Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0207
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0207, 588 aa
  1>>>pF1KSDA0207 588 - 588 aa - 588 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4848+/-0.00088; mu= 9.7418+/- 0.053
 mean_var=145.7844+/-30.509, 0's: 0 Z-trim(110.8): 57  B-trim: 2 in 1/51
 Lambda= 0.106223
 statistics sampled from 11844 (11898) to 11844 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.73), E-opt: 0.2 (0.365), width:  16
 Scan time:  2.210

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS43582.1 GRB10 gene_id:2887|Hs108|chr7          ( 594) 3918 612.3 5.4e-175
CCDS43583.1 GRB10 gene_id:2887|Hs108|chr7          ( 536) 3637 569.2 4.6e-162
CCDS2222.1 GRB14 gene_id:2888|Hs108|chr2           ( 540) 1954 311.3   2e-84
CCDS47586.1 GRB10 gene_id:2887|Hs108|chr7          ( 548) 1803 288.2 1.9e-77
CCDS11345.1 GRB7 gene_id:2886|Hs108|chr17          ( 532) 1756 280.9 2.7e-75
CCDS56028.1 GRB7 gene_id:2886|Hs108|chr17          ( 555) 1756 281.0 2.8e-75
CCDS82116.1 GRB7 gene_id:2886|Hs108|chr17          ( 447) 1207 196.8   5e-50
CCDS2359.1 RAPH1 gene_id:65059|Hs108|chr2          (1250)  523 92.2 4.1e-18
CCDS2360.1 RAPH1 gene_id:65059|Hs108|chr2          ( 644)  502 88.8 2.2e-17
CCDS31167.1 APBB1IP gene_id:54518|Hs108|chr10      ( 666)  392 72.0 2.7e-12


>>CCDS43582.1 GRB10 gene_id:2887|Hs108|chr7               (594 aa)
 initn: 3918 init1: 3918 opt: 3918  Z-score: 3255.1  bits: 612.3 E(32554): 5.4e-175
Smith-Waterman score: 3918; 99.7% identity (99.8% similar) in 578 aa overlap (11-588:17-594)

                     10        20        30        40        50    
pF1KSD       MQAAGPLFRSKDKVEQTPRSQQDPAGPGLPAQSDRLANHQEDDVDLEALVNDMN
                       .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MALAGCPDSFLHHPYYQDKVEQTPRSQQDPAGPGLPAQSDRLANHQEDDVDLEALVNDMN
               10        20        30        40        50        60

           60        70        80        90       100       110    
pF1KSD ASLESLYSACSMQSDTVPLLQNGQHARSQPRASGPPRSIQPQVSPRQRVQRSQPVHILAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ASLESLYSACSMQSDTVPLLQNGQHARSQPRASGPPRSIQPQVSPRQRVQRSQPVHILAV
               70        80        90       100       110       120

          120       130       140       150       160       170    
pF1KSD RRLQEEDQQFRTSSLPAIPNPFPELCGPGSPAVLTPGSLPPSQAAAKQDVKVFSEDGTSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RRLQEEDQQFRTSSLPAIPNPFPELCGPGSPPVLTPGSLPPSQAAAKQDVKVFSEDGTSK
              130       140       150       160       170       180

          180       190       200       210       220       230    
pF1KSD VVEILADMTARDLCQLLVYKSHCVDDNSWTLVEHHPHLGLERCLEDHELVVQVESTMASE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VVEILADMTARDLCQLLVYKSHCVDDNSWTLVEHHPHLGLERCLEDHELVVQVESTMASE
              190       200       210       220       230       240

          240       250       260       270       280       290    
pF1KSD SKFLFRKNYAKYEFFKNPMNFFPEQMVTWCQQSNGSQTQLLQNFLNSSSCPEIQGFLHVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SKFLFRKNYAKYEFFKNPMNFFPEQMVTWCQQSNGSQTQLLQNFLNSSSCPEIQGFLHVK
              250       260       270       280       290       300

          300       310       320       330       340       350    
pF1KSD ELGKKSWKKLYVCLRRSGLYCSTKGTSKEPRHLQLLADLEDSNIFSLIAGRKQYNAPTDH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ELGKKSWKKLYVCLRRSGLYCSTKGTSKEPRHLQLLADLEDSNIFSLIAGRKQYNAPTDH
              310       320       330       340       350       360

          360       370       380       390       400       410    
pF1KSD GLCIKPNKVRNETKELRLLCAEDEQTRTCWMTAFRLLKYGMLLYQNYRIPQQRKALLSPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GLCIKPNKVRNETKELRLLCAEDEQTRTCWMTAFRLLKYGMLLYQNYRIPQQRKALLSPF
              370       380       390       400       410       420

          420       430       440       450       460       470    
pF1KSD STPVRSVSENSLVAMDFSGQTGRVIENPAEAQSAALEEGHAWRKRSTRMNILGSQSPLHP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 STPVRSVSENSLVAMDFSGQTGRVIENPAEAQSAALEEGHAWRKRSTRMNILGSQSPLHP
              430       440       450       460       470       480

          480       490       500       510       520       530    
pF1KSD STLSTVIHRTQHWFHGRISREESHRIIKQQGLVDGLFLLRDSQSNPKAFVLTLCHHQKIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 STLSTVIHRTQHWFHGRISREESHRIIKQQGLVDGLFLLRDSQSNPKAFVLTLCHHQKIK
              490       500       510       520       530       540

          540       550       560       570       580        
pF1KSD NFQILPCEDDGQTFFSLDDGNTKFSDLIQLVDFYQLNKGVLPCKLKHHCIRVAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NFQILPCEDDGQTFFSLDDGNTKFSDLIQLVDFYQLNKGVLPCKLKHHCIRVAL
              550       560       570       580       590    

>>CCDS43583.1 GRB10 gene_id:2887|Hs108|chr7               (536 aa)
 initn: 3637 init1: 3637 opt: 3637  Z-score: 3023.1  bits: 569.2 E(32554): 4.6e-162
Smith-Waterman score: 3637; 99.8% identity (99.8% similar) in 536 aa overlap (53-588:1-536)

             30        40        50        60        70        80  
pF1KSD DPAGPGLPAQSDRLANHQEDDVDLEALVNDMNASLESLYSACSMQSDTVPLLQNGQHARS
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43                               MNASLESLYSACSMQSDTVPLLQNGQHARS
                                             10        20        30

             90       100       110       120       130       140  
pF1KSD QPRASGPPRSIQPQVSPRQRVQRSQPVHILAVRRLQEEDQQFRTSSLPAIPNPFPELCGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QPRASGPPRSIQPQVSPRQRVQRSQPVHILAVRRLQEEDQQFRTSSLPAIPNPFPELCGP
               40        50        60        70        80        90

            150       160       170       180       190       200  
pF1KSD GSPAVLTPGSLPPSQAAAKQDVKVFSEDGTSKVVEILADMTARDLCQLLVYKSHCVDDNS
       ::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GSPPVLTPGSLPPSQAAAKQDVKVFSEDGTSKVVEILADMTARDLCQLLVYKSHCVDDNS
              100       110       120       130       140       150

            210       220       230       240       250       260  
pF1KSD WTLVEHHPHLGLERCLEDHELVVQVESTMASESKFLFRKNYAKYEFFKNPMNFFPEQMVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 WTLVEHHPHLGLERCLEDHELVVQVESTMASESKFLFRKNYAKYEFFKNPMNFFPEQMVT
              160       170       180       190       200       210

            270       280       290       300       310       320  
pF1KSD WCQQSNGSQTQLLQNFLNSSSCPEIQGFLHVKELGKKSWKKLYVCLRRSGLYCSTKGTSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 WCQQSNGSQTQLLQNFLNSSSCPEIQGFLHVKELGKKSWKKLYVCLRRSGLYCSTKGTSK
              220       230       240       250       260       270

            330       340       350       360       370       380  
pF1KSD EPRHLQLLADLEDSNIFSLIAGRKQYNAPTDHGLCIKPNKVRNETKELRLLCAEDEQTRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EPRHLQLLADLEDSNIFSLIAGRKQYNAPTDHGLCIKPNKVRNETKELRLLCAEDEQTRT
              280       290       300       310       320       330

            390       400       410       420       430       440  
pF1KSD CWMTAFRLLKYGMLLYQNYRIPQQRKALLSPFSTPVRSVSENSLVAMDFSGQTGRVIENP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CWMTAFRLLKYGMLLYQNYRIPQQRKALLSPFSTPVRSVSENSLVAMDFSGQTGRVIENP
              340       350       360       370       380       390

            450       460       470       480       490       500  
pF1KSD AEAQSAALEEGHAWRKRSTRMNILGSQSPLHPSTLSTVIHRTQHWFHGRISREESHRIIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AEAQSAALEEGHAWRKRSTRMNILGSQSPLHPSTLSTVIHRTQHWFHGRISREESHRIIK
              400       410       420       430       440       450

            510       520       530       540       550       560  
pF1KSD QQGLVDGLFLLRDSQSNPKAFVLTLCHHQKIKNFQILPCEDDGQTFFSLDDGNTKFSDLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QQGLVDGLFLLRDSQSNPKAFVLTLCHHQKIKNFQILPCEDDGQTFFSLDDGNTKFSDLI
              460       470       480       490       500       510

            570       580        
pF1KSD QLVDFYQLNKGVLPCKLKHHCIRVAL
       ::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QLVDFYQLNKGVLPCKLKHHCIRVAL
              520       530      

>>CCDS2222.1 GRB14 gene_id:2888|Hs108|chr2                (540 aa)
 initn: 1751 init1: 610 opt: 1954  Z-score: 1629.1  bits: 311.3 E(32554): 2e-84
Smith-Waterman score: 1954; 54.7% identity (78.6% similar) in 543 aa overlap (53-588:1-540)

             30        40        50        60        70        80  
pF1KSD DPAGPGLPAQSDRLANHQEDDVDLEALVNDMNASLESLYSACSMQSDTVPLLQNGQHARS
                                     :..::..  :: :  .     :     . .
CCDS22                               MTTSLQDGQSAASRAAARDSPLAAQVCGAA
                                             10        20        30

             90       100       110       120       130       140  
pF1KSD QPRASGPPRSIQPQVSPRQRVQRSQPVHILAVRRLQEEDQQFRTSSLPAIPNPFPELCGP
       : :...   .  : .  :  .   . ..  :. : ...:  . .  .:.:::::::::  
CCDS22 QGRGDAHDLAPAPWLHARALLPLPDGTRGCAADRRKKKD--LDVPEMPSIPNPFPELCCS
               40        50        60          70        80        

            150       160       170       180       190       200  
pF1KSD GSPAVLTPGSLPPSQAAAKQDVKVFSEDGTSKVVEILADMTARDLCQLLVYKSHCVDDNS
          .::.   .: ...  :: .::.::: ::..... .:.::::.::::. :.: .::.:
CCDS22 PFTSVLSADLFPKANSRKKQVIKVYSEDETSRALDVPSDITARDVCQLLILKNHYIDDHS
       90       100       110       120       130       140        

            210       220       230         240       250       260
pF1KSD WTLVEHHPHLGLERCLEDHELVVQVEST--MASESKFLFRKNYAKYEFFKNPMNFFPEQM
       ::: :: ::.:.:: .::::::..: :.  .  :.:. ::::::::::::::: ::::.:
CCDS22 WTLFEHLPHIGVERTIEDHELVIEVLSNWGIEEENKLYFRKNYAKYEFFKNPMYFFPEHM
      150       160       170       180       190       200        

                270       280       290       300       310        
pF1KSD VTWCQQSNG--SQTQLLQNFLNSSSCPEIQGFLHVKELGKKSWKKLYVCLRRSGLYCSTK
       :..  ..::  : ::.:: ::.::. :::.::::.:: :::::::.:  ::::::: :::
CCDS22 VSFATETNGEISPTQILQMFLSSSTYPEIHGFLHAKEQGKKSWKKIYFFLRRSGLYFSTK
      210       220       230       240       250       260        

      320       330       340       350       360       370        
pF1KSD GTSKEPRHLQLLADLEDSNIFSLIAGRKQYNAPTDHGLCIKPNKVRNETKELRLLCAEDE
       ::::::::::..... .:.:.  .::.:...:::..:.:.::::. .  ..:..::::.:
CCDS22 GTSKEPRHLQFFSEFGNSDIYVSLAGKKKHGAPTNYGFCFKPNKAGGP-RDLKMLCAEEE
      270       280       290       300       310        320       

      380       390       400       410        420       430       
pF1KSD QTRTCWMTAFRLLKYGMLLYQNYRIPQQRKALLSPFS-TPVRSVSENSLVAMDFSGQTGR
       :.::::.::.::::::: :::::  : : ..  :  : .:.::.::::::::::::: .:
CCDS22 QSRTCWVTAIRLLKYGMQLYQNYMHPYQGRSGCSSQSISPMRSISENSLVAMDFSGQKSR
       330       340       350       360       370       380       

       440       450       460        470       480        490     
pF1KSD VIENPAEAQSAALEEGHAWRKRST-RMNILGSQSPLHPSTLSTV-IHRTQHWFHGRISRE
       :::::.:: :.:.::: ::::..  :..  :: .    :. ... :::.: ::: .:::.
CCDS22 VIENPTEALSVAVEEGLAWRKKGCLRLGTHGSPTASSQSSATNMAIHRSQPWFHHKISRD
       390       400       410       420       430       440       

         500       510       520       530       540       550     
pF1KSD ESHRIIKQQGLVDGLFLLRDSQSNPKAFVLTLCHHQKIKNFQILPCEDDGQTFFSLDDGN
       :..:.: :::::::.::.::::::::.:::.. : ::::.:::.: ::::. : .::::.
CCDS22 EAQRLIIQQGLVDGVFLVRDSQSNPKTFVLSMSHGQKIKHFQIIPVEDDGEMFHTLDDGH
       450       460       470       480       490       500       

         560       570       580        
pF1KSD TKFSDLIQLVDFYQLNKGVLPCKLKHHCIRVAL
       :.:.::::::.:::::::::::::::.: :.::
CCDS22 TRFTDLIQLVEFYQLNKGVLPCKLKHYCARIAL
       510       520       530       540

>>CCDS47586.1 GRB10 gene_id:2887|Hs108|chr7               (548 aa)
 initn: 1802 init1: 1802 opt: 1803  Z-score: 1504.0  bits: 288.2 E(32554): 1.9e-77
Smith-Waterman score: 3499; 91.7% identity (91.9% similar) in 578 aa overlap (11-588:17-548)

                     10        20        30        40        50    
pF1KSD       MQAAGPLFRSKDKVEQTPRSQQDPAGPGLPAQSDRLANHQEDDVDLEALVNDMN
                       .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MALAGCPDSFLHHPYYQDKVEQTPRSQQDPAGPGLPAQSDRLANHQEDDVDLEALVNDMN
               10        20        30        40        50        60

           60        70        80        90       100       110    
pF1KSD ASLESLYSACSMQSDTVPLLQNGQHARSQPRASGPPRSIQPQVSPRQRVQRSQPVHILAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ASLESLYSACSMQSDTVPLLQNGQHARSQPRASGPPRSIQPQVSPRQRVQRSQPVHILAV
               70        80        90       100       110       120

          120       130       140       150       160       170    
pF1KSD RRLQEEDQQFRTSSLPAIPNPFPELCGPGSPAVLTPGSLPPSQAAAKQDVKVFSEDGTSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RRLQEEDQQFRTSSLPAIPNPFPELCGPGSPPVLTPGSLPPSQAAAKQDVKVFSEDGTSK
              130       140       150       160       170       180

          180       190       200       210       220       230    
pF1KSD VVEILADMTARDLCQLLVYKSHCVDDNSWTLVEHHPHLGLERCLEDHELVVQVESTMASE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VVEILADMTARDLCQLLVYKSHCVDDNSWTLVEHHPHLGLERCLEDHELVVQVESTMASE
              190       200       210       220       230       240

          240       250       260       270       280       290    
pF1KSD SKFLFRKNYAKYEFFKNPMNFFPEQMVTWCQQSNGSQTQLLQNFLNSSSCPEIQGFLHVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                  
CCDS47 SKFLFRKNYAKYEFFKNPMNFFPEQMVTWCQQSNGSQTQLLQ------------------
              250       260       270       280                    

          300       310       320       330       340       350    
pF1KSD ELGKKSWKKLYVCLRRSGLYCSTKGTSKEPRHLQLLADLEDSNIFSLIAGRKQYNAPTDH
                                   ::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ----------------------------EPRHLQLLADLEDSNIFSLIAGRKQYNAPTDH
                                        290       300       310    

          360       370       380       390       400       410    
pF1KSD GLCIKPNKVRNETKELRLLCAEDEQTRTCWMTAFRLLKYGMLLYQNYRIPQQRKALLSPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GLCIKPNKVRNETKELRLLCAEDEQTRTCWMTAFRLLKYGMLLYQNYRIPQQRKALLSPF
          320       330       340       350       360       370    

          420       430       440       450       460       470    
pF1KSD STPVRSVSENSLVAMDFSGQTGRVIENPAEAQSAALEEGHAWRKRSTRMNILGSQSPLHP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 STPVRSVSENSLVAMDFSGQTGRVIENPAEAQSAALEEGHAWRKRSTRMNILGSQSPLHP
          380       390       400       410       420       430    

          480       490       500       510       520       530    
pF1KSD STLSTVIHRTQHWFHGRISREESHRIIKQQGLVDGLFLLRDSQSNPKAFVLTLCHHQKIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 STLSTVIHRTQHWFHGRISREESHRIIKQQGLVDGLFLLRDSQSNPKAFVLTLCHHQKIK
          440       450       460       470       480       490    

          540       550       560       570       580        
pF1KSD NFQILPCEDDGQTFFSLDDGNTKFSDLIQLVDFYQLNKGVLPCKLKHHCIRVAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NFQILPCEDDGQTFFSLDDGNTKFSDLIQLVDFYQLNKGVLPCKLKHHCIRVAL
          500       510       520       530       540        

>>CCDS11345.1 GRB7 gene_id:2886|Hs108|chr17               (532 aa)
 initn: 1817 init1: 587 opt: 1756  Z-score: 1465.2  bits: 280.9 E(32554): 2.7e-75
Smith-Waterman score: 1906; 53.7% identity (79.6% similar) in 538 aa overlap (66-588:1-532)

          40        50        60        70        80        90     
pF1KSD LANHQEDDVDLEALVNDMNASLESLYSACSMQSDTVPLLQNGQHARSQPRASGPPRSIQP
                                     :. :  :   ...     :  . :: . .:
CCDS11                               MELDLSPPHLSSSPEDLCPAPGTPPGTPRP
                                             10        20        30

         100        110        120       130       140         150 
pF1KSD QVSPR-QRVQRSQPVHILAV-RRLQEEDQQFRTSSLPAIPNPFPELCGPGS--PAVLTPG
         .:  ..:.::::. : .. :.:.::..  :..:::.:::::::::.: :  : .  :.
CCDS11 PDTPLPEEVKRSQPLLIPTTGRKLREEER--RATSLPSIPNPFPELCSPPSQSPILGGPS
               40        50          60        70        80        

                160       170       180       190       200        
pF1KSD S---LPPSQAAAKQDVKVFSEDGTSKVVEILADMTARDLCQLLVYKSHCVDDNSWTLVEH
       :   : : .:.  . :::.::::. . ::. :  ::: .:..:: ..: ..:..: ::: 
CCDS11 SARGLLPRDASRPHVVKVYSEDGACRSVEVAAGATARHVCEMLVQRAHALSDETWGLVEC
       90       100       110       120       130       140        

      210       220       230         240       250        260     
pF1KSD HPHLGLERCLEDHELVVQVEST--MASESKFLFRKNYAKYEFFKN-PMNFFPEQMVTWCQ
       ::::.::: ::::: ::.:...  ....:.:.::::.::::.::. : ..:::.::. : 
CCDS11 HPHLALERGLEDHESVVEVQAAWPVGGDSRFVFRKNFAKYELFKSSPHSLFPEKMVSSCL
      150       160       170       180       190       200        

           270       280       290       300       310       320   
pF1KSD QSNG--SQTQLLQNFLNSSSCPEIQGFLHVKELGKKSWKKLYVCLRRSGLYCSTKGTSKE
       ...   :. .:.:::::..: :::::::...  :.: ::...  ::::::: :::::::.
CCDS11 DAHTGISHEDLIQNFLNAGSFPEIQGFLQLRGSGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGTSKD
      210       220       230       240       250       260        

           330       340       350       360       370       380   
pF1KSD PRHLQLLADLEDSNIFSLIAGRKQYNAPTDHGLCIKPNKVRNETKELRLLCAEDEQTRTC
       ::::: .::...::.. .  ::: :. ::: :.:.::::.::  : ::..:.::::.:::
CCDS11 PRHLQYVADVNESNVYVVTQGRKLYGMPTDFGFCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQSRTC
      270       280       290       300       310       320        

           390       400       410          420       430       440
pF1KSD WMTAFRLLKYGMLLYQNYRIPQQRKALLSPF---STPVRSVSENSLVAMDFSGQTGRVIE
       :..::::.:::. ::.::.  :.:.  : :    : :.::.:.:.::::::::..:::::
CCDS11 WLAAFRLFKYGVQLYKNYQQAQSRH--LHPSCLGSPPLRSASDNTLVAMDFSGHAGRVIE
      330       340       350         360       370       380      

              450       460       470       480       490       500
pF1KSD NPAEAQSAALEEGHAWRKRSTRMNILGSQSPLHPSTLSTVIHRTQHWFHGRISREESHRI
       :: :: :.::::..::::....   :.   :   ..::..::::: :::::::::::.:.
CCDS11 NPREALSVALEEAQAWRKKTNHR--LSLPMPASGTSLSAAIHRTQLWFHGRISREESQRL
        390       400         410       420       430       440    

              510       520       530       540       550       560
pF1KSD IKQQGLVDGLFLLRDSQSNPKAFVLTLCHHQKIKNFQILPCEDDGQTFFSLDDGNTKFSD
       : ::::::::::.:.:: ::..:::.::: ::.:.. ::: :..:. .::.:::.:.:.:
CCDS11 IGQQGLVDGLFLVRESQRNPQGFVLSLCHLQKVKHYLILPSEEEGRLYFSMDDGQTRFTD
          450       460       470       480       490       500    

              570       580        
pF1KSD LIQLVDFYQLNKGVLPCKLKHHCIRVAL
       :.:::.:.:::.:.::: :.: : ::::
CCDS11 LLQLVEFHQLNRGILPCLLRHCCTRVAL
          510       520       530  

>>CCDS56028.1 GRB7 gene_id:2886|Hs108|chr17               (555 aa)
 initn: 1817 init1: 587 opt: 1756  Z-score: 1465.0  bits: 281.0 E(32554): 2.8e-75
Smith-Waterman score: 1913; 54.2% identity (79.9% similar) in 541 aa overlap (68-588:21-555)

        40        50        60        70        80             90  
pF1KSD NHQEDDVDLEALVNDMNASLESLYSACSMQSDTVPLLQNGQHARSQPR----ASG-PPRS
                                     ::.. :  .  :  :.:.    : : :: .
CCDS56           MGKWRPGQGHTTGSVKPLSCSDAMELDLSPPHLSSSPEDLCPAPGTPPGT
                         10        20        30        40        50

            100        110        120       130       140          
pF1KSD IQPQVSPR-QRVQRSQPVHILAV-RRLQEEDQQFRTSSLPAIPNPFPELCGPGS--PAVL
        .:  .:  ..:.::::. : .. :.:.::..  :..:::.:::::::::.: :  : . 
CCDS56 PRPPDTPLPEEVKRSQPLLIPTTGRKLREEER--RATSLPSIPNPFPELCSPPSQSPILG
               60        70        80          90       100        

      150          160       170       180       190       200     
pF1KSD TPGS---LPPSQAAAKQDVKVFSEDGTSKVVEILADMTARDLCQLLVYKSHCVDDNSWTL
        :.:   : : .:.  . :::.::::. . ::. :  ::: .:..:: ..: ..:..: :
CCDS56 GPSSARGLLPRDASRPHVVKVYSEDGACRSVEVAAGATARHVCEMLVQRAHALSDETWGL
      110       120       130       140       150       160        

         210       220       230         240       250        260  
pF1KSD VEHHPHLGLERCLEDHELVVQVEST--MASESKFLFRKNYAKYEFFKN-PMNFFPEQMVT
       :: ::::.::: ::::: ::.:...  ....:.:.::::.::::.::. : ..:::.::.
CCDS56 VECHPHLALERGLEDHESVVEVQAAWPVGGDSRFVFRKNFAKYELFKSSPHSLFPEKMVS
      170       180       190       200       210       220        

              270       280       290       300       310       320
pF1KSD WCQQSNG--SQTQLLQNFLNSSSCPEIQGFLHVKELGKKSWKKLYVCLRRSGLYCSTKGT
        : ...   :. .:.:::::..: :::::::...  :.: ::...  ::::::: :::::
CCDS56 SCLDAHTGISHEDLIQNFLNAGSFPEIQGFLQLRGSGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGT
      230       240       250       260       270       280        

              330       340       350       360       370       380
pF1KSD SKEPRHLQLLADLEDSNIFSLIAGRKQYNAPTDHGLCIKPNKVRNETKELRLLCAEDEQT
       ::.::::: .::...::.. .  ::: :. ::: :.:.::::.::  : ::..:.::::.
CCDS56 SKDPRHLQYVADVNESNVYVVTQGRKLYGMPTDFGFCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQS
      290       300       310       320       330       340        

              390       400       410          420       430       
pF1KSD RTCWMTAFRLLKYGMLLYQNYRIPQQRKALLSPF---STPVRSVSENSLVAMDFSGQTGR
       ::::..::::.:::. ::.::.  :.:.  : :    : :.::.:.:.::::::::..::
CCDS56 RTCWLAAFRLFKYGVQLYKNYQQAQSRH--LHPSCLGSPPLRSASDNTLVAMDFSGHAGR
      350       360       370         380       390       400      

       440       450       460       470       480       490       
pF1KSD VIENPAEAQSAALEEGHAWRKRSTRMNILGSQSPLHPSTLSTVIHRTQHWFHGRISREES
       ::::: :: :.::::..::::....   :.   :   ..::..::::: :::::::::::
CCDS56 VIENPREALSVALEEAQAWRKKTNHR--LSLPMPASGTSLSAAIHRTQLWFHGRISREES
        410       420       430         440       450       460    

       500       510       520       530       540       550       
pF1KSD HRIIKQQGLVDGLFLLRDSQSNPKAFVLTLCHHQKIKNFQILPCEDDGQTFFSLDDGNTK
       .:.: ::::::::::.:.:: ::..:::.::: ::.:.. ::: :..:. .::.:::.:.
CCDS56 QRLIGQQGLVDGLFLVRESQRNPQGFVLSLCHLQKVKHYLILPSEEEGRLYFSMDDGQTR
          470       480       490       500       510       520    

       560       570       580        
pF1KSD FSDLIQLVDFYQLNKGVLPCKLKHHCIRVAL
       :.::.:::.:.:::.:.::: :.: : ::::
CCDS56 FTDLLQLVEFHQLNRGILPCLLRHCCTRVAL
          530       540       550     

>>CCDS82116.1 GRB7 gene_id:2886|Hs108|chr17               (447 aa)
 initn: 1263 init1: 587 opt: 1207  Z-score: 1011.6  bits: 196.8 E(32554): 5e-50
Smith-Waterman score: 1357; 49.4% identity (75.6% similar) in 443 aa overlap (66-493:1-432)

          40        50        60        70        80        90     
pF1KSD LANHQEDDVDLEALVNDMNASLESLYSACSMQSDTVPLLQNGQHARSQPRASGPPRSIQP
                                     :. :  :   ...     :  . :: . .:
CCDS82                               MELDLSPPHLSSSPEDLCPAPGTPPGTPRP
                                             10        20        30

         100        110        120       130       140         150 
pF1KSD QVSPR-QRVQRSQPVHILAV-RRLQEEDQQFRTSSLPAIPNPFPELCGPGS--PAVLTPG
         .:  ..:.::::. : .. :.:.::..  :..:::.:::::::::.: :  : .  :.
CCDS82 PDTPLPEEVKRSQPLLIPTTGRKLREEER--RATSLPSIPNPFPELCSPPSQSPILGGPS
               40        50          60        70        80        

                160       170       180       190       200        
pF1KSD S---LPPSQAAAKQDVKVFSEDGTSKVVEILADMTARDLCQLLVYKSHCVDDNSWTLVEH
       :   : : .:.  . :::.::::. . ::. :  ::: .:..:: ..: ..:..: ::: 
CCDS82 SARGLLPRDASRPHVVKVYSEDGACRSVEVAAGATARHVCEMLVQRAHALSDETWGLVEC
       90       100       110       120       130       140        

      210       220       230         240       250        260     
pF1KSD HPHLGLERCLEDHELVVQVEST--MASESKFLFRKNYAKYEFFKN-PMNFFPEQMVTWCQ
       ::::.::: ::::: ::.:...  ....:.:.::::.::::.::. : ..:::.::. : 
CCDS82 HPHLALERGLEDHESVVEVQAAWPVGGDSRFVFRKNFAKYELFKSSPHSLFPEKMVSSCL
      150       160       170       180       190       200        

           270       280       290       300       310       320   
pF1KSD QSNG--SQTQLLQNFLNSSSCPEIQGFLHVKELGKKSWKKLYVCLRRSGLYCSTKGTSKE
       ...   :. .:.:::::..: :::::::...  :.: ::...  ::::::: :::::::.
CCDS82 DAHTGISHEDLIQNFLNAGSFPEIQGFLQLRGSGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGTSKD
      210       220       230       240       250       260        

           330       340       350       360       370       380   
pF1KSD PRHLQLLADLEDSNIFSLIAGRKQYNAPTDHGLCIKPNKVRNETKELRLLCAEDEQTRTC
       ::::: .::...::.. .  ::: :. ::: :.:.::::.::  : ::..:.::::.:::
CCDS82 PRHLQYVADVNESNVYVVTQGRKLYGMPTDFGFCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQSRTC
      270       280       290       300       310       320        

           390       400       410          420       430       440
pF1KSD WMTAFRLLKYGMLLYQNYRIPQQRKALLSPF---STPVRSVSENSLVAMDFSGQTGRVIE
       :..::::.:::. ::.::.  :.:.  : :    : :.::.:.:.::::::::..:::::
CCDS82 WLAAFRLFKYGVQLYKNYQQAQSRH--LHPSCLGSPPLRSASDNTLVAMDFSGHAGRVIE
      330       340       350         360       370       380      

              450       460       470       480       490       500
pF1KSD NPAEAQSAALEEGHAWRKRSTRMNILGSQSPLHPSTLSTVIHRTQHWFHGRISREESHRI
       :: :: :.::::..::::....   :.   :   ..::..      :  ::.:       
CCDS82 NPREALSVALEEAQAWRKKTNHR--LSLPMPASGTSLSAACS----W-SGRVSGTPRALS
        390       400         410       420            430         

              510       520       530       540       550       560
pF1KSD IKQQGLVDGLFLLRDSQSNPKAFVLTLCHHQKIKNFQILPCEDDGQTFFSLDDGNTKFSD
                                                                   
CCDS82 SLCATCRK                                                    
     440                                                           

>>CCDS2359.1 RAPH1 gene_id:65059|Hs108|chr2               (1250 aa)
 initn: 413 init1: 309 opt: 523  Z-score: 438.7  bits: 92.2 E(32554): 4.1e-18
Smith-Waterman score: 529; 28.0% identity (57.3% similar) in 475 aa overlap (10-460:108-571)

                                    10        20                 30
pF1KSD                      MQAAGPLFRSKDKVEQTPRSQQDPAG---------PGLP
                                     :: .. .:  .:. :..          :: 
CCDS23 LNQGETVDLDALMADLCSIEQELSSIGSGNSKRQITETKATQKLPVSRHTLKHGTLKGLS
        80        90       100       110       120       130       

               40        50        60          70        80        
pF1KSD AQSDRLANHQEDDVDLEALVNDMNASLESLYSAC--SMQSDTVPLLQNGQHARSQPRASG
       ..:.:.:. .. . .:. .. ... .  :.  :   :.  :: ::. : :: :.   .. 
CCDS23 SSSNRIAKPSHASYSLDDVTAQLEQASLSMDEAAQQSVLEDTKPLVTN-QHRRTASAGTV
       140       150       160       170       180        190      

       90            100       110       120       130       140   
pF1KSD PPRSIQP-----QVSPRQRVQRSQPVHILAVRRLQEEDQQFRTSSLPAIPNPFPELCGPG
           ..      . :  . ..  . . :  : : :: :   . .     :    :  .  
CCDS23 SDAEVHSISNSSHSSITSAASSMDSLDIDKVTRPQELDLTHQGQ-----PITEEEQAAKL
        200       210       220       230       240            250 

           150       160        170       180       190       200  
pF1KSD SPAVLTPGSLPPSQAAAKQDV-KVFSEDGTSKVVEILADMTARDLCQLLVYKSHCVDDNS
       .   .  .    ..: .:. : .:   : .::.. .   .:.:.. . :. ::::  . .
CCDS23 KAEKIRVALEKIKEAQVKKLVIRVHMSDDSSKTMMVDERQTVRQVLDNLMDKSHCGYSLD
             260       270       280       290       300       310 

            210       220         230       240       250       260
pF1KSD WTLVEHHPHLGLERCLEDHELVVQ--VESTMASESKFLFRKNYAKYEFFKNPMNFFPEQM
       :.:::   .: .:: .:::: .:.  .. :  :..:..: .   :: .::::.:..  . 
CCDS23 WSLVETVSELQMERIFEDHENLVENLLNWTRDSQNKLIFMERIEKYALFKNPQNYLLGKK
             320       330       340       350       360       370 

              270       280        290       300       310         
pF1KSD VTWCQQSNGSQTQLLQNFLNSS-SCPEIQGFLHVKELGKKSWKKLYVCLRRSGLYCSTKG
        :  . . .... : . : .:: . :::.: : .:. ::::::: :  :: ::.:   ::
CCDS23 ETAEMADRNKEVLLEECFCGSSVTVPEIEGVLWLKDDGKKSWKKRYFLLRASGIYYVPKG
             380       390       400       410       420       430 

     320       330       340       350       360       370         
pF1KSD TSKEPRHLQLLADLEDSNIFSLIAGRKQYNAPTDHGLCIKPNKVRNETKELRLLCAEDEQ
        .:  : :  . .:.  :..     :..:.::::. : .:  ....... .. :: .: .
CCDS23 KAKVSRDLVCFLQLDHVNVYYGQDYRNKYKAPTDYCLVLKHPQIQKKSQYIKYLCCDDVR
             440       450       460       470       480       490 

     380       390       400           410       420       430     
pF1KSD TRTCWMTAFRLLKYGMLLYQNYRIPQQRKA----LLSPFSTPVRSVSENSLVAMDFSGQT
       :   :....:. :::  ::.::.   .:        :  :. ..: : .: .  . :...
CCDS23 TLHQWVNGIRIAKYGKQLYMNYQEALKRTESAYDWTSLSSSSIKSGSSSSSIPESQSNHS
             500       510       520       530       540       550 

         440       450       460       470       480       490     
pF1KSD GRVIENPAEAQSAALEEGHAWRKRSTRMNILGSQSPLHPSTLSTVIHRTQHWFHGRISRE
       ..   . ...: :    ::. :..:                                   
CCDS23 NQSDSGVSDTQPA----GHV-RSQSIVSSVFSEAWKRGTQLEESSKARMESMNRPYTSLV
             560            570       580       590       600      

>>CCDS2360.1 RAPH1 gene_id:65059|Hs108|chr2               (644 aa)
 initn: 413 init1: 309 opt: 502  Z-score: 425.5  bits: 88.8 E(32554): 2.2e-17
Smith-Waterman score: 502; 32.6% identity (63.2% similar) in 304 aa overlap (164-460:325-623)

           140       150       160       170       180       190   
pF1KSD NPFPELCGPGSPAVLTPGSLPPSQAAAKQDVKVFSEDGTSKVVEILADMTARDLCQLLVY
                                     ..:   : .::.. .   .:.:.. . :. 
CCDS23 TKEEQAAKLKAEKIRVALEKIKEAQVKKLVIRVHMSDDSSKTMMVDERQTVRQVLDNLMD
          300       310       320       330       340       350    

           200       210       220         230       240       250 
pF1KSD KSHCVDDNSWTLVEHHPHLGLERCLEDHELVVQ--VESTMASESKFLFRKNYAKYEFFKN
       ::::  . .:.:::   .: .:: .:::: .:.  .. :  :..:..: .   :: .:::
CCDS23 KSHCGYSLDWSLVETVSELQMERIFEDHENLVENLLNWTRDSQNKLIFMERIEKYALFKN
          360       370       380       390       400       410    

             260       270       280        290       300       310
pF1KSD PMNFFPEQMVTWCQQSNGSQTQLLQNFLNSS-SCPEIQGFLHVKELGKKSWKKLYVCLRR
       :.:..  .  :  . . .... : . : .:: . :::.: : .:. ::::::: :  :: 
CCDS23 PQNYLLGKKETAEMADRNKEVLLEECFCGSSVTVPEIEGVLWLKDDGKKSWKKRYFLLRA
          420       430       440       450       460       470    

              320       330       340       350       360       370
pF1KSD SGLYCSTKGTSKEPRHLQLLADLEDSNIFSLIAGRKQYNAPTDHGLCIKPNKVRNETKEL
       ::.:   :: .:  : :  . .:.  :..     :..:.::::. : .:  ....... .
CCDS23 SGIYYVPKGKAKVSRDLVCFLQLDHVNVYYGQDYRNKYKAPTDYCLVLKHPQIQKKSQYI
          480       490       500       510       520       530    

              380       390       400           410       420      
pF1KSD RLLCAEDEQTRTCWMTAFRLLKYGMLLYQNYRIPQQRKA----LLSPFSTPVRSVSENSL
       . :: .: .:   :....:. :::  ::.::.   .:        :  :. ..: : .: 
CCDS23 KYLCCDDVRTLHQWVNGIRIAKYGKQLYMNYQEALKRTESAYDWTSLSSSSIKSGSSSSS
          540       550       560       570       580       590    

        430       440       450       460       470       480      
pF1KSD VAMDFSGQTGRVIENPAEAQSAALEEGHAWRKRSTRMNILGSQSPLHPSTLSTVIHRTQH
       .  . :.....   . ...: :    ::. :..:                          
CCDS23 IPESQSNHSNQSDSGVSDTQPA----GHV-RSQSIVSSVFSEAWKRGTQLEESSK     
          600       610            620       630       640         

        490       500       510       520       530       540      
pF1KSD WFHGRISREESHRIIKQQGLVDGLFLLRDSQSNPKAFVLTLCHHQKIKNFQILPCEDDGQ

>>CCDS31167.1 APBB1IP gene_id:54518|Hs108|chr10           (666 aa)
 initn: 517 init1: 316 opt: 392  Z-score: 334.1  bits: 72.0 E(32554): 2.7e-12
Smith-Waterman score: 549; 29.2% identity (55.7% similar) in 469 aa overlap (42-474:60-506)

              20        30        40        50         60        70
pF1KSD DKVEQTPRSQQDPAGPGLPAQSDRLANHQEDDVDLEALVNDMNASL-ESLYSACSMQSDT
                                     .: ::.::. :. :.. :.   . . :...
CCDS31 TLPPPDPNPPRAEFNYSVGFKDLNESLNALEDQDLDALMADLVADISEAEQRTIQAQKES
      30        40        50        60        70        80         

               80        90       100       110       120       130
pF1KSD VPLLQNGQHARSQPRASGPPRSIQPQVSPRQRVQRSQPVHILAVRRLQEEDQQFRTSSLP
          ::: .:. :          .: ..     .. .  ... :.   : ::.     . :
CCDS31 ---LQNQHHSAS----------LQASIFSGA-ASLGYGTNVAATGISQYEDDLPPPPADP
         90                 100        110       120       130     

              140       150       160                         170  
pF1KSD AIPNPFPELCGPGSPAVLTPGSLPPSQAAAKQD------------------VKVFSEDGT
       ..  :.:    :  :    : :    .: :: :                  :::  .:..
CCDS31 VLDLPLP----PPPPE---PLSQEEEEAQAKADKIKLALEKLKEAKVKKLVVKVHMNDNS
         140              150       160       170       180        

            180       190       200       210       220         230
pF1KSD SKVVEILADMTARDLCQLLVYKSHCVDDNSWTLVEHHPHLGLERCLEDHELVVQVES--T
       .: . .   . :::. . :  :.::  . .: : : .:.: .:: .:::: ::.: :  :
CCDS31 TKSLMVDERQLARDVLDNLFEKTHCDCNVDWCLYEIYPELQIERFFEDHENVVEVLSDWT
      190       200       210       220       230       240        

              240       250             260       270       280    
pF1KSD MASESKFLFRKNYAKYEFFKNPMNFF------PEQMVTWCQQSNGSQTQLLQNFLNSSS-
         .:.:.:: ..  ::  ::::.::.       :.  :  ...  .. .::.. . ..: 
CCDS31 RDTENKILFLEKEEKYAVFKNPQNFYLDNRGKKESKETNEKMNAKNKESLLEESFCGTSI
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CCDS31 IVPELEGALYLKEDGKKSWKRRYFLLRASGIYYVPKGKTKTSRDLACFIQFENVNIYYGT
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pF1KSD AGRKQYNAPTDHGLCIKPNKVRNETKELRLLCAEDEQTRTCWMTAFRLLKYGMLLYQNYR
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CCDS31 QHKMKYKAPTDYCFVLKHPQIQKESQYIKYLCCDDTRTLNQWVMGIRIAKYGKTLYDNYQ
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           . .: : . : . .:.  . .  . . .:: .  :    :     ::.:.:.  ::
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