Result of SIM4 for pF1KSDA0280

seq1 = pF1KSDA0280.tfa, 732 bp
seq2 = pF1KSDA0280/gi568815587r_73307534.tfa (gi568815587r:73307534_73568474), 260941 bp

>pF1KSDA0280 732
>gi568815587r:73307534_73568474 (Chr11)

(complement)

1-70  (100001-100070)   100% ->
71-151  (137705-137785)   100% ->
152-178  (143427-143453)   100% ->
179-304  (148476-148601)   100% ->
305-447  (156939-157081)   100% ->
448-622  (158814-158988)   99% ->
623-732  (160832-160941)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACCCTGTTTACAGCCCCGTGCAGCCTGGGGCTCCTTATGGCAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAACCCTGTTTACAGCCCCGTGCAGCCTGGGGCTCCTTATGGCAACCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TAAGAACATGGCCTACACGG         GTTACCCCACAGCCTATCCAG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100051 TAAGAACATGGCCTACACGGGTG...TAGGTTACCCCACAGCCTATCCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CAGCTGCCCCTGCCTACAATCCCAGCCTGTACCCCACCAATAGTCCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137726 CAGCTGCCCCTGCCTACAATCCCAGCCTGTACCCCACCAATAGTCCCAGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TATGCTCCAG         AGTTTCAGTTCCTGCATTCAGCTTATG    
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||>>>.
 137776 TATGCTCCAGGTA...CAGAGTTTCAGTTCCTGCATTCAGCTTATGGTA.

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    179      CAACTCTGCTGATGAAACAGGCCTGGCCACAGAACTCGTCTTCCT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143458 ..AAGCAACTCTGCTGATGAAACAGGCCTGGCCACAGAACTCGTCTTCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 GTGGCACTGAAGGCACCTTCCACCTCCCAGTGGACACCGGGACCGAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148521 GTGGCACTGAAGGCACCTTCCACCTCCCAGTGGACACCGGGACCGAGAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CGAACTTACCAAGCATCCTCTGCGGCTTTCA         GATATACTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 148571 CGAACTTACCAAGCATCCTCTGCGGCTTTCAGTA...CAGGATATACTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 GGGGACACCATACAAGGTCCCACCGACCCAGAGTAACACTGCTCCACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156949 GGGGACACCATACAAGGTCCCACCGACCCAGAGTAACACTGCTCCACCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CCTACTCCCCATCACCCAACCCCTATCAGACGGCCATGTATCCAATCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156999 CCTACTCCCCATCACCCAACCCCTATCAGACGGCCATGTATCCAATCAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AGTGCCTACCCCCAGCAGAATCTGTATGCCCAG         GGAGCCTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 157049 AGTGCCTACCCCCAGCAGAATCTGTATGCCCAGGTA...CAGGGAGCCTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CTACACACAGCCGGTGTATGCTGCCCAGCCTCATGTCATCCACCACACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
 158822 CTACACACAGCCGGTGTATGCTGCCCAGCCTCATGTCATCCACCATACCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CGGTCGTCCAGCCCAACAGCATTCCCTCTGCTATCTACCCAGCACCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158872 CGGTCGTCCAGCCCAACAGCATTCCCTCTGCTATCTACCCAGCACCTGTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GCCGCCCCGAGGACCAACGGTGTGGCCATGGGCATGGTGGCAGGCACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158922 GCCGCCCCGAGGACCAACGGTGTGGCCATGGGCATGGTGGCAGGCACCAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CATGGCAATGTCAGCAG         GTACCCTGCTGACTACACCCCAGC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 158972 CATGGCAATGTCAGCAGGTG...CAGGTACCCTGCTGACTACACCCCAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 ACACGGCGATTGGGGCACACCCTGTCTCCATGCCAACATATAGGGCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160856 ACACGGCGATTGGGGCACACCCTGTCTCCATGCCAACATATAGGGCCCAA

    750     .    :    .    :    .    :    .
    697 GGAACCCCTGCGTACAGCTACGTGCCCCCACACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160906 GGAACCCCTGCGTACAGCTACGTGCCCCCACACTGG

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