Result of FASTA (omim) for pF1KSDA0147
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0147, 1630 aa
  1>>>pF1KSDA0147 1630 - 1630 aa - 1630 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.3758+/-0.000446; mu= -6.5517+/- 0.028
 mean_var=506.9512+/-103.134, 0's: 0 Z-trim(123.7): 324  B-trim: 96 in 1/61
 Lambda= 0.056963
 statistics sampled from 43705 (44068) to 43705 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.78), E-opt: 0.2 (0.517), width:  16
 Scan time: 14.420

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_056171 (OMIM: 607733) protein scribble homolog  (1630) 10803 903.9       0
NP_874365 (OMIM: 607733) protein scribble homolog  (1655) 10383 869.4       0
NP_060684 (OMIM: 608195) leucine-rich repeat-conta ( 524) 2108 188.9   1e-46
XP_011513028 (OMIM: 608195) PREDICTED: leucine-ric ( 524) 2108 188.9   1e-46
XP_016866486 (OMIM: 608195) PREDICTED: leucine-ric ( 331) 1600 147.0 2.7e-34
XP_011513029 (OMIM: 608195) PREDICTED: leucine-ric ( 465) 1557 143.6 3.9e-33
XP_006714723 (OMIM: 606944) PREDICTED: protein LAP (1246) 1327 125.1 3.8e-27
NP_001006600 (OMIM: 606944) erbin isoform 7 [Homo  (1302) 1327 125.1   4e-27
NP_001240627 (OMIM: 606944) erbin isoform 4 [Homo  (1346) 1327 125.1 4.1e-27
NP_061165 (OMIM: 606944) erbin isoform 2 [Homo sap (1371) 1327 125.1 4.1e-27
NP_001240626 (OMIM: 606944) erbin isoform 1 [Homo  (1412) 1327 125.1 4.2e-27
NP_001240628 (OMIM: 606944) erbin isoform 8 [Homo  (1419) 1327 125.1 4.2e-27
XP_016865124 (OMIM: 606944) PREDICTED: protein LAP (1460) 1327 125.1 4.3e-27
XP_005248611 (OMIM: 606944) PREDICTED: protein LAP (1460) 1327 125.1 4.3e-27
XP_016865126 (OMIM: 606944) PREDICTED: protein LAP (1298) 1322 124.7 5.3e-27
NP_001240630 (OMIM: 606944) erbin isoform 9 [Homo  (1367) 1322 124.7 5.5e-27
XP_016865125 (OMIM: 606944) PREDICTED: protein LAP (1415) 1322 124.7 5.6e-27
XP_005248612 (OMIM: 606944) PREDICTED: protein LAP (1456) 1322 124.7 5.7e-27
XP_016857384 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1255) 1303 123.1 1.5e-26
XP_016857383 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1438) 1303 123.2 1.7e-26
XP_016857382 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1472) 1303 123.2 1.7e-26
XP_016857381 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1490) 1303 123.2 1.7e-26
NP_001317564 (OMIM: 614453) leucine-rich repeat-co (1495) 1303 123.2 1.7e-26
XP_016857379 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1528) 1303 123.2 1.7e-26
NP_065845 (OMIM: 614453) leucine-rich repeat-conta (1537) 1303 123.2 1.8e-26
XP_016857378 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1537) 1303 123.2 1.8e-26
XP_016857377 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1541) 1303 123.2 1.8e-26
XP_016857376 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1547) 1303 123.2 1.8e-26
XP_016857375 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1594) 1303 123.2 1.8e-26
XP_016857374 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1594) 1303 123.2 1.8e-26
NP_001255968 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich re ( 536)  559 61.6 2.1e-08
XP_016872192 (OMIM: 602775,607721) PREDICTED: leuc ( 582)  516 58.1 2.6e-07
NP_001311265 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich re ( 582)  516 58.1 2.6e-07
XP_016872193 (OMIM: 602775,607721) PREDICTED: leuc ( 582)  516 58.1 2.6e-07
NP_001311266 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich re ( 582)  516 58.1 2.6e-07
NP_031399 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich repea ( 582)  516 58.1 2.6e-07
XP_016872191 (OMIM: 602775,607721) PREDICTED: leuc ( 582)  516 58.1 2.6e-07
XP_011542154 (OMIM: 605352) PREDICTED: malignant f (1003)  483 55.6 2.5e-06
NP_004216 (OMIM: 605352) malignant fibrous histioc (1052)  483 55.6 2.6e-06
XP_016872767 (OMIM: 603583) PREDICTED: disks large ( 839)  443 52.3 2.2e-05
XP_016872764 (OMIM: 603583) PREDICTED: disks large ( 857)  443 52.3 2.2e-05
XP_016872762 (OMIM: 603583) PREDICTED: disks large ( 871)  443 52.3 2.2e-05
XP_016872772 (OMIM: 603583) PREDICTED: disks large ( 810)  442 52.2 2.2e-05
XP_016872755 (OMIM: 603583) PREDICTED: disks large ( 891)  443 52.3 2.2e-05
NP_001193698 (OMIM: 603583) disks large homolog 2  ( 909)  443 52.3 2.3e-05
XP_016872766 (OMIM: 603583) PREDICTED: disks large ( 842)  442 52.2 2.3e-05
XP_016872751 (OMIM: 603583) PREDICTED: disks large ( 923)  443 52.3 2.3e-05
NP_001136172 (OMIM: 603583) disks large homolog 2  ( 749)  440 52.0 2.4e-05
XP_011543090 (OMIM: 603583) PREDICTED: disks large ( 767)  440 52.0 2.4e-05
XP_016872774 (OMIM: 603583) PREDICTED: disks large ( 796)  440 52.0 2.5e-05


>>NP_056171 (OMIM: 607733) protein scribble homolog isof  (1630 aa)
 initn: 10803 init1: 10803 opt: 10803  Z-score: 4815.4  bits: 903.9 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 10803; 99.9% identity (99.9% similar) in 1630 aa overlap (1-1630:1-1630)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MLKCIPLWRCNRHVESVDKRHCSLQAVPEEIYRYSRSLEELLLDANQLRELPKPFFRLLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 MLKCIPLWRCNRHVESVDKRHCSLQAVPEEIYRYSRSLEELLLDANQLRELPKPFFRLLN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD LRKLGLSDNEIQRLPPEVANFMQLVELDVSRNDIPEIPESIKFCKALEIADFSGNPLSRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LRKLGLSDNEIQRLPPEVANFMQLVELDVSRNDIPEIPESIKFCKALEIADFSGNPLSRL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD PDGFTQLRSLAHLALNDVSLQALPGDVGNLANLVTLELRENLLKSLPASLSFLVKLEQLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 PDGFTQLRSLAHLALNDVSLQALPGDVGNLANLVTLELRENLLKSLPASLSFLVKLEQLD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD LGGNDLEVLPDTLGALPNLRELWLDRNQLSALPPELGNLRRLVCLDVSENRLEELPAELG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LGGNDLEVLPDTLGALPNLRELWLDRNQLSALPPELGNLRRLVCLDVSENRLEELPAELG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD GLVLLTDLLLSQNLLRRLPDGIGQLKQLSILKVDQNRLCEVTEAIGDCENLSELILTENL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 GLVLLTDLLLSQNLLRRLPDGIGQLKQLSILKVDQNRLCEVTEAIGDCENLSELILTENL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD LMALPRSLGKLTKLTNLNVDRNHLEALPPEIGGCVALSVLSLRDNRLAVLPPELAHTTEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LMALPRSLGKLTKLTNLNVDRNHLEALPPEIGGCVALSVLSLRDNRLAVLPPELAHTTEL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD HVLDVAGNRLQSLPFALTHLNLKALWLAENQAQPMLRFQTEDDARTGEKVLTCYLLPQQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 HVLDVAGNRLQSLPFALTHLNLKALWLAENQAQPMLRFQTEDDARTGEKVLTCYLLPQQP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD PLSLEDAGQQGSLSETWSDAPPSRVSVIQFLEAPIGDEDAEEAAAEKRGLQRRATPHPSE
       : ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 PPSLEDAGQQGSLSETWSDAPPSRVSVIQFLEAPIGDEDAEEAAAEKRGLQRRATPHPSE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD LKVMKRSIEGRRSEACPCQPDSGSPLPAEEEKRLSAESGLSEDSRPSASTVSEAEPEGPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LKVMKRSIEGRRSEACPCQPDSGSPLPAEEEKRLSAESGLSEDSRPSASTVSEAEPEGPS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD AEAQGGSQQEATTAGGEEDAEEDYQEPTVHFAEDALLPGDDREIEEGQPEAPWTLPGGRQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 AEAQGGSQQEATTAGGEEDAEEDYQEPTVHFAEDALLPGDDREIEEGQPEAPWTLPGGRQ
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD RLIRKDTPHYKKHFKISKLPQPEAVVALLQGMQPDGEGPVAPGGWHNGPHAPWAPRAQKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 RLIRKDTPHYKKHFKISKLPQPEAVVALLQGMQPDGEGPVAPGGWHNGPHAPWAPRAQKE
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD EEEEEEGSPQEEEEEEEEENRAEEEEASTEEEDKEGAVVSAPSVKGVSFDQANNLLIEPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 EEEEEEGSPQEEEEEEEEENRAEEEEASTEEEDKEGAVVSAPSVKGVSFDQANNLLIEPA
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD RIEEEELTLTILRQTGGLGISIAGGKGSTPYKGDDEGIFISRVSEEGPAARAGVRVGDKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 RIEEEELTLTILRQTGGLGISIAGGKGSTPYKGDDEGIFISRVSEEGPAARAGVRVGDKL
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD LEVNGVALQGAEHHEAVEALRGAGTAVQMRVWRERMVEPENAVTITPLRPEDDYSPRERR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LEVNGVALQGAEHHEAVEALRGAGTAVQMRVWRERMVEPENAVTITPLRPEDDYSPRERR
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD GGGLRLPLLPPESPGPLRQRHVACLARSERGLGFSIAGGKGSTPYRAGDAGIFVSRIAEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 GGGLRLPLLPPESPGPLRQRHVACLARSERGLGFSIAGGKGSTPYRAGDAGIFVSRIAEG
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD GAAHRAGTLQVGDRVLSINGVDVTEARHDHAVSLLTAASPTIALLLEREAGGPLPPSPLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 GAAHRAGTLQVGDRVLSINGVDVTEARHDHAVSLLTAASPTIALLLEREAGGPLPPSPLP
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD HSSPPTAAVATTSITTATPGVPGLPSLAPSLLAAALEGPYPVEEIRLPRAGGPLGLSIVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 HSSPPTAAVATTSITTATPGVPGLPSLAPSLLAAALEGPYPVEEIRLPRAGGPLGLSIVG
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD GSDHSSHPFGVQEPGVFISKVLPRGLAARSGLRVGDRILAVNGQDVRDATHQEAVSALLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 GSDHSSHPFGVQEPGVFISKVLPRGLAARSGLRVGDRILAVNGQDVRDATHQEAVSALLR
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD PCLELSLLVRRDPAPPGLRELCIQKAPGERLGISIRGGARGHAGNPRDPTDEGIFISKVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 PCLELSLLVRRDPAPPGLRELCIQKAPGERLGISIRGGARGHAGNPRDPTDEGIFISKVS
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KSD PTGAAGRDGRLRVGLRLLEVNQQSLLGLTHGEAVQLLRSVGDTLTVLVCDGFEASTDAAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 PTGAAGRDGRLRVGLRLLEVNQQSLLGLTHGEAVQLLRSVGDTLTVLVCDGFEASTDAAL
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KSD EVSPGVIANPFAAGIGHRNSLESISSIDRELSPEGPGKEKELPGQTLHWGPEATEAAGRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 EVSPGVIANPFAAGIGHRNSLESISSIDRELSPEGPGKEKELPGQTLHWGPEATEAAGRG
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KSD LQPLKLDYRALAAVPSAGSVQRVPSGAAGGKMAESPCSPSGQQPPSPPSPDELPANVKQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LQPLKLDYRALAAVPSAGSVQRVPSGAAGGKMAESPCSPSGQQPPSPPSPDELPANVKQA
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KSD YRAFAAVPTSHPPEDAPAQPPTPGPAASPEQLSFRERQKYFELEVRVPQAEGPPKRVSLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 YRAFAAVPTSHPPEDAPAQPPTPGPAASPEQLSFRERQKYFELEVRVPQAEGPPKRVSLV
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KSD GADDLRKMQEEEARKLQQKRAQMLREAAEAGAEARLALDGETLGEEEQEDEQPPWASPSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 GADDLRKMQEEEARKLQQKRAQMLREAAEAGAEARLALDGETLGEEEQEDEQPPWASPSP
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             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KSD TSRQSPASPPPLGGGAPVRTAKAERRHQERLRVQSPEPPAPERALSPAELRALEAEKRAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 TSRQSPASPPPLGGGAPVRTAKAERRHQERLRVQSPEPPAPERALSPAELRALEAEKRAL
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

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pF1KSD WRAARMKSLEQDALRAQMVLSRSQEGRGTRGPLERLAEAPSPAPTPSPTPVEDLGPQTST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 WRAARMKSLEQDALRAQMVLSRSQEGRGTRGPLERLAEAPSPAPTPSPTPVEDLGPQTST
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

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pF1KSD SPGRLSPDFAEELRSLEPSPSPGPQEEDGEVALVLLGRPSPGAVGPEDVALCSSRRPVRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 SPGRLSPDFAEELRSLEPSPSPGPQEEDGEVALVLLGRPSPGAVGPEDVALCSSRRPVRP
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630
pF1KSD GRRGLGPVPS
       ::::::::::
NP_056 GRRGLGPVPS
             1630

>>NP_874365 (OMIM: 607733) protein scribble homolog isof  (1655 aa)
 initn: 10789 init1: 10351 opt: 10383  Z-score: 4628.8  bits: 869.4 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 10743; 98.4% identity (98.4% similar) in 1655 aa overlap (1-1630:1-1655)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MLKCIPLWRCNRHVESVDKRHCSLQAVPEEIYRYSRSLEELLLDANQLRELPKPFFRLLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_874 MLKCIPLWRCNRHVESVDKRHCSLQAVPEEIYRYSRSLEELLLDANQLRELPKPFFRLLN
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pF1KSD LRKLGLSDNEIQRLPPEVANFMQLVELDVSRNDIPEIPESIKFCKALEIADFSGNPLSRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_874 LRKLGLSDNEIQRLPPEVANFMQLVELDVSRNDIPEIPESIKFCKALEIADFSGNPLSRL
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pF1KSD PDGFTQLRSLAHLALNDVSLQALPGDVGNLANLVTLELRENLLKSLPASLSFLVKLEQLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_874 PDGFTQLRSLAHLALNDVSLQALPGDVGNLANLVTLELRENLLKSLPASLSFLVKLEQLD
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pF1KSD LGGNDLEVLPDTLGALPNLRELWLDRNQLSALPPELGNLRRLVCLDVSENRLEELPAELG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_874 LGGNDLEVLPDTLGALPNLRELWLDRNQLSALPPELGNLRRLVCLDVSENRLEELPAELG
              190       200       210       220       230       240

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pF1KSD GLVLLTDLLLSQNLLRRLPDGIGQLKQLSILKVDQNRLCEVTEAIGDCENLSELILTENL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_874 GLVLLTDLLLSQNLLRRLPDGIGQLKQLSILKVDQNRLCEVTEAIGDCENLSELILTENL
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pF1KSD LMALPRSLGKLTKLTNLNVDRNHLEALPPEIGGCVALSVLSLRDNRLAVLPPELAHTTEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_874 LMALPRSLGKLTKLTNLNVDRNHLEALPPEIGGCVALSVLSLRDNRLAVLPPELAHTTEL
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pF1KSD HVLDVAGNRLQSLPFALTHLNLKALWLAENQAQPMLRFQTEDDARTGEKVLTCYLLPQQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_874 HVLDVAGNRLQSLPFALTHLNLKALWLAENQAQPMLRFQTEDDARTGEKVLTCYLLPQQP
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pF1KSD PLSLEDAGQQGSLSETWSDAPPSRVSVIQFLEAPIGDEDAEEAAAEKRGLQRRATPHPSE
       : ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_874 PPSLEDAGQQGSLSETWSDAPPSRVSVIQFLEAPIGDEDAEEAAAEKRGLQRRATPHPSE
              430       440       450       460       470       480

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pF1KSD LKVMKRSIEGRRSEACPCQPDSGSPLPAEEEKRLSAESGLSEDSRPSASTVSEAEPEGPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_874 LKVMKRSIEGRRSEACPCQPDSGSPLPAEEEKRLSAESGLSEDSRPSASTVSEAEPEGPS
              490       500       510       520       530       540

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pF1KSD AEAQGGSQQEATTAGGEEDAEEDYQEPTVHFAEDALLPGDDREIEEGQPEAPWTLPGGRQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_874 AEAQGGSQQEATTAGGEEDAEEDYQEPTVHFAEDALLPGDDREIEEGQPEAPWTLPGGRQ
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pF1KSD RLIRKDTPHYKKHFKISKLPQPEAVVALLQGMQPDGEGPVAPGGWHNGPHAPWAPRAQKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_874 RLIRKDTPHYKKHFKISKLPQPEAVVALLQGMQPDGEGPVAPGGWHNGPHAPWAPRAQKE
              610       620       630       640       650       660

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pF1KSD EEEEEEGSPQEEEEEEEEENRAEEEEASTEEEDKEGAVVSAPSVKGVSFDQANNLLIEPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_874 EEEEEEGSPQEEEEEEEEENRAEEEEASTEEEDKEGAVVSAPSVKGVSFDQANNLLIEPA
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pF1KSD RIEEEELTLTILRQTGGLGISIAGGKGSTPYKGDDEGIFISRVSEEGPAARAGVRVGDKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_874 RIEEEELTLTILRQTGGLGISIAGGKGSTPYKGDDEGIFISRVSEEGPAARAGVRVGDKL
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pF1KSD LEVNGVALQGAEHHEAVEALRGAGTAVQMRVWRERMVEPENAVTITPLRPEDDYSPRERR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_874 LEVNGVALQGAEHHEAVEALRGAGTAVQMRVWRERMVEPENAVTITPLRPEDDYSPRERR
              790       800       810       820       830       840

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pF1KSD GGGLRLPLLPPESPGPLRQRHVACLARSERGLGFSIAGGKGSTPYRAGDAGIFVSRIAEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_874 GGGLRLPLLPPESPGPLRQRHVACLARSERGLGFSIAGGKGSTPYRAGDAGIFVSRIAEG
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pF1KSD GAAHRAGTLQVGDRVLSINGVDVTEARHDHAVSLLTAASPTIALLLEREAGGPLPPSPLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_874 GAAHRAGTLQVGDRVLSINGVDVTEARHDHAVSLLTAASPTIALLLEREAGGPLPPSPLP
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pF1KSD HSSPPTAAVATTSITTATPGVPGLPSLAPSLLAAALEGPYPVEEIRLPRAGGPLGLSIVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_874 HSSPPTAAVATTSITTATPGVPGLPSLAPSLLAAALEGPYPVEEIRLPRAGGPLGLSIVG
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pF1KSD GSDHSSHPFGVQEPGVFISKVLPRGLAARSGLRVGDRILAVNGQDVRDATHQEAVSALLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_874 GSDHSSHPFGVQEPGVFISKVLPRGLAARSGLRVGDRILAVNGQDVRDATHQEAVSALLR
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pF1KSD PCLELSLLVRRDPAPPGLRELCIQKAPGERLGISIRGGARGHAGNPRDPTDEGIFISKVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_874 PCLELSLLVRRDPAPPGLRELCIQKAPGERLGISIRGGARGHAGNPRDPTDEGIFISKVS
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pF1KSD PTGAAGRDGRLRVGLRLLEVNQQSLLGLTHGEAVQLLRSVGDTLTVLVCDGFEASTDAAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_874 PTGAAGRDGRLRVGLRLLEVNQQSLLGLTHGEAVQLLRSVGDTLTVLVCDGFEASTDAAL
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KSD EVSPGVIANPFAAGIGHRNSLESISSIDRELSPEGPGKEKELPGQTLHWGPEATEAAGRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_874 EVSPGVIANPFAAGIGHRNSLESISSIDRELSPEGPGKEKELPGQTLHWGPEATEAAGRG
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pF1KSD LQPLKLDYRALAAVPSAGSVQRVPSGAAGGKMAESPCSPSGQQPPSPPSPDELPANVKQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_874 LQPLKLDYRALAAVPSAGSVQRVPSGAAGGKMAESPCSPSGQQPPSPPSPDELPANVKQA
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pF1KSD YRAFAAVPTSHPPEDAPAQPPTPGPAASPEQLSFRERQKYFELEVRVPQAEGPPKRVSLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_874 YRAFAAVPTSHPPEDAPAQPPTPGPAASPEQLSFRERQKYFELEVRVPQAEGPPKRVSLV
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KSD GADDLRKMQEEEARKLQQKRAQMLREAAEAGAEARLALDGETLGEEEQEDEQPPWASPSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_874 GADDLRKMQEEEARKLQQKRAQMLREAAEAGAEARLALDGETLGEEEQEDEQPPWASPSP
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KSD TSRQSPASPPPLGGGAPVRTAKAERRHQERLRVQSPEPPAPERALSPAELRALEAEKRAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_874 TSRQSPASPPPLGGGAPVRTAKAERRHQERLRVQSPEPPAPERALSPAELRALEAEKRAL
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KSD WRAARMKSLEQDALRAQMVLSRSQEGRGTRGPLERLAEAPSPAPTPSPTPVEDLGPQTST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_874 WRAARMKSLEQDALRAQMVLSRSQEGRGTRGPLERLAEAPSPAPTPSPTPVEDLGPQTST
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

                                      1570      1580      1590     
pF1KSD SPGRL-------------------------SPDFAEELRSLEPSPSPGPQEEDGEVALVL
       :::::                         ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_874 SPGRLPLSGKKFDYRAFAALPSSRPVYDIQSPDFAEELRSLEPSPSPGPQEEDGEVALVL
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

        1600      1610      1620      1630
pF1KSD LGRPSPGAVGPEDVALCSSRRPVRPGRRGLGPVPS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_874 LGRPSPGAVGPEDVALCSSRRPVRPGRRGLGPVPS
             1630      1640      1650     

>>NP_060684 (OMIM: 608195) leucine-rich repeat-containin  (524 aa)
 initn: 2516 init1: 1993 opt: 2108  Z-score: 959.9  bits: 188.9 E(85289): 1e-46
Smith-Waterman score: 2145; 64.5% identity (85.3% similar) in 504 aa overlap (1-494:1-499)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MLKCIPLWRCNRHVESVDKRHCSLQAVPEEIYRYSRSLEELLLDANQLRELPKPFFRLLN
       :..:::::::::::::.:::::::  ::::::::.:::::::::::::::::. ::.:..
NP_060 MFHCIPLWRCNRHVESIDKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEELLLDANQLRELPEQFFQLVK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD LRKLGLSDNEIQRLPPEVANFMQLVELDVSRNDIPEIPESIKFCKALEIADFSGNPLSRL
       :::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::::.:::::..::::::::.::
NP_060 LRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEIPEIPESISFCKALQVADFSGNPLTRL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD PDGFTQLRSLAHLALNDVSLQALPGDVGNLANLVTLELRENLLKSLPASLSFLVKLEQLD
       :..: .:..:. :..::.:::.:: ..::: ::..::::::::  :: ::. : .::.::
NP_060 PESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTYLPDSLTQLRRLEELD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD LGGNDLEVLPDTLGALPNLRELWLDRNQLSALPPELGNLRRLVCLDVSENRLEELPAELG
       ::.:..  ::...::: .:..:::: :::: :: :.:::. :.::::::::::.:: :..
NP_060 LGNNEIYNLPESIGALLHLKDLWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCLDVSENRLERLPEEIS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD GLVLLTDLLLSQNLLRRLPDGIGQLKQLSILKVDQNRLCEVTEAIGDCENLSELILTENL
       ::. ::::..:::::. .:::::.::.::::::::::: .. ::.:.::.:.::.:::: 
NP_060 GLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVDQNRLTQLPEAVGECESLTELVLTENQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD LMALPRSLGKLTKLTNLNVDRNHLEALPPEIGGCVALSVLSLRDNRLAVLPPELAHTTEL
       :..::.:.::: ::.:::.:::.: .:: ::::: .:.:. .:::::. .: :....:::
NP_060 LLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGCCSLTVFCVRDNRLTRIPAEVSQATEL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD HVLDVAGNRLQSLPFALTHLNLKALWLAENQAQPMLRFQTEDDARTGEKVLTCYLLPQQP
       ::::::::::  ::..:: :.::::::..::.::.: :::. :  ::::.::: :::: :
NP_060 HVLDVAGNRLLHLPLSLTALKLKALWLSDNQSQPLLTFQTDTDYTTGEKILTCVLLPQLP
              370       380       390       400       410       420

                430               440       450       460       470
pF1KSD --PLSLEDAGQQGSL--------SETWSDAPPSRVSVIQFLEAPIGDEDAEEAAAEKRGL
         :   :.  . :.:        .:.:..   .:::.:.:.:    ::  ::   : : :
NP_060 SEPTCQENLPRCGALENLVNDVSDEAWNERAVNRVSAIRFVE----DEKDEEDN-ETRTL
              430       440       450       460           470      

              480       490       500       510       520       530
pF1KSD QRRATPHPSELKVMKRSIEGRRSEACPCQPDSGSPLPAEEEKRLSAESGLSEDSRPSAST
        :::::::.::: ::...:. :..                                    
NP_060 LRRATPHPGELKHMKKTVENLRNDMNAAKGLDSNKNEVNHAIDRVTTSV           
         480       490       500       510       520               

>>XP_011513028 (OMIM: 608195) PREDICTED: leucine-rich re  (524 aa)
 initn: 2516 init1: 1993 opt: 2108  Z-score: 959.9  bits: 188.9 E(85289): 1e-46
Smith-Waterman score: 2145; 64.5% identity (85.3% similar) in 504 aa overlap (1-494:1-499)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MLKCIPLWRCNRHVESVDKRHCSLQAVPEEIYRYSRSLEELLLDANQLRELPKPFFRLLN
       :..:::::::::::::.:::::::  ::::::::.:::::::::::::::::. ::.:..
XP_011 MFHCIPLWRCNRHVESIDKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEELLLDANQLRELPEQFFQLVK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD LRKLGLSDNEIQRLPPEVANFMQLVELDVSRNDIPEIPESIKFCKALEIADFSGNPLSRL
       :::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::::.:::::..::::::::.::
XP_011 LRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEIPEIPESISFCKALQVADFSGNPLTRL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD PDGFTQLRSLAHLALNDVSLQALPGDVGNLANLVTLELRENLLKSLPASLSFLVKLEQLD
       :..: .:..:. :..::.:::.:: ..::: ::..::::::::  :: ::. : .::.::
XP_011 PESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTYLPDSLTQLRRLEELD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD LGGNDLEVLPDTLGALPNLRELWLDRNQLSALPPELGNLRRLVCLDVSENRLEELPAELG
       ::.:..  ::...::: .:..:::: :::: :: :.:::. :.::::::::::.:: :..
XP_011 LGNNEIYNLPESIGALLHLKDLWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCLDVSENRLERLPEEIS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD GLVLLTDLLLSQNLLRRLPDGIGQLKQLSILKVDQNRLCEVTEAIGDCENLSELILTENL
       ::. ::::..:::::. .:::::.::.::::::::::: .. ::.:.::.:.::.:::: 
XP_011 GLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVDQNRLTQLPEAVGECESLTELVLTENQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD LMALPRSLGKLTKLTNLNVDRNHLEALPPEIGGCVALSVLSLRDNRLAVLPPELAHTTEL
       :..::.:.::: ::.:::.:::.: .:: ::::: .:.:. .:::::. .: :....:::
XP_011 LLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGCCSLTVFCVRDNRLTRIPAEVSQATEL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD HVLDVAGNRLQSLPFALTHLNLKALWLAENQAQPMLRFQTEDDARTGEKVLTCYLLPQQP
       ::::::::::  ::..:: :.::::::..::.::.: :::. :  ::::.::: :::: :
XP_011 HVLDVAGNRLLHLPLSLTALKLKALWLSDNQSQPLLTFQTDTDYTTGEKILTCVLLPQLP
              370       380       390       400       410       420

                430               440       450       460       470
pF1KSD --PLSLEDAGQQGSL--------SETWSDAPPSRVSVIQFLEAPIGDEDAEEAAAEKRGL
         :   :.  . :.:        .:.:..   .:::.:.:.:    ::  ::   : : :
XP_011 SEPTCQENLPRCGALENLVNDVSDEAWNERAVNRVSAIRFVE----DEKDEEDN-ETRTL
              430       440       450       460           470      

              480       490       500       510       520       530
pF1KSD QRRATPHPSELKVMKRSIEGRRSEACPCQPDSGSPLPAEEEKRLSAESGLSEDSRPSAST
        :::::::.::: ::...:. :..                                    
XP_011 LRRATPHPGELKHMKKTVENLRNDMNAAKGLDSNKNEVNHAIDRVTTSV           
         480       490       500       510       520               

>>XP_016866486 (OMIM: 608195) PREDICTED: leucine-rich re  (331 aa)
 initn: 1983 init1: 1592 opt: 1600  Z-score: 736.8  bits: 147.0 E(85289): 2.7e-34
Smith-Waterman score: 1600; 70.9% identity (91.5% similar) in 330 aa overlap (1-330:1-330)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MLKCIPLWRCNRHVESVDKRHCSLQAVPEEIYRYSRSLEELLLDANQLRELPKPFFRLLN
       :..:::::::::::::.:::::::  ::::::::.:::::::::::::::::. ::.:..
XP_016 MFHCIPLWRCNRHVESIDKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEELLLDANQLRELPEQFFQLVK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD LRKLGLSDNEIQRLPPEVANFMQLVELDVSRNDIPEIPESIKFCKALEIADFSGNPLSRL
       :::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::::.:::::..::::::::.::
XP_016 LRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEIPEIPESISFCKALQVADFSGNPLTRL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD PDGFTQLRSLAHLALNDVSLQALPGDVGNLANLVTLELRENLLKSLPASLSFLVKLEQLD
       :..: .:..:. :..::.:::.:: ..::: ::..::::::::  :: ::. : .::.::
XP_016 PESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTYLPDSLTQLRRLEELD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD LGGNDLEVLPDTLGALPNLRELWLDRNQLSALPPELGNLRRLVCLDVSENRLEELPAELG
       ::.:..  ::...::: .:..:::: :::: :: :.:::. :.::::::::::.:: :..
XP_016 LGNNEIYNLPESIGALLHLKDLWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCLDVSENRLERLPEEIS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD GLVLLTDLLLSQNLLRRLPDGIGQLKQLSILKVDQNRLCEVTEAIGDCENLSELILTENL
       ::. ::::..:::::. .:::::.::.::::::::::: .. ::.:.::.:.::.:::: 
XP_016 GLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVDQNRLTQLPEAVGECESLTELVLTENQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD LMALPRSLGKLTKLTNLNVDRNHLEALPPEIGGCVALSVLSLRDNRLAVLPPELAHTTEL
       :..::.:.::: ::.:::.:::.: .:: :                              
XP_016 LLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEQ                             
              310       320       330                              

>>XP_011513029 (OMIM: 608195) PREDICTED: leucine-rich re  (465 aa)
 initn: 1924 init1: 1444 opt: 1557  Z-score: 715.8  bits: 143.6 E(85289): 3.9e-33
Smith-Waterman score: 1594; 58.1% identity (82.0% similar) in 427 aa overlap (78-494:24-440)

        50        60        70        80        90       100       
pF1KSD LRELPKPFFRLLNLRKLGLSDNEIQRLPPEVANFMQLVELDVSRNDIPEIPESIKFCKAL
                                     ..::..: .     ..::::::::.:::::
XP_011        MSHLYSTSGHKVFMGGEEKGELHLGNFYELCQ-----QEIPEIPESISFCKAL
                      10        20        30             40        

       110       120       130       140       150       160       
pF1KSD EIADFSGNPLSRLPDGFTQLRSLAHLALNDVSLQALPGDVGNLANLVTLELRENLLKSLP
       ..::::::::.:::..: .:..:. :..::.:::.:: ..::: ::..::::::::  ::
XP_011 QVADFSGNPLTRLPESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTYLP
       50        60        70        80        90       100        

       170       180       190       200       210       220       
pF1KSD ASLSFLVKLEQLDLGGNDLEVLPDTLGALPNLRELWLDRNQLSALPPELGNLRRLVCLDV
        ::. : .::.::::.:..  ::...::: .:..:::: :::: :: :.:::. :.::::
XP_011 DSLTQLRRLEELDLGNNEIYNLPESIGALLHLKDLWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCLDV
      110       120       130       140       150       160        

       230       240       250       260       270       280       
pF1KSD SENRLEELPAELGGLVLLTDLLLSQNLLRRLPDGIGQLKQLSILKVDQNRLCEVTEAIGD
       ::::::.:: :..::. ::::..:::::. .:::::.::.::::::::::: .. ::.:.
XP_011 SENRLERLPEEISGLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVDQNRLTQLPEAVGE
      170       180       190       200       210       220        

       290       300       310       320       330       340       
pF1KSD CENLSELILTENLLMALPRSLGKLTKLTNLNVDRNHLEALPPEIGGCVALSVLSLRDNRL
       ::.:.::.:::: :..::.:.::: ::.:::.:::.: .:: ::::: .:.:. .:::::
XP_011 CESLTELVLTENQLLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGCCSLTVFCVRDNRL
      230       240       250       260       270       280        

       350       360       370       380       390       400       
pF1KSD AVLPPELAHTTELHVLDVAGNRLQSLPFALTHLNLKALWLAENQAQPMLRFQTEDDARTG
       . .: :....:::::::::::::  ::..:: :.::::::..::.::.: :::. :  ::
XP_011 TRIPAEVSQATELHVLDVAGNRLLHLPLSLTALKLKALWLSDNQSQPLLTFQTDTDYTTG
      290       300       310       320       330       340        

       410       420         430               440       450       
pF1KSD EKVLTCYLLPQQP--PLSLEDAGQQGSL--------SETWSDAPPSRVSVIQFLEAPIGD
       ::.::: :::: :  :   :.  . :.:        .:.:..   .:::.:.:.:    :
XP_011 EKILTCVLLPQLPSEPTCQENLPRCGALENLVNDVSDEAWNERAVNRVSAIRFVE----D
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NP_001 SVEELDCSFNEVEALPSSIGQLTNLRTFAADHNYLQQLPPEIGSWKNITVLFLHSNKLET
     300       310       320       330       340       350         

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pF1KSD LPPELAHTTELHVLDVAGNRLQSLPFALTHLN-LKALWLAENQAQPMLRFQTEDDARTGE
       :: :..   .:.:.... :::..:::..:.:. : :.::..::..:.. .: : :..: .
NP_001 LPEEMGDMQKLKVINLSDNRLKNLPFSFTKLQQLTAMWLSDNQSKPLIPLQKETDSETQK
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pF1KSD KVLTCYLLPQQPPLSLEDA---GQQGSLSET-WSDAPPSRVSVIQFLEAPIGDEDAEEAA
        ::: :..::::    ::.   ... :.. . : .   .:..:   .:    :.: .:: 
NP_001 MVLTNYMFPQQP--RTEDVMFISDNESFNPSLWEEQRKQRAQVA--FECD-EDKDEREAP
     420       430         440       450       460          470    

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pF1KSD AEKRGLQRRATPHPSELKVMKRSIEG--RRSEACPCQPDSGSPL-PAEEEKRLSAESGL-
        .. .:.:  ::.:.::: : ....   .: .    . :::  : : :... .. . :. 
NP_001 PREGNLKRYPTPYPDELKNMVKTVQTIVHRLKDEETNEDSGRDLKPHEDQQDINKDVGVK
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pF1KSD -SEDSRPSASTVSEAEPEGPSAEAQGGSQQEATTAGG------EEDAEEDYQEPTVH---
        ::..    : :.: :    .  .:  :. ::  . :      .  : :. .. . :   
NP_001 TSESTTTVKSKVDEREKYMIGNSVQKISEPEAEISPGSLPVTANMKASENLKHIVNHDDV
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pF1KSD FAEDALLPGDDR-EIEEGQPEAPWTLPGGRQRLIRKDTPHYKKHFKISKLPQPEAVVALL
       : :.  : .:.. .. : .:                                        
NP_001 FEESEELSSDEEMKMAEMRPPLIETSINQPKVVALSNNKKDDTKETDSLSDEVTHNSNQN
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>>NP_061165 (OMIM: 606944) erbin isoform 2 [Homo sapiens  (1371 aa)
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pF1KSD        MLKCIPLWRCNRH----VESVDKRHCSLQAVPEEIYRYSRSLEELLLDANQLR
               .. .:  :: :     : ..:  ::::. ::.::. . ..:::: :::::..
NP_061 MTTKRSLFVRLVPC-RCLRGEEETVTTLDYSHCSLEQVPKEIFTFEKTLEELYLDANQIE
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pF1KSD ELPKPFFRLLNLRKLGLSDNEIQRLPPEVANFMQLVELDVSRNDIPEIPESIKFCKALEI
       :::: .:   .:.::.: ::..  ::  .::...: :::::.: : :.::.:: ::.: :
NP_061 ELPKQLFNCQSLHKLSLPDNDLTTLPASIANLINLRELDVSKNGIQEFPENIKNCKVLTI
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pF1KSD ADFSGNPLSRLPDGFTQLRSLAHLALNDVSLQALPGDVGNLANLVTLELRENLLKSLPAS
       .. : ::.:.:::::.:: .:..: :::. :. ::.. : :..:  :::::: :: :: .
NP_061 VEASVNPISKLPDGFSQLLNLTQLYLNDAFLEFLPANFGRLTKLQILELRENQLKMLPKT
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       .. :..::.::::.:..  .:..:  : .:.:.:.: :.:. .:  .:.:..:. ::::.
NP_061 MNRLTQLERLDLGSNEFTEVPEVLEQLSGLKEFWMDANRLTFIPGFIGSLKQLTYLDVSK
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pF1KSD NRLEELPAELGGLVLLTDLLLSQNLLRRLPDGIGQLKQLSILKVDQNRLCEVTEAIGDCE
       : .: .   ..    : :::::.: :..::. ::.::... ::.:.:.:  . ..::   
NP_061 NNIEMVEEGISTCENLQDLLLSSNSLQQLPETIGSLKNITTLKIDENQLMYLPDSIGGLI
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pF1KSD NLSELILTENLLMALPRSLGKLTKLTNLNVDRNHLEALPPEIGGCVALSVLSLRDNRLAV
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       : :.  : .:.. .. : .:                                        
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1630 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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