Result of FASTA (ccds) for pF1KB7014
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7014, 1914 aa
  1>>>pF1KB7014 1914 - 1914 aa - 1914 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0238+/-0.000994; mu= 21.5736+/- 0.060
 mean_var=89.8199+/-17.614, 0's: 0 Z-trim(106.4): 65  B-trim: 14 in 1/49
 Lambda= 0.135328
 statistics sampled from 8893 (8955) to 8893 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.622), E-opt: 0.2 (0.275), width:  16
 Scan time:  6.010

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS33847.2 PLXNA1 gene_id:5361|Hs108|chr3         (1896) 12756 2501.8       0
CCDS14752.1 PLXNA3 gene_id:55558|Hs108|chrX        (1871) 8581 1686.7       0
CCDS31013.1 PLXNA2 gene_id:5362|Hs108|chr1         (1894) 8278 1627.6       0
CCDS43646.1 PLXNA4 gene_id:91584|Hs108|chr7        (1894) 8230 1618.2       0
CCDS5826.1 PLXNA4 gene_id:91584|Hs108|chr7         ( 522) 1586 320.7 9.4e-87
CCDS43647.1 PLXNA4 gene_id:91584|Hs108|chr7        ( 492) 1585 320.5   1e-86
CCDS33854.1 PLXND1 gene_id:23129|Hs108|chr3        (1925) 1566 317.1 4.1e-85
CCDS14729.1 PLXNB3 gene_id:5365|Hs108|chrX         (1909) 1531 310.3 4.6e-83
CCDS55536.1 PLXNB3 gene_id:5365|Hs108|chrX         (1932) 1531 310.3 4.7e-83
CCDS43035.1 PLXNB2 gene_id:23654|Hs108|chr22       (1838) 1282 261.7 1.9e-68
CCDS2765.1 PLXNB1 gene_id:5364|Hs108|chr3          (2135) 1243 254.1 4.3e-66
CCDS9049.1 PLXNC1 gene_id:10154|Hs108|chr12        (1568)  739 155.6 1.4e-36
CCDS43636.1 MET gene_id:4233|Hs108|chr7            (1390)  418 92.9 9.2e-18
CCDS58833.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3          (1351)  342 78.1 2.6e-13
CCDS2807.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3           (1400)  328 75.4 1.8e-12
CCDS82777.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3          (1294)  325 74.7 2.5e-12
CCDS47689.1 MET gene_id:4233|Hs108|chr7            (1408)  311 72.0 1.8e-11
CCDS45347.1 SEMA4B gene_id:10509|Hs108|chr15       ( 837)  305 70.7 2.7e-11


>>CCDS33847.2 PLXNA1 gene_id:5361|Hs108|chr3              (1896 aa)
 initn: 12756 init1: 12756 opt: 12756  Z-score: 13448.8  bits: 2501.8 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 12756; 100.0% identity (100.0% similar) in 1896 aa overlap (19-1914:1-1896)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MMLTPAGPEHRGPRPQPAMPLPPRSLQVLLLLLLLLLLLPGMWAEAGLPRAGGGSQPPFR
                         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33                   MPLPPRSLQVLLLLLLLLLLLPGMWAEAGLPRAGGGSQPPFR
                                 10        20        30        40  

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 TFSASDWGLTHLVVHEQTGEVYVGAVNRIYKLSGNLTLLRAHVTGPVEDNEKCYPPPSVQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TFSASDWGLTHLVVHEQTGEVYVGAVNRIYKLSGNLTLLRAHVTGPVEDNEKCYPPPSVQ
             50        60        70        80        90       100  

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 SCPHGLGSTDNVNKLLLLDYAANRLLACGSASQGICQFLRLDDLFKLGEPHHRKEHYLSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SCPHGLGSTDNVNKLLLLDYAANRLLACGSASQGICQFLRLDDLFKLGEPHHRKEHYLSS
            110       120       130       140       150       160  

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 VQEAGSMAGVLIAGPPGQGQAKLFVGTPIDGKSEYFPTLSSRRLMANEEDADMFGFVYQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VQEAGSMAGVLIAGPPGQGQAKLFVGTPIDGKSEYFPTLSSRRLMANEEDADMFGFVYQD
            170       180       190       200       210       220  

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 EFVSSQLKIPSDTLSKFPAFDIYYVYSFRSEQFVYYLTLQLDTQLTSPDAAGEHFFTSKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EFVSSQLKIPSDTLSKFPAFDIYYVYSFRSEQFVYYLTLQLDTQLTSPDAAGEHFFTSKI
            230       240       250       260       270       280  

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 VRLCVDDPKFYSYVEFPIGCEQAGVEYRLVQDAYLSRPGRALAHQLGLAEDEDVLFTVFA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VRLCVDDPKFYSYVEFPIGCEQAGVEYRLVQDAYLSRPGRALAHQLGLAEDEDVLFTVFA
            290       300       310       320       330       340  

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 QGQKNRVKPPKESALCLFTLRAIKEKIKERIQSCYRGEGKLSLPWLLNKELGCINSPLQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QGQKNRVKPPKESALCLFTLRAIKEKIKERIQSCYRGEGKLSLPWLLNKELGCINSPLQI
            350       360       370       380       390       400  

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 DDDFCGQDFNQPLGGTVTIEGTPLFVDKDDGLTAVAAYDYRGRTVVFAGTRSGRIRKILV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DDDFCGQDFNQPLGGTVTIEGTPLFVDKDDGLTAVAAYDYRGRTVVFAGTRSGRIRKILV
            410       420       430       440       450       460  

              490       500       510       520       530       540
pF1KB7 DLSNPGGRPALAYESVVAQEGSPILRDLVLSPNHQYLYAMTEKQVTRVPVESCVQYTSCE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DLSNPGGRPALAYESVVAQEGSPILRDLVLSPNHQYLYAMTEKQVTRVPVESCVQYTSCE
            470       480       490       500       510       520  

              550       560       570       580       590       600
pF1KB7 LCLGSRDPHCGWCVLHSICSRRDACERADEPQRFAADLLQCVQLTVQPRNVSVTMSQVPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LCLGSRDPHCGWCVLHSICSRRDACERADEPQRFAADLLQCVQLTVQPRNVSVTMSQVPL
            530       540       550       560       570       580  

              610       620       630       640       650       660
pF1KB7 VLQAWNVPDLSAGVNCSFEDFTESESVLEDGRIHCRSPSAREVAPITRGQGDQRVVKLYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VLQAWNVPDLSAGVNCSFEDFTESESVLEDGRIHCRSPSAREVAPITRGQGDQRVVKLYL
            590       600       610       620       630       640  

              670       680       690       700       710       720
pF1KB7 KSKETGKKFASVDFVFYNCSVHQSCLSCVNGSFPCHWCKYRHVCTHNVADCAFLEGRVNV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KSKETGKKFASVDFVFYNCSVHQSCLSCVNGSFPCHWCKYRHVCTHNVADCAFLEGRVNV
            650       660       670       680       690       700  

              730       740       750       760       770       780
pF1KB7 SEDCPQILPSTQIYVPVGVVKPITLAARNLPQPQSGQRGYECLFHIPGSPARVTALRFNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SEDCPQILPSTQIYVPVGVVKPITLAARNLPQPQSGQRGYECLFHIPGSPARVTALRFNS
            710       720       730       740       750       760  

              790       800       810       820       830       840
pF1KB7 SSLQCQNSSYSYEGNDVSDLPVNLSVVWNGNFVIDNPQNIQAHLYKCPALRESCGLCLKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SSLQCQNSSYSYEGNDVSDLPVNLSVVWNGNFVIDNPQNIQAHLYKCPALRESCGLCLKA
            770       780       790       800       810       820  

              850       860       870       880       890       900
pF1KB7 DPRFECGWCVAERRCSLRHHCAADTPASWMHARHGSSRCTDPKILKLSPETGPRQGGTRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DPRFECGWCVAERRCSLRHHCAADTPASWMHARHGSSRCTDPKILKLSPETGPRQGGTRL
            830       840       850       860       870       880  

              910       920       930       940       950       960
pF1KB7 TITGENLGLRFEDVRLGVRVGKVLCSPVESEYISAEQIVCEIGDASSVRAHDALVEVCVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TITGENLGLRFEDVRLGVRVGKVLCSPVESEYISAEQIVCEIGDASSVRAHDALVEVCVR
            890       900       910       920       930       940  

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB7 DCSPHYRALSPKRFTFVTPTFYRVSPSRGPLSGGTWIGIEGSHLNAGSDVAVSVGGRPCS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DCSPHYRALSPKRFTFVTPTFYRVSPSRGPLSGGTWIGIEGSHLNAGSDVAVSVGGRPCS
            950       960       970       980       990      1000  

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB7 FSWRNSREIRCLTPPGQSPGSAPIIININRAQLTNPEVKYNYTEDPTILRIDPEWSINSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FSWRNSREIRCLTPPGQSPGSAPIIININRAQLTNPEVKYNYTEDPTILRIDPEWSINSG
           1010      1020      1030      1040      1050      1060  

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB7 GTLLTVTGTNLATVREPRIRAKYGGIERENGCLVYNDTTMVCRAPSVANPVRSPPELGER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GTLLTVTGTNLATVREPRIRAKYGGIERENGCLVYNDTTMVCRAPSVANPVRSPPELGER
           1070      1080      1090      1100      1110      1120  

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KB7 PDELGFVMDNVRSLLVLNSTSFLYYPDPVLEPLSPTGLLELKPSSPLILKGRNLLPPAPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PDELGFVMDNVRSLLVLNSTSFLYYPDPVLEPLSPTGLLELKPSSPLILKGRNLLPPAPG
           1130      1140      1150      1160      1170      1180  

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KB7 NSRLNYTVLIGSTPCTLTVSETQLLCEAPNLTGQHKVTVRAGGFEFSPGTLQVYSDSLLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NSRLNYTVLIGSTPCTLTVSETQLLCEAPNLTGQHKVTVRAGGFEFSPGTLQVYSDSLLT
           1190      1200      1210      1220      1230      1240  

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KB7 LPAIVGIGGGGGLLLLVIVAVLIAYKRKSRDADRTLKRLQLQMDNLESRVALECKEAFAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LPAIVGIGGGGGLLLLVIVAVLIAYKRKSRDADRTLKRLQLQMDNLESRVALECKEAFAE
           1250      1260      1270      1280      1290      1300  

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KB7 LQTDIHELTNDLDGAGIPFLDYRTYAMRVLFPGIEDHPVLKEMEVQANVEKSLTLFGQLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LQTDIHELTNDLDGAGIPFLDYRTYAMRVLFPGIEDHPVLKEMEVQANVEKSLTLFGQLL
           1310      1320      1330      1340      1350      1360  

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KB7 TKKHFLLTFIRTLEAQRSFSMRDRGNVASLIMTALQGEMEYATGVLKQLLSDLIEKNLES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TKKHFLLTFIRTLEAQRSFSMRDRGNVASLIMTALQGEMEYATGVLKQLLSDLIEKNLES
           1370      1380      1390      1400      1410      1420  

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KB7 KNHPKLLLRRTESVAEKMLTNWFTFLLYKFLKECAGEPLFMLYCAIKQQMEKGPIDAITG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KNHPKLLLRRTESVAEKMLTNWFTFLLYKFLKECAGEPLFMLYCAIKQQMEKGPIDAITG
           1430      1440      1450      1460      1470      1480  

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KB7 EARYSLSEDKLIRQQIDYKTLTLNCVNPENENAPEVPVKGLDCDTVTQAKEKLLDAAYKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EARYSLSEDKLIRQQIDYKTLTLNCVNPENENAPEVPVKGLDCDTVTQAKEKLLDAAYKG
           1490      1500      1510      1520      1530      1540  

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KB7 VPYSQRPKAADMDLEWRQGRMARIILQDEDVTTKIDNDWKRLNTLAHYQVTDGSSVALVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VPYSQRPKAADMDLEWRQGRMARIILQDEDVTTKIDNDWKRLNTLAHYQVTDGSSVALVP
           1550      1560      1570      1580      1590      1600  

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KB7 KQTSAYNISNSSTFTKSLSRYESMLRTASSPDSLRSRTPMITPDLESGTKLWHLVKNHDH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KQTSAYNISNSSTFTKSLSRYESMLRTASSPDSLRSRTPMITPDLESGTKLWHLVKNHDH
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CCDS14 PEGCPEILPSGDLLIPVGVMQPLTLRAKNLPQPQSGQKNYECVVRVQGRQQRVPAVRFNS
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CCDS14 SSVQCQNASYSYEGDEHGDTELDFSVVWDGDFPIDKPPSFRALLYKCWAQRPSCGLCLKA
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CCDS14 DPRFNCGWCISEHRCQLRTHCPAPK-TNWMHLSQKGTRCSHPRITQIHPLVGPKEGGTRV
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CCDS14 TIVGENLGLLSREV--GLRVAGVRCNSIPAEYISAERIVCEMEESLVPSPPPGPVELCVG
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CCDS14 FVRRDAKAIVCISPLSTLGPSQAPITLAIDRANISSPGLIYTYTQDPTVTRLEPTWSIIN
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CCDS14 LHSRAFVLTFIHTLEAQSSFSMRDRGTVASLTMVALQSRLDYATGLLKQLLADLIEKNLE
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CCDS14 GEARYSLSEDKLIRQQIDYKTLTLHCVCPENEGSAQVPVKVLNCDSITQAKDKLLDTVYK
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CCDS14 GIPYSQRPKAEDMDLEWRQGRMTRIILQDEDVTTKIECDWKRLNSLAHYQVTDGSLVALV
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CCDS14 PKQVSAYNMANSFTFTRSLSRYESLLRTASSPDSLRSRAPMITPDQETGTKLWHLVKNHD
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CCDS31 RLCIGECKPEFMTKSHQQYTFVNPSVLSLNPIRGPESGGTMVTITGHYLGAGSSVAVYLG
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CCDS31 NQTCEFYGRSMSEIVCVSPPSSNGLGPVPVSVSVDRAHV-DSNLQFEYIDDPRVQRIEPE
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CCDS31 SDRSVVALVPKQTSSYNIPASASISRTSISRYDSSFRYTGSPDSLRSRAPMITPDLESGV
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CCDS31 CLSVVAQTFMDSCSTSEHRLGKDSPSNKLLYAKDIPSYKSWVERYYADIAKLPAISDQDM
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CCDS31 NAYLAEQSRLHAVEFNMLSALNEIYSYVSKYSEELIGALEQDEQARRQRLAYKVEQLINA
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    1910    
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       :.. :
CCDS31 MSIES
    1890    

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CCDS43 TVFSKGQKRKMKSLDESALCIFILKQINDRIKERLQSCYRGEGTLDLAWLKVKDIPCSSA
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CCDS43 QPCLFHRRSPSYIVCNTTSSDEVLEMKVSVQVDRAKI-HQDLVFQYVEDPTIVRIEPEWS
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CCDS43 IVSGNTPIAVWGTHLDLIQNPQIRAKHGGKEHINICEVLNATEMTCQAPALALGPDHQSD
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CCDS43 LTERPEEFGFILDNVQSLLILNKTNFTYYPNPVFEAFGPSGILELKPGTPIILKGKNLIP
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CCDS43 PVAGGNVKLNYTVLVGEKPCTVTVSDVQLLCESPNLIGRHKVMARVGGMEYSPGMVYIAP
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CCDS43 KGPIDAITGEARYSLSEDKLIRQQIDYKTLVLSCVSPDNANSPEVPVKILNCDTITQVKE
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CCDS43 KILDAIFKNVPCSHRPKAADMDLEWRQGSGARMILQDEDITTKIENDWKRLNTLAHYQVP
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CCDS43 DGSVVALVSKQVTAYNAVNNSTVSRTSASKYENMIRYTGSPDSLRSRTPMITPDLESGVK
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pF1KB7 LAIKYMFDFLDEQADKHQIHDADVRHTWKSNCLPLRFWVNVIKNPQFVFDIHKNSITDAC
       ::::::::::::::::: :::  :::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS43 LAIKYMFDFLDEQADKHGIHDPHVRHTWKSNCLPLRFWVNMIKNPQFVFDIHKNSITDAC
             1720      1730      1740      1750      1760      1770

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pF1KB7 LSVVAQTFMDSCSTSEHKLGKDSPSNKLLYAKDIPNYKSWVERYYADIAKMPAISDQDMS
       :::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::.::::::.::.::::::::::.
CCDS43 LSVVAQTFMDSCSTSEHRLGKDSPSNKLLYAKDIPSYKNWVERYYSDIGKMPAISDQDMN
             1780      1790      1800      1810      1820      1830

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pF1KB7 AYLAEQSRLHLSQFNSMSALHEIYSYITKYKDEILAALEKDEQARRQRLRSKLEQVVDTM
       ::::::::.:...::.:::: ::.::. ::..:::. :..:.:  .:.:  :::::.  :
CCDS43 AYLAEQSRMHMNEFNTMSALSEIFSYVGKYSEEILGPLDHDDQCGKQKLAYKLEQVITLM
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pF1KB7 ALSS
       .:.:
CCDS43 SLDS
           

>>CCDS5826.1 PLXNA4 gene_id:91584|Hs108|chr7              (522 aa)
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Smith-Waterman score: 1586; 49.6% identity (75.0% similar) in 512 aa overlap (33-533:11-513)

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                                     ::  ::. :: . . : :  .    .:  :
CCDS58                     MKAMPWNWTCLLSHLLMVGMGSSTLLTRQPAPLSQKQRSF
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        :: .    :..:::: :.::..:.::::::::::..: .: .: ::: ::: :::::  
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pF1KB7 VQSCPHGLGSTDNVNKLLLLDYAANRLLACGSASQGICQFLRLDDLFKLGEPHHRKEHYL
       ::.: . : .:.::::.::.::  :::.::::  ::::..:::.::::::::.:.:::::
CCDS58 VQTCNEPLTTTNNVNKMLLIDYKENRLIACGSLYQGICKLLRLEDLFKLGEPYHKKEHYL
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pF1KB7 SSVQEAGSMAGVLIAGPPGQGQAKLFVGTPIDGKSEYFPTLSSRRLMANEEDADMFGFVY
       :.:.:.::. ::...   .. . :::..: .::: :::::.:::.:  : :   ::..:.
CCDS58 SGVNESGSVFGVIVS--YSNLDDKLFIATAVDGKPEYFPTISSRKLTKNSEADGMFAYVF
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       .::::.:..::::::.. .: :::::::.: : .:::.::::   ...:: ..   :. .
CCDS58 HDEFVASMIKIPSDTFTIIPDFDIYYVYGFSSGNFVYFLTLQ--PEMVSPPGSTTKEQVY
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pF1KB7 TSKIVRLCVDDPKFYSYVEFPIGCEQAGVEYRLVQDAYLSRPGRALAHQLGLAEDEDVLF
       :::.:::: .:  : :::: :::::..::::::.: ::::. : .:.. ::.  :.:.::
CCDS58 TSKLVRLCKEDTAFNSYVEVPIGCERSGVEYRLLQAAYLSKAGAVLGRTLGVHPDDDLLF
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       :::..::: ..:   :::::.: :. :...::::.:::::::: :.: ::  :.. : ..
CCDS58 TVFSKGQKRKMKSLDESALCIFILKQINDRIKERLQSCYRGEGTLDLAWLKVKDIPCSSA
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pF1KB7 PLQIDDDFCGQDFNQPLGGTVTIEGTPLFVDKDDGLTAVAAYDYRGRTVVFAGTRSGRIR
        : :::.::: :.: ::: .  ..: :.:..  : .:.: :: :......:.::.::...
CCDS58 LLTIDDNFCGLDMNAPLGVSDMVRGIPVFTEDRDRMTSVIAYVYKNHSLAFVGTKSGKLK
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pF1KB7 KILVDLSNPGGRPALAYESVVAQEGSPILRDLVLSPNHQ--YLYAMTEKQVT--RV-PVE
       : .    . : . ... :  .. ::.:   ... . .    ::   ..: ..  :: :. 
CCDS58 KSF----GTGPQGGITQE-WIGVEGDPPGANIASQEQMLCVYLQCSSHKAISDQRVQPLL
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pF1KB7 SCVQYTSCELCLGSRDPHCGWCVLHSICSRRDACERADEPQRFAADLLQCVQLTVQPRNV
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CCDS58 CCFLNVPGNSS                                                 
             520                                                   

>>CCDS43647.1 PLXNA4 gene_id:91584|Hs108|chr7             (492 aa)
 initn: 1575 init1: 1020 opt: 1585  Z-score: 1670.3  bits: 320.5 E(32554): 1e-86
Smith-Waterman score: 1585; 53.5% identity (78.3% similar) in 452 aa overlap (33-478:11-458)

             10        20        30        40        50            
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CCDS43                     MKAMPWNWTCLLSHLLMVGMGSSTLLTRQPAPLSQKQRSF
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pF1KB7 RTFSASDW-GLTHLVVHEQTGEVYVGAVNRIYKLSGNLTLLRAHVTGPVEDNEKCYPPPS
        :: .    :..:::: :.::..:.::::::::::..: .: .: ::: ::: :::::  
CCDS43 VTFRGEPAEGFNHLVVDERTGHIYLGAVNRIYKLSSDLKVLVTHETGPDEDNPKCYPPRI
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pF1KB7 VQSCPHGLGSTDNVNKLLLLDYAANRLLACGSASQGICQFLRLDDLFKLGEPHHRKEHYL
       ::.: . : .:.::::.::.::  :::.::::  ::::..:::.::::::::.:.:::::
CCDS43 VQTCNEPLTTTNNVNKMLLIDYKENRLIACGSLYQGICKLLRLEDLFKLGEPYHKKEHYL
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pF1KB7 SSVQEAGSMAGVLIAGPPGQGQAKLFVGTPIDGKSEYFPTLSSRRLMANEEDADMFGFVY
       :.:.:.::. ::...   .. . :::..: .::: :::::.:::.:  : :   ::..:.
CCDS43 SGVNESGSVFGVIVS--YSNLDDKLFIATAVDGKPEYFPTISSRKLTKNSEADGMFAYVF
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pF1KB7 QDEFVSSQLKIPSDTLSKFPAFDIYYVYSFRSEQFVYYLTLQLDTQLTSPDAAG--EHFF
       .::::.:..::::::.. .: :::::::.: : .:::.::::   ...:: ..   :. .
CCDS43 HDEFVASMIKIPSDTFTIIPDFDIYYVYGFSSGNFVYFLTLQ--PEMVSPPGSTTKEQVY
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pF1KB7 TSKIVRLCVDDPKFYSYVEFPIGCEQAGVEYRLVQDAYLSRPGRALAHQLGLAEDEDVLF
       :::.:::: .:  : :::: :::::..::::::.: ::::. : .:.. ::.  :.:.::
CCDS43 TSKLVRLCKEDTAFNSYVEVPIGCERSGVEYRLLQAAYLSKAGAVLGRTLGVHPDDDLLF
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pF1KB7 TVFAQGQKNRVKPPKESALCLFTLRAIKEKIKERIQSCYRGEGKLSLPWLLNKELGCINS
       :::..::: ..:   :::::.: :. :...::::.:::::::: :.: ::  :.. : ..
CCDS43 TVFSKGQKRKMKSLDESALCIFILKQINDRIKERLQSCYRGEGTLDLAWLKVKDIPCSSA
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pF1KB7 PLQIDDDFCGQDFNQPLGGTVTIEGTPLFVDKDDGLTAVAAYDYRGRTVVFAGTRSGRIR
        : :::.::: :.: ::: .  ..: :.:..  : .:.: :: :......:.::.::...
CCDS43 LLTIDDNFCGLDMNAPLGVSDMVRGIPVFTEDRDRMTSVIAYVYKNHSLAFVGTKSGKLK
        400       410       420       430       440       450      

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pF1KB7 KILVDLSNPGGRPALAYESVVAQEGSPILRDLVLSPNHQYLYAMTEKQVTRVPVESCVQY
       :.                                                          
CCDS43 KMPGTSLCPTLELQTGPRSHRATVTLELLFSSCSSN                        
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>>CCDS33854.1 PLXND1 gene_id:23129|Hs108|chr3             (1925 aa)
 initn: 2310 init1: 734 opt: 1566  Z-score: 1641.6  bits: 317.1 E(32554): 4.1e-85
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                   10        20        30        40        50      
pF1KB7     MMLTPAGPEHRGPRPQPAMPLPPRSLQVLLLLLLLLLLLPGMWAEAGLPRAGGGSQ
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CCDS33 MAPRAAGGAPLSARAAAASPPPFQTPPRC-PVPLLLLLLL----------GAARA--GAL
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pF1KB7 PPFRTFSASDWGLTHLVVHEQTGEVYVGAVNRIYKLSG-NLTLLRAHVTGPVEDNEKCYP
          : :  :    .....   .: ::..::::.:.::: ::.:    ..::: :.  :. 
CCDS33 EIQRRFP-SPTPTNNFALDGAAGTVYLAAVNRLYQLSGANLSLEAEAAVGPVPDSPLCHA
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pF1KB7 PPSVQ-SCPHGLGSTDNVNKLLLLDYAANRLLACGSASQGICQFLRLDDL------FKLG
       :   : :: :    ::: ::.: :: . . ...:::  ::.::. :  ..      :  .
CCDS33 PQLPQASCEHPRRLTDNYNKILQLDPGQGLVVVCGSIYQGFCQLRRRGNISAVAVRFPPA
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pF1KB7 EPHHRKEHYLSSV------QEAGSMAGVLIAGPPGQGQAKLFVGTPIDGK-SEYFP---T
        :  .    . :.      .  .: .:...    : : ..:.::.   :  : .::   .
CCDS33 APPAEPVTVFPSMLNVAANHPNASTVGLVLPPAAGAGGSRLLVGATYTGYGSSFFPRNRS
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pF1KB7 LSSRRLMANEEDA----DMFGFVYQDEFVSSQLKIPSDTLSKFPA-----FDIYYVYSFR
       : ..:.  . : :    :  : . .  . . .:.  .:.. :.         . .: .: 
CCDS33 LEDHRFENTPEIAIRSLDTRGDLAK--LFTFDLNPSDDNILKIKQGAKEQHKLGFVSAFL
        230       240       250         260       270       280    

     270            280       290       300             310        
pF1KB7 SEQ-----FVYYLTLQLDTQLTSPDAAGEHFFTSKIVRLCV------DDPKFY-SYVEFP
         .        :  : :...  . :  ..    : ..:.:.      :  :.  ::... 
CCDS33 HPSDPPPGAQSYAYLALNSEARAGDKESQA--RSLLARICLPHGAGGDAKKLTESYIQLG
          290       300       310         320       330       340  

       320       330       340       350       360       370       
pF1KB7 IGCEQAGVEYRLVQDAYLSRPGRALAHQLGLAEDEDVLFTVFAQGQKNRVKPPKESALCL
       . :  ::   :          :   .. ...   .. ::.:: . : . .     .::: 
CCDS33 LQC--AGGAGR----------GDLYSRLVSVFPARERLFAVFERPQGSPAARAAPAALCA
              350                 360       370       380       390

       380       390       400       410              420          
pF1KB7 FTLRAIKEKIKERIQSCYRGEGKLSLPWLLNKELG----C---INSPLQIDDDFCGQ-DF
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CCDS33 FRFADVRAAIRAARTACFVEPAPDVVAVLDSVVQGTGPACERKLNIQLQPEQLDCGAAHL
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CCDS33 EA
         

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CCDS55 EMNSALAELSGNYTSAPHCLEALQELYNHIHRYYDQIISALEEDPVGQKLQLACRLQQVA
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CCDS55 ALVENKVTDL
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CCDS43 TDL
          




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