Result of FASTA (ccds) for pF1KA1568
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1568, 1378 aa
  1>>>pF1KA1568 1378 - 1378 aa - 1378 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8432+/-0.00109; mu= 7.9161+/- 0.066
 mean_var=278.9014+/-58.995, 0's: 0 Z-trim(112.0): 200  B-trim: 46 in 1/50
 Lambda= 0.076798
 statistics sampled from 12623 (12844) to 12623 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.711), E-opt: 0.2 (0.395), width:  16
 Scan time:  6.270

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS43109.1 ROBO2 gene_id:6092|Hs108|chr3          (1378) 9310 1046.6       0
CCDS54609.1 ROBO2 gene_id:6092|Hs108|chr3          (1394) 9179 1032.1       0
CCDS54610.1 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3          (1551) 4138 473.6 1.9e-132
CCDS46872.2 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3          (1606) 4100 469.4 3.6e-131
CCDS54611.1 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3          (1651) 4053 464.2 1.3e-129
CCDS44755.1 ROBO3 gene_id:64221|Hs108|chr11        (1386) 3375 389.0 4.9e-107
CCDS11952.1 DCC gene_id:1630|Hs108|chr18           (1447)  648 86.9 4.5e-16
CCDS42929.1 DSCAM gene_id:1826|Hs108|chr21         (2012)  622 84.2 4.2e-15
CCDS8384.1 DSCAML1 gene_id:57453|Hs108|chr11       (2113)  602 82.0   2e-14
CCDS46221.1 PXDN gene_id:7837|Hs108|chr2           (1479)  597 81.2 2.3e-14
CCDS53957.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15          (1408)  588 80.2 4.5e-14
CCDS58378.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15          (1450)  588 80.2 4.5e-14
CCDS10247.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15          (1461)  588 80.2 4.6e-14
CCDS45769.1 SDK2 gene_id:54549|Hs108|chr17         (2172)  562 77.5 4.4e-13
CCDS8455.1 ROBO4 gene_id:54538|Hs108|chr11         (1007)  552 76.1 5.6e-13
CCDS47855.1 PXDNL gene_id:137902|Hs108|chr8        (1463)  544 75.4 1.3e-12
CCDS33790.1 CNTN3 gene_id:5067|Hs108|chr3          (1028)  523 72.9 5.3e-12
CCDS73385.1 NCAM1 gene_id:4684|Hs108|chr11         ( 858)  504 70.7   2e-11
CCDS61010.1 IGSF9B gene_id:22997|Hs108|chr11       (1437)  507 71.3 2.3e-11
CCDS73386.1 NCAM1 gene_id:4684|Hs108|chr11         ( 761)  487 68.8 6.9e-11


>>CCDS43109.1 ROBO2 gene_id:6092|Hs108|chr3               (1378 aa)
 initn: 9310 init1: 9310 opt: 9310  Z-score: 5589.0  bits: 1046.6 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 9310; 100.0% identity (100.0% similar) in 1378 aa overlap (1-1378:1-1378)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MSLLMFTQLLLCGFLYVRVDGSRLRQEDFPPRIVEHPSDVIVSKGEPTTLNCKAEGRPTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MSLLMFTQLLLCGFLYVRVDGSRLRQEDFPPRIVEHPSDVIVSKGEPTTLNCKAEGRPTP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 TIEWYKDGERVETDKDDPRSHRMLLPSGSLFFLRIVHGRRSKPDEGSYVCVARNYLGEAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TIEWYKDGERVETDKDDPRSHRMLLPSGSLFFLRIVHGRRSKPDEGSYVCVARNYLGEAV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 SRNASLEVALLRDDFRQNPTDVVVAAGEPAILECQPPRGHPEPTIYWKKDKVRIDDKEER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SRNASLEVALLRDDFRQNPTDVVVAAGEPAILECQPPRGHPEPTIYWKKDKVRIDDKEER
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 ISIRGGKLMISNTRKSDAGMYTCVGTNMVGERDSDPAELTVFERPTFLRRPINQVVLEEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ISIRGGKLMISNTRKSDAGMYTCVGTNMVGERDSDPAELTVFERPTFLRRPINQVVLEEE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 AVEFRCQVQGDPQPTVRWKKDDADLPRGRYDIKDDYTLRIKKTMSTDEGTYMCIAENRVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AVEFRCQVQGDPQPTVRWKKDDADLPRGRYDIKDDYTLRIKKTMSTDEGTYMCIAENRVG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 KMEASATLTVRAPPQFVVRPRDQIVAQGRTVTFPCETKGNPQPAVFWQKEGSQNLLFPNQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KMEASATLTVRAPPQFVVRPRDQIVAQGRTVTFPCETKGNPQPAVFWQKEGSQNLLFPNQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 PQQPNSRCSVSPTGDLTITNIQRSDAGYYICQALTVAGSILAKAQLEVTDVLTDRPPPII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PQQPNSRCSVSPTGDLTITNIQRSDAGYYICQALTVAGSILAKAQLEVTDVLTDRPPPII
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 LQGPANQTLAVDGTALLKCKATGDPLPVISWLKEGFTFPGRDPRATIQEQGTLQIKNLRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LQGPANQTLAVDGTALLKCKATGDPLPVISWLKEGFTFPGRDPRATIQEQGTLQIKNLRI
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 SDTGTYTCVATSSSGETSWSAVLDVTESGATISKNYDLSDLPGPPSKPQVTDVTKNSVTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SDTGTYTCVATSSSGETSWSAVLDVTESGATISKNYDLSDLPGPPSKPQVTDVTKNSVTL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 SWQPGTPGTLPASAYIIEAFSQSVSNSWQTVANHVKTTLYTVRGLRPNTIYLFMVRAINP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SWQPGTPGTLPASAYIIEAFSQSVSNSWQTVANHVKTTLYTVRGLRPNTIYLFMVRAINP
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA1 QGLSDPSPMSDPVRTQDISPPAQGVDHRQVQKELGDVLVRLHNPVVLTPTTVQVTWTVDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QGLSDPSPMSDPVRTQDISPPAQGVDHRQVQKELGDVLVRLHNPVVLTPTTVQVTWTVDR
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA1 QPQFIQGYRVMYRQTSGLQATSSWQNLDAKVPTERSAVLVNLKKGVTYEIKVRPYFNEFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QPQFIQGYRVMYRQTSGLQATSSWQNLDAKVPTERSAVLVNLKKGVTYEIKVRPYFNEFQ
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA1 GMDSESKTVRTTEEAPSAPPQSVTVLTVGSYNSTSISVSWDPPPPDHQNGIIQEYKIWCL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GMDSESKTVRTTEEAPSAPPQSVTVLTVGSYNSTSISVSWDPPPPDHQNGIIQEYKIWCL
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA1 GNETRFHINKTVDAAIRSVIIGGLFPGIQYRVEVAASTSAGVGVKSEPQPIIIGRRNEVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GNETRFHINKTVDAAIRSVIIGGLFPGIQYRVEVAASTSAGVGVKSEPQPIIIGRRNEVV
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA1 ITENNNSITEQITDVVKQPAFIAGIGGACWVILMGFSIWLYWRRKKRKGLSNYAVTFQRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ITENNNSITEQITDVVKQPAFIAGIGGACWVILMGFSIWLYWRRKKRKGLSNYAVTFQRG
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA1 DGGLMSNGSRPGLLNAGDPSYPWLADSWPATSLPVNNSNSGPNEIGNFGRGDVLPPVPGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DGGLMSNGSRPGLLNAGDPSYPWLADSWPATSLPVNNSNSGPNEIGNFGRGDVLPPVPGQ
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA1 GDKTATMLSDGAIYSSIDFTTKTSYNSSSQITQATPYATTQILHSNSIHELAVDLPDPQW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GDKTATMLSDGAIYSSIDFTTKTSYNSSSQITQATPYATTQILHSNSIHELAVDLPDPQW
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA1 KSSIQQKTDLMGFGYSLPDQNKGNNGGKGGKKKKNKNSSKPQKNNGSTWANVPLPPPPVQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KSSIQQKTDLMGFGYSLPDQNKGNNGGKGGKKKKNKNSSKPQKNNGSTWANVPLPPPPVQ
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA1 PLPGTELEHYAVEQQENGYDSDSWCPPLPVQTYLHQGLEDELEEDDDRVPTPPVRGVASS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PLPGTELEHYAVEQQENGYDSDSWCPPLPVQTYLHQGLEDELEEDDDRVPTPPVRGVASS
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KA1 PAISFGQQSTATLTPSPREEMQPMLQAHLDELTRAYQFDIAKQTWHIQSNNQPPQPPVPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PAISFGQQSTATLTPSPREEMQPMLQAHLDELTRAYQFDIAKQTWHIQSNNQPPQPPVPP
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KA1 LGYVSGALISDLETDVADDDADDEEEALEIPRPLRALDQTPGSSMDNLDSSVTGKAFTSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LGYVSGALISDLETDVADDDADDEEEALEIPRPLRALDQTPGSSMDNLDSSVTGKAFTSS
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KA1 QRPRPTSPFSTDSNTSAALSQSQRPRPTKKHKGGRMDQQPALPHRREGMTDEEALVPYSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QRPRPTSPFSTDSNTSAALSQSQRPRPTKKHKGGRMDQQPALPHRREGMTDEEALVPYSK
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370        
pF1KA1 PSFPSPGGHSSSGTASSKGSTGPRKTEVLRAGHQRNASDLLDIGYMGSNSQGQFTGEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PSFPSPGGHSSSGTASSKGSTGPRKTEVLRAGHQRNASDLLDIGYMGSNSQGQFTGEL
             1330      1340      1350      1360      1370        

>>CCDS54609.1 ROBO2 gene_id:6092|Hs108|chr3               (1394 aa)
 initn: 9179 init1: 9179 opt: 9179  Z-score: 5510.5  bits: 1032.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 9179; 100.0% identity (100.0% similar) in 1358 aa overlap (21-1378:37-1394)

                         10        20        30        40        50
pF1KA1           MSLLMFTQLLLCGFLYVRVDGSRLRQEDFPPRIVEHPSDVIVSKGEPTTL
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RVTRRMWTWAPGLLMMTVVFWGHQGNGQGQGSRLRQEDFPPRIVEHPSDVIVSKGEPTTL
         10        20        30        40        50        60      

               60        70        80        90       100       110
pF1KA1 NCKAEGRPTPTIEWYKDGERVETDKDDPRSHRMLLPSGSLFFLRIVHGRRSKPDEGSYVC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NCKAEGRPTPTIEWYKDGERVETDKDDPRSHRMLLPSGSLFFLRIVHGRRSKPDEGSYVC
         70        80        90       100       110       120      

              120       130       140       150       160       170
pF1KA1 VARNYLGEAVSRNASLEVALLRDDFRQNPTDVVVAAGEPAILECQPPRGHPEPTIYWKKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VARNYLGEAVSRNASLEVALLRDDFRQNPTDVVVAAGEPAILECQPPRGHPEPTIYWKKD
        130       140       150       160       170       180      

              180       190       200       210       220       230
pF1KA1 KVRIDDKEERISIRGGKLMISNTRKSDAGMYTCVGTNMVGERDSDPAELTVFERPTFLRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KVRIDDKEERISIRGGKLMISNTRKSDAGMYTCVGTNMVGERDSDPAELTVFERPTFLRR
        190       200       210       220       230       240      

              240       250       260       270       280       290
pF1KA1 PINQVVLEEEAVEFRCQVQGDPQPTVRWKKDDADLPRGRYDIKDDYTLRIKKTMSTDEGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PINQVVLEEEAVEFRCQVQGDPQPTVRWKKDDADLPRGRYDIKDDYTLRIKKTMSTDEGT
        250       260       270       280       290       300      

              300       310       320       330       340       350
pF1KA1 YMCIAENRVGKMEASATLTVRAPPQFVVRPRDQIVAQGRTVTFPCETKGNPQPAVFWQKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YMCIAENRVGKMEASATLTVRAPPQFVVRPRDQIVAQGRTVTFPCETKGNPQPAVFWQKE
        310       320       330       340       350       360      

              360       370       380       390       400       410
pF1KA1 GSQNLLFPNQPQQPNSRCSVSPTGDLTITNIQRSDAGYYICQALTVAGSILAKAQLEVTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GSQNLLFPNQPQQPNSRCSVSPTGDLTITNIQRSDAGYYICQALTVAGSILAKAQLEVTD
        370       380       390       400       410       420      

              420       430       440       450       460       470
pF1KA1 VLTDRPPPIILQGPANQTLAVDGTALLKCKATGDPLPVISWLKEGFTFPGRDPRATIQEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VLTDRPPPIILQGPANQTLAVDGTALLKCKATGDPLPVISWLKEGFTFPGRDPRATIQEQ
        430       440       450       460       470       480      

              480       490       500       510       520       530
pF1KA1 GTLQIKNLRISDTGTYTCVATSSSGETSWSAVLDVTESGATISKNYDLSDLPGPPSKPQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GTLQIKNLRISDTGTYTCVATSSSGETSWSAVLDVTESGATISKNYDLSDLPGPPSKPQV
        490       500       510       520       530       540      

              540       550       560       570       580       590
pF1KA1 TDVTKNSVTLSWQPGTPGTLPASAYIIEAFSQSVSNSWQTVANHVKTTLYTVRGLRPNTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TDVTKNSVTLSWQPGTPGTLPASAYIIEAFSQSVSNSWQTVANHVKTTLYTVRGLRPNTI
        550       560       570       580       590       600      

              600       610       620       630       640       650
pF1KA1 YLFMVRAINPQGLSDPSPMSDPVRTQDISPPAQGVDHRQVQKELGDVLVRLHNPVVLTPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YLFMVRAINPQGLSDPSPMSDPVRTQDISPPAQGVDHRQVQKELGDVLVRLHNPVVLTPT
        610       620       630       640       650       660      

              660       670       680       690       700       710
pF1KA1 TVQVTWTVDRQPQFIQGYRVMYRQTSGLQATSSWQNLDAKVPTERSAVLVNLKKGVTYEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TVQVTWTVDRQPQFIQGYRVMYRQTSGLQATSSWQNLDAKVPTERSAVLVNLKKGVTYEI
        670       680       690       700       710       720      

              720       730       740       750       760       770
pF1KA1 KVRPYFNEFQGMDSESKTVRTTEEAPSAPPQSVTVLTVGSYNSTSISVSWDPPPPDHQNG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KVRPYFNEFQGMDSESKTVRTTEEAPSAPPQSVTVLTVGSYNSTSISVSWDPPPPDHQNG
        730       740       750       760       770       780      

              780       790       800       810       820       830
pF1KA1 IIQEYKIWCLGNETRFHINKTVDAAIRSVIIGGLFPGIQYRVEVAASTSAGVGVKSEPQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IIQEYKIWCLGNETRFHINKTVDAAIRSVIIGGLFPGIQYRVEVAASTSAGVGVKSEPQP
        790       800       810       820       830       840      

              840       850       860       870       880       890
pF1KA1 IIIGRRNEVVITENNNSITEQITDVVKQPAFIAGIGGACWVILMGFSIWLYWRRKKRKGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IIIGRRNEVVITENNNSITEQITDVVKQPAFIAGIGGACWVILMGFSIWLYWRRKKRKGL
        850       860       870       880       890       900      

              900       910       920       930       940       950
pF1KA1 SNYAVTFQRGDGGLMSNGSRPGLLNAGDPSYPWLADSWPATSLPVNNSNSGPNEIGNFGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SNYAVTFQRGDGGLMSNGSRPGLLNAGDPSYPWLADSWPATSLPVNNSNSGPNEIGNFGR
        910       920       930       940       950       960      

              960       970       980       990      1000      1010
pF1KA1 GDVLPPVPGQGDKTATMLSDGAIYSSIDFTTKTSYNSSSQITQATPYATTQILHSNSIHE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GDVLPPVPGQGDKTATMLSDGAIYSSIDFTTKTSYNSSSQITQATPYATTQILHSNSIHE
        970       980       990      1000      1010      1020      

             1020      1030      1040      1050      1060      1070
pF1KA1 LAVDLPDPQWKSSIQQKTDLMGFGYSLPDQNKGNNGGKGGKKKKNKNSSKPQKNNGSTWA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LAVDLPDPQWKSSIQQKTDLMGFGYSLPDQNKGNNGGKGGKKKKNKNSSKPQKNNGSTWA
       1030      1040      1050      1060      1070      1080      

             1080      1090      1100      1110      1120      1130
pF1KA1 NVPLPPPPVQPLPGTELEHYAVEQQENGYDSDSWCPPLPVQTYLHQGLEDELEEDDDRVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NVPLPPPPVQPLPGTELEHYAVEQQENGYDSDSWCPPLPVQTYLHQGLEDELEEDDDRVP
       1090      1100      1110      1120      1130      1140      

             1140      1150      1160      1170      1180      1190
pF1KA1 TPPVRGVASSPAISFGQQSTATLTPSPREEMQPMLQAHLDELTRAYQFDIAKQTWHIQSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TPPVRGVASSPAISFGQQSTATLTPSPREEMQPMLQAHLDELTRAYQFDIAKQTWHIQSN
       1150      1160      1170      1180      1190      1200      

             1200      1210      1220      1230      1240      1250
pF1KA1 NQPPQPPVPPLGYVSGALISDLETDVADDDADDEEEALEIPRPLRALDQTPGSSMDNLDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NQPPQPPVPPLGYVSGALISDLETDVADDDADDEEEALEIPRPLRALDQTPGSSMDNLDS
       1210      1220      1230      1240      1250      1260      

             1260      1270      1280      1290      1300      1310
pF1KA1 SVTGKAFTSSQRPRPTSPFSTDSNTSAALSQSQRPRPTKKHKGGRMDQQPALPHRREGMT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SVTGKAFTSSQRPRPTSPFSTDSNTSAALSQSQRPRPTKKHKGGRMDQQPALPHRREGMT
       1270      1280      1290      1300      1310      1320      

             1320      1330      1340      1350      1360      1370
pF1KA1 DEEALVPYSKPSFPSPGGHSSSGTASSKGSTGPRKTEVLRAGHQRNASDLLDIGYMGSNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DEEALVPYSKPSFPSPGGHSSSGTASSKGSTGPRKTEVLRAGHQRNASDLLDIGYMGSNS
       1330      1340      1350      1360      1370      1380      

               
pF1KA1 QGQFTGEL
       ::::::::
CCDS54 QGQFTGEL
       1390    

>>CCDS54610.1 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3               (1551 aa)
 initn: 3986 init1: 1608 opt: 4138  Z-score: 2491.4  bits: 473.6 E(32554): 1.9e-132
Smith-Waterman score: 4771; 53.7% identity (75.2% similar) in 1422 aa overlap (5-1332:10-1399)

                    10        20        30        40        50     
pF1KA1      MSLLMFTQLLLCGFLYVRVDGSRLRQEDFPPRIVEHPSDVIVSKGEPTTLNCKAE
                .:  . ::.       :::::::::::::::::::.:::::::.:::::::
CCDS54 MIAEPAHFYLFGLICLCS-------GSRLRQEDFPPRIVEHPSDLIVSKGEPATLNCKAE
               10               20        30        40        50   

          60        70        80        90       100       110     
pF1KA1 GRPTPTIEWYKDGERVETDKDDPRSHRMLLPSGSLFFLRIVHGRRSKPDEGSYVCVARNY
       ::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::: ::::::::
CCDS54 GRPTPTIEWYKGGERVETDKDDPRSHRMLLPSGSLFFLRIVHGRKSRPDEGVYVCVARNY
            60        70        80        90       100       110   

         120       130       140       150       160       170     
pF1KA1 LGEAVSRNASLEVALLRDDFRQNPTDVVVAAGEPAILECQPPRGHPEPTIYWKKDKVRID
       ::::::.:::::::.:::::::::.::.::.::::..::::::::::::: ::::   .:
CCDS54 LGEAVSHNASLEVAILRDDFRQNPSDVMVAVGEPAVMECQPPRGHPEPTISWKKDGSPLD
           120       130       140       150       160       170   

         180       190       200       210       220       230     
pF1KA1 DKEERISIRGGKLMISNTRKSDAGMYTCVGTNMVGERDSDPAELTVFERPTFLRRPINQV
       ::.:::.::::::::. ::::::: :.::::::::::.:. :::::.:::.:..:: : .
CCDS54 DKDERITIRGGKLMITYTRKSDAGKYVCVGTNMVGERESEVAELTVLERPSFVKRPSNLA
           180       190       200       210       220       230   

         240       250       260       270       280       290     
pF1KA1 VLEEEAVEFRCQVQGDPQPTVRWKKDDADLPRGRYDIKDDYTLRIKKTMSTDEGTYMCIA
       :  ....::.:...::: :::::.:::..::..::.:.::.::.:.:. . : :.: :.:
CCDS54 VTVDDSAEFKCEARGDPVPTVRWRKDDGELPKSRYEIRDDHTLKIRKVTAGDMGSYTCVA
           240       250       260       270       280       290   

         300       310          320       330       340       350  
pF1KA1 ENRVGKMEASATLTVRA---PPQFVVRPRDQIVAQGRTVTFPCETKGNPQPAVFWQKEGS
       :: ::: ::::::::..   ::.:::.::::.:: :::::: ::. ::::::.::..:::
CCDS54 ENMVGKAEASATLTVQVGSEPPHFVVKPRDQVVALGRTVTFQCEATGNPQPAIFWRREGS
           300       310       320       330       340       350   

            360       370       380       390       400       410  
pF1KA1 QNLLFPNQPQQPNSRCSVSPTGDLTITNIQRSDAGYYICQALTVAGSILAKAQLEVTDVL
       :::::  :: : .:: ::: ::::::::.::::.::::::.:.:::::..:: ::::::.
CCDS54 QNLLFSYQPPQSSSRFSVSQTGDLTITNVQRSDVGYYICQTLNVAGSIITKAYLEVTDVI
           360       370       380       390       400       410   

            420       430       440       450       460       470  
pF1KA1 TDRPPPIILQGPANQTLAVDGTALLKCKATGDPLPVISWLKEGFTFPGRDPRATIQEQGT
       .:::::.: :::.:::.::::: .:.: :::.:.:.: : :.:     .: :    :.:.
CCDS54 ADRPPPVIRQGPVNQTVAVDGTFVLSCVATGSPVPTILWRKDGVLVSTQDSRIKQLENGV
           420       430       440       450       460       470   

            480       490       500       510         520       530
pF1KA1 LQIKNLRISDTGTYTCVATSSSGETSWSAVLDVTESGATIS--KNYDLSDLPGPPSKPQV
       :::.  ...::: :::.:.. :::..::: ..: : :. ..  .  : . .:. ::::.:
CCDS54 LQIRYAKLGDTGRYTCIASTPSGEATWSAYIEVQEFGVPVQPPRPTDPNLIPSAPSKPEV
           480       490       500       510       520       530   

              540        550       560       570       580         
pF1KA1 TDVTKNSVTLSWQPG-TPGTLPASAYIIEAFSQSVSNSWQTVANHVKTTLYTVRGLRPNT
       :::..:.:::::::. . :. :.: :::::::.. ..::::::..:::   ...::.::.
CCDS54 TDVSRNTVTLSWQPNLNSGATPTS-YIIEAFSHASGSSWQTVAENVKTETSAIKGLKPNA
           540       550        560       570       580       590  

     590       600       610       620       630       640         
pF1KA1 IYLFMVRAINPQGLSDPSPMSDPVRTQDISPPAQGVDHRQVQKELGDVLVRLHNPVVLTP
       ::::.::: :  :.:::: .::::.:::. : .:::::.:::.:::.....::::.::. 
CCDS54 IYLFLVRAANAYGISDPSQISDPVKTQDVLPTSQGVDHKQVQRELGNAVLHLHNPTVLSS
            600       610       620       630       640       650  

     650       660       670       680       690       700         
pF1KA1 TTVQVTWTVDRQPQFIQGYRVMYRQTSGLQATSSWQNLDAKVPTERSAVLVNLKKGVTYE
       ....: ::::.: :.::::...:: ... .. :.:  .....:.. :.:. .:.:::.::
CCDS54 SSIEVHWTVDQQSQYIQGYKILYRPSGANHGESDWLVFEVRTPAKNSVVIPDLRKGVNYE
            660       670       680       690       700       710  

     710       720       730       740       750       760         
pF1KA1 IKVRPYFNEFQGMDSESKTVRTTEEAPSAPPQSVTVLTVGSYNSTSISVSWDPPPPDHQN
       ::.::.:::::: ::: : ..: :::::::::.::: . .. :.:.: :::.::: : ::
CCDS54 IKARPFFNEFQGADSEIKFAKTLEEAPSAPPQGVTV-SKNDGNGTAILVSWQPPPEDTQN
            720       730       740        750       760       770 

     770       780       790       800       810       820         
pF1KA1 GIIQEYKIWCLGNETRFHINKTVDAAIRSVIIGGLFPGIQYRVEVAASTSAGVGVKSEPQ
       :..::::.::::::::.:::::::..  ::.:  : :::.: :::::::.:: :::::::
CCDS54 GMVQEYKVWCLGNETRYHINKTVDGSTFSVVIPFLVPGIRYSVEVAASTGAGSGVKSEPQ
             780       790       800       810       820       830 

     830       840       850       860       870       880         
pF1KA1 PIIIGRRNEVVITENNNSITEQITDVVKQPAFIAGIGGACWVILMGFSIWLYWRRKKRKG
        : .  ... :  :.. :...::.:::::::::::::.:::.::: :::::: .::::.:
CCDS54 FIQLDAHGNPVSPEDQVSLAQQISDVVKQPAFIAGIGAACWIILMVFSIWLYRHRKKRNG
             840       850       860       870       880       890 

     890            900       910       920        930       940   
pF1KA1 L-SNYA----VTFQRGDGGLMSNGSRPGLLNAGDPS-YPWLADSWPATSLPVNNSNSGPN
       : :.::    ::.::: :  .:.:.:::::: ..:.  :::::.:: :.   :. . .  
CCDS54 LTSTYAGIRKVTYQRG-GEAVSSGGRPGLLNISEPAAQPWLADTWPNTGNNHNDCSISCC
             900        910       920       930       940       950

           950          960             970       980       990    
pF1KA1 EIGNFGRGD---VLPPVPGQGDKTATM------LSDGAIYSSIDFTTKTSYNSSSQITQA
         :: : .:   .    :::    ::       ::..   .: : . .  ..  .:  : 
CCDS54 TAGN-GNSDSNLTTYSRPGQPTPYATTQLIQSNLSNNMNNGSGD-SGEKHWKPLGQQKQE
               960       970       980       990       1000        

         1000      1010          1020      1030      1040      1050
pF1KA1 TPYATTQILHSNSIHE--LAVDLPDPQ--WKSSIQQKTDLMGFGYSLPDQNKGNNGGKGG
       .  .  .:...:....   : :   :   ...: .:.:   : .:.  :......:..: 
CCDS54 VAPVQYNIVEQNKLNKDYRANDTVPPTIPYNQSYDQNT---GGSYNSSDRGSSTSGSQG-
     1010      1020      1030      1040         1050      1060     

             1060      1070      1080      1090      1100      1110
pF1KA1 KKKKNKNSSKPQKNNGSTWANVPLPPPPVQPLPGTELEHYAVEQQENGYDSDSWCPPLPV
        .::.  . :  :..: .::.. :::::..: : .. :.: .  .:. ::..  ::  :.
CCDS54 -HKKGARTPKVPKQGGMNWADL-LPPPPAHPPPHSNSEEYNISVDES-YDQEMPCPVPPA
          1070      1080       1090      1100       1110      1120 

             1120       1130      1140       1150      1160        
pF1KA1 QTYLHQGLEDELEEDDD-RVPTPPVRGVASSPA-ISFGQQSTATLTPSPREEMQPMLQAH
       . ::.:   :::::..: : :::::::.::::: .:...::::::::::.::.:::::  
CCDS54 RMYLQQ---DELEEEEDERGPTPPVRGAASSPAAVSYSHQSTATLTPSPQEELQPMLQDC
               1130      1140      1150      1160      1170        

     1170      1180      1190      1200        1210         1220   
pF1KA1 LDELTRAYQFDIAKQTWHIQSNNQPPQPPVPP--LGYVSGALISDLETDVAD---DDADD
        .: :  .: .  ..   . :   ::.:  ::   ::.:: :.::..::. .   :.:: 
CCDS54 PEE-TGHMQHQPDRRRQPV-SPPPPPRPISPPHTYGYISGPLVSDMDTDAPEEEEDEADM
     1180       1190       1200      1210      1220      1230      

          1230       1240      1250                                
pF1KA1 EEEALEIPRPL-RALDQTPGSSMDNLDSSVTG----------------------------
       :   ..  : : :.:.:::.::. .:.:::::                            
CCDS54 EVAKMQTRRLLLRGLEQTPASSVGDLESSVTGSMINGWGSASEEDNISSGRSSVSSSDGS
       1240      1250      1260      1270      1280      1290      

                                          1260      1270      1280 
pF1KA1 ---------------------------------KAFTSSQRPRPTSPFSTDSNTSAALSQ
                                        . : .:: :::::: ::::: :::. :
CCDS54 FFTDADFAQAVAAAAEYAGLKVARRQMQDAAGRRHFHASQCPRPTSPVSTDSNMSAAVMQ
       1300      1310      1320      1330      1340      1350      

            1290      1300      1310      1320      1330      1340 
pF1KA1 SQRPRPTKKHKGGRMDQQPALPHRREGMTDEEALVPYSKPSFPSPGGHSSSGTASSKGST
       . ::    ::. :..        ::: .::.    :   :.. :: ..:..         
CCDS54 KTRPAKKLKHQPGHL--------RRETYTDDLPPPPVPPPAIKSPTAQSKTQLEVRPVVV
       1360      1370              1380      1390      1400        

            1350      1360      1370                               
pF1KA1 GPRKTEVLRAGHQRNASDLLDIGYMGSNSQGQFTGEL                       
                                                                   
CCDS54 PKLPSMDARTDRSSDRKGSSYKGREVLDGRQVVDMRTNPGDPREAQEQQNDGKGRGNKAA
     1410      1420      1430      1440      1450      1460        

>>CCDS46872.2 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3               (1606 aa)
 initn: 3986 init1: 1608 opt: 4100  Z-score: 2468.5  bits: 469.4 E(32554): 3.6e-131
Smith-Waterman score: 4752; 54.9% identity (77.6% similar) in 1361 aa overlap (5-1279:10-1352)

                    10        20        30        40        50     
pF1KA1      MSLLMFTQLLLCGFLYVRVDGSRLRQEDFPPRIVEHPSDVIVSKGEPTTLNCKAE
                .:  . ::.       :::::::::::::::::::.:::::::.:::::::
CCDS46 MIAEPAHFYLFGLICLCS-------GSRLRQEDFPPRIVEHPSDLIVSKGEPATLNCKAE
               10               20        30        40        50   

          60        70        80        90       100       110     
pF1KA1 GRPTPTIEWYKDGERVETDKDDPRSHRMLLPSGSLFFLRIVHGRRSKPDEGSYVCVARNY
       ::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::: ::::::::
CCDS46 GRPTPTIEWYKGGERVETDKDDPRSHRMLLPSGSLFFLRIVHGRKSRPDEGVYVCVARNY
            60        70        80        90       100       110   

         120       130       140       150       160       170     
pF1KA1 LGEAVSRNASLEVALLRDDFRQNPTDVVVAAGEPAILECQPPRGHPEPTIYWKKDKVRID
       ::::::.:::::::.:::::::::.::.::.::::..::::::::::::: ::::   .:
CCDS46 LGEAVSHNASLEVAILRDDFRQNPSDVMVAVGEPAVMECQPPRGHPEPTISWKKDGSPLD
           120       130       140       150       160       170   

         180       190       200       210       220       230     
pF1KA1 DKEERISIRGGKLMISNTRKSDAGMYTCVGTNMVGERDSDPAELTVFERPTFLRRPINQV
       ::.:::.::::::::. ::::::: :.::::::::::.:. :::::.:::.:..:: : .
CCDS46 DKDERITIRGGKLMITYTRKSDAGKYVCVGTNMVGERESEVAELTVLERPSFVKRPSNLA
           180       190       200       210       220       230   

         240       250       260       270       280       290     
pF1KA1 VLEEEAVEFRCQVQGDPQPTVRWKKDDADLPRGRYDIKDDYTLRIKKTMSTDEGTYMCIA
       :  ....::.:...::: :::::.:::..::..::.:.::.::.:.:. . : :.: :.:
CCDS46 VTVDDSAEFKCEARGDPVPTVRWRKDDGELPKSRYEIRDDHTLKIRKVTAGDMGSYTCVA
           240       250       260       270       280       290   

         300       310          320       330       340       350  
pF1KA1 ENRVGKMEASATLTVRA---PPQFVVRPRDQIVAQGRTVTFPCETKGNPQPAVFWQKEGS
       :: ::: ::::::::..   ::.:::.::::.:: :::::: ::. ::::::.::..:::
CCDS46 ENMVGKAEASATLTVQVGSEPPHFVVKPRDQVVALGRTVTFQCEATGNPQPAIFWRREGS
           300       310       320       330       340       350   

            360       370       380       390       400       410  
pF1KA1 QNLLFPNQPQQPNSRCSVSPTGDLTITNIQRSDAGYYICQALTVAGSILAKAQLEVTDVL
       :::::  :: : .:: ::: ::::::::.::::.::::::.:.:::::..:: ::::::.
CCDS46 QNLLFSYQPPQSSSRFSVSQTGDLTITNVQRSDVGYYICQTLNVAGSIITKAYLEVTDVI
           360       370       380       390       400       410   

            420       430       440       450       460       470  
pF1KA1 TDRPPPIILQGPANQTLAVDGTALLKCKATGDPLPVISWLKEGFTFPGRDPRATIQEQGT
       .:::::.: :::.:::.::::: .:.: :::.:.:.: : :.:     .: :    :.:.
CCDS46 ADRPPPVIRQGPVNQTVAVDGTFVLSCVATGSPVPTILWRKDGVLVSTQDSRIKQLENGV
           420       430       440       450       460       470   

            480       490       500       510         520       530
pF1KA1 LQIKNLRISDTGTYTCVATSSSGETSWSAVLDVTESGATIS--KNYDLSDLPGPPSKPQV
       :::.  ...::: :::.:.. :::..::: ..: : :. ..  .  : . .:. ::::.:
CCDS46 LQIRYAKLGDTGRYTCIASTPSGEATWSAYIEVQEFGVPVQPPRPTDPNLIPSAPSKPEV
           480       490       500       510       520       530   

              540        550       560       570       580         
pF1KA1 TDVTKNSVTLSWQPG-TPGTLPASAYIIEAFSQSVSNSWQTVANHVKTTLYTVRGLRPNT
       :::..:.:::::::. . :. :.: :::::::.. ..::::::..:::   ...::.::.
CCDS46 TDVSRNTVTLSWQPNLNSGATPTS-YIIEAFSHASGSSWQTVAENVKTETSAIKGLKPNA
           540       550        560       570       580       590  

     590       600       610       620       630       640         
pF1KA1 IYLFMVRAINPQGLSDPSPMSDPVRTQDISPPAQGVDHRQVQKELGDVLVRLHNPVVLTP
       ::::.::: :  :.:::: .::::.:::. : .:::::.:::.:::.....::::.::. 
CCDS46 IYLFLVRAANAYGISDPSQISDPVKTQDVLPTSQGVDHKQVQRELGNAVLHLHNPTVLSS
            600       610       620       630       640       650  

     650       660       670       680       690       700         
pF1KA1 TTVQVTWTVDRQPQFIQGYRVMYRQTSGLQATSSWQNLDAKVPTERSAVLVNLKKGVTYE
       ....: ::::.: :.::::...:: ... .. :.:  .....:.. :.:. .:.:::.::
CCDS46 SSIEVHWTVDQQSQYIQGYKILYRPSGANHGESDWLVFEVRTPAKNSVVIPDLRKGVNYE
            660       670       680       690       700       710  

     710       720       730       740       750       760         
pF1KA1 IKVRPYFNEFQGMDSESKTVRTTEEAPSAPPQSVTVLTVGSYNSTSISVSWDPPPPDHQN
       ::.::.:::::: ::: : ..: :::::::::.::: . .. :.:.: :::.::: : ::
CCDS46 IKARPFFNEFQGADSEIKFAKTLEEAPSAPPQGVTV-SKNDGNGTAILVSWQPPPEDTQN
            720       730       740        750       760       770 

     770       780       790       800       810       820         
pF1KA1 GIIQEYKIWCLGNETRFHINKTVDAAIRSVIIGGLFPGIQYRVEVAASTSAGVGVKSEPQ
       :..::::.::::::::.:::::::..  ::.:  : :::.: :::::::.:: :::::::
CCDS46 GMVQEYKVWCLGNETRYHINKTVDGSTFSVVIPFLVPGIRYSVEVAASTGAGSGVKSEPQ
             780       790       800       810       820       830 

     830       840       850       860       870       880         
pF1KA1 PIIIGRRNEVVITENNNSITEQITDVVKQPAFIAGIGGACWVILMGFSIWLYWRRKKRKG
        : .  ... :  :.. :...::.:::::::::::::.:::.::: :::::: .::::.:
CCDS46 FIQLDAHGNPVSPEDQVSLAQQISDVVKQPAFIAGIGAACWIILMVFSIWLYRHRKKRNG
             840       850       860       870       880       890 

     890            900       910       920        930             
pF1KA1 L-SNYA----VTFQRGDGGLMSNGSRPGLLNAGDPS-YPWLADSWPATSLPVN-------
       : :.::    ::.::: :  .:.:.:::::: ..:.  :::::.:: :.   :       
CCDS46 LTSTYAGIRKVTYQRG-GEAVSSGGRPGLLNISEPAAQPWLADTWPNTGNNHNDCSISCC
             900        910       920       930       940       950

           940       950        960         970       980          
pF1KA1 ---NSNSGPNEIGNFGR-GDVLPPVPGQGD--KTATMLSDGAIYSSIDFTTKT----SYN
          :.::  : . ...: .: .    .: :  .:  :: ....:...:...:     ..:
CCDS46 TAGNGNSDSN-LTTYSRPADCIANYNNQLDNKQTNLMLPESTVYGDVDLSNKINEMKTFN
              960        970       980       990      1000         

        990              1000         1010      1020      1030     
pF1KA1 SSSQIT--------QATPYATTQILHSN---SIHELAVDLPDPQWKSSIQQKTDLMGFGY
       : .           : :::::::...::   .... . :  . .::   ::: ..    :
CCDS46 SPNLKDGRFVNPSGQPTPYATTQLIQSNLSNNMNNGSGDSGEKHWKPLGQQKQEVAPVQY
    1010      1020      1030      1040      1050      1060         

        1040                                      1050      1060   
pF1KA1 SLPDQNK----------------------GNNGG------KG----GKKKKNKNSSKPQ-
       .. .:::                       :.::      .:    :.. ..:..  :. 
CCDS46 NIVEQNKLNKDYRANDTVPPTIPYNQSYDQNTGGSYNSSDRGSSTSGSQGHKKGARTPKV
    1070      1080      1090      1100      1110      1120         

            1070      1080      1090      1100      1110      1120 
pF1KA1 -KNNGSTWANVPLPPPPVQPLPGTELEHYAVEQQENGYDSDSWCPPLPVQTYLHQGLEDE
        :..: .::.. :::::..: : .. :.: .  .:. ::..  ::  :.. ::.:   ::
CCDS46 PKQGGMNWADL-LPPPPAHPPPHSNSEEYNISVDES-YDQEMPCPVPPARMYLQQ---DE
    1130      1140       1150      1160       1170      1180       

             1130      1140       1150      1160      1170         
pF1KA1 LEEDDD-RVPTPPVRGVASSPA-ISFGQQSTATLTPSPREEMQPMLQAHLDELTRAYQFD
       :::..: : :::::::.::::: .:...::::::::::.::.:::::    : :  .: .
CCDS46 LEEEEDERGPTPPVRGAASSPAAVSYSHQSTATLTPSPQEELQPMLQ-DCPEETGHMQHQ
         1190      1200      1210      1220      1230       1240   

    1180      1190      1200        1210         1220      1230    
pF1KA1 IAKQTWHIQSNNQPPQPPVPP--LGYVSGALISDLETDVAD---DDADDEEEALEIPRPL
         ..   . :   ::.:  ::   ::.:: :.::..::. .   :.:: :   ..  : :
CCDS46 PDRRRQPV-SPPPPPRPISPPHTYGYISGPLVSDMDTDAPEEEEDEADMEVAKMQTRRLL
          1250       1260      1270      1280      1290      1300  

          1240      1250          1260      1270      1280         
pF1KA1 -RALDQTPGSSMDNLDSSVTGKAF----TSSQRPRPTSPFSTDSNTSAALSQSQRPRPTK
        :.:.:::.::. .:.:::::. .    ..:..   .:  :. :......          
CCDS46 LRGLEQTPASSVGDLESSVTGSMINGWGSASEEDNISSGRSSVSSSDGSFFTDADFAQAV
           1310      1320      1330      1340      1350      1360  

    1290      1300      1310      1320      1330      1340         
pF1KA1 KHKGGRMDQQPALPHRREGMTDEEALVPYSKPSFPSPGGHSSSGTASSKGSTGPRKTEVL
                                                                   
CCDS46 AAAAEYAGLKVARRQMQDAAGRRHFHASQCPRPTSPVSTDSNMSAAVMQKTRPAKKLKHQ
           1370      1380      1390      1400      1410      1420  

>>CCDS54611.1 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3               (1651 aa)
 initn: 4052 init1: 2501 opt: 4053  Z-score: 2440.2  bits: 464.2 E(32554): 1.3e-129
Smith-Waterman score: 4748; 55.1% identity (77.6% similar) in 1351 aa overlap (21-1279:58-1397)

                         10        20        30        40        50
pF1KA1           MSLLMFTQLLLCGFLYVRVDGSRLRQEDFPPRIVEHPSDVIVSKGEPTTL
                                     :::::::::::::::::::.:::::::.::
CCDS54 IPDPEDVERGNDHGTPIPTSDNDDNSLGYTGSRLRQEDFPPRIVEHPSDLIVSKGEPATL
        30        40        50        60        70        80       

               60        70        80        90       100       110
pF1KA1 NCKAEGRPTPTIEWYKDGERVETDKDDPRSHRMLLPSGSLFFLRIVHGRRSKPDEGSYVC
       :::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::: :::
CCDS54 NCKAEGRPTPTIEWYKGGERVETDKDDPRSHRMLLPSGSLFFLRIVHGRKSRPDEGVYVC
        90       100       110       120       130       140       

              120       130       140       150       160       170
pF1KA1 VARNYLGEAVSRNASLEVALLRDDFRQNPTDVVVAAGEPAILECQPPRGHPEPTIYWKKD
       :::::::::::.:::::::.:::::::::.::.::.::::..::::::::::::: ::::
CCDS54 VARNYLGEAVSHNASLEVAILRDDFRQNPSDVMVAVGEPAVMECQPPRGHPEPTISWKKD
       150       160       170       180       190       200       

              180       190       200       210       220       230
pF1KA1 KVRIDDKEERISIRGGKLMISNTRKSDAGMYTCVGTNMVGERDSDPAELTVFERPTFLRR
          .:::.:::.::::::::. ::::::: :.::::::::::.:. :::::.:::.:..:
CCDS54 GSPLDDKDERITIRGGKLMITYTRKSDAGKYVCVGTNMVGERESEVAELTVLERPSFVKR
       210       220       230       240       250       260       

              240       250       260       270       280       290
pF1KA1 PINQVVLEEEAVEFRCQVQGDPQPTVRWKKDDADLPRGRYDIKDDYTLRIKKTMSTDEGT
       : : .:  ....::.:...::: :::::.:::..::..::.:.::.::.:.:. . : :.
CCDS54 PSNLAVTVDDSAEFKCEARGDPVPTVRWRKDDGELPKSRYEIRDDHTLKIRKVTAGDMGS
       270       280       290       300       310       320       

              300       310       320       330       340       350
pF1KA1 YMCIAENRVGKMEASATLTVRAPPQFVVRPRDQIVAQGRTVTFPCETKGNPQPAVFWQKE
       : :.::: ::: ::::::::. ::.:::.::::.:: :::::: ::. ::::::.::..:
CCDS54 YTCVAENMVGKAEASATLTVQEPPHFVVKPRDQVVALGRTVTFQCEATGNPQPAIFWRRE
       330       340       350       360       370       380       

              360       370       380       390       400       410
pF1KA1 GSQNLLFPNQPQQPNSRCSVSPTGDLTITNIQRSDAGYYICQALTVAGSILAKAQLEVTD
       :::::::  :: : .:: ::: ::::::::.::::.::::::.:.:::::..:: :::::
CCDS54 GSQNLLFSYQPPQSSSRFSVSQTGDLTITNVQRSDVGYYICQTLNVAGSIITKAYLEVTD
       390       400       410       420       430       440       

              420       430       440       450       460       470
pF1KA1 VLTDRPPPIILQGPANQTLAVDGTALLKCKATGDPLPVISWLKEGFTFPGRDPRATIQEQ
       :..:::::.: :::.:::.::::: .:.: :::.:.:.: : :.:     .: :    :.
CCDS54 VIADRPPPVIRQGPVNQTVAVDGTFVLSCVATGSPVPTILWRKDGVLVSTQDSRIKQLEN
       450       460       470       480       490       500       

              480       490       500       510         520        
pF1KA1 GTLQIKNLRISDTGTYTCVATSSSGETSWSAVLDVTESGATIS--KNYDLSDLPGPPSKP
       :.:::.  ...::: :::.:.. :::..::: ..: : :. ..  .  : . .:. ::::
CCDS54 GVLQIRYAKLGDTGRYTCIASTPSGEATWSAYIEVQEFGVPVQPPRPTDPNLIPSAPSKP
       510       520       530       540       550       560       

      530       540        550       560       570       580       
pF1KA1 QVTDVTKNSVTLSWQPG-TPGTLPASAYIIEAFSQSVSNSWQTVANHVKTTLYTVRGLRP
       .::::..:.:::::::. . :. :.: :::::::.. ..::::::..:::   ...::.:
CCDS54 EVTDVSRNTVTLSWQPNLNSGATPTS-YIIEAFSHASGSSWQTVAENVKTETSAIKGLKP
       570       580       590        600       610       620      

       590       600       610       620       630       640       
pF1KA1 NTIYLFMVRAINPQGLSDPSPMSDPVRTQDISPPAQGVDHRQVQKELGDVLVRLHNPVVL
       :.::::.::: :  :.:::: .::::.:::. : .:::::.:::.:::.....::::.::
CCDS54 NAIYLFLVRAANAYGISDPSQISDPVKTQDVLPTSQGVDHKQVQRELGNAVLHLHNPTVL
        630       640       650       660       670       680      

       650       660       670       680       690       700       
pF1KA1 TPTTVQVTWTVDRQPQFIQGYRVMYRQTSGLQATSSWQNLDAKVPTERSAVLVNLKKGVT
       . ....: ::::.: :.::::...:: ... .. :.:  .....:.. :.:. .:.:::.
CCDS54 SSSSIEVHWTVDQQSQYIQGYKILYRPSGANHGESDWLVFEVRTPAKNSVVIPDLRKGVN
        690       700       710       720       730       740      

       710       720       730       740       750       760       
pF1KA1 YEIKVRPYFNEFQGMDSESKTVRTTEEAPSAPPQSVTVLTVGSYNSTSISVSWDPPPPDH
       ::::.::.:::::: ::: : ..: :::::::::.::: . .. :.:.: :::.::: : 
CCDS54 YEIKARPFFNEFQGADSEIKFAKTLEEAPSAPPQGVTV-SKNDGNGTAILVSWQPPPEDT
        750       760       770       780        790       800     

       770       780       790       800       810       820       
pF1KA1 QNGIIQEYKIWCLGNETRFHINKTVDAAIRSVIIGGLFPGIQYRVEVAASTSAGVGVKSE
       :::..::::.::::::::.:::::::..  ::.:  : :::.: :::::::.:: :::::
CCDS54 QNGMVQEYKVWCLGNETRYHINKTVDGSTFSVVIPFLVPGIRYSVEVAASTGAGSGVKSE
         810       820       830       840       850       860     

       830       840       850       860       870       880       
pF1KA1 PQPIIIGRRNEVVITENNNSITEQITDVVKQPAFIAGIGGACWVILMGFSIWLYWRRKKR
       :: : .  ... :  :.. :...::.:::::::::::::.:::.::: :::::: .::::
CCDS54 PQFIQLDAHGNPVSPEDQVSLAQQISDVVKQPAFIAGIGAACWIILMVFSIWLYRHRKKR
         870       880       890       900       910       920     

       890                     900       910       920        930  
pF1KA1 KGL-SNYA-------------VTFQRGDGGLMSNGSRPGLLNAGDPS-YPWLADSWPATS
       .:: :.::             ::.::: :  .:.:.:::::: ..:.  :::::.:: :.
CCDS54 NGLTSTYAGIRKVPSFTFTPTVTYQRG-GEAVSSGGRPGLLNISEPAAQPWLADTWPNTG
         930       940       950        960       970       980    

                      940       950        960         970         
pF1KA1 LPVN----------NSNSGPNEIGNFGR-GDVLPPVPGQGD--KTATMLSDGAIYSSIDF
          :          :.::  : . ...: .: .    .: :  .:  :: ....:...:.
CCDS54 NNHNDCSISCCTAGNGNSDSN-LTTYSRPADCIANYNNQLDNKQTNLMLPESTVYGDVDL
          990      1000       1010      1020      1030      1040   

     980           990              1000         1010      1020    
pF1KA1 TTKT----SYNSSSQIT--------QATPYATTQILHSN---SIHELAVDLPDPQWKSSI
       ..:     ..:: .           : :::::::...::   .... . :  . .::   
CCDS54 SNKINEMKTFNSPNLKDGRFVNPSGQPTPYATTQLIQSNLSNNMNNGSGDSGEKHWKPLG
          1050      1060      1070      1080      1090      1100   

         1030      1040                                      1050  
pF1KA1 QQKTDLMGFGYSLPDQNK----------------------GNNGG------KG----GKK
       ::: ..    :.. .:::                       :.::      .:    :..
CCDS54 QQKQEVAPVQYNIVEQNKLNKDYRANDTVPPTIPYNQSYDQNTGGSYNSSDRGSSTSGSQ
          1110      1120      1130      1140      1150      1160   

           1060        1070      1080      1090      1100      1110
pF1KA1 KKNKNSSKPQ--KNNGSTWANVPLPPPPVQPLPGTELEHYAVEQQENGYDSDSWCPPLPV
        ..:..  :.  :..: .::.. :::::..: : .. :.: .  .:. ::..  ::  :.
CCDS54 GHKKGARTPKVPKQGGMNWADL-LPPPPAHPPPHSNSEEYNISVDES-YDQEMPCPVPPA
          1170      1180       1190      1200       1210      1220 

             1120       1130      1140       1150      1160        
pF1KA1 QTYLHQGLEDELEEDDD-RVPTPPVRGVASSPA-ISFGQQSTATLTPSPREEMQPMLQAH
       . ::.:   :::::..: : :::::::.::::: .:...::::::::::.::.:::::  
CCDS54 RMYLQQ---DELEEEEDERGPTPPVRGAASSPAAVSYSHQSTATLTPSPQEELQPMLQ-D
               1230      1240      1250      1260      1270        

     1170      1180      1190      1200        1210         1220   
pF1KA1 LDELTRAYQFDIAKQTWHIQSNNQPPQPPVPP--LGYVSGALISDLETDVAD---DDADD
         : :  .: .  ..   . :   ::.:  ::   ::.:: :.::..::. .   :.:: 
CCDS54 CPEETGHMQHQPDRRRQPV-SPPPPPRPISPPHTYGYISGPLVSDMDTDAPEEEEDEADM
      1280      1290       1300      1310      1320      1330      

          1230       1240      1250          1260      1270        
pF1KA1 EEEALEIPRPL-RALDQTPGSSMDNLDSSVTGKAF----TSSQRPRPTSPFSTDSNTSAA
       :   ..  : : :.:.:::.::. .:.:::::. .    ..:..   .:  :. :.....
CCDS54 EVAKMQTRRLLLRGLEQTPASSVGDLESSVTGSMINGWGSASEEDNISSGRSSVSSSDGS
       1340      1350      1360      1370      1380      1390      

     1280      1290      1300      1310      1320      1330        
pF1KA1 LSQSQRPRPTKKHKGGRMDQQPALPHRREGMTDEEALVPYSKPSFPSPGGHSSSGTASSK
       .                                                           
CCDS54 FFTDADFAQAVAAAAEYAGLKVARRQMQDAAGRRHFHASQCPRPTSPVSTDSNMSAAVMQ
       1400      1410      1420      1430      1440      1450      

>>CCDS44755.1 ROBO3 gene_id:64221|Hs108|chr11             (1386 aa)
 initn: 3435 init1: 2137 opt: 3375  Z-score: 2035.1  bits: 389.0 E(32554): 4.9e-107
Smith-Waterman score: 3654; 44.6% identity (68.5% similar) in 1366 aa overlap (19-1346:52-1364)

                           10        20        30        40        
pF1KA1             MSLLMFTQLLLCGFLYVRVDGSRLRQEDFPPRIVEHPSDVIVSKGEPT
                                     ..:::.  ::  :::::.: :..::.:::.
CCDS44 DISNSSELLLGFNSSLAALNHTLLPPGDPSLNGSRVGPEDAMPRIVEQPPDLLVSRGEPA
              30        40        50        60        70        80 

       50        60        70        80        90       100        
pF1KA1 TLNCKAEGRPTPTIEWYKDGERVETDKDDPRSHRMLLPSGSLFFLRIVHGRRSKPDEGSY
       :: :.::::: :.:::::.: :: : ..:::.::.:::::.::: :::::::..:::: :
CCDS44 TLPCRAEGRPRPNIEWYKNGARVATVREDPRAHRLLLPSGALFFPRIVHGRRARPDEGVY
              90       100       110       120       130       140 

      110       120       130       140       150       160        
pF1KA1 VCVARNYLGEAVSRNASLEVALLRDDFRQNPTDVVVAAGEPAILECQPPRGHPEPTIYWK
       .:::::::: :.:::::::::.:::::::.: .::::.::::.::: ::::::::.. :.
CCDS44 TCVARNYLGAAASRNASLEVAVLRDDFRQSPGNVVVAVGEPAVLECVPPRGHPEPSVSWR
             150       160       170       180       190       200 

      170       180       190       200       210       220        
pF1KA1 KDKVRIDDKEERISIRGGKLMISNTRKSDAGMYTCVGTNMVGERDSDPAELTVFERPTFL
       :: .:. ..: ::.:::::::.:.: :::::::.::..::.:::.:  ::. :.:::.::
CCDS44 KDGARLKEEEGRITIRGGKLMMSHTLKSDAGMYVCVASNMAGERESAAAEVMVLERPSFL
             210       220       230       240       250       260 

      230       240       250       260       270       280        
pF1KA1 RRPINQVVLEEEAVEFRCQVQGDPQPTVRWKKDDADLPRGRYDIKDDYTLRIKKTMSTDE
       :::.::::: .  : : :.:.::: : .::.:.:..:: :::.:..:..: : .. . ::
CCDS44 RRPVNQVVLADAPVTFLCEVKGDPPPRLRWRKEDGELPTGRYEIRSDHSLWIGHVSAEDE
             270       280       290       300       310       320 

      290       300       310       320       330       340        
pF1KA1 GTYMCIAENRVGKMEASATLTVRAPPQFVVRPRDQIVAQGRTVTFPCETKGNPQPAVFWQ
       ::: :.::: ::. :::..:.:..:::.:..:.::..: :..:.: ::::::: ::.:::
CCDS44 GTYTCVAENSVGRAEASGSLSVHVPPQLVTQPQDQMAAPGESVAFQCETKGNPPPAIFWQ
             330       340       350       360       370       380 

      350       360       370       380       390       400        
pF1KA1 KEGSQNLLFPNQPQQPNSRCSVSPTGDLTITNIQRSDAGYYICQALTVAGSILAKAQLEV
       ::::: ::::.:  ::..: :::: :.:.:: .::.:::::.:::..::::::::: ::.
CCDS44 KEGSQVLLFPSQSLQPTGRFSVSPRGQLNITAVQRGDAGYYVCQAVSVAGSILAKALLEI
             390       400       410       420       430       440 

      410       420       430       440       450       460        
pF1KA1 TDVLTDRPPPIILQGPANQTLAVDGTALLKCKATGDPLPVISWLKEGFTFPGRDPRATIQ
         .  :  ::.::::::::::.. ... : :..::.: : . : :.:  . : : .   .
CCDS44 KGASLDGLPPVILQGPANQTLVLGSSVWLPCRVTGNPQPSVRWKKDGQWLQGDDLQFKTM
             450       460       470       480       490       500 

      470       480       490       500        510       520       
pF1KA1 EQGTLQIKNLRISDTGTYTCVATSSSGETSWSAVLDVTES-GATISKNYDLSDLPGPPSK
        .::: : :..  : : :.::: ::.::..::. : . :. :.. .   . :. :: ::.
CCDS44 ANGTLYIANVQEMDMGFYSCVAKSSTGEATWSGWLKMREDWGVSPDPPTEPSSPPGAPSQ
             510       520       530       540       550       560 

       530       540       550       560       570       580       
pF1KA1 PQVTDVTKNSVTLSWQPGTPGTLPASAYIIEAFSQSVSNSWQTVANHVKTTLYTVRGLRP
       : ::..::::.::.:.:.      ...:.::::: ...:.:.:::. :.   .:: ::.:
CCDS44 PVVTEITKNSITLTWKPNPQTGAAVTSYVIEAFSPAAGNTWRTVADGVQLETHTVSGLQP
             570       580       590       600       610       620 

       590       600       610       620       630       640       
pF1KA1 NTIYLFMVRAINPQGLSDPSPMSDPVRTQDISPPAQGVDHRQVQKELGDVLVRLHNPVVL
       ::::::.:::..  :::.:::.:.:::::: ::     :  . :. :..: :::..:.::
CCDS44 NTIYLFLVRAVGAWGLSEPSPVSEPVRTQDSSPSRPVEDPWRGQQGLAEVAVRLQEPIVL
             630       640       650       660       670       680 

       650       660       670       680       690       700       
pF1KA1 TPTTVQVTWTVDRQPQFIQGYRVMYRQTSGLQATSSWQNLDAKVPTERSAVLVNLKKGVT
        : :.::.::::   :..::.:: .: ..: .. .::  :: . :...:.:: .:  :. 
CCDS44 GPRTLQVSWTVDGPVQLVQGFRVSWR-VAGPEG-GSWTMLDLQSPSQQSTVLRGLPPGTQ
             690       700        710        720       730         

       710       720       730       740       750       760       
pF1KA1 YEIKVRPYFNEFQGMDSESKTVRTTEEAPSAPPQSVTVLTVGSYNSTSISVSWDPPPPDH
        .:::.   .:  : .: : :    :::::.:::.:.:   :. :: ::.:::.:: :..
CCDS44 IQIKVQAQGQEGLGAESLSVTRSIPEEAPSGPPQGVAVALGGDGNS-SITVSWEPPLPSQ
     740       750       760       770       780        790        

       770       780       790       800       810       820       
pF1KA1 QNGIIQEYKIWCLGNETRFHINKTVDAAIRSVIIGGLFPGIQYRVEVAASTSAGVGVKSE
       :::.: ::.:::::::.:::.:... .  ::... :: ::. ::. :::.::::::: : 
CCDS44 QNGVITEYQIWCLGNESRFHLNRSAAGWARSAMLRGLVPGLLYRTLVAAATSAGVGVPSA
      800       810       820       830       840       850        

       830       840        850       860       870       880      
pF1KA1 PQPIIIGRRNEVVI-TENNNSITEQITDVVKQPAFIAGIGGACWVILMGFSIWLYWRRKK
       :  . .    ..    : . ... ... :...:::.:: :.:: ..:.:.   ::::::.
CCDS44 PVLVQLPSPPDLEPGLEVGAGLAVRLARVLREPAFLAGSGAACGALLLGLCAALYWRRKQ
      860       870       880       890       900       910        

        890               900       910       920       930        
pF1KA1 RKGLSNY--------AVTFQRGDGGLMSNGSRPGLLNAGDPSYPWLADSWPATSLPVNNS
       :: ::.:        ::.: ...: : . .::: . . :   : :::::::  :   . :
CCDS44 RKELSHYTASFAYTPAVSFPHSEG-LSGASSRPPM-GLGPAPYSWLADSWPHPSR--SPS
      920       930       940        950        960       970      

      940       950       960       970       980       990        
pF1KA1 NSGPNEIGNFGRGDVLPPVPGQGDKTATMLSDGAIYSSIDFTTKTSYNSSSQITQAT--P
        . :       ::.  :  :   :.   . ....:   .  :.. .   .   . .:  :
CCDS44 AQEP-------RGSCCPSNPDPDDR---YYNEAGISLYLAQTARGTAAPGEGPVYSTIDP
                 980       990         1000      1010      1020    

       1000       1010      1020      1030      1040      1050     
pF1KA1 YATT-QILHSNSIHELAVDLPDPQWKSSIQQKTDLMGFGYSLPDQNKGNNGGKGGKKKKN
        .   : .:..  .. . ::  : :..            :. :. ..:..:.:::: :  
CCDS44 AGEELQTFHGGFPQHPSGDL-GP-WSQ------------YAPPEWSQGDSGAKGGKVKL-
         1030      1040                    1050      1060          

        1060      1070      1080        1090      1100      1110   
pF1KA1 KNSSKPQKNNGSTWANVPLPPPPVQPLPGTELE--HYAVEQQENGYDSDSWCPPLPVQTY
          .:: .  . .: .. :::::    :. ::   .   :. :.. . . ::::.: ...
CCDS44 --LGKPVQMPSLNWPEA-LPPPP----PSCELSCLEGPEEELEGSSEPEEWCPPMPERSH
      1070      1080           1090      1100      1110      1120  

          1120      1130      1140      1150      1160       1170  
pF1KA1 LHQGLEDELEEDDDRVPTPPVRGVASSPAISFGQQSTATLTPSPREEMQPMLQA-HLDEL
       : .        ..    . : :  . ::. :.:::::::::::: .  ::  .  :: ..
CCDS44 LTE------PSSSGGCLVTPSRRETPSPTPSYGQQSTATLTPSPPDPPQPPTDMPHLHQM
                 1130      1140      1150      1160      1170      

           1180      1190        1200      1210       1220         
pF1KA1 TRAYQFDIAKQTWHIQSNNQPPQP--PVPPLGYVSGALISD-LETDVADDDADDE-----
        :   .  ..      : .::      . : :  .:   :  :  . : . :..      
CCDS44 PRRVPLGPSSPL----SVSQPMLGIREARPAGLGAGPAASPHLSPSPAPSTASSAPGRTW
       1180          1190      1200      1210      1220      1230  

         1230      1240      1250      1260        1270      1280  
pF1KA1 EEALEIPRPLRALDQTPGSSMDNLDSSVTGKAFTSSQR--PRPTSPFSTDSNTSAALSQS
       .   :.  ::    : : . . .  ...  .  .:     : :  :   ... .  :  .
CCDS44 QGNGEMTPPL----QGPRARFRKKPKALPYRRENSPGDLPPPPLPPPEEEASWALELRAA
           1240          1250      1260      1270      1280        

           1290      1300        1310      1320                1330
pF1KA1 QRPRPTKKHKGGRMDQQPALP--HRREGMTDEEALVPYSKPSFPS----------PGGHS
             .....:.     :.:   .:    :::: .:::.::: :           :..:
CCDS44 GSMSSLERERSGERKAVQAVPLAAQRVLHPDEEAWLPYSRPSFLSRGQGTSTCSTAGSNS
     1290      1300      1310      1320      1330      1340        

             1340      1350      1360      1370        
pF1KA1 SSGTASSKGSTGPRKTEVLRAGHQRNASDLLDIGYMGSNSQGQFTGEL
       : :..::.:: :: ..                                
CCDS44 SRGSSSSRGSRGPGRSRSRSQSRSQSQRPGQKRREEPR          
     1350      1360      1370      1380                

>>CCDS11952.1 DCC gene_id:1630|Hs108|chr18                (1447 aa)
 initn: 410 init1: 186 opt: 648  Z-score: 402.0  bits: 86.9 E(32554): 4.5e-16
Smith-Waterman score: 762; 27.2% identity (51.8% similar) in 929 aa overlap (30-828:139-1036)

                10        20        30        40        50         
pF1KA1  MSLLMFTQLLLCGFLYVRVDGSRLRQEDFPPRIVEHPSDVIVSKGEPTTLNCKAEGRPT
                                     : :.. .  .: .  :. . :.:.. :.: 
CCDS11 KPDEGLYQCEASLGDSGSIISRTAKVAVAGPLRFLSQTESVTAFMGDTVLLKCEVIGEPM
      110       120       130       140       150       160        

      60        70        80        90       100       110         
pF1KA1 PTIEWYKDGERVETDKDDPRSHRMLLPSGSLFFLRIVHGRRSKPDEGSYVCVARNYLGEA
       :::.: :. . .     : :   ..::::.: . :.  :     : : : : :::    :
CCDS11 PTIHWQKNQQDLTPIPGDSRV--VVLPSGALQISRLQPG-----DIGIYRCSARN---PA
      170       180         190       200            210           

     120        130              140       150       160       170 
pF1KA1 VSRNAS-LEVALLRDD-------FRQNPTDVVVAAGEPAILECQPPRGHPEPTIYWKKDK
        ::...  :: .: :        : : :..::.  :. :.:::    :.: :.. : . .
CCDS11 SSRTGNEAEVRILSDPGLHRQLYFLQRPSNVVAIEGKDAVLECCVS-GYPPPSFTWLRGE
      220       230       240       250       260        270       

             180        190       200       210       220       230
pF1KA1 VRIDDKEERISIRGGK-LMISNTRKSDAGMYTCVGTNMVGERDSDPAELTVFERPTFLRR
         :. . .. :. ::. :.:::.  .:.:::::: : . .:  :  :::::.  : :: .
CCDS11 EVIQLRSKKYSLLGGSNLLISNVTDDDSGMYTCVVT-YKNENISASAELTVLVPPWFLNH
       280       290       300       310        320       330      

              240       250       260        270       280         
pF1KA1 PINQVVLEEEAVEFRCQVQGDPQPTVRWKKD-DADLPRGRYDIKDDYTLRIKKTMSTDEG
       : :  . :   .::.: :.: : ::: : :. :. .:   ..:    .:::  ....:::
CCDS11 PSNLYAYESMDIEFECTVSGKPVPTVNWMKNGDVVIPSDYFQIVGGSNLRILGVVKSDEG
        340       350       360       370       380       390      

     290       300       310            320         330            
pF1KA1 TYMCIAENRVGKMEASATLTVRAP--PQFVV---RPRD--QIVAQGRTVTF----PCETK
        :.:.:::..:. ..:: : :  :  :.  :    :::   .....: : .    : :.:
CCDS11 FYQCVAENEAGNAQTSAQLIVPKPAIPSSSVLPSAPRDVVPVLVSSRFVRLSWRPPAEAK
        400       410       420       430       440       450      

      340        350       360       370          380              
pF1KA1 GNPQP-AVFWQKEGSQNLLFPNQPQQPNSRCSVS---PTGDLTITNIQRSDAG-------
       :: :  .::...::..     :  :  . . .:.   : .  :.  .  .. :       
CCDS11 GNIQTFTVFFSREGDNRERALNTTQPGSLQLTVGNLKPEAMYTFRVVAYNEWGPGESSQP
        460       470       480       490       500       510      

        390        400         410       420                       
pF1KA1 -YYICQA-LTVAGSI--LAKAQLEVTDVLTDRPPPIILQGPAN--------------QTL
            :  : : : .  :  ..   :..:    ::   .::..              :..
CCDS11 IKVATQPELQVPGPVENLQAVSTSPTSILITWEPPAYANGPVQGYRLFCTEVSTGKEQNI
        520       530       540       550       560       570      

     430                   440                                     
pF1KA1 AVDGTAL------------LKCKA--------TGDPLPVI--------------------
        ::: .             :.  :        . : . :.                    
CCDS11 EVDGLSYKLEGLKKFTEYSLRFLAYNRYGPGVSTDDITVVTLSDVPSAPPQNVSLEVVNS
        580       590       600       610       620       630      

          450               460        470       480               
pF1KA1 -----SWL------KEGFT--FPGRDPRATIQ-EQGTLQIKNLRISDTG-------TYTC
            :::      ..::   .  :  ..: . :. ::. .::    ::       ..  
CCDS11 RSIKVSWLPPPSGTQNGFITGYKIRHRKTTRRGEMETLEPNNLWYLFTGLEKGSQYSFQV
        640       650       660       670       680       690      

      490          500       510       520       530       540     
pF1KA1 VATSSSGE---TSWSAVLDVTESGATISKNYDLSDLPGPPSKPQVTDVTKNSVTLSWQPG
        : . .:    ..:        .. :  .. : :..:  ::. .:   : : . .:: : 
CCDS11 SAMTVNGTGPPSNWY-------TAETPENDLDESQVPDQPSSLHVRPQT-NCIIMSWTPP
        700       710              720       730        740        

         550       560        570       580       590       600    
pF1KA1 TPGTLPASAYIIEAFSQSVSNSW-QTVANHVKTTLYTVRGLRPNTIYLFMVRAINPQGLS
          .. . .:::   . .:.. . .::    :   :... :. .. :.. ..:.:  :  
CCDS11 LNPNIVVRGYII---GYGVGSPYAETVRVDSKQRYYSIERLESSSHYVISLKAFNNAG--
      750       760          770       780       790       800     

          610       620       630       640                650     
pF1KA1 DPSPMSDPVRTQDISPPAQGVDHRQVQKELGDVLVRLHNP---------VVLTPTTVQVT
       .  :. . . :..:. :.. ::.  .  ..   .  : .:         :.::  .:.:.
CCDS11 EGVPLYESATTRSITDPTDPVDYYPLLDDFPTSVPDLSTPMLPPVGVQAVALTHDAVRVS
           810       820       830       840       850       860   

         660       670          680       690       700       710  
pF1KA1 WTVDRQPQFIQGYRV-MY--RQTSGLQATSSWQNLDAKVPTERSAVLVNLKKGVTYEIKV
       :. .  :.  .  .: .:  :  ....:...... :.   :  : . ..:: .. ::..:
CCDS11 WADNSVPKNQKTSEVRLYTVRWRTSFSASAKYKSEDT---TSLSYTATGLKPNTMYEFSV
           870       880       890       900          910       920

            720       730       740       750       760       770  
pF1KA1 RPYFNEFQGMDSESKTVRTTEEAPSAPPQSVTVLTVGSYNSTSISVSWDPPPPDHQNGII
           :. ..  : .  . : : ::.. :...::.:  . .  .. :::.::   . :: :
CCDS11 MVTKNRRSSTWSMTAHATTYEAAPTSAPKDLTVITREG-KPRAVIVSWQPP--LEANGKI
              930       940       950        960       970         

             780         790       800       810       820         
pF1KA1 QEYKI-WCLGNETRFH--INKTVDAAIRSVIIGGLFPGIQYRVEVAASTSAGVGVKSEPQ
         : . . : ..  .   : .:...   .  :  :    .:  .. : .: :::  :.: 
CCDS11 TAYILFYTLDKNIPIDDWIMETISGDRLTHQIMDLNLDTMYYFRIQARNSKGVGPLSDPI
       980       990      1000      1010      1020      1030       

     830       840       850       860       870       880         
pF1KA1 PIIIGRRNEVVITENNNSITEQITDVVKQPAFIAGIGGACWVILMGFSIWLYWRRKKRKG
                                                                   
CCDS11 LFRTLKVEHPDKMANDQGRHGDGGYWPVDTNLIDRSTLNEPPIGQMHPPHGSVTPQKNSN
      1040      1050      1060      1070      1080      1090       

>>CCDS42929.1 DSCAM gene_id:1826|Hs108|chr21              (2012 aa)
 initn: 390 init1: 209 opt: 622  Z-score: 384.7  bits: 84.2 E(32554): 4.2e-15
Smith-Waterman score: 897; 26.2% identity (51.8% similar) in 1117 aa overlap (27-1076:403-1431)

                   10        20        30        40        50      
pF1KA1     MSLLMFTQLLLCGFLYVRVDGSRLRQEDFPPRIVEHPSDVIVSKGEPTTLNCKAEG
                                     ::  :.:.   :. .:: .::..: :...:
CCDS42 DHMVKSDGGAYQCFVRKDKLSAQDYVQVVLEDGTPKIISAFSEKVVSPAEPVSLMCNVKG
            380       390       400       410       420       430  

         60        70        80        90       100       110      
pF1KA1 RPTPTIEWYKDGERVETDKDDPRSHRMLLPSGSLFFLRIVHGRRSKPDEGSYVCVARNYL
        : ::: :  : . .     . :  .:.   :..     . . . . : : : :.: :  
CCDS42 TPLPTITWTLDDDPI-LKGGSHRISQMITSEGNVVSYLNISSSQVR-DGGVYRCTANNSA
            440        450       460       470        480       490

        120       130       140        150       160       170     
pF1KA1 GEAVSRNASLEVALLRDDFRQNPTDVVVA-AGEPAILECQPPRGHPEPTIYWKKDKVRID
       : .:  .: ..:   :      :   ..: ::. . ..:.   :.:  .: : :..  . 
CCDS42 G-VVLYQARINV---RGPASIRPMKNITAIAGRDTYIHCRVI-GYPYYSIKWYKNSNLLP
               500          510       520        530       540     

         180        190        200       210       220             
pF1KA1 DKEERISIRG-GKLMISNTRKS-DAGMYTCVGTNMVGERDSDPAELTV----FERP-TFL
        ......... : : .:...:  : : :::    .     :. ...::    : .:  : 
CCDS42 FNHRQVAFENNGTLKLSDVQKEVDEGEYTCNVLVQPQLSTSQSVHVTVKVPPFIQPFEFP
         550       560       570       580       590       600     

      230       240       250       260       270            280   
pF1KA1 RRPINQVVLEEEAVEFRCQVQGDPQPTVRWKKDDADLPRGRYDIK-D--DYT--LRIKKT
       :  :.: :.   .:     :.::   :. :.::   .: :   .  :  :.:  :::.. 
CCDS42 RFSIGQRVFIPCVV-----VSGDLPITITWQKDGRPIP-GSLGVTIDNIDFTSSLRISNL
         610            620       630        640       650         

           290       300       310       320       330       340   
pF1KA1 MSTDEGTYMCIAENRVGKMEASATLTVRAPPQFVVRPRDQIVAQGRTVTFPCETKGNPQP
           .:.: :::.:... .: .. : ::.::.:::.::::    :..: . : ..: : :
CCDS42 SLMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIVRVPPKFVVQPRDQDGIYGKAVILNCSAEGYPVP
     660       670       680       690       700       710         

            350       360       370       380       390       400  
pF1KA1 AVFWQ-KEGSQNLLFPNQPQQPNSRCSVSPTGDLTITNIQRSDAGYYICQALTVAGSILA
       .. :. ..:.    :  ::   :.: .:  .:.: : .. . :.:::.:.. . .:. ..
CCDS42 TIVWKFSKGAGVPQF--QPIALNGRIQVLSNGSLLIKHVVEEDSGYYLCKVSNDVGADVS
     720       730         740       750       760       770       

            410       420       430        440       450       460 
pF1KA1 KAQLEVTDVLTDRPPPIILQGPANQTLAVDGTAL-LKCKATGDPLPVISWLKEGFTFPGR
       :..      :: . : .: . : : :::..:    ..: : :.   .. : ::   .  .
CCDS42 KSM-----YLTVKIPAMITSYP-NTTLATQGQKKEMSCTAHGEKPIIVRWEKEDRIINPE
       780            790        800       810       820       830 

               470       480            490       500       510    
pF1KA1 DPRATI--QEQGTLQIKNLRI-----SDTGTYTCVATSSSGETSWSAVLDVTESGATISK
         :  .  .: :   :..:.:      :.: ..: : .: ::      : : :       
CCDS42 MARYLVSTKEVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHAINSYGEDRGIIQLTVQEP------
             840       850       860       870       880           

          520       530       540       550       560       570    
pF1KA1 NYDLSDLPGPPSKPQVTDVTKNSVTLSWQPGTPGTLPASAYIIEAFSQSVSNSWQTV--A
              : :: . .. ::   ..:: :  :  :. : ..: ::   .. :.::...  .
CCDS42 -------PDPP-EIEIKDVKARTITLRWTMGFDGNSPITGYDIEC--KNKSDSWDSAQRT
                 890       900       910       920         930     

            580         590       600       610       620       630
pF1KA1 NHVKTTLY--TVRGLRPNTIYLFMVRAINPQGLSDPSPMSDPVRTQDISPPAQGVDHRQV
       . :.  :   :.  ..:.. : . . : :  : :.::  .. . : : . : .:   ..:
CCDS42 KDVSPQLNSATIIDIHPSSTYSIRMYAKNRIGKSEPS--NELTITADEAAP-DG-PPQEV
         940       950       960       970         980         990 

              640       650       660          670        680      
pF1KA1 QKELGDVLVRLHNPVVLTPTTVQVTWTVDR---QPQFIQGYRVMYRQ-TSGLQATSSWQN
       . :          :.  .  ...::: . .   :  .:.::.. ::. ..: .   .  .
CCDS42 HLE----------PI--SSQSIRVTWKAPKKHLQNGIIRGYQIGYREYSTGGNFQFNIIS
                        1000      1010      1020      1030         

        690       700       710       720       730       740      
pF1KA1 LDAKVPTERSAVLVNLKKGVTYEIKVRPYFNEFQGMDSESKTVRTTEEAPSAPPQSVTVL
       .:..  .:   .: ::.: . : . :.       : .:.   . : :..:: ::..: ..
CCDS42 VDTSGDSE-VYTLDNLNKFTQYGLVVQACNRAGTGPSSQEIITTTLEDVPSYPPENVQAI
    1040       1050      1060      1070      1080      1090        

        750       760       770         780       790       800    
pF1KA1 TVGSYNSTSISVSWDPPPPDHQNGIIQEYKI--WCLGNETRFHINKTVDAAIRSVIIGGL
       ..   .  :::.::.    .  :::.: ...  :    . ..   :.. ..  :. . ::
CCDS42 AT---SPESISISWSTLSKEALNGILQGFRVIYWANLMDGELGEIKNITTTQPSLELDGL
     1100         1110      1120      1130      1140      1150     

          810       820                 830            840         
pF1KA1 FPGIQYRVEVAASTSAGVGVKSE----------PQP-----IIIGRRNEVVITE----NN
           .: ..: : : :: ::.::          : :        .  . : ..     . 
CCDS42 EKYTNYSIQVLAFTRAGDGVRSEQIFTRTKEDVPGPPAGVKAAAASASMVFVSWLPPLKL
        1160      1170      1180      1190      1200      1210     

         850             860       870            880       890    
pF1KA1 NSITEQITDVVKQP------AFIAGIGGACWVILM-----GFSIWLYWRRKKRKGLSNYA
       :.: .. :   ..:       : :.  .  . :        .:.:.    .  .: :.  
CCDS42 NGIIRKYTVFCSHPYPTVISEFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVWVVAVTSAGRGNSSEI
        1220      1230      1240      1250      1260      1270     

          900       910       920       930       940       950    
pF1KA1 VTFQRGDGGLMSNGSRPGLLNAGDPSYPWLADSWPATSLPVNNSNSGPNEIGNFGRGDVL
       .: .     : .  .:  :  .:  . ::. :      :: .              ::  
CCDS42 ITVE----PLAKAPARI-LTFSGTVTTPWMKD----IVLPCKAV------------GDPS
            1280       1290      1300          1310                

          960          970         980       990      1000         
pF1KA1 PPVPGQGDK--TATMLS-DG--AIYSSIDFTTKTSYNSSSQITQATPYATTQILHSNSIH
       : :  . :.  : .... ::  .:.:. .:  .:    .:   .    :...   .. : 
CCDS42 PAVKWMKDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSFIIRTVKAEDSGYYSCI--ANNNWGSDEIIL
         1320      1330      1340      1350      1360        1370  

    1010      1020      1030      1040      1050      1060         
pF1KA1 ELAVDLPDPQWKSSIQQKTDLMGFGYSLPDQNKGNNGGKGGKKKKNKNSSKPQKNNGSTW
       .: :..:  : . .... :.       ::    :.:::.. .    . :    ..:.  :
CCDS42 NLQVQVPPDQPRLTVSKTTSSSITLSWLP----GDNGGSSIRGYILQYS----EDNSEQW
           1380      1390      1400          1410          1420    

    1070      1080      1090      1100      1110      1120         
pF1KA1 ANVPLPPPPVQPLPGTELEHYAVEQQENGYDSDSWCPPLPVQTYLHQGLEDELEEDDDRV
       .. :. :                                                     
CCDS42 GSFPISPSERSYRLENLKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISEIIEAKTLGKEPQFSKEQELF
         1430      1440      1450      1460      1470      1480    

>>CCDS8384.1 DSCAML1 gene_id:57453|Hs108|chr11            (2113 aa)
 initn: 418 init1: 231 opt: 602  Z-score: 372.4  bits: 82.0 E(32554): 2e-14
Smith-Waterman score: 892; 27.5% identity (54.7% similar) in 832 aa overlap (27-826:464-1239)

                   10        20        30        40        50      
pF1KA1     MSLLMFTQLLLCGFLYVRVDGSRLRQEDFPPRIVEHPSDVIVSKGEPTTLNCKAEG
                                     ::  ::::   :. .:. ::  .: : :.:
CCDS83 TSAQKSHSGAYQCFATRKAQTAQDFAIIALEDGTPRIVSSFSEKVVNPGEQFSLMCAAKG
           440       450       460       470       480       490   

         60        70        80        90       100       110      
pF1KA1 RPTPTIEWYKDGERVETDKDDPRSHRMLLPSGSLFFLRIVHGRRSKPDEGSYVCVARNYL
        : ::. :  : : .  :  . :.... . .:. .    : : . . : : : :.::: .
CCDS83 APPPTVTWALDDEPIVRD-GSHRTNQYTMSDGTTISHMNVTGPQIR-DGGVYRCTARNLV
           500       510        520       530        540       550 

        120       130       140            150       160       170 
pF1KA1 GEAVSRNASLEVALLRDDFRQNPT-----DVVVAAGEPAILECQPPRGHPEPTIYWKKDK
       : :   .: ..:       :  :.     .....::. ....:.   :.:  .: : :: 
CCDS83 GSA-EYQARINV-------RGPPSIRAMRNITAVAGRDTLINCRVI-GYPYYSIKWYKDA
              560              570       580        590       600  

             180       190        200       210       220       230
pF1KA1 VRIDDKEERISIRGGKLMISNTRKS-DAGMYTCVGTNMVGERDSDPAELTVFERPTFLRR
       . . :..... ...: : .....:. : : : :  . ..  . :    . :  .   : .
CCDS83 LLLPDNHRQVVFENGTLKLTDVQKGMDEGEYLC--SVLIQPQLSISQSVHVAVKVPPLIQ
            610       620       630         640       650       660

               240        250       260        270          280    
pF1KA1 PIN-QVVLEEEAVEFRCQVQ-GDPQPTVRWKKDDADLPRGR-YDIKDDY---TLRIKKTM
       :..   .   . . . : :. ::    . :.::   .  :    :..     .:.:... 
CCDS83 PFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITWRKDGQVIISGSGVTIESKEFMSSLQISSVS
              670       680       690       700       710       720

          290       300       310       320       330       340    
pF1KA1 STDEGTYMCIAENRVGKMEASATLTVRAPPQFVVRPRDQIVAQGRTVTFPCETKGNPQPA
          .:.: ::: : .. .     : ::.::.:::.: .:    :.. .. : . : : : 
CCDS83 LKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIVRVPPRFVVQPNNQDGIYGKAGVLNCSVDGYPPPK
              730       740       750       760       770       780

           350       360         370       380       390       400 
pF1KA1 VFWQK-EGSQNLLFPNQ--PQQPNSRCSVSPTGDLTITNIQRSDAGYYICQALTVAGSIL
       :.:.. .:: :   :.:  :   ..: .. :...: : .. . : :::.::: . .:. .
CCDS83 VMWKHAKGSGN---PQQYHPVPLTGRIQILPNSSLLIRHVLEEDIGYYLCQASNGVGTDI
              790          800       810       820       830       

             410       420       430        440       450          
pF1KA1 AKAQLEVTDVLTDRPPPIILQGPANQTLAVDGTAL-LKCKATGDPLPVISWLKEGFTF-P
       .:...     :: . : .: . : : :.:. : :  :.: : :.   .: : :   .. :
CCDS83 SKSMF-----LTVKIPAMITSHP-NTTIAIKGHAKELNCTARGERPIIIRWEKGDTVIDP
       840            850        860       870       880       890 

     460         470            480       490       500       510  
pF1KA1 GRDPRATI--QEQG-----TLQIKNLRISDTGTYTCVATSSSGETSWSAVLDVTESGATI
        :  : .:  ...:     ::..:    .:.  ..: : .: ::      : : :     
CCDS83 DRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGEDRGLIQLTVQEP----
             900       910       920       930       940           

            520       530       540       550       560       570  
pF1KA1 SKNYDLSDLPGPPSKPQVTDVTKNSVTLSWQPGTPGTLPASAYIIEAFSQSVSNSWQTVA
                : :: . .. .:   :..: :     :.   ... ::  ..: : ...  .
CCDS83 ---------PDPP-ELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDSWDFKQST
                950        960       970       980       990       

            580         590       600       610       620       630
pF1KA1 NHVKTTLY--TVRGLRPNTIYLFMVRAINPQGLSDPSPMSDPVRTQDISPPAQGVDHRQV
        ... :.   ..  :.: ..: . . ..:  : :.::     . :.. .: .  .:    
CCDS83 RNISPTINQANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELT-ISTEEAAPDGPPMD----
      1000      1010      1020      1030       1040      1050      

              640       650       660          670        680      
pF1KA1 QKELGDVLVRLHNPVVLTPTTVQVTWTVDR---QPQFIQGYRVMYRQTS-GLQATSSWQN
               : :. ::  :  ..:::: . .   :   :.::.. ::..: : ..  :  .
CCDS83 --------VTLQ-PV--TSQSIQVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVE
                      1060      1070      1080      1090      1100 

        690       700       710       720       730       740      
pF1KA1 LDAKVPTERSAVLVNLKKGVTYEIKVRPYFNEFQGMDSESKTVRTTEEAPSAPPQSVTVL
       . :   .:   .: :::: . : . :. .     : .:   .. : :..:: ::..: .:
CCDS83 MKATGDSE-VYTLDNLKKFAQYGVVVQAFNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRAL
             1110      1120      1130      1140      1150      1160

        750       760       770         780       790       800    
pF1KA1 TVGSYNSTSISVSWDPPPPDHQNGIIQEYKI--WCLGNETRFHINKTVDAAIRSVIIGGL
       ..   .:    .::. :: .  ::... :..  : :  . ..   ... .. . : . :.
CCDS83 SI---TSDVAVISWSEPPRSTLNGVLKGYRVIFWSLYVDGEWGEMQNITTTRERVELRGM
                1170      1180      1190      1200      1210       

          810       820       830       840       850       860    
pF1KA1 FPGIQYRVEVAASTSAGVGVKSEPQPIIIGRRNEVVITENNNSITEQITDVVKQPAFIAG
           .: :.: : :.:: ::.:                                      
CCDS83 EKFTNYSVQVLAYTQAGDGVRSSVLYIQTKEDVPGPPAGIKAVPSSASSVVVSWLPPTKP
      1220      1230      1240      1250      1260      1270       

>>CCDS46221.1 PXDN gene_id:7837|Hs108|chr2                (1479 aa)
 initn: 367 init1: 254 opt: 597  Z-score: 371.3  bits: 81.2 E(32554): 2.3e-14
Smith-Waterman score: 757; 30.5% identity (58.8% similar) in 495 aa overlap (105-579:217-694)

           80        90       100       110        120       130   
pF1KA1 KDDPRSHRMLLPSGSLFFLRIVHGRRSKPDEGSYVC-VARNYLGEAVSRNASLEVALLRD
                                     ... .:   :   :..:.  .  :.   : 
CCDS46 LRLDSNTLHCDCEILWLADLLKTYAESGNAQAAAICEYPRRIQGRSVATITPEELNCERP
        190       200       210       220       230       240      

           140       150       160       170        180        190 
pF1KA1 DFRQNPTDVVVAAGEPAILECQPPRGHPEPTIYWKKDKVRIDDKEE-RISI-RGGKLMIS
        . ..: :. :..:. . . :.  .:.:.: : : ... ... : . :...   : :::.
CCDS46 RITSEPQDADVTSGNTVYFTCRA-EGNPKPEIIWLRNNNELSMKTDSRLNLLDDGTLMIQ
        250       260        270       280       290       300     

             200       210       220          230       240        
pF1KA1 NTRKSDAGMYTCVGTNMVGERDSDPAELTVF---ERPTFLRRPINQVVLEEEAVEFRCQV
       ::...: :.: :.. :..::  .. . :  :    ::::. .: :  ::  :.: ..:..
CCDS46 NTQETDQGIYQCMAKNVAGEVKTQEVTLRYFGSPARPTFVIQPQNTEVLVGESVTLECSA
         310       320       330       340       350       360     

      250       260         270       280       290       300      
pF1KA1 QGDPQPTVRWKKDD-ADLPRG-RYDIKDDYTLRIKKTMSTDEGTYMCIAENRVGKMEASA
        : : : . : . : . ::   : .:  .  : :..... : : : : : : . ...:.:
CCDS46 TGHPPPRISWTRGDRTPLPVDPRVNITPSGGLYIQNVVQGDSGEYACSATNNIDSVHATA
         370       380       390       400       410       420     

        310       320       330       340       350       360      
pF1KA1 TLTVRAPPQFVVRPRDQIVAQGRTVTFPCETKGNPQPAVFWQKEGSQNLLFPNQPQQPNS
        . :.: :::.: :.:..: .:.:: : ::.:::: :.. : : :::         . . 
CCDS46 FIIVQALPQFTVTPQDRVVIEGQTVDFQCEAKGNPPPVIAWTKGGSQ--------LSVDR
         430       440       450       460       470               

        370       380       390       400       410       420      
pF1KA1 RCSVSPTGDLTITNIQRSDAGYYICQALTVAGSILAKAQLEVTDVLTDRPPPIILQGPAN
       :  :  .: : :...   : : : :::... ::  . :.: :      :  :.. . :..
CCDS46 RHLVLSSGTLRISGVALHDQGQYECQAVNIIGSQKVVAHLTVQP----RVTPVFASIPSD
       480       490       500       510       520           530   

        430       440       450       460       470       480      
pF1KA1 QTLAVDGTALLKCKATGDPLPVISWLKEGFTFPGRDPRATIQEQGTLQIKNLRISDTGTY
        :. : ... : :.. :.: :.:.: :.:     .. .  :. .: : :...  .:.: :
CCDS46 TTVEVGANVQLPCSSQGEPEPAITWNKDGVQVT-ESGKFHISPEGFLTINDVGPADAGRY
           540       550       560        570       580       590  

        490       500       510           520       530       540  
pF1KA1 TCVATSSSGETSWSAVLDVTESGATISKNYD----LSDLPGPPSKPQVTDVTKNSVTLSW
        ::: .. : .: : ::.:.     .:.: :     : . .  .  .. . :.. .  : 
CCDS46 ECVARNTIGSASVSMVLSVNVPD--VSRNGDPFVATSIVEAIATVDRAINSTRTHLFDS-
            600       610         620       630       640          

            550              560        570       580       590    
pF1KA1 QPGTPGTL------PASAYIIE-AFSQSV-SNSWQTVANHVKTTLYTVRGLRPNTIYLFM
       .: .:. :      : . : .: : .  .   . : . .::.  :               
CCDS46 RPRSPNDLLALFRYPRDPYTVEQARAGEIFERTLQLIQEHVQHGLMVDLNGTSYHYNDLV
     650       660       670       680       690       700         

          600       610       620       630       640       650    
pF1KA1 VRAINPQGLSDPSPMSDPVRTQDISPPAQGVDHRQVQKELGDVLVRLHNPVVLTPTTVQV
                                                                   
CCDS46 SPQYLNLIANLSGCTAHRRVNNCSDMCFHQKYRTHDGTCNNLQHPMWGASLTAFERLLKS
     710       720       730       740       750       760         




1378 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Wed Nov  2 21:25:45 2016 done: Wed Nov  2 21:25:46 2016
 Total Scan time:  6.270 Total Display time:  0.770

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com