Result of FASTA (ccds) for pF1KB4196
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4196, 957 aa
  1>>>pF1KB4196 957 - 957 aa - 957 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2327+/-0.000955; mu= 13.1536+/- 0.058
 mean_var=127.6314+/-25.798, 0's: 0 Z-trim(109.2): 48  B-trim: 73 in 1/50
 Lambda= 0.113526
 statistics sampled from 10685 (10731) to 10685 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.68), E-opt: 0.2 (0.33), width:  16
 Scan time:  3.690

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS14480.2 DRP2 gene_id:1821|Hs108|chrX           ( 957) 6406 1061.2       0
CCDS55465.1 DRP2 gene_id:1821|Hs108|chrX           ( 879) 5833 967.3       0
CCDS75965.1 DMD gene_id:1756|Hs108|chrX            ( 956) 2708 455.5 2.3e-127
CCDS48091.1 DMD gene_id:1756|Hs108|chrX            (1225) 2708 455.5 2.8e-127
CCDS55395.1 DMD gene_id:1756|Hs108|chrX            (3681) 2708 455.8 6.9e-127
CCDS14233.1 DMD gene_id:1756|Hs108|chrX            (3685) 2708 455.8  7e-127
CCDS55394.1 DMD gene_id:1756|Hs108|chrX            (1115) 2649 445.9 2.1e-124
CCDS34547.1 UTRN gene_id:7402|Hs108|chr6           (3433) 2527 426.2 5.5e-118
CCDS14232.1 DMD gene_id:1756|Hs108|chrX            ( 622) 2281 385.4 1.8e-106
CCDS14234.1 DMD gene_id:1756|Hs108|chrX            ( 617) 1699 290.1   9e-78
CCDS14231.1 DMD gene_id:1756|Hs108|chrX            ( 635) 1699 290.1 9.2e-78
CCDS45848.1 DTNA gene_id:1837|Hs108|chr18          ( 686)  575 106.0 2.6e-22
CCDS59311.1 DTNA gene_id:1837|Hs108|chr18          ( 683)  571 105.4   4e-22
CCDS59312.1 DTNA gene_id:1837|Hs108|chr18          ( 724)  571 105.4 4.2e-22
CCDS59309.1 DTNA gene_id:1837|Hs108|chr18          ( 513)  561 103.7 9.9e-22
CCDS59310.1 DTNA gene_id:1837|Hs108|chr18          ( 510)  557 103.0 1.5e-21
CCDS56061.1 DTNA gene_id:1837|Hs108|chr18          ( 690)  557 103.1   2e-21
CCDS46502.1 DYTN gene_id:391475|Hs108|chr2         ( 578)  552 102.2   3e-21
CCDS42426.1 DTNA gene_id:1837|Hs108|chr18          ( 374)  478 90.0 9.4e-18
CCDS56060.1 DTNA gene_id:1837|Hs108|chr18          ( 371)  474 89.3 1.5e-17
CCDS11908.1 DTNA gene_id:1837|Hs108|chr18          ( 567)  474 89.5 2.1e-17
CCDS46234.1 DTNB gene_id:1838|Hs108|chr2           ( 567)  468 88.5 4.1e-17
CCDS46233.1 DTNB gene_id:1838|Hs108|chr2           ( 560)  466 88.1 5.1e-17
CCDS82428.1 DTNB gene_id:1838|Hs108|chr2           ( 590)  466 88.2 5.3e-17
CCDS46235.1 DTNB gene_id:1838|Hs108|chr2           ( 597)  466 88.2 5.4e-17
CCDS46236.1 DTNB gene_id:1838|Hs108|chr2           ( 609)  466 88.2 5.5e-17
CCDS74496.1 DTNB gene_id:1838|Hs108|chr2           ( 620)  466 88.2 5.6e-17
CCDS46237.1 DTNB gene_id:1838|Hs108|chr2           ( 627)  466 88.2 5.6e-17
CCDS58702.1 DTNB gene_id:1838|Hs108|chr2           ( 545)  388 75.4 3.5e-13


>>CCDS14480.2 DRP2 gene_id:1821|Hs108|chrX                (957 aa)
 initn: 6406 init1: 6406 opt: 6406  Z-score: 5673.4  bits: 1061.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6406; 100.0% identity (100.0% similar) in 957 aa overlap (1-957:1-957)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MQPMVMQGCPYTLPRCHDWQAADQFHHSSSLRSTCPHPQVRAAVTSPAPPQDGAGVPCLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MQPMVMQGCPYTLPRCHDWQAADQFHHSSSLRSTCPHPQVRAAVTSPAPPQDGAGVPCLS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 LKLLNGSVGASGPLEPPAMNLCWNEIKKKSHNLRARLEAFSDHSGKLQLPLQEIIDWLSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LKLLNGSVGASGPLEPPAMNLCWNEIKKKSHNLRARLEAFSDHSGKLQLPLQEIIDWLSQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 KDEELSAQLPLQGDVALVQQEKETHAAFMEEVKSRGPYIYSVLESAQAFLSQHPFEELEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KDEELSAQLPLQGDVALVQQEKETHAAFMEEVKSRGPYIYSVLESAQAFLSQHPFEELEE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 PHSESKDTSPKQRIQNLSRFVWKQATVASELWEKLTARCVDQHRHIERTLEQLLEIQGAM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PHSESKDTSPKQRIQNLSRFVWKQATVASELWEKLTARCVDQHRHIERTLEQLLEIQGAM
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 EELSTTLSQAEGVRATWEPIGDLFIDSLPEHIQAIKLFKEEFSPMKDGVKLVNDLAHQLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EELSTTLSQAEGVRATWEPIGDLFIDSLPEHIQAIKLFKEEFSPMKDGVKLVNDLAHQLA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 ISDVHLSMENSQALEQINVRWKQLQASVSERLKQLQDAHRDFGPGSQHFLSSSVQVPWER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ISDVHLSMENSQALEQINVRWKQLQASVSERLKQLQDAHRDFGPGSQHFLSSSVQVPWER
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 AISPNKVPYYINHQAQTTCWDHPKMTELYQTLADLNNIKFSAYRTAMKLRRVQKALRLDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AISPNKVPYYINHQAQTTCWDHPKMTELYQTLADLNNIKFSAYRTAMKLRRVQKALRLDL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 VTLTTALEIFNEHDLQASEHVMDVVEVIHCLTALYERLEEERGILVNVPLCVDMSLNWLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VTLTTALEIFNEHDLQASEHVMDVVEVIHCLTALYERLEEERGILVNVPLCVDMSLNWLL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB4 NVFDSGRSGKMRALSFKTGIACLCGTEVKEKLQYLFSQVANSGSQCDQRHLGVLLHEAIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NVFDSGRSGKMRALSFKTGIACLCGTEVKEKLQYLFSQVANSGSQCDQRHLGVLLHEAIQ
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB4 VPRQLGEVAAFGGSNVEPSVRSCFRFSTGKPVIEASQFLEWVNLEPQSMVWLAVLHRVTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VPRQLGEVAAFGGSNVEPSVRSCFRFSTGKPVIEASQFLEWVNLEPQSMVWLAVLHRVTI
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB4 AEQVKHQTKCSICRQCPIKGFRYRSLKQFNVDICQTCFLTGRASKGNKLHYPIMEYYTPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AEQVKHQTKCSICRQCPIKGFRYRSLKQFNVDICQTCFLTGRASKGNKLHYPIMEYYTPT
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB4 TSSENMRDFATTLKNKFRSKHYFSKHPQRGYLPVQSVLEADYSETPASSPMWPHADTHSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TSSENMRDFATTLKNKFRSKHYFSKHPQRGYLPVQSVLEADYSETPASSPMWPHADTHSR
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB4 IEHFASRLAEMESQNCSFFNDSLSPDDSIDEDQYLLRHSSPITDREPAFGQQAPCSVATE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IEHFASRLAEMESQNCSFFNDSLSPDDSIDEDQYLLRHSSPITDREPAFGQQAPCSVATE
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB4 SKGELQKILAHLEDENRILQGELRRLKWQHEEAAEAPSLADGSTEAATDHRNEELLAEAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SKGELQKILAHLEDENRILQGELRRLKWQHEEAAEAPSLADGSTEAATDHRNEELLAEAR
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB4 ILRQHKSRLETRMQILEDHNKQLESQLQRLRELLLQPPTESDGSGSAGSSLASSPQQSEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ILRQHKSRLETRMQILEDHNKQLESQLQRLRELLLQPPTESDGSGSAGSSLASSPQQSEG
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       
pF1KB4 SHPREKGQTTPDTEAADDVGSKSQDVSLCLEDIMEKLRHAFPSVRSSDVTANTLLAS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SHPREKGQTTPDTEAADDVGSKSQDVSLCLEDIMEKLRHAFPSVRSSDVTANTLLAS
              910       920       930       940       950       

>>CCDS55465.1 DRP2 gene_id:1821|Hs108|chrX                (879 aa)
 initn: 5833 init1: 5833 opt: 5833  Z-score: 5166.7  bits: 967.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5833; 100.0% identity (100.0% similar) in 879 aa overlap (79-957:1-879)

       50        60        70        80        90       100        
pF1KB4 PPQDGAGVPCLSLKLLNGSVGASGPLEPPAMNLCWNEIKKKSHNLRARLEAFSDHSGKLQ
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55                               MNLCWNEIKKKSHNLRARLEAFSDHSGKLQ
                                             10        20        30

      110       120       130       140       150       160        
pF1KB4 LPLQEIIDWLSQKDEELSAQLPLQGDVALVQQEKETHAAFMEEVKSRGPYIYSVLESAQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LPLQEIIDWLSQKDEELSAQLPLQGDVALVQQEKETHAAFMEEVKSRGPYIYSVLESAQA
               40        50        60        70        80        90

      170       180       190       200       210       220        
pF1KB4 FLSQHPFEELEEPHSESKDTSPKQRIQNLSRFVWKQATVASELWEKLTARCVDQHRHIER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FLSQHPFEELEEPHSESKDTSPKQRIQNLSRFVWKQATVASELWEKLTARCVDQHRHIER
              100       110       120       130       140       150

      230       240       250       260       270       280        
pF1KB4 TLEQLLEIQGAMEELSTTLSQAEGVRATWEPIGDLFIDSLPEHIQAIKLFKEEFSPMKDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TLEQLLEIQGAMEELSTTLSQAEGVRATWEPIGDLFIDSLPEHIQAIKLFKEEFSPMKDG
              160       170       180       190       200       210

      290       300       310       320       330       340        
pF1KB4 VKLVNDLAHQLAISDVHLSMENSQALEQINVRWKQLQASVSERLKQLQDAHRDFGPGSQH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VKLVNDLAHQLAISDVHLSMENSQALEQINVRWKQLQASVSERLKQLQDAHRDFGPGSQH
              220       230       240       250       260       270

      350       360       370       380       390       400        
pF1KB4 FLSSSVQVPWERAISPNKVPYYINHQAQTTCWDHPKMTELYQTLADLNNIKFSAYRTAMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FLSSSVQVPWERAISPNKVPYYINHQAQTTCWDHPKMTELYQTLADLNNIKFSAYRTAMK
              280       290       300       310       320       330

      410       420       430       440       450       460        
pF1KB4 LRRVQKALRLDLVTLTTALEIFNEHDLQASEHVMDVVEVIHCLTALYERLEEERGILVNV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LRRVQKALRLDLVTLTTALEIFNEHDLQASEHVMDVVEVIHCLTALYERLEEERGILVNV
              340       350       360       370       380       390

      470       480       490       500       510       520        
pF1KB4 PLCVDMSLNWLLNVFDSGRSGKMRALSFKTGIACLCGTEVKEKLQYLFSQVANSGSQCDQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PLCVDMSLNWLLNVFDSGRSGKMRALSFKTGIACLCGTEVKEKLQYLFSQVANSGSQCDQ
              400       410       420       430       440       450

      530       540       550       560       570       580        
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RHLGVLLHEAIQVPRQLGEVAAFGGSNVEPSVRSCFRFSTGKPVIEASQFLEWVNLEPQS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MVWLAVLHRVTIAEQVKHQTKCSICRQCPIKGFRYRSLKQFNVDICQTCFLTGRASKGNK
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LHYPIMEYYTPTTSSENMRDFATTLKNKFRSKHYFSKHPQRGYLPVQSVLEADYSETPAS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SPMWPHADTHSRIEHFASRLAEMESQNCSFFNDSLSPDDSIDEDQYLLRHSSPITDREPA
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB4 DHRNEELLAEARILRQHKSRLETRMQILEDHNKQLESQLQRLRELLLQPPTESDGSGSAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DHRNEELLAEARILRQHKSRLETRMQILEDHNKQLESQLQRLRELLLQPPTESDGSGSAG
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pF1KB4 SSLASSPQQSEGSHPREKGQTTPDTEAADDVGSKSQDVSLCLEDIMEKLRHAFPSVRSSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SSLASSPQQSEGSHPREKGQTTPDTEAADDVGSKSQDVSLCLEDIMEKLRHAFPSVRSSD
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      950       
pF1KB4 VTANTLLAS
       :::::::::
CCDS55 VTANTLLAS
                

>>CCDS75965.1 DMD gene_id:1756|Hs108|chrX                 (956 aa)
 initn: 3123 init1: 2656 opt: 2708  Z-score: 2400.1  bits: 455.5 E(32554): 2.3e-127
Smith-Waterman score: 3351; 55.0% identity (82.3% similar) in 902 aa overlap (79-954:53-951)

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CCDS75 YHNLDENSQKILRSLEGSDDAVLLQRRLDNMNFKWSELRKKSLNIRSHLEASSDQWKRLH
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pF1KB4 LPLQEIIDWLSQKDEELSAQLPLQGDVALVQQEKETHAAFMEEVKSRGPYIYSVLESAQA
       : :::.. ::. ::.::: : :. ::   ::.....: :: .:.:.. : :.:.::... 
CCDS75 LSLQELLVWLQLKDDELSRQAPIGGDFPAVQKQNDVHRAFKRELKTKEPVIMSTLETVRI
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pF1KB4 FLSQHPFEELEEPHSESKDTSPKQRIQNLSRFVWKQATVASELWEKLTARCVDQHRHIER
       ::...:.: ::. ..: ..  :..: ::..:.. :::  ..  ::::. . .: .:.:..
CCDS75 FLTEQPLEGLEKLYQEPRELPPEERAQNVTRLLRKQAEEVNTEWEKLNLHSADWQRKIDE
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pF1KB4 TLEQLLEIQGAMEELSTTLSQAEGVRATWEPIGDLFIDSLPEHIQAIKLFKEEFSPMKDG
       :::.: :.: : .::.  : ::: ....:.:.:::.:::: .:.. .: .. :..:.:..
CCDS75 TLERLRELQEATDELDLKLRQAEVIKGSWQPVGDLLIDSLQDHLEKVKALRGEIAPLKEN
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pF1KB4 VKLVNDLAHQLAISDVHLSMENSQALEQINVRWKQLQASVSERLKQLQDAHRDFGPGSQH
       :. :::::.::.   ..::  : ..::..:.::: ::..: .:..::..:::::::.:::
CCDS75 VSHVNDLARQLTTLGIQLSPYNLSTLEDLNTRWKLLQVAVEDRVRQLHEAHRDFGPASQH
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pF1KB4 FLSSSVQVPWERAISPNKVPYYINHQAQTTCWDHPKMTELYQTLADLNNIKFSAYRTAMK
       :::.::: :::::::::::::::::..:::::::::::::::.::::::..:::::::::
CCDS75 FLSTSVQGPWERAISPNKVPYYINHETQTTCWDHPKMTELYQSLADLNNVRFSAYRTAMK
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pF1KB4 LRRVQKALRLDLVTLTTALEIFNEHDLQASEHVMDVVEVIHCLTALYERLEEERGILVNV
       :::.:::: :::..:..: . ...:.:. ... ::....:.:::..:.:::.:.. ::::
CCDS75 LRRLQKALCLDLLSLSAACDALDQHNLKQNDQPMDILQIINCLTTIYDRLEQEHNNLVNV
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pF1KB4 PLCVDMSLNWLLNVFDSGRSGKMRALSFKTGIACLCGTEVKEKLQYLFSQVANSGSQCDQ
       :::::: :::::::.:.::.:..:.:::::::  :: .....: .:::.:::.: . :::
CCDS75 PLCVDMCLNWLLNVYDTGRTGRIRVLSFKTGIISLCKAHLEDKYRYLFKQVASSTGFCDQ
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pF1KB4 RHLGVLLHEAIQVPRQLGEVAAFGGSNVEPSVRSCFRFSTGKPVIEASQFLEWVNLEPQS
       :.::.:::..::.::::::::.:::::.::::::::.:...:: :::. ::.:. :::::
CCDS75 RRLGLLLHDSIQIPRQLGEVASFGGSNIEPSVRSCFQFANNKPEIEAALFLDWMRLEPQS
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pF1KB4 MVWLAVLHRVTIAEQVKHQTKCSICRQCPIKGFRYRSLKQFNVDICQTCFLTGRASKGNK
       :::: :::::. :: .:::.::.::..::: ::::::::.:: ::::.::..::..::.:
CCDS75 MVWLPVLHRVAAAETAKHQAKCNICKECPIIGFRYRSLKHFNYDICQSCFFSGRVAKGHK
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pF1KB4 LHYPIMEYYTPTTSSENMRDFATTLKNKFRSKHYFSKHPQRGYLPVQSVLEADYSETP--
       .:::..:: :::::.:..:::: .::::::.:.::.:::. ::::::.:::.:  :::  
CCDS75 MHYPMVEYCTPTTSGEDVRDFAKVLKNKFRTKRYFAKHPRMGYLPVQTVLEGDNMETPVT
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pF1KB4 -----------ASSPMWPHADTHSRIEHFASRLAEMESQNCSFFNDSLSPDDSIDEDQYL
                  ::::.  : ::::::::.::::::::..: :..:::.::..:::... :
CCDS75 LINFWPVDSAPASSPQLSHDDTHSRIEHYASRLAEMENSNGSYLNDSISPNESIDDEHLL
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pF1KB4 LRH-------SSPITD-REPAFGQQAPCSVATESKGELQKILAHLEDENRILQGELRRLK
       ..:       .::... : ::   :   :. .: .:::..::: ::.::: ::.:  :::
CCDS75 IQHYCQSLNQDSPLSQPRSPA---QILISLESEERGELERILADLEEENRNLQAEYDRLK
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       810         820       830       840       850       860     
pF1KB4 WQHEEAAEAP--SLADGSTEAATDHRNEELLAEARILRQHKSRLETRMQILEDHNKQLES
        :::. . .:  :  .    .  . :. ::.:::..:::::.:::.::::::::::::::
CCDS75 QQHEHKGLSPLPSPPEMMPTSPQSPRDAELIAEAKLLRQHKGRLEARMQILEDHNKQLES
     800       810       820       830       840       850         

         870       880       890       900          910       920  
pF1KB4 QLQRLRELLLQPPTESDGSGSAGSSLASSPQQSEGSHP---REKGQTTPDTEAADDVGSK
       ::.:::.:: :: .:.  .:.. :: ..: :.:..:.:   :  :. : :. . .:. : 
CCDS75 QLHRLRQLLEQPQAEAKVNGTTVSSPSTSLQRSDSSQPMLLRVVGSQTSDSMGEEDLLSP
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            930       940       950         
pF1KB4 SQDVSLCLEDIMEKLRHAFPSVRSSDVTANTLLAS  
        ::.:  ::..::.: ..::: :. .. .. .     
CCDS75 PQDTSTGLEEVMEQLNNSFPSSRGRNTPGKPMREDTM
     920       930       940       950      

>>CCDS48091.1 DMD gene_id:1756|Hs108|chrX                 (1225 aa)
 initn: 3123 init1: 2656 opt: 2708  Z-score: 2398.5  bits: 455.5 E(32554): 2.8e-127
Smith-Waterman score: 3351; 55.0% identity (82.3% similar) in 902 aa overlap (79-954:322-1220)

       50        60        70        80        90       100        
pF1KB4 PPQDGAGVPCLSLKLLNGSVGASGPLEPPAMNLCWNEIKKKSHNLRARLEAFSDHSGKLQ
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CCDS48 YHNLDENSQKILRSLEGSDDAVLLQRRLDNMNFKWSELRKKSLNIRSHLEASSDQWKRLH
             300       310       320       330       340       350 

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pF1KB4 LPLQEIIDWLSQKDEELSAQLPLQGDVALVQQEKETHAAFMEEVKSRGPYIYSVLESAQA
       : :::.. ::. ::.::: : :. ::   ::.....: :: .:.:.. : :.:.::... 
CCDS48 LSLQELLVWLQLKDDELSRQAPIGGDFPAVQKQNDVHRAFKRELKTKEPVIMSTLETVRI
             360       370       380       390       400       410 

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pF1KB4 FLSQHPFEELEEPHSESKDTSPKQRIQNLSRFVWKQATVASELWEKLTARCVDQHRHIER
       ::...:.: ::. ..: ..  :..: ::..:.. :::  ..  ::::. . .: .:.:..
CCDS48 FLTEQPLEGLEKLYQEPRELPPEERAQNVTRLLRKQAEEVNTEWEKLNLHSADWQRKIDE
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pF1KB4 TLEQLLEIQGAMEELSTTLSQAEGVRATWEPIGDLFIDSLPEHIQAIKLFKEEFSPMKDG
       :::.: :.: : .::.  : ::: ....:.:.:::.:::: .:.. .: .. :..:.:..
CCDS48 TLERLRELQEATDELDLKLRQAEVIKGSWQPVGDLLIDSLQDHLEKVKALRGEIAPLKEN
             480       490       500       510       520       530 

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pF1KB4 VKLVNDLAHQLAISDVHLSMENSQALEQINVRWKQLQASVSERLKQLQDAHRDFGPGSQH
       :. :::::.::.   ..::  : ..::..:.::: ::..: .:..::..:::::::.:::
CCDS48 VSHVNDLARQLTTLGIQLSPYNLSTLEDLNTRWKLLQVAVEDRVRQLHEAHRDFGPASQH
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pF1KB4 FLSSSVQVPWERAISPNKVPYYINHQAQTTCWDHPKMTELYQTLADLNNIKFSAYRTAMK
       :::.::: :::::::::::::::::..:::::::::::::::.::::::..:::::::::
CCDS48 FLSTSVQGPWERAISPNKVPYYINHETQTTCWDHPKMTELYQSLADLNNVRFSAYRTAMK
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pF1KB4 LRRVQKALRLDLVTLTTALEIFNEHDLQASEHVMDVVEVIHCLTALYERLEEERGILVNV
       :::.:::: :::..:..: . ...:.:. ... ::....:.:::..:.:::.:.. ::::
CCDS48 LRRLQKALCLDLLSLSAACDALDQHNLKQNDQPMDILQIINCLTTIYDRLEQEHNNLVNV
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pF1KB4 PLCVDMSLNWLLNVFDSGRSGKMRALSFKTGIACLCGTEVKEKLQYLFSQVANSGSQCDQ
       :::::: :::::::.:.::.:..:.:::::::  :: .....: .:::.:::.: . :::
CCDS48 PLCVDMCLNWLLNVYDTGRTGRIRVLSFKTGIISLCKAHLEDKYRYLFKQVASSTGFCDQ
             720       730       740       750       760       770 

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pF1KB4 RHLGVLLHEAIQVPRQLGEVAAFGGSNVEPSVRSCFRFSTGKPVIEASQFLEWVNLEPQS
       :.::.:::..::.::::::::.:::::.::::::::.:...:: :::. ::.:. :::::
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       :::: :::::. :: .:::.::.::..::: ::::::::.:: ::::.::..::..::.:
CCDS14 MVWLPVLHRVAAAETAKHQAKCNICKECPIIGFRYRSLKHFNYDICQSCFFSGRVAKGHK
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pF1KB4 LHYPIMEYYTPTTSSENMRDFATTLKNKFRSKHYFSKHPQRGYLPVQSVLEADYSETP--
       .:::..:: :::::.:..:::: .::::::.:.::.:::. ::::::.:::.:  :::  
CCDS14 MHYPMVEYCTPTTSGEDVRDFAKVLKNKFRTKRYFAKHPRMGYLPVQTVLEGDNMETPVT
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pF1KB4 -----------ASSPMWPHADTHSRIEHFASRLAEMESQNCSFFNDSLSPDDSIDEDQYL
                  ::::.  : ::::::::.::::::::..: :..:::.::..:::... :
CCDS14 LINFWPVDSAPASSPQLSHDDTHSRIEHYASRLAEMENSNGSYLNDSISPNESIDDEHLL
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pF1KB4 LRH-------SSPITD-REPAFGQQAPCSVATESKGELQKILAHLEDENRILQGELRRLK
       ..:       .::... : ::   :   :. .: .:::..::: ::.::: ::.:  :::
CCDS14 IQHYCQSLNQDSPLSQPRSPA---QILISLESEERGELERILADLEEENRNLQAEYDRLK
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pF1KB4 WQHEEAAEAP--SLADGSTEAATDHRNEELLAEARILRQHKSRLETRMQILEDHNKQLES
        :::. . .:  :  .    .  . :. ::.:::..:::::.:::.::::::::::::::
CCDS14 QQHEHKGLSPLPSPPEMMPTSPQSPRDAELIAEAKLLRQHKGRLEARMQILEDHNKQLES
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pF1KB4 QLQRLRELLLQPPTESDGSGSAGSSLASSPQQSEGSHP---REKGQTTPDTEAADDVGSK
       ::.:::.:: :: .:.  .:.. :: ..: :.:..:.:   :  :. : :. . .:. : 
CCDS14 QLHRLRQLLEQPQAEAKVNGTTVSSPSTSLQRSDSSQPMLLRVVGSQTSDSMGEEDLLSP
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pF1KB4 SQDVSLCLEDIMEKLRHAFPSVRSSDVTANTLLAS  
        ::.:  ::..::.: ..::: :. .. .. .     
CCDS14 PQDTSTGLEEVMEQLNNSFPSSRGRNTPGKPMREDTM
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>>CCDS55394.1 DMD gene_id:1756|Hs108|chrX                 (1115 aa)
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CCDS55 LSLQELLVWLQLKDDELSRQAPIGGDFPAVQKQNDVHRAFKRELKTKEPVIMSTLETVRI
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       ::...:.: ::. ..: ..  :..: ::..:.. :::  ..  ::::. . .: .:.:..
CCDS55 FLTEQPLEGLEKLYQEPRELPPEERAQNVTRLLRKQAEEVNTEWEKLNLHSADWQRKIDE
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pF1KB4 VKLVNDLAHQLAISDVHLSMENSQALEQINVRWKQLQASVSERLKQLQDAHRDFGPGSQH
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CCDS55 VSHVNDLARQLTTLGIQLSPYNLSTLEDLNTRWKLLQVAVEDRVRQLHEAHRDFGPASQH
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pF1KB4 FLSSSVQVPWERAISPNKVPYYINHQAQTTCWDHPKMTELYQTLADLNNIKFSAYRTAMK
       :::.::: :::::::::::::::::..:::::::::::::::.::::::..:::::::::
CCDS55 FLSTSVQGPWERAISPNKVPYYINHETQTTCWDHPKMTELYQSLADLNNVRFSAYRTAMK
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pF1KB4 LRRVQKALRLDLVTLTTALEIFNEHDLQASEHVMDVVEVIHCLTALYERLEEERGILVNV
       :::.:::: :::..:..: . ...:.:. ... ::....:.:::..:.:::.:.. ::::
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pF1KB4 PLCVDMSLNWLLNVFDSGRSGKMRALSFKTGIACLCGTEVKEKLQYLFSQVANSGSQCDQ
       :::::: :::::::.:.::.:..:.:::::::  :: .....: .:::.:::.: . :::
CCDS55 PLCVDMCLNWLLNVYDTGRTGRIRVLSFKTGIISLCKAHLEDKYRYLFKQVASSTGFCDQ
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pF1KB4 RHLGVLLHEAIQVPRQLGEVAAFGGSNVEPSVRSCFRFSTGKPVIEASQFLEWVNLEPQS
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CCDS55 RRLGLLLHDSIQIPRQLGEVASFGGSNIEPSVRSCFQFANNKPEIEAALFLDWMRLEPQS
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pF1KB4 MVWLAVLHRVTIAEQVKHQTKCSICRQCPIKGFRYRSLKQFNVDICQTCFLTGRASKGNK
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CCDS55 MVWLPVLHRVAAAETAKHQAKCNICKECPIIGFRYRSLKHFNYDICQSCFFSGRVAKGHK
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pF1KB4 LHYPIMEYYTPTTSSENMRDFATTLKNKFRSKHYFSKHPQRGYLPVQSVLEADYSETPAS
       .:::..:: :::::.:..:::: .::::::.:.::.:::. ::::::.:::.:  ::   
CCDS55 MHYPMVEYCTPTTSGEDVRDFAKVLKNKFRTKRYFAKHPRMGYLPVQTVLEGDNMETN--
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pF1KB4 SPMWPHADTHSRIEHFASRLAEMESQNCSFFNDSLSPDDSIDEDQYLLRHSSPITDREPA
                                                                   
CCDS55 ------------------------------------------------------------
                                                                   

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pF1KB4 FGQQAPCSVATESKGELQKILAHLEDENRILQGELRRLKWQHEEAAEAP--SLADGSTEA
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CCDS55 ------------------------------LQAEYDRLKQQHEHKGLSPLPSPPEMMPTS
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pF1KB4 ATDHRNEELLAEARILRQHKSRLETRMQILEDHNKQLESQLQRLRELLLQPPTESDGSGS
         . :. ::.:::..:::::.:::.::::::::::::::::.:::.:: :: .:.  .:.
CCDS55 PQSPRDAELIAEAKLLRQHKGRLEARMQILEDHNKQLESQLHRLRQLLEQPQAEAKVNGT
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       . :: ..: :.:..:.:   :  :. : :. . .:. :  ::.:  ::..::.: ..:::
CCDS55 TVSSPSTSLQRSDSSQPMLLRVVGSQTSDSMGEEDLLSPPQDTSTGLEEVMEQLNNSFPS
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pF1KB4 VRSSDVTANTLLAS  
        :. .. .. .     
CCDS55 SRGRNTPGKPMREDTM
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>>CCDS34547.1 UTRN gene_id:7402|Hs108|chr6                (3433 aa)
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pF1KB4 LPLQEIIDWLSQKDEELSAQLPLQGDVALVQQEKETHAAFMEEVKSRGPYIYSVLESAQA
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CCDS34 MSLEELIKWLNMKDEELKKQMPIGGDVPALQLQYDHCKALRRELKEKEYSVLNAVDQARV
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pF1KB4 FLSQHPFEELEEPHS--ESK-DTSPKQRIQNLSRFVWKQATVASELWEKLTARCVDQHRH
       ::...:.:  :::.   .:: . .:..: :.... . ::.. ..: ::.:.:   . ...
CCDS34 FLADQPIEAPEEPRRNLQSKTELTPEERAQKIAKAMRKQSSEVKEKWESLNAVTSNWQKQ
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pF1KB4 IERTLEQLLEIQGAMEELSTTLSQAEGVRATWEPIGDLFIDSLPEHIQAIKLFKEEFSPM
       ....::.: ..::::..:.. ...::.::  :.:.:::.:::: .::. :  :.::..:.
CCDS34 VDKALEKLRDLQGAMDDLDADMKEAESVRNGWKPVGDLLIDSLQDHIEKIMAFREEIAPI
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pF1KB4 KDGVKLVNDLAHQLAISDVHLSMENSQALEQINVRWKQLQASVSERLKQLQDAHRDFGPG
       .  :: ::::. ::.  :.: :.. :. :...:.::: ::.::..::::::.:::::::.
CCDS34 NFKVKTVNDLSSQLSPLDLHPSLKMSRQLDDLNMRWKLLQVSVDDRLKQLQEAHRDFGPS
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pF1KB4 SQHFLSSSVQVPWERAISPNKVPYYINHQAQTTCWDHPKMTELYQTLADLNNIKFSAYRT
       ::::::.:::.::.:.:: ::::::::::.:::::::::::::.:.::::::..::::::
CCDS34 SQHFLSTSVQLPWQRSISHNKVPYYINHQTQTTCWDHPKMTELFQSLADLNNVRFSAYRT
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pF1KB4 AMKLRRVQKALRLDLVTLTTALEIFNEHDLQASEHVMDVVEVIHCLTALYERLEEERGIL
       :.:.::.:::: :::. :.:. :::..: :. ......: .::.:::. :. ::. .  :
CCDS34 AIKIRRLQKALCLDLLELSTTNEIFKQHKLNQNDQLLSVPDVINCLTTTYDGLEQMHKDL
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pF1KB4 VNVPLCVDMSLNWLLNVFDSGRSGKMRALSFKTGIACLCGTEVKEKLQYLFSQVANSGSQ
       ::::::::: :::::::.:.::.::.:. :.: :.  :    ..:: .:::..::.   .
CCDS34 VNVPLCVDMCLNWLLNVYDTGRTGKIRVQSLKIGLMSLSKGLLEEKYRYLFKEVAGPTEM
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pF1KB4 CDQRHLGVLLHEAIQVPRQLGEVAAFGGSNVEPSVRSCFRFSTGKPVIEASQFLEWVNLE
       ::::.::.:::.:::.::::::::::::::.::::::::. ...:: : ...:..:..::
CCDS34 CDQRQLGLLLHDAIQIPRQLGEVAAFGGSNIEPSVRSCFQQNNNKPEISVKEFIDWMHLE
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       ::::::: :::::. :: .:::.::.::..::: ::::::::.:: :.::.::..::..:
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pF1KB4 GNKLHYPIMEYYTPTTSSENMRDFATTLKNKFRSKHYFSKHPQRGYLPVQSVLEADYSET
       :.:::::..::  ::::.:..:::. .::::::::.::.:::. ::::::.:::.:  ::
CCDS34 GHKLHYPMVEYCIPTTSGEDVRDFTKVLKNKFRSKKYFAKHPRLGYLPVQTVLEGDNLET
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pF1KB4 PASS-PMWP------------HADTHSRIEHFASRLAEMESQNCSFFNDSLSPDDSIDED
       : .   :::            : :::::::..:.:::.::  : ::..:: :   :....
CCDS34 PITLISMWPEHYDPSQSPQLFHDDTHSRIEQYATRLAQMERTNGSFLTDSSSTTGSVEDE
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pF1KB4 QYLLR-HSSPITDREPAFGQQAPC----SVATESKGELQKILAHLEDENRILQGELRRLK
       . :.. . . .  . :.   :.:     ::  : .:::..:.: ::.:.: :: : ..::
CCDS34 HALIQQYCQTLGGESPVSQPQSPAQILKSVEREERGELERIIADLEEEQRNLQVEYEQLK
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pF1KB4 WQHEEAAEAPSLADGSTEAATDHRNE--ELLAEARILRQHKSRLETRMQILEDHNKQLES
        :: . .  :  .   .  .  : .:  ::.:::..:::::.:::.::::::::::::::
CCDS34 DQHLRRG-LPVGSPPESIISPHHTSEDSELIAEAKLLRQHKGRLEARMQILEDHNKQLES
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pF1KB4 QLQRLRELLLQPPTESDGSGSAGSSLASSPQQSEGSHPREKGQTTPDTE--AADDVGSKS
       ::.:::.:: ::  ::: :   : :  .:::.:  :.  .   . :. .  :..:. .  
CCDS34 QLHRLRQLLEQP--ESD-SRINGVSPWASPQHSALSYSLDPDASGPQFHQAAGEDLLAPP
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       .:.:  : ..::... .:::              
CCDS34 HDTSTDLTEVMEQIHSTFPSCCPNVPSRPQAM  
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>>CCDS14232.1 DMD gene_id:1756|Hs108|chrX                 (622 aa)
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CCDS14                        MREQLKGHETQTTCWDHPKMTELYQSLADLNNVRFSA
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       :::::::::.:::: :::..:..: . ...:.:. ... ::....:.:::..:.:::.:.
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CCDS14 RLEPQSMVWLPVLHRVAAAETAKHQAKCNICKECPIIGFRYRSLKHFNYDICQSCFFSGR
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pF1KB4 ASKGNKLHYPIMEYYTPTTSSENMRDFATTLKNKFRSKHYFSKHPQRGYLPVQSVLEADY
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CCDS14 VAKGHKMHYPMVEYCTPTTSGEDVRDFAKVLKNKFRTKRYFAKHPRMGYLPVQTVLEGDN
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pF1KB4 SETPASSPMWPHADTHSRIEHFASRLAEMESQNCSFFNDSLSPDDSIDEDQYLLRH----
        :::::::.  : ::::::::.::::::::..: :..:::.::..:::... :..:    
CCDS14 METPASSPQLSHDDTHSRIEHYASRLAEMENSNGSYLNDSISPNESIDDEHLLIQHYCQS
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pF1KB4 ---SSPITD-REPAFGQQAPCSVATESKGELQKILAHLEDENRILQGELRRLKWQHEEAA
          .::... : ::   :   :. .: .:::..::: ::.::: ::.:  ::: :::. .
CCDS14 LNQDSPLSQPRSPA---QILISLESEERGELERILADLEEENRNLQAEYDRLKQQHEHKG
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pF1KB4 EAP--SLADGSTEAATDHRNEELLAEARILRQHKSRLETRMQILEDHNKQLESQLQRLRE
        .:  :  .    .  . :. ::.:::..:::::.:::.::::::::::::::::.:::.
CCDS14 LSPLPSPPEMMPTSPQSPRDAELIAEAKLLRQHKGRLEARMQILEDHNKQLESQLHRLRQ
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pF1KB4 LLLQPPTESDGSGSAGSSLASSPQQSEGSHP---REKGQTTPDTEAADDVGSKSQDVSLC
       :: :: .:.  .:.. :: ..: :.:..:.:   :  :. : :. . .:. :  ::.:  
CCDS14 LLEQPQAEAKVNGTTVSSPSTSLQRSDSSQPMLLRVVGSQTSDSMGEEDLLSPPQDTSTG
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pF1KB4 LEDIMEKLRHAFPSVRSSDVTANTLLAS                    
       ::..::.: ..::: :. .:                            
CCDS14 LEEVMEQLNNSFPSSRGHNVGSLFHMADDLGRAMESLVSVMTDEEGAE
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>>CCDS14234.1 DMD gene_id:1756|Hs108|chrX                 (617 aa)
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CCDS14                        MREQLKGHETQTTCWDHPKMTELYQSLADLNNVRFSA
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pF1KB4 YRTAMKLRRVQKALRLDLVTLTTALEIFNEHDLQASEHVMDVVEVIHCLTALYERLEEER
       :::::::::.:::: :::..:..: . ...:.:. ... ::....:.:::..:.:::.:.
CCDS14 YRTAMKLRRLQKALCLDLLSLSAACDALDQHNLKQNDQPMDILQIINCLTTIYDRLEQEH
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pF1KB4 GILVNVPLCVDMSLNWLLNVFDSGRSGKMRALSFKTGIACLCGTEVKEKLQYLFSQVANS
       . :::::::::: :::::::.:.::.:..:.:::::::  :: .....: .:::.:::.:
CCDS14 NNLVNVPLCVDMCLNWLLNVYDTGRTGRIRVLSFKTGIISLCKAHLEDKYRYLFKQVASS
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pF1KB4 GSQCDQRHLGVLLHEAIQVPRQLGEVAAFGGSNVEPSVRSCFRFSTGKPVIEASQFLEWV
        . ::::.::.:::..::.::::::::.:::::.::::::::.:...:: :::. ::.:.
CCDS14 TGFCDQRRLGLLLHDSIQIPRQLGEVASFGGSNIEPSVRSCFQFANNKPEIEAALFLDWM
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pF1KB4 NLEPQSMVWLAVLHRVTIAEQVKHQTKCSICRQCPIKGFRYRSLKQFNVDICQTCFLTGR
        ::::::::: :::::. :: .:::.::.::..::: ::::::::.:: ::::.::..::
CCDS14 RLEPQSMVWLPVLHRVAAAETAKHQAKCNICKECPIIGFRYRSLKHFNYDICQSCFFSGR
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pF1KB4 ASKGNKLHYPIMEYYTPTTSSENMRDFATTLKNKFRSKHYFSKHPQRGYLPVQSVLEADY
       ..::.:.:::..:: :::::.:..:::: .::::::.:.::.:::. ::::::.:::.: 
CCDS14 VAKGHKMHYPMVEYCTPTTSGEDVRDFAKVLKNKFRTKRYFAKHPRMGYLPVQTVLEGDN
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pF1KB4 SETP-------------ASSPMWPHADTHSRIEHFASRLAEMESQNCSFFNDSLSPDDSI
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CCDS14 METPVTLINFWPVDSAPASSPQLSHDDTHSRIEHYASRLAEMENSNGSYLNDSISPNESI
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pF1KB4 DEDQYLLRH-------SSPITD-REPAFGQQAPCSVATESKGELQKILAHLEDENRILQG
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CCDS14 DDEHLLIQHYCQSLNQDSPLSQPRSPA---QILISLESEERGELERILADLEEENRNLQA
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CCDS14 EYDRLKQQHEHKGLSPLPSPPEMMPTSPQSPRDAELIAEAKLLRQHKGRLEARMQILEDH
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CCDS14 NKQLESQLHRLRQLLEQPQAEAKVNGTTVSSPSTSLQRSDSSQPMLLRVVGSQTSDSMGE
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CCDS14 EDLLSPPQDTSTGLEEVMEQLNNSFPSSRGRNTPGKPMREDTM
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957 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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