCDS57 KMKQFLSDEQNILALRSIQGRQRENPGQSLNRLFQEVPKRRNGSEGNITTRIRASETGSD
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       .::::::::::.:.. :: .::    :  : :.:.   ..:.:::.:::.::::::.:::
CCDS57 EAIKSILEQAKRELQVQKTAEP----AQPSSASGS---GNSDDAIRSILQQARREMEAQQ
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pF1KSD QAL---LEME---------VAPRGRSVPPSPP--ERPSLA-------TASQNGAPALVKQ
        ::   :..          ..:.  :. : :     : ::       .: . :: :: . 
CCDS57 AALDPALKQAPLSQSDITILTPKLLSTSPMPTVSSYPPLAISLKKPSAAPEAGASALPNP
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pF1KSD EEGSGGPAQAP-LPVLSPAAFVQSIIRKVKSEIGDAGYFDHHWASDRGLLSRPYASVSPS
          .    .:: :   . :  .:...:.::.:.: .: .  :: :      :  ::   .
CCDS57 PALKKEAQDAPGLDPQGAADCAQGVLRQVKNEVGRSGAWKDHWWSAVQPERRNAASSEEA
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pF1KSD LSSSSSSGY---SGQPNGRAWPRGDEAPV--PPEDE---AAAGAEDEPPRTGELKAEGAT
        .  ...:    ::  .: . ::.... .  :  .:      .::.   ...::.  ::.
CCDS57 KAEETGGGKEKGSGGSGGGSQPRAERSQLQGPSSSEYWKEWPSAESPYSQSSELSLTGAS
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pF1KSD ---AEAGARLPYYPAYVP--RTLKPTVPPLTPEQYELYMYREVDTLELTRQVKEKLAKNG
          .  .. ::  :  ::  .  ::.::::::::::.:::.::::.::::::::::::::
CCDS57 RSETPQNSPLPSSPI-VPMSKPTKPSVPPLTPEQYEVYMYQEVDTIELTRQVKEKLAKNG
             910        920       930       940       950       960

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pF1KSD ICQRIFGEKVLGLSQGSVSDMLSRPKPWSKLTQKGREPFIRMQLWLSDQLGQAV----GQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. .:::.:    ::
CCDS57 ICQRIFGEKVLGLSQGSVSDMLSRPKPWSKLTQKGREPFIRMQLWLNGELGQGVLPVQGQ
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pF1KSD QPG------ASQASPTE---------PRSSPSPPPSPTEPEKSSQEPLSLS---------
       : :      .:  .: .         :..: :  :.:  : .::.   ::.         
CCDS57 QQGPVLHSVTSLQDPLQQGCVSSESTPKTSASCSPAPESPMSSSESVKSLTELVQQPCPP
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pF1KSD LESSKENQQPEGR----SSSSLSGKMYSGSQAPGGIQEIVAMSPELDTYSITKRVKEVLT
       .:.::... ::      :.:. .  .  ....  .:::.::::::::::.::::::::::
CCDS57 IEASKDSKPPEPSDPPASDSQPTTPLPLSGHSALSIQELVAMSPELDTYGITKRVKEVLT
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

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pF1KSD DNNLGQRLFGESILGLTQGSVSDLLSRPKPWHKLSLKGREPFVRMQLWLNDPHNVEKLRD
       :::::::::::.:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::: :
CCDS57 DNNLGQRLFGETILGLTQGSVSDLLARPKPWHKLSLKGREPFVRMQLWLNDPNNVEKLMD
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

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pF1KSD MKKLEKKAYLKRRYGLISTGSDSESPAT---RSECPSPCLQPQDLSLLQIKKPRVVLAPE
       ::..:::::.:::.. .: ..  : :..    :.  ::  :::     :.::::::::::
CCDS57 MKRMEKKAYMKRRHSSVSDSQPCEPPSVGTEYSQGASP--QPQH----QLKKPRVVLAPE
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pF1KSD EKEALRKAYQLEPYPSQQTIELLSFQLNLKTNTVINWFHNYRSRMRREMLVEGTQDEPDL
       :::::..::: .:::: .::: :. ::::::.::::::::::::.:::...:  :     
CCDS57 EKEALKRAYQQKPYPSPKTIEDLATQLNLKTSTVINWFHNYRSRIRRELFIEEIQ-----
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pF1KSD DPSGGPGILPPGHSHPDPTPQSPDSETEDQKPTVKELELQEGPEENSTPLTTQDKAQVRI
         .:. :    : :  .:. .:  .   ..  .   .:  :::   ..  : . :.: . 
CCDS57 --AGSQG--QAGASD-SPSARSGRAAPSSEGDSCDGVEATEGP---GSADTEEPKSQGEA
      1310        1320       1330      1340         1350      1360 

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pF1KSD KQEQMEEDAEEEAGSQPQDSGELDKGQGPPKEEHPDPPGNDGLPKVAPGPLLPGGSTPDC
       ..:.. . ::.   ..:  ::      ::   .  :   ..: :  .::::         
CCDS57 EREEVPRPAEQ---TEPPPSGT----PGPDDARDDD---HEGGPVEGPGPL---------
            1370         1380          1390         1400           

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pF1KSD PSLHPQQESEAGERLHPDPLSFKSASESSRCSLEVSLNSPSAASSPGLMMSVSPVPSSSA
       ::  : . . ..    :.  . ..:.  ..        .:.: ::       .: ::.:.
CCDS57 PS--PASATATAAPAAPEDAATSAAAAPGE--------GPAAPSS-------APPPSNSS
             1410      1420      1430                     1440     

     1420      1430      1440      1450      1460      1470        
pF1KSD PISPSPPGAPPAKVPSASPTADMAGALHPSAKVNPNLQRRHEKMANLNNIIYRLERAANR
         : : :   :... :     . :::   ... ::    :..: ::::.::.:::.::.:
CCDS57 --SSSAP-RRPSSLQSLFGLPEAAGA--RDSRDNP---LRKKKAANLNSIIHRLEKAASR
          1450       1460        1470         1480      1490       

     1480      
pF1KSD EEALEWEF
       :: .::::
CCDS57 EEPIEWEF
      1500     

>>CCDS59071.1 CUX1 gene_id:1523|Hs108|chr7                (639 aa)
 initn: 910 init1: 375 opt: 889  Z-score: 465.9  bits: 97.6 E(32554): 1.3e-19
Smith-Waterman score: 937; 44.0% identity (70.9% similar) in 402 aa overlap (1-399:1-360)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAANVGSMFQYWKRFDLRRLQKELNSVASELSARQEESEHSHKHLIELRREFKKNVPEEI
       :::::::::::::::::..::                                     ..
CCDS59 MAANVGSMFQYWKRFDLQQLQ-------------------------------------DL
               10        20                                        

               70        80        90       100       110          
pF1KSD REMVAPVLKSFQAEVVALSKRSQEAEAAFLSVYKQLIEAPDPVPVFEAARSLDDRLQP-P
       :..:::.:::::.:. ::::::.:::::::.:::.::..:::::... ...:. ..:   
CCDS59 RKQVAPLLKSFQGEIDALSKRSKEAEAAFLNVYKRLIDVPDPVPALDLGQQLQLKVQRLH
            30        40        50        60        70        80   

     120       130       140       150       160       170         
pF1KSD SFDPSGQPRRDLHTSWKRNPELLSPKEQREGTSPAGPTLTEGSRLPGIPGK--ALLTETL
       ...  .:  :.  :  . : :.   :.:.   .     . :  .     ..  ::  :  
CCDS59 DIETENQKLRE--TLEEYNKEFAEVKNQEVTIKALKEKIREYEQTLKNQAETIALEKEQK
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pF1KSD LQRNEAEKQKGLQEVQITLAARLGEAEEKIKVLHSALKATQAELLELRRKYDEEAASKAD
       :: . :::.. :::.:.. ...: :::.:.. :..::. :..::..:. :::::...:::
CCDS59 LQNDFAEKERKLQETQMSTTSKLEEAEHKVQSLQTALEKTRTELFDLKTKYDEETTAKAD
             150       160       170       180       190       200 

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pF1KSD EVGLIMTNLEKANQRAEAAQREVESLREQLASVNSSIRLACCSPQGPSGDKVNFTLCSGP
       :. .:::.::.::::::.::::.:.:::::.:.: :..::    ..:.   : . . .  
CCDS59 EIEMIMTDLERANQRAEVAQREAETLREQLSSANHSLQLASQIQKAPD---VAIEVLTRS
             210       220       230       240          250        

       300       310       320       330       340       350       
pF1KSD RLEAALASKDREILRLLKDVQHLQSSLQELEEASANQIADLERQLTAKSEAIEKLEEKLQ
        ::. ::.:.::: .:..:::.::.:: .:.: ::.::..::.::.::. ....:::::.
CCDS59 SLEVELAAKEREIAQLVEDVQRLQASLTKLRENSASQISQLEQQLSAKNSTLKQLEEKLK
      260       270       280       290       300       310        

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pF1KSD AQSDYEEIKTELSILKAMKLASSTCSLPQGMAKPEDSLLIAKEAFFPTQKFLLEKPSLLA
       .:.::::.: ::.:::.:..: :  .  :  ::: . ::. :                  
CCDS59 GQADYEEVKKELNILKSMEFAPSEGAGTQDAAKPLEVLLLEKNRSLQSENAALRISNSDL
      320       330       340       350       360       370        

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pF1KSD SPEEDPSEDDSIKDSLGTEQSYPSPQQLPPPPGPEDPLSPSPGQPLLGPSLGPDGTRTFS
                                                                   
CCDS59 SGRCAELQVRITEAVATATEQRELIARLEQDLSIIQSIQRPDAEGAAEHRLEKIPEPIKE
      380       390       400       410       420       430        

>>CCDS56500.1 CUX1 gene_id:1523|Hs108|chr7                (662 aa)
 initn: 948 init1: 375 opt: 828  Z-score: 434.9  bits: 92.0 E(32554): 6.6e-18
Smith-Waterman score: 1050; 47.0% identity (75.6% similar) in 402 aa overlap (1-399:1-383)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MAANVGSMFQYWKRFDLRRLQKELNSVASELSARQEESEHSHKHLIELRREFKKNVPEEI
       :::::::::::::::::..::.::...:. :. ::.:::.:.:.:::  ::::::.::  
CCDS56 MAANVGSMFQYWKRFDLQQLQRELDATATVLANRQDESEQSRKRLIEQSREFKKNTPE--
               10        20        30        40        50          

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pF1KSD REMVAPVLKSFQAEVVALSKRSQEAEAAFLSVYKQLIEAPDPVPVFEAARSLDDRLQP-P
                     . ::::::.:::::::.:::.::..:::::... ...:. ..:   
CCDS56 --------------IDALSKRSKEAEAAFLNVYKRLIDVPDPVPALDLGQQLQLKVQRLH
                     60        70        80        90       100    

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pF1KSD SFDPSGQPRRDLHTSWKRNPELLSPKEQREGTSPAGPTLTEGSRLPGIPGK--ALLTETL
       ...  .:  :.  :  . : :.   :.:.   .     . :  .     ..  ::  :  
CCDS56 DIETENQKLRE--TLEEYNKEFAEVKNQEVTIKALKEKIREYEQTLKNQAETIALEKEQK
          110         120       130       140       150       160  

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pF1KSD LQRNEAEKQKGLQEVQITLAARLGEAEEKIKVLHSALKATQAELLELRRKYDEEAASKAD
       :: . :::.. :::.:.. ...: :::.:.. :..::. :..::..:. :::::...:::
CCDS56 LQNDFAEKERKLQETQMSTTSKLEEAEHKVQSLQTALEKTRTELFDLKTKYDEETTAKAD
            170       180       190       200       210       220  

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pF1KSD EVGLIMTNLEKANQRAEAAQREVESLREQLASVNSSIRLACCSPQGPSGDKVNFTLCSGP
       :. .:::.::.::::::.::::.:.:::::.:.: :..::    ..:. ...  .: .  
CCDS56 EIEMIMTDLERANQRAEVAQREAETLREQLSSANHSLQLASQIQKAPDVEQAIEVL-TRS
            230       240       250       260       270        280 

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pF1KSD RLEAALASKDREILRLLKDVQHLQSSLQELEEASANQIADLERQLTAKSEAIEKLEEKLQ
        ::. ::.:.::: .:..:::.::.:: .:.: ::.::..::.::.::. ....:::::.
CCDS56 SLEVELAAKEREIAQLVEDVQRLQASLTKLRENSASQISQLEQQLSAKNSTLKQLEEKLK
             290       300       310       320       330       340 

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pF1KSD AQSDYEEIKTELSILKAMKLASSTCSLPQGMAKPEDSLLIAKEAFFPTQKFLLEKPSLLA
       .:.::::.: ::.:::.:..: :  .  :  ::: . ::. :                  
CCDS56 GQADYEEVKKELNILKSMEFAPSEGAGTQDAAKPLEVLLLEKNRSLQSENAALRISNSDL
             350       360       370       380       390       400 

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pF1KSD SPEEDPSEDDSIKDSLGTEQSYPSPQQLPPPPGPEDPLSPSPGQPLLGPSLGPDGTRTFS
                                                                   
CCDS56 SGRCAELQVRITEAVATATEQRELIARLEQDLSIIQSIQRPDAEGAAEHRLEKIPEPIKE
             410       420       430       440       450       460 




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 start: Thu Nov  3 01:11:02 2016 done: Thu Nov  3 01:11:03 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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