Result of FASTA (omim) for pF1KA1331
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1331, 589 aa
  1>>>pF1KA1331 589 - 589 aa - 589 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7111+/-0.000402; mu= 17.8400+/- 0.025
 mean_var=93.0693+/-18.678, 0's: 0 Z-trim(113.6): 66  B-trim: 45 in 1/52
 Lambda= 0.132945
 statistics sampled from 22926 (22992) to 22926 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.638), E-opt: 0.2 (0.27), width:  16
 Scan time:  7.370

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_067640 (OMIM: 608261) sentrin-specific protease ( 589) 3987 775.4       0
XP_005247748 (OMIM: 608261) PREDICTED: sentrin-spe ( 474) 3206 625.6 1.2e-178
XP_005247747 (OMIM: 608261) PREDICTED: sentrin-spe ( 545) 2496 489.4 1.3e-137
XP_016862462 (OMIM: 608261) PREDICTED: sentrin-spe ( 430) 1715 339.5 1.3e-92
XP_016874729 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 432) 1005 203.4 1.3e-51
XP_016874725 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 631) 1005 203.5 1.7e-51
XP_016874726 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 631) 1005 203.5 1.7e-51
XP_011536546 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 663) 1005 203.5 1.8e-51
XP_016874719 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 694) 1005 203.5 1.9e-51
XP_006719425 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 445) 1001 202.6 2.3e-51
XP_016874727 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 445) 1001 202.6 2.3e-51
XP_016874728 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 445) 1001 202.6 2.3e-51
XP_016874724 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 637) 1001 202.7   3e-51
XP_016874722 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 637) 1001 202.7   3e-51
XP_016874723 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 637) 1001 202.7   3e-51
NP_001254524 (OMIM: 612157) sentrin-specific prote ( 644) 1001 202.7   3e-51
NP_001254523 (OMIM: 612157) sentrin-specific prote ( 644) 1001 202.7   3e-51
XP_011536547 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 660) 1001 202.7 3.1e-51
XP_016874721 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 675) 1001 202.8 3.1e-51
XP_016874720 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 675) 1001 202.8 3.1e-51
XP_006719424 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 676) 1001 202.8 3.1e-51
XP_016874718 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 707) 1001 202.8 3.2e-51
NP_056485 (OMIM: 612844) sentrin-specific protease ( 574)  494 105.5 5.2e-22
NP_689912 (OMIM: 612845) sentrin-specific protease ( 755)  488 104.4 1.4e-21
XP_011510846 (OMIM: 612845) PREDICTED: sentrin-spe ( 755)  488 104.4 1.4e-21
XP_005269367 (OMIM: 612845) PREDICTED: sentrin-spe ( 727)  341 76.2 4.2e-13
XP_011510847 (OMIM: 612845) PREDICTED: sentrin-spe ( 643)  209 50.8 1.6e-05


>>NP_067640 (OMIM: 608261) sentrin-specific protease 2 [  (589 aa)
 initn: 3987 init1: 3987 opt: 3987  Z-score: 4136.8  bits: 775.4 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 3987; 99.8% identity (99.8% similar) in 589 aa overlap (1-589:1-589)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MYRWLVRILGTIFRFCDRSVPPARALLKRRRSDSTLFSTVDTDEIPAKRPRLDCFIHQVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 MYRWLVRILGTIFRFCDRSVPPARALLKRRRSDSTLFSTVDTDEIPAKRPRLDCFIHQVK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 NSLYNAASLFGFPFQLTTKPMVTSACNGTRNVAPSGEVFSNSSSCELTGSGSWNNMLKLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 NSLYNAASLFGFPFQLTTKPMVTSACNGTRNVAPSGEVFSNSSSCELTGSGSWNNMLKLG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 NKSPNGISDYPKIRVTVTRDQPRRVLPSFGFTLNSEGCNRRPGGRRHSKGNPESSLMWKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 NKSPNGISDYPKIRVTVTRDQPRRVLPSFGFTLNSEGCNRRPGGRRHSKGNPESSLMWKP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 QEQAVTEMISEESGKGLRRPHCTVEEGVQKEEREKYRKLLERLKESGHGNSVCPVTSNYH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 QEQAVTEMISEESGKGLRRPHCTVEEGVQKEEREKYRKLLERLKESGHGNSVCPVTSNYH
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 SSQRSQMDTLKTKGWGEEQNHGVKTTQFVPKQYRLVETRGPLCSLRSEKRCSKGKITDTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 SSQRSQMDTLKTKGWGEEQNHGVKTTQFVPKQYRLVETRGPLCSLRSEKRCSKGKITDTE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 KMVGIRFENESRRGYQLEPDLSEEVSARLRLGSGSNGLLRRKVSIIETKEKNCSGKERDR
        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 TMVGIRFENESRRGYQLEPDLSEEVSARLRLGSGSNGLLRRKVSIIETKEKNCSGKERDR
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 RTDDLLELTEDMEKEISNALGHGPQDEILSSAFKLRITRGDIQTLKNYHWLNDEVINFYM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 RTDDLLELTEDMEKEISNALGHGPQDEILSSAFKLRITRGDIQTLKNYHWLNDEVINFYM
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 NLLVERNKKQGYPALHVFSTFFYPKLKSGGYQAVKRWTKGVNLFEQEIILVPIHRKVHWS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 NLLVERNKKQGYPALHVFSTFFYPKLKSGGYQAVKRWTKGVNLFEQEIILVPIHRKVHWS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 LVVIDLRKKCLKYLDSMGQKGHRICEILLQYLQDESKTKRNSDLNLLEWTHHSMKPHEIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 LVVIDLRKKCLKYLDSMGQKGHRICEILLQYLQDESKTKRNSDLNLLEWTHHSMKPHEIP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580         
pF1KA1 QQLNGSDCGMFTCKYADYISRDKPITFTQHQMPLFRKKMVWEILHQQLL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 QQLNGSDCGMFTCKYADYISRDKPITFTQHQMPLFRKKMVWEILHQQLL
              550       560       570       580         

>>XP_005247748 (OMIM: 608261) PREDICTED: sentrin-specifi  (474 aa)
 initn: 3206 init1: 3206 opt: 3206  Z-score: 3328.5  bits: 625.6 E(85289): 1.2e-178
Smith-Waterman score: 3206; 99.8% identity (99.8% similar) in 474 aa overlap (116-589:1-474)

          90       100       110       120       130       140     
pF1KA1 CNGTRNVAPSGEVFSNSSSCELTGSGSWNNMLKLGNKSPNGISDYPKIRVTVTRDQPRRV
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005                               MLKLGNKSPNGISDYPKIRVTVTRDQPRRV
                                             10        20        30

         150       160       170       180       190       200     
pF1KA1 LPSFGFTLNSEGCNRRPGGRRHSKGNPESSLMWKPQEQAVTEMISEESGKGLRRPHCTVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LPSFGFTLNSEGCNRRPGGRRHSKGNPESSLMWKPQEQAVTEMISEESGKGLRRPHCTVE
               40        50        60        70        80        90

         210       220       230       240       250       260     
pF1KA1 EGVQKEEREKYRKLLERLKESGHGNSVCPVTSNYHSSQRSQMDTLKTKGWGEEQNHGVKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EGVQKEEREKYRKLLERLKESGHGNSVCPVTSNYHSSQRSQMDTLKTKGWGEEQNHGVKT
              100       110       120       130       140       150

         270       280       290       300       310       320     
pF1KA1 TQFVPKQYRLVETRGPLCSLRSEKRCSKGKITDTEKMVGIRFENESRRGYQLEPDLSEEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
XP_005 TQFVPKQYRLVETRGPLCSLRSEKRCSKGKITDTETMVGIRFENESRRGYQLEPDLSEEV
              160       170       180       190       200       210

         330       340       350       360       370       380     
pF1KA1 SARLRLGSGSNGLLRRKVSIIETKEKNCSGKERDRRTDDLLELTEDMEKEISNALGHGPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SARLRLGSGSNGLLRRKVSIIETKEKNCSGKERDRRTDDLLELTEDMEKEISNALGHGPQ
              220       230       240       250       260       270

         390       400       410       420       430       440     
pF1KA1 DEILSSAFKLRITRGDIQTLKNYHWLNDEVINFYMNLLVERNKKQGYPALHVFSTFFYPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DEILSSAFKLRITRGDIQTLKNYHWLNDEVINFYMNLLVERNKKQGYPALHVFSTFFYPK
              280       290       300       310       320       330

         450       460       470       480       490       500     
pF1KA1 LKSGGYQAVKRWTKGVNLFEQEIILVPIHRKVHWSLVVIDLRKKCLKYLDSMGQKGHRIC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LKSGGYQAVKRWTKGVNLFEQEIILVPIHRKVHWSLVVIDLRKKCLKYLDSMGQKGHRIC
              340       350       360       370       380       390

         510       520       530       540       550       560     
pF1KA1 EILLQYLQDESKTKRNSDLNLLEWTHHSMKPHEIPQQLNGSDCGMFTCKYADYISRDKPI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EILLQYLQDESKTKRNSDLNLLEWTHHSMKPHEIPQQLNGSDCGMFTCKYADYISRDKPI
              400       410       420       430       440       450

         570       580         
pF1KA1 TFTQHQMPLFRKKMVWEILHQQLL
       ::::::::::::::::::::::::
XP_005 TFTQHQMPLFRKKMVWEILHQQLL
              460       470    

>>XP_005247747 (OMIM: 608261) PREDICTED: sentrin-specifi  (545 aa)
 initn: 2480 init1: 2480 opt: 2496  Z-score: 2591.7  bits: 489.4 E(85289): 1.3e-137
Smith-Waterman score: 3594; 92.4% identity (92.4% similar) in 589 aa overlap (1-589:1-545)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MYRWLVRILGTIFRFCDRSVPPARALLKRRRSDSTLFSTVDTDEIPAKRPRLDCFIHQVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MYRWLVRILGTIFRFCDRSVPPARALLKRRRSDSTLFSTVDTDEIPAKRPRLDCFIHQVK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 NSLYNAASLFGFPFQLTTKPMVTSACNGTRNVAPSGEVFSNSSSCELTGSGSWNNMLKLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NSLYNAASLFGFPFQLTTKPMVTSACNGTRNVAPSGEVFSNSSSCELTGSGSWNNMLKLG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 NKSPNGISDYPKIRVTVTRDQPRRVLPSFGFTLNSEGCNRRPGGRRHSKGNPESSLMWKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NKSPNGISDYPKIRVTVTRDQPRRVLPSFGFTLNSEGCNRRPGGRRHSKGNPESSLMWKP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 QEQAVTEMISEESGKGLRRPHCTVEEGVQKEEREKYRKLLERLKESGHGNSVCPVTSNYH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QEQAVTEMISEESGKGLRRPHCTVEEGVQKEEREKYRKLLERLKESGHGNSVCPVTSNYH
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 SSQRSQMDTLKTKGWGEEQNHGVKTTQFVPKQYRLVETRGPLCSLRSEKRCSKGKITDTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SSQRSQMDTLKTKGWGEEQNHGVKTTQFVPKQYRLVETRGPLCSLRSEKRCSKGKITDTE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 KMVGIRFENESRRGYQLEPDLSEEVSARLRLGSGSNGLLRRKVSIIETKEKNCSGKERDR
        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TMVGIRFENESRRGYQLEPDLSEEVSARLRLGSGSNGLLRRKVSIIETKEKNCSGKERDR
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 RTDDLLELTEDMEKEISNALGHGPQDEILSSAFKLRITRGDIQTLKNYHWLNDEVINFYM
       ::::::::::                                            ::::::
XP_005 RTDDLLELTE--------------------------------------------VINFYM
              370                                                  

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 NLLVERNKKQGYPALHVFSTFFYPKLKSGGYQAVKRWTKGVNLFEQEIILVPIHRKVHWS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NLLVERNKKQGYPALHVFSTFFYPKLKSGGYQAVKRWTKGVNLFEQEIILVPIHRKVHWS
        380       390       400       410       420       430      

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 LVVIDLRKKCLKYLDSMGQKGHRICEILLQYLQDESKTKRNSDLNLLEWTHHSMKPHEIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LVVIDLRKKCLKYLDSMGQKGHRICEILLQYLQDESKTKRNSDLNLLEWTHHSMKPHEIP
        440       450       460       470       480       490      

              550       560       570       580         
pF1KA1 QQLNGSDCGMFTCKYADYISRDKPITFTQHQMPLFRKKMVWEILHQQLL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QQLNGSDCGMFTCKYADYISRDKPITFTQHQMPLFRKKMVWEILHQQLL
        500       510       520       530       540     

>>XP_016862462 (OMIM: 608261) PREDICTED: sentrin-specifi  (430 aa)
 initn: 1699 init1: 1699 opt: 1715  Z-score: 1783.5  bits: 339.5 E(85289): 1.3e-92
Smith-Waterman score: 2813; 90.5% identity (90.5% similar) in 474 aa overlap (116-589:1-430)

          90       100       110       120       130       140     
pF1KA1 CNGTRNVAPSGEVFSNSSSCELTGSGSWNNMLKLGNKSPNGISDYPKIRVTVTRDQPRRV
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016                               MLKLGNKSPNGISDYPKIRVTVTRDQPRRV
                                             10        20        30

         150       160       170       180       190       200     
pF1KA1 LPSFGFTLNSEGCNRRPGGRRHSKGNPESSLMWKPQEQAVTEMISEESGKGLRRPHCTVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LPSFGFTLNSEGCNRRPGGRRHSKGNPESSLMWKPQEQAVTEMISEESGKGLRRPHCTVE
               40        50        60        70        80        90

         210       220       230       240       250       260     
pF1KA1 EGVQKEEREKYRKLLERLKESGHGNSVCPVTSNYHSSQRSQMDTLKTKGWGEEQNHGVKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EGVQKEEREKYRKLLERLKESGHGNSVCPVTSNYHSSQRSQMDTLKTKGWGEEQNHGVKT
              100       110       120       130       140       150

         270       280       290       300       310       320     
pF1KA1 TQFVPKQYRLVETRGPLCSLRSEKRCSKGKITDTEKMVGIRFENESRRGYQLEPDLSEEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
XP_016 TQFVPKQYRLVETRGPLCSLRSEKRCSKGKITDTETMVGIRFENESRRGYQLEPDLSEEV
              160       170       180       190       200       210

         330       340       350       360       370       380     
pF1KA1 SARLRLGSGSNGLLRRKVSIIETKEKNCSGKERDRRTDDLLELTEDMEKEISNALGHGPQ
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::               
XP_016 SARLRLGSGSNGLLRRKVSIIETKEKNCSGKERDRRTDDLLELTE---------------
              220       230       240       250                    

         390       400       410       420       430       440     
pF1KA1 DEILSSAFKLRITRGDIQTLKNYHWLNDEVINFYMNLLVERNKKQGYPALHVFSTFFYPK
                                    :::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 -----------------------------VINFYMNLLVERNKKQGYPALHVFSTFFYPK
                                      260       270       280      

         450       460       470       480       490       500     
pF1KA1 LKSGGYQAVKRWTKGVNLFEQEIILVPIHRKVHWSLVVIDLRKKCLKYLDSMGQKGHRIC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LKSGGYQAVKRWTKGVNLFEQEIILVPIHRKVHWSLVVIDLRKKCLKYLDSMGQKGHRIC
        290       300       310       320       330       340      

         510       520       530       540       550       560     
pF1KA1 EILLQYLQDESKTKRNSDLNLLEWTHHSMKPHEIPQQLNGSDCGMFTCKYADYISRDKPI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EILLQYLQDESKTKRNSDLNLLEWTHHSMKPHEIPQQLNGSDCGMFTCKYADYISRDKPI
        350       360       370       380       390       400      

         570       580         
pF1KA1 TFTQHQMPLFRKKMVWEILHQQLL
       ::::::::::::::::::::::::
XP_016 TFTQHQMPLFRKKMVWEILHQQLL
        410       420       430

>>XP_016874729 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-specifi  (432 aa)
 initn: 975 init1: 975 opt: 1005  Z-score: 1047.6  bits: 203.4 E(85289): 1.3e-51
Smith-Waterman score: 1012; 44.3% identity (73.6% similar) in 352 aa overlap (238-589:94-432)

       210       220       230       240       250       260       
pF1KA1 VQKEEREKYRKLLERLKESGHGNSVCPVTSNYHSSQRSQMDTLKTKGWGEEQNHGVKTTQ
                                     ..: :   : :.: ..   . :..:  .. 
XP_016 EQLSHSVYSLSSYTPDVAFGSKDSGTLHHPHHHHSVPHQPDNLAAS---NTQSEGSDSVI
            70        80        90       100          110       120

       270       280       290       300       310       320       
pF1KA1 FVPKQYRLVETRGPLCSLRSEKRCSKGKITDTEKMVGIRFENESRRGYQLEPDLSEEVSA
       ..  . .  .:  :  :. . .   . .  . .: ......:.  :  . : .. . :  
XP_016 LL--KVKDSQTPTPRTSVYDSRARERLRQIEEQKALALQLQNQ--RLQEREHSVHDSVEL
                130       140       150       160         170      

       330       340       350       360       370       380       
pF1KA1 RLRLGSGSNGLLRRKVSIIETKEKNCSGKERDRRTDDLLELTEDMEKEISNALGHGPQDE
       .::.       :.... .  ..: . .:..     :.. :.::.:::::.:.. .: :::
XP_016 HLRVP------LEKEIPVTVVQETQKKGHKLTDSEDEFPEITEEMEKEIKNVFRNGNQDE
        180             190       200       210       220       230

       390       400       410       420       430       440       
pF1KA1 ILSSAFKLRITRGDIQTLKNYHWLNDEVINFYMNLLVERNKKQGYPALHVFSTFFYPKLK
       .:: ::.: ::: :::::.. .:::::.::::::.:.::.:..: :..:.:.:::. :::
XP_016 VLSEAFRLTITRKDIQTLNHLNWLNDEIINFYMNMLMERSKEKGLPSVHAFNTFFFTKLK
              240       250       260       270       280       290

       450       460       470       480       490       500       
pF1KA1 SGGYQAVKRWTKGVNLFEQEIILVPIHRKVHWSLVVIDLRKKCLKYLDSMGQKGHRICEI
       ..:::::::::: :..:  .:.:::::  ::: :.:.:.::: . : ::::  ... :.:
XP_016 TAGYQAVKRWTKKVDVFSVDILLVPIHLGVHWCLAVVDFRKKNITYYDSMGGINNEACRI
              300       310       320       330       340       350

       510       520       530       540       550       560       
pF1KA1 LLQYLQDESKTKRNSDLNLLEWTHHSMKPHEIPQQLNGSDCGMFTCKYADYISRDKPITF
       :::::..::  :. ....   :   : : .:::::.::::::::.::::: :..:.::.:
XP_016 LLQYLKQESIDKKRKEFDTNGWQLFSKKSQEIPQQMNGSDCGMFACKYADCITKDRPINF
              360       370       380       390       400       410

       570       580         
pF1KA1 TQHQMPLFRKKMVWEILHQQLL
       ::..:: :::.:::::::..::
XP_016 TQQHMPYFRKRMVWEILHRKLL
              420       430  

>>XP_016874725 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-specifi  (631 aa)
 initn: 1047 init1: 975 opt: 1005  Z-score: 1045.3  bits: 203.5 E(85289): 1.7e-51
Smith-Waterman score: 1012; 44.3% identity (73.6% similar) in 352 aa overlap (238-589:293-631)

       210       220       230       240       250       260       
pF1KA1 VQKEEREKYRKLLERLKESGHGNSVCPVTSNYHSSQRSQMDTLKTKGWGEEQNHGVKTTQ
                                     ..: :   : :.: ..   . :..:  .. 
XP_016 EQLSHSVYSLSSYTPDVAFGSKDSGTLHHPHHHHSVPHQPDNLAAS---NTQSEGSDSVI
            270       280       290       300          310         

       270       280       290       300       310       320       
pF1KA1 FVPKQYRLVETRGPLCSLRSEKRCSKGKITDTEKMVGIRFENESRRGYQLEPDLSEEVSA
       ..  . .  .:  :  :. . .   . .  . .: ......:.  :  . : .. . :  
XP_016 LL--KVKDSQTPTPRTSVYDSRARERLRQIEEQKALALQLQNQ--RLQEREHSVHDSVEL
     320         330       340       350       360         370     

       330       340       350       360       370       380       
pF1KA1 RLRLGSGSNGLLRRKVSIIETKEKNCSGKERDRRTDDLLELTEDMEKEISNALGHGPQDE
       .::.       :.... .  ..: . .:..     :.. :.::.:::::.:.. .: :::
XP_016 HLRVP------LEKEIPVTVVQETQKKGHKLTDSEDEFPEITEEMEKEIKNVFRNGNQDE
         380             390       400       410       420         

       390       400       410       420       430       440       
pF1KA1 ILSSAFKLRITRGDIQTLKNYHWLNDEVINFYMNLLVERNKKQGYPALHVFSTFFYPKLK
       .:: ::.: ::: :::::.. .:::::.::::::.:.::.:..: :..:.:.:::. :::
XP_016 VLSEAFRLTITRKDIQTLNHLNWLNDEIINFYMNMLMERSKEKGLPSVHAFNTFFFTKLK
     430       440       450       460       470       480         

       450       460       470       480       490       500       
pF1KA1 SGGYQAVKRWTKGVNLFEQEIILVPIHRKVHWSLVVIDLRKKCLKYLDSMGQKGHRICEI
       ..:::::::::: :..:  .:.:::::  ::: :.:.:.::: . : ::::  ... :.:
XP_016 TAGYQAVKRWTKKVDVFSVDILLVPIHLGVHWCLAVVDFRKKNITYYDSMGGINNEACRI
     490       500       510       520       530       540         

       510       520       530       540       550       560       
pF1KA1 LLQYLQDESKTKRNSDLNLLEWTHHSMKPHEIPQQLNGSDCGMFTCKYADYISRDKPITF
       :::::..::  :. ....   :   : : .:::::.::::::::.::::: :..:.::.:
XP_016 LLQYLKQESIDKKRKEFDTNGWQLFSKKSQEIPQQMNGSDCGMFACKYADCITKDRPINF
     550       560       570       580       590       600         

       570       580         
pF1KA1 TQHQMPLFRKKMVWEILHQQLL
       ::..:: :::.:::::::..::
XP_016 TQQHMPYFRKRMVWEILHRKLL
     610       620       630 

>>XP_016874726 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-specifi  (631 aa)
 initn: 1047 init1: 975 opt: 1005  Z-score: 1045.3  bits: 203.5 E(85289): 1.7e-51
Smith-Waterman score: 1012; 44.3% identity (73.6% similar) in 352 aa overlap (238-589:293-631)

       210       220       230       240       250       260       
pF1KA1 VQKEEREKYRKLLERLKESGHGNSVCPVTSNYHSSQRSQMDTLKTKGWGEEQNHGVKTTQ
                                     ..: :   : :.: ..   . :..:  .. 
XP_016 EQLSHSVYSLSSYTPDVAFGSKDSGTLHHPHHHHSVPHQPDNLAAS---NTQSEGSDSVI
            270       280       290       300          310         

       270       280       290       300       310       320       
pF1KA1 FVPKQYRLVETRGPLCSLRSEKRCSKGKITDTEKMVGIRFENESRRGYQLEPDLSEEVSA
       ..  . .  .:  :  :. . .   . .  . .: ......:.  :  . : .. . :  
XP_016 LL--KVKDSQTPTPRTSVYDSRARERLRQIEEQKALALQLQNQ--RLQEREHSVHDSVEL
     320         330       340       350       360         370     

       330       340       350       360       370       380       
pF1KA1 RLRLGSGSNGLLRRKVSIIETKEKNCSGKERDRRTDDLLELTEDMEKEISNALGHGPQDE
       .::.       :.... .  ..: . .:..     :.. :.::.:::::.:.. .: :::
XP_016 HLRVP------LEKEIPVTVVQETQKKGHKLTDSEDEFPEITEEMEKEIKNVFRNGNQDE
         380             390       400       410       420         

       390       400       410       420       430       440       
pF1KA1 ILSSAFKLRITRGDIQTLKNYHWLNDEVINFYMNLLVERNKKQGYPALHVFSTFFYPKLK
       .:: ::.: ::: :::::.. .:::::.::::::.:.::.:..: :..:.:.:::. :::
XP_016 VLSEAFRLTITRKDIQTLNHLNWLNDEIINFYMNMLMERSKEKGLPSVHAFNTFFFTKLK
     430       440       450       460       470       480         

       450       460       470       480       490       500       
pF1KA1 SGGYQAVKRWTKGVNLFEQEIILVPIHRKVHWSLVVIDLRKKCLKYLDSMGQKGHRICEI
       ..:::::::::: :..:  .:.:::::  ::: :.:.:.::: . : ::::  ... :.:
XP_016 TAGYQAVKRWTKKVDVFSVDILLVPIHLGVHWCLAVVDFRKKNITYYDSMGGINNEACRI
     490       500       510       520       530       540         

       510       520       530       540       550       560       
pF1KA1 LLQYLQDESKTKRNSDLNLLEWTHHSMKPHEIPQQLNGSDCGMFTCKYADYISRDKPITF
       :::::..::  :. ....   :   : : .:::::.::::::::.::::: :..:.::.:
XP_016 LLQYLKQESIDKKRKEFDTNGWQLFSKKSQEIPQQMNGSDCGMFACKYADCITKDRPINF
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       570       580         
pF1KA1 TQHQMPLFRKKMVWEILHQQLL
       ::..:: :::.:::::::..::
XP_016 TQQHMPYFRKRMVWEILHRKLL
     610       620       630 

>>XP_011536546 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-specifi  (663 aa)
 initn: 1047 init1: 975 opt: 1005  Z-score: 1045.0  bits: 203.5 E(85289): 1.8e-51
Smith-Waterman score: 1012; 44.3% identity (73.6% similar) in 352 aa overlap (238-589:325-663)

       210       220       230       240       250       260       
pF1KA1 VQKEEREKYRKLLERLKESGHGNSVCPVTSNYHSSQRSQMDTLKTKGWGEEQNHGVKTTQ
                                     ..: :   : :.: ..   . :..:  .. 
XP_011 EQLSHSVYSLSSYTPDVAFGSKDSGTLHHPHHHHSVPHQPDNLAAS---NTQSEGSDSVI
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pF1KA1 FVPKQYRLVETRGPLCSLRSEKRCSKGKITDTEKMVGIRFENESRRGYQLEPDLSEEVSA
       ..  . .  .:  :  :. . .   . .  . .: ......:.  :  . : .. . :  
XP_011 LL--KVKDSQTPTPRTSVYDSRARERLRQIEEQKALALQLQNQ--RLQEREHSVHDSVEL
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pF1KA1 RLRLGSGSNGLLRRKVSIIETKEKNCSGKERDRRTDDLLELTEDMEKEISNALGHGPQDE
       .::.       :.... .  ..: . .:..     :.. :.::.:::::.:.. .: :::
XP_011 HLRVP------LEKEIPVTVVQETQKKGHKLTDSEDEFPEITEEMEKEIKNVFRNGNQDE
       410             420       430       440       450       460 

       390       400       410       420       430       440       
pF1KA1 ILSSAFKLRITRGDIQTLKNYHWLNDEVINFYMNLLVERNKKQGYPALHVFSTFFYPKLK
       .:: ::.: ::: :::::.. .:::::.::::::.:.::.:..: :..:.:.:::. :::
XP_011 VLSEAFRLTITRKDIQTLNHLNWLNDEIINFYMNMLMERSKEKGLPSVHAFNTFFFTKLK
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pF1KA1 SGGYQAVKRWTKGVNLFEQEIILVPIHRKVHWSLVVIDLRKKCLKYLDSMGQKGHRICEI
       ..:::::::::: :..:  .:.:::::  ::: :.:.:.::: . : ::::  ... :.:
XP_011 TAGYQAVKRWTKKVDVFSVDILLVPIHLGVHWCLAVVDFRKKNITYYDSMGGINNEACRI
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pF1KA1 LLQYLQDESKTKRNSDLNLLEWTHHSMKPHEIPQQLNGSDCGMFTCKYADYISRDKPITF
       :::::..::  :. ....   :   : : .:::::.::::::::.::::: :..:.::.:
XP_011 LLQYLKQESIDKKRKEFDTNGWQLFSKKSQEIPQQMNGSDCGMFACKYADCITKDRPINF
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       570       580         
pF1KA1 TQHQMPLFRKKMVWEILHQQLL
       ::..:: :::.:::::::..::
XP_011 TQQHMPYFRKRMVWEILHRKLL
             650       660   

>>XP_016874719 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-specifi  (694 aa)
 initn: 1047 init1: 975 opt: 1005  Z-score: 1044.7  bits: 203.5 E(85289): 1.9e-51
Smith-Waterman score: 1012; 44.3% identity (73.6% similar) in 352 aa overlap (238-589:356-694)

       210       220       230       240       250       260       
pF1KA1 VQKEEREKYRKLLERLKESGHGNSVCPVTSNYHSSQRSQMDTLKTKGWGEEQNHGVKTTQ
                                     ..: :   : :.: ..   . :..:  .. 
XP_016 EQLSHSVYSLSSYTPDVAFGSKDSGTLHHPHHHHSVPHQPDNLAAS---NTQSEGSDSVI
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pF1KA1 FVPKQYRLVETRGPLCSLRSEKRCSKGKITDTEKMVGIRFENESRRGYQLEPDLSEEVSA
       ..  . .  .:  :  :. . .   . .  . .: ......:.  :  . : .. . :  
XP_016 LL--KVKDSQTPTPRTSVYDSRARERLRQIEEQKALALQLQNQ--RLQEREHSVHDSVEL
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       330       340       350       360       370       380       
pF1KA1 RLRLGSGSNGLLRRKVSIIETKEKNCSGKERDRRTDDLLELTEDMEKEISNALGHGPQDE
       .::.       :.... .  ..: . .:..     :.. :.::.:::::.:.. .: :::
XP_016 HLRVP------LEKEIPVTVVQETQKKGHKLTDSEDEFPEITEEMEKEIKNVFRNGNQDE
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pF1KA1 ILSSAFKLRITRGDIQTLKNYHWLNDEVINFYMNLLVERNKKQGYPALHVFSTFFYPKLK
       .:: ::.: ::: :::::.. .:::::.::::::.:.::.:..: :..:.:.:::. :::
XP_016 VLSEAFRLTITRKDIQTLNHLNWLNDEIINFYMNMLMERSKEKGLPSVHAFNTFFFTKLK
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pF1KA1 SGGYQAVKRWTKGVNLFEQEIILVPIHRKVHWSLVVIDLRKKCLKYLDSMGQKGHRICEI
       ..:::::::::: :..:  .:.:::::  ::: :.:.:.::: . : ::::  ... :.:
XP_016 TAGYQAVKRWTKKVDVFSVDILLVPIHLGVHWCLAVVDFRKKNITYYDSMGGINNEACRI
            560       570       580       590       600       610  

       510       520       530       540       550       560       
pF1KA1 LLQYLQDESKTKRNSDLNLLEWTHHSMKPHEIPQQLNGSDCGMFTCKYADYISRDKPITF
       :::::..::  :. ....   :   : : .:::::.::::::::.::::: :..:.::.:
XP_016 LLQYLKQESIDKKRKEFDTNGWQLFSKKSQEIPQQMNGSDCGMFACKYADCITKDRPINF
            620       630       640       650       660       670  

       570       580         
pF1KA1 TQHQMPLFRKKMVWEILHQQLL
       ::..:: :::.:::::::..::
XP_016 TQQHMPYFRKRMVWEILHRKLL
            680       690    

>>XP_006719425 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-specifi  (445 aa)
 initn: 975 init1: 975 opt: 1001  Z-score: 1043.2  bits: 202.6 E(85289): 2.3e-51
Smith-Waterman score: 1001; 48.1% identity (76.6% similar) in 308 aa overlap (282-589:146-445)

             260       270       280       290       300       310 
pF1KA1 TKGWGEEQNHGVKTTQFVPKQYRLVETRGPLCSLRSEKRCSKGKITDTEKMVGIRFENES
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XP_006 SDSVILLKVKDSQTPTPSSTFFQAELWIKELTSVYDSRARERLRQIEEQKALALQLQNQ-
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pF1KA1 RRGYQLEPDLSEEVSARLRLGSGSNGLLRRKVSIIETKEKNCSGKERDRRTDDLLELTED
        :  . : .. . :  .::.       :.... .  ..: . .:..     :.. :.::.
XP_006 -RLQEREHSVHDSVELHLRVP------LEKEIPVTVVQETQKKGHKLTDSEDEFPEITEE
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             380       390       400       410       420       430 
pF1KA1 MEKEISNALGHGPQDEILSSAFKLRITRGDIQTLKNYHWLNDEVINFYMNLLVERNKKQG
       :::::.:.. .: :::.:: ::.: ::: :::::.. .:::::.::::::.:.::.:..:
XP_006 MEKEIKNVFRNGNQDEVLSEAFRLTITRKDIQTLNHLNWLNDEIINFYMNMLMERSKEKG
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        :..:.:.:::. :::..:::::::::: :..:  .:.:::::  ::: :.:.:.::: .
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             500       510       520       530       540       550 
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        : ::::  ... :.::::::..::  :. ....   :   : : .:::::.::::::::
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589 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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