seq1 = pF1KA1682.tfa, 2241 bp
seq2 = pF1KA1682/gi568815593r_32129781.tfa (gi568815593r:32129781_32412838), 283058 bp

>pF1KA1682 2241
>gi568815593r:32129781_32412838 (Chr5)

(complement)

1-81  (100001-100081)   100% ->
82-142  (136097-136157)   100% ->
143-285  (138717-138859)   100% ->
286-358  (140934-141006)   100% ->
359-489  (141892-142022)   100% ->
490-583  (144045-144138)   100% ->
584-713  (149597-149726)   100% ->
714-789  (157071-157146)   100% ->
790-896  (163961-164067)   100% ->
897-1021  (164713-164837)   100% ->
1022-1100  (169240-169318)   100% ->
1101-1171  (170712-170782)   100% ->
1172-1344  (173666-173838)   100% ->
1345-1512  (177710-177877)   100% ->
1513-1674  (178905-179066)   100% ->
1675-2241  (182492-183058)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGGGGAAAGGAGTAGTCGGCGGTGGCGGCGGCACCAAGGCCCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGGGGAAAGGAGTAGTCGGCGGTGGCGGCGGCACCAAGGCCCCCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCCTCCTTCGTGTCGTACGTACGCCCTGAG         GAAATTCACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100051 GCCCTCCTTCGTGTCGTACGTACGCCCTGAGGTG...TAGGAAATTCACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CAAACGAAAAGGAAGTAACAGAGAAGGAAGTAACTCTTCACTTGTTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136107 CAAACGAAAAGGAAGTAACAGAGAAGGAAGTAACTCTTCACTTGTTGCCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 G         GTGAACAGCTGCTTTGTGAAGCCAGCACAGTACTGAAGTA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136157 GGTA...CAGGTGAACAGCTGCTTTGTGAAGCCAGCACAGTACTGAAGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGTCCAGGAAGATTCCTGTCAGCATGGGGTCTATGGGAGGCTTGTCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138757 TGTCCAGGAAGATTCCTGTCAGCATGGGGTCTATGGGAGGCTTGTCTGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CAGACTTCAAGATTGCCTTCTTGGGTGATGATGAATCTGCATTGGATAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138807 CAGACTTCAAGATTGCCTTCTTGGGTGATGATGAATCTGCATTGGATAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAT         GAAACTCAATTTAAGAATAAGGTTATAGGAGAAAATGA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138857 GATGTA...TAGGAAACTCAATTTAAGAATAAGGTTATAGGAGAAAATGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CATTACACTCCACTGTGTTGATCAGATTTATGGAG         TGTTTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 140972 CATTACACTCCACTGTGTTGATCAGATTTATGGAGGTA...TAGTGTTTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 ATGAGAAAAAGAAAACTCTCTTTGGACAACTGAAGAAATACCCTGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141898 ATGAGAAAAAGAAAACTCTCTTTGGACAACTGAAGAAATACCCTGAGAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CTCATCATCCACTGCAAAGACCTTCGAGTGTTCCAGTTTTGTCTGAGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141948 CTCATCATCCACTGCAAAGACCTTCGAGTGTTCCAGTTTTGTCTGAGGTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CACAAAGGAAGAGGAAGTCAAAAGG         ATTGTCAGTGGCATAA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 141998 CACAAAGGAAGAGGAAGTCAAAAGGGTA...TAGATTGTCAGTGGCATAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TTCATCATACCCAGGCTCCTAAACTGCTTAAACGATTATTTCTGTTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144061 TTCATCATACCCAGGCTCCTAAACTGCTTAAACGATTATTTCTGTTTTCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TATGCGACTGCTGCACAAAACAATACAG         TCACTGATCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 144111 TATGCGACTGCTGCACAAAACAATACAGGTA...TAGTCACTGATCCCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 GAACCATACCGTAATGTTTGACACACTTAAGGACTGGTGTTGGGAACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149610 GAACCATACCGTAATGTTTGACACACTTAAGGACTGGTGTTGGGAACTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 AACGGACCAAAGGCAACATGAAGTACAAAGCAGTGAGTGTCAACGAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149660 AACGGACCAAAGGCAACATGAAGTACAAAGCAGTGAGTGTCAACGAAGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TATAAAGTCTGTGAGAG         ATTGCCAGCATACTTTGTTGTCCC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 149710 TATAAAGTCTGTGAGAGGTA...TAGATTGCCAGCATACTTTGTTGTCCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 CACCCCTCTTCCTGAAGAGAATGTGCAGCGCTTTCAGGGTCATGGCATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157095 CACCCCTCTTCCTGAAGAGAATGTGCAGCGCTTTCAGGGTCATGGCATAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 CA         ATATGGTGTTGGTCCTGCCACAATGGAAGTGCCCTTTTG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157145 CAGTA...CAGATATGGTGTTGGTCCTGCCACAATGGAAGTGCCCTTTTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 AAAATGTCAGCACTGCCCAAAGAACAGGATGACGGCATTTTACAAATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164000 AAAATGTCAGCACTGCCCAAAGAACAGGATGACGGCATTTTACAAATCCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 AAAGAGCTTCTTAGATGG         AATTTACAAGACCATCCACAGGC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 164050 AAAGAGCTTCTTAGATGGGTC...TAGAATTTACAAGACCATCCACAGGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 CACCCTATGAAATTGTTAAAACGGAAGACCTGTCAAGCAACTTCCTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164736 CACCCTATGAAATTGTTAAAACGGAAGACCTGTCAAGCAACTTCCTGTCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 CTGCAGGAAATCCAGACTGCATACTCTAAATTTAAACAGCTATTTCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164786 CTGCAGGAAATCCAGACTGCATACTCTAAATTTAAACAGCTATTTCTGAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 AG         ATAACAGTACTGAATTTTGGGACACAGATATAAAATGGT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164836 AGGTG...CAGATAACAGTACTGAATTTTGGGACACAGATATAAAATGGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 TTTCTCTGTTGGAAAGTAGCAGCTGGCTTGACATAATCAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 169279 TTTCTCTGTTGGAAAGTAGCAGCTGGCTTGACATAATCAGGTA...CAGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 CGTTGCCTGAAAAAAGCAATAGAGATTACAGAATGTATGGAAGCACAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170713 CGTTGCCTGAAAAAAGCAATAGAGATTACAGAATGTATGGAAGCACAAAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 CATGAATGTTCTTCTTTTAG         AGGAGAATGCATCCGACCTCT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 170763 CATGAATGTTCTTCTTTTAGGTA...TAGAGGAGAATGCATCCGACCTCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1193 GCTGTCTCATTTCCTCTCTGGTGCAACTGATGATGGACCCCCACTGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173687 GCTGTCTCATTTCCTCTCTGGTGCAACTGATGATGGACCCCCACTGCAGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 ACCAGAATTGGTTTCCAGAGCCTCATCCAAAAGGAGTGGGTCATGGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173737 ACCAGAATTGGTTTCCAGAGCCTCATCCAAAAGGAGTGGGTCATGGGTGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 CCACTGTTTCTTGGATCGCTGCAACCATCTCCGCCAGAACGACAAAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173787 CCACTGTTTCTTGGATCGCTGCAACCATCTCCGCCAGAACGACAAAGAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 AG         GTTCCTGTGTTCCTGCTTTTCCTAGATTGTGTCTGGCAG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173837 AGGTG...CAGGTTCCTGTGTTCCTGCTTTTCCTAGATTGTGTCTGGCAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 CTGGTGCACCAGCATCCCCCGGCATTTGAATTCACAGAGACTTACCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177749 CTGGTGCACCAGCATCCCCCGGCATTTGAATTCACAGAGACTTACCTGAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 TGTTTTGTCAGATAGCCTGTATATACCTATTTTTAGCACCTTCTTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177799 TGTTTTGTCAGATAGCCTGTATATACCTATTTTTAGCACCTTCTTCTTCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 ATTCACCTCATCAAAAAGATACTAACATG         GGTAGAGAAGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 177849 ATTCACCTCATCAAAAAGATACTAACATGGTA...CAGGGTAGAGAAGGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1525 CAGGATACACAAAGCAAGCCTTTGAATCTGCTCACCGTGTGGGATTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178917 CAGGATACACAAAGCAAGCCTTTGAATCTGCTCACCGTGTGGGATTGGTC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 GGTGCAGTTTGAACCCAAAGCCCAGACATTGCTCAAAAACCCTCTTTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178967 GGTGCAGTTTGAACCCAAAGCCCAGACATTGCTCAAAAACCCTCTTTATG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 TGGAAAAGCCAAAACTGGACAAAGGCCAACGGAAAGGAATGCGCTTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179017 TGGAAAAGCCAAAACTGGACAAAGGCCAACGGAAAGGAATGCGCTTCAAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675          CATCAACGACAACTTTCTTTGCCACTTACACAATCTAAGTC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179067 GTA...AAGCATCAACGACAACTTTCTTTGCCACTTACACAATCTAAGTC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1716 ATCTCCCAAAAGAGGATTTTTCAGGGAAGAAACAGATCATTTAATTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182533 ATCTCCCAAAAGAGGATTTTTCAGGGAAGAAACAGATCATTTAATTAAAA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1766 ACCTTCTGGGCAAGAGAATTAGCAAACTTATTAATTCTTCTGATGAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182583 ACCTTCTGGGCAAGAGAATTAGCAAACTTATTAATTCTTCTGATGAGCTC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 CAAGACAACTTTCGAGAGTTCTATGACAGCTGGCATAGCAAGTCCACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182633 CAAGACAACTTTCGAGAGTTCTATGACAGCTGGCATAGCAAGTCCACTGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 CTACCATGGTTTGTTGTTACCGCATATCGAGGGGCCCGAAATCAAAGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182683 CTACCATGGTTTGTTGTTACCGCATATCGAGGGGCCCGAAATCAAAGTCT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 GGGCCCAGCGCTACCTACGTTGGATTCCAGAAGCCCAAATCCTAGGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182733 GGGCCCAGCGCTACCTACGTTGGATTCCAGAAGCCCAAATCCTAGGTGGT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 GGCCAAGTGGCCACTCTGAGCAAACTCTTGGAAATGATGGAGGAAGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182783 GGCCAAGTGGCCACTCTGAGCAAACTCTTGGAAATGATGGAGGAAGTCCA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 GAGTTTACAAGAGAAGATCGACGAGAGACACCACAGCCAGCAGGCCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182833 GAGTTTACAAGAGAAGATCGACGAGAGACACCACAGCCAGCAGGCCCCCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 AGGCTGAGGCCCCCTGCCTGCTGAGGAACTCTGCCCGCCTCTCGTCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182883 AGGCTGAGGCCCCCTGCCTGCTGAGGAACTCTGCCCGCCTCTCGTCTTTG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 TTTCCTTTCGCTCTGCTCCAGCGACATTCCTCTAAGCCCGTCTTACCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182933 TTTCCTTTCGCTCTGCTCCAGCGACATTCCTCTAAGCCCGTCTTACCCAC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 CAGTGGCTGGAAAGCTTTGGGAGATGAAGACGATTTGGCCAAACGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182983 CAGTGGCTGGAAAGCTTTGGGAGATGAAGACGATTTGGCCAAACGAGAAG

   2350     .    :    .    :    .
   2216 ATGAGTTCGTGGACCTAGGGGATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||
 183033 ATGAGTTCGTGGACCTAGGGGATGTG