Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0173
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0173, 1199 aa
  1>>>pF1KSDA0173 1199 - 1199 aa - 1199 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5223+/-0.000952; mu= 12.2298+/- 0.057
 mean_var=131.0190+/-25.956, 0's: 0 Z-trim(109.8): 29  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.112049
 statistics sampled from 11107 (11128) to 11107 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.695), E-opt: 0.2 (0.342), width:  16
 Scan time:  5.360

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS2422.1 TTLL4 gene_id:9654|Hs108|chr2           (1199) 8066 1316.1       0
CCDS32124.1 TTLL5 gene_id:23093|Hs108|chr14        (1281) 1047 181.5 1.2e-44
CCDS45724.1 TTLL6 gene_id:284076|Hs108|chr17       ( 891)  765 135.8 4.5e-31
CCDS690.2 TTLL7 gene_id:79739|Hs108|chr1           ( 887)  700 125.3 6.5e-28
CCDS5301.1 TTLL2 gene_id:83887|Hs108|chr6          ( 592)  513 95.0 5.8e-19
CCDS48012.1 TTLL11 gene_id:158135|Hs108|chr9       ( 800)  474 88.8 5.9e-17
CCDS6834.2 TTLL11 gene_id:158135|Hs108|chr9        ( 538)  371 72.0 4.4e-12


>>CCDS2422.1 TTLL4 gene_id:9654|Hs108|chr2                (1199 aa)
 initn: 8066 init1: 8066 opt: 8066  Z-score: 7047.9  bits: 1316.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 8066; 99.9% identity (100.0% similar) in 1199 aa overlap (1-1199:1-1199)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MASAGTQHYSIGLRQKNSFKQSGPSGTVPATPPQKPSEGRVWPQAHQQVKPIWKLEKKQV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 MASAGTQHYSIGLRQKNSFKQSGPSGTVPATPPEKPSEGRVWPQAHQQVKPIWKLEKKQV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD ETLSAGLGPGLLGVPPQPAYFFCPSTLCSSGTTAVIAGHSSSCYLHSLPDLFNSTLLYRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 ETLSAGLGPGLLGVPPQPAYFFCPSTLCSSGTTAVIAGHSSSCYLHSLPDLFNSTLLYRR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD SSYRQKPYQQLESFCLRSSPSEKSPFSLPQKSLPVSLTANKATSSMVFSMAQPMASSSTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 SSYRQKPYQQLESFCLRSSPSEKSPFSLPQKSLPVSLTANKATSSMVFSMAQPMASSSTE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD PYLCLAAAGENPSGKSLASAISGKIPSPLSSSYKPMLNNNSFMWPNSTPVPLLQTTQGLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 PYLCLAAAGENPSGKSLASAISGKIPSPLSSSYKPMLNNNSFMWPNSTPVPLLQTTQGLK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD PVSPPKIQPVSWHHSGGTGDCAPQPVDHKVPKSIGTVPADASAHIALSTASSHDTSTTSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 PVSPPKIQPVSWHHSGGTGDCAPQPVDHKVPKSIGTVPADASAHIALSTASSHDTSTTSV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD ASSWYNRNNLAMRAEPLSCALDDSSDSQDPTKEIRFTEAVRKLTARGFEKMPRQGCQLEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 ASSWYNRNNLAMRAEPLSCALDDSSDSQDPTKEIRFTEAVRKLTARGFEKMPRQGCQLEQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD SSFLNPSFQWNVLNRSRRWKPPAVNQQFPQEDAGSVRRVLPGASDTLGLDNTVFCTKRIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 SSFLNPSFQWNVLNRSRRWKPPAVNQQFPQEDAGSVRRVLPGASDTLGLDNTVFCTKRIS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD IHLLASHASGLNHNPACESVIDSSAFGEGKAPGPPFPQTLGIANVATRLSSIQLGQSEKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 IHLLASHASGLNHNPACESVIDSSAFGEGKAPGPPFPQTLGIANVATRLSSIQLGQSEKE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD RPEEARELDSSDRDISSATDLQPDQAETEDTEEELVDGLEDCCSRDENEEEEGDSECSSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 RPEEARELDSSDRDISSATDLQPDQAETEDTEEELVDGLEDCCSRDENEEEEGDSECSSL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD SAVSPSESVAMISRSCMEILTKPLSNHEKVVRPALIYSLFPNVPPTIYFGTRDERVEKLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 SAVSPSESVAMISRSCMEILTKPLSNHEKVVRPALIYSLFPNVPPTIYFGTRDERVEKLP
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD WEQRKLLRWKMSTVTPNIVKQTIGRSHFKISKRNDDWLGCWGHHMKSPSFRSIREHQKLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 WEQRKLLRWKMSTVTPNIVKQTIGRSHFKISKRNDDWLGCWGHHMKSPSFRSIREHQKLN
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD HFPGSFQIGRKDRLWRNLSRMQSRFGKKEFSFFPQSFILPQDAKLLRKAWESSSRQKWIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 HFPGSFQIGRKDRLWRNLSRMQSRFGKKEFSFFPQSFILPQDAKLLRKAWESSSRQKWIV
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD KPPASARGIGIQVIHKWSQLPKRRPLLVQRYLHKPYLISGSKFDLRIYVYVTSYDPLRIY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 KPPASARGIGIQVIHKWSQLPKRRPLLVQRYLHKPYLISGSKFDLRIYVYVTSYDPLRIY
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD LFSDGLVRFASCKYSPSMKSLGNKFMHLTNYSVNKKNAEYQANADEMACQGHKWALKALW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 LFSDGLVRFASCKYSPSMKSLGNKFMHLTNYSVNKKNAEYQANADEMACQGHKWALKALW
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD NYLSQKGVNSDAIWEKIKDVVVKTIISSEPYVTSLLKMYVRRPYSCHELFGFDIMLDENL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 NYLSQKGVNSDAIWEKIKDVVVKTIISSEPYVTSLLKMYVRRPYSCHELFGFDIMLDENL
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD KPWVLEVNISPSLHSSSPLDISIKGQMIRDLLNLAGFVLPNAEDIISSPSSCSSSTTSLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 KPWVLEVNISPSLHSSSPLDISIKGQMIRDLLNLAGFVLPNAEDIISSPSSCSSSTTSLP
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD TSPGDKCRMAPEHVTAQKMKKAYYLTQKIPDQDFYASVLDVLTPDDVRILVEMEDEFSRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 TSPGDKCRMAPEHVTAQKMKKAYYLTQKIPDQDFYASVLDVLTPDDVRILVEMEDEFSRR
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD GQFERIFPSHISSRYLRFFEQPRYFNILTTQWEQKYHGNKLKGVDLLRSWCYKGFHMGVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 GQFERIFPSHISSRYLRFFEQPRYFNILTTQWEQKYHGNKLKGVDLLRSWCYKGFHMGVV
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD SDSAPVWSLPTSLLTISKDDVILNAFSKSETSKLGKQSSCEVSLLLSEDGTTPKSKKTQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 SDSAPVWSLPTSLLTISKDDVILNAFSKSETSKLGKQSSCEVSLLLSEDGTTPKSKKTQA
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190         
pF1KSD GLSPYPQKPSSSKDSEDTSKEPSLSTQTLPVIKCSGQTSRLSASSTFQSISDSLLAVSP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 GLSPYPQKPSSSKDSEDTSKEPSLSTQTLPVIKCSGQTSRLSASSTFQSISDSLLAVSP
             1150      1160      1170      1180      1190         

>>CCDS32124.1 TTLL5 gene_id:23093|Hs108|chr14             (1281 aa)
 initn: 408 init1: 408 opt: 1047  Z-score: 915.4  bits: 181.5 E(32554): 1.2e-44
Smith-Waterman score: 1047; 37.4% identity (68.9% similar) in 473 aa overlap (591-1054:51-515)

              570       580       590       600       610       620
pF1KSD TKPLSNHEKVVRPALIYSLFPNVPPTIYFGTRDERVEKLPWEQRKLLRWKMSTVTPNIVK
                                     :.:. .. .   .:  : .:.  .   .:.
CCDS32 VISQEDHPCIMWTGGCRRIPVLVFHADAILTKDNNIRVIG--ERYHLSYKIVRTDSRLVR
               30        40        50        60          70        

               630       640        650       660       670        
pF1KSD QTIGRSHF-KISKRNDDWLGCW-GHHMKSPSFRSIREHQKLNHFPGSFQIGRKDRLWRNL
       . .    : ..   . :.   : : :.:   .:.. : ::.:::: :... :::::..:.
CCDS32 SILTAHGFHEVHPSSTDYNLMWTGSHLKPFLLRTLSEAQKVNHFPRSYELTRKDRLYKNI
       80        90       100       110       120       130        

      680       690       700       710       720       730        
pF1KSD SRMQSRFGKKEFSFFPQSFILPQDAKLLRKAWESSSRQKWIVKPPASARGIGIQVIHKWS
        :::   : : : ..::.:.:: .   . ... :..:  ::::: ::.:: :. .:.. .
CCDS32 IRMQHTHGFKAFHILPQTFLLPAEYAEFCNSY-SKDRGPWIVKPVASSRGRGVYLINNPN
      140       150       160       170        180       190       

      740       750       760       770       780       790        
pF1KSD QLPKRRPLLVQRYLHKPYLISGSKFDLRIYVYVTSYDPLRIYLFSDGLVRFASCKYSPSM
       :.  .. .::.::...: ::.  :::.:.:: ::::::: :::. .::.:::. .:. . 
CCDS32 QISLEENILVSRYINNPLLIDDFKFDVRLYVLVTSYDPLVIYLYEEGLARFATVRYDQGA
       200       210       220       230       240       250       

      800       810       820        830       840       850       
pF1KSD KSLGNKFMHLTNYSVNKKNAEYQANAD-EMACQGHKWALKALWNYLSQKGVNSDAIWEKI
       :.. :.::::::::::::...: .  : :.   :.::...:.  ::.:.: .. :.  ..
CCDS32 KNIRNQFMHLTNYSVNKKSGDYVSCDDPEVEDYGNKWSMSAMLRYLKQEGRDTTALMAHV
       260       270       280       290       300       310       

       860       870       880       890       900       910       
pF1KSD KDVVVKTIISSEPYVTSLLKMYVRRPYSCHELFGFDIMLDENLKPWVLEVNISPSLHSSS
       .:...:::::.:  ...  : .: .  :: ::.:::...: .::::.::::.::::  ..
CCDS32 EDLIIKTIISAELAIATACKTFVPHRSSCFELYGFDVLIDSTLKPWLLEVNLSPSLACDA
       320       330       340       350       360       370       

       920       930       940           950       960       970   
pF1KSD PLDISIKGQMIRDLLNLAGFVLPNAEDIISS----PSSCSSSTTSLPTSPGDKCRMAPEH
       :::..::..:: :.....:::  .  .  :.    :.  ::  .  : .  ..::  :  
CCDS32 PLDLKIKASMISDMFTVVGFVCQDPAQRASTRPIYPTFESSRRN--PFQKPQRCR--PLS
       380       390       400       410       420         430     

           980       990      1000      1010      1020      1030   
pF1KSD VTAQKMKKAYYLTQKIPDQDFYASVLDVLTPDDVRILVEMEDEFSRRGQFERIFPSHISS
       ..  .::.    ...     . .:::  :. .....: ....: .::: : ::::.  . 
CCDS32 ASDAEMKNLVGSAREKGPGKLGGSVLG-LSMEEIKVLRRVKEENDRRGGFIRIFPTSETW
           440       450       460        470       480       490  

           1040       1050      1060      1070      1080      1090 
pF1KSD R-YLRFFEQPRYFN-ILTTQWEQKYHGNKLKGVDLLRSWCYKGFHMGVVSDSAPVWSLPT
       . :  ..:.   .: .:.:.  :                                     
CCDS32 EIYGSYLEHKTSMNYMLATRLFQDRMTADGAPELKIESLNSKAKLHAALYERKLLSLEVR
            500       510       520       530       540       550  

>>CCDS45724.1 TTLL6 gene_id:284076|Hs108|chr17            (891 aa)
 initn: 438 init1: 367 opt: 765  Z-score: 671.4  bits: 135.8 E(32554): 4.5e-31
Smith-Waterman score: 765; 27.5% identity (57.7% similar) in 640 aa overlap (585-1199:87-699)

          560       570       580       590       600       610    
pF1KSD SCMEILTKPLSNHEKVVRPALIYSLFPNVPPTIYFGTRDERVEKLPWEQRKLLRWKMSTV
                                     :    : .. . .    ...: :  ..:. 
CCDS45 SQEGENSEEKGDSSKEDPKETVALAFVRENPGAQNGLQNAQQQGKKKRKKKRLVINLSSC
         60        70        80        90       100       110      

          620       630       640        650       660       670   
pF1KSD TPNIVKQTIGRSHFKISKRNDDWLGCWGHHMKS-PSFRSIREHQKLNHFPGSFQIGRKDR
         . :...  .  :. . ..:::   :  .  :      .. .::.:::::  .: ::: 
CCDS45 RYESVRRAAQQYGFREGGEDDDWTLYWTDYSVSLERVMEMKSYQKINHFPGMSEICRKDL
        120       130       140       150       160       170      

           680       690       700       710       720       730   
pF1KSD LWRNLSRMQSRFGKKEFSFFPQSFILPQDAKLLRKAWESSSRQKWIVKPPASARGIGIQV
       : ::.::: . :  :.: :::... :: :   :.   .: . . .: :: .. .: :: .
CCDS45 LARNMSRMLKMF-PKDFRFFPRTWCLPADWGDLQTYSRSRKNKTYICKPDSGCQGKGIFI
        180        190       200       210       220       230     

           740       750       760       770       780       790   
pF1KSD IHKWSQLPKRRPLLVQRYLHKPYLISGSKFDLRIYVYVTSYDPLRIYLFSDGLVRFASCK
        .  ...   . .. : :. ::..:.: :::::::: ::: :::::.....::.:::. .
CCDS45 TRTVKEIKPGEDMICQLYISKPFIIDGFKFDLRIYVLVTSCDPLRIFVYNEGLARFATTS
         240       250       260       270       280       290     

            800       810       820       830       840       850  
pF1KSD YS-PSMKSLGNKFMHLTNYSVNKKNAEYQANADEMACQGHKWALKALWNYLSQKGVNSDA
       :: :   .: .  :::::::.::...... .:     .: :  :...  :: ... : . 
CCDS45 YSRPCTDNLDDICMHLTNYSINKHSSNFSRDAH----SGSKRKLSTFSAYLEDHSYNVEQ
         300       310       320           330       340       350 

            860       870       880            890       900       
pF1KSD IWEKIKDVVVKTIISSEPYVTSLLKMYVRRPY-----SCHELFGFDIMLDENLKPWVLEV
       ::. :.::..::.::..: .    ....  :      .: :..::::.::..::::.:::
CCDS45 IWRDIEDVIIKTLISAHPIIRH--NYHTCFPNHTLNSACFEILGFDILLDHKLKPWLLEV
             360       370         380       390       400         

       910       920       930       940              950       960
pF1KSD NISPSLHSSSPLDISIKGQMIRDLLNLAGFVLPNAEDIISSP-------SSCSSSTTSLP
       : :::. ..: ::  .:  .. : : : ..   . . ..          ..: :    . 
CCDS45 NHSPSFSTDSRLDKEVKDGLLYDTLVLINLESCDKKKVLEEERQRGQFLQQCCSREMRIE
     410       420       430       440       450       460         

              970       980        990      1000      1010         
pF1KSD TSPGDKCRMAPEHVTAQKMK-KAYYLTQKIPDQDFYASVLDVLTPDDVRILVEMEDEFSR
        . : .  .  .  : .: .  .. :     ... : . ..     :   : .       
CCDS45 EAKGFRAVQLKKTETYEKENCGGFRLIYPSLNSEKYEKFFQ-----DNNSLFQNTVASRA
     470       480       490       500       510            520    

    1020      1030       1040      1050      1060      1070        
pF1KSD RGQFERIFPSHIS-SRYLRFFEQPRYFNILTTQWEQKYHGNKLKGVDLLRSWCYKGFHMG
       : .. : . ...  .:  . :.. .  ..   : :.  .  . ::   .:.:  :  .  
CCDS45 REEYARQLIQELRLKREKKPFQMKKKVEM---QGESAGEQVRKKG---MRGWQQKQQQKD
          530       540       550          560          570        

     1080       1090      1100       1110       1120      1130     
pF1KSD VVSDSAPVWSL-PTSLLTISKDDVI-LNAFSKSET-SKLGKQSSCEVSLLLSEDGTTPKS
        .. .:    . : .:.. . : .. . .  :.:: :.:....        .:....   
CCDS45 KAATQASKQYIQPLTLVSYTPDLLLSVRGERKNETDSSLNQEAP-------TEEASSVFP
      580       590       600       610       620              630 

        1140      1150      1160       1170      1180      1190    
pF1KSD KKTQAGLSPYPQKPSSSKDSEDTSK-EPSLSTQTLPVIKCSGQTSRLSASSTFQSI----
       : :.:  .:. . :.  . . ..:: :::  . ..   : .. .. ....  . :.    
CCDS45 KLTSA--KPFSSLPDLRNINLSSSKLEPSKPNFSIKEAKSASAVNVFTGTVHLTSVETTP
               640       650       660       670       680         

                                                                   
pF1KSD -SDSLLAVSP                                                  
        : . :..::                                                  
CCDS45 ESTTQLSISPKSPPTLAVTASSEYSGPETDRVVSFKCKKQQTPPHLTQKKMLKSFLPTKS
     690       700       710       720       730       740         

>>CCDS690.2 TTLL7 gene_id:79739|Hs108|chr1                (887 aa)
 initn: 585 init1: 286 opt: 700  Z-score: 614.6  bits: 125.3 E(32554): 6.5e-28
Smith-Waterman score: 705; 29.4% identity (59.0% similar) in 642 aa overlap (598-1191:21-630)

       570       580       590       600          610              
pF1KSD EKVVRPALIYSLFPNVPPTIYFGTRDERVEKLPWE---QRKLLRWKMS-TVTPN------
                                     .::..   .::. . : . :.: :      
CCDS69           MPSLPQEGVIQGPSPLDLNTELPYQSTMKRKVRKKKKKGTITANVAGTKF
                         10        20        30        40        50

        620       630       640         650       660       670    
pF1KSD -IVKQTIGRSHFKISKRNDDWLGC-W-GHHMKSPSFRSIREHQKLNHFPGSFQIGRKDRL
        ::. .: .  :  .  .:.  .  :    ... ..  ....:..:::::  .: ::: :
CCDS69 EIVRLVIDEMGFMKTPDEDETSNLIWCDSAVQQEKISELQNYQRINHFPGMGEICRKDFL
               60        70        80        90       100       110

          680        690       700          710        720         
pF1KSD WRNLSRM-QSRFGKKEFSFFPQSFILPQDAKLLR---KAWESSSRQK-WIVKPPASARGI
        ::...: .::    ...: :...:.: .   ..   :  ... .:: .::::  .: : 
CCDS69 ARNMTKMIKSR--PLDYTFVPRTWIFPAEYTQFQNYVKELKKKRKQKTFIVKPANGAMGH
              120         130       140       150       160        

     730       740       750       760       770       780         
pF1KSD GIQVIHKWSQLPKRRPLLVQRYLHKPYLISGSKFDLRIYVYVTSYDPLRIYLFSDGLVRF
       ::..:.. ..::..  :.::.:..::.:. : :::::::. ::: :::.:.:. :::::.
CCDS69 GISLIRNGDKLPSQDHLIVQEYIEKPFLMEGYKFDLRIYILVTSCDPLKIFLYHDGLVRM
      170       180       190       200       210       220        

     790       800        810       820       830       840        
pF1KSD ASCKYSPSMKS-LGNKFMHLTNYSVNKKNAEYQANADEMACQGHKWALKALWNYLSQKGV
       .. :: :  .: : . .::::::::::.: ...   ::   .: : ..: . ..:. .  
CCDS69 GTEKYIPPNESNLTQLYMHLTNYSVNKHNEHFE--RDETENKGSKRSIKWFTEFLQANQH
      230       240       250       260         270       280      

      850       860       870       880            890       900   
pF1KSD NSDAIWEKIKDVVVKTIISSEPYVTSLLKMYV--RRPYS---CHELFGFDIMLDENLKPW
       .   .:  :...::::.: .::.:    .:    . : :   : :..::::.::..::::
CCDS69 DVAKFWSDISELVVKTLIVAEPHVLHAYRMCRPGQPPGSESVCFEVLGFDILLDRKLKPW
        290       300       310       320       330       340      

           910       920       930       940       950             
pF1KSD VLEVNISPSLHSSSPLDISIKGQMIRDLLNLAGFVLPNAEDIISSPSSCS--------SS
       .::.: .::. ... .: ..:  .. . :.: ..   . .  ... .. .        : 
CCDS69 LLEINRAPSFGTDQKIDYDVKRGVLLNALKLLNIRTSDKRRNLAKQKAEAQRRLYGQNSI
        350       360       370       380       390       400      

         960        970       980       990          1000      1010
pF1KSD TTSLP-TSPGDKCRMAPEHVTAQKMKKAYYLTQKIPDQDF----YASVLDVLTPDDVRIL
          :: .:  .. :   :.   .  ..   . ..:  ..     ...   .  :.:  .:
CCDS69 KRLLPGSSDWEQQRHQLERRKEELKERLAQVRKQISREEHENRHMGNYRRIYPPEDKALL
        410       420       430       440       450       460      

             1020      1030      1040      1050      1060      1070
pF1KSD VEMEDEFSRRGQFERIFPSHISSRYLRFFEQPRYFNILTTQWEQKYHGNKLKGVDLLRSW
        ..:. ..        : . .:.:   :  : .  : :  . :.         .:::.. 
CCDS69 EKYENLLAV------AFQTFLSGRAASF--QRELNNPLKRMKEEDI-------LDLLEQ-
        470             480         490       500              510 

               1080         1090      1100      1110      1120     
pF1KSD CYKGFH--MGVVSDS---APVWSLPTSLLTISKDDVILNAFSKSETSKLGKQSSCEVSLL
       :    .  :: .. .    :. :.: :   ...       . .:..:  ...:: : .  
CCDS69 CEIDDEKLMGKTTKTRGPKPLCSMPESTEIMKRPK-----YCSSDSSYDSSSSSSESDEN
              520       530       540            550       560     

        1130       1140           1150      1160      1170         
pF1KSD LSEDGTTPKS-KKTQAGLSP---YP--QKPSSSKDSEDTSKEPSLSTQTLPVIKCSGQTS
        .:.  . :  :..  .:.:   :   :.::: . :  .:   :.:.:. :    ::.: 
CCDS69 EKEEYQNKKREKQVTYNLKPSNHYKLIQQPSSIRRS--VSCPRSISAQS-P---SSGDTR
         570       580       590       600         610             

    1180      1190                                                 
pF1KSD RLSASSTFQSISDSLLAVSP                                        
        .::.. . :.:                                                
CCDS69 PFSAQQMI-SVSRPTSASRSHSLNRASSYMRHLPHSNDACSTNSQVSESLRQLKTKEQED
     620        630       640       650       660       670        

>>CCDS5301.1 TTLL2 gene_id:83887|Hs108|chr6               (592 aa)
 initn: 649 init1: 216 opt: 513  Z-score: 453.9  bits: 95.0 E(32554): 5.8e-19
Smith-Waterman score: 706; 34.9% identity (67.7% similar) in 347 aa overlap (605-934:85-414)

          580       590       600       610       620          630 
pF1KSD LIYSLFPNVPPTIYFGTRDERVEKLPWEQRKLLRWKMSTVTPNIVKQTI---GRSHFKIS
                                     : : .... .:: .:....   : ..:  .
CCDS53 PPRRGRPTPTLEKKKKPHLMAEDEPSGALLKPLVFRVDETTPAVVQSVLLERGWNKFDKQ
           60        70        80        90       100       110    

              640       650            660       670       680     
pF1KSD KRN-DDWLGCWGHHMKSPSFR-----SIREHQKLNHFPGSFQIGRKDRLWRNLSRMQSRF
       ..: .::   :    .. :::     :..  :.::: ::. .. ::: : ..:..:.  .
CCDS53 EQNAEDWNLYW----RTSSFRMTEHNSVKPWQQLNHHPGTTKLTRKDCLAKHLKHMRRMY
          120           130       140       150       160       170

         690       700        710            720       730         
pF1KSD GKKEFSFFPQSFILPQD-AKLLRKAWE-----SSSRQKWIVKPPASARGIGIQVIHKWSQ
       : . ..:.: .:..:.: .:.. . ..     ..... :: ::   .:: :: ..  ...
CCDS53 GTSLYQFIPLTFVMPNDYTKFVAEYFQERQMLGTKHSYWICKPAELSRGRGILIFSDFKD
              180       190       200       210       220       230

     740       750       760       770       780       790         
pF1KSD LPKRRPLLVQRYLHKPYLISGSKFDLRIYVYVTSYDPLRIYLFSDGLVRFASCKYSPSMK
       .      .::.:. .: ::.  : :::::: ::.. :: ::....::::::. :.  ...
CCDS53 FIFDDMYIVQKYISNPLLIGRYKCDLRIYVCVTGFKPLTIYVYQEGLVRFATEKF--DLS
              240       250       260       270       280          

     800       810       820       830       840       850         
pF1KSD SLGNKFMHLTNYSVNKKNAEYQANADEMACQGHKWALKALWNYLSQKGVNSDAIWEKIKD
       .: :.. :::: :.::..: :. .  :.  .: ::.:. ...:: .  :..  .:.::. 
CCDS53 NLQNNYAHLTNSSINKSGASYE-KIKEVIGHGCKWTLSRFFSYLRSWDVDDLLLWKKIHR
      290       300       310        320       330       340       

     860       870       880         890       900       910       
pF1KSD VVVKTIISSEPYVTSLLKMYVRRPYS--CHELFGFDIMLDENLKPWVLEVNISPSLHSSS
       .:. ::..  : :          :..  : :::::::..:.:::::.:::: ::.:  . 
CCDS53 MVILTILAIAPSV----------PFAANCFELFGFDILIDDNLKPWLLEVNYSPALTLDC
       350       360                 370       380       390       

       920       930       940       950       960       970       
pF1KSD PLDISIKGQMIRDLLNLAGFVLPNAEDIISSPSSCSSSTTSLPTSPGDKCRMAPEHVTAQ
         :. .: ....:...:                                           
CCDS53 STDVLVKRKLVHDIIDLIYLNGLRNEGREASNATHGNSNIDAAKSDRGGLDAPDCLPYDS
       400       410       420       430       440       450       

>>CCDS48012.1 TTLL11 gene_id:158135|Hs108|chr9            (800 aa)
 initn: 430 init1: 178 opt: 474  Z-score: 417.9  bits: 88.8 E(32554): 5.9e-17
Smith-Waterman score: 609; 28.4% identity (54.6% similar) in 670 aa overlap (389-1010:17-650)

      360       370       380       390        400       410       
pF1KSD EQSSFLNPSFQWNVLNRSRRWKPPAVNQQFPQEDAGSVRRV-LPGASDTLGLDNTVFCTK
                                     :... :  ::. :::      :: .   : 
CCDS48               MAAAASVTGRVTWAASPMRSLGLGRRLSLPGPR----LDAV---TA
                             10        20        30                

       420       430          440       450       460       470    
pF1KSD RISIHLLASHASGLNHNP---ACESVIDSSAFGEGKAPGPPFPQTLGIANVATRLSSIQL
        ..  : ..:..::...    .: .    . .: : : .     .:     :  ::... 
CCDS48 AVNPSL-SDHGNGLGRGTRGSGCSGGSLVADWGGGAAAAAAVALAL-----APALSTMRR
      40         50        60        70        80             90   

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pF1KSD GQSEKERPEEAR-ELDSSDRDISSATDLQPDQAETEDTEEELVDGLE-DCCSRDENEEEE
       :.::.:    :: : ..    ...:      .::.: : : ... .. :  .  : : . 
CCDS48 GSSESELA--ARWEAEA----VAAAK--AAAKAEAEATAETVAEQVRVDAGAAGEPECKA
           100             110         120       130       140     

            540       550       560       570       580       590  
pF1KSD GDSECSSLSAVSPSESVAMISRSCMEILTKPLSNHEKVVRPALIYSLFPNVPPTIYFGTR
       :. :  .. : .:..  :   ..  ..: .:  .     .:  . .: :.  :      :
CCDS48 GE-EQPKVLAPAPAQPSAA-EEGNTQVLQRPPPTLPPS-KPKPVQGLCPHGKP------R
          150       160        170       180        190            

             600       610       620       630       640        650
pF1KSD DE-RVEKLPWEQRKLLRWKMSTVTPNIVKQTIGRSHFKISKRNDDWLGC-WGHHMKSPSF
       :. :  :    . .    ..  :: .  :   . . .::: :.  :    .:...    .
CCDS48 DKGRSCKRSSGHGSGENGSQRPVTVDSSKARTSLDALKISIRQLKWKEFPFGRRLPCDIY
        200       210       220       230       240       250      

                     660       670       680       690       700   
pF1KSD -RSIREHQ------KLNHFPGSFQIGRKDRLWRNLSRMQSRFGKKEFSFFPQSFILPQDA
        ...  :.      ..:.:::  .. ::  : : .  ::. :  .:..:.:.:.:::.. 
CCDS48 WHGVSFHDNDIFSGQVNKFPGMTEMVRKITLSRAVRTMQNLF-PEEYNFYPRSWILPDEF
        260       270       280       290        300       310     

                 710       720       730       740            750  
pF1KSD KL------LRKAWESSSRQKWIVKPPASARGIGIQVIHKWSQLP-----KRRPLLVQRYL
       .:      . :  . : .  .:::: .. .: :: .:.  :..      . :: .::.:.
CCDS48 QLFVAQVQMVKDDDPSWKPTFIVKPDGGCQGDGIYLIKDPSDIRLAGTLQSRPAVVQEYI
         320       330       340       350       360       370     

            760       770       780       790        800       810 
pF1KSD HKPYLISGSKFDLRIYVYVTSYDPLRIYLFSDGLVRFASCKYS-PSMKSLGNKFMHLTNY
        :: ::.  :::.:.:: . : :::.::. .::: :: .  :. :. :.:   :::::::
CCDS48 CKPLLIDKLKFDIRLYVLLKSLDPLEIYIAKDGLSRFCTEPYQEPTPKNLHRIFMHLTNY
         380       390       400       410       420       430     

             820       830       840       850       860       870 
pF1KSD SVNKKNAEYQANADEMACQGHKWALKALWNYLSQKGVNSDAIWEKIKDVVVKTIISSEPY
       :.: .....  ..:  :  : : .....   ::.:::.   .:  : .::.::.:.  : 
CCDS48 SLNIHSGNF-IHSDS-ASTGSKRTFSSILCRLSSKGVDIKKVWSDIISVVIKTVIALTPE
         440         450       460       470       480       490   

             880          890       900       910                  
pF1KSD VTSLLKMYVR--RPY-SCHELFGFDIMLDENLKPWVLEVNISPSL-----HSSSP-----
       .  . .  .   ::  .: ...::::.: .:::: .:::: .::.     :  ::     
CCDS48 LKVFYQSDIPTGRPGPTCFQILGFDILLMKNLKPILLEVNANPSMRIEHEHELSPGVFEN
           500       510       520       530       540       550   

          920       930       940          950       960       970 
pF1KSD ----LDISIKGQMIRDLLNLAGFVLPNAEDI---ISSPSSCSSSTTSLPTSPGDKCRMAP
           .:  .:  .::: : :   .  . :.    . .: . . .. .   . .  :   :
CCDS48 VPSLVDEEVKVAVIRDTLRLMDPLKKKRENQSQQLEKPFAGKEDALDGELTSAPDCNANP
           560       570       580       590       600       610   

              980       990      1000      1010      1020      1030
pF1KSD E-HVTAQKMKKAYYLTQKIPDQDFYASVLDVLTPDDVRILVEMEDEFSRRGQFERIFPSH
       : :. .  .:...    :   :  :  ..: ..   .:.:                    
CCDS48 EAHLPSICLKQVF---PKYAKQFNYLRLVDRMANLFIRFLGIKGTMKLGPTGFRTFIRSC
           620          630       640       650       660       670

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pF1KSD ISSRYLRFFEQPRYFNILTTQWEQKYHGNKLKGVDLLRSWCYKGFHMGVVSDSAPVWSLP
                                                                   
CCDS48 KLSSSSLSMAAVDILYIDITRRWNSMTLDQRDSGMCLQAFVEAFFFLAQRKFKMLPLHEQ
              680       690       700       710       720       730

>>CCDS6834.2 TTLL11 gene_id:158135|Hs108|chr9             (538 aa)
 initn: 407 init1: 178 opt: 371  Z-score: 330.5  bits: 72.0 E(32554): 4.4e-12
Smith-Waterman score: 483; 28.9% identity (55.7% similar) in 508 aa overlap (389-870:17-492)

      360       370       380       390        400       410       
pF1KSD EQSSFLNPSFQWNVLNRSRRWKPPAVNQQFPQEDAGSVRRV-LPGASDTLGLDNTVFCTK
                                     :... :  ::. :::      :: .   : 
CCDS68               MAAAASVTGRVTWAASPMRSLGLGRRLSLPGPR----LDAV---TA
                             10        20        30                

       420       430          440       450       460       470    
pF1KSD RISIHLLASHASGLNHNP---ACESVIDSSAFGEGKAPGPPFPQTLGIANVATRLSSIQL
        ..  : ..:..::...    .: .    . .: : : .     .:. :     ::... 
CCDS68 AVNPSL-SDHGNGLGRGTRGSGCSGGSLVADWGGGAAAAAAVALALAPA-----LSTMRR
      40         50        60        70        80             90   

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pF1KSD GQSEKERPEEARELDSSDRDISSATDLQPDQAETEDTEEELVDGLE-DCCSRDENEEEEG
       :.::.:       : .  .  . :.     .::.: : : ... .. :  .  : : . :
CCDS68 GSSESE-------LAARWEAEAVAAAKAAAKAEAEATAETVAEQVRVDAGAAGEPECKAG
                  100       110       120       130       140      

           540       550       560       570       580       590   
pF1KSD DSECSSLSAVSPSESVAMISRSCMEILTKPLSNHEKVVRPALIYSLFPNVPPTIYFGTRD
       . :  .. : .:..  :   ..  ..: .:  .     .:  . .: :.  :      ::
CCDS68 E-EQPKVLAPAPAQPSAA-EEGNTQVLQRPPPTLPPS-KPKPVQGLCPHGKP------RD
         150       160        170       180        190             

            600       610       620       630       640        650 
pF1KSD E-RVEKLPWEQRKLLRWKMSTVTPNIVKQTIGRSHFKISKRNDDWLGC-WGHHMKSPSF-
       . :  :    . .    ..  :: .  :   . . .::: :.  :    .:...    . 
CCDS68 KGRSCKRSSGHGSGENGSQRPVTVDSSKARTSLDALKISIRQLKWKEFPFGRRLPCDIYW
       200       210       220       230       240       250       

                    660       670       680       690       700    
pF1KSD RSIREHQ------KLNHFPGSFQIGRKDRLWRNLSRMQSRFGKKEFSFFPQSFILPQDAK
       ...  :.      ..:.:::  .. ::  : : .  ::. :  .:..:.:.:.:::.. .
CCDS68 HGVSFHDNDIFSGQVNKFPGMTEMVRKITLSRAVRTMQNLF-PEEYNFYPRSWILPDEFQ
       260       270       280       290        300       310      

                710       720       730       740            750   
pF1KSD L------LRKAWESSSRQKWIVKPPASARGIGIQVIHKWSQLP-----KRRPLLVQRYLH
       :      . :  . : .  .:::: .. .: :: .:.  :..      . :: .::.:. 
CCDS68 LFVAQVQMVKDDDPSWKPTFIVKPDGGCQGDGIYLIKDPSDIRLAGTLQSRPAVVQEYIC
        320       330       340       350       360       370      

           760       770       780       790        800       810  
pF1KSD KPYLISGSKFDLRIYVYVTSYDPLRIYLFSDGLVRFASCKYS-PSMKSLGNKFMHLTNYS
       :: ::.  :::.:.:: . : :::.::. .::: :: .  :. :. :.:   ::::::::
CCDS68 KPLLIDKLKFDIRLYVLLKSLDPLEIYIAKDGLSRFCTEPYQEPTPKNLHRIFMHLTNYS
        380       390       400       410       420       430      

            820       830       840       850       860       870  
pF1KSD VNKKNAEYQANADEMACQGHKWALKALWNYLSQKGVNSDAIWEKIKDVVVKTIISSEPYV
       .: .....  ..:  :  : : .....   ::.:::.   .:  : .::.::.:.  :  
CCDS68 LNIHSGNF-IHSDS-ASTGSKRTFSSILCRLSSKGVDIKKVWSDIISVVIKTVIALTPEL
        440         450       460       470       480       490    

            880       890       900       910       920       930  
pF1KSD TSLLKMYVRRPYSCHELFGFDIMLDENLKPWVLEVNISPSLHSSSPLDISIKGQMIRDLL
                                                                   
CCDS68 KVFYQSDIPTGRPGPTCFQVTIASSQPAFPALTGLKRALWLRVG                
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1199 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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