Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0147
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0147, 1630 aa
  1>>>pF1KSDA0147 1630 - 1630 aa - 1630 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.2509+/-0.00107; mu= -5.6552+/- 0.065
 mean_var=441.3760+/-87.935, 0's: 0 Z-trim(115.8): 133  B-trim: 0 in 0/54
 Lambda= 0.061048
 statistics sampled from 16289 (16422) to 16289 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.772), E-opt: 0.2 (0.504), width:  16
 Scan time:  6.610

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS6411.1 SCRIB gene_id:23513|Hs108|chr8          (1630) 10803 967.1       0
CCDS6412.1 SCRIB gene_id:23513|Hs108|chr8          (1655) 10383 930.1       0
CCDS4953.2 LRRC1 gene_id:55227|Hs108|chr6          ( 524) 2108 200.9 9.1e-51
CCDS34172.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5         (1302) 1327 132.5 9.2e-30
CCDS58954.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5         (1346) 1327 132.5 9.4e-30
CCDS3990.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5          (1371) 1327 132.5 9.5e-30
CCDS58953.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5         (1412) 1327 132.5 9.7e-30
CCDS58952.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5         (1419) 1327 132.5 9.8e-30
CCDS58951.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5         (1367) 1322 132.0 1.3e-29
CCDS81341.1 LRRC7 gene_id:57554|Hs108|chr1         (1495) 1303 130.4 4.4e-29
CCDS645.1 LRRC7 gene_id:57554|Hs108|chr1           (1537) 1303 130.4 4.5e-29


>>CCDS6411.1 SCRIB gene_id:23513|Hs108|chr8               (1630 aa)
 initn: 10803 init1: 10803 opt: 10803  Z-score: 5157.0  bits: 967.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 10803; 99.9% identity (99.9% similar) in 1630 aa overlap (1-1630:1-1630)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MLKCIPLWRCNRHVESVDKRHCSLQAVPEEIYRYSRSLEELLLDANQLRELPKPFFRLLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MLKCIPLWRCNRHVESVDKRHCSLQAVPEEIYRYSRSLEELLLDANQLRELPKPFFRLLN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD LRKLGLSDNEIQRLPPEVANFMQLVELDVSRNDIPEIPESIKFCKALEIADFSGNPLSRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LRKLGLSDNEIQRLPPEVANFMQLVELDVSRNDIPEIPESIKFCKALEIADFSGNPLSRL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD PDGFTQLRSLAHLALNDVSLQALPGDVGNLANLVTLELRENLLKSLPASLSFLVKLEQLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PDGFTQLRSLAHLALNDVSLQALPGDVGNLANLVTLELRENLLKSLPASLSFLVKLEQLD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD LGGNDLEVLPDTLGALPNLRELWLDRNQLSALPPELGNLRRLVCLDVSENRLEELPAELG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LGGNDLEVLPDTLGALPNLRELWLDRNQLSALPPELGNLRRLVCLDVSENRLEELPAELG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD GLVLLTDLLLSQNLLRRLPDGIGQLKQLSILKVDQNRLCEVTEAIGDCENLSELILTENL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GLVLLTDLLLSQNLLRRLPDGIGQLKQLSILKVDQNRLCEVTEAIGDCENLSELILTENL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD LMALPRSLGKLTKLTNLNVDRNHLEALPPEIGGCVALSVLSLRDNRLAVLPPELAHTTEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LMALPRSLGKLTKLTNLNVDRNHLEALPPEIGGCVALSVLSLRDNRLAVLPPELAHTTEL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD HVLDVAGNRLQSLPFALTHLNLKALWLAENQAQPMLRFQTEDDARTGEKVLTCYLLPQQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 HVLDVAGNRLQSLPFALTHLNLKALWLAENQAQPMLRFQTEDDARTGEKVLTCYLLPQQP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD PLSLEDAGQQGSLSETWSDAPPSRVSVIQFLEAPIGDEDAEEAAAEKRGLQRRATPHPSE
       : ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PPSLEDAGQQGSLSETWSDAPPSRVSVIQFLEAPIGDEDAEEAAAEKRGLQRRATPHPSE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD LKVMKRSIEGRRSEACPCQPDSGSPLPAEEEKRLSAESGLSEDSRPSASTVSEAEPEGPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LKVMKRSIEGRRSEACPCQPDSGSPLPAEEEKRLSAESGLSEDSRPSASTVSEAEPEGPS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD AEAQGGSQQEATTAGGEEDAEEDYQEPTVHFAEDALLPGDDREIEEGQPEAPWTLPGGRQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 AEAQGGSQQEATTAGGEEDAEEDYQEPTVHFAEDALLPGDDREIEEGQPEAPWTLPGGRQ
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD RLIRKDTPHYKKHFKISKLPQPEAVVALLQGMQPDGEGPVAPGGWHNGPHAPWAPRAQKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 RLIRKDTPHYKKHFKISKLPQPEAVVALLQGMQPDGEGPVAPGGWHNGPHAPWAPRAQKE
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD EEEEEEGSPQEEEEEEEEENRAEEEEASTEEEDKEGAVVSAPSVKGVSFDQANNLLIEPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 EEEEEEGSPQEEEEEEEEENRAEEEEASTEEEDKEGAVVSAPSVKGVSFDQANNLLIEPA
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD RIEEEELTLTILRQTGGLGISIAGGKGSTPYKGDDEGIFISRVSEEGPAARAGVRVGDKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 RIEEEELTLTILRQTGGLGISIAGGKGSTPYKGDDEGIFISRVSEEGPAARAGVRVGDKL
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD LEVNGVALQGAEHHEAVEALRGAGTAVQMRVWRERMVEPENAVTITPLRPEDDYSPRERR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LEVNGVALQGAEHHEAVEALRGAGTAVQMRVWRERMVEPENAVTITPLRPEDDYSPRERR
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD GGGLRLPLLPPESPGPLRQRHVACLARSERGLGFSIAGGKGSTPYRAGDAGIFVSRIAEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GGGLRLPLLPPESPGPLRQRHVACLARSERGLGFSIAGGKGSTPYRAGDAGIFVSRIAEG
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD GAAHRAGTLQVGDRVLSINGVDVTEARHDHAVSLLTAASPTIALLLEREAGGPLPPSPLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GAAHRAGTLQVGDRVLSINGVDVTEARHDHAVSLLTAASPTIALLLEREAGGPLPPSPLP
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD HSSPPTAAVATTSITTATPGVPGLPSLAPSLLAAALEGPYPVEEIRLPRAGGPLGLSIVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 HSSPPTAAVATTSITTATPGVPGLPSLAPSLLAAALEGPYPVEEIRLPRAGGPLGLSIVG
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD GSDHSSHPFGVQEPGVFISKVLPRGLAARSGLRVGDRILAVNGQDVRDATHQEAVSALLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GSDHSSHPFGVQEPGVFISKVLPRGLAARSGLRVGDRILAVNGQDVRDATHQEAVSALLR
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD PCLELSLLVRRDPAPPGLRELCIQKAPGERLGISIRGGARGHAGNPRDPTDEGIFISKVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PCLELSLLVRRDPAPPGLRELCIQKAPGERLGISIRGGARGHAGNPRDPTDEGIFISKVS
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KSD PTGAAGRDGRLRVGLRLLEVNQQSLLGLTHGEAVQLLRSVGDTLTVLVCDGFEASTDAAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PTGAAGRDGRLRVGLRLLEVNQQSLLGLTHGEAVQLLRSVGDTLTVLVCDGFEASTDAAL
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KSD EVSPGVIANPFAAGIGHRNSLESISSIDRELSPEGPGKEKELPGQTLHWGPEATEAAGRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 EVSPGVIANPFAAGIGHRNSLESISSIDRELSPEGPGKEKELPGQTLHWGPEATEAAGRG
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KSD LQPLKLDYRALAAVPSAGSVQRVPSGAAGGKMAESPCSPSGQQPPSPPSPDELPANVKQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LQPLKLDYRALAAVPSAGSVQRVPSGAAGGKMAESPCSPSGQQPPSPPSPDELPANVKQA
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KSD YRAFAAVPTSHPPEDAPAQPPTPGPAASPEQLSFRERQKYFELEVRVPQAEGPPKRVSLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 YRAFAAVPTSHPPEDAPAQPPTPGPAASPEQLSFRERQKYFELEVRVPQAEGPPKRVSLV
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KSD GADDLRKMQEEEARKLQQKRAQMLREAAEAGAEARLALDGETLGEEEQEDEQPPWASPSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GADDLRKMQEEEARKLQQKRAQMLREAAEAGAEARLALDGETLGEEEQEDEQPPWASPSP
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KSD TSRQSPASPPPLGGGAPVRTAKAERRHQERLRVQSPEPPAPERALSPAELRALEAEKRAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 TSRQSPASPPPLGGGAPVRTAKAERRHQERLRVQSPEPPAPERALSPAELRALEAEKRAL
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KSD WRAARMKSLEQDALRAQMVLSRSQEGRGTRGPLERLAEAPSPAPTPSPTPVEDLGPQTST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 WRAARMKSLEQDALRAQMVLSRSQEGRGTRGPLERLAEAPSPAPTPSPTPVEDLGPQTST
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KSD SPGRLSPDFAEELRSLEPSPSPGPQEEDGEVALVLLGRPSPGAVGPEDVALCSSRRPVRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 SPGRLSPDFAEELRSLEPSPSPGPQEEDGEVALVLLGRPSPGAVGPEDVALCSSRRPVRP
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630
pF1KSD GRRGLGPVPS
       ::::::::::
CCDS64 GRRGLGPVPS
             1630

>>CCDS6412.1 SCRIB gene_id:23513|Hs108|chr8               (1655 aa)
 initn: 10789 init1: 10351 opt: 10383  Z-score: 4957.0  bits: 930.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 10743; 98.4% identity (98.4% similar) in 1655 aa overlap (1-1630:1-1655)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MLKCIPLWRCNRHVESVDKRHCSLQAVPEEIYRYSRSLEELLLDANQLRELPKPFFRLLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MLKCIPLWRCNRHVESVDKRHCSLQAVPEEIYRYSRSLEELLLDANQLRELPKPFFRLLN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD LRKLGLSDNEIQRLPPEVANFMQLVELDVSRNDIPEIPESIKFCKALEIADFSGNPLSRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LRKLGLSDNEIQRLPPEVANFMQLVELDVSRNDIPEIPESIKFCKALEIADFSGNPLSRL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD PDGFTQLRSLAHLALNDVSLQALPGDVGNLANLVTLELRENLLKSLPASLSFLVKLEQLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PDGFTQLRSLAHLALNDVSLQALPGDVGNLANLVTLELRENLLKSLPASLSFLVKLEQLD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD LGGNDLEVLPDTLGALPNLRELWLDRNQLSALPPELGNLRRLVCLDVSENRLEELPAELG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LGGNDLEVLPDTLGALPNLRELWLDRNQLSALPPELGNLRRLVCLDVSENRLEELPAELG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD GLVLLTDLLLSQNLLRRLPDGIGQLKQLSILKVDQNRLCEVTEAIGDCENLSELILTENL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GLVLLTDLLLSQNLLRRLPDGIGQLKQLSILKVDQNRLCEVTEAIGDCENLSELILTENL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD LMALPRSLGKLTKLTNLNVDRNHLEALPPEIGGCVALSVLSLRDNRLAVLPPELAHTTEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LMALPRSLGKLTKLTNLNVDRNHLEALPPEIGGCVALSVLSLRDNRLAVLPPELAHTTEL
              310       320       330       340       350       360

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pF1KSD HVLDVAGNRLQSLPFALTHLNLKALWLAENQAQPMLRFQTEDDARTGEKVLTCYLLPQQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 HVLDVAGNRLQSLPFALTHLNLKALWLAENQAQPMLRFQTEDDARTGEKVLTCYLLPQQP
              370       380       390       400       410       420

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pF1KSD PLSLEDAGQQGSLSETWSDAPPSRVSVIQFLEAPIGDEDAEEAAAEKRGLQRRATPHPSE
       : ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PPSLEDAGQQGSLSETWSDAPPSRVSVIQFLEAPIGDEDAEEAAAEKRGLQRRATPHPSE
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pF1KSD LKVMKRSIEGRRSEACPCQPDSGSPLPAEEEKRLSAESGLSEDSRPSASTVSEAEPEGPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LKVMKRSIEGRRSEACPCQPDSGSPLPAEEEKRLSAESGLSEDSRPSASTVSEAEPEGPS
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pF1KSD AEAQGGSQQEATTAGGEEDAEEDYQEPTVHFAEDALLPGDDREIEEGQPEAPWTLPGGRQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 AEAQGGSQQEATTAGGEEDAEEDYQEPTVHFAEDALLPGDDREIEEGQPEAPWTLPGGRQ
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pF1KSD RLIRKDTPHYKKHFKISKLPQPEAVVALLQGMQPDGEGPVAPGGWHNGPHAPWAPRAQKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 RLIRKDTPHYKKHFKISKLPQPEAVVALLQGMQPDGEGPVAPGGWHNGPHAPWAPRAQKE
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pF1KSD EEEEEEGSPQEEEEEEEEENRAEEEEASTEEEDKEGAVVSAPSVKGVSFDQANNLLIEPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 EEEEEEGSPQEEEEEEEEENRAEEEEASTEEEDKEGAVVSAPSVKGVSFDQANNLLIEPA
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pF1KSD RIEEEELTLTILRQTGGLGISIAGGKGSTPYKGDDEGIFISRVSEEGPAARAGVRVGDKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 RIEEEELTLTILRQTGGLGISIAGGKGSTPYKGDDEGIFISRVSEEGPAARAGVRVGDKL
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pF1KSD LEVNGVALQGAEHHEAVEALRGAGTAVQMRVWRERMVEPENAVTITPLRPEDDYSPRERR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LEVNGVALQGAEHHEAVEALRGAGTAVQMRVWRERMVEPENAVTITPLRPEDDYSPRERR
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pF1KSD GGGLRLPLLPPESPGPLRQRHVACLARSERGLGFSIAGGKGSTPYRAGDAGIFVSRIAEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GGGLRLPLLPPESPGPLRQRHVACLARSERGLGFSIAGGKGSTPYRAGDAGIFVSRIAEG
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pF1KSD GAAHRAGTLQVGDRVLSINGVDVTEARHDHAVSLLTAASPTIALLLEREAGGPLPPSPLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GAAHRAGTLQVGDRVLSINGVDVTEARHDHAVSLLTAASPTIALLLEREAGGPLPPSPLP
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pF1KSD HSSPPTAAVATTSITTATPGVPGLPSLAPSLLAAALEGPYPVEEIRLPRAGGPLGLSIVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 HSSPPTAAVATTSITTATPGVPGLPSLAPSLLAAALEGPYPVEEIRLPRAGGPLGLSIVG
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pF1KSD GSDHSSHPFGVQEPGVFISKVLPRGLAARSGLRVGDRILAVNGQDVRDATHQEAVSALLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GSDHSSHPFGVQEPGVFISKVLPRGLAARSGLRVGDRILAVNGQDVRDATHQEAVSALLR
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pF1KSD PCLELSLLVRRDPAPPGLRELCIQKAPGERLGISIRGGARGHAGNPRDPTDEGIFISKVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PCLELSLLVRRDPAPPGLRELCIQKAPGERLGISIRGGARGHAGNPRDPTDEGIFISKVS
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pF1KSD PTGAAGRDGRLRVGLRLLEVNQQSLLGLTHGEAVQLLRSVGDTLTVLVCDGFEASTDAAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PTGAAGRDGRLRVGLRLLEVNQQSLLGLTHGEAVQLLRSVGDTLTVLVCDGFEASTDAAL
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pF1KSD EVSPGVIANPFAAGIGHRNSLESISSIDRELSPEGPGKEKELPGQTLHWGPEATEAAGRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 EVSPGVIANPFAAGIGHRNSLESISSIDRELSPEGPGKEKELPGQTLHWGPEATEAAGRG
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

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pF1KSD LQPLKLDYRALAAVPSAGSVQRVPSGAAGGKMAESPCSPSGQQPPSPPSPDELPANVKQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LQPLKLDYRALAAVPSAGSVQRVPSGAAGGKMAESPCSPSGQQPPSPPSPDELPANVKQA
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KSD YRAFAAVPTSHPPEDAPAQPPTPGPAASPEQLSFRERQKYFELEVRVPQAEGPPKRVSLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 YRAFAAVPTSHPPEDAPAQPPTPGPAASPEQLSFRERQKYFELEVRVPQAEGPPKRVSLV
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             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KSD GADDLRKMQEEEARKLQQKRAQMLREAAEAGAEARLALDGETLGEEEQEDEQPPWASPSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GADDLRKMQEEEARKLQQKRAQMLREAAEAGAEARLALDGETLGEEEQEDEQPPWASPSP
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

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pF1KSD TSRQSPASPPPLGGGAPVRTAKAERRHQERLRVQSPEPPAPERALSPAELRALEAEKRAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 TSRQSPASPPPLGGGAPVRTAKAERRHQERLRVQSPEPPAPERALSPAELRALEAEKRAL
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KSD WRAARMKSLEQDALRAQMVLSRSQEGRGTRGPLERLAEAPSPAPTPSPTPVEDLGPQTST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 WRAARMKSLEQDALRAQMVLSRSQEGRGTRGPLERLAEAPSPAPTPSPTPVEDLGPQTST
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

                                      1570      1580      1590     
pF1KSD SPGRL-------------------------SPDFAEELRSLEPSPSPGPQEEDGEVALVL
       :::::                         ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 SPGRLPLSGKKFDYRAFAALPSSRPVYDIQSPDFAEELRSLEPSPSPGPQEEDGEVALVL
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

        1600      1610      1620      1630
pF1KSD LGRPSPGAVGPEDVALCSSRRPVRPGRRGLGPVPS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LGRPSPGAVGPEDVALCSSRRPVRPGRRGLGPVPS
             1630      1640      1650     

>>CCDS4953.2 LRRC1 gene_id:55227|Hs108|chr6               (524 aa)
 initn: 2516 init1: 1993 opt: 2108  Z-score: 1024.9  bits: 200.9 E(32554): 9.1e-51
Smith-Waterman score: 2145; 64.5% identity (85.3% similar) in 504 aa overlap (1-494:1-499)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MLKCIPLWRCNRHVESVDKRHCSLQAVPEEIYRYSRSLEELLLDANQLRELPKPFFRLLN
       :..:::::::::::::.:::::::  ::::::::.:::::::::::::::::. ::.:..
CCDS49 MFHCIPLWRCNRHVESIDKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEELLLDANQLRELPEQFFQLVK
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pF1KSD LRKLGLSDNEIQRLPPEVANFMQLVELDVSRNDIPEIPESIKFCKALEIADFSGNPLSRL
       :::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::::.:::::..::::::::.::
CCDS49 LRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEIPEIPESISFCKALQVADFSGNPLTRL
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pF1KSD PDGFTQLRSLAHLALNDVSLQALPGDVGNLANLVTLELRENLLKSLPASLSFLVKLEQLD
       :..: .:..:. :..::.:::.:: ..::: ::..::::::::  :: ::. : .::.::
CCDS49 PESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTYLPDSLTQLRRLEELD
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pF1KSD LGGNDLEVLPDTLGALPNLRELWLDRNQLSALPPELGNLRRLVCLDVSENRLEELPAELG
       ::.:..  ::...::: .:..:::: :::: :: :.:::. :.::::::::::.:: :..
CCDS49 LGNNEIYNLPESIGALLHLKDLWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCLDVSENRLERLPEEIS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD GLVLLTDLLLSQNLLRRLPDGIGQLKQLSILKVDQNRLCEVTEAIGDCENLSELILTENL
       ::. ::::..:::::. .:::::.::.::::::::::: .. ::.:.::.:.::.:::: 
CCDS49 GLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVDQNRLTQLPEAVGECESLTELVLTENQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD LMALPRSLGKLTKLTNLNVDRNHLEALPPEIGGCVALSVLSLRDNRLAVLPPELAHTTEL
       :..::.:.::: ::.:::.:::.: .:: ::::: .:.:. .:::::. .: :....:::
CCDS49 LLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGCCSLTVFCVRDNRLTRIPAEVSQATEL
              310       320       330       340       350       360

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pF1KSD HVLDVAGNRLQSLPFALTHLNLKALWLAENQAQPMLRFQTEDDARTGEKVLTCYLLPQQP
       ::::::::::  ::..:: :.::::::..::.::.: :::. :  ::::.::: :::: :
CCDS49 HVLDVAGNRLLHLPLSLTALKLKALWLSDNQSQPLLTFQTDTDYTTGEKILTCVLLPQLP
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                430               440       450       460       470
pF1KSD --PLSLEDAGQQGSL--------SETWSDAPPSRVSVIQFLEAPIGDEDAEEAAAEKRGL
         :   :.  . :.:        .:.:..   .:::.:.:.:    ::  ::   : : :
CCDS49 SEPTCQENLPRCGALENLVNDVSDEAWNERAVNRVSAIRFVE----DEKDEEDN-ETRTL
              430       440       450       460           470      

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pF1KSD QRRATPHPSELKVMKRSIEGRRSEACPCQPDSGSPLPAEEEKRLSAESGLSEDSRPSAST
        :::::::.::: ::...:. :..                                    
CCDS49 LRRATPHPGELKHMKKTVENLRNDMNAAKGLDSNKNEVNHAIDRVTTSV           
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>>CCDS34172.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5              (1302 aa)
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               .. .:  :: :     : ..:  ::::. ::.::. . ..:::: :::::..
CCDS34 MTTKRSLFVRLVPC-RCLRGEEETVTTLDYSHCSLEQVPKEIFTFEKTLEELYLDANQIE
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pF1KSD ELPKPFFRLLNLRKLGLSDNEIQRLPPEVANFMQLVELDVSRNDIPEIPESIKFCKALEI
       :::: .:   .:.::.: ::..  ::  .::...: :::::.: : :.::.:: ::.: :
CCDS34 ELPKQLFNCQSLHKLSLPDNDLTTLPASIANLINLRELDVSKNGIQEFPENIKNCKVLTI
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       .. : ::.:.:::::.:: .:..: :::. :. ::.. : :..:  :::::: :: :: .
CCDS34 VEASVNPISKLPDGFSQLLNLTQLYLNDAFLEFLPANFGRLTKLQILELRENQLKMLPKT
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       .. :..::.::::.:..  .:..:  : .:.:.:.: :.:. .:  .:.:..:. ::::.
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       : .: .   ..    : :::::.: :..::. ::.::... ::.:.:.:  . ..::   
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       .. ::  . : . ::: :.:.::.: .. .:.:.:. ::::::.   ..:: :..:.: .
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       :: :..   .:.:.... :::..:::..:.:. : :.::..::..:.. .: : :..: .
CCDS34 LPEEMGDMQKLKVINLSDNRLKNLPFSFTKLQQLTAMWLSDNQSKPLIPLQKETDSETQK
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        ::: :..::::    ::.   ... :.. . : .   .:..:   .:    :.: .:: 
CCDS34 MVLTNYMFPQQP--RTEDVMFISDNESFNPSLWEEQRKQRAQVA--FECD-EDKDEREAP
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        .. .:.:  ::.:.::: : ....   .: .    . :::  : : :... .. . :. 
CCDS34 PREGNLKRYPTPYPDELKNMVKTVQTIVHRLKDEETNEDSGRDLKPHEDQQDINKDVGVK
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pF1KSD -SEDSRPSASTVSEAEPEGPSAEAQGGSQQEATTAGG------EEDAEEDYQEPTVH---
        ::..    : :.: :    .  .:  :. ::  . :      .  : :. .. . :   
CCDS34 TSESTTTVKSKVDEREKYMIGNSVQKISEPEAEISPGSLPVTANMKASENLKHIVNHDDV
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       : :.  : .:.. .. : .:                                        
CCDS34 FEESEELSSDEEMKMAEMRPPLIETSINQPKVVALSNNKKDDTKETDSLSDEVTHNSNQN
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>>CCDS58954.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5              (1346 aa)
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Smith-Waterman score: 1330; 39.2% identity (69.3% similar) in 612 aa overlap (2-589:9-614)

                      10            20        30        40         
pF1KSD        MLKCIPLWRCNRH----VESVDKRHCSLQAVPEEIYRYSRSLEELLLDANQLR
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CCDS58 MTTKRSLFVRLVPC-RCLRGEEETVTTLDYSHCSLEQVPKEIFTFEKTLEELYLDANQIE
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pF1KSD ELPKPFFRLLNLRKLGLSDNEIQRLPPEVANFMQLVELDVSRNDIPEIPESIKFCKALEI
       :::: .:   .:.::.: ::..  ::  .::...: :::::.: : :.::.:: ::.: :
CCDS58 ELPKQLFNCQSLHKLSLPDNDLTTLPASIANLINLRELDVSKNGIQEFPENIKNCKVLTI
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pF1KSD ADFSGNPLSRLPDGFTQLRSLAHLALNDVSLQALPGDVGNLANLVTLELRENLLKSLPAS
       .. : ::.:.:::::.:: .:..: :::. :. ::.. : :..:  :::::: :: :: .
CCDS58 VEASVNPISKLPDGFSQLLNLTQLYLNDAFLEFLPANFGRLTKLQILELRENQLKMLPKT
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       .. :..::.::::.:..  .:..:  : .:.:.:.: :.:. .:  .:.:..:. ::::.
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       :: :..   .:.:.... :::..:::..:.:. : :.::..::..:.. .: : :..: .
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pF1KSD KVLTCYLLPQQPPLSLEDA---GQQGSLSET-WSDAPPSRVSVIQFLEAPIGDEDAEEAA
        ::: :..::::    ::.   ... :.. . : .   .:..:   .:    :.: .:: 
CCDS58 MVLTNYMFPQQP--RTEDVMFISDNESFNPSLWEEQRKQRAQVA--FECD-EDKDEREAP
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pF1KSD AEKRGLQRRATPHPSELKVMKRSIEG--RRSEACPCQPDSGSPL-PAEEEKRLSAESGL-
        .. .:.:  ::.:.::: : ....   .: .    . :::  : : :... .. . :. 
CCDS58 PREGNLKRYPTPYPDELKNMVKTVQTIVHRLKDEETNEDSGRDLKPHEDQQDINKDVGVK
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pF1KSD -SEDSRPSASTVSEAEPEGPSAEAQGGSQQEATTAGG------EEDAEEDYQEPTVH---
        ::..    : :.: :    .  .:  :. ::  . :      .  : :. .. . :   
CCDS58 TSESTTTVKSKVDEREKYMIGNSVQKISEPEAEISPGSLPVTANMKASENLKHIVNHDDV
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pF1KSD FAEDALLPGDDR-EIEEGQPEAPWTLPGGRQRLIRKDTPHYKKHFKISKLPQPEAVVALL
       : :.  : .:.. .. : .:                                        
CCDS58 FEESEELSSDEEMKMAEMRPPLIETSINQPKVVALSNNKKDDTKETDSLSDEVTHNSNQN
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>>CCDS3990.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5               (1371 aa)
 initn: 1127 init1: 1127 opt: 1327  Z-score: 647.5  bits: 132.5 E(32554): 9.5e-30
Smith-Waterman score: 1330; 39.2% identity (69.3% similar) in 612 aa overlap (2-589:9-614)

                      10            20        30        40         
pF1KSD        MLKCIPLWRCNRH----VESVDKRHCSLQAVPEEIYRYSRSLEELLLDANQLR
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CCDS39 MTTKRSLFVRLVPC-RCLRGEEETVTTLDYSHCSLEQVPKEIFTFEKTLEELYLDANQIE
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pF1KSD ELPKPFFRLLNLRKLGLSDNEIQRLPPEVANFMQLVELDVSRNDIPEIPESIKFCKALEI
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CCDS39 ELPKQLFNCQSLHKLSLPDNDLTTLPASIANLINLRELDVSKNGIQEFPENIKNCKVLTI
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pF1KSD ADFSGNPLSRLPDGFTQLRSLAHLALNDVSLQALPGDVGNLANLVTLELRENLLKSLPAS
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CCDS39 VEASVNPISKLPDGFSQLLNLTQLYLNDAFLEFLPANFGRLTKLQILELRENQLKMLPKT
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pF1KSD LSFLVKLEQLDLGGNDLEVLPDTLGALPNLRELWLDRNQLSALPPELGNLRRLVCLDVSE
       .. :..::.::::.:..  .:..:  : .:.:.:.: :.:. .:  .:.:..:. ::::.
CCDS39 MNRLTQLERLDLGSNEFTEVPEVLEQLSGLKEFWMDANRLTFIPGFIGSLKQLTYLDVSK
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pF1KSD NRLEELPAELGGLVLLTDLLLSQNLLRRLPDGIGQLKQLSILKVDQNRLCEVTEAIGDCE
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CCDS39 NNIEMVEEGISTCENLQDLLLSSNSLQQLPETIGSLKNITTLKIDENQLMYLPDSIGGLI
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pF1KSD NLSELILTENLLMALPRSLGKLTKLTNLNVDRNHLEALPPEIGGCVALSVLSLRDNRLAV
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pF1KSD LPPELAHTTELHVLDVAGNRLQSLPFALTHLN-LKALWLAENQAQPMLRFQTEDDARTGE
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CCDS39 LPEEMGDMQKLKVINLSDNRLKNLPFSFTKLQQLTAMWLSDNQSKPLIPLQKETDSETQK
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CCDS39 MVLTNYMFPQQP--RTEDVMFISDNESFNPSLWEEQRKQRAQVA--FECD-EDKDEREAP
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pF1KSD FAEDALLPGDDR-EIEEGQPEAPWTLPGGRQRLIRKDTPHYKKHFKISKLPQPEAVVALL
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CCDS58 VEASVNPISKLPDGFSQLLNLTQLYLNDAFLEFLPANFGRLTKLQILELRENQLKMLPKT
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pF1KSD LSFLVKLEQLDLGGNDLEVLPDTLGALPNLRELWLDRNQLSALPPELGNLRRLVCLDVSE
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pF1KSD NRLEELPAELGGLVLLTDLLLSQNLLRRLPDGIGQLKQLSILKVDQNRLCEVTEAIGDCE
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       :: :..   .:.:.... :::..:::..:.:. : :.::..::..:.. .: : :..: .
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        ::: :..::::    ::.   ... :.. . : .   .:..:   .:    :.: .:: 
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        .. .:.:  ::.:.::: : ....   .: .    . :::  : : :... .. ..  :
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